ID HTH_ARAC_FAMILY_1; PATTERN. AC PS00041; DT 01-APR-1990 CREATED; 01-APR-2006 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Bacterial regulatory proteins, araC family signature. PA [KRQ]-[LIVMA]-x(2)-[GSTALIV]-{FYWPGDN}-x(2)-[LIVMSA]-x(4,9)-[LIVMF]-x- PA {PLH}-[LIVMSTA]-[GSTACIL]-{GPK}-{F}-x-[GANQRF]-[LIVMFY]-x(4,5)-[LFY]- PA x(3)-[FYIVA]-{FYWHCM}-{PGVI}-x(2)-[GSADENQKR]-x-[NSTAPKL]-[PARL]. NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=329(327); /POSITIVE=220(218); /UNKNOWN=1(1); /FALSE_POS=108(108); NR /FALSE_NEG=47; /PARTIAL=0; CC /TAXO-RANGE=??EP?; /MAX-REPEAT=2; CC /VERSION=2; DR P43463 , AARP_PROST , T; P19219 , ADAA_BACSU , T; DR P06134 , ADA_ECOLI , T; P26189 , ADA_SALTY , T; DR P33234 , ADIY_ECOLI , T; P43464 , AGGR_ECOLX , T; DR P9WJW2 , ALKA_MYCTO , T; P9WJW3 , ALKA_MYCTU , T; DR O31249 , ALKR_ACIAD , T; Q84BZ4 , ANDR_BURCE , T; DR P05052 , APPY_ECOLI , T; Q03320 , ARACL_STRAT, T; DR P35319 , ARACL_STRLI, T; P11765 , ARAC_CITFR , T; DR P07642 , ARAC_DICCH , T; P0A9E1 , ARAC_ECO57 , T; DR P0A9E0 , ARAC_ECOLI , T; P03022 , ARAC_SALTY , T; DR G3XCU2 , ARGR_PSEAE , T; P40408 , BTR_BACSU , T; DR P26950 , CAF1R_YERPE, T; Q9HTH5 , CDHR_PSEAE , T; DR P25393 , CFAD_ECOLX , T; P17410 , CHBR_ECOLI , T; DR P43460 , CSVR_ECOLX , T; P10805 , ENVY_ECOLI , T; DR P36547 , EUTR_ECOLI , T; Q9ZFU7 , EUTR_SALTY , T; DR P26993 , EXSA_PSEAE , T; P23774 , FAPR_ECOLX , T; DR P63202 , GADW_ECO57 , T; Q8FCI7 , GADW_ECOL6 , T; DR P63201 , GADW_ECOLI , T; P63203 , GADW_SHIFL , T; DR Q9EYV5 , GADX_ECO27 , T; P58230 , GADX_ECO57 , T; DR Q8FCI6 , GADX_ECOL6 , T; P37639 , GADX_ECOLI , T; DR Q83PR0 , GADX_SHIFL , T; A0A0H2ZIC3, GBDR_PSEAB , T; DR Q9HTI4 , GBDR_PSEAE , T; O87389 , GLXA_RHIME , T; DR E1WAC0 , HILD_SALTS , T; P0CL08 , HILD_SALTY , T; DR P31778 , HRPB_RALN1 , T; P69342 , INVF_SALTI , T; DR P69343 , INVF_SALTY , T; O33813 , LACR_STAXY , T; DR P28808 , LCRF_YERPE , T; Q51872 , LUMQ_PHOLE , T; DR P0ACH6 , MARA_ECO57 , T; P0ACH5 , MARA_ECOLI , T; DR P0A2S6 , MARA_SALEN , T; P0A2S5 , MARA_SALTI , T; DR P0A2S4 , MARA_SALTY , T; P0ACH7 , MARA_SHIFL , T; DR P0ACH9 , MELR_ECOL6 , T; P0ACH8 , MELR_ECOLI , T; DR P28809 , MMSR_PSEAE , T; Q00753 , MSMR_STRMU , T; DR P0A2S7 , MXIE_SHIFL , T; P0A2S8 , MXIE_SHISO , T; DR P76241 , NIMR_ECOLI , T; B1Q2A8 , NPHR_RHOSO , T; DR P40883 , PCHR_PSEAE , T; P43459 , PERA_ECO27 , T; DR T2KMF4 , PLH4_FORAG , T; Q05587 , POCR_SALTY , T; DR Q52620 , PQRA_PROVU , T; P43465 , RAFR_PEDPE , T; DR A0A0H3GPK2, RAMA_KLEPH , T; Q48413 , RAMA_KLEPN , T; DR H9L484 , RAMA_SALTY , T; A7ML57 , RHAR_CROS8 , T; DR A7ZUB8 , RHAR_ECO24 , T; Q8X7B3 , RHAR_ECO57 , T; DR C5A074 , RHAR_ECOBW , T; A8A710 , RHAR_ECOHS , T; DR A1AI83 , RHAR_ECOK1 , T; Q0TAF7 , RHAR_ECOL5 , T; DR Q8FBD7 , RHAR_ECOL6 , T; P09378 , RHAR_ECOLI , T; DR Q1R413 , RHAR_ECOUT , T; A4WG90 , RHAR_ENT38 , T; DR A6TGB0 , RHAR_KLEP7 , T; Q65Q30 , RHAR_MANSM , T; DR B5F0N0 , RHAR_SALA4 , T; A9MI63 , RHAR_SALAR , T; DR Q57HG7 , RHAR_SALCH , T; B5FPP6 , RHAR_SALDC , T; DR B5QWY5 , RHAR_SALEP , T; B4TBY4 , RHAR_SALHS , T; DR B4SZZ4 , RHAR_SALNS , T; Q5PKG1 , RHAR_SALPA , T; DR A9MZC9 , RHAR_SALPB , T; B5BJG9 , RHAR_SALPK , T; DR B4TPR0 , RHAR_SALSV , T; Q8Z2V5 , RHAR_SALTI , T; DR P40865 , RHAR_SALTY , T; Q31U83 , RHAR_SHIBS , T; DR Q32A71 , RHAR_SHIDS , T; Q0SZ96 , RHAR_SHIF8 , T; DR Q83PD9 , RHAR_SHIFL , T; A7FN79 , RHAR_YERP3 , T; DR Q1C0W2 , RHAR_YERPA , T; B2K1W6 , RHAR_YERPB , T; DR Q8ZIZ9 , RHAR_YERPE , T; A9QYR6 , RHAR_YERPG , T; DR Q1CEB6 , RHAR_YERPN , T; A4TRS7 , RHAR_YERPP , T; DR Q66FF1 , RHAR_YERPS , T; B1JNC4 , RHAR_YERPY , T; DR A8AL27 , RHAS_CITK8 , T; A7ZUB7 , RHAS_ECO24 , T; DR B7UNM6 , RHAS_ECO27 , T; B7MI37 , RHAS_ECO45 , T; DR B7L9G1 , RHAS_ECO55 , T; Q8X897 , RHAS_ECO57 , T; DR B5YZ43 , RHAS_ECO5E , T; B7NUA1 , RHAS_ECO7I , T; DR B7N2P7 , RHAS_ECO81 , T; B7M6V7 , RHAS_ECO8A , T; DR C5A073 , RHAS_ECOBW , T; B1XB72 , RHAS_ECODH , T; DR A8A709 , RHAS_ECOHS , T; A1AI82 , RHAS_ECOK1 , T; DR Q0TAF8 , RHAS_ECOL5 , T; Q8CXW5 , RHAS_ECOL6 , T; DR B1IVH3 , RHAS_ECOLC , T; P09377 , RHAS_ECOLI , T; DR B7NFK3 , RHAS_ECOLU , T; B6I4P8 , RHAS_ECOSE , T; DR B1LMU6 , RHAS_ECOSM , T; Q1R414 , RHAS_ECOUT , T; DR A4WG91 , RHAS_ENT38 , T; B5XZ49 , RHAS_KLEP3 , T; DR A6TGA9 , RHAS_KLEP7 , T; Q6DA22 , RHAS_PECAS , T; DR C6DJR4 , RHAS_PECCP , T; B5F0M9 , RHAS_SALA4 , T; DR A9MI64 , RHAS_SALAR , T; Q57HG8 , RHAS_SALCH , T; DR B5FPP5 , RHAS_SALDC , T; B5QWY4 , RHAS_SALEP , T; DR B5RFC3 , RHAS_SALG2 , T; B4TBY3 , RHAS_SALHS , T; DR B4SZZ3 , RHAS_SALNS , T; Q5PKG2 , RHAS_SALPA , T; DR A9MZC8 , RHAS_SALPB , T; C0Q3L4 , RHAS_SALPC , T; DR B5BJG8 , RHAS_SALPK , T; B4TPQ9 , RHAS_SALSV , T; DR P0A2T0 , RHAS_SALTI , T; P0A2S9 , RHAS_SALTY , T; DR Q31U84 , RHAS_SHIBS , T; Q32A70 , RHAS_SHIDS , T; DR Q0SZ95 , RHAS_SHIF8 , T; Q83PE0 , RHAS_SHIFL , T; DR Q3YV71 , RHAS_SHISS , T; A7FN80 , RHAS_YERP3 , T; DR B2K1W5 , RHAS_YERPB , T; A9QYR8 , RHAS_YERPG , T; DR A4TRS8 , RHAS_YERPP , T; Q66FF2 , RHAS_YERPS , T; DR B1JNC5 , RHAS_YERPY , T; Q6NI56 , RIPA_CORDI , T; DR Q8FQS2 , RIPA_COREF , T; Q8NRR3 , RIPA_CORGL , T; DR P16114 , RNS_ECOLX , T; P0ACI1 , ROB_ECO57 , T; DR P0ACI0 , ROB_ECOLI , T; P0ACI2 , ROB_SHIFL , T; DR Q8Z4A6 , SIRC_SALTI , T; E1WAB2 , SIRC_SALTS , T; DR P0CL09 , SIRC_SALTY , T; P0A9E4 , SOXS_ECO57 , T; DR P0A9E3 , SOXS_ECOL6 , T; P0A9E2 , SOXS_ECOLI , T; DR Q56143 , SOXS_SALTY , T; A5F384 , TCPN_VIBC3 , T; DR P0C6D6 , TCPN_VIBCH , T; P28816 , TETD_ECOLX , T; DR P43462 , THCR_RHOER , T; P32326 , URER_ECOLX , T; DR Q02458 , URER_PROMH , T; P0A2T2 , VIRF_SHIDY , T; DR P0A2T1 , VIRF_SHIFL , T; P0A2T3 , VIRF_SHISO , T; DR A1JU91 , VIRF_YERE8 , T; P0C2V5 , VIRF_YEREN , T; DR P0ACI5 , XYLR_ECO57 , T; P0ACI4 , XYLR_ECOL6 , T; DR P0ACI3 , XYLR_ECOLI , T; P45043 , XYLR_HAEIN , T; DR Q04710 , XYLS1_PSEPU, T; Q05092 , XYLS2_PSEPU, T; DR Q05335 , XYLS3_PSEPU, T; Q04713 , XYLS4_PSEPU, T; DR P07859 , XYLS_PSEPU , T; P45008 , Y1052_HAEIN, T; DR Q8ZM00 , Y3175_SALTY, T; P55449 , Y4FK_SINFN , T; DR P43461 , YCGK_PSEVC , T; P76103 , YDCO_ECOLI , T; DR P96660 , YDEC_BACSU , T; P96662 , YDEE_BACSU , T; DR Q8X4Z9 , YDEO_ECO57 , T; Q8FHG0 , YDEO_ECOL6 , T; DR P76135 , YDEO_ECOLI , T; Q83RF4 , YDEO_SHIFL , T; DR O31522 , YESS_BACSU , T; P54722 , YFIF_BACSU , T; DR P31449 , YIDL_ECOLI , T; P32677 , YIJO_ECOLI , T; DR P40331 , YISR_BACSU , T; P43458 , YMCR_STRLA , T; DR O34901 , YOBQ_BACSU , T; P77396 , YPDC_ECOLI , T; DR Q47129 , FEAR_ECOLI , N; Q2FK47 , HPTR_STAA3 , N; DR Q2G1E1 , HPTR_STAA8 , N; Q2YV56 , HPTR_STAAB , N; DR Q5HJF7 , HPTR_STAAC , N; Q99X00 , HPTR_STAAM , N; DR Q7A7X9 , HPTR_STAAN , N; Q6GK93 , HPTR_STAAR , N; DR Q6GCQ3 , HPTR_STAAS , N; Q8NYJ9 , HPTR_STAAW , N; DR Q9WW32 , MTRA_NEIGO , N; P72171 , ORUR_PSEAE , N; DR P55922 , RAMA_ENTCL , N; P77379 , RCLR_ECOLI , N; DR Q6DA21 , RHAR_PECAS , N; C6DJR5 , RHAR_PECCP , N; DR B7LVD8 , RHAS_ESCF3 , N; Q65Q31 , RHAS_MANSM , N; DR B2TVP7 , RHAS_SHIB3 , N; Q1C0W1 , RHAS_YERPA , N; DR Q8ZJ00 , RHAS_YERPE , N; Q1CEB5 , RHAS_YERPN , N; DR Q9Z3Q6 , RHRA_RHIME , N; P9WMJ2 , VIRS_MYCTO , N; DR P9WMJ3 , VIRS_MYCTU , N; Q9I1P2 , VQSM_PSEAE , N; DR Q8NYT6 , Y077_STAAW , N; Q6GD21 , Y078_STAAS , N; DR Q5HJR8 , Y084_STAAC , N; Q7A882 , Y097_STAAN , N; DR Q99XB1 , Y101_STAAM , N; Q6GKK1 , Y107_STAAR , N; DR P9WMJ0 , Y1395_MYCTO, N; P9WMJ1 , Y1395_MYCTU, N; DR P68912 , Y1430_MYCBO, N; Q8CQE3 , Y165_STAES , N; DR P95283 , Y1931_MYCTU, N; Q5HKE0 , Y2406_STAEQ, N; DR P77634 , YBCM_ECOLI , N; O31449 , YBFI_BACSU , N; DR O31456 , YBFP_BACSU , N; P77402 , YDIP_ECOLI , N; DR Q936F1 , YHTH1_STAAU, N; P77601 , YKGA_ECOLI , N; DR P76138 , YNEL_ECOLI , N; Q46855 , YQHC_ECOLI , N; DR O32071 , YTDP_BACSU , N; DR Q9U2G5 , MRP7_CAEEL , ?; DR K9NBS6 , AAM_RHOER , F; P77744 , ABGR_ECOLI , F; DR Q7LXU6 , AIPS_SACS2 , F; Q8H1D8 , APY4_ARATH , F; DR Q7VMS5 , ARGD_HAEDU , F; Q5N3D4 , AROB_SYNP6 , F; DR P74985 , ARSB_YEREN , F; P0CH01 , AT21A_ARATH, F; DR F4IK01 , AUG1_ARATH , F; Q47C02 , BIOC_DECAR , F; DR Q9Z0S1 , BPNT1_MOUSE, F; A2XW69 , BRE1A_ORYSI, F; DR Q7XU27 , BRE1A_ORYSJ, F; Q31DE8 , CBID_PROM9 , F; DR Q54468 , CHB_SERMA , F; Q8ZAG5 , CORA_YERPE , F; DR Q66FY7 , CORA_YERPS , F; Q924C3 , ENPP1_RAT , F; DR O04036 , ERD6_ARATH , F; P43712 , FABD_HAEIN , F; DR Q04952 , FKS3_YEAST , F; Q6FFC1 , FTSW_ACIAD , F; DR Q2J6U8 , GATB_FRACC , F; Q47SC0 , GATB_THEFY , F; DR O15303 , GRM6_HUMAN , F; Q5NCH9 , GRM6_MOUSE , F; DR Q863I4 , GRM6_RABIT , F; P35349 , GRM6_RAT , F; DR Q31IC2 , HLDE_HYDCU , F; P57683 , KDPA_PSEAE , F; DR Q88FD7 , KDPA_PSEPK , F; Q883V6 , KDPA_PSESM , F; DR A5V2F7 , KUP1_RHIWR , F; P15911 , L2_FOWPN , F; DR P75826 , LYSO_ECOLI , F; Q6TQR6 , L_CCHFI , F; DR Q1KXX8 , MATK_HELAN , F; A0RK76 , MEND_BACAH , F; DR Q81K94 , MEND_BACAN , F; A7GU91 , MEND_BACCN , F; DR Q816H7 , MEND_BACCR , F; Q632I2 , MEND_BACCZ , F; DR Q6HC26 , MEND_BACHK , F; A9VM77 , MEND_BACMK , F; DR A8FGK9 , MEND_BACP2 , F; P23970 , MEND_BACSU , F; DR A7Z812 , MEND_BACVZ , F; Q5KVX6 , MEND_GEOKA , F; DR A4IS14 , MEND_GEOTN , F; Q92AY5 , MEND_LISIN , F; DR Q71YZ2 , MEND_LISMF , F; Q8Y6K9 , MEND_LISMO , F; DR A0AJC9 , MEND_LISW6 , F; Q2RYY4 , METK_SALRD , F; DR Q823C4 , METN_CHLCV , F; Q5JL08 , MON1_ORYSJ , F; DR Q6DC77 , MPRGB_DANRE, F; P65458 , MURA1_STRP1, F; DR P0DC44 , MURA1_STRP3, F; Q5XCX7 , MURA1_STRP6, F; DR P65459 , MURA1_STRP8, F; Q48UD0 , MURA1_STRPM, F; DR P0DC45 , MURA1_STRPQ, F; Q5NYP9 , MUTS_AROAE , F; DR A5DSI2 , NAR1_LODEL , F; Q3E7D0 , NAT12_ARATH, F; DR A5CTB2 , NHAA2_CLAM3, F; O42101 , NR5A2_CHICK, F; DR Q4WVN4 , NRPS8_ASPFU, F; Q8QVU9 , POL2_CNSV , F; DR Q11188 , POPL1_CAEEL, F; F4J264 , PRFB3_ARATH, F; DR A1CHL3 , PRP28_ASPCL, F; Q4WPE9 , PRP28_ASPFU, F; DR A2QIL2 , PRP28_ASPNC, F; Q2UH00 , PRP28_ASPOR, F; DR Q0CLX0 , PRP28_ASPTN, F; A6RJA2 , PRP28_BOTFB, F; DR Q1DMX8 , PRP28_COCIM, F; Q5BCU6 , PRP28_EMENI, F; DR Q4I7F9 , PRP28_GIBZE, F; A1CX72 , PRP28_NEOFI, F; DR Q7SEL0 , PRP28_NEUCR, F; Q0UWC8 , PRP28_PHANO, F; DR A7EGG4 , PRP28_SCLS1, F; Q6FCS7 , PURA_ACIAD , F; DR Q7FGZ2 , RH1_ARATH , F; O08429 , RP54_VIBAN , F; DR Q8NG04 , S2610_HUMAN, F; Q32LP4 , S4A10_BOVIN, F; DR Q6U841 , S4A10_HUMAN, F; Q5DTL9 , S4A10_MOUSE, F; DR Q80ZA5 , S4A10_RAT , F; Q99PY0 , SCTL_SHIFL , F; DR Q7VKC2 , SELA_HAEDU , F; Q9H3S1 , SEM4A_HUMAN, F; DR Q62179 , SEM4B_MOUSE, F; Q8PJE5 , SYFB_XANAC , F; DR Q73Y21 , SYG_MYCPA , F; Q5YZT7 , SYG_NOCFA , F; DR O75005 , SYV_SCHPO , F; Q2T4P1 , THAQ_BURTA , F; DR Q5I2M5 , TLR9_BOVIN , F; Q5I2M4 , TLR9_SHEEP , F; DR A6NFC5 , TM235_HUMAN, F; A7S2N8 , UFL1_NEMVE , F; DR Q8W487 , YB95_ARATH , F; O34572 , YKOC_BACSU , F; 3D 1BL0; 1D5Y; 1U8B; 1WPK; 1XS9; 1ZGW; 2K9S; 3GBG; 3MKL; 4FE4; 4FE7; 5SUW; 3D 6XIU; 6XIV; 7BEF; 7BEG; 7R3W; 7VWY; 7VWZ; 7W5W; 7W5X; 7W5Y; DO PDOC00040; //