PROSITE entry PS50025
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | LAM_G_DOMAIN |
| Accession [info] | PS50025 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50025 |
| Associated ProRule [info] | PRU00122 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Laminin G domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=174; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=169; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7543000; R2=0.0273845; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9490.0000000; R2=9.1428576; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=415; H_SCORE=13284; N_SCORE=12.1; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=210; H_SCORE=11410; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='S'; M= -1, -4,-22, -3, -3,-17, -6,-10,-16, -6,-17,-12, -3, -7, -6, -7, 3, 1,-11,-25,-11, -6; /M: M= -6,-13,-22,-15,-13, -4,-16, -9, -2,-12, -4, -1, -9,-14,-12,-11, -7, -3, 0,-20, -3,-14; /M: SY='S'; M= -4, -5,-22, -7, -3,-11,-12, -7,-13, -7,-14, -8, -1, -7, -2, -6, 3, 1,-12,-24, -8, -4; /M: SY='F'; M= -7,-15,-22,-18,-14, 13,-12,-12, -8,-16, -3, -5,-10,-20,-16,-12, -6, -4, -7,-10, 5,-14; /M: SY='F'; M= -9, -8,-23,-10, -9, 1,-12, -7,-13, -8,-10, -7, -4,-16,-10, -3, -4, -4,-10,-19, -2,-10; /M: SY='G'; M= -5, -8,-22,-10,-11, -7, 6,-14,-16,-13,-14,-10, -2,-15,-13,-11, 0, -4,-11,-22,-12,-12; /M: SY='S'; M= -3, -4,-23, -4, -2,-16, -2, -8,-18, -7,-17,-11, 0,-10, -5, -7, 4, -2,-14,-25,-12, -4; /M: M= -4, -5,-23, -6, -4,-17, -1, -7,-19, -7,-16,-10, -1, -8, -4, -5, -1, -6,-16,-24,-13, -5; /I: I=-6; MD=-32; /M: M= -6, -2,-19, -2, -3,-10, -7, -3,-11, -6,-11, -7, 0,-11, -2, -6, 0, -2,-10,-18, -4, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='S'; M= 3, -6,-19, -8, -7,-15, 3, -9,-15,-12,-15,-10, -1,-15, -6,-12, 9, 1,-10,-26,-13, -7; /M: SY='Y'; M=-13,-16,-26,-17,-13, 8,-22, 1, -7, -9, -4, -3,-13,-18, -9, -5,-12, -8, -9, 0, 20,-12; /M: SY='V'; M= 0,-17,-19,-21,-16, -4,-20,-18, 9,-17, 9, 5,-15,-22,-14,-15, -8, -2, 10,-21, -5,-16; /M: M= -3, -5,-21, -9, -2,-10,-15,-10, -9, -3, -9, -6, -2,-16, -4, -2, -1, -1, -7,-21, -8, -3; /M: SY='F'; M=-11,-21,-21,-24,-18, 18,-24,-12, 2,-17, 8, 3,-18,-22,-18,-12,-15, -7, 0, -6, 12,-18; /M: SY='P'; M= -3, -3,-26, -1, 4,-23,-12,-11,-18, -2,-19,-13, -3, 11, -1, -5, 1, -2,-17,-28,-18, 0; /M: SY='P'; M= -3, -4,-24, -3, 0,-19,-10,-10,-18, -2,-15,-10, -4, 2, -3, -5, 0, -1,-15,-26,-15, -2; /M: SY='L'; M= -6,-13,-23,-15,-11, -5,-19,-14, -1,-13, 1, -1,-11,-17,-11,-12, -9, -5, -2,-12, -4,-11; /M: SY='R'; M= -7, -3,-22, -3, 0,-14,-15, -6,-16, 0,-14, -9, -2,-10, -1, 1, -1, -3,-13,-24, -8, -1; /I: I=-4; MD=-22; /M: M= -4, -2,-15, -3, -2, -7, -7, -4, -8, -5, -7, -5, 0, -6, -4, -4, -2, -3, -8,-14, -5, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: SY='A'; M= 1, -5,-19, -7, -3,-14,-12,-10,-10, -4,-11, -7, -4, -6, -3, -6, 1, 0, -7,-21,-10, -4; D=-4; /I: I=-4; MD=-22; /M: M= -6, -6,-18, -7, -4,-14,-11, -9,-14, -5,-10, -8, -4,-15, -5, -2, -3, -3,-11,-22, -8, -5; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: M= -6, -4,-20, -6, -2,-10,-16, -7,-10, -5, -8, -5, -2,-11, -3, -4, -3, 0, -8,-20, -7, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='E'; M= -5, -2,-23, -2, 2,-19,-11, -3,-19, 1,-18,-11, 1, -9, 1, 2, 2, -2,-15,-23,-10, 0; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='F'; M= -6,-13,-21,-15, -9, 1,-15,-14, -5,-15, -2, -3,-10,-16,-12,-14, -6, -4, -5,-14, -3,-11; /M: SY='N'; M= -7, 9,-23, 8, 8,-22,-12, 0,-21, 2,-21,-13, 10,-11, 5, 0, 6, 2,-18,-30,-12, 6; /M: SY='I'; M= -7,-27,-22,-32,-24, 7,-31,-23, 27,-25, 22, 14,-23,-23,-21,-22,-18, -7, 20,-19, 0,-24; /M: SY='S'; M= 2, 0,-19, 0, 6,-20, -9, -9,-17, -2,-19,-13, 2,-11, 2, -5, 13, 7,-12,-30,-14, 4; /M: SY='F'; M=-12,-28,-21,-34,-25, 32,-29,-20, 15,-27, 24, 13,-23,-26,-26,-20,-22, -9, 10,-10, 9,-24; /M: SY='E'; M= -7, 1,-23, 2, 8,-20,-12, -2,-19, 2,-18,-10, 3,-12, 7, 4, 3, -1,-16,-27,-11, 6; /M: SY='F'; M=-14,-29,-19,-36,-27, 50,-30,-21, 9,-27, 15, 6,-22,-27,-32,-20,-19, -8, 9, -3, 17,-27; /M: SY='R'; M=-12, -7,-27, -8, 0,-20,-18, -3,-24, 23,-18, -8, 0,-17, 8, 41, -6, -6,-16,-22,-10, 2; /M: SY='T'; M= 1, -3,-14, -9, -8,-13,-17,-19,-12,-10,-14,-12, -2, 2,-10,-11, 16, 37, -5,-30,-13, -9; /M: SY='R'; M= -7, -8,-22,-10, -3, -8,-19,-10,-11, -3, -8, -6, -7,-16, -4, 2, -3, 2, -8,-16, -4, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='Q'; M= -1, 2,-21, 2, 8,-23,-13, -5,-17, 2,-16, -9, 2,-12, 11, 0, 5, 0,-15,-27,-13, 9; D=-6; /I: I=-6; DM=-29; /M: SY='P'; M= -2, -4,-26, -1, 6,-24,-13,-10,-20, -3,-20,-14, -6, 19, 0, -9, 2, -1,-19,-29,-19, 1; /M: SY='N'; M= -7, 17,-22, 13, 4,-22, -8, 3,-21, -1,-22,-15, 20,-12, 2, -2, 6, 1,-21,-32,-14, 2; /M: SY='G'; M= 7, -9,-23,-11,-17,-25, 45,-19,-30,-17,-25,-17, -1,-17,-16,-19, 4,-12,-21,-22,-26,-16; /M: SY='L'; M= -8,-27,-19,-30,-22, 5,-30,-21, 24,-25, 29, 17,-25,-26,-20,-20,-20, -6, 20,-22, -2,-22; /M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-23, 9,-31,-22, 25,-28, 37, 20,-27,-26,-20,-22,-25, -9, 16,-20, 0,-22; /M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-31,-23, 24,-27,-18, 12,-25, 26, 14,-25,-28,-23,-19,-22, -8, 8, -7, 10,-22; /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-20,-15, 19,-24, 7, -6,-13, -1, -2,-15,-25,-10, -9,-15,-10, -9, 11, 34,-14; /M: SY='A'; M= 2, -7,-19,-13,-10,-11,-12, -9, -6,-10, -7, -5, -3,-17, -8, -9, 1, 2, -3,-21, -9,-10; /M: SY='G'; M= -1, -1,-24, 0, -3,-23, 14, -8,-25, -9,-22,-15, 1,-14, -6,-10, 4, -6,-18,-25,-18, -5; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='D'; M= -5, 4,-22, 5, -1,-20, 2, -7,-22, -5,-21,-14, 5,-10, -3, -6, 5, -1,-17,-26,-14, -2; D=-4; /I: I=-4; MD=-19; /M: M= -3, -3,-15, -3, 0,-11, -1, -3,-11, 0, -9, -5, -1, -7, 0, 0, -2, -5,-10,-11, -5, -1; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='N'; M= -5, 2,-18, 2, 2,-14, -6, 0,-14, -1,-12, -8, 3, -8, 1, -1, -1, -3,-13,-17, -8, 1; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='N'; M= -8, -1,-24, -1, 0,-18, -7, -3,-19, 0,-17,-10, 2,-12, 1, 1, -1, -3,-16,-22, -8, -1; D=-4; /I: I=-4; DM=-19; /M: SY='N'; M= -4, 1,-20, 0, -3,-21, -1, -8,-21, -3,-20,-13, 4,-12, -4, -4, 4, -2,-16,-27,-14, -4; /M: SY='D'; M=-11, 22,-27, 31, 12,-31, -7, -2,-29, -1,-25,-20, 10, -8, 2, -6, 2, -7,-23,-34,-18, 7; /M: SY='F'; M=-15,-21,-24,-25,-20, 34,-26, -2, -3,-18, 0, -2,-16,-22,-20,-14,-14, -7, -5, 8, 32,-20; /M: SY='L'; M= -7,-25,-21,-30,-23, 10,-29,-18, 21,-24, 23, 15,-22,-25,-20,-20,-19, -7, 16,-17, 4,-22; /M: SY='A'; M= 10, -7,-15,-11, -4,-15,-10,-10,-11, -8,-11, -8, -3,-13, -4, -9, 6, 2, -6,-26,-13, -5; /M: SY='L'; M= -7,-28,-18,-30,-23, 6,-30,-23, 24,-25, 29, 15,-26,-27,-22,-21,-21, -7, 21,-22, -1,-23; /M: SY='E'; M= -4, -3,-23, -2, 11,-15,-13, -3,-16, -4,-13, -9, -4,-12, 4, -6, 1, -4,-15,-21, -6, 7; /M: SY='L'; M= -9,-28,-21,-31,-21, 7,-30,-21, 23,-26, 35, 20,-27,-24,-19,-21,-24, -9, 15,-20, -1,-21; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='R'; M= -8, -5,-23, -6, -2,-13,-19, -7, -8, -2, -8, -5, -4,-17, -2, 2, -5, -4, -4,-25, -8, -3; /M: SY='D'; M= -9, 20,-26, 22, 12,-28, -2, 0,-29, 2,-25,-19, 16,-12, 3, -1, 2, -7,-26,-31,-17, 7; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='G'; M= 0, -7,-27, -8,-16,-27, 52,-17,-34,-15,-27,-18, 2,-19,-15,-14, 2,-15,-25,-21,-26,-16; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='H'; M=-11, -6,-26, -8, -2,-11,-19, 14,-18, 5,-14, -5, 0,-18, 4, 12, -6, -6,-15,-18, 5, -1; /M: SY='I'; M= -4,-28,-19,-30,-23, 2,-29,-24, 25,-25, 25, 13,-26,-23,-22,-21,-18, -5, 23,-24, -5,-23; /M: SY='K'; M= -7, -8,-22, -9, 1,-13,-20, -3,-10, 2,-10, -3, -7,-16, 2, 2, -4, -2, -6,-22, -4, 1; /M: SY='F'; M=-10,-26,-19,-30,-23, 23,-28,-17, 13,-23, 20, 9,-23,-27,-23,-18,-19, -7, 11,-10, 12,-23; /M: SY='R'; M= -6, -4,-21, -6, -2,-14,-17, -3,-13, -1,-12, -7, -1,-16, 0, 4, 2, 4, -9,-24, -8, -2; /M: SY='F'; M=-10,-25,-21,-29,-23, 22,-27,-13, 10,-20, 8, 6,-21,-26,-20,-17,-15, -7, 8, 2, 20,-22; /I: I=-3; MD=-13; /M: SY='B'; M=-10, 20,-24, 20, 7,-25, -8, 2,-26, 4,-25,-17, 19,-13, 3, 2, 5, -2,-22,-32,-15, 4; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='L'; M= -6,-13,-15,-15,-13, 1,-19,-12, 3,-17, 11, 4,-12,-20,-13,-13,-11, -3, 2,-19, -2,-14; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: SY='G'; M= 1, -6,-26, -7,-14,-25, 45,-17,-31,-16,-25,-17, 1,-16,-16,-17, 1,-14,-24,-21,-25,-15; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: SY='S'; M= 0, 2,-15, 1, 0,-20, -3, -8,-19, -5,-20,-14, 5,-12, -2, -6, 10, 3,-12,-30,-17, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: SY='G'; M= -3, -2,-24, -2, -3,-22, 15, -9,-26, -3,-21,-14, 2,-13, -4, -4, 2, -7,-20,-21,-17, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: M= -2, -5,-14, -5, -3, -8,-10, -7, -8, -4, -7, -6, -5, -5, -6, -3, -2, -1, -4,-17, -7, -5; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: M= -1,-10,-19,-12, -6,-11,-13,-11, -3, -6, -6, -1, -7,-12, -5, -6, -2, -1, -2,-19, -8, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-13; /M: SY='V'; M= -1,-11,-20,-14, -7,-10,-19,-13, 0, -9, -2, 0,-10,-15, -7,-10, -3, 1, 2,-24, -8, -8; /I: I=-6; MD=-29; /M: M= -6,-11,-22,-12, -5,-11,-21,-11, 0, -8, -1, 0, -9,-15, -5, -6, -5, -2, 0,-25, -8, -6; D=-6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='I'; M= -5,-16,-20,-19,-13, -3,-24,-13, 7,-13, 6, 4,-14,-18,-11,-12, -9, -1, 7,-22, -3,-13; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='T'; M= -6, -7,-22, -9, -5,-11,-17,-10, -8, -6, -8, -5, -4,-11, -4, -2, 0, 2, -7,-25, -9, -6; /M: SY='S'; M= 1, -5,-19, -5, -3,-15,-14,-11,-11, -9,-13,-10, -2, -6, -6,-10, 8, 7, -6,-29,-13, -5; /I: I=-5; MD=-27; /M: SY='E'; M= -5, 0,-24, 1, 5,-22, -3, -7,-21, 0,-19,-13, 2, -5, 1, -2, 2, -4,-18,-26,-16, 2; D=-5; /I: I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27; /M: SY='E'; M= -4, -1,-23, -3, 1,-17,-12, -4,-15, 0,-16, -9, 1,-11, 1, 0, 1, -1,-12,-24, -9, 0; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='R'; M= -6, -6,-24, -8, -1,-17,-16, -5,-15, 2,-14, -7, -3, -4, 1, 6, -2, -2,-12,-25,-11, -2; D=-5; /I: I=-5; DM=-27; /M: SY='I'; M= -8,-26,-19,-29,-24, 11,-30,-17, 20,-23, 20, 12,-23,-27,-21,-19,-18, -6, 18,-15, 8,-23; /M: SY='N'; M= -2, 18,-11, 9, -2,-21, -5, -1,-20, -6,-22,-16, 25,-16, -4, -7, 8, 1,-19,-36,-18, -3; /M: SY='D'; M=-16, 37,-29, 52, 13,-34,-11, -3,-32, -3,-23,-24, 14, -9, -2,-11, -2, -9,-25,-35,-18, 5; /M: SY='G'; M= -1, -1,-27, -3,-12,-27, 43,-12,-33,-14,-27,-17, 8,-17,-12,-14, 3,-14,-27,-24,-24,-12; /M: SY='Q'; M= -8, -1,-26, -1, 13,-24,-17, 2,-21, 10,-17, -7, 0,-11, 18, 10, -3, -7,-20,-23, -9, 14; /M: SY='W'; M=-18,-32,-43,-31,-21, 7,-21,-23,-18,-15,-16,-16,-32,-22,-16,-15,-31,-23,-25,102, 23,-15; /M: SY='H'; M=-17, -2,-29, -3, -2,-17,-20, 80,-24,-10,-17, 0, 7,-20, 8, -1, -9,-16,-25,-28, 17, -1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M= -5, -2,-22, -4, -2,-15,-17, -3,-15, 1,-15, -8, 0,-13, 0, 4, 2, 3,-10,-24, -7, -2; /M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-28, 3,-32,-27, 31,-23, 15, 12,-26,-27,-25,-22,-14, -3, 37,-25, -5,-28; /M: SY='S'; M= -2, -5,-20, -7, 0,-13,-17, -7,-11, -2,-12, -7, -3,-15, -1, -1, 3, 2, -7,-24, -8, -1; /M: SY='I'; M= -3,-27,-19,-32,-25, 8,-28,-24, 24,-24, 17, 12,-23,-25,-23,-22,-16, -6, 23,-18, -2,-25; /M: SY='E'; M= -7, -4,-23, -5, 4,-14,-19, -6,-11, -1,-10, -6, -3,-15, 1, 2, -2, -2, -9,-23, -7, 2; /M: SY='R'; M=-11,-11,-26,-13, -4,-13,-20, -5,-15, 10,-11, -4, -6,-19, 3, 27, -8, -7,-12,-15, -3, -3; /I: I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='N'; M= -6, 7,-22, 5, 3,-17,-10, -1,-17, -1,-16,-12, 10,-15, 0, -1, 3, -1,-16,-27,-10, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='G'; M= -6, 0,-26, 0, 3,-24, 6, -8,-26, 1,-21,-13, 2,-14, 1, 2, -1, -8,-21,-22,-16, 1; D=-5; /I: I=-5; DM=-25; /M: SY='R'; M= -8, -1,-25, -4, 0,-19,-10, -3,-22, 11,-19,-11, 6,-16, 5, 20, -1, -4,-18,-22,-10, 1; /M: SY='Q'; M= -7, -1,-23, -1, 4,-19,-13, -3,-16, 2,-16, -8, 2,-14, 5, 4, 2, -1,-13,-26,-11, 3; /M: SY='V'; M= 3,-20,-17,-24,-20, -7,-11,-19, 7,-19, 6, 5,-16,-21,-17,-18, -8, -4, 10,-22, -9,-20; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='T'; M= -6, -9,-21,-12, -6, -7,-19, -9, -7, -4, -8, -4, -5,-16, -4, 0, -1, 3, -4,-18, -4, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='L'; M= -9,-27,-20,-30,-21, 6,-29,-19, 22,-25, 33, 20,-25,-26,-18,-19,-22, -8, 15,-21, -1,-20; /M: SY='Q'; M= -3, -8,-21,-10, -1,-16,-18, -9, -8, -1,-10, -2, -6,-15, 2, -1, 2, 2, -5,-22, -8, 0; /M: SY='V'; M= -2,-29,-15,-31,-28, 1,-31,-28, 30,-23, 16, 12,-26,-27,-26,-21,-13, -2, 38,-26, -7,-28; /M: SY='D'; M=-15, 38,-27, 50, 15,-34, -7, 0,-34, -1,-27,-25, 20,-10, 0, -8, 2, -8,-27,-37,-19, 7; /I: I=-3; MD=-14; /M: SY='G'; M= -6, 8,-22, 8, -1,-21, 10, -5,-24, -3,-21,-15, 9,-13, -4, -3, 2, -6,-20,-23,-14, -3; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='E'; M= -5, -4,-20, -4, 4,-13,-11, -7,-10, -2, -9, -6, -4, -5, 1, -3, -3, -3,-10,-18, -9, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='E'; M= -3, -5,-20, -4, 1,-17,-11, -3,-17, -4,-15,-10, -3, -6, 0, -4, 0, -5,-15,-22, -9, 0; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='V'; M= -3,-12,-17,-14, -9, -8,-18,-12, -4, -8, -6, -3, -9,-14, -7, -6, -3, -1, 1,-21, -8, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: M= -3,-10,-19,-12, -7,-12,-15,-11, -4, -8, -6, -2, -7,-16, -6, -6, -3, -2, -1,-23,-10, -7; D=-3; /I: I=-3; DM=-14; /M: SY='E'; M= -7, -3,-24, -3, 2,-15,-14, 1,-15, -1,-13, -8, -1,-14, 2, -1, -1, -3,-13,-23, -4, 0; /M: SY='S'; M= -3, -7,-22, -8, -3,-14, -5,-11,-15, -6,-14, -9, -3,-10, -6, -5, 1, -3,-11,-25,-14, -5; /M: SY='T'; M= -3, -9,-20,-12, -7,-11,-17,-13, -4, -6, -7, -4, -7,-15, -6, -6, 0, 4, 1,-25, -9, -7; /M: SY='S'; M= -1, -3,-22, -5, -4,-18,-10,-10,-12, -6,-14, -9, -1, -4, -4, -8, 3, 1,-10,-28,-14, -5; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='P'; M= -4, -8,-22, -8, 0,-19,-15, -9,-13, -7,-15,-10, -6, 11, -1, -8, -1, -2,-15,-24,-15, -2; D=-6; /I: I=-6; MD=-29; /M: SY='G'; M= -4, -4,-24, -6, -7,-19, 9,-10,-18, -7,-15,-10, 1,-11, -6, -7, -2, -7,-16,-23,-16, -8; D=-6; /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='S'; M= -3, 0,-22, -1, 1,-19, -4, -8,-19, -3,-18,-11, 1, -8, -3, -7, 3, -2,-15,-27,-15, -1; /M: SY='N'; M= -5, -1,-21, -3, 0,-10,-12, -6,-14, -6,-13,-10, 1,-11, -6, -6, 0, -2,-12,-25, -9, -4; /M: SY='T'; M= -3, -5,-21, -7, -2,-15,-14,-12,-11, -3,-10, -6, -4,-12, -1, -4, 1, 4, -8,-24,-11, -2; /M: M= -7, -6,-25, -6, -4,-13,-10, -8,-12, -7, -9, -6, -4, -8, -4, -5, -5, -6,-12,-22, -9, -6; /I: I=-3; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15; /M: SY='L'; M= -6,-21,-18,-24,-18, 5,-24,-16, 15,-21, 23, 14,-18,-23,-16,-16,-17, -6, 11,-19, -1,-17; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='B'; M= -8, 13,-22, 12, 5,-23, -6, -2,-21, 0,-20,-14, 13,-10, 1, -3, 2, -3,-19,-29,-14, 2; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='L'; M= -4,-10,-17,-11, -6, -4,-18,-10, -1,-12, 3, -1,-10,-10, -9,-11, -5, 1, 0,-20, -5, -8; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='N'; M= -6, 8,-21, 8, 3,-20, -3, -2,-20, 1,-19,-13, 10, -9, 0, 1, 2, -4,-17,-25,-14, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='S'; M= -2, 1,-18, 1, 3,-18, -1, -7,-17, -3,-15,-10, 2, -9, 0, -4, 5, 1,-13,-22,-13, 1; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='P'; M= -7, -2,-24, 0, 1,-19,-14, -6,-16, -2,-16, -9, -2, 2, 0, -4, -2, -5,-15,-24,-12, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-15; /M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-29,-22, 7,-29,-19, 21,-24, 26, 15,-24,-25,-19,-19,-19, -6, 16,-19, 1,-22; /M: SY='Y'; M=-16,-22,-25,-24,-19, 31,-28, 0, 0,-16, 4, 1,-19,-27,-17,-12,-17, -8, -4, 11, 42,-19; /M: SY='I'; M= -8,-28,-19,-32,-25, 12,-31,-24, 25,-26, 23, 14,-25,-27,-24,-22,-19, -6, 23,-19, 1,-25; /M: SY='G'; M= 1, -9,-29,-10,-18,-27, 59,-19,-36,-18,-27,-19, 0,-20,-19,-19, 0,-17,-27,-19,-27,-18; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='G'; M= 1, -9,-28,-10,-16,-27, 50,-18,-32,-16,-25,-17, -1,-17,-16,-16, 0,-16,-24,-21,-26,-17; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='L'; M= -3,-20,-16,-23,-18, 1,-22,-15, 8,-16, 12, 6,-17,-23,-16,-13,-11, -4, 10,-21, -3,-17; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='P'; M= -6,-13,-30, -9, -3,-21,-16,-16,-13, -8,-19,-12,-12, 38, -8,-14, -6, -6,-16,-27,-20, -8; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='E'; M= -7, 2,-24, 4, 7,-19,-12, -8,-16, -2,-16,-12, 0, 0, -1, -3, -1, -5,-15,-26,-15, 2; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='N'; M= -4, 1,-23, 1, 0,-18, -6, -6,-18, -4,-17,-12, 2,-10, -3, -5, 1, -3,-14,-24,-13, -2; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: M= -3, -8,-20,-11, -6,-11,-13, -9, -7, -7, -5, -2, -6,-12, -4, -7, -3, -3, -7,-22, -7, -6; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: M= -5, -6,-21, -8, -4,-10,-11, -7,-13, -3,-11, -7, -3,-11, -4, -1, -2, -3,-10,-21, -8, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: M= -3, -7,-20, -9, -3,-14,-15,-12, -7, -3, -7, -4, -5, -8, -3, -4, -1, 0, -6,-24,-11, -4; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='S'; M= -3, -5,-21, -5, -2,-17, -7, -9,-15, -4,-14,-10, -2, -1, -3, -5, 2, -1,-13,-22,-12, -3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: M= -3, -4,-13, -4, -4, -9, -8, -4, -9, -5, -7, -5, -3, -6, -3, -4, -1, -2, -7,-16, -6, -4; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='V'; M= -1,-10,-16,-11, -7, -7,-11,-12, -2, -7, 0, -1, -9,-13, -8, -6, -5, -2, 1,-18, -7, -8; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='P'; M= -2, -9,-20, -9, -4,-14,-14,-10, -8, -4,-11, -6, -6, 6, -4, -4, -2, -1, -8,-21,-10, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='V'; M= -2, -8,-17,-12, -9, -5,-16,-10, 1,-10, -2, -1, -5,-13, -7,-10, -3, 0, 2,-19, -4, -9; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='T'; M= -4, -6,-22, -8, -4,-15,-11, -8,-13, -4,-12, -7, -2,-11, -1, -1, 1, 2,-11,-22,-11, -3; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='E'; M= -4, 0,-25, 0, 3,-21,-13, -3,-18, 0,-20,-12, 2, 1, 0, -3, 1, -3,-16,-27,-13, 0; /M: SY='G'; M= -2, -2,-24, -4, -9,-20, 19, -9,-27,-10,-25,-17, 6, -7, -9,-10, 5, -7,-23,-26,-19,-10; /M: SY='F'; M=-18,-29,-21,-36,-27, 61,-30,-17, 4,-27, 14, 3,-21,-29,-33,-19,-21,-10, 2, 5, 27,-27; /M: SY='R'; M= -7, -6,-21, -7, -4,-16,-20, -7, -7, 0,-11, -4, -5,-17, -1, 3, -3, -2, -2,-26, -9, -4; /M: SY='G'; M= 1,-10,-29,-10,-20,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-20,-20,-19, 0,-19,-28,-20,-29,-20; /M: SY='C'; M= -9,-20,104,-50,-28,-19,-29,-28,-50,-28,-17,-17,-19,-38,-28,-28,-10,-10, -8,-46,-27,-28; /M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-34,-26, 4,-32,-22, 34,-25, 26, 26,-24,-24,-18,-22,-21, -9, 23,-21, -1,-24; /M: SY='R'; M= -6, -3,-25, -3, 5,-23,-11, -2,-25, 13,-21,-12, 1,-14, 9, 22, 2, -5,-18,-23,-11, 5; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='B'; M= -9, 17,-24, 16, 5,-23, -2, -2,-24, -1,-21,-17, 17,-14, -1, -1, 3, -4,-22,-31,-17, 2; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='I'; M= -5,-28,-19,-31,-25, 6,-30,-25, 25,-24, 21, 12,-25,-26,-24,-21,-18, -5, 25,-19, -3,-25; /M: SY='R'; M= -9, -7,-23, -8, -2,-12,-20, -4,-10, 2,-11, -4, -4,-18, 2, 6, -3, -2, -7,-20, -3, -1; /M: SY='I'; M= -8,-27,-21,-31,-25, 12,-30,-21, 23,-24, 19, 12,-24,-26,-23,-21,-18, -7, 20,-14, 6,-25; /M: SY='N'; M= -8, 23,-21, 16, 0,-23, 2, 1,-24, -3,-25,-18, 29,-17, -2, -4, 6, -3,-24,-34,-18, -1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= -3, 1,-26, 0, -4,-24, 18, -8,-26, -7,-21,-14, 6,-17, -5, -6, 0,-11,-22,-25,-19, -5; /M: SY='K'; M= -6, -4,-25, -4, 3,-21,-15, -3,-16, 6,-15, -6, -2,-13, 5, 6, -3, -6,-12,-23,-10, 3; /M: M= -6, -6,-25, -5, -2,-16,-18, -9, -9, -6,-10, -6, -5, 0, -1, -7, -3, -2,-11,-24, -9, -3; /M: SY='I'; M= -7,-23,-22,-25,-18, 0,-25,-19, 13,-18, 11, 6,-20,-15,-16,-15,-14, -5, 11,-20, -2,-19; /M: SY='D'; M= -8, 15,-24, 17, 3,-24, -5, -6,-21, -5,-18,-16, 11,-10, -3, -8, 1, -4,-19,-32,-17, -1; /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-23,-16, 8,-26,-16, 10,-18, 20, 10,-19,-22,-16,-14,-18, -8, 5,-17, 2,-17; /M: M= 0, -7,-21, -9, -4,-13,-14,-11,-10, -7, -7, -6, -6,-10, -5, -8, -2, -1, -9,-21, -9, -5; /M: SY='E'; M= -3, 1,-24, 1, 8,-20,-12, -5,-19, -1,-16,-11, 0, -5, 2, -2, 2, -2,-16,-27,-14, 4; /M: M= -3, -6,-23, -6, -3,-12,-16,-10,-10, -6,-10, -8, -5, -7, -5, -7, -2, -2, -9,-21, -8, -5; /I: I=-6; MD=-32; /M: SY='A'; M= 1, -6,-21, -9, -4,-15,-12, -9, -9, -5,-10, -4, -3,-11, -1, -5, 0, -1, -7,-24,-11, -3; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: M= -7, -5,-23, -6, 0,-13,-16, -5,-12, -2,-10, -6, -3,-12, 0, 0, -2, -2,-10,-24, -8, -1; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='S'; M= -1, -6,-19, -8, -6,-13,-11, -9,-11, -4,-12, -7, -3,-13, -5, -3, 2, 2, -6,-24,-10, -6; D=-4; /I: I=-4; MD=-18; /M: SY='N'; M= -6, 0,-22, -2, 1,-17, -9, -2,-18, 2,-17,-10, 3,-12, 1, 3, 1, -3,-15,-23, -9, 0; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: M= -3, -6,-14, -8, -2, -7, -9, -6, -3, -4, -3, -1, -5, -8, -2, -2, -4, -3, -3,-12, -6, -3; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='G'; M= -2, 4,-22, 2, -4,-23, 13, -9,-23, -7,-21,-15, 7,-14, -6, -9, 2, -7,-19,-25,-18, -5; D=-4; /I: I=-4; DM=-18; /M: SY='V'; M= -1,-16,-17,-20,-16, -7,-22,-19, 11,-14, 0, 3,-13,-20,-14,-15, -4, 0, 16,-26, -9,-16; /M: M= -4, -7,-16,-10, -3,-11,-15, -9,-11, -6,-10, -6, -5,-16, -5, -4, 0, -1, -6,-24,-10, -4; /M: M= -3, -6,-23, -6, -2,-18,-15,-10,-13, -3,-14, -9, -5,-20, -3, -7, -3, -4,-12,-25,-12, -4; /I: I=-4; MD=-19; /M: SY='G'; M= -4, -2,-20, -4,-10,-22, 24, -8,-25,-12,-22,-14, 4,-12,-10,-12, 2, -9,-21,-24,-19,-10; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Post-processing [info]
| COMPETES_HIT_WITH | PS51828 |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 439 in 154 different sequences |
| Number of true positive hits | 439 in 154 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 69 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 86.42 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 6 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | Laminin G-like |
| Version [info] | 8 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
154 sequences
AGRIN_CHICK (P31696), AGRIN_DIPOM (Q90404), AGRIN_HUMAN (O00468), AGRIN_MOUSE (A2ASQ1), AGRIN_RAT (P25304), AXO_DROME (M9PE65), CADE_DROME (Q24298), CADH3_CAEEL (P34616), CADH4_CAEEL (Q19319), CADN2_DROME (Q9VJB6), CADN_DROME (O15943), CELR1_HUMAN (Q9NYQ6), CELR1_MOUSE (O35161), CELR2_HUMAN (Q9HCU4), CELR2_MOUSE (Q9R0M0), CELR2_RAT (Q9QYP2), CELR3_HUMAN (Q9NYQ7), CELR3_MOUSE (Q91ZI0), CELR3_RAT (O88278), CELR_CAEEL (G5EDK5), CNT3B_HUMAN (Q96NU0), CNTP1_HUMAN (P78357), CNTP1_MOUSE (O54991), CNTP1_RAT (P97846), CNTP2_HUMAN (Q9UHC6), CNTP2_MOUSE (Q9CPW0), CNTP2_PONAB (Q5RD64), CNTP3_HUMAN (Q9BZ76), CNTP4_HUMAN (Q9C0A0), CNTP4_MOUSE (Q99P47), CNTP5_CANLF (Q0V8T0), CNTP5_CHICK (Q0V8S9), CNTP5_HUMAN (Q8WYK1), CRB_DROME (P10040), CRUM1_HUMAN (P82279), CRUM1_MOUSE (Q8VHS2), CRUM2_HUMAN (Q5IJ48), CRUM2_MOUSE (Q80YA8), CSPG4_HUMAN (Q6UVK1), CSPG4_MOUSE (Q8VHY0), CSPG4_RAT (Q00657), CTP5A_MOUSE (Q0V8T9), CTP5A_RAT (Q0V8T6), CTP5B_MOUSE (Q0V8T8), CTP5B_RAT (Q0V8T5), CTP5C_MOUSE (Q0V8T7), CTP5C_RAT (Q0V8T4), CTP5D_RAT (Q0V8T3), EGFLA_BOVIN (A3KN33), EGFLA_HUMAN (Q63HQ2), EGFLA_MOUSE (Q4VBE4), EGFLA_RAT (B4F785), ELP_ACRMI (B8UU78), EPI1_CAEEL (Q21313), EYS_DANRE (B8JI71), EYS_DROME (A0A1F4), EYS_HUMAN (Q5T1H1), EYS_MACFA (A0A2K5V015), EYS_PONAB (Q5R6R1), FAT1_HUMAN (Q14517), FAT2_DROME (Q9VW71), FAT2_HUMAN (Q9NYQ8), FAT2_MOUSE (Q5F226), FAT2_RAT(O88277), FAT3_HUMAN (Q8TDW7), FAT3_MOUSE (Q8BNA6), FAT3_RAT(Q8R508), FAT4_HUMAN (Q6V0I7), FAT4_MOUSE (Q2PZL6), FAT_DROME (P33450), GAS6_HUMAN (Q14393), GAS6_MOUSE (Q61592), GAS6_RAT(Q63772), HMR1_CAEEL (Q967F4), LAM3_CAEEL (G5ECE3), LAMA1_HUMAN (P25391), LAMA1_MOUSE (P19137), LAMA2_HUMAN (P24043), LAMA2_MOUSE (Q60675), LAMA3_HUMAN (Q16787), LAMA3_MOUSE (Q61789), LAMA4_HUMAN (Q16363), LAMA4_MOUSE (P97927), LAMA5_HUMAN (O15230), LAMA5_MOUSE (Q61001), LAMA_DROME (Q00174), NELL1_MOUSE (Q2VWQ2), NELL2_DANRE (A1A5Y0), NELL2_XENLA (Q7ZXL5), NLR1_CAEEL (Q19617), NR1AA_DANRE (A1XQX0), NR1AB_DANRE (A1XQX1), NR1BA_DANRE (A1XQX2), NR1BB_DANRE (A1XQX3), NR3AA_DANRE (A1XQX8), NR3AB_DANRE (A1XQY0), NR3BA_DANRE (A1XQY1), NR3BB_DANRE (A1XQY3), NRX1A_BOVIN (Q28146), NRX1A_CHICK (Q9DDD0), NRX1A_HUMAN (Q9ULB1), NRX1A_MOUSE (Q9CS84), NRX1A_RAT (Q63372), NRX1B_BOVIN (Q28142), NRX1B_CHICK (D0PRN2), NRX1B_HUMAN (P58400), NRX1B_MOUSE (P0DI97), NRX1B_RAT (Q63373), NRX1_DROME (Q3KN41), NRX2A_HUMAN (Q9P2S2), NRX2A_MOUSE (E9Q7X7), NRX2A_RAT (Q63374), NRX2B_HUMAN (P58401), NRX2B_MOUSE (E9PUN2), NRX2B_RAT (Q63376), NRX3A_CHICK (D0PRN3), NRX3A_HUMAN (Q9Y4C0), NRX3A_MOUSE (Q6P9K9), NRX3A_RAT (Q07310), NRX3B_BOVIN (Q28143), NRX3B_CHICK (D0PRN4), NRX3B_HUMAN (Q9HDB5), NRX3B_MOUSE (Q8C985), NRX4_DROME (Q94887), PCDL_ACRMI (B8V7Q1), PGBM_HUMAN (P98160), PGBM_MOUSE (Q05793), PROS_BOVIN (P07224), PROS_HUMAN (P07225), PROS_MACMU (Q28520), PROS_MOUSE (Q08761), PROS_RABIT (P98118), PROS_RAT(P53813), SHBG_CROCR (A0EQL2), SHBG_HUMAN (P04278), SHBG_MOUSE (P97497), SHBG_PHOSU (Q62588), SHBG_RABIT (P15196), SHBG_RAT(P08689), SLIT1_CAEEL (G5EFX6), SLIT1_HUMAN (O75093), SLIT1_MOUSE (Q80TR4), SLIT1_RAT (O88279), SLIT2_HUMAN (O94813), SLIT2_MOUSE (Q9R1B9), SLIT3_HUMAN (O75094), SLIT3_MOUSE (Q9WVB4), SLIT3_RAT (O88280), SLIT_DROME (P24014), STAN_DROME (Q9V5N8), UNC52_CAEEL (Q06561), USH2A_HUMAN (O75445), USH2A_MOUSE (Q2QI47), USH2A_RAT (Q8K3K1)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
69 sequences
CO5A1_CRILO (Q60467), CO5A1_HUMAN (P20908), CO5A1_MOUSE (O88207), CO5A1_RAT (Q9JI03), CO5A3_HUMAN (P25940), CO9A1_CHICK (P12106), CO9A1_HUMAN (P20849), CO9A1_MOUSE (Q05722), COBA1_HUMAN (P12107), COBA1_MOUSE (Q61245), COBA1_RAT (P20909), COBA2_BOVIN (Q32S24), COBA2_HUMAN (P13942), COBA2_MOUSE (Q64739), COCA1_CHICK (P13944), COCA1_HUMAN (Q99715), COCA1_MOUSE (Q60847), COEA1_CHICK (P32018), COEA1_HUMAN (Q05707), COEA1_MOUSE (Q80X19), COFA1_HUMAN (P39059), COFA1_MOUSE (O35206), COGA1_HUMAN (Q07092), COGA1_MOUSE (Q8BLX7), COIA1_HUMAN (P39060), COIA1_MOUSE (P39061), COJA1_HUMAN (Q14993), COJA1_MOUSE (Q0VF58), COKA1_HUMAN (Q9P218), COKA1_MOUSE (Q923P0), COLA1_HUMAN (Q96P44), COLA1_XENLA (Q641F3), COMA1_HUMAN (Q8NFW1), COOA1_HUMAN (Q17RW2), COOA1_MOUSE (Q30D77), CORA1_HUMAN (Q8IZC6), CORA1_MOUSE (Q5QNQ9), CORA1_RAT (Q80ZF0), CRA1A_DANRE (C7DZK3), CRA1B_DANRE (A0MSJ1), NELL1_HUMAN (Q92832), NELL1_RAT (Q62919), NELL2_BOVIN (A6QR11), NELL2_HUMAN (Q99435), NELL2_MOUSE (Q61220), NELL2_PONAB (Q5R3Z7), NELL2_RAT (Q62918), NELL2_XENTR (A2VCU8), NEL_CHICK (Q90827), TSEAR_HUMAN (Q8WU66), TSEAR_MOUSE (J3S6Y1), TSP1_BOVIN (Q28178), TSP1_HUMAN (P07996), TSP1_MOUSE (P35441), TSP1_XENLA (P35448), TSP2_BOVIN (Q95116), TSP2_CHICK (P35440), TSP2_HUMAN (P35442), TSP2_MOUSE (Q03350), TSP3A_DANRE (Q8JHW2), TSP3B_DANRE (Q1L8P7), TSP3_HUMAN (P49746), TSP3_MOUSE (Q05895), TSP4B_DANRE (Q8JGW0), TSP4_BOVIN (Q3SWW8), TSP4_HUMAN (P35443), TSP4_MOUSE (Q9Z1T2), TSP4_RAT(P49744), TSP4_XENLA (Q06441)» more |
| PDB [Detailed view] |
64 PDB
1C4R; 1D2S; 1DYK; 1F5F; 1H30; 1KDK; 1KDM; 1LHN; 1LHO; 1LHU; 1LHV; 1LHW; 1OKQ; 1PZ7; 1PZ8; 1PZ9; 1Q56; 1QU0; 2C5D; 2H0B; 2JD4; 2R16; 2R1B; 2R1D; 2WJS; 2WQZ; 2XB6; 3ASI; 3B3Q; 3BIW; 3BOD; 3MW2; 3MW3; 3MW4; 3POY; 3PVE; 3QCW; 3R05; 3SH4; 3SH5; 3V64; 3V65; 3VKF; 4RA0; 5IK4; 5IK5; 5IK7; 5IK8; 5MC9; 5VXZ; 5XAU; 5Z8Y; 6CW1; 6PNP; 6PNQ; 6PYA; 6PYB; 6PYF; 6ULB; 7CEC; 7ML7; 7ZC9; 8D1B; 8S9P » more |