Entry: PS00665

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General information about the entry

Entry name [info] DHDPS_1
Accession [info] PS00665
Entry type [info] PATTERN
Date [info] JUN-1992 (CREATED); NOV-1995 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00569

Name and characterization of the entry

Description [info] Dihydrodipicolinate synthase signature 1.
Pattern [info]
[GSA]-[LIVM]-[LIVMFY]-x(2)-G-[ST]-[TG]-G-E-[GASNF]-x(6)-[EQ].

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 409 in 409 different sequences
Number of true positive hits 409 in 409 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 175
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 70.03 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
409 sequences

DAPA1_ARATH (Q9LZX6), DAPA1_BACHD (Q9KC32), DAPA1_CLOAB (Q97GI9), 
DAPA1_STRCO (Q9X9W0), DAPA1_WHEAT (P24846), DAPA2_ARATH (Q9FVC8), 
DAPA2_BACHD (Q9KA91), DAPA2_STRCO (O86841), DAPA2_WHEAT (P24847), 
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DAPA_ACIF2  (B7J6C4), DAPA_ACIF5  (B5ELM5), DAPA_ACTP2  (A3N0Q9), 
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DAPA_ANASK  (B4UHY1), DAPA_AQUAE  (O67216), DAPA_ARCFU  (O29352), 
DAPA_AROAE  (Q5P838), DAPA_AZOSB  (A1K4F8), DAPA_BACA2  (A7Z4U8), 
DAPA_BACSU  (Q04796), DAPA_BARBK  (A1US27), DAPA_BIFA0  (B8DWI2), 
DAPA_BIFLD  (B3DTC8), DAPA_BIFLO  (Q8G527), DAPA_BORPE  (Q7VXZ8), 
DAPA_BRADU  (Q9RH76), DAPA_BUCA5  (B8D8P8), DAPA_BUCAI  (P57197), 
DAPA_BUCAP  (Q8KA24), DAPA_BUCAT  (B8D702), DAPA_BUCBP  (Q89AY0), 
DAPA_BUCCC  (Q058B1), DAPA_CAMFF  (A0RP26), DAPA_CAMJ8  (A8FLL9), 
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DAPA_CHESB  (Q11JT7), DAPA_CHLAB  (Q5L5G7), DAPA_CHLCV  (Q822H0), 
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DAPA_GEOSM  (C6E9Q9), DAPA_GEOUR  (A5GD89), DAPA_GLUDA  (A9HIW2), 
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DAPA_KLEP7  (A6TCA1), DAPA_KOSOT  (C5CHX9), DAPA_LACS1  (Q1WU86), 
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DAPA_LISIN  (Q92BS0), DAPA_LISMC  (C1L2Z1), DAPA_LISMF  (Q71ZN5), 
DAPA_LISMH  (B8DE74), DAPA_LISMO  (Q8Y766), DAPA_LISW6  (A0AIN8), 
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DAPA_METST  (Q2NHW2), DAPA_METTH  (O26892), DAPA_METTP  (A0B7E1), 
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DAPA_SHEB5  (A3D5N2), DAPA_SHEB8  (A6WPI6), DAPA_SHEB9  (A9L573), 
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DAPA_SHIDS  (Q32D87), DAPA_SHIF8  (Q0T239), DAPA_SHIFL  (P0A6L3), 
DAPA_SHISS  (Q3YZ74), DAPA_SORC5  (A9FHA5), DAPA_SOYBN  (Q42800), 
DAPA_SPHAL  (Q1GSC8), DAPA_SPHWW  (A5V3L9), DAPA_STRM5  (B4SRX7), 
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DAPA_SYNS3  (Q0IE16), DAPA_SYNS9  (Q3B0T8), DAPA_SYNSC  (Q3ANI5), 
DAPA_SYNY3  (Q55513), DAPA_TERTT  (C5BQD1), DAPA_THEAB  (B7IF13), 
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DAPA_THENN  (B9K865), DAPA_THEP1  (A5IM62), DAPA_THEP3  (B0KAL7), 
DAPA_THEPX  (B0K4I3), DAPA_THESQ  (B1LBR1), DAPA_THETN  (Q8RBI5), 
DAPA_THEYD  (B5YKK4), DAPA_THIDA  (Q3SJU8), DAPA_THISH  (B8GN57), 
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DAPA_WIGBR  (Q8D2M3), DAPA_WOLPM  (Q73H02), DAPA_WOLPP  (B3CM06), 
DAPA_WOLSU  (Q7M7L6), DAPA_XANAC  (Q8PLN5), DAPA_XANCP  (Q8P9V6), 
DAPA_XYLFA  (Q9PER5), DAPA_XYLFT  (Q87AT3), DAPA_YERE8  (A1JL07), 
DAPA_YERP3  (A7FG49), DAPA_YERPE  (Q8ZCD0), DAPA_YERPP  (A4TMN2), 
DAPA_YERPS  (Q668F7), DAPA_ZYMMO  (Q5NPL6), NANA1_ECOL6 (Q8FD58), 
NANA2_ECOL6 (Q8FDU7), NANA_ACTP2  (A3N352), NANA_ACTP7  (B3GZ05), 
NANA_ACTPJ  (B0BSI2), NANA_CITK8  (A8AQB6), NANA_CLOP1  (Q0TUP8), 
NANA_CLOPE  (Q9S4K9), NANA_CLOPS  (Q0SWI8), NANA_ECO24  (A7ZSB8), 
NANA_ECO27  (B7UJV8), NANA_ECO45  (B7MBY7), NANA_ECO55  (B7LHT3), 
NANA_ECO57  (P0A6L5), NANA_ECO5E  (B5YSV2), NANA_ECO7I  (B7NKT6), 
NANA_ECO8A  (B7M0T7), NANA_ECOBW  (C4ZSW3), NANA_ECODH  (B1XHJ8), 
NANA_ECOHS  (A8A535), NANA_ECOK1  (A1AGB9), NANA_ECOL5  (Q0TCP1), 
NANA_ECOLC  (B1IQQ4), NANA_ECOLI  (P0A6L4), NANA_ECOSE  (B6I1U3), 
NANA_ECOSM  (B1LGJ0), NANA_ECOUT  (Q1R6B5), NANA_ENT38  (A4WF38), 
NANA_ESCF3  (B7LRJ3), NANA_FUSNN  (Q8RDN6), NANA_HAEIN  (P44539), 
NANA_HISS1  (Q0I2T8), NANA_HISS2  (B0UTI7), NANA_LACPL  (P59407), 
NANA_PASMU  (Q9CKB0), NANA_SALA4  (B5F7J9), NANA_SALAR  (A9MNY6), 
NANA_SALCH  (Q57JC9), NANA_SALDC  (B5FIR8), NANA_SALEP  (B5R0L2), 
NANA_SALG2  (B5RET7), NANA_SALHS  (B4TJR3), NANA_SALNS  (B4T750), 
NANA_SALPA  (Q5PLE9), NANA_SALPB  (A9N833), NANA_SALPC  (C0PZN4), 
NANA_SALPK  (B5BGP5), NANA_SALSV  (B4TWJ0), NANA_SALTI  (Q8Z3F0), 
NANA_SALTY  (Q8ZLQ6), NANA_SHIB3  (B2U1V9), NANA_SHIBS  (Q31W94), 
NANA_SHIDS  (Q32BB4), NANA_SHIF8  (Q0T065), NANA_SHIFL  (P0A6L6), 
NANA_SHISS  (Q3YX23), NPL_DANRE   (Q6NYR8), YAGE_ECOLI  (P75682), 
YJHH_ECOLI  (P39359)
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UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
175 sequences

DAPA2_CLOAB (Q97D80), DAPAL_HALS3 (B0R3D6), DAPAL_HALSA (Q9HS19), 
DAPAL_PYRAE (Q8ZU75), DAPAL_PYRAR (A4WJK5), DAPAL_PYRFU (Q8U319), 
DAPAL_PYRIL (A1RRA5), DAPAL_PYRNV (B1YB29), DAPAL_RHIML (O69782), 
DAPAL_THEAC (Q9HJ17), DAPAL_THEON (B6YU51), DAPAL_THEPD (A1S0T1), 
DAPA_ACAM1  (B0C142), DAPA_ACHLI  (A9NGC2), DAPA_ACIC5  (C1F658), 
DAPA_ACIET  (B9MER6), DAPA_ACISJ  (A1W4S3), DAPA_ALBFT  (Q21WN2), 
DAPA_ARCB4  (A8ET60), DAPA_AZOPC  (B6YQ20), DAPA_BACV8  (A6L5G7), 
DAPA_BARHE  (Q6G468), DAPA_BARQU  (Q6G091), DAPA_BART1  (A9IRK3), 
DAPA_BDEBA  (Q6MRM9), DAPA_BLOFL  (Q7VRT1), DAPA_BLOPB  (Q492F5), 
DAPA_BRAHW  (C0R176), DAPA_BRUAB  (Q57E96), DAPA_BRUME  (Q8YG60), 
DAPA_BRUO2  (A5VPI5), DAPA_BRUSU  (Q8G1R0), DAPA_CALBD  (B9MRD1), 
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DAPA_CAMHC  (A7I0Y0), DAPA_CAUCR  (Q9A900), DAPA_CHLCH  (Q3APU0), 
DAPA_CHLL2  (B3EH29), DAPA_CHLP8  (B3QM33), DAPA_CHLPB  (B3EMS4), 
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DAPA_LACF3  (B2GC11), DAPA_LACH4  (A8YUT3), DAPA_LACLA  (Q9CF61), 
DAPA_LACLM  (A2RJL6), DAPA_LACLS  (Q02XU7), DAPA_LACRD  (A5VJ58), 
DAPA_LACRJ  (B2G6M9), DAPA_LEPCP  (B1Y7F0), DAPA_LEUMM  (Q03YE2), 
DAPA_METPP  (A2SIX7), DAPA_METS3  (A5ULF8), DAPA_NOSP7  (B2IT87), 
DAPA_NOSS1  (Q8YQY1), DAPA_OENOB  (Q04FS1), DAPA_PARD8  (A6LA57), 
DAPA_PEDPA  (Q03HT2), DAPA_PELCD  (Q3A1U7), DAPA_PELLD  (Q3B2G4), 
DAPA_PELPB  (B4SE03), DAPA_PELPD  (A1ATI8), DAPA_PHOPR  (Q6LN85), 
DAPA_POLSQ  (A4SX51), DAPA_PORG3  (B2RMB9), DAPA_PROA2  (B4S5J5), 
DAPA_PROVI  (A4SG05), DAPA_PSYA2  (Q4FVD6), DAPA_PSYIN  (A1SVX2), 
DAPA_PSYWF  (A5WHC3), DAPA_RALSO  (Q8Y099), DAPA_RICCK  (A8EYZ4), 
DAPA_SODGM  (Q2NS74), DAPA_STAA1  (A7X271), DAPA_STAA2  (A6U1L6), 
DAPA_STAA3  (Q2FH43), DAPA_STAA8  (Q9EZ12), DAPA_STAA9  (A5ISS7), 
DAPA_STAAB  (Q2YXX4), DAPA_STAAC  (Q5HG25), DAPA_STAAE  (A6QGU6), 
DAPA_STAAM  (P63947), DAPA_STAAN  (P63948), DAPA_STAAR  (Q6GH13), 
DAPA_STAAS  (Q6G9G6), DAPA_STAAT  (A8Z3X3), DAPA_STAAW  (Q8NWS5), 
DAPA_STACT  (B9DP23), DAPA_STAEQ  (Q5HPE7), DAPA_STAES  (Q8CP96), 
DAPA_STAHJ  (Q4L6A0), DAPA_STAS1  (Q49XJ7), DAPA_STRGC  (A8AXI2), 
DAPA_STRMU  (Q8DUE5), DAPA_STRP2  (Q04KR9), DAPA_STRP4  (B5E4D5), 
DAPA_STRP7  (C1C6Z0), DAPA_STRPI  (B1IBH4), DAPA_STRPJ  (B8ZPG7), 
DAPA_STRPN  (Q97R25), DAPA_STRPS  (B2IPH2), DAPA_STRR6  (Q8DPZ9), 
DAPA_STRS2  (A4W0I7), DAPA_STRSV  (A3CN43), DAPA_STRSY  (A4VU96), 
DAPA_STRTD  (Q03K16), DAPA_STRU0  (B9DS79), DAPA_STRZJ  (C1CE08), 
DAPA_STRZP  (C1CK93), DAPA_STRZT  (C1CRD6), DAPA_SULDN  (Q30R77), 
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NPL_HUMAN   (Q9BXD5), NPL_MOUSE   (Q9DCJ9), NPL_PIG     (Q9BEC7), 
NPL_PONAB   (Q5RDY1), NPL_RAT     (Q66H59), NPL_XENTR   (Q5M905), 
PHDJ_NOCSK  (Q79EM8)
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PDB
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69 PDB

1DHP; 1F5Z; 1F6K; 1F6P; 1F73; 1F74; 1F7B; 1FDY; 1FDZ; 1HL2; 1NAL; 1O5K; 1S5V; 1S5W; 1XXX; 1YXC; 1YXD; 2A6L; 2A6N; 2ATS; 2EHH; 2OJP; 2PUR; 2V8Z; 2V9D; 2VC6; 2WKJ; 2WNN; 2WNQ; 2WNZ; 2WO5; 2WPB; 2XFW; 2YGY; 2YXG; 3C0J; 3CPR; 3DEN; 3DU0; 3FLU; 3G0S; 3I7Q; 3I7R; 3I7S; 3L21; 3LBC; 3LBM; 3LCF; 3LCG; 3LCH; 3LCI; 3LCL; 3LCW; 3LCX; 3LER; 3M5V; 3N2X; 3NEV; 3NOE; 3PB0; 3PB2; 3PS7; 3PUO; 3QZE; 3S8H; 4BWL; 4DPP; 4DPQ; 4EOU
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