Due to scheduled maintenance work, this service may not be available on Monday January 22nd between 08.00 am and 9.00 am CEST
To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50015

General information about the entry

Entry name [info] SAP_B
Accession [info] PS50015
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-APR-2005 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 20-DEC-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50015
Associated ProRule [info] PRU00415

Name and characterization of the entry

Description [info] Saposin B type domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=83;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=83;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.2652; R2=0.0156; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=509; N_SCORE=9.2; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=432; N_SCORE=8.0; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M=  0,  0,-24, -4, -3,-20,  1, -3,-20, -7,-20,-12,  6, -6, -1, -9,  3, -6,-19,-26,-15, -3;
/M: SY='D'; M= -6, 10,-25, 14,  4,-26,  5, -8,-24, -8,-20,-17,  8,-10, -3,-11,  2, -7,-21,-31,-20,  0;
/M: SY='x'; M= -7, -9,-25, -7, -9,-11,-18,-13, -2,-15, -3, -2,-11, -1,-13,-17, -9, -6, -2,-26,-11,-12;
/M: SY='L'; M= -9,-22,-20,-25,-17, 12,-27,-16,  8,-18, 15,  9,-20,-19,-18,-15,-15, -2,  7,-15,  6,-17;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,  3,-28,  5,  9,-25,-16, -2,-19, -2,-21,-12,  2, -5, 12, -5, -1, -6,-21,-14,-11, 10;
/M: SY='V'; M=  0,-15,-19,-16,-11, -6,-19,-19,  7,-17,  7,  2,-15,-20,-14,-17, -7, -2, 10,-25, -9,-13;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='E'; M=-10, -3,-26, -3, 14,-22,-22, -7,-16, 14,-13, -4, -4,-11, 11, 12, -5, -3,-14,-24,-11, 12;
/M: SY='x'; M= -5, -3,-22, -4, -7,-11, -8,-11,-13, -4, -9, -1, -5,-16, -6, -7, -2,  0, -9,-22, -8, -6;
/M: SY='L'; M=  1,-26,-18,-30,-23,  1,-27,-24, 23,-24, 24, 14,-24,-25,-20,-21,-16, -5, 22,-23, -5,-22;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-32,-29,  4,-32,-28, 32,-23, 13, 13,-26,-26,-26,-22,-13, -2, 39,-25, -5,-29;
/M: SY='T'; M= -3, -1,-21, -5, -2,-21, -9, -6,-17,  4,-19, -9,  4,-15,  1,  2,  4,  5,-11,-27,-13, -1;
/M: SY='K'; M= -7,-11,-27,-11, -5,-13,-19,-12,-10,  2,-10, -6,-11,-18, -3,  0,-10, -8, -7, -3,  0, -4;
/M: SY='L'; M=  1,-26,-20,-30,-22,  0,-24,-22, 21,-24, 25, 15,-23,-24,-18,-22,-18, -8, 16,-21, -5,-21;
/M: SY='Q'; M= -6,  3,-25,  2, 13,-25,-10, -5,-21,  3,-20,-11,  3,-11, 14, -1,  3, -1,-21,-21,-14, 14;
/M: SY='N'; M= -5, 11,-22,  6,  3,-19,-13, -1,-21,  8,-20,-13, 14,-14,  2,  3,  2,  2,-18,-28,-11,  2;
/M: SY='M'; M= -6,-16,-21,-22,-14,  0,-17, -7,  4,-14, 11, 17,-14,-22, -6, -9,-14, -7,  1,-20, -3,-10;
/M: SY='L'; M= -1,-23,-18,-26,-20, -1,-23,-23, 17,-23, 18,  9,-20,-23,-18,-20,-10, -1, 16,-25, -7,-20;
/M: SY='K'; M=-10,  2,-28,  6,  9,-25,-16, -9,-23, 13,-18,-12, -2, -3,  4, 10, -6, -6,-19,-26,-14,  5;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-22,  5, 10,-23,-16, -7,-21,  9,-21,-12,  3, -9,  8,  3, -1, -2,-18,-27,-13,  9;
/M: SY='N'; M= -2, 16,-24, 11,  4,-25,  0,  0,-22, -2,-24,-17, 20, -9,  0, -7,  3, -7,-23,-31,-19,  1;
/M: SY='A'; M=  3,-11,-21,-14, -7,-16,-12,-16, -4, -7, -9, -3, -7, -7, -8, -9,  0,  0, -1,-26,-15, -9;
/M: SY='T'; M=  1, -3,-17, -9, -7, -8,-16,-13,-10,-11, -9, -8, -1, -8, -6,-11,  7, 14, -7,-26,-10, -6;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-21; IM=0;
/M: SY='E'; M= -6, -1,-17,  1, 14,-16,-14, -3,-11,  8,-10, -5, -3, -7, 11,  5, -3, -5, -8,-16, -9, 12; D=-4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='E'; M= -3,  9,-21, 15, 16,-25,-12, -4,-20,  3,-17,-13,  1, -3,  9, -1,  0, -6,-17,-23,-14, 12; D=-4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='E'; M= -3, -6,-19, -7,  3,-13,-14,-11,-10,  0, -8, -6, -5,-12, -2,  0, -2,  1, -7,-16, -9,  0; D=-4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='I'; M= -3,-24,-17,-28,-23,  0,-27,-23, 29,-21, 16, 13,-21,-21,-19,-20,-14, -5, 28,-20, -4,-23; D=-4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='L'; M= -5,-10,-21,-11, -9,-11,-16, -9, -3, -8,  3,  0, -9,-19, -7, -3, -8, -4, -2,-23, -8, -9; D=-4;
/I:         DM=-21;
/M: SY='Q'; M= -5,  9,-24,  9,  8,-27,-15,  2,-19,  7,-20,-10,  7,-13, 10,  1,  0, -6,-16,-29,-13,  9;
/M: SY='Y'; M=  9,-14,-19,-20,-16, 10,-13, -2, -7,-14, -6, -5,-10,-20,-14,-15, -3, -4, -4, -6, 15,-16;
/M: SY='I'; M=  4,-25,-17,-30,-22,  1,-25,-23, 21,-22, 21, 14,-24,-24,-20,-21,-15, -6, 21,-22, -6,-22;
/M: SY='E'; M= -5, 11,-24, 13, 14,-25,-10, -4,-23,  1,-21,-16,  8,-10,  2, -3,  6,  1,-18,-31,-16,  7;
/M: SY='K'; M=-10, -1,-27, -1, 11,-28,-19,  1,-22, 20,-22, -8,  2,-11, 20, 18, -1, -4,-20,-24,-10, 15;
/M: SY='L'; M= -1,-19,-19,-19,-11, -5,-21,-20, 10,-18, 15,  6,-20,-22,-15,-17,-12, -4, 12,-25, -9,-13;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='D'; M= -5,  9,-23, 10,  3,-22, -9,  0,-23, -1,-20,-15,  9,-15, -1,  0,  4, -2,-19,-25,-12,  1;
/M: SY='R'; M= -9,-16,-22,-18,-11, -5,-23,-14, -5,  2, -2,  0,-13,-21, -8,  7, -9, -2,  1,-14, -2,-11;
/M: SY='L'; M= -2,-24,-18,-27,-20,  7,-20,-20, 12,-24, 25, 13,-22,-25,-19,-19,-17, -5,  9,-20, -3,-19;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-32, -9, -4,-23, -8,-14,-22, -6,-24,-17,-10, 32, -8,-10, -6, -8,-24,-16,-19, -9;
/M: SY='x'; M= -3, -9,-22, -8, -5,-14,-10,-15, -7,-11, -2, -5, -8,-11, -8,-12, -2, -3, -7,-27,-13, -7;
/I:         MD=-22;
/M: SY='P'; M= -4, -4,-19, -3,  1,-17, -5, -7,-15,  4,-18,-10, -1, 15,  1,  1,  0, -4,-15,-17,-13, -1; D=-4;
/I:         I=-5; B1=0; E1=0; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='V'; M= -1,-11, -8,-14,-11,  7,-13,-11,  6,-11,  7,  2, -9,-13,-12,-10, -5,  0,  8,-10, -1,-11; D=-4;
/I:         DM=-22;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-22,-22,-18,  1,-25,-18, 11,-20, 13,  8,-23,-15,-18,-19,-17, -8,  9,-12, -1,-19;
/M: SY='S'; M=  0, -8,-23, -8, -2,-20,  0, -8,-21, -2,-19,-11, -3,-13, -1,  2,  5, -3,-14,-20,-14, -2;
/M: SY='D'; M= -1,  2,-23,  3,  3,-26, -6, -7,-21, -3,-19,-13, -1, -3,  3, -8,  3,  3,-16,-27,-16,  2;
/M: SY='M'; M= -7,-13,-23,-14, -1,-15,-25,-12,  4, -4, -1,  5,-12,-17,  5, -5, -7, -5,  3,-24, -9,  1;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,  4,-27,  6, 14,-27,-19,  2,-23, 15,-21,-10,  2,-12, 18, 11, -1, -4,-20,-24, -8, 15;
/M: SY='E'; M= -8,  1,-12, -1, 10,-20,-14, -1,-21,  2,-18, -9,  3,-14,  8, -1,  0, -4,-20,-28,-13,  9;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-19,-31,-24, 18,-31,-21, 21,-23, 16, 10,-24,-26,-24,-20,-17, -7, 21,-14,  7,-24;
/M: SY='V'; M=  0,-24,-16,-27,-22, -2,-21,-22, 17,-18, 13, 12,-22,-25,-20,-18,-12, -4, 23,-25, -8,-22;
/M: SY='D'; M= -7, 14,-25, 22, 13,-29, -4, -1,-30,  0,-25,-20,  7,-11,  1, -2,  6, -5,-22,-32,-17,  6;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-23, -6,  3,-14,-20, -4,-14,  4,-11, -3, -2,-15, 11,  8, -2,  1,-13,-21, -5,  7;
/M: SY='Y'; M=-17,-21,-27,-23,-22, 30,-20,  9, -3,-17, -1, -1,-16,-28,-18,-14,-17,-11, -7, 12, 47,-22;
/M: SY='M'; M= -6,-13,-24,-16, -9, -9, -3,-14, -6,-11, -4,  2, -9,-18, -7,-10, -6, -6, -6,-21,-10, -8;
/M: SY='D'; M=-10,  7,-29, 16, 10,-29,-16, -9,-23,  0,-25,-18, -1, 16,  0, -5,  0, -6,-20,-32,-20,  3;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-23, -5,  1,-17,-21,-11, -7,  0, -6, -3, -6,-16,  0,  2, -3, -2, -4,-27,-11, -1;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-18,-32,-24,  6,-30,-22, 25,-25, 24, 16,-24,-25,-20,-22,-19, -7, 19,-19,  1,-24;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-22,-30,-22,  6,-31,-23, 24,-23, 22, 13,-22,-24,-18,-20,-18, -6, 18,-20, -1,-21;
/M: SY='D'; M= -8, 16,-27, 21, 18,-29,-15, -2,-27, 10,-23,-16,  7,-10, 13,  1,  1, -4,-23,-27,-12, 15;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-22,-19,-18, -2,-18,-15,  9,-17, 13, 11,-18,-23,-15,-16,-15, -6,  8,-19,  0,-17;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-25, 17,-30,-22, 21,-27, 27, 16,-25,-26,-22,-22,-24,-10, 12, -7,  6,-24;
/M: SY='L'; M= -8,-12,-22,-11, -2,-11,-22,-11, -1, -8,  5,  5,-12,-15, -1, -5, -8, -4, -2,-26, -9, -2;
/M: SY='N'; M=  0,  4,-23,  2,  2,-24,  5,  1,-27, -3,-22,-15,  7,-14, -1,  0,  5, -4,-21,-28,-16, -1;
/M: SY='E'; M= -8, -4,-26, -2,  8,-22, -6, -2,-18,  1,-13, -3, -4,-14,  7,  1, -3, -9,-16,-25,-13,  7;
/I:         MD=-25;
/M: SY='M'; M= -3,-10,-18,-13, -7,-11,-17,-13,  3, -4, -2,  8,-11,-15, -5, -6, -5,  0,  7,-23, -9, -7; D=-5;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D'; M= -8, 16,-22, 19,  9,-26,-11, -3,-22,  0,-21,-15, 13,-13,  7, -3,  8,  1,-19,-33,-16,  8;
/M: SY='P'; M=  5,-17,-32,-12, -2,-27,-15,-20,-18,-10,-25,-18,-17, 63,-10,-20, -4, -7,-22,-28,-27,-10;
/M: SY='Q'; M= -8,  8,-25,  9, 10,-28,-11,  4,-23,  8,-24,-12,  8,-13, 13,  3,  4, -5,-20,-29,-13, 11;
/M: SY='E'; M= -1,-10,-21,-11,  2,-10,-17,-13, -8, -3, -3, -4, -9,-15, -1, -6, -3, -2, -6,-22, -9,  1;
/M: SY='I'; M=  1,-25,-19,-32,-25,  0,-29,-27, 29,-23, 11, 10,-20,-22,-22,-24,-10, -2, 28,-23, -6,-25;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S'; M=  2, -6,-22, -7, -1,-22,  5, -7,-19, -4,-19, -8, -2,-14,  1, -6,  6, -4,-13,-26,-16,  0;
/M: SY='H'; M= -5, -4,-23, -5, -3,-16,-20,  3, -8, -5, -1,  2, -7,-17,  1, -6, -8, -5, -8,-25, -6, -2;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-33,-26,  4,-32,-24, 31,-26, 28, 20,-27,-27,-22,-22,-21, -7, 27,-23, -3,-25;
/M: SY='G'; M= -8, -5,-28, -5, -7,-21, 14,  7,-26, -9,-16,-10,  0,-15, -7, -6, -6,-14,-23,-25,-13, -8;
/M: SY='L'; M= -1,-23,-20,-27,-19,  9,-19,-18,  6,-19, 19,  9,-20,-25,-18,-12,-17, -8,  5,-16, -2,-18;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='S'; M= -5, -1,-24,  0,  4,-24,-10,-10,-19,  4,-22,-10,  0, -4,  3,  0,  7,  1,-15,-29,-16,  2;
/M: SY='S'; M= -1, -8,-21, -8,  1, -9,-12, -2,-17,-10,-16,-10, -4, -1, -3,-11,  6,  1,-15,-25, -9, -1;
/M: SY='D'; M= -3,  5,-22,  6, -3,-22, -2,-12,-18, -6,-17,-14,  4,-10, -8, -8,  2, -2,-12,-30,-18, -6;
/M: SY='T'; M= -5, -1,-24, -2, -3,-18, -4, -8,-21, -4,-17,-11, -2,-10,  0, -6,  1,  2,-17,-22,-10, -2;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_12 which contains 556'388 sequence entries.


Total number of hits 94 in 51 different sequences
Number of true positive hits 94 in 51 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 14
Number of 'partial' sequences 4
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 87.04 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann, PS_Langendijk_Genevaux
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 4
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Saposin B-type
Version [info] 4

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
51 sequences

AOAH_HUMAN  (P28039    ), AOAH_MOUSE  (O35298    ), AOAH_RABIT  (O18823    ), 
APA1_ARATH  (O65390    ), APA2_ARATH  (Q8VYL3    ), APA3_ARATH  (Q9XEC4    ), 
ASM1_CAEEL  (Q10916    ), ASM2_CAEEL  (Q23498    ), ASM3_CAEEL  (Q9UAY4    ), 
ASM_BOVIN   (Q0VD19    ), ASM_HUMAN   (P17405    ), ASM_MOUSE   (Q04519    ), 
ASPR1_ORYSJ (Q42456    ), ASPRX_ORYSJ (P42211    ), ASPR_CUCPE  (O04057    ), 
ASPR_HORVU  (P42210    ), CARDA_CYNCA (Q9XFX3    ), CARDB_CYNCA (Q9XFX4    ), 
CNPY2_HUMAN (Q9Y2B0    ), CNPY2_MOUSE (Q9QXT0    ), CTNA_DICDI  (Q86IV5    ), 
CTNB_DICDI  (Q8WSR7    ), CTNC_DICDI  (Q86HV8    ), CTNL_DICDI  (Q554K2    ), 
CYPR1_CYNCA (P40782    ), GNLY_HUMAN  (P22749    ), NKL_HORSE   (Q8HZQ3    ), 
NKL_PIG     (Q29075    ), PFPA_ENTHI  (P34095    ), PFPB_ENTHI  (Q24824    ), 
PFPC_ENTHI  (Q24825    ), PFPN_ENTHI  (Q07831    ), PSPB_BOVIN  (P15781    ), 
PSPB_CANLF  (P17129    ), PSPB_HUMAN  (P07988    ), PSPB_MOUSE  (P50405    ), 
PSPB_PIG    (P15782    ), PSPB_RABIT  (P15285    ), PSPB_RAT    (P22355    ), 
SAPL1_HUMAN (Q6NUJ1    ), SAPL1_MOUSE (Q8C1C1    ), SAP_BOVIN   (P26779    ), 
SAP_CAVPO   (P20097    ), SAP_CHICK   (O13035    ), SAP_HUMAN   (P07602    ), 
SAP_MOUSE   (Q61207    ), SAP_PIG     (P81405    ), SAP_RAT     (P10960    ), 
SGMA_DICDI  (Q55C09    ), SGMB_DICDI  (Q54C16    ), SPP11_CAEEL (Q10018    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
14 sequences

CNPY1_DANRE (Q2L6L1    ), CNPY1_XENLA (Q5M7D4    ), CNPY3_BOVIN (Q0P5N1    ), 
CNPY3_DANRE (A3KNS2    ), CNPY3_HUMAN (Q9BT09    ), CNPY3_MOUSE (Q9DAU1    ), 
CNPY3_PIG   (A5GFQ5    ), CNPY3_XENLA (Q6GN40    ), CNPY3_XENTR (Q5HZV5    ), 
CNPY4_BOVIN (Q3SWX1    ), CNPY4_DANRE (Q2L6K8    ), CNPY4_HUMAN (Q8N129    ), 
CNPY4_MOUSE (Q8BQ47    ), SEELE_DROME (Q7JXF7    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
4 sequences

CARDE_CYNCA (P85136    ), CARDF_CYNCA (P85137    ), CARDG_CYNCA (P85138    ), 
CARDH_CYNCA (P85139    )
» more

PDB
[Detailed view]
27 PDB

1L9L; 1M12; 1N69; 1NKL; 1OF9; 1QDM; 1SN6; 2DOB; 2GTG; 2QYP; 2R0R; 2R1Q; 2RB3; 2Z9A; 3BQP; 3BQQ; 4DDJ; 4UEX; 4V2O; 5FI9; 5FIB; 5FIC; 5I81; 5I85; 5I8R; 5JG8; 5NXB
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission