PROSITE entry PS50023
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
Entry name [info] | LIM_DOMAIN_2 |
Accession [info] | PS50023 |
Entry type [info] | MATRIX |
Date [info] |
01-NOV-1997 CREATED;
01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
PROSITE Doc. [info] | PDOC00382 |
Associated ProRule [info] | PRU00125 |
Name and characterization of the entry
Description [info] | LIM domain profile. |
Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=61; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.7028; R2=0.0099; TEXT='NScore'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=586; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=283; N_SCORE=5.5; MODE=1; TEXT='R?'; /DEFAULT: B0=-50; E0=-50; D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='P'; M= -6, -4,-26, -1, 3,-22,-13,-10,-17, -6,-19,-14, -4, 13, -3,-11, -1, -4,-17,-26,-16, -2; /M: SY='R'; M= -9, -8,-24,-10, -4,-15,-17, -9,-12, 10,-11, -4, -4,-16, -2, 11, -7, -6, -8,-23, -9, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-40,-30,-29,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='A'; M= 11, -6,-18, -9, -5,-18, -3, -6,-16, -8,-16,-11, -3, -8, -5,-11, 4, -3,-11,-23,-12, -6; /M: SY='G'; M= 0, -8,-20,-10, -9,-20, 8,-11,-22, -1,-19,-11, -2,-18, -7, 3, 0, -7,-13,-23,-16, -9; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='G'; M= -4, 6,-25, 4, 0,-26, 12, -2,-29, -1,-25,-16, 10,-15, 0, -2, 4, -7,-24,-28,-18, 0; /M: SY='K'; M= -9, -1,-28, 0, 8,-24,-12, -3,-23, 15,-19, -9, 0,-13, 10, 12, -5, -8,-20,-22,-11, 8; /M: SY='P'; M= -3,-13,-27,-13, -6,-16, -8,-12,-13, -8,-13, -8, -9, 6, -6,-10, -4, -5,-13,-22,-13, -8; /M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-36,-29, 4,-36,-28, 39,-27, 19, 17,-23,-24,-23,-26,-18, -7, 31,-21, -1,-29; /M: SY='Y'; M= -5, -8,-21, -9, -6, -5,-17, -4, -9, -8, -8, -6, -6,-15, -5, -7, -1, 2, -8,-16, 6, -7; /M: SY='D'; M= -3, 2,-28, 7, 2,-26, 5,-10,-27, -6,-24,-19, 0, 6, -6,-11, 1, -8,-23,-28,-21, -3; /M: SY='R'; M= 0, -2,-22, -4, 0,-20, -8, -9,-18, 2,-16,-11, 1,-13, 0, 5, 3, 1,-13,-26,-14, -1; /I: MD=-21; /M: SY='E'; M= -7, 3,-17, 7, 14,-10,-13, -1,-15, -1,-11,-10, -1, -7, 4, -4, -2, -6,-15,-15, -3, 9; D=-3; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-21; /M: SY='V'; M= -8,-20,-15,-22,-15, -1,-25,-15, 5,-10, 2, 3,-18,-22,-13, -8,-13, -7, 8,-16, 2,-15; /M: SY='V'; M= -8,-23,-17,-26,-19, 2,-27,-16, 14,-14, 14, 14,-22,-24,-15, -8,-17, -6, 15,-20, 0,-18; /M: SY='R'; M= -8, -5,-22, -8, -2,-17,-19, -8,-11, 5,-10, -5, -1,-16, 2, 11, -2, 1, -7,-26,-11, -1; /M: SY='A'; M= 26,-11, -4,-18,-12,-15, -6,-18, -9,-11, -9, -7,-10,-15,-12,-17, 6, 0, 0,-24,-16,-11; /M: SY='L'; M= -8, -9,-23,-10, -7,-10,-15,-11, -6, -7, 3, 2, -8,-17, -6, -3,-11, -6, -7,-23, -8, -8; /M: SY='D'; M= -7, 18,-25, 21, 2,-30, 19, -7,-33, -7,-28,-22, 16,-15, -5,-11, 4, -9,-27,-31,-23, -2; /M: SY='K'; M=-11, -3,-25, -4, 3,-16,-18, -3,-21, 16,-15, -7, -1,-16, 4, 16, -7, -6,-17,-20, -5, 3; /M: SY='x'; M= -1, -9,-18,-11, -7, -9,-17, -8, -7, -5, -9, -5, -6,-16, -7, -4, 0, -1, -1,-24, -6, -8; /M: SY='W'; M=-20,-31,-36,-34,-27, 32,-25,-13, -9,-20, -6, -9,-29,-29,-22,-17,-29,-19,-16, 77, 44,-22; /M: SY='H'; M=-19, 0,-22, 0, -1,-20,-20, 92,-30,-11,-20, -2, 9,-21, 8, -2,-10,-19,-29,-31, 17, -1; /M: SY='P'; M= -6,-14,-26,-12, -2,-17,-21,-16, -5, -3, -8, -4,-13, 7, -6, -7, -7, -6, -5,-26,-15, -6; /M: SY='E'; M= -2, 11,-23, 12, 18,-26,-10, -1,-25, 3,-22,-17, 9, -8, 7, -2, 5, -3,-22,-30,-16, 12; /M: SY='C'; M=-11,-17, 99,-26,-26,-20,-29,-12,-30,-27,-20,-17,-16,-37,-24,-26,-10,-11,-13,-47,-23,-26; /M: SY='F'; M=-16,-29,-20,-36,-27, 60,-29,-16, 4,-28, 14, 3,-21,-29,-34,-19,-20, -9, 3, 3, 25,-27; /M: SY='R'; M= -5, -7,-13,-11, -6,-17,-20,-11,-14, 8,-14, -6, -4,-17, -2, 10, -2, 2, -6,-26,-10, -5; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='A'; M= 6, -8, -4,-13, -8,-11,-14,-12,-11,-10,-11, -6, -6,-17, -7,-12, 6, 5, -5,-26,-10, -8; /M: SY='E'; M= -6, -3,-20, -3, 1,-15,-19, -7, -8, -3, -8, -5, -4,-16, -3, -5, -4, -4, -5,-26, -9, -2; /M: SY='C'; M= -9,-19,116,-29,-29,-20,-28,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-29, -9,-10,-10,-49,-30,-29; /M: SY='G'; M= -4, 3,-25, 2, 1,-24, 11, -1,-27, -1,-24,-14, 9,-15, 1, -2, 3, -8,-24,-27,-17, 0; /M: SY='K'; M= -6, -4,-14, -7, 1,-21,-19, -7,-18, 11,-17, -7, -1,-15, 4, 10, -1, 0,-12,-27,-12, 2; /M: SY='P'; M= -7, -5,-24, -6, 0,-20,-16, -3,-17, -2,-19,-10, -1, 8, 5, -2, -1, -3,-19,-26,-13, 1; /M: SY='L'; M=-11,-29,-19,-32,-22, 16,-31,-21, 19,-29, 39, 17,-27,-29,-22,-19,-27,-10, 10,-17, 3,-22; /M: SY='S'; M= 1, 4,-19, 3, 0,-23, 0,-10,-21, -5,-19,-15, 4,-13, -4, -7, 7, 2,-15,-29,-18, -2; /M: SY='E'; M= -5, 1,-23, 2, 5,-23, -4, -9,-20, -5,-18,-13, 1, -2, -2, -8, 3, -2,-17,-30,-18, 1; /I: MD=-23; /M: SY='G'; M= -4, -5,-21, -5, -4,-19, 9,-10,-19, -3,-15, -9, -3,-14, -5, -4, 0, -4,-13,-21,-15, -5; D=-4; /I: I=-5; MI=0; IM=0; DM=-23; /M: M= -7, -5,-23, -8, -4,-10, -7, -9,-17, -2,-14, -9, -1,-15, -5, -2, -1, 0,-14,-19, -7, -5; /M: SY='F'; M=-13,-20, 9,-27,-23, 23,-27, -7, -6,-22, 0, -3,-17,-30,-23,-18,-14, -7, -3, -9, 18,-23; /M: SY='F'; M= -8,-16,-21,-19,-17, 16,-22, -7, -1,-14, 0, 0,-13,-23,-17,-12,-11, -6, 0, -8, 14,-17; /M: SY='E'; M= -6, -8,-24, -7, 3,-10,-17,-12, -8, -8, -5, -3, -9,-11, -5,-11, -6, -6, -8,-17, -8, -1; /M: SY='R'; M=-12, -5,-26, -5, 2,-16,-20, 2,-16, 8,-13, -6, -3,-13, 3, 12, -8, -7,-13,-22, -4, 1; /M: SY='D'; M=-10, 22,-27, 28, 15,-30, -4, 1,-30, 1,-24,-19, 13,-11, 2, -5, 0, -8,-25,-32,-17, 8; /M: SY='G'; M= -4, 5,-27, 4, -4,-28, 28, -9,-32, -6,-27,-17, 9,-16, -7, -6, 3,-11,-26,-27,-23, -6; /M: SY='R'; M= -8, -2,-27, -2, 8,-24,-16, -3,-21, 14,-16, -7, -2,-13, 11, 15, -5, -6,-17,-24,-11, 9; /M: SY='I'; M= -6,-25,-25,-25,-17, -3,-27,-22, 13,-19, 11, 5,-22, 1,-18,-20,-16, -7, 7,-22, -8,-19; /M: SY='Y'; M=-16,-23,-23,-25,-21, 25,-29, 4, 4,-18, 9, 4,-21,-28,-17,-14,-20, -9, -1, 10, 44,-21; /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-28,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-29,-30,-10,-10,-10,-50,-29,-30; /I: I=-20; MI=0; IM=0; /M: SY='K'; M=-10, -4,-27, -3, 9,-22,-16, -4,-21, 17,-19, -7, -2,-10, 8, 16, -6, -8,-17,-23,-11, 7; /M: SY='E'; M= -5, 2,-25, 2, 4,-22,-12, 1,-21, 4,-20,-12, 3, -5, 3, 3, 1, -3,-18,-26,-11, 2; /M: SY='C'; M=-16, 11, 25, 15, -4,-28,-19, 13,-34,-14,-24,-19, 3,-24, -9,-15, -6,-13,-23,-41,-14, -8; /M: SY='Y'; M=-16,-17,-26,-20,-17, 26,-26, 17, -5,-13, -3, -1,-13,-26,-12,-10,-15, -9,-10, 10, 47,-17; /M: SY='H'; M= -9, -6,-25, -6, -2, -8,-10, 1,-15,-10,-10, -8, -4,-13, -6, -9, -7, -9,-15,-17, -2, -5; /M: SY='K'; M= -5, -1,-26, -2, 7,-24,-15, -7,-20, 16,-19, -8, 0,-11, 8, 14, -3, -6,-16,-24,-13, 6; /M: SY='R'; M= -7, -8,-20,-10, -5,-12,-19, -7, -9, -2, -1, -1, -7,-18, -3, 3, -9, -4, -8,-22, -7, -5; /M: SY='F'; M=-12,-19,-22,-24,-17, 24,-23, -7, -3,-16, 3, 1,-13,-22,-18,-10,-12, -5, -2, -8, 13,-17; /M: SY='G'; M= 5, -4,-21, -6, -5,-23, 11,-13,-22, -5,-20,-13, -1,-14, -6, -8, 4, -5,-15,-25,-19, -6; /M: SY='P'; M= -5, -9,-23, -8, -1,-21,-16,-14,-13, -4,-16,-11, -8, 12, -4, -7, -1, 0,-12,-28,-17, -5; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
Total number of hits | 918 in 402 different sequences |
Number of true positive hits | 918 in 402 different sequences |
Number of 'unknown' hits | 0 |
Number of false positive hits | 0 |
Number of false negative sequences | 3 |
Number of 'partial' sequences | 0 |
Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 99.67 % |
Comments [info]
Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
Maximum number of repetitions [info] | 6 |
Matrix type [info] | protein_domain |
Scaling database [info] | reversed |
Author [info] | K_Hofmann, CJA_Sigrist |
Feature key [info] | DOMAIN |
Feature description [info] | LIM zinc-binding |
Version [info] | 4 |
Cross-references [info]
UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
402 sequences
ABLM1_HUMAN (O14639), ABLM1_MOUSE (Q8K4G5), ABLM2_HUMAN (Q6H8Q1), ABLM2_MOUSE (Q8BL65), ABLM2_RAT (Q6KC51), ABLM3_HUMAN (O94929), ABLM3_MOUSE (Q69ZX8), ADCE_DICDI (Q55GN8), AJUBA_BOVIN (E1BKA3), AJUBA_DROME (Q9VY77), AJUBA_HUMAN (Q96IF1), AJUBA_MOUSE (Q91XC0), AJUBA_RAT (Q5U2Z2), APTE_DROME (P29673), AWH_DROME (Q8IRC7), CRIP1_BOVIN (Q56K04), CRIP1_HUMAN (P50238), CRIP1_MOUSE (P63254), CRIP1_RAT (P63255), CRIP2_BOVIN (Q0VFX8), CRIP2_HUMAN (P52943), CRIP2_MOUSE (Q9DCT8), CRIP2_PONAB (Q5R7Y1), CRIP2_RAT (P36201), CRIP3_HUMAN (Q6Q6R5), CRIP3_MOUSE (Q6Q6R3), CSRP1_BOVIN (Q3MHY1), CSRP1_CHICK (P67966), CSRP1_COTJA (P67967), CSRP1_HUMAN (P21291), CSRP1_MOUSE (P97315), CSRP1_PONAB (Q5RCT4), CSRP1_RAT (P47875), CSRP2_BOVIN (Q32LE9), CSRP2_CHICK (P50460), CSRP2_COTJA (Q05158), CSRP2_HUMAN (Q16527), CSRP2_MOUSE (P97314), CSRP2_RAT (Q62908), CSRP3_BOVIN (Q4U0T9), CSRP3_HUMAN (P50461), CSRP3_MOUSE (P50462), CSRP3_RAT (P50463), DA1_ARATH (P0C7Q8), DAR1_ARATH (Q8W4F0), DAR2_ARATH (Q0WSN2), DAR4_ARATH (Q9FKN7), DAR5_ARATH (Q84WJ0), DAR6_ARATH (Q9FJX8), DAR7_ARATH (Q9FJX9), ESN_DROME (Q9U1I1), ESN_DROPS (Q292U5), FBLI1_BOVIN (Q1JQB5), FBLI1_HUMAN (Q8WUP2), FBLI1_MOUSE (Q71FD7), FBLI1_PONAB (Q5REN1), FHL1_HUMAN (Q13642), FHL1_MOUSE (P97447), FHL1_RAT(Q9WUH4), FHL2_BOVIN (Q2KI95), FHL2_HUMAN (Q14192), FHL2_MOUSE (O70433), FHL2_RAT(O35115), FHL3_BOVIN (Q3ZBI6), FHL3_HUMAN (Q13643), FHL3_MOUSE (Q9R059), FHL5_BOVIN (Q2YDK0), FHL5_HUMAN (Q5TD97), FHL5_MACFA (Q4R7A4), FHL5_MOUSE (Q9WTX7), FHL5_RAT(Q6AXT1), HDR3_ORYSJ (Q10NJ6), HIL_DROME (Q0E908), HM14_CAEEL (P20271), ISL1_CHICK (P50211), ISL1_DANRE (P53405), ISL1_HUMAN (P61371), ISL1_MESAU (P61373), ISL1_MOUSE (P61372), ISL1_RAT(P61374), ISL2A_DANRE (P53406), ISL2A_ONCTS (P53408), ISL2B_DANRE (P53407), ISL2B_ONCTS (P50212), ISL2_CHICK (P53410), ISL2_HUMAN (Q96A47), ISL2_MOUSE (Q9CXV0), ISL2_RAT(P50480), ISL3_ONCTS (P53409), KY_CAEEL(G5EF51), LASP1_BOVIN (Q3B7M5), LASP1_CAEEL (P34416), LASP1_DROME (Q8I7C3), LASP1_HUMAN (Q14847), LASP1_MOUSE (Q61792), LASP1_PIG (P80171), LASP1_PONAB (Q5R5W0), LASP1_RABIT (O77506), LASP1_RAT (Q99MZ8), LDB3_HUMAN (O75112), LDB3_MOUSE (Q9JKS4), LHX1_CHICK (P53411), LHX1_DANRE (Q90476), LHX1_HUMAN (P48742), LHX1_MESAU (P63008), LHX1_MOUSE (P63006), LHX1_PANTR (Q5IS44), LHX1_RAT(P63007), LHX1_SAIBB (Q5IS89), LHX1_XENLA (P29674), LHX2_HUMAN (P50458), LHX2_MOUSE (Q9Z0S2), LHX2_RAT(P36198), LHX3_CHICK (P53412), LHX3_DANRE (Q90421), LHX3_HALRO (Q25132), LHX3_HUMAN (Q9UBR4), LHX3_MOUSE (P50481), LHX3_PIG(O97581), LHX3_XENLA (P36200), LHX4_HUMAN (Q969G2), LHX4_MOUSE (P53776), LHX5_DANRE (P52889), LHX5_HUMAN (Q9H2C1), LHX5_MOUSE (P61375), LHX5_RAT(P61376), LHX5_XENLA (P37137), LHX6_HUMAN (Q9UPM6), LHX6_MOUSE (Q9R1R0), LHX8_HUMAN (Q68G74), LHX8_MOUSE (O35652), LHX9_BOVIN (A0JNI8), LHX9_CHICK (Q90881), LHX9_DANRE (Q1LWV4), LHX9_GLARU (A2PZF9), LHX9_HUMAN (Q9NQ69), LHX9_MOUSE (Q9WUH2), LHX9_PSAFA (A2I8Z7), LHX9_RAT(Q80W90), LHX9_XENLA (Q68EY3), LIM4_CAEEL (G5EEA1), LIM6_CAEEL (Q21192), LIM7_CAEEL (G5EC36), LIMA1_HUMAN (Q9UHB6), LIMA1_MOUSE (Q9ERG0), LIMA1_PIG (B0KYV5), LIMA1_RAT (F1LR10), LIMA_DICDI (Q54QR1), LIMB_DICDI (Q54NW4), LIMC1_HUMAN (Q9UPQ0), LIMC1_MOUSE (Q3UH68), LIMC1_XENLA (Q3KQW7), LIMCH_DICDI (Q55GV9), LIMC_DICDI (Q9BIW5), LIMD1_BOVIN (G5E5X0), LIMD1_HUMAN (Q9UGP4), LIMD1_MOUSE (Q9QXD8), LIMD1_RAT (B5DEH0), LIMD1_XENLA (Q06BR1), LIMD1_XENTR (B7ZUL2), LIMD2_BOVIN (Q1LZA7), LIMD2_HUMAN (Q9BT23), LIMD2_MOUSE (Q8BGB5), LIMD2_RAT (Q4KM31), LIMD_DICDI (Q9BIW4), LIME_DICDI (O60952), LIMF_DICDI (Q86I44), LIMG_DICDI (Q55DS4), LIMK1_CHICK (Q8QFP8), LIMK1_DROME (Q8IR79), LIMK1_HUMAN (P53667), LIMK1_MOUSE (P53668), LIMK1_RAT (P53669), LIMK1_XENLA (O42565), LIMK2_BOVIN (Q32L23), LIMK2_CHICK (P53666), LIMK2_HUMAN (P53671), LIMK2_MOUSE (O54785), LIMK2_RAT (P53670), LIMKA_DICDI (Q54L00), LIMKB_DICDI (P0CD62), LIMS1_HUMAN (P48059), LIMS1_MOUSE (Q99JW4), LIMS2_BOVIN (Q2KJ33), LIMS2_HUMAN (Q7Z4I7), LIMS2_MOUSE (Q91XD2), LIMS3_HUMAN (P0CW19), LIMS4_HUMAN (P0CW20), LIN11_CAEEL (P20154), LMCD1_BOVIN (Q17QE2), LMCD1_HUMAN (Q9NZU5), LMCD1_MOUSE (Q8VEE1), LMCD1_PIG (Q5PXT2), LMO3_BOVIN (Q2KIA3), LMO3_DANRE (Q503U0), LMO3_HUMAN (Q8TAP4), LMO3_MOUSE (Q8BZL8), LMO3_PONAB (Q5RBW7), LMO3_RAT(Q99MB5), LMO3_XENLA (Q9YH16), LMO41_XENTR (Q5FVB2), LMO42_XENTR (Q6DJ06), LMO4A_XENLA (Q8AW92), LMO4B_XENLA (Q801P0), LMO4_BOVIN (Q3SWZ8), LMO4_HUMAN (P61968), LMO4_MOUSE (P61969), LMO7_HUMAN (Q8WWI1), LMX1A_HUMAN (Q8TE12), LMX1A_MESAU (Q04650), LMX1A_MOUSE (Q9JKU8), LMX1B_CHICK (P53413), LMX1B_HUMAN (O60663), LMX1B_MESAU (Q60564), LMX1B_MOUSE (O88609), LMX1B_XENLA (Q8UVR3), LNEBL_MOUSE (Q9DC07), LPP_CHICK (Q5F464), LPP_HUMAN (Q93052), LPP_MOUSE (Q8BFW7), LPP_RAT (Q5XI07), LPXN_HUMAN (O60711), LPXN_MOUSE (Q99N69), LPXN_RABIT (Q9N261), LRG1_YEAST (P35688), MCA2B_DANRE (F1RA39), MCA3A_DANRE (F1QH17), MCA3B_DANRE (F1QWK4), MEC3_CAEBR (P34764), MEC3_CAEEL (P09088), MEC3_CAERE (P34765), MICA1_BOVIN (F1MH07), MICA1_DANRE (E7F9T0), MICA1_HUMAN (Q8TDZ2), MICA1_MOUSE (Q8VDP3), MICA1_RAT (D3ZBP4), MICA2_BOVIN (F1MF74), MICA2_HUMAN (O94851), MICA2_MOUSE (Q8BML1), MICA2_RAT (D4A1F2), MICA2_XENTR (F6QZ15), MICA3_BOVIN (G3MWR8), MICA3_HUMAN (Q7RTP6), MICA3_MOUSE (Q8CJ19), MICAL_DROME (Q86BA1), MILK1_BOVIN (E1BBG2), MILK1_HUMAN (Q8N3F8), MILK1_MOUSE (Q8BGT6), MILK1_RAT (D3ZQL6), MILK2_HUMAN (Q8IY33), MILK2_MOUSE (Q3TN34), MILK2_RAT (D3ZEN0), MLP1_DROME (P53777), MLP2_DROME (Q24400), NRAP_HUMAN (Q86VF7), NRAP_MOUSE (Q80XB4), PAXB_DICDI (Q8MML5), PAXI_CHICK (P49024), PAXI_HUMAN (P49023), PAXI_MOUSE (Q8VI36), PAXI_PONAB (Q5R7I1), PAXI_RAT(Q66H76), PDLI1_BOVIN (Q5E9E1), PDLI1_HUMAN (O00151), PDLI1_MOUSE (O70400), PDLI1_RAT (P52944), PDLI2_BOVIN (Q3T0C8), PDLI2_HUMAN (Q96JY6), PDLI2_MACFA (Q9GKU1), PDLI2_MOUSE (Q8R1G6), PDLI2_RAT (Q6AYD6), PDLI3_BOVIN (Q3SYZ8), PDLI3_CHICK (Q9PU47), PDLI3_HUMAN (Q53GG5), PDLI3_MOUSE (O70209), PDLI3_PIG (Q6QGC0), PDLI3_RAT (Q66HS7), PDLI3_XENLA (Q6GLJ6), PDLI4_BOVIN (Q3T005), PDLI4_CHICK (Q9PW72), PDLI4_HUMAN (P50479), PDLI4_MOUSE (P70271), PDLI4_RAT (P36202), PDLI5_HUMAN (Q96HC4), PDLI5_MOUSE (Q8CI51), PDLI5_RAT (Q62920), PDLI7_BOVIN (Q3SX40), PDLI7_CHICK (Q679P3), PDLI7_DANRE (Q6P7E4), PDLI7_HUMAN (Q9NR12), PDLI7_MOUSE (Q3TJD7), PDLI7_RAT (Q9Z1Z9), PDLI7_XENLA (Q6INU3), PIN2_CAEEL (Q19157), PLI2A_ARATH (O80839), PLI2B_ARATH (Q1ECF5), PLI2B_ORYSJ (Q7F9R9), PLI2C_ARATH (Q500W4), PRC3A_XENLA (A8WH69), PRC3B_XENLA (A0A1L8F1M4), PRI1A_XENLA (Q90Z06), PRI1B_XENLA (Q90WV2), PRIC1_AEDAE (Q174I2), PRIC1_ANOGA (Q7QJT4), PRIC1_DROME (A1Z6W3), PRIC1_DROPS (Q292U2), PRIC1_HUMAN (Q96MT3), PRIC1_MOUSE (Q3U5C7), PRIC1_RAT (Q71QF9), PRIC1_XENTR (Q28FG2), PRIC2_HUMAN (Q7Z3G6), PRIC2_MOUSE (Q80Y24), PRIC3_HUMAN (O43900), PRIC3_MOUSE (Q80VL3), PRIC4_HUMAN (Q2TBC4), PXL1_CAEEL (Q09476), PXL1_YEAST (P36166), RBTN1_BOVIN (Q0P5B3), RBTN1_DANRE (Q8JFQ2), RBTN1_HUMAN (P25800), RBTN1_MOUSE (Q924W9), RBTN1_XENLA (Q3B8H4), RBTN2_BOVIN (Q1LZ94), RBTN2_DANRE (Q9PTJ3), RBTN2_HUMAN (P25791), RBTN2_MOUSE (P25801), RBTN2_XENLA (Q90XH3), RBTN2_XENTR (Q5M8V8), RGA1_SCHPO (O43052), RGA1_YEAST (P39083), RGA2_YEAST (Q06407), RGA3_SCHPO (O14014), RGA4_SCHPO (O74360), SCEL_HUMAN (O95171), SCEL_MOUSE (Q9EQG3), SF3_HELAN (P29675), TES_AOTNA (Q07DW1), TES_ATEAB (Q00PK1), TES_ATEGE (Q09YL5), TES_BOVIN (Q2YDE9), TES_CALJA (Q2QLG8), TES_CANLF (A0M8U6), TES_CHICK (Q90YH9), TES_CHLAE (Q2IBA3), TES_COLGU (Q07DZ4), TES_DASNO (Q07E51), TES_EULMM (Q2IBH0), TES_FELCA (A0M8S5), TES_HORSE (Q2QLB2), TES_HUMAN (Q9UGI8), TES_LOXAF (Q108U9), TES_MICMU (Q2QL92), TES_MONDO (Q2QLA1), TES_MOUSE (P47226), TES_MUNMU (Q09YK3), TES_MUNRE (Q07DX3), TES_MUSPF (Q07E27), TES_NEONE (Q07E40), TES_NOMLE (Q07DY3), TES_OTOGA (Q2QLH9), TES_PANTR (Q2QLF4), TES_PAPAN (A0M8R4), TES_PIG (Q2QLE3), TES_PLEMO (Q2QLC3), TES_PONAB (Q5RC52), TES_RABIT (Q09YN8), TES_RAT (Q2LAP6), TES_RHIFE (Q2IBC3), TES_SAIBB (Q09YI0), TES_SHEEP (Q09YJ2), TES_XENLA (Q7ZXE9), TES_XENTR (Q6DIR5), TGFI1_BOVIN (Q3MHZ4), TGFI1_HUMAN (O43294), TGFI1_MOUSE (Q62219), TGFI1_RAT (Q99PD6), TGFI1_XENLA (Q2TCH4), TRIP6_BOVIN (Q3SX26), TRIP6_HUMAN (Q15654), TRIP6_MOUSE (Q9Z1Y4), TTX3_CAEEL (G5EE86), UNC95_CAEEL (Q9NEZ5), UNC97_CAEEL (P50464), WLI2A_ARATH (O04193), WLI2B_ARATH (Q9M047), WLIM1_ARATH (Q94JX5), WTIP_DANRE (A8DZE6), WTIP_HUMAN (A6NIX2), WTIP_MOUSE (Q7TQJ8), WTIP_XENLA (A9LS46), XIRP2_MOUSE (Q4U4S6), Y6787_DICDI (Q55BI0), YOCC_SCHPO (O74398), ZASP_DROME (A1ZA47), ZN185_HUMAN (O15231), ZN185_MOUSE (Q62394), ZYX_CAEEL (Q9U3F4), ZYX_CHICK (Q04584), ZYX_HUMAN (Q15942), ZYX_MOUSE (Q62523), ZYX_XENLA (A5H447), ZYX_XENTR (Q0VA45)» more
|
UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
3 sequences
HEL2_SCHPO (Q76PD2), HEL2_YEAST (Q05580), Y2098_DICDI (Q55A66) |
PDB [Detailed view] |
75 PDB
1A7I; 1B8T; 1CTL; 1CXX; 1G47; 1IBI; 1IML; 1J2O; 1M3V; 1NYP; 1QLI; 1RUT; 1U5S; 1V6G; 1WIG; 1WYH; 1X3H; 1X4K; 1X4L; 1X61; 1X62; 1X63; 1X64; 1X68; 1X6A; 1ZFO; 2CO8; 2COR; 2CU8; 2CUP; 2CUQ; 2CUR; 2D8X; 2D8Y; 2D8Z; 2DAR; 2DFY; 2DJ7; 2DLO; 2EGQ; 2EHE; 2IYB; 2JTN; 2KBX; 2L4Z; 2L6Y; 2L6Z; 2LXD; 2LZU; 2MBV; 2MIU; 2O10; 2O13; 2RGT; 2XJY; 2XJZ; 2XQN; 2YPA; 3F6Q; 3IXE; 3MMK; 3PY7; 4HI8; 4HI9; 4JCJ; 4KFZ; 6CME; 6MIF; 6U4M; 6U4N; 7D2S; 7D2T; 7D2U; 7LT9; 7QB0 » more |