PROSITE entry PS50018
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | RAS_GTPASE_ACTIV_2 |
| Accession [info] | PS50018 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-1995 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00438 |
| Associated ProRule [info] | PRU00167 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Ras GTPase-activating proteins profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=195; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=190; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.4110000; R2=0.0141000; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=12135.0556641; R2=20.0501060; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=503; H_SCORE=22220; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=19373; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='D'; M=-16, 31,-30, 43, 20,-40,-14, 4,-32, 4,-26,-18, 12,-10, 23, -2, 0,-10,-30,-32,-16, 22; /M: SY='W'; M=-14,-23,-34,-24,-16, -7,-24,-20, -9, 4,-13, -7,-20,-22, -9, 6,-22,-16, -8, 37, 5,-12; /M: SY='D'; M=-12, 27,-23, 35, 13,-28,-15, -7,-28, -3,-22,-22, 10, -9, -2, -9, 7, 12,-19,-35,-16, 6; /M: SY='E'; M= -6, -3,-24, 0, 15, -8,-21, -8,-13, -7, 0, -6, -8,-14, 3, -9, -8, -9,-14,-22, -8, 10; /M: SY='L'; M= -9,-21,-19,-23,-18, 8,-28,-13, 10,-21, 23, 8,-21,-25,-17,-16,-15, 5, 7,-13, 12,-18; /M: SY='A'; M= 38,-11,-11,-19,-10,-16, -4,-19, -7,-13, -4, -7,-10,-13,-10,-19, 8, 1, 0,-22,-17,-10; /M: SY='R'; M= -3,-10,-24,-13, -8,-13,-10, -7,-13, -1,-14, -7, -4,-17, 0, 9, 1, 0,-10,-17, -2, -6; /M: SY='V'; M= -4,-13,-22,-18,-19,-13, -5,-20, 6,-18, -8, -3, -6,-12,-17,-19, -3, -5, 7,-28,-15,-20; /M: SY='L'; M=-13,-29,-21,-31,-22, 25,-30,-15, 14,-28, 37, 14,-27,-30,-23,-19,-27,-10, 6, -9, 15,-22; /M: SY='V'; M= 2,-28,-15,-30,-25, 1,-27,-26, 24,-23, 21, 12,-27,-27,-24,-21,-15, -4, 30,-25, -7,-25; /M: SY='R'; M= -9, 9,-21, 5, 0,-20,-13, -5,-23, 9,-22,-15, 14,-15, 1, 18, 8, 10,-17,-30,-14, -1; /M: SY='L'; M= 2,-18,-20,-25,-19, -2,-23,-20, 17,-22, 20, 9,-14,-23,-17,-20,-14, -6, 11,-23, -7,-19; /M: SY='F'; M=-17,-26,-21,-34,-22, 53,-28,-15, 1,-24, 11, 7,-19,-27,-23,-16,-19,-10, -2, 1, 20,-19; /M: SY='D'; M=-15, 6,-27, 12, 7,-18,-20, -3,-19, 1, -8,-10, -1,-16, 4, 7, -8, -6,-17,-24, -5, 4; /M: SY='H'; M= -5, 2,-21, 2, 11,-21,-14, 18,-24, -1,-22,-13, 6,-11, 6, -2, 12, 6,-18,-32, -7, 7; /M: SY='R'; M=-15, -3,-28, -1, 16,-20,-21, 12,-24, 10,-13, -9, -1,-14, 9, 24, -7, -7,-21,-25, -8, 10; /M: SY='H'; M=-12, 11,-25, 6, 3,-16,-13, 35,-23, 1,-23,-11, 21,-18, 5, 1, 0, -7,-25,-27, 4, 2; /M: SY='L'; M= -2,-21,-21,-23,-13, -3,-23,-16, 4,-11, 23, 8,-20,-24,-11, -2,-19, -8, 1,-20, -6,-13; /M: SY='L'; M= -3,-19,-20,-21,-10, -2,-25,-19, 11,-21, 22, 8,-18,-20,-12,-18,-12, -2, 6,-23, -6,-12; /M: SY='Y'; M= -7,-13,-23,-12, -5, -3,-21, 11, -6, -8, 0, -1,-11,-21, -5, -8, -9, -7, -6,-15, 14, -7; /M: SY='Q'; M= -9,-10,-28, -9, 7,-21,-22, -9, -7, -3, -8, -4, -8, 1, 11, -1, -5, -7,-13,-25,-13, 7; /M: SY='L'; M=-12,-31,-23,-33,-24, 19,-30,-22, 16,-28, 32, 13,-29,-29,-24,-21,-27,-11, 10, -1, 6,-23; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-34,-26, 27,-31,-23, 20,-28, 28, 13,-26,-29,-27,-21,-22, -8, 16,-13, 7,-26; /M: SY='W'; M= -7,-13, -2,-17,-11,-16,-20, -9,-22, -3,-19,-12,-12,-21, -4, -7, -9, -5,-17, 9, -3, -7; /M: SY='N'; M= 1, 7,-18, 1, 0,-18,-13, -7,-10, -5,-13, -5, 8,-14, 0, -8, 5, 7, -8,-30,-14, 0; /M: SY='L'; M= -2,-26,-17,-29,-21, 3,-25,-17, 19,-22, 30, 24,-26,-26,-16,-18,-20, -7, 16,-22, -4,-19; /M: SY='L'; M= -3,-20,-21,-28,-21, 15,-25,-19, 14,-24, 17, 7,-13,-24,-21,-20,-15, -7, 7,-16, 1,-21; /M: SY='D'; M= -8, 16,-23, 21, 8,-28,-12, -5,-24, 5,-23,-12, 7,-11, 7, -1, 7, 2,-18,-32,-15, 7; /M: SY='K'; M=-11, 1,-26, -1, 9,-23,-19, 1,-23, 20,-18, -8, 3,-13, 10, 17, -5, -4,-19,-24, -9, 9; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 24, 57,-31,-19, 0,-31, 9,-21,-21, 2, -1, 18, -1, 0,-10,-30,-31,-20, 38; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-35,-28, 9,-34,-27, 34,-27, 21, 15,-25,-26,-25,-24,-19, -7, 30,-20, 0,-28; /M: SY='E'; M= -1, 4,-25, 8, 30,-27,-15, -6,-26, 15,-24,-17, 1, -5, 11, 4, 5, -4,-21,-28,-17, 21; /M: SY='K'; M= -4, -7,-23, -7, -3,-15,-17, -3,-12, 4, -4, 2, -6,-17, -1, 4, -7, -7, -9,-24, -7, -3; /M: SY='A'; M= 11, -9,-18,-13, -3,-14,-16,-17, -5, -6, -3, -5, -8,-13, -6,-11, 2, 6, -2,-24,-12, -5; /M: SY='D'; M= -5, 21,-21, 29, 7,-29,-11, -7,-23, -5,-22,-19, 8,-12, 0,-10, 8, 1,-14,-35,-17, 3; /M: SY='D'; M=-10, 19,-25, 26, 12,-29, -3, -3,-31, 2,-27,-22, 14,-12, 2, 4, 8, -4,-24,-34,-19, 6; /M: SY='A'; M= 4, -8,-20,-10, -6,-18,-15,-11, -5, -8, -9, 4,-10, 1, -1,-12, 0, 0, -4,-27,-14, -4; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25; /M: SY='Q'; M= -9, 8,-22, 3, 3,-22,-17, 6,-16, -3,-13, -6, 9,-14, 16, -2, 3, 6,-18,-28, -9, 9; /M: SY='T'; M= 1, 6,-16, 6, 3,-18,-14,-13,-16, -8,-13,-14, 2,-11, -4,-10, 14, 20, -9,-32,-14, 0; /M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-34,-24, 5,-33,-23, 32,-28, 35, 23,-25,-25,-18,-23,-25,-10, 18,-20, 0,-23; /M: SY='F'; M=-15,-30,-19,-36,-27, 53,-30,-21, 8,-29, 20, 6,-24,-30,-34,-20,-22, -9, 8, -2, 18,-27; /M: SY='R'; M=-18, -9,-28,-10, -1,-19,-20, -2,-28, 26,-19,-10, 0,-19, 8, 62, -7, -4,-18,-21,-10, -1; /M: SY='G'; M= 7,-10,-26,-12,-15,-26, 41,-17,-32,-10,-24,-16, -2,-18,-13, -6, 0,-14,-22,-20,-25,-15; /M: SY='N'; M= -9, 36,-19, 17, -1,-19, -2, 7,-19, -1,-28,-19, 54,-19, -1, -1, 11, 5,-27,-39,-19, -1; /M: SY='S'; M= 4, -2,-13, -5, -4,-18, -9,-15,-16,-10,-23,-16, 3, 1, -5,-11, 28, 27, -9,-35,-18, -5; /M: SY='L'; M= -9,-24, 1,-27,-19, -2,-29,-22, 8,-26, 22, 7,-23,-17,-20,-21,-19, -4, 4,-27, -9,-20; /M: SY='A'; M= 31,-17,-11,-24,-16,-12,-11,-23, 4,-14, 1, -2,-17,-17,-16,-20, 1, -1, 15,-23,-16,-16; /M: SY='T'; M= 4, -3,-12, -8, -7,-14,-12,-16, -9,-12,-17,-12, 3,-11, -6,-12, 26, 29, -2,-34,-14, -7; /M: SY='K'; M=-11, -3,-28, -4, 6,-26,-20, -7,-27, 35,-24, -9, 0,-13, 12, 34, -6, -4,-19,-21,-10, 8; /M: SY='M'; M= 3,-18, -8,-26,-18, -7,-20,-16, 11,-18, 7, 16,-14,-19,-10,-19, -5, -3, 8,-26, -9,-15; /M: SY='M'; M= -9,-25,-20,-31,-22, 3,-26,-12, 24,-20, 29, 38,-24,-24,-12,-16,-22, -9, 16,-21, -1,-17; /M: SY='T'; M= -3, 3,-17, 3, 11,-18,-17,-13,-15, -5,-15,-14, 0, -9, -2, -8, 13, 19, -7,-32,-15, 5; /M: SY='Z'; M= -8, -9,-21,-12, 2, 1,-19, -8,-10, -9, -6, -1, -6,-15, 3, -8, 1, 1,-10,-20, -3, 4; /M: SY='Y'; M=-10,-21, 8,-27,-23, 19,-26, -7, -5,-20, 1, 0,-19,-29,-20,-18,-14, -8, -4, -5, 24,-22; /M: SY='F'; M= -6,-12,-17,-23,-18, 19,-19,-10, 2,-15, 4, 15, -7,-20,-15,-13, -7, 2, 0,-15, 4,-15; /M: SY='R'; M=-15, -7,-29, -8, 2,-16,-21, -7,-27, 34,-22, -9, -2,-16, 6, 43,-11,-10,-18,-17, -6, 2; /M: SY='V'; M= 1,-17,-19,-19,-15,-11,-10,-18, -1,-10, -2, -2,-12,-21,-12, -2, -2, -3, 6,-25,-13,-15; /I: I=-10; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25; /M: SY='Y'; M= -9,-15,-23,-16,-12, -5,-23, -9, -5, 0,-10, -5,-13,-11, -9, 5, -5, 1, 1,-15, 7,-13; /M: SY='G'; M= 9,-10,-26,-12,-18,-28, 57,-20,-34,-18,-26,-18, -2,-18,-18,-20, 2,-16,-24,-20,-28,-18; /M: SY='N'; M= 4, 9,-20, 2, -1,-23, -4, -5,-17, -5,-16,-11, 12,-15, 6, -7, 5, 0,-17,-28,-16, 3; /M: SY='E'; M= -4, 9,-23, 7, 12,-24,-15, 10,-22, 2,-19,-12, 8,-11, 9, -1, 4, 4,-20,-29,-10, 10; /M: SY='Y'; M=-13,-20,-27,-22,-20, 30,-27, 11, -1,-12, 0, -1,-19,-28,-13,-12,-17, -9, -8, 23, 64,-20; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 46, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 14,-21, -1,-21; /M: SY='Q'; M=-13, -3,-28, -3, 2,-23,-21, 13,-15, 5,-16, -4, 1,-15, 14, 12, -4, -9,-16,-25, -5, 5; /M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -3, 5,-26,-17, 5,-22, 19,-23, -7, 1,-13, 14, 16, 1, -5,-16,-25, -9, 9; /M: SY='T'; M= 6,-15,-16,-22,-16, -6,-22,-22, 9,-18, 9, 3,-13,-16,-14,-18, -1, 15, 8,-24, -8,-16; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20, 0,-20; /M: SY='K'; M= -5, 6,-25, 10, 5,-23,-13, -3,-25, 11,-23,-14, 3,-13, 6, 10, 2, -4,-18,-23, -6, 4; /M: SY='P'; M= -7, -4,-35, 5, 5,-32,-16,-13,-23, -6,-27,-19,-10, 53, -1,-15, -5, -9,-27,-30,-25, -1; /M: SY='V'; M= -5,-26, -3,-28,-24, 5,-28,-24, 15,-25, 16, 7,-23,-28,-24,-21,-12, -3, 20,-26, -6,-24; /M: SY='L'; M= -9,-30,-22,-33,-24, 6,-33,-24, 30,-29, 37, 19,-27,-27,-21,-23,-25, -9, 20,-21, -1,-24; /M: SY='R'; M=-12, 2,-27, 2, 4,-23,-17, -5,-23, 21,-18, -9, 5,-15, 8, 23, -5, -7,-19,-25,-11, 5; /M: SY='E'; M= -9, 0,-26, 3, 12,-23,-15,-10,-14, 4,-15, -9, -3,-12, 4, -1, -4, -5,-11,-26,-14, 7; /M: SY='I'; M= -8,-30,-26,-38,-30, 0,-38,-30, 46,-28, 18, 18,-22,-22,-22,-28,-18, -8, 34,-22, -2,-30; /M: SY='I'; M= -3,-25,-11,-33,-25, -3,-29,-22, 26,-22, 15, 21,-21,-23,-17,-22,-16, -8, 21,-24, -6,-23; /M: SY='E'; M= -6, 8,-24, 11, 17,-25,-19, -7,-17, -1,-15,-12, 1, -8, 10, -7, 3, 4,-16,-29,-14, 13; /M: SY='S'; M= -2, 11, -7, 10, 4,-23, -7, 4,-25, -8,-28,-19, 16,-14, 0, -8, 19, 5,-19,-39,-17, 1; /M: SY='K'; M= -5, 2,-24, 2, 8,-25,-12, -8,-25, 17,-28,-16, 6, -1, 5, 12, 7, 0,-20,-29,-17, 6; /M: SY='D'; M=-13, 24,-28, 35, 19,-35,-13, -2,-33, 13,-28,-20, 11, -9, 10, 2, 2, -7,-26,-32,-17, 15; /I: I=-3; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25; /M: SY='S'; M= 3, -6,-16, -6, -3,-13, -8,-14,-17,-12,-25,-17, 1, 6, -6,-13, 24, 15,-12,-33,-17, -5; /M: SY='C'; M=-14,-23, 37,-31,-28, 22,-20,-20,-17,-27, -8,-10,-18,-33,-31,-23,-14,-11, -8,-16, 4,-28; /M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 23, 52,-32,-19, 1,-30, 9,-21,-19, 2, -2, 22, 0, 0,-10,-30,-30,-19, 37; /M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-33,-27, 3,-33,-27, 33,-26, 25, 16,-27,-27,-24,-23,-19, -6, 32,-24, -4,-27; /M: SY='D'; M=-11, 31,-24, 43, 16,-32,-10, -4,-32, -2,-27,-25, 14, -9, 1, -9, 10, 3,-23,-38,-19, 8; /M: SY='P'; M=-10,-17,-38, -8, 2,-30,-20,-18,-22, 0,-30,-18,-17, 74, -7,-12,-10,-10,-28,-28,-27, -7; /M: SY='T'; M= 4, -6,-15, -9, -1,-15,-14,-12, -8, -9, -9, -4, -4,-13, 0,-10, 11, 13, -3,-29,-13, 0; /M: SY='R'; M=-13, -2,-30, -1, 13,-28,-20, -4,-29, 36,-25,-10, 0,-12, 16, 37, -8,-10,-22,-21,-11, 13; /I: I=-6; MI=0; MD=-25; IM=0; /M: SY='L'; M= -1,-18,-16,-21,-16, 1,-20,-16, 13,-20, 24, 10,-15,-22,-15,-16,-15, -6, 9,-19, -5,-16;D=-10; /I: DM=-25; /M: SY='E'; M= -9, -8,-28, -4, 15,-20,-23,-12,-14, 6, -7, -7,-12, 4, 1, -2,-11, -9,-13,-26,-14, 7; /M: SY='E'; M= -1, 0,-27, 4, 14,-27, -9,-12,-24, 1,-23,-18, -3, 13, 0, -7, 3, -2,-21,-29,-21, 6; /M: SY='N'; M= -6, 14,-21, 10, 1,-23, -1, 8,-26, 1,-28,-17, 23,-15, 1, 2, 12, 0,-23,-34,-15, 0; /M: SY='E'; M= -7, 14,-25, 24, 40,-29,-14, -2,-29, 4,-24,-22, 6, -4, 12, -4, 9, -3,-25,-34,-20, 26; /M: SY='D'; M= -2, 18,-21, 21, 21,-27, -8, -3,-26, -1,-26,-21, 15, -9, 5, -6, 14, 1,-22,-36,-20, 13; /M: SY='V'; M= 2,-26,-13,-27,-23, 0,-25,-25, 20,-21, 17, 9,-25,-27,-23,-19,-10, -1, 29,-27, -9,-23; /M: SY='E'; M= -9, 13,-27, 18, 35,-29,-15, -2,-29, 14,-25,-19, 9, -6, 13, 4, 3, -6,-26,-31,-18, 24; /M: SY='E'; M= -6, 2,-23, 3, 18,-23,-18, -9,-24, 14,-20,-14, 1, -8, 7, 9, 5, 9,-17,-28,-14, 12; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-25; MD=-25; /M: SY='N'; M= -9, 23,-21, 9, 0,-20, -5, 6,-18, 2,-24,-11, 38,-18, 6, 6, 8, 0,-24,-35,-17, 2; /M: SY='L'; M=-10,-16,-25,-18, -7, -9,-25, -9, 4, -7, 5, 5,-12,-20, 5, -3,-11, -7, -3,-18, 1, -3; /M: SY='R'; M= 0, 0,-24, 0, 9,-24,-14, 0,-25, 12,-19,-12, 0,-12, 5, 19, -2, -6,-17,-24,-13, 5; /M: SY='N'; M=-12, 11,-23, 1, -3,-15,-13, 12,-12, -5, -8, -5, 22,-21, 3, 2, -4, -6,-20,-30, -9, -1; /M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 20,-29,-18, 17,-28, 40, 21,-27,-29,-21,-19,-27,-10, 8,-15, 5,-21; /M: SY='L'; M=-12,-20,-23,-20,-10, 2,-27, -7, 6,-12, 18, 11,-20,-24, -6, -4,-19, -9, 1,-13, 9, -9; /M: SY='Q'; M= -3, 0,-24, -1, 3,-21,-15, -2,-17, 7,-15, -7, 2,-15, 12, 6, 0, -5,-17,-21, -6, 6; /M: SY='Y'; M=-14,-25,-27,-28,-23, 13,-28, -3, 13,-16, 11, 16,-24,-27,-13,-15,-22,-11, 5, 13, 32,-20; /M: SY='T'; M= -3,-16,-13,-22,-19, -3,-24,-20, 11,-15, 8, 11,-16,-20,-16,-14, -1, 18, 18,-27, -7,-17; /M: SY='E'; M= -8, 16,-24, 20, 25,-27,-14, -5,-27, 6,-23,-19, 10, -7, 7, -2, 8, 4,-22,-33,-17, 16; /M: SY='K'; M=-12, -3,-28, -1, 14,-25,-21, -7,-25, 32,-23,-10, -2,-12, 9, 30, -8, -9,-16,-23,-12, 10; /M: SY='F'; M= -8,-28,-19,-34,-26, 35,-29,-22, 13,-27, 20, 8,-23,-28,-29,-21,-19, -8, 13, -9, 10,-26; /M: SY='F'; M=-14,-32,-25,-36,-27, 33,-29,-24, 10,-27, 17, 5,-27,-29,-28,-21,-25,-12, 6, 18, 15,-25; /M: SY='E'; M=-10, 11,-25, 17, 19,-26,-15, 17,-28, 2,-24,-16, 8,-10, 7, -2, 6, -2,-23,-33,-10, 12; /M: SY='A'; M= 29, -7,-15,-14, -5,-22, -5,-16,-16, 5,-16,-11, -6,-11, -4, -2, 7, -1, -6,-22,-17, -5; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-38,-29, 1,-38,-29, 45,-29, 22, 19,-22,-22,-21,-28,-20, -9, 30,-21, -1,-29; /M: SY='I'; M= -7,-22,-19,-27,-22, 10,-28,-20, 17,-22, 12, 7,-18,-23,-20,-19, -9, 3, 16,-17, 5,-22; /M: SY='S'; M= 4, 6,-17, -1, -4,-19, 2, -5,-17, -4,-23,-10, 16,-14, -2, -6, 17, 5,-14,-33,-18, -3; /M: SY='S'; M= 12, 2,-11, -1, -2,-19, -2,-10,-18, -9,-26,-18, 11,-11, -2,-10, 33, 19,-10,-37,-19, -2; /M: SY='S'; M= 7,-14,-14,-16,-14,-11,-15,-20, 6,-16, -9, -4, -7,-17,-12,-17, 14, 8, 14,-32,-14,-14; /M: SY='D'; M= -8, 20,-22, 26, 11,-27,-10, 3,-25, -4,-25,-20, 14,-12, 1, -8, 11, 0,-18,-37,-16, 6; /M: SY='E'; M=-12, 6,-28, 11, 20,-23,-20, -3,-19, 6,-18,-12, 0,-10, 10, 2, -2, -8,-19,-24, -7, 14; /M: SY='F'; M=-14,-29, -2,-36,-27, 30,-32,-23, 11,-30, 19, 7,-23,-29,-29,-23,-21,-10, 7,-13, 7,-27; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='P'; M= -8,-14,-27,-14, -8,-10,-22,-10, -5, -4,-14, -7,-10, 8, -7,-10, -3, 0, -9,-16, 4,-11; /M: SY='Q'; M= -5, -3,-25, -3, 5,-25, -2, -9,-17, -5,-18,-10, -1, -6, 6, -8, 1, -3,-15,-27,-18, 5; /M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22, 6,-30,-18, 26,-26, 39, 27,-26,-26,-16,-20,-26,-10, 14,-20, 0,-20; /M: SY='R'; M=-17,-15, -6,-17, -9,-10,-23, -8,-23, 12,-15, -9, -7,-25, -3, 41,-11, -9,-11,-23,-10, -9; /M: SY='Y'; M=-12, 4,-26, 6, -4, -3,-15, -2,-19, -8,-18,-15, 2,-19, -4,-10, 0, -5,-19, -2, 10, -4; /M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30, 0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30; /M: SY='C'; M= -7,-22, 46,-30,-26, 10,-27,-20,-14,-26, -4, -9,-20,-33,-27,-24,-13, -9, -5,-22, -1,-26; /M: SY='H'; M=-11, -3,-28, -3, 2,-23, -9, 24,-27, 13,-24, -7, 2,-15, 8, 8, -5,-12,-23,-21, 3, 3; /M: SY='C'; M= -3, -9, 27,-15,-18,-14,-22,-21, -8,-20, -7, -9, -8,-25,-18,-20, -3, 0, 0,-36,-18,-18; /M: SY='L'; M=-11,-30,-23,-33,-23, 14,-33,-23, 26,-30, 39, 18,-27,-27,-22,-23,-27,-10, 14,-17, 3,-23; /M: SY='R'; M=-18,-12,-30,-12, -4, -4,-24, 8,-18, 15,-14, -5, -8,-22, 8, 29,-13,-10,-17, -1, 24, -2; /M: SY='Q'; M=-11, 11,-17, 10, 13,-32,-16, 1,-25, 12,-25,-12, 11,-13, 24, 6, -1, -8,-27,-29,-15, 19; /M: SY='A'; M= 7,-13, -6,-17,-11,-14,-14,-16, -6, -6, -7, -2,-10,-19, -9, -6, 3, 0, 2,-28,-14,-10; /M: SY='A'; M= 13,-17,-13,-22,-16, -6,-18,-22, 5,-17, 11, 2,-17,-19,-16,-18, -2, 8, 11,-24,-10,-16; /M: SY='C'; M= -3, 0, 7, -3, 4,-25, -9, 3,-26, -8,-22,-15, 4,-17, 3,-10, 4, -6,-21,-34,-17, 3; /M: SY='H'; M= -8, -4,-27, -4, 12,-21,-21, 16,-15, 3,-14, -5, -3,-13, 7, 4, -6,-11,-13,-26, -5, 7; /M: SY='R'; M=-10, -4,-26, -6, 0,-20,-19, 0,-14, 12,-14, -5, 2,-16, 6, 13, -4, -6,-13,-25, -8, 2; /M: SY='F'; M=-17,-24,-10,-33,-26, 46,-26,-20, -4,-26, 5, -3,-17,-30,-31,-19,-20,-11, -6, 13, 17,-25; /M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-15, -5,-21,-23,-19, -9,-11,-15,-11,-20, 56,-11,-13,-13,-10,-19,-27,-22,-12; /M: SY='D'; M= -8, 24,-22, 27, 16,-27, -9, -2,-26, -1,-26,-21, 20,-10, 5, -5, 11, 4,-23,-36,-18, 10; /M: SY='N'; M= -1, 11,-23, 3, -4,-17,-12, 5,-13, -1,-18,-10, 16,-17, -3, -5, -1, -6,-15,-25, -5, -5; /M: SY='A'; M= 13, -7,-17,-12, -9,-18, -1,-16,-15, -9,-13,-11, -3, -6, -9, -9, 9, 7, -9,-26,-18, -9; /M: SY='T'; M= -5, -2,-23, -3, 2,-12,-22, -2, -7,-10, -4, -6, -5,-14, -4,-12, -2, 4, -7,-23, -1, -2; /I: MD=-15; /M: SY='V'; M= -7, -4,-21, -3, -9,-15,-16,-12, 3,-11, -4, 4, -7,-17, -5,-13, -4, -5, 6,-27,-10, -8; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='R'; M= -7, -4,-18, -5, 4,-14,-16, -6, -9, 6, -9, -5, -2, -9, 6, 11, -1, 4, -8,-17, -7, 4; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='Y'; M= -7,-12,-16,-14, -9, 3,-19, -7, 9,-11, 7, 4,-10,-13, -8,-11, -8, 1, 4, -7, 10,-10; D=-2; /I: MD=-15; /M: SY='C'; M= -5,-10, 2,-11, -7, -7,-13, -9, -7, -5, 0, -3, -7,-15, -6, 2, -3, -2, -4,-19, -8, -7; D=-2; /I: I=-4; MI=0; IM=0; DM=-20; /M: SY='A'; M= 15,-21,-16,-26,-20, -8,-11,-24, 10,-19, 8, 3,-19,-21,-19,-21, -7, -5, 15,-23,-12,-20; /M: SY='V'; M= 0,-28,-18,-33,-28, -2,-31,-29, 35,-23, 12, 12,-24,-24,-24,-24,-12, -4, 37,-25, -7,-28; /M: SY='G'; M= 5, -5,-20, -5,-10,-25, 36,-15,-30,-15,-30,-20, 5,-15,-10,-15, 19, -1,-20,-30,-25,-10; /M: SY='G'; M= 3, 1,-19, -2, -8,-24, 29,-12,-28,-13,-30,-20, 12,-15, -8,-13, 20, 1,-21,-32,-24, -8; /M: SY='F'; M= -8,-25,-18,-32,-23, 45,-24,-19, 2,-26, 13, 2,-18,-26,-29,-19,-14, -6, 1, -4, 14,-23; /M: SY='V'; M= -7,-29,-18,-33,-27, 11,-31,-23, 27,-24, 22, 18,-26,-27,-24,-21,-18, -6, 28,-21, -1,-26; /M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15, 0,-28, 9, 0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-29,-20, 12,-30,-15, 18,-28, 44, 18,-29,-30,-19,-19,-29,-10, 8,-14, 10,-20; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-28, 65,-30,-15, 2,-28, 14, 2,-21,-30,-34,-19,-21,-10, 0, 9, 32,-28; /M: SY='F'; M=-12,-29,-22,-37,-28, 30,-32,-22, 24,-26, 18, 17,-22,-26,-26,-22,-20, -9, 17,-10, 10,-27; /M: SY='C'; M= 1, 3, 37,-10,-16,-21, -6,-14,-24,-16,-23,-18, 11,-26,-16,-17, 1, -6,-17,-39,-25,-16; /M: SY='P'; M= -9,-21,-37,-12, -3,-27,-21,-21,-16,-11,-27,-17,-21, 80,-12,-20,-10, -9,-23,-30,-28,-12; /M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20, 8, 0, 5,-21,-19,-12; /M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-38,-28, 2,-38,-28, 45,-30, 25, 20,-22,-22,-20,-28,-22,-10, 26,-20, 0,-28; /M: SY='L'; M= -6,-30,-17,-31,-25, 5,-31,-25, 27,-26, 30, 16,-29,-29,-24,-21,-21, -6, 29,-24, -4,-25; /M: SY='S'; M= 10, 7,-14, 1, -3,-21, 6, -8,-20, -9,-28,-19, 18,-13, -3,-10, 27, 10,-15,-36,-21, -3; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, 0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='D'; M=-14, 12,-28, 18, 8,-25,-16, 9,-28, 11,-24,-14, 6,-14, 10, 10, -2, -8,-23,-23, -2, 7; /M: SY='A'; M= 7,-12,-16,-15, -5, -9,-15,-14, -2,-13, 5, 4,-11,-16, -6,-14, 1, 4, -1,-26,-11, -6; /M: SY='F'; M= -7,-17,-20,-22, -8, 38,-22,-15, -9,-18, -2, -7,-12,-20,-21,-15, -6, -6, -7, -6, 10,-12; /M: SY='N'; M=-12, 22,-25, 17, 1,-24, 0, 10,-24, 1,-24,-10, 26,-17, 0, -2, 0, -8,-25,-33,-14, 0; /M: SY='I'; M=-11,-29,-26,-34,-25, 7,-35,-21, 34,-28, 29, 18,-24,-25,-19,-24,-24,-10, 19,-15, 8,-25; /M: SY='I'; M= -8,-26,-22,-31,-24, 0,-33,-24, 28,-21, 19, 13,-21,-23,-18,-16,-16, -3, 23,-23, -4,-24; /M: SY='D'; M= -7, 17,-23, 25, 5,-27,-11, -9,-22, -7,-24,-20, 8, -2, -3,-13, 11, 4,-16,-37,-18, 0; /I: I=-6; MI=0; MD=-23; IM=0; /M: SY='E'; M= -7, 7,-22, 11, 13,-25, -2, 5,-25, 4,-21,-13, 4, -9, 9, -1, 3, -7,-21,-24,-12, 11; D=-4; /I: DM=-23; /M: SY='Y'; M= -9, -8, -8,-12, -9,-11,-21, -5, -8, -2,-13, -6, -3,-21, -1, -1, -3, -4, -7,-20, 2, -6; /M: SY='P'; M= -7,-19,-29,-15, -7,-15,-21,-19, -7,-16, -4, -7,-18, 36,-12,-18, -9, -2,-13,-28,-18,-12; /M: SY='S'; M= -6, 10,-21, 11, 2,-23,-10, 11,-24, -7,-26,-17, 12, -2, 0, -8, 13, 6,-20,-36,-13, -1; /M: SY='P'; M= 1, -4,-25, -2, 3,-22,-16,-16,-16, -9,-14,-14, -9, 21, -7,-15, 0, 4,-15,-29,-19, -4; /M: SY='N'; M= -9, 6,-23, 3, 0,-21,-17, 3,-14, -3,-16, -8, 8,-14, 8, 1, 4, 4,-14,-29, -9, 2; /M: SY='A'; M= 5, 0,-19, -4, -1,-19,-16,-12, -6, -7,-10, -7, -1,-13, 0,-11, 3, 4, -3,-27,-14, -1; /M: SY='R'; M= 1, -8,-22, -9, 3,-20,-15, -9,-20, 14,-17,-10, -4,-15, 3, 26, -1, -5,-10,-24,-14, 0; /M: SY='R'; M=-18, -8,-30, -8, 2,-22,-20, -2,-30, 34,-22,-10, 0,-18, 10, 62,-10,-10,-20,-20,-10, 2; /M: SY='T'; M= -4, 10,-18, -1, -7,-17, -4,-11,-17, -8,-20,-15, 17, -5, -8, -9, 12, 22,-15,-32,-17, -8; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-20, 16,-30, 43, 16,-28,-30,-24,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='T'; M= 2, -9,-19,-17,-14,-13,-11,-21, -2, -9, -8, -4, -6,-13,-11,-13, 4, 16, 1,-24,-11,-14; /M: SY='L'; M= -4,-18,-16,-20,-14, 0,-22,-18, 5,-22, 21, 5,-15,-22,-14,-16, -5, 8, 4,-26, -6,-14; /M: SY='I'; M= -9,-29,-25,-36,-27, 2,-35,-25, 39,-27, 24, 23,-23,-23,-19,-25,-21, -9, 27,-21, -1,-26; /M: SY='A'; M= 35, -6,-10,-13, -6,-20, 0,-16,-14,-10,-17,-14, -3,-10, -6,-16, 21, 7, -4,-27,-20, -6; /M: SY='K'; M=-10, 0,-30, 0, 10,-30,-20,-10,-30, 50,-30,-10, 0,-10, 10, 30,-10,-10,-20,-20,-10, 10; /M: SY='V'; M= -2,-17,-14,-23,-20, -5,-24,-21, 16,-17, 3, 9,-15,-20,-16,-17, 1, 12, 22,-28, -8,-19; /M: SY='I'; M= -9,-30,-23,-35,-26, 4,-35,-26, 35,-29, 31, 19,-25,-25,-21,-25,-23, -9, 24,-21, -1,-26; /M: SY='Q'; M=-10, -3,-29, -3, 16,-35,-21, 7,-16, 6,-13, 2, -3,-12, 52, 7, -3,-10,-26,-20, -9, 34; /M: SY='N'; M= -3, 14,-18, 5, -3,-18, -6, 10,-15, -8,-24,-14, 28,-16, -1, -6, 17, 4,-17,-37,-13, -3; /M: SY='L'; M= -2,-28,-21,-32,-23, 2,-29,-24, 26,-26, 30, 15,-25,-25,-20,-23,-20, -8, 19,-21, -4,-23; /M: SY='A'; M= 38, -9,-13,-16,-11,-22, 12,-19,-16,-12,-15,-13, -6,-12,-11,-19, 11, -1, -6,-22,-22,-11; /M: SY='N'; M= -7, 31,-18, 15, -1,-19, -2, 5,-19, -2,-28,-19, 48,-18, -1, -2, 15, 7,-25,-39,-19, -1; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 57 in 57 different sequences |
| Number of true positive hits | 56 in 56 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 1 |
| Number of false negative sequences | 1 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 98.25 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.25 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Ras-GAP |
| Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
56 sequences
BUD2_CANAL (Q5A506), BUD2_YEAST (P33314), DAB2P_HUMAN (Q5VWQ8), DAB2P_MOUSE (Q3UHC7), DAB2P_RAT (Q6P730), GAP1_CAEEL (Q22720), GAP1_DROME (P48423), GAP1_SCHPO (P33277), GAP2_CAEEL (Q8MLZ5), GAP2_DROME (Q8T498), GAPA_DICDI (O00899), GAPD1_BOVIN (A5D794), GAPD1_HUMAN (Q14C86), GAPD1_MOUSE (Q6PAR5), GAPD1_XENLA (A2RV61), IQG1_CANAL (Q5AH02), IQG1_SCHPO (O14188), IQGA1_HUMAN (P46940), IQGA1_MOUSE (Q9JKF1), IQGA2_HUMAN (Q13576), IQGA2_MOUSE (Q3UQ44), IQGA3_HUMAN (Q86VI3), IRA1_YEAST (P18963), IRA2_YEAST (P19158), NF1_HUMAN (P21359), NF1_MOUSE (Q04690), NF1_RAT (P97526), NFAA_DICDI (Q55AR6), NGAP_DICDI (Q54Y08), NGAP_HUMAN (Q9UJF2), RAS4B_HUMAN (C9J798), RASA1_BOVIN (P09851), RASA1_HUMAN (P20936), RASA1_RAT (P50904), RASA2_HUMAN (Q15283), RASA2_MOUSE (P58069), RASA2_RAT (Q63713), RASA3_BOVIN (Q28013), RASA3_HUMAN (Q14644), RASA3_MOUSE (Q60790), RASA3_RAT (Q9QYJ2), RASL1_HUMAN (O95294), RASL1_MOUSE (Q9Z268), RASL2_HUMAN (O43374), RASL2_MOUSE (Q6PFQ7), RASL3_BOVIN (A6QQ91), RASL3_HUMAN (Q86YV0), RASL3_MOUSE (Q8C2K5), RGAA_DICDI (Q54K32), RME6_CAEBR (A8WVM4), RME6_CAEEL (Q9GYH7), RME6_DROME (Q9VZ08), RME6_DROPS (Q29HW3), SYGP1_HUMAN (Q96PV0), SYGP1_MOUSE (F6SEU4), SYGP1_RAT (Q9QUH6)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
1 sequence
IQG1_YEAST (Q12280) |
| UniProtKB/Swiss-Prot False positive sequences |
1 sequence
RLMH_PROM5 (A2BWR4) |
| PDB [Detailed view] |
27 PDB
1NF1; 1WER; 1WQ1; 3BXJ; 3FAY; 5CJP; 6OB2; 6OB3; 6V65; 6V6F; 7MOC; 7MP5; 7MP6; 7PGP; 7PGQ; 7PGR; 7PGS; 7PGT; 7PGU; 7R03; 7R04; 8BOS; 8E20; 8EDL; 8EDM; 8EDN; 8EDO » more |