Entry: PS50022

General information about the entry
Entry name FA58C_3
Accession number PS50022
Entry type MATRIX
Date MAY-2003 (CREATED); MAY-2003 (DATA UPDATE); APR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC00988
Associated ProRule PRU00081
Name and characterization of the entry
DescriptionCoagulation factors 5/8 type C domain (FA58C) profile.
Matrix / Profile 
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=150;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=150;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1392250; R2=0.0273076; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=233; N_SCORE=8.5000; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=160; N_SCORE=6.5000; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C'; M=  3,-15, 40,-22,-19,-15,-19,-22,-15,-18,-13,-12,-14,-24,-19,-20, -1,  1, -2,-35,-20,-19;
/M:         M= -2, -7,-21, -9, -9, -9,-12,-12,-10, -7,-10, -7, -5,-14, -8, -6, -1, -1, -6,-22, -7, -9;
/M: SY='E'; M= -1, -6,-23, -6,  2,-18,-14,-10,-10, -7,-11, -8, -6, -1, -3,-11,  0, -1, -9,-27,-14, -2;
/M: SY='P'; M= -7,-13,-26,-12, -8,-12,-21,-15, -1,-13, -8, -3,-11, 13,-11,-15, -7, -4, -5,-26,-13,-12;
/I:         I=-20; MD=-22;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-16,  0,  2,-15, -6, -7,-13, -2,-12, -9,  1, -8,  0, -3,  3,  1, -9,-19,-10,  1; D=-10;
/I:         I=-20; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='L'; M= -8,-21,-19,-23,-17,  5,-22,-17, 13,-21, 25, 12,-20,-24,-16,-15,-18, -7,  8,-19, -2,-17; D=-10;
/I:         I=-20; DM=-22;
/M: SY='G'; M=  4, -2,-23, -5,-12,-24, 34,-14,-27,-12,-24,-16,  6,-15,-12,-13,  5, -8,-21,-24,-23,-12; D=-10;
/I:         I=-20; DM=-22;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-21,-26,-19,  4,-26,-16, 14,-19, 21, 17,-21,-22,-14,-15,-18, -7,  9,-16,  0,-16;
/M: SY='E'; M= -1, -8,-23, -8,  4,-16,-15,-12,-10, -3, -8, -6, -7, -9, -2, -4, -3, -5, -8,-24,-12,  0;
/M: SY='D'; M= -2,  9,-22, 11,  7,-25, -3, -7,-23, -4,-23,-17,  7, -8,  1, -7, 10,  1,-18,-32,-18,  4;
/M: SY='G'; M= -2, -3,-24, -3, -5,-22, 13,-12,-22, -9,-19,-13,  0,-12, -6,-10,  3, -5,-18,-25,-18, -6;
/M:         M=  0,-11,-23,-12, -6,-12,-13,-12,-10, -7, -9, -6, -8, -4, -8, -5, -3, -3, -7,-24,-13, -8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='I'; M=  1,-18,-16,-22,-17, -2,-21,-17, 18,-17, 10,  8,-14,-15,-14,-17, -9, -4, 15,-17, -4,-17; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='P'; M=  2, -5,-18, -4,  3,-14, -9, -7,-12, -5,-13,-10, -4, 11, -2, -8,  0, -2,-12,-18,-11, -1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='D'; M= -8, 17,-20, 20,  9,-21, -7, -1,-20, -1,-18,-15, 11, -7,  2, -4,  3, -2,-18,-25,-12,  5; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-18,  0,  0,-14, -9, -7,-13, -2,-15, -9,  0, -5, -3, -5,  4,  0, -9,-21,-10, -2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Q'; M=  1,  0,-23, -1,  6,-26, -9, -6,-20,  4,-20,-11,  1, -3, 13,  1,  5, -1,-18,-25,-16,  9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='I'; M= -5,-26,-20,-32,-25,  7,-30,-24, 27,-23, 17, 14,-21,-24,-22,-22,-16, -5, 23,-19,  0,-25;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-17, -5, -4,-17,-11,-11,-14, -5,-16,-11,  2,-12, -1, -5, 12, 18, -8,-28,-11, -3;
/M: SY='A'; M= 27, -8,-11,-13, -9,-17, -7,-17, -8,-10,-11, -9, -7,-13, -9,-15, 10,  4,  1,-24,-15, -9;
/M: SY='S'; M=  8,  1,-10, -1, -2,-18, -4,-11,-18,-10,-24,-17,  7,-11, -3,-11, 29, 20, -9,-36,-17, -3;
/M: SY='S'; M=  9, -1,-15, -4, -3,-18, -2,-11,-16, -9,-22,-15,  5,-12, -4,-10, 22, 10, -8,-33,-17, -4;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-19, -2,  4,-17,-10, -7,-15, -7,-14,-10,  0,-14,  2, -9,  7,  2,-12,-27,-11,  3;
/M:         M= -6,-11,-24,-12, -7, -8,-15,-10, -9, -8, -9, -6, -9,-19, -4, -6, -4, -4, -7, -5,  0, -6;
/M: SY='B'; M= -1,  9,-21,  8,  6,-23, -6, -7,-22, -2,-22,-16,  9, -7,  1, -5,  9,  3,-18,-31,-18,  3;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-23,  1,  6,-19, -8, -6,-17, -5,-16,-12,  2,-10,  0, -7,  4, -2,-15,-25,-12,  2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='Y'; M= -4, -9,-21,-11, -9, -5, -9, -8, -9, -9, -9, -7, -6,-13, -8, -9, -4, -3, -9, -6,  2, -9; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M:         M= -4, -3,-18, -4,  0,-10, -7, -1,-12, -7, -9, -8, -2,-12, -3, -7, -1, -1,-11, -9, -4, -2; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='G'; M=  2, -3,-17, -4, -3,-18, 11,-11,-20, -7,-18,-13,  1,-11, -6, -9,  6, -2,-15,-20,-15, -5; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='P'; M= -1,-10,-27, -7,  1,-23,-15,-14,-18, -5,-23,-16,-10, 35, -7,-13, -3, -7,-19,-27,-20, -6;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-25,  7, 10,-27, -3, -4,-25,  3,-22,-15,  3, -9,  4, -2,  1, -8,-20,-28,-17,  6;
/M:         M= -2, -7,-23,-11, -7,-10,-14, -7,-10, -3, -9, -5, -4,-15, -4, -3, -4, -4, -9,-15, -3, -6;
/M: SY='A'; M= 20, -6,-18,-11, -6,-17, -3,-12,-12, -8,-12, -9, -4,-11, -7,-13,  4, -3, -7,-22,-14, -7;
/M: SY='R'; M= -7, -8,-25, -9, -4,-16,-15, -8,-18, 11,-13, -8, -3,-16,  0, 26, -6, -7,-11,-22,-11, -5;
/M: SY='L'; M= -6,-16,-22,-16,-16,  1,-23,-19,  9,-22, 20,  7,-18,-22,-17,-19,-17, -8,  6,-22, -5,-17;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-23,  9, -3,-21,  3, -1,-22, -8,-20,-15, 12,-17, -6, -9,  3, -3,-18,-29,-14, -5;
/I:         I=-12; MD=-25;
/M: SY='D'; M= -7, 17,-17, 23,  6,-20, -6, -4,-20,  2,-17,-13,  7, -7, -1, -3,  1, -3,-14,-22,-11,  3; D=-12;
/I:         I=-12; MI=-25; MD=-25; IM=-25; DM=-25;
/M: SY='G'; M= -2,  0,-20,  1, -4,-22, 23,-10,-24, -7,-19,-13,  3,-12, -5, -8,  2, -7,-18,-19,-18, -5; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-22, 17,  3,-23,  1, -4,-23, -2,-21,-16, 13,-10, -1, -4,  3, -4,-20,-27,-15,  0; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M:         M= -3, -6,-24, -7, -3,-19, -2,-12,-15, -5,-15, -8, -3, -3, -4, -7, -1, -5,-13,-22,-15, -4; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='N'; M=  2,  8,-19,  3, -2,-20, -3, -7,-19, -3,-21,-15, 12,-13, -4, -4,  9,  4,-15,-29,-15, -4;
/M: SY='T'; M= -1,  2,-17, -4, -6,-17, -1,-13,-19, -9,-19,-14,  7, -8, -8,-10, 13, 19,-13,-29,-16, -7;
/M: SY='A'; M=  3,-12,-22,-15,-12, -6, -3,-11,-13, -7,-12, -7, -7,-16,-11, -5, -2, -6, -8,-17, -5,-12;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-29,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,148, 31,-20;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S'; M= -2, -7,  0,-10, -8,-15,-13,  2,-15,-11,-15, -9, -2,-19, -6,-10,  4, -1, -9,-30, -9, -8; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S'; M=  8, -7,-18, -9, -6,-20, -2,-14,-16,-10,-21,-14, -3,  9, -7,-13, 13,  9,-11,-28,-19, -8; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='S'; M= -2,  0,-18,  0, -2,-15, -4, -8,-13, -5,-13, -9,  0, -5, -2, -7,  2, -2,-11,-21,-12, -3; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='S'; M=  5, -2,-18, -4, -3,-17,-11,-13,-10, -7,-13,-10,  0,-11, -5,-10,  8,  5, -5,-29,-15, -4;
/M: SY='N'; M= -3,  2,-24,  0, -1,-21, -2,  0,-22, -4,-21,-13,  6, -7, -1, -4,  2, -4,-20,-26,-12, -2;
/M: SY='D'; M= -1,  6,-23,  8,  4,-24, -5, -9,-21, -3,-22,-17,  5, -2, -3, -8,  7, -1,-17,-30,-18,  0;
/M:         M= -1, -3,-24, -3, -4,-17, -5, -6,-16, -7,-13,-10, -3, -8, -5,-10, -3, -7,-14,-22, -9, -6;
/M: SY='P'; M= -9,  1,-29,  3,  1,-19,-11, -8,-22, -1,-24,-16,  2, 16, -4, -5, -2, -4,-23,-26,-14, -3;
/M: SY='Q'; M= -8, -1,-27,  0, 14,-28,-17, 11,-19,  1,-18, -6, -1, -5, 22, -1, -1, -8,-21,-26,-10, 17;
/M: SY='W'; M=-15,-25,-35,-28,-19, 13,-20,-16,-15,-16,-14,-13,-23,-25,-14,-14,-20,-13,-20, 70, 22,-14;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-24,-34,-25,  4,-32,-24, 29,-27, 28, 16,-26,-25,-20,-24,-23, -9, 20,-14,  1,-24;
/M: SY='Q'; M= -3, -4,-21, -7,  5,-21,-16, -6,-12, -2,-12, -4, -4,-12, 16, -4,  5,  7,-12,-24, -9, 10;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-17,-33,-27,  8,-31,-27, 28,-24, 18, 12,-25,-26,-26,-22,-15, -4, 31,-22, -3,-27;
/M: SY='D'; M=-16, 40,-28, 54, 19,-36, -9, -1,-36,  3,-29,-27, 19,-10,  1, -7,  1, -8,-28,-37,-19, 10;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21, 21,-29,-19, 15,-28, 38, 16,-26,-29,-22,-19,-25, -8,  8,-15,  5,-21;
/M: SY='G'; M= -3, -3,-27, -2, -6,-26, 28,-13,-28,-10,-21,-14,  1,-16, -7,-10, -1,-13,-23,-24,-22, -7;
/M: SY='K'; M= -1,  1,-24,  1,  9,-24, -7, -7,-24, 10,-21,-13,  1,-11,  3,  5,  2, -3,-17,-25,-15,  6;
/M: SY='P'; M=  2,-11,-23,-11,  1,-18,-19,-17, -8, -7,-11, -9,-11, 10, -7,-11, -1,  2, -7,-27,-16, -5;
/M: SY='R'; M=-10, -9,-25,-10, -1,-10,-21,  2,-14,  8,-12, -3, -6,-17,  2, 14, -7, -4,-10,-16,  4, -1;
/M: SY='N'; M= -8,  4,-23,  1,  3,-18,-17, -6,-17,  4,-16,-10,  5, -9,  0,  3,  1,  4,-14,-26,-12,  1;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-34,-28, 11,-33,-26, 31,-26, 20, 14,-23,-26,-25,-23,-18, -7, 28,-20,  0,-28;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-19,  9,  0,-20,-10, -6,-20, -1,-21,-15, 12,-13, -2, -3, 11, 10,-14,-31,-13, -1;
/M: SY='G'; M=  1, -4,-25, -4, -3,-27, 17,-12,-28,  0,-23,-14,  0,-15, -2, -1,  2, -8,-20,-23,-20, -3;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28,  9,-33,-27, 31,-26, 20, 13,-26,-26,-25,-23,-18, -6, 30,-19, -1,-28;
/M: SY='V'; M= -3, -7,-18, -7, -6,-15,-17,-14, -5, -5, -7, -5, -7,-18, -8, -3, -3,  0,  2,-27,-11, -8;
/M: SY='I'; M= -8,-20,-20,-26,-21,  4,-29,-18, 17,-20, 15, 10,-18,-22,-16,-18,-11,  7, 13,-17,  6,-20;
/M: SY='Q'; M= -5, -7,-22, -9, -2,-15,-20, -7, -9, -1, -5,  0, -7,-16,  9,  0, -3,  1, -9,-21, -4,  3;
/M: SY='G'; M= -7,-15,-31,-14,-15,-17, 14,-12,-22,-15,-20,-13, -9, -2,-14,-15, -7,-13,-21, -4,-12,-15;
/M: SY='R'; M= -1, -8,-22, -8, -2,-17, -8,-10,-20,  3,-18,-12, -4, -8, -3, 12,  1, -5,-12,-24,-14, -4;
/M: SY='Q'; M= -2, -3,-24, -4,  1,-24, -7, -7,-19,  1,-19,-10, -2, -5,  7,  0, -1, -5,-18,-23,-13,  3;
/M: SY='B'; M=  2,  9,-21,  7,  1,-23,  1, -6,-23, -4,-21,-15,  9,-13, -2, -7,  7, -1,-18,-29,-17, -1;
/M: SY='G'; M=  2, -9,-20,-11,-11,-11,  3,-12,-18,-11,-16,-12, -3,-15,-11,-12,  3, -3,-13,-15, -9,-11;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='D'; M= -4,  2,-21,  3,  2,-18,  1, -9,-17, -5,-15,-11,  2, -7, -4, -8,  0, -5,-14,-21,-14, -1; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-15;
/M: SY='N'; M= -4,  4,-14,  2,  1,-12, -2,  1,-12, -3,-13, -8,  8, -6, -1, -3,  3, -1,-12,-18, -9,  0; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='N'; M= -2,  4,-11,  3,  2,-12, -4, -2,-10, -1,-12, -8,  6, -4, -1, -2,  4,  0, -8,-17, -9,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='G'; M= -3, -2,-17, -2, -1,-13,  5, -5,-15, -5,-11, -4, -2, -9,  0, -6, -2, -7,-13,-14, -9, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='W'; M=-11,-13,-22,-16,-12,  8,-16, -3,-10, -6, -9, -6, -9,-17, -8,  0,-11, -8,-10, 16, 14,-10; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='V'; M=  0,-18,-16,-21,-18, -6,-22,-21, 14,-15,  3,  4,-16,-14,-16,-16, -6,  1, 19,-21, -9,-18; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-18, -5, -1,-19, -9,-12,-18,  3,-17,-11,  0,-10,  0,  1,  8, 14,-11,-25,-12, -1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='S'; M= -3,  4,-21,  4,  5,-23, -5, -7,-23,  4,-21,-13,  6,-12,  3,  1,  7,  3,-17,-28,-15,  4; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-15;
/M: SY='Y'; M=-17,-21,-26,-23,-21, 32,-27,  8,  0,-16,  3,  1,-18,-28,-16,-13,-18, -9, -6, 15, 54,-21;
/M: SY='K'; M= -4, -1,-24, -2,  7,-21,-16, -9,-18, 14,-18, -9,  0,-12,  4, 10, -1, -2,-13,-23,-12,  5;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-20,-34,-27,  5,-32,-26, 32,-26, 22, 16,-25,-25,-23,-23,-18, -6, 29,-22, -3,-26;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-26, -4, 10,-15,-18,  1,-14,  0,-10, -4, -4,-14, 13,  1, -3, -6,-16,-18, -2, 11;
/M: SY='Y'; M= -7,-20,-20,-23,-21, 12,-19, -6,  4,-16,  0,  0,-17,-25,-18,-16,-10, -3,  6, -4, 24,-21;
/M: SY='S'; M=  5, -1,-14, -2, -2,-19, -1,-11,-19, -7,-24,-16,  7,-12, -1, -7, 27, 14,-11,-35,-18, -2;
/M: SY='B'; M= -8,  6,-22,  5,  3,-18,-15, -4,-13, -5,-10, -8,  5,-12,  1, -6,  1,  2,-14,-29,-11,  1;
/M: SY='D'; M=-14, 39,-27, 50, 15,-35, -8,  0,-34,  1,-28,-26, 22,-10,  0, -6,  2, -7,-28,-38,-20,  7;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -1, -1,-27, -4,-13,-26, 47,-15,-34,-14,-28,-19,  8,-19,-14,-15,  3,-13,-26,-24,-26,-14;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-24,  2, 16,-23,-19, -6,-18,  5,-16,-11, -1, -7,  8,  0,  2,  2,-14,-28,-14, 11;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-18,  5,  2,-17, -9, -2,-18,  1,-20,-13, 16,-10, -1,  0,  8,  9,-16,-29,-13,  0; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='W'; M=-19,-34,-40,-36,-27, 24,-22,-21,-14,-20,-12,-13,-32,-28,-22,-18,-32,-23,-21,104, 31,-21; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='T'; M= -6, -1,-20, -5, -2,-17,-17, -7,-11, -1,-14, -7,  0,-12, -1, -3,  4, 12, -7,-27, -9, -3;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-23,  1,  5,-17,-17, -9,-15, -2,-15,-11, -3, -4,  0, -5,  3,  5,-11,-27,-10,  1;
/M: SY='I'; M= -5,-25,-21,-27,-23, 12,-28,-15, 15,-20, 12,  6,-23,-23,-21,-19,-16, -7, 15, -8, 15,-23;
/M: SY='R'; M= -5, -9,-23, -9, -6,-13,-14, -8,-12,  0, -9, -5, -7,-15, -5,  2, -6, -4, -6,-22, -7, -7;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='B'; M= -1, 10,-17, 10,  6,-20,  0, -3,-18, -2,-17,-13,  9, -7,  2, -5,  4, -3,-16,-22,-14,  4; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='A'; M=  2,  2,-11,  1,  2,-11, -3, -4,-11,  1, -9, -6,  1, -6,  1, -2,  2, -1, -8,-13, -7,  2; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='A'; M=  1, -2,-12, -2, -1,-11, -3, -4, -9, -3, -9, -6, -1,  0, -3, -5,  1,  0, -7,-15, -9, -3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='K'; M= -5, -4,-15, -4,  2,-11,-10, -4, -8,  6, -8, -1, -3, -9,  5,  6, -3, -3, -7,-11, -5,  3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='V'; M= -1,-11,-14,-14, -9, -5,-16, -9,  7,-10,  2,  4,-10,-13, -7,-10, -4,  1,  8,-16, -4, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='F'; M= -8,-16,-15,-21,-17, 28,-15,-13,  1,-17,  3,  0,-11,-19,-19,-13, -9, -6,  3, -4,  9,-16; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-21,  3,  6,-14,-14, -6,-17,  2,-15,-11,  1, -3,  2,  0,  0,  1,-14,-20, -8,  3; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G'; M=  5, -7,-25, -8,-13,-25, 37,-18,-30,-13,-25,-17,  0,-14,-14,-15,  4,-10,-21,-23,-24,-14;
/M: SY='N'; M= -8, 20,-22, 11,  2,-21, -1, -2,-20, -3,-24,-17, 29,-11, -3, -5,  6,  1,-23,-34,-19, -1;
/M:         M= -5,-13,-20,-15, -9, -5,-19,-13, -8, -7, -8, -6,-10,-17, -8, -6, -4,  0, -5, -8, -3, -8;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-26, 24, 13,-25, -6, -2,-28,  0,-24,-20, 13,-11,  0, -6,  2, -6,-23,-31,-16,  6;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='N'; M= -2,  2,-20,  1, -1,-17,  0, -6,-18, -3,-17,-12,  6, -7, -4, -3,  3, -2,-15,-23,-13, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='N'; M= -5,  4,-15,  2,  0,-11, -6,  0,-12, -1,-13, -8,  7, -9, -2, -1,  3,  1,-11,-18, -5, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='S'; M=  7, -1,-13, -3, -2,-15, -2, -8,-13, -5,-12, -9, -1, -8, -1, -7,  8,  6, -8,-20,-12, -2; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='I'; M= -4,-13,-18,-13, -9, -7,-16,-13,  3,-12, -2, -1,-12, -4,-10,-13, -5, -1,  3,-14, -5,-11; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='V'; M= -2, -9,-15, -9, -8,-10,-16, -9, -2, -2, -6, -2, -9,-15, -7, -4, -4, -2,  6,-17, -6, -8; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='T'; M= -7, -7,-20, -9, -3, -8,-20, -4, -7, -3, -5, -4, -5,-14, -2,  0, -3,  3, -6,-19, -1, -3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='N'; M= -5, -2,-21, -6, -6,-14,-12, -1, -8, -6,-11, -5,  4,-17, -1, -4, -1, -3, -8,-23, -8, -5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='N'; M= -8,  3,-22,  1, -1,-15,-12, -7,-12, -5,-12, -8,  6,-17, -4, -3,  0,  1,-11,-24,-12, -3;
/M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-32,-23, 36,-29,-20, 10,-26, 22,  7,-22,-27,-27,-18,-20, -8,  6, -7, 12,-23;
/M: SY='D'; M= -7,  8,-25, 10,  6,-18,-14, -2,-21,  1,-19,-14,  5, -8, -2, -3, -1, -5,-17,-27,-12,  1;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-24,-11, -4, -7,-19,-11,-10, -9,-11, -8, -7,  7, -8, -9, -3, -1,-10,-24,-11, -7;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-31, -9, -1,-23,-16,-16,-15, -9,-21,-14,-14, 56, -8,-16, -6, -6,-21,-26,-22, -8; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='I'; M= -6,-23,-20,-28,-21, -4,-28,-23, 21,-18,  9,  8,-18,-21,-16,-15,-12, -2, 19,-23, -5,-21;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-24, -2,  3,-20,-16, -8,-10,  0,-14, -8,  2,-12,  1, -1, -1, -2, -9,-28,-13,  1;
/M: SY='A'; M= 35,-11,-11,-19,-12,-17,  0,-20, -9,-12, -9, -9, -9,-13,-12,-19,  8,  3,  0,-21,-17,-12;
/M: SY='R'; M=-14, -4,-28, -5,  4,-23,-17, -1,-27, 23,-22,-10,  3,-16, 13, 46, -4, -6,-20,-23,-12,  5;
/M: SY='Y'; M=-16,-17,-27,-18,-15, 22,-24, 13, -6,-11, -4, -2,-14,-26,-10, -9,-14, -9,-10, 10, 45,-15;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-18,-32,-28,  1,-33,-28, 33,-24, 17, 13,-26,-25,-25,-23,-15, -4, 36,-25, -6,-28;
/M: SY='R'; M=-15, -9,-29,-10,  0,-20,-20, -3,-26, 28,-18, -9, -2,-18,  8, 55, -9, -9,-17,-20,-10,  0;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-22,-34,-26, 12,-33,-24, 30,-27, 26, 17,-25,-26,-23,-23,-21, -8, 23,-18,  3,-26;
/M: SY='H'; M= -9, -5,-22, -5, -6,-12,-18,  1, -7, -7, -9, -4, -4,-19, -5, -5, -3, -2, -3,-22, -1, -7;
/M: SY='P'; M=  3,-17,-22,-18,-11,-14,-15,-20, -5,-15,-11, -8,-14, 19,-14,-20, -6, -5, -6,-25,-18,-14;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='T'; M= -3, -7,-14,-10, -6, -6,-12,-11,  0, -8,  0,  0, -5,-10, -6, -7, -2,  4,  1,-17, -6, -7; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S'; M=  2, -6,-20,-10, -5,-17, -6, -9,-13, -8,-13, -8, -3,-14, -1, -8,  5,  5, -9,-23,-12, -3;
/M: SY='S'; M= -2,  3,-22,  0,  0,-18, -4, -8,-21, -4,-21,-15,  5,-10, -3, -7,  7,  6,-17,-20,-13, -2;
/M: SY='W'; M= -7,-15,-30,-17,-13, -4,-13,-12,-17,-11,-16,-13,-14,-18, -9,-12,-13,-12,-19, 36,  9,-10;
/M: SY='H'; M= -8, -2,-25, -3, -1,-14,-15, 10,-16, -3,-16, -8,  1,-13,  0, -4, -3, -5,-15,-17,  0, -2;
/M: SY='G'; M=  2, -1,-23, -4, -4,-18,  4, -7,-20, -7,-18,-11,  3,-12, -4, -8,  2, -6,-17,-23,-13, -5;
/M: SY='A'; M=  3, -7,-20,-12,-10,-11,-11, -7, -7, -7, -9, -5, -3,-18, -8, -7, -1, -2, -4,-22, -6,-11;
/M: SY='I'; M= -2,-11,-22,-15,-10,-13,-16,-16,  2,-12, -7, -3, -5,-11, -7,-12, -1, -4, -1,-23,-11,-10;
/M: SY='A'; M=  4,-12, -8,-17,-11,-10,-14,-18, -4,-15, -3, -5, -9,-18,-12,-15, -2, -3, -1,-25,-12,-12;
/M: SY='L'; M=  1,-16,-19,-19,-14, -1,-20,-12,  5,-15, 11,  9,-16,-21,-12,-14,-11, -5,  4,-15,  1,-13;
/M: SY='R'; M= -9,  0,-28,  2, 20,-24,-16, -3,-27, 18,-20,-14,  1,-11, 10, 26, -4, -9,-21,-25,-15, 13;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-21,-29,-22, 10,-27,-20, 18,-23, 19, 14,-23,-25,-20,-20,-18, -7, 15,-12,  2,-21;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-28, 12, 38,-25,-18, -1,-25,  6,-18,-15,  1, -4, 16,  0, -1, -8,-25,-27,-15, 27;
/M: SY='L'; M= -5,-24,-19,-24,-17, -1,-25,-21, 15,-20, 18,  8,-22,-19,-18,-18,-16, -6, 15,-24, -6,-18;
/M: SY='Y'; M=-11,-21,-24,-24,-18, 15,-25, -4,  6,-17, 12,  7,-19,-26,-14,-14,-18, -8,  0,  1, 25,-18;
/M: SY='G'; M=  5, -6,-24, -8,-13,-24, 37,-17,-27,-16,-22,-16,  0,-18,-15,-18,  3,-11,-19,-24,-24,-14;
/M: SY='C'; M= -3, -7, 24,-11, -8,-18,-17,-15,-19,-11,-16,-13, -6,-21,-11,-13,  0, -2, -9,-34,-18,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_06, total number of sequence entries in that release: 540261.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 118 hits in 88 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 116 hits in 86 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 2 hits in 2 different sequences
  • Number of known missed hits: 1
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 98.31 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 99.15 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: P_Bucher, N_Hulo
  • Taxonomic range: Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 2
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: F5/8 type C
  • VERSION: 1
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
AEBP1_HUMAN (Q8IUX7), AEBP1_MOUSE (Q640N1), AEBP1_RAT   (A2RUV9), 
AFTD_MYCTU  (P96419), CNT3B_HUMAN (Q96NU0), CNTP1_HUMAN (P78357), 
CNTP1_MOUSE (O54991), CNTP1_RAT   (P97846), CNTP2_HUMAN (Q9UHC6), 
CNTP2_MOUSE (Q9CPW0), CNTP2_PONAB (Q5RD64), CNTP3_HUMAN (Q9BZ76), 
CNTP4_HUMAN (Q9C0A0), CNTP4_MOUSE (Q99P47), CNTP5_CANFA (Q0V8T0), 
CNTP5_CHICK (Q0V8S9), CNTP5_HUMAN (Q8WYK1), CPXM1_HUMAN (Q96SM3), 
CPXM1_MOUSE (Q9Z100), CPXM2_HUMAN (Q8N436), CPXM2_MOUSE (Q9D2L5), 
CTP5A_MOUSE (Q0V8T9), CTP5A_RAT   (Q0V8T6), CTP5B_MOUSE (Q0V8T8), 
CTP5B_RAT   (Q0V8T5), CTP5C_MOUSE (Q0V8T7), CTP5C_RAT   (Q0V8T4), 
CTP5D_RAT   (Q0V8T3), DCBD1_HUMAN (Q8N8Z6), DCBD2_HUMAN (Q96PD2), 
DCBD2_MOUSE (Q91ZV3), DCBD2_RAT   (Q91ZV2), DDR1_HUMAN  (Q08345), 
DDR1_MOUSE  (Q03146), DDR1_PANTR  (Q7YR43), DDR1_RAT    (Q63474), 
DDR2_HUMAN  (Q16832), DDR2_MOUSE  (Q62371), DIS1A_DICDI (P02886), 
DIS1B_DICDI (P02887), DIS1D_DICDI (P02888), DIS2_DICDI  (P42530), 
EDIL3_HUMAN (O43854), EDIL3_MOUSE (O35474), EDIL3_PONAB (Q5R7K9), 
FA5V_OXYMI  (Q58L90), FA5V_OXYSU  (Q58L91), FA5V_PSETE  (Q7SZN0), 
FA5_BOVIN   (Q28107), FA5_HUMAN   (P12259), FA5_MOUSE   (O88783), 
FA5_PIG     (Q9GLP1), FA5_PSETE   (Q593B6), FA8_CANFA   (O18806), 
FA8_HUMAN   (P00451), FA8_MOUSE   (Q06194), FA8_PIG     (P12263), 
GAOA_GIBZA  (P0CS93), GAOA_GIBZE  (I1S2N3), HMCT_BOMMO  (P98092), 
MFGM_BOVIN  (Q95114), MFGM_HUMAN  (Q08431), MFGM_MOUSE  (P21956), 
MFGM_PIG    (P79385), MFGM_RAT    (P70490), NAGH_CLOPE  (P26831), 
NANH_CLOSE  (P29767), NANH_MICVI  (Q02834), NRP1A_DANRE (Q8QFX6), 
NRP1_CHICK  (P79795), NRP1_HUMAN  (O14786), NRP1_MOUSE  (P97333), 
NRP1_RAT    (Q9QWJ9), NRP1_XENLA  (P28824), NRP2_HUMAN  (O60462), 
NRP2_MOUSE  (O35375), NRP2_RAT    (O35276), NRX4_DROME  (Q94887), 
SSPO_BOVIN  (P98167), SSPO_CHICK  (Q2PC93), SSPO_HUMAN  (A2VEC9), 
SSPO_MOUSE  (Q8CG65), SSPO_RAT    (Q700K0), XLRS1_HUMAN (O15537), 
XLRS1_MOUSE (Q9Z1L4), XLRS1_TAKRU (Q9W6R5)
False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile):
AFTD_MYCS2  (A0QPD4)
False positive hits (sequences which do not belong to the set under consideration):
OGA_CLOP1   (Q0TR53), OGA_CLOPE   (Q8XL08)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]		 1CFG; 1CZS; 1CZT; 1CZV; 1D7P; 1EUT; 1EUU; 1FAC; 1FV4; 1GOF; 1GOG; 1GOH; 1IQD; 1K3I; 1KEX; 1SDD; 1T2X; 1W8N; 1W8O; 1WCQ; 1Y61; 2BER; 2BZD; 2EIB; 2EIC; 2EID; 2EIE; 2JKX; 2L9L; 2ORX; 2ORZ; 2PQS; 2QQI; 2QQJ; 2QQK; 2QQL; 2QQM; 2QQN; 2QQO; 2R7E; 2VM9; 2VMC; 2VMD; 2VME; 2VZ1; 2VZ3; 2W1Q; 2W1S; 2W1U; 2W94; 2W95; 2WDB; 2WN2; 2WN3; 2WQ8; 2WUH; 2Z4F; 3BN6; 3CDZ; 3HNB; 3HNY; 3HOB; 3I97; 4AG4; 4DEQ; 4GZ9;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)

If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or