Entry: PS01179

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PID
Accession [info] PS01179
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); NOV-1997 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00907
Associated ProRule [info] PRU00148

Name and characterization of the entry

Description [info] Phosphotyrosine interaction domain (PID) profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ARNDCQEGHILKMFPSTWYVBZX'; LENGTH=148; TOPOLOGY=LINEAR;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=10;N2=140;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.3685; R2=0.0249; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=396; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=356; N_SCORE=7.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; I=-20; D=-20;
...
                A   R   N   D   C   Q   E   G   H   I   L   K   M   F   P   S   T   W   Y   V   B   Z   X
/M: SY='N'; M=-11, -4,  0,-16,-24,-10,-13,-22,-10,  5,  3, -9,  5, -1,-15,-12, -7,-22, -5, -2, -8,-13,-10;
/M: SY='G'; M= -6,-10,  0, -9,-27,-10, -5,  6,-13,-17,-18,-11,-12,-12, -4, -1, -8,-23,-16,-17, -7, -9, -8;
/M: SY='D'; M= -3,-14, -3,  7,-27, -4, -2,  2,-12,-21,-15,-10,-13,-26,  0, -4,-10,-27,-19,-17,  1, -4, -8;
/M: SY='G'; M= -2,-17, -4,-14,-15,-15,-17, 14, -9,-14,-16,-18, -8,-18,-20,  1, -4,-26,-16, -7,-12,-17, -8;
/M: SY='V'; M= -5,-13,-19,-24,  9,-14,-19,-28,-23,  7, -3,-11,  1,-12,-26,-10, -5,-30,-12, 18,-21,-17,-12;
/M: SY='S'; M= -6, -3,  0,  1, -7,  3,  5,-17,-10,-18,-21,  3,-12,-24,-13,  4, -2,-31,-15,-13,  0,  3, -8;
/M: SY='F'; M=-20,-15,-20,-30,-24,-26,-25,-30, -1,  0,  5,-20,  0, 56,-30,-20,-10, 19, 53, -4,-25,-25,-10;
/M: SY='K'; M=  7,  0, -8,-12,-19,  0, -3,-15,-14, -9,-10,  7, -4,-19,-14,  0, -2,-23,-12, -1, -9, -1, -6;
/M: SY='A'; M= 26,-20,-19,-24,-10,-19,-19,-14,-24,  9,  0,-14,  0,-10,-19,  0,  0,-24,-15, 23,-19,-19, -4;
/M: SY='R'; M=-15, 31,  2, -7,-27,  1, -2,-19, -1,-22,-18, 21, -9, -7,-19, -9, -8,-13,  2,-17, -4, -2,-10;
/M: SY='Y'; M=-14,-13,-18,-21,-24,-13,-18,-26,  4,  1,  7,-16,  1, 25,-27,-14, -6,  9, 47, -4,-20,-18, -8;
/M: SY='L'; M=-10,-20,-26,-31,-21,-17,-21,-30,-19, 25, 39,-27, 25,  6,-26,-26,-10,-20,  0, 13,-28,-20,-10;
/M: SY='G'; M=  0,-20,  0,-10,-30,-20,-20, 70,-20,-40,-30,-20,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-30,-30,-10,-20,-10;
/M: SY='C'; M= -6,-21, -6,-21, 25,-16,-20,-20,-21, -9,-15,-21,-12,-12,-26, -2, -4,-16,-13, -6,-13,-18,-12;
/M: SY='V'; M= -4,-17,-19,-17,-15,-19,-20,-26,-21, 16,  8,-17,  9, -4,-23, -8,  2,-28, -8, 26,-16,-20, -8;
/M: SY='E'; M=-11, -4, -3, 14,-30, 14, 35,-19, -3,-23,-14,  2,-14,-28,  4, -4,-10,-28,-17,-25,  5, 24,-10;
/M: SY='V'; M= -3,-18,-24,-28,-14,-22,-25,-28,-24, 25, 14,-19, 16,  0,-25,-11,  1,-26, -6, 33,-25,-24, -8;
/I:         MD=-13;
/M: SY='l'; D=-2; M= -2,-11,-15,-17,-21,-12, -9,-19,-17, -4,  2,-10, -2, -2,  4, -9,  0,-18, -7, -5,-16,-11, -6;
/I:         MD=-13;
/M: SY='e'; D=-2; M= -9, 10,  2, 13,-23, 14, 25,-14, -1,-24,-19, 16,-12,-25, -5, -2, -7,-21,-12,-21,  8, 19, -7;
/I:         MD=-13;
/M: SY='s'; D=-2; M=  8, -5,  2, -2, -4, -1, -1,  0, -5, -8,-11, -4, -8, -9, -4, 15,  7,-16, -9, -3, -1, -1,  0;
/I:         MD=-13;
/M: SY='m'; D=-2; M= -3, -2, -1,  0, -6,  1,  1, -4,  0, -1,  0,  0,  5, -4, -3, -2, -2, -7, -2, -2,  0,  1, -2;
/I:         MD=-13; DM=-13;
/M: SY='r'; D=-2; M= -4, 16,  0, -2, -7,  2,  0, -5,  0, -7, -5,  9, -2, -5, -4, -2, -2, -5, -2, -5, -2,  0, -2;
/I:         MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13; I=-5;
/M: SY='t'; D=-2; M=  4, -3,  0, -2, -2, -1, -1, -2, -4, -3, -3, -2, -3, -4, -2,  5,  7, -7, -4,  0,  0, -1,  0;
/I:         MD=-13; DM=-13;
/M: SY='l'; D=-2; M= -2, -5, -6, -5, -7, -4, -2, -6, -5,  0,  3, -5,  0, -2,  6, -5, -2, -6, -3, -2, -6, -4, -2;
/I:         MD=-13; DM=-13;
/M: SY='d'; D=-2; M= -1, -2,  4, 10, -5,  0,  2, -1, -1, -8, -7, -1, -6, -8, -2,  4,  0,-10, -5, -5,  7,  1, -1;
/I:         MD=-13; DM=-13;
/M: SY='f'; D=-2; M= -4,  0, -2, -5, -6, -4, -3, -6, -4, -3, -2,  1, -1,  8, -5, -4, -2,  0,  3, -2, -4, -3, -2;
/I:         MD=-13; DM=-13;
/M: SY='n'; D=-2; M= -2,  0, 15,  5, -5,  0,  0,  0,  2, -5, -7,  0, -5, -5, -5,  2,  0,-10, -5, -7, 10,  0, -2;
/I:         MI=-13; MD=-13; IM=-13; DM=-13; I=-5;
/M: SY='t'; D=-2; M= -1, -4,  3, -3, -5, -4, -4, -7, -5,  1, -2, -4, -1, -3, -6,  2,  6,-11, -4,  1,  0, -4, -2;
/I:         DM=-13;
/M: SY='r'; D=-2; M= -7, 23,  0, -4,-14,  1, -2,  0, -2,-15,-10,  8, -5,-10, -9, -3, -5, -9, -6,-10, -4, -2, -4;
/I:         DM=-13;
/M: SY='t'; D=-2; M=  0, -5, -1, -5, -7, -3, -5,  1, -5, -5, -5, -5,  1, -6, -6,  4,  6,-12, -6, -2, -3, -4, -2;
/I:         DM=-13;
/M: SY='m'; D=-2; M= -6, -3, -4,  0,-16,  7,  0,-10,  0, -4, -4, -1,  7,-13,  3, -5, -5,-14, -6, -8, -1,  3, -5;
/I:         DM=-13;
/M: SY='v'; D=-2; M=  6,-11,-15,-17,-14, -1,-10,-18,-14,  6,  2,-10,  3,-11,-18, -4, -3,-21, -9, 12,-15, -6, -6;
/I:         DM=-13;
/M: SY='r'; D=-2; M=  4, 11, -5,-13,-17, -5, -8, -4,-12,-14,-12,  1, -7,-15,-14,  1,  2,-20,-13, -4, -9, -8, -5;
/I:         DM=-13;
/M: SY='R'; M= -9,  7, -7, -9,-13,  0, -1, -2,-11,-23,-19,  0,-11,-24, -9, -5,-11,-26,-19,-16,-10, -2,-11;
/M: SY='E'; M=-11, -3,  4, 28,-27, 12, 43,-17, -2,-30,-21,  5,-21,-30, -3,  2, -3,-32,-18,-26, 17, 28, -8;
/M: SY='A'; M= 13,-10,-13,-12,-17, -6,  1,-15,-16, -4, -3, -3, -4,-15,-14, -3, -4,-24,-14,  2,-11, -2, -6;
/M: SY='I'; M=  9,-22,-14,-28,-20,-13,-20,-21,-21, 21,  5,-19, 11, -7,-16, -4, -3,-22, -8, 16,-20,-19, -6;
/M: SY='S'; M= -2,-10,  9, -2,-20, -4, -4, -3,  0,-17,-18,-11,-12,-18, -3, 11,  5,-32,-14,-16,  0, -6, -5;
/M: SY='G'; M= -3,  6, -5,-11,-13,  5, -4,  0, -9,-23,-16,  1, -8,-25,-18, -5,-11,-22,-16,-19, -9,  0, -9;
/M: SY='V'; M=  0, -8,-10, -5,-20,-12,-11,-20,-17,  2, -1,-10, -2,-14,-18, -6, -5,-26,-11,  8, -6,-13, -8;
/M: SY='S'; M= -2,  6, -4,-11, -9, -2, -6,-16, -1,-17,-13,  0, -8,-12,-19,  0, -2,-22, -2,-11, -9, -6, -7;
/M: SY='R'; M=-12,  9, -5,-11, -9,  0,  0,-19,  4,-17,-11, -1,  0, -7,-18, -5, -7,-24, -5,-13, -9, -1, -9;
/M: SY='A'; M=  8,  1,-10,-15,-19,  7, -4,-14, -8, -6, -7,  3,  6,-19,-14, -3, -5,-21,-11, -2,-10,  0, -6;
/I:         MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; I=-3;
/M: SY='T'; M=  0, -9, -8,-13,-21,  3, -7, -8,-11, -8,-10, -7,  2,-19, -4,  0,  4,-24,-13, -6,-10, -2, -6;
/M: SY='E'; M= -4, 10, -4, -2,-26,  4, 13,-16, -9,-23,-21,  9,-14,-24,  9,  0,  0,-26,-17,-19, -4,  6, -7;
/M: SY='I'; M= -3,-23,-14,-26,-23,-19,-24, -9,-25, 18,  1,-23,  4, -8,-21, -6, -6,-24,-10, 16,-22,-24, -8;
/M: SY='T'; M=-10, -7, -5, -3,-26, -3,  0,-20, -2,-12,-10, -4, -7,-14,-15, -5, -1, -8, -2,-12, -3, -2, -8;
/M: SY='L'; M= -8,-21,-21,-20,-21,-19,-20,-30,-22, 22, 23,-24, 11,  0,-25,-19, -7,-24, -4, 19,-20,-21,-10;
/M: SY='H'; M= -9,  0,  5, -7,-20, -4, -6,-15, 17,-15,-10, -9, -5, -3,-19,  1,  0,-26,  0,-13, -3, -6, -7;
/M: SY='V'; M= -5,-23,-26,-33,-19,-24,-28,-33,-28, 36, 18,-25, 15,  1,-26,-16, -5,-24, -4, 37,-30,-28,-10;
/M: SY='S'; M=  9,-12,  0, -8,-11, -5, -5, -7,-13,-10,-11,-13,-10,-13,-13, 22, 15,-33,-15, -4, -6, -5, -1;
/M: SY='T'; M= -7,-14,-11,-17,-24, -5,-12,-16,-14,  0, -1,-14,  0, -9, -6, -5,  4,-18, -1, -4,-14,-11, -7;
/M: SY='D'; M= -3, -5,  4, 19,-22,  4,  6,-11, -6,-22,-17,  0,-14,-26,-12,  4, -3,-31,-15,-16, 13,  5, -6;
/M: SY='G'; M= -3, -3,  6, -2,-25, -6, -3, 25,-11,-30,-25, -6,-17,-24,-15,  5, -4,-26,-22,-23,  0, -5, -8;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-21,-20,-21,-19,-19,-29,-21, 21, 25,-24, 11,  0,-25,-20, -7,-24, -4, 18,-20,-20,-10;
/M: SY='K'; M= -9, 18,  3, -3,-25,  4,  6,-19, -8,-18,-19, 18, -9,-21,-12, -1,  0,-25,-11,-14,  0,  3, -8;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-22,-31,-19,-23,-25,-32,-25, 26, 20,-25, 12,  9,-24,-15,  0,-20,  0, 22,-26,-25, -8;
/M: SY='L'; M= -2,-12,-19,-27,-20,-14,-19,-25,-19, 17, 19,-18, 14, -1,-22,-14, -6,-22, -5, 13,-23,-18, -8;
/M: SY='D'; M=-10, -4, 15, 34,-25,  0,  8,-11,  7,-28,-24,  2,-18,-30,-13,  0, -8,-34,-13,-21, 27,  3, -9;
/M: SY='A'; M=  8,-12, -7, -3,-22,  1,  6,-16,-12, -7,-10, -6, -8,-22, -4,  0, -5,-25,-16, -5, -3,  3, -6;
/M: SY='K'; M= -7,  5,  3, 16,-26, 12, 20,-16, -5,-27,-23, 16,-15,-30, -7,  0, -3,-27,-14,-21, 11, 16, -8;
/M: SY='T'; M= -3,-11,  2, -8, -3,-10, -9,-18,-17,-13,-15,-10,-13,-14, -1, 12, 32,-32,-15, -7,  0,-10, -3;
/M: SY='K'; M= -8, 14,  0,  0,-30, 16, 11, -2, -5,-29,-25, 20,-10,-31,-11, -4,-11,-21,-15,-25, -1, 13,-10;
/M: SY='N'; M=  4, -7,  9,  4,-21,  3,  4, -2, -5,-17,-18, -3,-12,-24,-14,  3, -5,-28,-18,-14,  7,  3, -7;
/M: SY='I'; M= -5,-17,-15,-22,-22, -8,-15,-26,-20, 14,  3,-17,  4, -9, -8, -5,  1,-25, -8, 11,-19,-13, -7;
/M: SY='I'; M= -8,-17,-17,-25,-23, -9,-13,-29,-16, 21, 17,-18, 20, -2,-18,-14, -2,-22, -3, 11,-19,-13, -8;
/M: SY='A'; M=  4,-14,-14,-20,-20,-10,-16, -9,  2, -2,  1,-14,  5, -3,-21, -9, -8,-12,  8, -1,-16,-15, -7;
/M: SY='E'; M=-12, -5, 10, 20,-25,  3, 20,-16,  5,-22,-14, -2,-14,-23,-11,  0, -3,-32,-13,-22, 16, 11, -8;
/M: SY='H'; M=-17, -4,  2, -7,-12,  5, -4,-22, 64,-25,-16,-12, -2,-11,-22,-10,-16,-27, 12,-24, -5, -2,-11;
/M: SY='P'; M= -1, -4, -7, -7,-28, -1,  3,-16,  1,-20,-20, -3,-13,-23, 24, -2, -3,-27,-15,-20, -9, -2, -7;
/M: SY='V'; M= -6,-17,-22,-28,-20,-10,-20,-29,-18, 24, 18,-19, 20, -2,-24,-16, -6,-23, -4, 21,-24,-16,-10;
/M: SY='R'; M=-13, 18,  3, -1,-30,  7,  5, -8,  5,-27,-23,  7,-13,-25,  2, -4,-10,-25,-15,-26, -2,  3,-10;
/M: SY='K'; M= -8,  7,  3, -9,-22, -3, -5,-18,-11,-12,-16,  8, -7, -8,-15,  0,  2,-22, -6, -9, -3, -5, -7;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-23,-36,-24,-22,-28,-36,-28, 42, 21,-27, 17,  1,-23,-18, -7,-22, -2, 32,-30,-28,-10;
/M: SY='S'; M= 10,-10, 10,  0,-10,  0,  0,  0,-10,-20,-30,-10,-20,-20,-10, 40, 20,-40,-20,-10,  0,  0,  0;
/M: SY='F'; M=-17,-21,-20,-36, -7,-33,-28,-31,-17,  2,  6,-27,  0, 54,-29,-18,-10,  2, 26,  1,-27,-28,-11;
/M: SY='I'; M=  3,-14,-16,-28,  6,-15,-20,-24,-22,  5,  2,-17,  0,-10,-22,-10, -7,-26,-12,  6,-20,-20, -9;
/M: SY='A'; M= 38,-18, -9,-18,-10,-10,-10, -3,-19, -6,-10,-11, -9,-17,-12, 12,  2,-24,-18,  4,-10,-10, -1;
/M: SY='D'; M=-11, -2, -5,  3,-31,  2, -1, -5, -9,-22,-21, -3,-13,-24, -7, -7,-12, -6,-12,-20, -1,  0,-11;
/I:         MI=-28; MD=-28; IM=-28; I=-5;
/M: SY='g'; D=-5; M= -3, -9,  0,  0,-13, -6, -6, 10, -8, -7, -7, -8, -5,-10, -7, -2, -6,-11, -8, -6,  0, -7, -4;
/I:         MD=-28; DM=-28;
/M: SY='g'; D=-5; M= -3,  3, -3, -7,-15, -6, -7, 10, -9,-13,-12,  0, -6,-13,-12, -3, -7,-13,-11, -6, -7, -7, -5;
/I:         DM=-28;
/M: SY='D'; M=-16,-10, 22, 54,-28, -2, 12,  0, -1,-37,-30, -2,-27,-36,-12,  1,-10,-37,-21,-30, 41,  5,-10;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-11,-11,-25, -7, -9,-22,-13, -1, -6, -4,  3,-14,  0, -9, -4,-26,-12,  0,-12,-11, -9;
/M: SY='D'; M=-10, -3,  9, 17,-22, -1,  7,-16,  3,-20,-19,  0,-13,-23,-13,  1,  3,-32,-11,-13, 14,  2, -8;
/I:         MI=-32; MD=-32; IM=-32; I=-6;
/M: SY='s'; D=-6; M=  0,  2, -2, -5, -6, -3, -4, -7, -6, -3, -5, -1, -3, -5, -7,  4,  6,-13, -5,  2, -4, -4, -2;
/I:         DM=-32;
/M: SY='D'; M=-13,-12, -1,  6,-24, -8, -6, -8,  1,-15, -5,-12,  0, -8,-18, -8, -7,-24, -5,-12,  3, -7, -9;
/M: SY='A'; M=  1, -2, -1,-12,-18, -5, -3,-14, -9, -8, -4, -6,  0, -4,-16,  0,  0,-22, -8, -7, -6, -4, -6;
/M: SY='R'; M= -3, 13,  0, -1,-22,  1,  8,-14, -6,-22,-18,  4,-14,-12,-13,  4, -2,-24,-11,-16, -2,  4, -6;
/M: SY='R'; M=  0,  2, -9,-19,-22,-10,-14,-11,-10, -8, -7, -5, -5,  0,-19, -5, -2,-10,  4, -5,-14,-14, -6;
/M: SY='F'; M=-14, -8,-14,-20,-21,-21,-19,-26,-15,  3,  3,-15,  5, 25,-24,-14, -8,-11,  7,  5,-17,-19,-10;
/M: SY='A'; M= 27, -8, -4,-14,-16, -8, -9, 11,-16,-19,-17, -7,-13,-21,-13,  8, -3,-22,-20, -9, -8, -9, -3;
/M: SY='Y'; M=-11, -4,-16,-20,-27, -7,-17,-25,  9,  0,  0, -7,  2, 15,-25,-15, -8, 13, 50, -6,-18,-16, -8;
/I:         MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; I=-3;
/M: SY='S'; M=  3,-11,  0,-13, -4, -8,-11, -4,-14,-10,-15, -7, -4,-17,-17,  3, -2,-29,-16, -7, -6,-10, -7;
/M: SY='C'; M=-10,-21,-12,-21, 74,-14,-20,-19,-11,-29,-20,-22,-15,-23,-32, -8,-11,-41,-22,-16,-14,-18,-16;
/M: SY='H'; M=-20, -1,  6, -2,-29,  7, -2,-21, 91,-26,-17,-10,  0,-14,-21,-11,-18,-23, 26,-27, -2, -2,-10;
/M: SY='V'; M= -2, -8,-15,-22,-22, -6,-16,-15,-12,  6,  0,-10,  8, -8,-21, -9, -7,-17, -1,  8,-18,-13, -8;
/M: SY='F'; M=-17,-21,-21,-37, -5,-36,-28,-29,-21,  0, 12,-29,  0, 59,-31,-20,-10,  0, 19,  0,-28,-28,-11;
/M: SY='E'; M=-14,  0,-10,-12,-27, -5,  3,-23, -1,-15, -5, -7, -7,  4,-17,-11, -7,  0,  3,-15,-11,  0,-10;
/M: SY='C'; M=  9,-21,-10,-19, 37,-18,-18, -8,-22,-18,-17,-19,-14,-18,-24,  6, -1,-36,-23, -3,-13,-18, -9;
/M: SY='E'; M= -8,-14,-12, -7, -3, -3, 12,-26,-15, -6, -9, -9, -8,-19, -6, -7, -8,-31,-17, -6, -9,  3,-11;
/M: SY='K'; M= -5,  5, -3,  5,-28,  3, 11,-17, -6,-24,-23, 18,-13,-23,  0, -6, -8,-19, -6,-20,  1,  6, -8;
/I:         MD=-24;
/M: SY='t'; D=-5; M= -2, -5,  2,  3, -9, -4, -2,  5, -6,-11, -9, -4, -7,-10, -5,  3,  6,-12, -8, -7,  3, -3, -2;
/I:         MI=-24; MD=-24; IM=-24; DM=-24; I=-5;
/M: SY='g'; D=-5; M= -1, -3,  1,  5, -5, -2,  0,  6, -2, -7, -5, -2, -4, -6, -3,  0, -3, -5, -5, -5,  3, -1, -1;
/I:         DM=-24;
/M: SY='q'; D=-5; M= -1,  3,  0,  0, -5,  7,  3, -3,  0, -4, -4,  5,  0, -7, -1,  0, -1, -3, -1, -5,  0,  5, -1;
/I:         DM=-24;
/M: SY='l'; D=-5; M=  0, -9, -3, -8,-17,  0, -3,-12, -7, -4,  0, -9, -2,-11, -2, -2, -2,-21,-10, -8, -6, -2, -5;
/I:         DM=-24;
/M: SY='A'; M= 39,-17, -7,-16,-10, -9, -9,  7,-17,-11,-10, -9, -9,-18, -9,  7, -2,-17,-18, -3, -8, -9, -1;
/M: SY='E'; M=  0,  3,  0,  4,-22, 22, 24,-13, -1,-21,-18,  9,-10,-27, -5,  3, -5,-22,-14,-20,  2, 23, -6;
/M: SY='D'; M= -8,  0,  6,  9,-22,  2,  3,-11, -4,-17,-15, -2,-12,-21, -2,  2, -2,-28,-14,-17,  7,  1, -7;
/M: SY='I'; M= -7,-21,-22,-30,-20,-19,-23,-30,-23, 31, 25,-25, 16,  3,-22,-19, -7,-19, -1, 23,-26,-23, -8;
/M: SY='A'; M= 12,-16, -9,-17,-11,-12,-13,-13,-19,  5, -4,-13, -2, -9,-14,  7,  7,-25,-11, 12,-12,-13, -3;
/M: SY='L'; M= -4, -7, -6, -8,-17,  1,  0,-18,  0, -5, -1, -9, -1,-12,-14,  0,  2,-25, -6, -3, -7,  0, -6;
/M: SY='A'; M= 15,-11,  1,  0,-11, -5, -3, -6,-13,-14,-15, -7,-13,-17, -8, 17, 16,-27,-15, -5,  2, -4, -1;
/M: SY='I'; M= -6,-20,-22,-29,-18,-18,-23,-29,-21, 29, 22,-22, 18,  2,-22,-17, -6,-20, -2, 26,-26,-22, -8;
/M: SY='G'; M= -6,  1,  1, -5,-26,  0, -6, 24,  2,-30,-23, -1,-11,-25,-15, -3,-14,-19,-14,-24, -5, -3, -8;
/M: SY='Q'; M= -4, -4,  0, 13, -9, 16, 18,-14, -2,-24,-18,  0,-13,-29, -9,  0, -7,-27,-16,-21,  9, 17, -8;
/M: SY='A'; M= 25,-19,-14,-22,-13,-12,-13,-10,-19,  4,  6,-15,  0, -9,-14, -2, -3,-17,-11,  5,-15,-13, -3;
/M: SY='F'; M=-15,-20,-17,-33, 14,-33,-26,-26,-20, -6,  2,-26, -4, 48,-29,-15, -8, -4, 13, -2,-24,-26,-11;
/M: SY='S'; M=  0, -4,  1,  4,-19, 13, 11,-10, -2,-16,-15,  0, -5,-23, -8,  8,  0,-26,-13,-14,  3, 12, -5;
/M: SY='V'; M= -4,-11,-23,-23,-14,-18,-18,-25,-20, 16, 18,-13, 10,  0,-24,-16, -4,-22, -5, 22,-23,-18, -8;
/M: SY='R'; M=  2,  1,-11,-21, -5, -9,-14,-20,-16,  1, -3, -6, -1,-11,-18, -6, -5,-21,-10,  5,-16,-14, -7;
/M: SY='Y'; M=-15,-12,-18,-24,-22,-15,-20,-25,  2,  4,  9,-15,  9, 33,-25,-18, -8, 11, 42, -2,-21,-19, -8;
/M: SY='K'; M= -6,  8,  7,  6,-23, 19, 18,-13,  0,-22,-22, 15,-10,-26, -8,  3, -4,-24,-13,-22,  6, 19, -7;
/M: SY='E'; M= -9, 15, -5, -3,-23, 11, 13,-19, -4,-14, -9, 10, -4,-19,-12, -6, -7,-21,-10,-11, -5, 11, -8;
/M: SY='K'; M=-13,  8, -9,-16, -8, -9, -9,-22, -7,-15,-11,  7, -6,  8,-20,-12, -8, -7, 10,-10,-12, -9,-10;
/M: SY='L'; M=-10,  5,-14,-15,-22,  0, -5,-22,-10, -2, 13,  0,  6, -7,-19,-17, -8,-17, -4, -4,-15, -3, -8;
/M: SY='R'; M=-14, 24, 12, 14,-25,  5,  6,-13,  5,-27,-23, 18,-13,-24,-13, -4, -8,-25,-10,-21, 12,  4, -8;
/M: SY='A'; M= 12,  2,  2, -2,-17,  2,  9, -8, -7,-18,-16,  6,-12,-20, -8,  4, -2,-22,-15,-13,  0,  5, -4;
/I:         MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28; I=-3;
/M: SY='P'; M=  2, -9,  0,  4,-24,  0, 14,-10, -8,-19,-20, -2,-16,-24, 18,  0, -5,-26,-20,-20,  2,  6, -6;
/M: SY='E'; M= -5, -4, -5, -3,-24,  1,  8, -5, -7,-16,-15,  0, -1,-20,  4, -1, -6,-23,-15,-16, -5,  4, -7;
/M: SY='A'; M=  8, -3, -7, -4,-17, -6, -3,-13,-14, -9, -7,  4, -5,-17,-13, -4, -4,-21,-11, -1, -3, -4, -6;
/M: SY='L'; M=  0, -2,-10,-15,-15, -8, -8,-17,-14, -2,  4, -5,  0, -7,-17, -3,  2,-21, -8,  1,-12, -8, -5;
/M: SY='V'; M= -2,  4,-11,-16,-17, -3,-10,-19,-12,  1,  0, -4,  0,-10,-18, -3, -2,-22, -9,  6,-15, -8, -7;
/M: SY='Q'; M= -3,  2,  0,  3,-22, 10,  8, -6, -4,-20,-13,  0, -9,-23,-11,  0, -3,-22,-13,-17,  1,  8, -7;
/M: SY='P'; M= -8, -5,  0, -5,-23, -2,  0,-18,  0, -8,-13, -1, -6,-16,  1, -3, -1,-25, -9, -8, -3, -2, -7;
/M: SY='S'; M=  2, -7,  6,  0,-19,  4,  5,  0,  2,-21,-21, -4,-13,-22, -4,  9, -2,-27,-15,-19,  1,  4, -5;
/M: SY='K'; M=-10,  0, -1,  2,-27,  0,  6, -8, -4,-22,-20,  7,-14,-15,-13, -6, -9,  1,  0,-21,  0,  3, -9;
/M: SY='R'; M= -1, 16, -3, -9,-19,  0, -2,-14, -9,-15,-10, 10, -6,-15,-13,  0,  2,-21, -9, -8, -7, -2, -5;
/M: SY='V'; M=  1,-13, -5,  1,-14, -9, -6,-12,-12, -3, -6,-10, -2,-14,-15,  2,  0,-28,-12,  4,  0, -7, -5;
/M: SY='V'; M= -1, -5,-11, -8,-19, -9, -7,-19,-10,  0,  1, -7, -1, -7,-18, -8, -5,-17,  0,  2, -9, -9, -7;
/M: SY='E'; M= -9, -1, -3,  1,-23, -2,  5, -6,  0,-14,-10, -4, -7,-18,-14, -6,-10,-24,-11,-10, -2,  0, -8;
/M: SY='N'; M= -8,-10, 16,  5,-24, -9, -4,  7, -6,-22,-23, -8,-17,-15,  2,  0, -7,-25,-17,-24,  9, -7, -8;
/M: SY='T'; M= -7,-11, -5, -5,-20,-11, -5, -9, -5,-13,-11,-11, -9, -6, -4,  0,  3,-21, -7, -7, -5, -8, -6;
/M: SY='Q'; M= -2, -4,  1, -1,-22, 16,  5, 11, -4,-24,-22, -3,-11,-28,-11,  7, -5,-22,-17,-22, -2, 10, -6;
/M: SY='S'; M=  0, -9,  0,  2,-16, -1,  7, -9,-10,-14,-20, -6,-14,-19,  0, 15,  5,-31,-17, -8,  0,  2, -4;
/M: SY='A'; M= 12,-11,-11,-12,-18,  0,  0,-11,-10, -6, -2, -7,  1,-16,  0, -3, -5,-20,-13, -7,-10,  0, -5;
/M: SY='W'; M=-13,-16,-25,-30,-27,-17,-22,-24,-14,  5, 10,-19,  6, 17,-24,-25,-14, 35, 20, -2,-27,-19,-11;
/M: SY='P'; M= -3,-12,  0, -2,-25, -7, -6,  1, -6,-15,-16, -8, -6,-16,  6, -4, -8,-19, -9,-17, -2, -8, -8;
/M: SY='S'; M=  1,-12,  1,  7,-20, -4,  3, -1,-11,-18,-19, -7,-15,-22,  0,  8,  0,-27,-18,-14,  3, -1, -5;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 111 in 103 different sequences
Number of true positive hits 111 in 103 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 6
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 94.87 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PID
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
103 sequences

ANS1A_HUMAN (Q92625), ANS1A_MOUSE (P59672), ANS1B_DANRE (A5PMU4), 
ANS1B_HUMAN (Q7Z6G8), ANS1B_MOUSE (Q8BIZ1), ANS1B_RAT   (P0C6S7), 
APBA1_HUMAN (Q02410), APBA1_MOUSE (B2RUJ5), APBA1_RAT   (O35430), 
APBA2_HUMAN (Q99767), APBA2_MOUSE (P98084), APBA2_PONAB (Q5RD33), 
APBA2_RAT   (O35431), APBA3_HUMAN (O96018), APBA3_MOUSE (O88888), 
APBA3_RAT   (O70248), APBB1_HUMAN (O00213), APBB1_MOUSE (Q9QXJ1), 
APBB1_RAT   (P46933), APBB2_HUMAN (Q92870), APBB2_MOUSE (Q9DBR4), 
APBB3_HUMAN (O95704), APBB3_MOUSE (Q8R1C9), APBB3_RAT   (O35827), 
ARHA_XENLA  (Q801G1), ARHB_XENLA  (Q67FQ3), ARH_HUMAN   (Q5SW96), 
ARH_MOUSE   (Q8C142), CAPON_DROME (Q8SXX4), CAPON_HUMAN (O75052), 
CAPON_MOUSE (Q9D3A8), CAPON_RAT   (O54960), CCM2_DANRE  (Q6DRP4), 
CCM2_HUMAN  (Q9BSQ5), CCM2_MOUSE  (Q8K2Y9), CED6_CAEEL  (O76337), 
CED6_DROME  (Q7JUY7), DAB1_HUMAN  (O75553), DAB1_MACFA  (Q9BGX5), 
DAB1_MOUSE  (P97318), DAB1_RAT    (Q8CJH2), DAB2_HUMAN  (P98082), 
DAB2_MOUSE  (P98078), DAB2_RAT    (O88797), DAB_DROME   (P98081), 
DP13A_HUMAN (Q9UKG1), DP13A_MOUSE (Q8K3H0), DP13B_HUMAN (Q8NEU8), 
DP13B_MOUSE (Q8K3G9), DYC1_CAEEL  (Q8STF6), ES8L2_HUMAN (Q9H6S3), 
ES8L2_MOUSE (Q99K30), GULP1_DANRE (Q32PV0), GULP1_HUMAN (Q9UBP9), 
GULP1_MOUSE (Q8K2A1), GULP1_RAT   (Q5PQS4), JIP1_DROME  (Q9W0K0), 
JIP1_HUMAN  (Q9UQF2), JIP1_MOUSE  (Q9WVI9), JIP1_RAT    (Q9R237), 
JIP2_HUMAN  (Q13387), JIP2_MOUSE  (Q9ERE9), LIN10_CAEEL (O17583), 
NUMB1_CAEEL (Q9XTY6), NUMBL_HUMAN (Q9Y6R0), NUMBL_MOUSE (O08919), 
NUMBL_RAT   (A1L1I3), NUMB_DROME  (P16554), NUMB_HUMAN  (P49757), 
NUMB_MOUSE  (Q9QZS3), NUMB_RAT    (Q2LC84), PCLI1_HUMAN (Q7Z2X4), 
PCLI1_MOUSE (Q3UBG2), RBG1L_CHICK (Q5ZJ17), RBG1L_HUMAN (Q5R372), 
RBG1L_MOUSE (A6H6A9), RBG1L_PONAB (Q5RCW6), RBGP1_HUMAN (Q9Y3P9), 
RBGP1_MOUSE (A2AWA9), RBGP1_PONAB (Q5RAN1), RGS12_HUMAN (O14924), 
RGS12_MOUSE (Q8CGE9), RGS12_RAT   (O08774), RGS_DROME   (Q9VCX1), 
SHC1_BOVIN  (Q0IIE2), SHC1_HUMAN  (P29353), SHC1_MOUSE  (P98083), 
SHC1_PONAB  (Q5R7W7), SHC1_RAT    (Q5M824), SHC1_XENLA  (Q8AY68), 
SHC2_HUMAN  (P98077), SHC2_MOUSE  (Q8BMC3), SHC2_RAT    (O70142), 
SHC3_HUMAN  (Q92529), SHC3_MOUSE  (Q61120), SHC3_RAT    (O70143), 
SHC4_HUMAN  (Q6S5L8), SHC4_MOUSE  (Q6S5L9), TBCD1_BOVIN (O97790), 
TBCD1_HUMAN (Q86TI0), TBCD1_MOUSE (Q60949), TBCD4_HUMAN (O60343), 
TBCD4_MOUSE (Q8BYJ6)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
6 sequences

ES8L2_PONAB (Q5RC07), ITBP1_BOVIN (Q3ZBM4), ITBP1_HUMAN (O14713), 
ITBP1_MOUSE (O35671), ITBP1_PONAB (Q5R5S7), SH2D5_MOUSE (Q8JZW5)
» More

PDB
[Detailed view]
33 PDB

1AQC; 1DDM; 1M7E; 1N3H; 1NTV; 1NU2; 1OQN; 1OY2; 1P3R; 1SHC; 1WGU; 1WJ1; 1X11; 2DYQ; 2EJ8; 2ELA; 2L1C; 2M38; 2NMB; 2ROZ; 2YSZ; 2YT0; 2YT1; 3D8D; 3D8E; 3D8F; 3DXC; 3DXD; 3DXE; 3F0W; 3SUZ; 3SV1; 4DBB
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission