Entry: PS00665

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General information about the entry

Entry name [info] DHDPS_1
Accession [info] PS00665
Entry type [info] PATTERN
Date [info] JUN-1992 (CREATED); NOV-1995 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00569

Name and characterization of the entry

Description [info] Dihydrodipicolinate synthase signature 1.
Pattern [info]
[GSA]-[LIVM]-[LIVMFY]-x(2)-G-[ST]-[TG]-G-E-[GASNF]-x(6)-[EQ].

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 409 in 409 different sequences
Number of true positive hits 409 in 409 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 175
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 70.03 %

Comments [info]

Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 1

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
409 sequences

DAPA1_ARATH (Q9LZX6), DAPA1_BACHD (Q9KC32), DAPA1_CLOAB (Q97GI9), 
DAPA1_STRCO (Q9X9W0), DAPA1_WHEAT (P24846), DAPA2_ARATH (Q9FVC8), 
DAPA2_BACHD (Q9KA91), DAPA2_STRCO (O86841), DAPA2_WHEAT (P24847), 
DAPAL_CHLAA (A9WE23), DAPA_ACIC1  (A0LV15), DAPA_ACICJ  (A5FZS7), 
DAPA_ACIF2  (B7J6C4), DAPA_ACIF5  (B5ELM5), DAPA_ACTP2  (A3N0Q9), 
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DAPA_ALCBS  (Q0VRH4), DAPA_ALISL  (B6EJT2), DAPA_ALKEH  (Q0A5S1), 
DAPA_ALKOO  (A8MF40), DAPA_ANAD2  (B8JAN5), DAPA_ANADE  (Q2IGX5), 
DAPA_ANADF  (A7H773), DAPA_ANAMF  (B9KI57), DAPA_ANAMM  (Q5PB64), 
DAPA_ANASK  (B4UHY1), DAPA_AQUAE  (O67216), DAPA_ARCFU  (O29352), 
DAPA_AROAE  (Q5P838), DAPA_AZOSB  (A1K4F8), DAPA_BACA2  (A7Z4U8), 
DAPA_BACSU  (Q04796), DAPA_BARBK  (A1US27), DAPA_BIFA0  (B8DWI2), 
DAPA_BIFLD  (B3DTC8), DAPA_BIFLO  (Q8G527), DAPA_BORPE  (Q7VXZ8), 
DAPA_BRADU  (Q9RH76), DAPA_BUCA5  (B8D8P8), DAPA_BUCAI  (P57197), 
DAPA_BUCAP  (Q8KA24), DAPA_BUCAT  (B8D702), DAPA_BUCBP  (Q89AY0), 
DAPA_BUCCC  (Q058B1), DAPA_CALS4  (Q8RBI5), DAPA_CAMFF  (A0RP26), 
DAPA_CAMJ8  (A8FLL9), DAPA_CAMJD  (A7H443), DAPA_CAMJE  (Q9PPB4), 
DAPA_CAMJJ  (A1VZF4), DAPA_CAMJR  (Q5HUY6), DAPA_CAMLR  (B9KFX0), 
DAPA_CELJU  (B3PC19), DAPA_CHESB  (Q11JT7), DAPA_CHLAB  (Q5L5G7), 
DAPA_CHLCV  (Q822H0), DAPA_CHLFF  (Q255G0), DAPA_CHLMU  (Q9PK33), 
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DAPA_CLOTH  (A3DE17), DAPA_COILA  (Q39535), DAPA_CORA7  (C3PH04), 
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DAPA_ECOLC  (B1IWI1), DAPA_ECOLI  (P0A6L2), DAPA_ECOSE  (B6I548), 
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DAPA_ERWT9  (B2VE56), DAPA_ERYLH  (Q2N9J7), DAPA_ESCF3  (B7LKG3), 
DAPA_EXIS2  (B1YJ39), DAPA_EXISA  (C4L2D2), DAPA_FERNB  (A7HJ56), 
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DAPA_GEODF  (B9M380), DAPA_GEOLS  (B3E936), DAPA_GEOMG  (Q39Z67), 
DAPA_GEOSL  (Q74GT6), DAPA_GEOSM  (C6E9Q9), DAPA_GEOUR  (A5GD89), 
DAPA_GLUDA  (A9HIW2), DAPA_GLUOX  (Q5FUW9), DAPA_HAEDU  (Q7VM87), 
DAPA_HAEI8  (Q4QNT3), DAPA_HAEIE  (A5UAN5), DAPA_HAEIG  (A5UG62), 
DAPA_HAEIN  (P43797), DAPA_HALHL  (A1WZ50), DAPA_HALMA  (Q5V5D4), 
DAPA_HELMI  (B0THT2), DAPA_HERAR  (A4G724), DAPA_HISS1  (Q0I260), 
DAPA_HISS2  (B0UVZ8), DAPA_IDILO  (Q5QU03), DAPA_JANSC  (Q28WG2), 
DAPA_KINRD  (A6W828), DAPA_KLEP7  (A6TCA1), DAPA_KOSOT  (C5CHX9), 
DAPA_LACS1  (Q1WU86), DAPA_LARHH  (C1DD55), DAPA_LAWIP  (Q1MPX7), 
DAPA_LEGPC  (A5IEB3), DAPA_LEGPH  (Q5ZT51), DAPA_LEGPL  (Q5WUD4), 
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DAPA_LEPBP  (B0SL58), DAPA_LEPIC  (Q72U22), DAPA_LEPIN  (Q8F132), 
DAPA_LEUCK  (B1MZM8), DAPA_LISIN  (Q92BS0), DAPA_LISMC  (C1L2Z1), 
DAPA_LISMF  (Q71ZN5), DAPA_LISMH  (B8DE74), DAPA_LISMO  (Q8Y766), 
DAPA_LISW6  (A0AIN8), DAPA_MACCJ  (B9EBZ6), DAPA_MAGSM  (A0LDB5), 
DAPA_MAIZE  (P26259), DAPA_MARHV  (A1U1A6), DAPA_META3  (A6UVG7), 
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DAPA_METMJ  (A3CVI7), DAPA_METMP  (Q6LZP8), DAPA_METPE  (B8GKG7), 
DAPA_METRJ  (B1LTD9), DAPA_METST  (Q2NHW2), DAPA_METTH  (O26892), 
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DAPA_MOOTA  (Q2RJK7), DAPA_MYCBO  (P63946), DAPA_MYCBP  (A1KM94), 
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DAPA_MYCLE  (Q9CBW4), DAPA_MYCPA  (Q73VZ7), DAPA_MYCTA  (A5U6A6), 
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DAPA_PROMM  (Q7V990), DAPA_PROMP  (Q7UZK9), DAPA_PROMS  (A2BTN4), 
DAPA_PROMT  (Q46ID7), DAPA_PSE14  (Q48LD5), DAPA_PSEA6  (Q15SZ4), 
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DAPA_PSEU2  (Q4ZW75), DAPA_PSEU5  (A4VN86), DAPA_RHILO  (P58207), 
DAPA_RHIME  (Q92R55), DAPA_RHIML  (Q07607), DAPA_RHOCS  (B6IN13), 
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DAPA_RICMO  (Q9AKQ3), DAPA_RICPR  (O05969), DAPA_RICPU  (C4K288), 
DAPA_RICRI  (Q9AKJ9), DAPA_RICRO  (B0BXJ1), DAPA_RICRS  (A8GS25), 
DAPA_RICTY  (Q9AKE4), DAPA_ROSDO  (Q16BK4), DAPA_RUEPO  (Q5LMK7), 
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DAPA_SALSV  (B4TR62), DAPA_SALTI  (Q8Z4R8), DAPA_SALTY  (Q8ZN71), 
DAPA_SHEB2  (B8E724), DAPA_SHEB5  (A3D5N2), DAPA_SHEB8  (A6WPI6), 
DAPA_SHEB9  (A9L573), DAPA_SHEDO  (Q12NF7), DAPA_SHEFN  (Q082V3), 
DAPA_SHEON  (Q8EFT7), DAPA_SHEPA  (A8H415), DAPA_SHEPC  (A4Y644), 
DAPA_SHEPW  (B8CMS5), DAPA_SHESA  (A0KVS0), DAPA_SHESM  (Q0HHQ6), 
DAPA_SHESR  (Q0HU08), DAPA_SHESW  (A1RKF2), DAPA_SHIB3  (B2TXQ4), 
DAPA_SHIBS  (Q31Y13), DAPA_SHIDS  (Q32D87), DAPA_SHIF8  (Q0T239), 
DAPA_SHIFL  (P0A6L3), DAPA_SHISS  (Q3YZ74), DAPA_SORC5  (A9FHA5), 
DAPA_SOYBN  (Q42800), DAPA_SPHAL  (Q1GSC8), DAPA_SPHWW  (A5V3L9), 
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DAPA_SYNR3  (A5GQ13), DAPA_SYNS3  (Q0IE16), DAPA_SYNS9  (Q3B0T8), 
DAPA_SYNSC  (Q3ANI5), DAPA_SYNY3  (Q55513), DAPA_TERTT  (C5BQD1), 
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DAPA_THEMA  (Q9X1K9), DAPA_THENN  (B9K865), DAPA_THEP1  (A5IM62), 
DAPA_THEP3  (B0KAL7), DAPA_THEPX  (B0K4I3), DAPA_THESQ  (B1LBR1), 
DAPA_THEYD  (B5YKK4), DAPA_THIDA  (Q3SJU8), DAPA_THISH  (B8GN57), 
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DAPA_WIGBR  (Q8D2M3), DAPA_WOLPM  (Q73H02), DAPA_WOLPP  (B3CM06), 
DAPA_WOLSU  (Q7M7L6), DAPA_XANAC  (Q8PLN5), DAPA_XANCP  (Q8P9V6), 
DAPA_XYLFA  (Q9PER5), DAPA_XYLFT  (Q87AT3), DAPA_YERE8  (A1JL07), 
DAPA_YERP3  (A7FG49), DAPA_YERPE  (Q8ZCD0), DAPA_YERPP  (A4TMN2), 
DAPA_YERPS  (Q668F7), DAPA_ZYMMO  (Q5NPL6), NANA1_ECOL6 (Q8FD58), 
NANA2_ECOL6 (Q8FDU7), NANA_ACTP2  (A3N352), NANA_ACTP7  (B3GZ05), 
NANA_ACTPJ  (B0BSI2), NANA_CITK8  (A8AQB6), NANA_CLOP1  (Q0TUP8), 
NANA_CLOPE  (Q9S4K9), NANA_CLOPS  (Q0SWI8), NANA_ECO24  (A7ZSB8), 
NANA_ECO27  (B7UJV8), NANA_ECO45  (B7MBY7), NANA_ECO55  (B7LHT3), 
NANA_ECO57  (P0A6L5), NANA_ECO5E  (B5YSV2), NANA_ECO7I  (B7NKT6), 
NANA_ECO8A  (B7M0T7), NANA_ECOBW  (C4ZSW3), NANA_ECODH  (B1XHJ8), 
NANA_ECOHS  (A8A535), NANA_ECOK1  (A1AGB9), NANA_ECOL5  (Q0TCP1), 
NANA_ECOLC  (B1IQQ4), NANA_ECOLI  (P0A6L4), NANA_ECOSE  (B6I1U3), 
NANA_ECOSM  (B1LGJ0), NANA_ECOUT  (Q1R6B5), NANA_ENT38  (A4WF38), 
NANA_ESCF3  (B7LRJ3), NANA_FUSNN  (Q8RDN6), NANA_HAEIN  (P44539), 
NANA_HISS1  (Q0I2T8), NANA_HISS2  (B0UTI7), NANA_LACPL  (P59407), 
NANA_PASMU  (Q9CKB0), NANA_SALA4  (B5F7J9), NANA_SALAR  (A9MNY6), 
NANA_SALCH  (Q57JC9), NANA_SALDC  (B5FIR8), NANA_SALEP  (B5R0L2), 
NANA_SALG2  (B5RET7), NANA_SALHS  (B4TJR3), NANA_SALNS  (B4T750), 
NANA_SALPA  (Q5PLE9), NANA_SALPB  (A9N833), NANA_SALPC  (C0PZN4), 
NANA_SALPK  (B5BGP5), NANA_SALSV  (B4TWJ0), NANA_SALTI  (Q8Z3F0), 
NANA_SALTY  (Q8ZLQ6), NANA_SHIB3  (B2U1V9), NANA_SHIBS  (Q31W94), 
NANA_SHIDS  (Q32BB4), NANA_SHIF8  (Q0T065), NANA_SHIFL  (P0A6L6), 
NANA_SHISS  (Q3YX23), NPL_DANRE   (Q6NYR8), YAGE_ECOLI  (P75682), 
YJHH_ECOLI  (P39359)
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UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
175 sequences

DAPA2_CLOAB (Q97D80), DAPAL_HALS3 (B0R3D6), DAPAL_HALSA (Q9HS19), 
DAPAL_PYRAE (Q8ZU75), DAPAL_PYRAR (A4WJK5), DAPAL_PYRFU (Q8U319), 
DAPAL_PYRIL (A1RRA5), DAPAL_PYRNV (B1YB29), DAPAL_RHIML (O69782), 
DAPAL_THEAC (Q9HJ17), DAPAL_THEON (B6YU51), DAPAL_THEPD (A1S0T1), 
DAPA_ACAM1  (B0C142), DAPA_ACHLI  (A9NGC2), DAPA_ACIC5  (C1F658), 
DAPA_ACIET  (B9MER6), DAPA_ACISJ  (A1W4S3), DAPA_ARCB4  (A8ET60), 
DAPA_AZOPC  (B6YQ20), DAPA_BACV8  (A6L5G7), DAPA_BARHE  (Q6G468), 
DAPA_BARQU  (Q6G091), DAPA_BART1  (A9IRK3), DAPA_BDEBA  (Q6MRM9), 
DAPA_BLOFL  (Q7VRT1), DAPA_BLOPB  (Q492F5), DAPA_BRAHW  (C0R176), 
DAPA_BRUAB  (Q57E96), DAPA_BRUME  (Q8YG60), DAPA_BRUO2  (A5VPI5), 
DAPA_BRUSU  (Q8G1R0), DAPA_CALBD  (B9MRD1), DAPA_CALS8  (A4XJU0), 
DAPA_CAMC1  (A7ZDQ5), DAPA_CAMC5  (A7GYB0), DAPA_CAMHC  (A7I0Y0), 
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DAPA_CHLP8  (B3QM33), DAPA_CHLPB  (B3EMS4), DAPA_CHLPD  (A1BE04), 
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DAPA_LACH4  (A8YUT3), DAPA_LACLA  (Q9CF61), DAPA_LACLM  (A2RJL6), 
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DAPA_LEPCP  (B1Y7F0), DAPA_LEUMM  (Q03YE2), DAPA_METPP  (A2SIX7), 
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DAPA_OENOB  (Q04FS1), DAPA_PARD8  (A6LA57), DAPA_PEDPA  (Q03HT2), 
DAPA_PELCD  (Q3A1U7), DAPA_PELLD  (Q3B2G4), DAPA_PELPB  (B4SE03), 
DAPA_PELPD  (A1ATI8), DAPA_PHOPR  (Q6LN85), DAPA_POLSQ  (A4SX51), 
DAPA_PORG3  (B2RMB9), DAPA_PROA2  (B4S5J5), DAPA_PROVI  (A4SG05), 
DAPA_PSYA2  (Q4FVD6), DAPA_PSYIN  (A1SVX2), DAPA_PSYWF  (A5WHC3), 
DAPA_RALSO  (Q8Y099), DAPA_RHOFT  (Q21WN2), DAPA_RICCK  (A8EYZ4), 
DAPA_SODGM  (Q2NS74), DAPA_STAA1  (A7X271), DAPA_STAA2  (A6U1L6), 
DAPA_STAA3  (Q2FH43), DAPA_STAA8  (Q9EZ12), DAPA_STAA9  (A5ISS7), 
DAPA_STAAB  (Q2YXX4), DAPA_STAAC  (Q5HG25), DAPA_STAAE  (A6QGU6), 
DAPA_STAAM  (P63947), DAPA_STAAN  (P63948), DAPA_STAAR  (Q6GH13), 
DAPA_STAAS  (Q6G9G6), DAPA_STAAT  (A8Z3X3), DAPA_STAAW  (Q8NWS5), 
DAPA_STACT  (B9DP23), DAPA_STAEQ  (Q5HPE7), DAPA_STAES  (Q8CP96), 
DAPA_STAHJ  (Q4L6A0), DAPA_STAS1  (Q49XJ7), DAPA_STRGC  (A8AXI2), 
DAPA_STRMU  (Q8DUE5), DAPA_STRP2  (Q04KR9), DAPA_STRP4  (B5E4D5), 
DAPA_STRP7  (C1C6Z0), DAPA_STRPI  (B1IBH4), DAPA_STRPJ  (B8ZPG7), 
DAPA_STRPN  (Q97R25), DAPA_STRPS  (B2IPH2), DAPA_STRR6  (Q8DPZ9), 
DAPA_STRS2  (A4W0I7), DAPA_STRSV  (A3CN43), DAPA_STRSY  (A4VU96), 
DAPA_STRTD  (Q03K16), DAPA_STRU0  (B9DS79), DAPA_STRZJ  (C1CE08), 
DAPA_STRZP  (C1CK93), DAPA_STRZT  (C1CRD6), DAPA_SULDN  (Q30R77), 
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PHDJ_NOCSK  (Q79EM8)
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