Entry: PS50021

General information about the entry
Entry name CH
Accession number PS50021
Entry type MATRIX
Date DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC50021
Associated ProRule PRU00044; PRU00300
Name and characterization of the entry
DescriptionCalponin homology domain profile.
Matrix / Profile 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=109;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=104;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.9715; R2=0.01425177; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=529; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=388; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-70; E1=-70; MM=3; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -7, -4,-21, -3,  0,-16,-19, -8, -9, -4, -4, -2, -5, -8, -2, -6, -6, -3,-10,-27,-11, -2;
/M: SY='S'; M= -4, -5,-14, -5,  1,-19,-18,-13,-11, -3,-14, -9, -4, -9, -3, -4,  2,  1, -6,-30,-15, -2;
/M: SY='E'; M= -1, -5,-24, -5,  9,-22,-16, -6,-14, -2,-12, -6, -5, -2,  9, -3,  1, -3,-14,-26,-14,  8;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-29,  9, 22,-26,-18, -7,-25, 17,-20,-14, -1,-10,  8,  8, -6,-10,-21,-18,-13, 15;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-27,  2, 15,-23,-17, -1,-22, 15,-19,-11,  1,-12, 10, 12, -3, -7,-19,-23,-10, 12;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-23, -3,  4,-19,-14,-11,-11, -4, -9, -7, -4,-13,  1, -5, -1,  2,-10,-25,-13,  2;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-14,-32,-23, 21,-28,-21, 13,-26, 22,  9,-23,-27,-24,-20,-20, -8, 10,-13,  5,-23;
/M: SY='L'; M= -4,-18,-19,-22,-15, -5,-23,-18,  6,-12, 13,  7,-16,-21,-12, -7,-11,  3,  7,-23, -6,-14;
/M: SY='R'; M= -8,  2,-25,  0,  4,-20,-11, -5,-17,  5,-12, -8,  4,-16,  1,  8, -4, -6,-16,-26,-13,  1;
/M: SY='W'; M=-20,-38,-48,-38,-29,  9,-20,-25,-19,-19,-19,-18,-38,-30,-19,-19,-38,-29,-28,139, 30,-20;
/M: SY='I'; M= -3,-26, -4,-32,-25,  0,-29,-25, 22,-24, 15, 12,-23,-26,-22,-23,-15, -6, 21,-25, -6,-25;
/M: SY='N'; M=-11, 16,-25,  6,  6,-22,-12,  3,-17,  5,-21,-11, 26,-16, 11,  8,  1, -4,-23,-30,-14,  8;
/M: SY='S'; M=  0,  3,-22,  2,  5,-21, -9, -3,-19,  3,-20,-11,  5,-13,  6,  0,  7, -1,-16,-25,-10,  5;
/M: SY='H'; M= -7,-11,-14,-13, -6,-15,-22,  7, -9, -4, -4,  2, -8,-20,  2, -2, -7, -5, -7,-26, -4, -3;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-15,-22,-18, -2,-19,-19,  5,-18, 14,  5,-17,-23,-17,-14,-11,  2,  6,-23, -6,-18;
/M: SY='A'; M=  4, -9,-22,-11, -5,-20, -2,-12,-13, -3,-14, -7, -5,-13, -6, -5,  0, -4, -6,-25,-16, -6;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-24, -1,  6,-23, -6, -6,-21,  3,-17,-11,  0, -7,  1,  0, -3, -8,-19,-26,-16,  3;
/M:         M=  0, -3,-22, -3, -2,-12,-12, -7,-15, -5,-13,-11, -4, -8, -6, -7, -2, -4,-12,-19, -2, -6;
/M:         M= -8,-11,-26,-11,-10,-10, -8,-13, -8,-10, -8, -6, -8, -8,-10,-11, -7, -7, -8,-20, -7,-11;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='D'; M= -5,  0,-19,  1,  0,-21, -3, -7,-21,  0,-20,-13,  0, -4, -2, -3, -2, -7,-17,-19,-13, -2; D=-5;
/I:         I=-3; MD=-14;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-13, -6, -3,-10,-13, -3, -6,  1, -7, -3, -4,-11, -3,  0, -4, -4, -1,-18, -6, -3; D=-5;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-16,  3,  0,-16, -4, -6,-15,  0,-14,-10,  5, -5, -1,  2,  3,  2,-12,-21,-12, -1; D=-5;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='I'; M= -7,-20,-19,-24,-19, -6,-24,-20, 14,-16,  5,  6,-17,-17,-16,-13,-12, -6, 14,-24, -8,-20; D=-5;
/I:         I=-3; DM=-14;
/M: SY='B'; M= -7, 10,-21,  9, 10,-20,-11, -6,-20,  0,-18,-14, 10,-12,  2, -4,  5,  3,-18,-30,-15,  6;
/M: SY='N'; M= -9, 23,-23, 19,  7,-24, -3,  6,-24, -2,-25,-18, 28,-15,  4, -4,  8, -2,-25,-35,-17,  5;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-18,-36,-27, 49,-30,-20,  8,-29, 20,  7,-23,-29,-32,-20,-22, -9,  6, -3, 18,-27;
/M: SY='Y'; M= -3, -8,-21,-11, -5, -5,-17, -5,-10, -4, -9, -5, -6,-17, -3, -3,  0,  0, -7,-18,  1, -5;
/M: SY='D'; M= -4, 10,-21, 11,  7,-25, -9, -8,-21,  0,-20,-15,  6,-11,  2, -4,  8,  5,-15,-31,-16,  5;
/I:         I=-6; MI=-30; MD=-29; IM=-30; DM=-29; II=-30;
/M: SY='D'; M=  0,  9,-17, 13, -1,-23, -1,-11,-24, -8,-22,-18,  4,-14, -6,-12,  7, -2,-15,-26,-17, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-19,-33,-24, 14,-28,-23, 10,-27, 25,  8,-28,-29,-22,-21,-26,-12,  4, 10,  6,-22;
/M: SY='R'; M= -3, -2,-21, -5,  1,-22,-14, -7,-22, 16,-22,-10,  3,-14,  5, 20,  3, -1,-14,-25,-12,  2;
/M: SY='D'; M=-15, 42,-26, 51, 13,-33, -9,  0,-33, -1,-28,-26, 26,-12, -1, -8,  5, -2,-27,-39,-19,  6;
/M: SY='G'; M=  3, -9,-28,-10,-18,-29, 62,-19,-37,-19,-29,-20,  0,-19,-18,-19,  3,-16,-27,-21,-29,-18;
/M: SY='V'; M= -8,-17,-22,-19,-12, -7,-26,-12,  8,-12,  8,  6,-15,-21,-10, -8,-12, -3,  9,-22, -5,-13;
/M: SY='V'; M=  1,-19,-16,-23,-18, -3,-22,-20,  8,-14,  6,  4,-17,-17,-17,-14,-10, -4, 12,-22, -7,-18;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-22, 21,-30,-17, 16,-28, 36, 14,-26,-29,-22,-20,-26, -9,  8,-12, 11,-22;
/M: SY='C'; M= -2,-14, 29,-23,-20, -8,-21,-21, -6,-22, -2, -5,-11,-27,-19,-21, -6, -3, -2,-33,-15,-20;
/M: SY='K'; M=  1,  1,-25,  1,  9,-26,-15,  1,-21, 12,-19, -9,  1,-11, 12,  6, -1, -7,-18,-24,-11, 10;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-30,-21, 10,-29,-19, 19,-28, 41, 18,-28,-29,-21,-20,-26, -9, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='I'; M=  0,-25,-20,-30,-22,  4,-26,-22, 21,-24, 21, 12,-22,-23,-19,-22,-16, -6, 16,-19, -1,-22;
/M: SY='N'; M=-11, 22,-25, 18, 17,-23,-11, 20,-26,  2,-24,-16, 26,-13,  7, -1,  2, -7,-28,-33,-12, 11;
/M: SY='K'; M=  0, -7,-20,-10, -6,-17,-14, -8,-11,  3,-13, -5, -4,-17, -2,  2, -1, -3, -4,-24,-10, -5;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-18,-29,-22,  5,-30,-13, 20,-25, 21, 12,-21,-26,-19,-21,-18, -8, 15,-20,  4,-22;
/M: SY='R'; M= -2, -6,-21, -7, -1,-13,-16, -6,-13,  2,-13, -7, -3,-16,  1,  5,  2,  0, -8,-21, -5, -1;
/M: SY='P'; M= -8,-15,-36, -7,  1,-29,-11,-18,-21, -9,-27,-18,-15, 63, -9,-18, -8,-10,-27,-29,-28, -8;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-28, 10,  3,-28,  9, -7,-29,  1,-25,-17,  8,-11, -2, -2, -1,-10,-24,-27,-20,  0;
/I:         I=-9; MD=-25;
/M: SY='S'; M=  2, -8,-17, -8, -8,-11, -9,-14,-10, -9, -5, -6, -6,-16, -9, -9,  3,  3, -5,-25,-11, -8; D=-5;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; II=-30;
/M:         M= -7, -1,-18,  0, -4,-12,-14,-10, -2, -7, -5, -3, -2,-10, -7, -8, -3, -3, -1,-23, -9, -7; D=-5;
/I:         I=-9; DM=-25;
/M: SY='D'; M=-10,  0,-22,  2, -3,-10,-16, -6,-14, -6,-12, -8, -3, -5, -6, -8, -7, -7,-13,-14, -3, -5; D=-5;
/I:         I=-9; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-26, -4,  1,-16,-14,-12,-15, -2,-13,-10, -7,-14, -4, -5, -7, -7,-12, -9, -9, -1;
/M: SY='K'; M= -6, -6,-24, -6,  1,-20,-19,-11,-15, 11,-15, -7, -5, -6,  1,  8, -2,  0,-10,-25,-12,  0;
/M: SY='M'; M= -3,-12,-22,-14, -9,-10,-20,-11, -2, -2, -3,  1, -9,-16, -8, -4, -8, -5,  1,-21, -7, -9;
/M: SY='V'; M=  0,-11,-20,-14,-10,-12,-17,-12, -1, -9, -5, -3, -8,-16, -8, -9, -5, -4,  1,-21, -8,-10;
/M: SY='N'; M= -1,  3,-22, -1, -2,-19, -9, -8,-15, -1,-16,-10,  6, -9, -2, -3,  2, -1,-13,-27,-13, -3;
/M: SY='K'; M= -6,  2,-26,  2,  6,-22,-13, -6,-21,  8,-20,-10,  2, -7,  7,  5,  0, -4,-19,-23,-12,  6;
/I:         I=-4; MD=-10;
/M: SY='N'; M= -3,  3,-18,  2,  1,-16, -4, -7,-13, -2,-16,-10,  5,  0, -2, -4,  2, -2,-13,-19,-13, -1; D=-5;
/I:         I=-4; MD=-10;
/M: SY='P'; M= -3, -4,-19, -3,  1,-14,-11, -8,-10, -1,-12, -8, -2, 10, -2, -4, -1, -3,-12,-19,-12, -2; D=-5;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M:         M= -2, -7,-12, -8, -6, -7, -5, -8, -3, -4, -2,  0, -5, -4, -5, -4, -3, -1, -3,-12, -6, -6; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='S'; M=  0, -3,-11, -6, -5, -8, -2, -5, -6, -6, -6,  1,  1,-10, -1, -4,  4,  2, -5,-17, -8, -3; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -4, -1,-18, -1,  4,-16,-11, -2,-14,  3,-13, -7,  1, -1,  4,  7,  0, -3,-12,-19,-11,  3; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='F'; M= -8,-16,-15,-20,-11, 25,-19,-13,  2,-15,  5,  2,-13,-16,-16,-12,-10, -5,  1, -2,  8,-12; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='H'; M= -8,  2,-20,  2,  4,-17,-14,  8,-15,  6,-12, -4,  3,-12,  7,  6, -4, -6,-14,-20, -5,  5; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='K'; M= -4, -4, -7, -6, -2,-17,-15, -4,-16,  5,-15, -8, -2,-12,  2,  4, -5, -7,-13,-20, -8, -1; D=-5;
/I:         I=-4; DM=-10;
/M: SY='L'; M= -9,-16,-20,-19,-13, -4,-24,-12,  5,-11, 10, 10,-14,-21, -9, -5,-13, -5,  2,-19, -3,-12;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-26, 10, 24,-24,-15, -1,-23,  6,-18,-13,  5,-10, 13,  1, -1, -7,-22,-26,-13, 18;
/M: SY='N'; M=-12, 28,-22, 13,  0,-20, -6,  7,-19,  3,-26,-16, 44,-20,  3,  9,  5, -2,-26,-34,-16,  1;
/M: SY='V'; M=  3,-23, -7,-29,-22, -3,-26,-24, 17,-22, 11,  6,-20,-23,-19,-21,-11, -4, 18,-24, -8,-22;
/M: SY='N'; M= -7, 11,-24,  8,  8,-23, -9,  0,-21,  4,-21,-12, 15,-14,  7,  3,  3, -4,-20,-29,-15,  7;
/M: SY='Y'; M= -7, -8,-23,-11, -6, -7,-20,  0, -5, -5,  0,  2, -5,-20,  1, -4, -8, -4, -8,-17,  4, -4;
/M: SY='F'; M= 15,-20,-11,-28,-20, 16,-14,-21, -2,-19, -1, -4,-16,-21,-23,-20, -4, -5,  5,-10, -2,-20;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-32,-24, 17,-29,-21, 20,-27, 29, 16,-25,-27,-22,-21,-23, -9, 14,-16,  3,-23;
/M: SY='N'; M= -6, 11,-23, 11, 10,-26, -7, -1,-23,  5,-23,-14, 12,-12,  9,  0,  6, -3,-21,-30,-15,  9;
/M: SY='F'; M=  2,-17,-17,-23,-17,  5,-19,-17,  2,-17, -1, -2,-12,-21,-16,-17, -5, -3,  4,-11, -2,-16;
/M: SY='A'; M= 20,-16,  1,-23,-17,-13, -9,-21, -3,-18,  0, -3,-13,-19,-15,-21, -3, -5,  2,-25,-16,-17;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='K'; M=-10,  6,-27,  9, 15,-26,-15, -2,-26, 16,-22,-13,  3,-12,  8, 16, -3, -7,-20,-27,-14, 11;
/M: SY='K'; M= -5,  1,-25,  1, 10,-20,-16, -2,-22, 12,-20,-12,  0,-12,  6,  6,  0, -3,-18,-21, -7,  8;
/M: SY='L'; M= -8,-19,-21,-22,-15,  3,-25,-11, 10,-17, 16, 10,-18,-24,-11,-14,-17, -9,  4,-15,  7,-15;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-29, -1, -8,-28, 41,-12,-34,-11,-27,-18,  6,-17,-10,-12,  0,-15,-27,-24,-24, -9;
/M: SY='V'; M= -3,-25,  1,-30,-26,  3,-28,-24, 15,-22,  8,  6,-22,-27,-24,-21,-12, -3, 22,-24, -5,-25;
/M: SY='P'; M= -9, -8,-27, -5,  3,-22,-19,-11,-18,  5,-20,-12, -7, 17, -1,  1, -4, -5,-17,-27,-17, -1;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='L'; M=  0, -8,-12, -9, -6, -4,-11, -9,  1,-11,  4,  0, -8,-10, -8,-10, -3,  0,  2,-16, -6, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-19;
/M: SY='V'; M= -6, -9,-20, -8, -4,-11,-21,-16, -3, -3, -7, -4,-11,-14, -9, -6, -7, -6,  4,-25,-11, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-19;
/M: SY='L'; M=-11,-11,-23,-16,-16,  3,-15,-10,  1,-16,  5,  3, -5,-22,-13,-12,-12, -7, -4,-15,  2,-15;
/M: SY='F'; M= -9,-27,-19,-33,-24, 23,-31,-23, 18,-26, 19, 10,-22,-24,-25,-22,-18, -7, 13,-13,  5,-25;
/M: SY='D'; M= -3,  5,-24,  9,  9,-25, -5, -7,-22, -4,-15,-13,  0,-12,  3, -6,  1, -3,-17,-27,-16,  6;
/M: SY='P'; M= 10, -9,-21,-10, -7,-21, -3,-18,-16,-11,-19,-14, -6, 15,-11,-17,  6,  4,-12,-28,-22,-10;
/M: SY='E'; M= -8,  6,-25,  9, 19,-22,-16, -1,-20,  4,-18,-13,  3,-11,  7, -1,  1, -5,-16,-29,-14, 13;
/M: SY='D'; M=-17, 40,-29, 55, 19,-36,-10,  4,-37,  1,-28,-25, 17,-11,  2, -7,  0,-10,-28,-37,-18, 10;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-22,-32,-24,  5,-32,-22, 30,-26, 30, 20,-24,-26,-19,-22,-22, -9, 20,-20,  0,-24;
/M: SY='V'; M= -6,-16,-19,-19,-17,  6,-24,-13,  8,-14,  2,  3,-14,-25,-17,-14,-10, -4, 13,-14,  6,-17;
/M: SY='E'; M= -9, 13,-26, 21, 22,-26,-16, -5,-23,  2,-17,-16,  3,-10,  5, -4,  0, -5,-18,-30,-15, 13;
/M: SY='G'; M= -5, -9,-26,-10,-10,-21, 15,-13,-21, -5,-18,-10, -4,-12,-10, -3, -3,-10,-14,-24,-19,-11;
/I:         I=-9; MD=-27;
/M: SY='N'; M=-10,  9,-22,  3,  1,-19, -9,  0,-22, 10,-23,-12, 16,-15,  3, 10,  0, -4,-20,-27,-13,  1; D=-5;
/I:         I=-9; MD=-27;
/M: SY='D'; M= -7,  7,-23,  8,  4,-22, -7, -2,-21,  4,-19,-12,  7, -3,  2,  3, -2, -7,-19,-25,-14,  2; D=-5;
/I:         I=-9; MI=-30; MD=-27; IM=-30; DM=-27; II=-30;
/M: SY='K'; M= -9,-11,-28,-12, -3,-14,-21, -5,-12,  5,-12, -2, -9,  4, -3,  1,-10, -7,-12,-22, -8, -5;
/M: SY='L'; M= -7, -6,-24, -4, -8,-12,-16,-13, -4,-13,  7,  3,-11,-12, -9,-13,-13, -8, -5,-25,-10, -9;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-22, -9,  1,-16,-22,-12, -4, -1,-10, -5, -2,-13,  0, -4, -2,  1, -4,-23,-10, -1;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-14,-26,-19, -1,-28,-19, 14,-15, 21, 12,-24,-27,-18,-12,-19, -6, 17,-24, -5,-19;
/M: SY='A'; M=  7,-11,-11,-15,-13,-15,  5,-18,-13,-16,-12, -9, -6,-17,-11,-17,  6,  2, -7,-26,-17,-12;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-18,-25,-19, 10,-27,-17, 12,-19, 17,  8,-18,-26,-18,-14,-16, -6, 10,-18,  2,-19;
/M: SY='I'; M= -7,-20, -3,-27,-22,  4,-29,-23, 12,-23, 10,  7,-17,-23,-20,-21,-10,  5, 12,-24, -4,-22;
/M: SY='W'; M=  0,-24,-26,-28,-20,  1,-21,-23,  0,-19,  5, -1,-23,-22,-15,-18,-16, -5, -3, 26,  3,-16;
/M: SY='Y'; M= -8, -8,-17,-11, -7, -6,-20,  4, -9, -8, -7, -2, -5,-19,  3, -7, -1,  3,-11,-16, 10, -3;
/M: SY='L'; M=  2,-22,-19,-26,-17,  0,-25,-21, 15,-21, 19,  9,-20,-23,-16,-19,-13, -5, 13,-22, -6,-17;
/M: SY='L'; M= -7,-23,-22,-27,-19,  5,-26,-17, 15,-21, 16, 14,-19,-21,-13,-18,-14, -5,  9,-14,  0,-17;
/M: SY='S'; M= -3, -7,-22,-10, -6,-14, -6, -7,-14, -5,-10, -7, -1,-18,  0, -1,  1, -3,-13,-19, -6, -4;
/M: SY='R'; M=-11,-14,-24,-16,-11,  0,-19, -3,-10, -3, -4, -2, -9,-21, -8,  7, -9, -5, -8,-13,  2,-10;
/M: SY='Y'; M=-11,-14,-26,-17,-13,  9,-16,  3, -8,-11, -5, -3,-10,-22,-11, -7,-12, -8,-10, -1, 22,-13;
/M:         M= -3, -8,-20,-10, -5,-16,-17, -4, -9, -7, -8, -4, -7, -7, -1, -7, -4, -3, -9,-25, -9, -4;
/I:         E1=0;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 426 hits in 279 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 426 hits in 279 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 15
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 96.60 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: P_Bucher
  • Taxonomic range: Eukaryotes
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 4
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: CH
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
ACTN1_BOVIN (Q3B7N2), ACTN1_CHICK (P05094), ACTN1_HUMAN (P12814), 
ACTN1_MACFA (Q2PFV7), ACTN1_MOUSE (Q7TPR4), ACTN1_RAT   (Q9Z1P2), 
ACTN2_BOVIN (Q3ZC55), ACTN2_CHICK (P20111), ACTN2_HUMAN (P35609), 
ACTN2_MOUSE (Q9JI91), ACTN3_BOVIN (Q0III9), ACTN3_HUMAN (Q08043), 
ACTN3_MOUSE (O88990), ACTN4_BOVIN (A5D7D1), ACTN4_CHICK (Q90734), 
ACTN4_HUMAN (O43707), ACTN4_MOUSE (P57780), ACTN4_PONAB (Q5RCS6), 
ACTN4_RAT   (Q9QXQ0), ACTNA_DICDI (P05095), ACTNB_DICDI (O76329), 
ACTN_ANOGA  (Q7PKQ5), ACTN_DROME  (P18091), AIN1_SCHPO  (O13728), 
ANC1_CAEEL  (Q9N4M4), ARHG6_CHICK (Q5ZLR6), ARHG6_HUMAN (Q15052), 
ARHG6_MOUSE (Q8K4I3), ARHG6_RAT   (Q5XXR3), ARHG7_HUMAN (Q14155), 
ARHG7_MOUSE (Q9ES28), ASPM_AOTVO  (P62283), ASPM_BOVIN  (P62285), 
ASPM_CANFA  (P62286), ASPM_COLGU  (P62287), ASPM_FELCA  (P62288), 
ASPM_GORGO  (P62289), ASPM_HUMAN  (Q8IZT6), ASPM_HYLLA  (P62290), 
ASPM_MACFA  (P62291), ASPM_MACMU  (P62292), ASPM_MOUSE  (Q8CJ27), 
ASPM_PANTR  (P62293), ASPM_PONPY  (P62294), ASPM_SAIBB  (P62296), 
ASPM_SHEEP  (P62297), ASP_DROME   (Q9VC45), ATK4_ARATH  (O81635), 
CLMN_HUMAN  (Q96JQ2), CLMN_MOUSE  (Q8C5W0), CNN1_BOVIN  (Q2HJ38), 
CNN1_CHICK  (P26932), CNN1_HUMAN  (P51911), CNN1_MELGA  (P37803), 
CNN1_MOUSE  (Q08091), CNN1_MUSPF  (Q9GK38), CNN1_PIG    (Q08092), 
CNN1_RAT    (Q08290), CNN1_SHEEP  (Q7YRL2), CNN2_BOVIN  (Q3SYU6), 
CNN2_HUMAN  (Q99439), CNN2_MOUSE  (Q08093), CNN2_PIG    (Q08094), 
CNN2_PONAB  (Q5RFN6), CNN3_BOVIN  (Q32L92), CNN3_HUMAN  (Q15417), 
CNN3_MOUSE  (Q9DAW9), CNN3_RAT    (P37397), CTXA_DICDI  (Q54HG2), 
CTXA_POLPA  (Q9Y0T4), CTXB_DICDI  (Q550R2), CTXB_POLPA  (Q9Y0T3), 
CYTSA_CANFA (Q2KNA0), CYTSA_CHICK (Q2KN97), CYTSA_DANRE (Q2KN93), 
CYTSA_HUMAN (Q69YQ0), CYTSA_MOUSE (Q2KN98), CYTSA_PANTR (Q2KNA1), 
CYTSA_RAT   (Q2KN99), CYTSA_TAKRU (Q2KN94), CYTSA_TETNG (Q2KN95), 
CYTSA_XENTR (Q2KN96), CYTSB_HUMAN (Q5M775), CYTSB_MOUSE (Q5SXY1), 
DIXC1_HUMAN (Q155Q3), DIXC1_MOUSE (Q80Y83), DIXC1_RAT   (Q2VUH7), 
DMDA_DROME  (Q9VDW6), DMD_CAEEL   (Q9TW65), DMD_CANFA   (O97592), 
DMD_CHICK   (P11533), DMD_HUMAN   (P11532), DMD_MOUSE   (P11531), 
DMD_PIG     (Q5GN48), DYST_HUMAN  (Q03001), DYST_MOUSE  (Q91ZU6), 
EB1C_ARATH  (Q9FGQ6), EB1_DICDI   (Q8WQ86), EH1L1_HUMAN (Q8N3D4), 
EH1L1_MOUSE (Q99MS7), EHBP1_HUMAN (Q8NDI1), EHBP1_MOUSE (Q69ZW3), 
FIMB1_ARATH (Q7G188), FIMB2_ARATH (Q9FKI0), FIMB3_ARATH (Q9FJ70), 
FIMB_DICDI  (P54680), FIMB_SCHPO  (O59945), FIMB_YEAST  (P32599), 
FLNA_DROME  (Q9VEN1), FLNA_HUMAN  (P21333), FLNA_MOUSE  (Q8BTM8), 
FLNB_HUMAN  (O75369), FLNB_MOUSE  (Q80X90), FLNC_HUMAN  (Q14315), 
FLNC_MOUSE  (Q8VHX6), GA2L1_HUMAN (Q99501), GA2L1_MOUSE (Q8JZP9), 
GA2L2_HUMAN (Q8NHY3), GA2L2_MOUSE (Q5SSG4), GA2L3_HUMAN (Q86XJ1), 
GA2L3_MOUSE (Q3UWW6), GAS2_HUMAN  (O43903), GAS2_MOUSE  (P11862), 
GEFP_DICDI  (Q54TK8), GELA_DICDI  (P13466), GXCB_DICDI  (Q55E26), 
GXCDD_DICDI (Q1ZXH8), HOOK_ANOGA  (Q7PWT9), HOOK_CULQU  (B0WPU9), 
HOOK_DICDI  (Q54IK9), IQG1_YEAST  (Q12280), IQGA1_HUMAN (P46940), 
IQGA1_MOUSE (Q9JKF1), IQGA2_HUMAN (Q13576), IQGA2_MOUSE (Q3UQ44), 
IQGA3_HUMAN (Q86VI3), LIMC1_HUMAN (Q9UPQ0), LIMC1_MOUSE (Q3UH68), 
LIMC1_XENLA (Q3KQW7), LIMCH_DICDI (Q55GV9), LMO7_HUMAN  (Q8WWI1), 
LRCH1_FELCA (P41737), LRCH1_HUMAN (Q9Y2L9), LRCH1_MOUSE (P62046), 
LRCH2_HUMAN (Q5VUJ6), LRCH2_MOUSE (Q3UMG5), LRCH3_HUMAN (Q96II8), 
LRCH3_MOUSE (Q8BVU0), LRCH4_HUMAN (O75427), LRCH4_MOUSE (Q921G6), 
MACF1_HUMAN (Q9UPN3), MACF1_MOUSE (Q9QXZ0), MACF1_RAT   (D3ZHV2), 
MARE1_BOVIN (Q3ZBD9), MARE1_CHICK (Q5ZLC7), MARE1_COTCO (Q6V291), 
MARE1_COTJA (Q66T82), MARE1_HUMAN (Q15691), MARE1_MOUSE (Q61166), 
MARE1_PONAB (Q5R7Z5), MARE1_RAT   (Q66HR2), MARE1_XENTR (Q6P848), 
MARE2_BOVIN (Q3SZP2), MARE2_CHICK (Q5ZKK1), MARE2_HUMAN (Q15555), 
MARE2_MOUSE (Q8R001), MARE2_PONAB (Q5R4I6), MARE2_RAT   (Q3B8Q0), 
MARE3_HUMAN (Q9UPY8), MARE3_MOUSE (Q6PER3), MARE3_RAT   (Q5XIT1), 
MCA3A_DANRE (F1QH17), MCA3B_DANRE (F1QWK4), MICA1_BOVIN (F1MH07), 
MICA1_DANRE (E7F9T0), MICA1_HUMAN (Q8TDZ2), MICA1_MOUSE (Q8VDP3), 
MICA1_RAT   (D3ZBP4), MICA2_BOVIN (F1MF74), MICA2_HUMAN (O94851), 
MICA2_MOUSE (Q8BML1), MICA2_RAT   (D4A1F2), MICA2_XENTR (F6QZ15), 
MICA3_BOVIN (G3MWR8), MICA3_HUMAN (Q7RTP6), MICA3_MOUSE (Q8CJ19), 
MICAL_DROME (Q86BA1), MILK1_HUMAN (Q8N3F8), MILK1_MOUSE (Q8BGT6), 
MILK2_HUMAN (Q8IY33), MP20_DROME  (P14318), MYPH_ECHGR  (Q24799), 
NAV2_HUMAN  (Q8IVL1), NAV3_DANRE  (Q5TZ18), NAV3_HUMAN  (Q8IVL0), 
NAV3_MOUSE  (Q80TN7), PAKD_DICDI  (Q55DD4), PARVA_HUMAN (Q9NVD7), 
PARVA_MOUSE (Q9EPC1), PARVA_RAT   (Q9HB97), PARVB_HUMAN (Q9HBI1), 
PARVB_MOUSE (Q9ES46), PARVG_HUMAN (Q9HBI0), PARVG_MOUSE (Q9ERD8), 
PARV_CAEEL  (O16785), PLEC_CRIGR  (Q9JI55), PLEC_HUMAN  (Q15149), 
PLEC_MOUSE  (Q9QXS1), PLEC_RAT    (P30427), PLSI_BOVIN  (A6H742), 
PLSI_CHICK  (P19179), PLSI_HUMAN  (Q14651), PLSI_MOUSE  (Q3V0K9), 
PLSL_DANRE  (Q6P698), PLSL_HUMAN  (P13796), PLSL_MOUSE  (Q61233), 
PLST_BOVIN  (A7E3Q8), PLST_CRIGR  (O88818), PLST_HUMAN  (P13797), 
PLST_MOUSE  (Q99K51), PLST_RAT    (Q63598), RNG2_SCHPO  (O14188), 
SCP1_YEAST  (Q08873), SICK_DROME  (Q9VIQ9), SMTL1_HUMAN (A8MU46), 
SMTL1_MOUSE (Q99LM3), SMTL2_BOVIN (Q2KI85), SMTL2_HUMAN (Q2TAL5), 
SMTL2_MOUSE (Q8CI12), SMTN_HUMAN  (P53814), SMTN_MOUSE  (Q921U8), 
SPEF2_HUMAN (Q9C093), SPEF2_PIG   (Q2IA00), SPEF2_RAT   (Q9R095), 
SPTB1_HUMAN (P11277), SPTB1_MOUSE (P15508), SPTB2_HUMAN (Q01082), 
SPTB2_MOUSE (Q62261), SPTCB_DROME (Q00963), SPTN2_HUMAN (O15020), 
SPTN2_RAT   (Q9QWN8), SPTN4_HUMAN (Q9H254), SPTN5_HUMAN (Q9NRC6), 
SSP4_DROME  (A1ZAU8), STG1_SCHPO  (O14185), SYNE1_HUMAN (Q8NF91), 
SYNE1_MOUSE (Q6ZWR6), SYNE2_HUMAN (Q8WXH0), SYNE2_MOUSE (Q6ZWQ0), 
TAGL2_BOVIN (Q5E9F5), TAGL2_HUMAN (P37802), TAGL2_MOUSE (Q9WVA4), 
TAGL2_RAT   (Q5XFX0), TAGL3_BOVIN (Q3ZBY2), TAGL3_HUMAN (Q9UI15), 
TAGL3_MACFA (Q4R5J4), TAGL3_MOUSE (Q9R1Q8), TAGL3_PONAB (Q5R6R2), 
TAGL3_RAT   (P37805), TAGL_BOVIN  (Q9TS87), TAGL_CHICK  (P19966), 
TAGL_HUMAN  (Q01995), TAGL_MOUSE  (P37804), TAGL_RAT    (P31232), 
UNC53_CAEEL (Q7YSI9), UTRO_HUMAN  (P46939), VAV2_HUMAN  (P52735), 
VAV2_MOUSE  (Q60992), VAV3_HUMAN  (Q9UKW4), VAV3_MOUSE  (Q9R0C8), 
VAV_BOVIN   (Q08DN7), VAV_CAEEL   (Q45FX5), VAV_DROME   (Q9NHV9), 
VAV_HUMAN   (P15498), VAV_MOUSE   (P27870), VAV_RAT     (P54100), 
Y2471_DICDI (Q75JP5), Y7875_DICDI (Q1ZXE2), YBX7_SCHPO  (Q10201)
False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile):
BIM1_YEAST  (P40013), CAM1B_DANRE (A5WUN7), CAMP1_HUMAN (Q5T5Y3), 
CAMP1_MOUSE (A2AHC3), CAMP1_XENLA (Q6IRN6), CAMP2_HUMAN (Q08AD1), 
CAMP2_MOUSE (Q8C1B1), CAMP3_HUMAN (Q9P1Y5), CAMP3_MOUSE (Q80VC9), 
CHDC2_HUMAN (Q8N9S7), EB1A_ARATH  (Q7XJ60), EB1B_ARATH  (Q9FJJ5), 
MAL3_SCHPO  (Q10113), MARE2_XENLA (Q7ZXP1), SPEF2_MOUSE (Q8C9J3)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]		 1AA2; 1AOA; 1BHD; 1BKR; 1DXX; 1H67; 1MB8; 1P2X; 1P5S; 1PA7; 1PXY; 1QAG; 1RT8; 1SH5; 1SH6; 1SJJ; 1TJT; 1UEG; 1UJO; 1V5K; 1VKA; 1WJO; 1WKU; 1WYL; 1WYM; 1WYN; 1WYO; 1WYP; 1WYQ; 1WYR; 2D85; 2D86; 2D87; 2D88; 2D89; 2DK9; 2E9K; 2EYI; 2EYN; 2JV9; 2K2R; 2K3S; 2L3G; 2QJZ; 2R0O; 2R8U; 2RR8; 2VZC; 2VZD; 2VZG; 2VZI; 2WA5; 2WA6; 2WA7; 2WFN; 2YRN; 3CO1; 3F7P; 3FER; 3HOC; 3HOP; 3HOR; 3I6X; 3KMU; 3KMW; 3KY9; 3LUE; 3REP; 4B7L; 4EDL; 4EDM; 4EDN;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or