ID   BROMODOMAIN_2; MATRIX.
AC   PS50014;
DT   01-NOV-1995 CREATED; 18-JUN-2025 DATA UPDATE; 18-JUN-2025 INFO UPDATE.
DE   Bromodomain (BrD) profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=106;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=101;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9910014; R2=0.0061618; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1300; N_SCORE=10.0; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=732; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='RR';
MA   /DEFAULT: M0=-22; D=-150; I=-150; B1=-1000; E1=-1000; MI=-380; MD=-380; IM=-380; DM=-380;
MA   /I: B1=0; BI=-380; BD=-380;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-18,-41,5,-34,-46,-23,-25,40,-22,-61,-37,-8,3,49,20,-25,-26,24,8;
MA   /M: SY='M'; M=-29,-73,1,0,-61,-9,23,-3,6,21,43,15,1,1,-1,-2,-30,9,-77,-20;
MA   /M: SY='S'; M=-12,-27,-5,5,-34,-69,-61,-6,23,17,19,-20,-2,20,5,23,7,3,-77,-39;
MA   /M: SY='N'; M=-37,-76,33,26,-78,-13,3,-54,21,-59,0,50,37,34,-24,-2,-2,-31,-83,-68;
MA   /M: SY='E'; M=5,-27,15,35,-42,-68,-61,0,33,-20,-32,-1,28,30,-37,-2,-17,2,-78,-39;
MA   /M: SY='L'; M=-40,-17,2,-5,22,-18,-64,8,-51,48,39,-2,4,-21,-15,-48,-5,-19,-10,-55;
MA   /M: SY='Q'; M=-48,-77,-21,5,-3,-71,16,-19,48,-22,36,-30,-20,54,21,-12,-6,-47,-6,24;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-75,2,16,-68,-45,15,-5,41,-17,-2,-38,-68,36,36,-26,1,8,-77,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-18,-40,-37,-4,14,-28,-35,6,51,10,-23,-32,-31,29,-8,-7,-12,7,-71,-23;
MA   /M: SY='C'; M=-23,105,-45,-56,9,-78,-70,15,-49,45,45,-71,-81,-27,-48,-32,-60,-39,-76,-33;
MA   /M: SY='K'; M=-37,-74,11,24,-17,-19,4,-50,40,-30,-17,31,-67,15,21,34,-36,-69,-73,18;
MA   /M: SY='E'; M=5,-73,-28,51,20,-18,-58,-25,-1,-46,-10,-6,-44,27,8,15,10,-15,-72,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-22,-70,-80,-48,14,-81,-74,50,-72,27,43,-74,-76,-71,-43,-34,-18,58,-73,-23;
MA   /I: I=-9; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-73,-23,-22,-21,-86,-69,20,-75,75,9,-79,-82,-70,-50,-76,-64,-7,-71,6; D=-9;
MA   /I: I=-9; MD=-22;
MA   /M: SY='D'; M=-47,-79,47,44,-76,-49,-12,-75,22,-23,-68,8,-28,13,23,10,-1,-54,-9,-28; D=-9;
MA   /I: I=-9; MD=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=13,-29,-27,10,2,-5,-63,-63,0,6,13,7,-73,30,14,4,-12,-21,-77,-30; D=-9;
MA   /I: I=-9; MD=-22;
MA   /M: SY='L'; M=-21,-76,-88,-81,1,-88,-77,39,-78,56,27,-83,-85,-75,-22,-77,-65,20,-76,-34; D=-9;
MA   /I: I=-9; MD=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-36,-95,-11,-58,16,-93,-19,1,-24,-36,-25,-14,-95,-82,-10,2,-51,-4,-25,-10; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
MA   /M: SY='K'; M=-17,-90,17,-22,-91,-57,-73,-86,36,-37,16,-17,-83,22,-17,17,-32,-83,-95,-81; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-18,-6,-12,-30,-74,24,32,-56,25,-36,-30,24,-78,0,0,-16,-28,-61,-81,22; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-59,-8,2,-23,-46,-79,73,-21,16,-16,-62,-23,-78,32,40,-39,-35,-11,-83,3; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-34,-30,26,24,-37,-34,-63,-76,25,-13,-68,-16,48,6,27,-16,-26,-75,-82,-30; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-38,-8,3,-38,20,-24,26,16,-2,16,14,-9,4,-63,23,-27,-49,-21,11,-10; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='S'; M=39,19,-40,-44,5,-24,-63,-52,-63,-69,-31,8,-70,-18,-67,59,25,-46,-75,18; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='W'; M=5,-79,29,1,-3,-12,-14,-69,11,-3,-64,-37,-26,-34,19,-1,-33,-37,95,-25; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='P'; M=-5,-29,-41,-38,-18,-74,-69,13,-3,7,-17,-69,80,19,-33,-45,-14,-2,-76,-26; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='F'; M=-48,-72,-86,-82,112,-45,-69,-49,-48,-1,-51,-76,-85,-85,-75,-73,-30,-35,-46,-6; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='H'; M=-2,-73,-62,13,-25,-72,38,-12,-2,29,10,-14,-71,28,30,3,0,-16,-76,-28; D=-9;
MA   /I: I=-9; DM=-22;
MA   /M: SY='Q'; M=-37,-75,-28,36,-29,-29,30,-70,44,-57,-62,21,-66,46,17,7,13,-14,-76,-10;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-29,-82,-70,-60,-70,-43,-69,-36,-1,27,-56,-30,104,-65,-21,-65,-60,-23,-78,-72; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='V'; M=-40,-74,-77,-69,-37,-42,-77,11,-71,2,-10,-75,70,-32,-75,-19,-55,70,-82,-65; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-59,-74,79,-14,-78,-39,-57,-6,-33,-52,-70,41,8,-54,-44,44,10,-68,-91,-69; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-76,26,-40,-70,-44,-13,-61,46,15,-58,-6,42,-24,26,-15,-22,-4,-80,-66; D=-11;
MA   /I: I=-11; MD=-27;
MA   /M: SY='K'; M=-49,6,12,21,-43,-25,-24,-12,51,-43,-64,20,-70,-1,11,10,-58,11,-82,-43; D=-11;
MA   /I: I=-11; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
MA   /M: SY='E'; M=-43,2,25,44,3,5,-61,-35,7,2,3,28,-72,-8,-40,-61,-15,-46,-77,1; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=17,-40,-45,-48,2,-29,14,27,-17,16,-48,-38,-33,-39,-68,-8,-59,26,-65,55; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='P'; M=-35,-84,-3,-3,-79,-70,9,-69,-20,-26,-66,-65,106,-25,-20,-38,5,-33,-82,-75; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='D'; M=-20,-77,93,-10,-27,1,-28,-24,-17,-29,-23,25,-69,-27,-35,-31,-39,-44,-89,-67; D=-11;
MA   /I: I=-11; DM=-27;
MA   /M: SY='Y'; M=-67,-79,-69,-38,-9,-47,-42,-31,-20,-25,-50,-69,-80,-60,-62,-20,-16,-14,-35,123;
MA   /M: SY='Y'; M=-33,15,-14,-51,19,-48,35,-38,-10,-29,-54,-18,-2,-36,-14,-61,8,-34,37,99;
MA   /M: SY='E'; M=-20,-75,40,43,-74,-54,-55,-38,39,-44,23,-10,-27,36,3,17,1,-67,-78,-14;
MA   /M: SY='I'; M=-47,-74,-76,-70,17,-81,-35,65,-8,-1,22,-14,-35,10,-20,-66,-39,43,-70,5;
MA   /M: SY='I'; M=-41,-74,-80,-76,-10,-82,-20,86,-22,-26,-41,-71,-13,-71,-74,0,-55,43,-76,-57;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-31; IM=0; DM=-31;
MA   /M: SY='K'; M=-23,-74,-23,17,3,-16,1,-70,63,-57,-63,-20,-4,30,-21,23,16,-33,-73,-21;
MA   /M: SY='N'; M=-49,-76,8,23,-24,-27,36,-33,34,-72,-30,47,-7,40,19,10,-2,-71,-78,-15;
MA   /M: SY='P'; M=-30,-86,-65,-56,-82,-42,-68,-71,-16,-50,-3,-29,118,-63,-70,-11,-33,-74,-79,-79;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-14,-82,-74,-6,-79,-62,32,-69,14,121,-72,-73,-24,-69,-69,-18,17,-74,-51;
MA   /M: SY='D'; M=-6,37,96,-6,-80,-62,-58,-78,-57,-78,-75,-6,-67,-55,-64,33,-7,-43,21,-68;
MA   /M: SY='L'; M=-68,-70,-85,-78,51,-85,-69,17,-77,75,18,-80,-83,-73,-75,-75,-42,-26,-64,-23;
MA   /M: SY='S'; M=-29,-24,24,15,-73,8,-57,-70,24,-50,-11,12,-32,30,13,38,12,-25,-78,-9;
MA   /M: SY='T'; M=-29,-68,18,6,-67,-42,-64,14,-6,-22,-10,-33,-63,-11,-41,23,80,-39,-83,-65;
MA   /M: SY='I'; M=-63,-74,-85,-81,-49,-86,-76,88,-76,7,75,-76,-75,-71,-77,-73,-58,25,-75,-55;
MA   /M: SY='K'; M=-32,-77,-5,40,-74,-44,-55,-33,56,-14,-20,5,-66,38,48,-17,-32,-68,-77,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-9,-75,-11,38,-55,-41,6,-74,61,-47,-5,16,-64,41,6,17,-19,-71,-77,-65;
MA   /M: SY='K'; M=-63,-13,-55,-47,-77,-69,5,-78,77,-75,-15,37,-68,0,69,-27,-40,-74,-77,-64;
MA   /M: SY='L'; M=-24,-2,-46,-76,15,-82,-37,52,-75,52,21,-27,-78,-71,-75,-49,-38,33,-73,-53;
MA   /M: SY='W'; M=4,-76,17,49,-72,-67,-58,-21,42,-53,-16,20,-34,9,17,-6,-25,-46,57,-30;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='N'; M=-11,-25,-31,28,-74,-12,-18,-34,25,-48,-31,51,-67,8,-12,45,12,-68,-81,-27; D=-33;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='G'; M=-58,8,-19,-27,-22,63,25,-55,-17,-28,-66,39,-33,8,7,-13,-9,-74,13,-43; D=-33;
MA   /I: I=-33; DM=-84;
MA   /M: SY='E'; M=6,-24,-54,45,-24,-26,9,-52,25,-17,14,1,-6,35,11,-8,-30,-51,-70,31;
MA   /M: SY='Y'; M=-71,-82,-36,-72,-20,-77,-38,-22,-65,-53,-50,-26,-83,-61,-63,-66,-65,-60,-29,132;
MA   /I: I=-33; MD=-84;
MA   /M: SY='K'; M=-28,12,13,15,-70,-24,10,-69,33,-23,-62,-7,-2,20,29,15,14,-19,-22,0; D=-33;
MA   /I: I=-33; MI=0; MD=-84; IM=0; DM=-84;
MA   /M: SY='S'; M=-51,-2,13,-3,-73,1,-18,-69,-23,-48,-66,21,-65,-4,-17,62,58,-40,-84,-44;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-27,-74,-48,7,-76,-71,24,-15,28,-2,-71,50,-66,-5,-63,3,39,-74,-25;
MA   /M: SY='E'; M=6,-75,40,50,-48,-27,19,-51,13,-29,-11,-16,-65,43,-39,12,-7,-68,-20,-6;
MA   /M: SY='E'; M=11,-77,38,77,-79,-38,-24,-76,-10,-36,-36,-11,-36,45,-53,-10,-39,-72,1,-68;
MA   /M: SY='F'; M=-71,12,-86,-81,107,-83,-68,-21,-77,17,14,-77,-84,-83,-75,-73,-46,-9,-48,-4;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-27,-16,6,-54,-60,-63,19,-20,30,20,0,-73,8,-15,-12,-29,33,-72,23;
MA   /M: SY='D'; M=27,-29,46,29,-37,-64,24,-50,22,-37,-64,6,-67,20,8,11,-56,-68,-1,11;
MA   /M: SY='D'; M=-36,-80,114,3,-86,-65,25,-85,-54,-83,-80,-37,-66,-53,-62,-55,-58,-82,-101,-68;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-34,-84,-77,53,-80,-72,43,-74,10,74,-75,-77,-73,-74,-69,-58,50,-68,-47;
MA   /M: SY='K'; M=-41,-75,-1,12,-33,-45,-26,-62,44,-13,36,36,-69,38,39,-17,-44,-4,8,-61;
MA   /M: SY='L'; M=-43,-72,-72,-16,-49,-79,-62,-43,-10,70,4,-70,-76,44,-5,-66,-1,-49,28,2;
MA   /M: SY='M'; M=-61,-71,-84,-77,-49,-83,-69,65,-73,15,103,-74,-74,-68,-73,-71,-31,34,-76,-54;
MA   /M: SY='F'; M=-54,27,-81,-47,88,-81,-69,12,-32,27,-13,-75,-41,-11,-71,-70,-39,4,32,2;
MA   /M: SY='Q'; M=-16,-74,16,13,-72,-47,44,-6,12,-68,-17,13,-67,45,29,27,15,-38,-4,-23;
MA   /M: SY='N'; M=-40,-69,11,-28,-77,-31,-46,-42,-48,-80,-69,113,-71,12,-14,-24,-27,-75,-92,-71;
MA   /M: SY='C'; M=68,96,-70,-66,-11,-59,15,-34,-66,-43,-61,-61,-73,-65,-70,15,-20,-19,-81,-67;
MA   /M: SY='R'; M=-26,-28,-62,-10,2,-72,-4,-2,43,-2,39,15,-71,9,44,-36,-27,-15,-18,25;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-71,-62,11,-39,-72,2,12,3,1,25,-17,-68,19,3,-21,58,-13,-80,-41; D=-21;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='Y'; M=-70,-78,-74,-42,57,-79,-48,-30,-69,-5,12,-72,-82,-22,-67,-9,-64,-38,-39,109; D=-21;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='N'; M=-65,-73,-7,-40,-62,-12,44,-75,-54,-77,-66,105,-75,-53,-60,-50,-20,-77,-76,55; D=-21;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-81,-8,38,-82,40,-66,-60,13,-59,-4,-25,44,-34,-6,-4,-19,-56,-82,-76; D=-21;
MA   /I: I=-21; MD=-53;
MA   /M: SY='P'; M=-26,-86,29,33,-34,0,-67,-81,-2,-83,-76,-38,61,-9,-10,2,-26,-38,-85,-35; D=-21;
MA   /I: I=-21; MI=0; MD=-53; IM=0; DM=-53;
MA   /M: SY='D'; M=-25,13,65,20,-43,43,-13,-81,-17,-79,-73,35,-23,0,-41,7,-32,-77,-83,-37;
MA   /M: SY='S'; M=-13,-69,21,-20,-74,-58,46,-72,-16,-74,-66,20,4,-14,-18,69,41,-44,-86,-64;
MA   /M: SY='E'; M=-27,-77,28,50,-20,-21,-19,-14,-4,-18,-20,-11,32,25,-11,-7,-26,-3,25,-63;
MA   /M: SY='I'; M=-61,15,-22,-22,5,-81,-68,52,-36,11,-44,-16,-76,-15,-35,-46,-19,49,-68,42;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-75,-13,-17,-5,-2,7,-18,-21,-22,-54,-44,-74,-59,8,-12,5,10,29,88;
MA   /M: SY='K'; M=-51,-77,-11,17,-71,-51,12,6,59,-29,-34,-24,-34,39,28,15,-40,-22,37,-61;
MA   /M: SY='M'; M=24,34,39,-29,-7,-67,2,13,-12,-6,60,4,-71,-24,-1,-10,-27,-36,-76,-5;
MA   /M: SY='A'; M=69,-9,-66,-64,-68,22,-67,-24,-64,-33,-29,-27,-68,-60,-68,32,-17,2,-75,-2;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,24,12,19,-69,-69,32,-3,39,-5,-20,7,-68,44,-6,6,-8,-14,-79,-33;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-74,-30,37,-43,-45,-58,-20,44,-21,4,-5,-32,28,26,1,4,-11,-75,-11;
MA   /M: SY='M'; M=-64,15,-84,-77,1,-83,-68,15,-75,68,74,-78,-80,-70,-74,-73,-28,16,-72,-52;
MA   /M: SY='E'; M=-26,-76,-54,52,15,-53,23,-43,15,10,-55,-9,-68,48,5,-11,-23,-20,-11,8;
MA   /M: SY='K'; M=8,-74,37,31,-77,-40,-1,-22,53,-72,1,29,-65,17,-9,12,-24,-68,-81,-66;
MA   /M: SY='F'; M=-23,-8,-13,7,43,-74,-17,-4,-1,13,2,-4,-73,22,-36,-20,6,25,-67,19;
MA   /M: SY='F'; M=9,38,-77,-73,83,-29,-65,-13,-71,8,2,-69,-78,-5,-71,-12,-11,-14,-5,27;
MA   /M: SY='E'; M=-37,-19,10,52,11,-41,2,-10,17,1,-57,-2,-68,7,12,-9,-28,-39,-16,31;
MA   /M: SY='Q'; M=-36,-77,28,27,-30,-50,2,-53,44,-38,16,-36,2,53,15,6,-17,-22,-77,-32;
MA   /M: SY='W'; M=-1,-74,-22,9,-35,-24,-36,-4,37,28,-6,-30,-70,37,3,-20,-9,-26,55,-58;
MA   /M: SY='W'; M=-26,-73,-78,-30,28,-80,-67,36,-17,44,49,-74,-77,-65,8,-40,-61,3,58,6;
MA   /M: SY='K'; M=-5,-32,16,24,-71,-49,-19,-19,47,-11,-32,17,-45,31,21,1,-13,-26,-78,-31;
MA   /M: SY='E'; M=-13,-76,17,66,-46,-55,-55,-51,29,-34,3,33,1,25,2,-18,-25,-70,-79,-67;
MA   /M: SY='M'; M=9,-71,-40,26,16,-71,6,25,-30,17,33,-17,-70,3,-17,8,-10,9,-73,-34;
MA   /I: E1=0; IE=-380; DE=-380;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=Bromo;
CC   /VERSION=6;
PR   PRU00035;
DO   PDOC00550;
//