Due to maintenance work, this service will not be available Thursday September 18th between 1pm and 4pm CEST.
Entry: PS50031

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] EH
Accession [info] PS50031
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50031
Associated ProRule [info] PRU00077

Name and characterization of the entry

Description [info] EH domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=91;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=86;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.1558; R2=.02262896; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4627.62406015038; R2=25.8890977443609; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=368; N_SCORE=8.5; H_SCORE=14181; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=280; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11877; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='D'; M=-14, 28,-29, 40, 26,-34, -5, -2,-35,  4,-27,-24, 13, -9,  5, -5,  0,-10,-29,-34,-20, 15;
/M: SY='K'; M= -9, -2,-26, -5,  5,-22,-21, -8,-11, 14,-13, -4,  0,-14,  9,  6, -6, -5,-11,-24,-10,  6;
/M: SY='A'; M= 19, -4,-19, -9, -2,-23, -2,-12,-16, -5,-18,-10, -1, -1, -2,-12,  8, -2,-12,-25,-20, -3;
/M: SY='K'; M=-12, -5,-27, -5,  2,-17,-22, -8,-19, 21,-14, -5, -5,-16,  8, 21,-11, -9,-14,-20, -7,  5;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-26,-27,-24, 42,-30,  5,  2,-17,  4,  1,-21,-30,-20,-14,-19, -9, -3, 20, 59,-24;
/M: SY='E'; M= -9, 13,-30, 20, 21,-24,-14, -4,-27, -1,-23,-21,  3, -3,  3, -8, -2, -9,-26,-14,-11, 12;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-25,  6, 20,-30,-13, -5,-25, 14,-23,-13,  1, -8, 16,  5,  3, -4,-21,-26,-15, 18;
/M: SY='I'; M=-12,-25,-28,-32,-22,  6,-35,-19, 28,-20, 15, 13,-19,-22,-14,-20,-19,-10, 14,-13,  9,-21;
/M: SY='F'; M=-20,-27,-23,-33,-27, 63,-30, -6,  0,-23,  7,  0,-20,-30,-30,-17,-20,-10, -3, 17, 47,-27;
/M: SY='D'; M= -6,  5,-23,  6,  5,-20,-14,  1,-18, -2,-11,-10,  4,-15,  2,  1,  1, -4,-16,-30,-12,  3;
/M: SY='S'; M=  2,  2,-20,  2,  5,-27, -6, -6,-23,  4,-24,-13,  4,-11, 13,  2, 14,  4,-17,-29,-16,  9;
/I:         MD=-32;
/M: SY='V'; M=  0,-12,  1,-16,-13,  0,-16,-15,  3,-14,  5,  1,-11,-15,-13,-13, -4,  5,  7,-17, -5,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M: SY='R'; M= -1, -5,-20, -6,  2,-18,-14, -8,-16, 11,-14, -8, -1,-14,  1, 17, -1, -4, -8,-23,-12,  0; D=-3;
/M: SY='P'; M= -1, -5,-25, -2,  7,-22,-15,-14,-17, -4,-18,-14, -8, 26, -4,-11,  0,  2,-17,-27,-19,  0; D=-3;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-22,-27,-20,  7,-22,-22, 14,-18,  9,  6,-18,-16,-20,-17,-15, -7, 11,-16, -2,-21; D=-3;
/M: SY='F'; M=-13,-26,-19,-30,-22, 32,-27,-14, 11,-25, 28, 13,-23,-27,-23,-17,-23, -9,  4, -5, 16,-21; D=-3;
/M: SY='M'; M= -5,-14,-20,-16, -6, -7,-19, -8,  0, -3,  6, 12,-13,-18, -4, -1,-10, -6,  0,-19, -3, -5; D=-3;
/M: SY='N'; M= -5,  4,-19,  0,  0,-16,-11,  0,-19,  9,-22,-12, 10,-13,  1,  6,  9,  7,-15,-25, -6,  0; D=-3;
/M: SY='S'; M=  6, -5,-11, -8, -6, -8, -7,-12,-12,-12,-15,-12,  2,-12, -6,-11, 23, 16, -5,-29,-12, -6; D=-3;
/M: SY='G'; M= -6,  1,-27,  1, -7,-26, 29,-11,-33,  0,-26,-17,  6,-17, -8,  3, -2,-14,-25,-22,-21, -8; D=-3;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-28,-20,  8,-28,-20, 21,-27, 41, 18,-27,-27,-19,-19,-25, -8, 14,-19, -1,-20; D=-3;
/M: SY='P'; M= -7, -2,-27,  2,  1,-25,-12,-11,-20, -6,-26,-18, -1, 39, -5,-10,  3, -1,-23,-31,-23, -5; D=-3;
/M: SY='D'; M= -4,  7,-24,  9,  2,-26, -8, -7,-21,  3,-19, -9,  3, -9,  3, -1,  0, -6,-16,-28,-16,  2;
/M: SY='Q'; M= -4,  5,-23,  6,  6,-24,-16, -4,-16, -5,-16,-11,  2, -4,  7, -8,  5,  5,-16,-30,-14,  6;
/M: SY='V'; M= -7, -7,-21, -7,-11,-12,-25,-17,  8,-15,  5,  2,-12,-20,-10,-16, -8, -1, 10,-27, -9,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-30, 47, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/M: SY='G'; M= 12, -1,-20, -5, -4,-24, 17,-12,-25, -7,-23,-16,  5,-14, -6, -7,  8, -5,-18,-26,-22, -5;
/M: SY='H'; M=-12, -1,-27, -1,  9,-26,-18, 19,-26, 16,-23, -7,  3,-13, 18, 19, -2, -7,-23,-25, -5, 12;
/M: SY='I'; M= -2,-28,-22,-35,-28, -2,-34,-29, 39,-25, 14, 14,-22,-22,-22,-26,-14, -6, 33,-23, -5,-28;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='B'; M=  5, 14,-19, 14,  9,-21, -7, -7,-22, -4,-21,-19, 11,-11, -1,-10, 11,  2,-17,-32,-17,  4;
/M: SY='L'; M= -5,-27,-19,-28,-19,  7,-27,-20, 16,-27, 42, 16,-27,-27,-19,-19,-24, -5,  9,-21, -2,-19;
/M: SY='A'; M= 16,-16, 15,-22,-18,-14,-15,-23, -3,-18, -9, -7,-13,-21,-17,-21,  5,  1,  9,-32,-18,-18;
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M:
/M: SY='F'; M= 11,-19,-10,-26,-19, 14,-17,-19, -1,-19,  1, -3,-15,-21,-20,-20, -3, -3,  3,-13,  1,-19;
/M: SY='V'; M= -2,-25,-19,-26,-20, -1,-26,-19, 17,-20, 13, 10,-23,-16,-19,-19,-12, -4, 18,-22, -2,-21;
/M: SY='A'; M= 27,-14, -7,-23,-15, -2, -6,-20, -9,-16, -4, -7,-12,-16,-17,-20,  2, -1, -1,-17,-11,-15;
/M: SY='M'; M=-10,-23,-20,-30,-20, 12,-24,-11, 16,-19, 22, 32,-20,-23,-12,-15,-18, -7,  8,-18,  2,-16;
/M: SY='H'; M=-14,-10,-28,-13, -7, -5,-22, 29,-16,  1,-12, -2, -3,-20,  0, 13,-11,-13,-15,-16, 13, -7;
/M: SY='L'; M= -9,-26, -9,-28,-19,  8,-27,-19, 12,-27, 35, 15,-25,-28,-19,-19,-22, -7,  6,-23, -3,-19;
/M: SY='I'; M= -5,-27,-20,-32,-26,  0,-32,-27, 33,-25, 16, 13,-22,-24,-22,-23,-13, -4, 31,-25, -5,-26;
/M: SY='A'; M=  5,  0,-21, -6, -4, -8,-12, -2,-14, -4,-14, -9,  3,-17,  2, -3,  0, -5,-14,-15,  1, -2;
/M: SY='Q'; M= -8, -4, -7, -4, -3,-19,-17, -5,-17, -4, -9, -4, -7,-20,  6, -3, -8,-10,-15,-22, -6,  1;
/M: SY='A'; M= 11,-12,-11,-16, -8,-17,-14,-15,-12,  4, -8, -4,-10,-17, -5,  4, -4, -5, -4,-23,-14, -7;
/M: SY='Q'; M=-10, -7,-23,-10, -3,-16,-21,  3, -3, -6,  2,  6, -4,-20, 11, -3,-10, -8, -7,-25, -6,  3;
/M: SY='N'; M= -5, 12,-24,  9, 12,-26,-12, -1,-20,  4,-23,-14, 16,-12, 12,  3,  6, -3,-21,-31,-16, 12;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-27, -9,-11,-26, 32,-11,-30, -5,-22,-13, -2,-18,-11, -8, -3,-14,-22,-21,-20,-11;
/I:         MD=-17;
/M: SY='G'; M= -4,  0,-16,  1,  4,-15,  6,  0,-16,  0,-14, -9,  2,  0, -1, -2, -2, -7,-15,-14,-10,  1; D=-3;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-17;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-26, -3,  4,-14,-20, -5, -8, -7, -7, -7, -6, -3, -4,-11, -7, -7,-10,-23, -6, -2;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-25,  5, 13,-25,-17,-10,-20, -1,-21,-16, -3, 11,  2, -3,  5,  2,-17,-31,-19,  6;
/M: SY='I'; M= -2,-25,-22,-29,-22, -6,-29,-27, 24,-21,  7,  7,-21, -5,-20,-23,-11, -3, 21,-25,-10,-24;
/M: SY='P'; M= -9,-13,-36, -7,  0,-28,-17,-17,-20, -9,-29,-20,-11, 72, -9,-17, -5, -5,-28,-31,-28, -9;
/M: SY='S'; M=  0, -2,-20, -3, -4,-13,-14,  0,-14, -4,-11, -6, -1,-16, -1, -2,  2,  0,-11,-21, -1, -4;
/M: SY='S'; M=  0, -8,-16, -8,  1,-16,-16,-13, -5, -9,-10, -7, -6,-15,  0,-10, 11,  8,  2,-32,-14,  0;
/M: SY='L'; M= -8,-22,-20,-25,-18,  4,-26,-18, 17,-26, 33, 13,-19,-26,-17,-19,-19, -6,  8,-23, -3,-18;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-32, -9, -4,-20,-19,-16,-14,-11,-18,-14,-16, 48,-10,-18, -7, -5,-20,-25,-16,-10;
/M: SY='S'; M= -1,  6,-21,  7, -1,-22,-10,-11,-16, -9,-20,-16,  6,  6, -6,-13,  8,  3,-14,-34,-20, -5;
/M: SY='Q'; M= -5, -5,-24, -4,  3,-13,-14, -3,-17, -6,-15,-11, -2,-12,  4, -7,  3, -3,-17,-12, -7,  4;
/M: SY='L'; M=  1,-20,-16,-23,-15, -1,-20,-17,  8,-21, 23, 12,-18,-22,-13,-17,-10,  1,  5,-24, -6,-14;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-24,-31,-22,  3,-29,-23, 19,-17, 11, 10,-21,-23,-18,-13,-17, -9, 16,-10, -1,-21;
/M: SY='P'; M= -6, -3,-32,  1,  7,-30,-16, -6,-21, -4,-26,-16, -3, 41,  4,-11, -4, -8,-27,-30,-22,  3;
/M: SY='P'; M= -3,-10,-27, -6,  3,-25,-12,-15,-17, -8,-24,-16, -8, 32, -2,-13,  6,  1,-17,-31,-23, -2;
/M: SY='S'; M=  1,-10,-10,-11, -8,-12,-13,-16,-12,-14,-20,-14, -3,  7,-11,-16, 10,  3, -9,-31,-17,-11;
/M: SY='K'; M= -7,  2,-25,  2,  8,-20,-15, -7,-25, 14,-23,-14,  4, -6,  3, 14,  1, -3,-19,-26,-13,  5;
/M: SY='R'; M= -4, -7,-21,-13, -9,  0,-16,-10,-12,  1, -8, -6,  0,-20, -8,  9, -6, -5, -8,-19, -5, -9;
/M: SY='H'; M= -4, -3,-27, -5, -1,-18, -7,  4,-20, -2,-19, -9,  2,  3, -4, -6, -4, -9,-20,-26,-12, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 197 in 113 different sequences
Number of true positive hits 196 in 112 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 7
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 99.49 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 96.55 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] EH
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
112 sequences

EDE1_YEAST  (P34216), EHD1_BOVIN  (Q5E9R3), EHD1_HUMAN  (Q9H4M9), 
EHD1_MOUSE  (Q9WVK4), EHD1_PONAB  (Q5RBP4), EHD1_RAT    (Q641Z6), 
EHD2_HUMAN  (Q9NZN4), EHD2_MOUSE  (Q8BH64), EHD2_RAT    (Q4V8H8), 
EHD3_HUMAN  (Q9NZN3), EHD3_MOUSE  (Q9QXY6), EHD3_RAT    (Q8R491), 
EHD4_HUMAN  (Q9H223), EHD4_MOUSE  (Q9EQP2), END3_AJECN  (A6RFP4), 
END3_ASHGO  (Q755V2), END3_ASPCL  (A1CPG1), END3_ASPFC  (B0XR88), 
END3_ASPFU  (Q4WSE8), END3_ASPNC  (A2QRG2), END3_ASPOR  (Q2UCH0), 
END3_ASPTN  (Q0D0N9), END3_BOTFB  (A6SIJ6), END3_CANAL  (Q5AJ82), 
END3_CANGA  (Q6FP98), END3_CHAGB  (Q2H2V8), END3_COCIM  (Q1DUU2), 
END3_DEBHA  (Q6BY77), END3_EMENI  (Q5BEK7), END3_KLULA  (Q6CTM9), 
END3_LODEL  (A5DXI9), END3_MAGO7  (P0CT09), END3_MAGOY  (L7IIY8), 
END3_NEOFI  (A1D2B8), END3_NEUCR  (Q7S9V9), END3_PICGU  (A5DF78), 
END3_PICST  (A3M008), END3_PODAN  (B2AS96), END3_SCHPO  (Q9USZ7), 
END3_SCLS1  (A7E7N7), END3_VANPO  (A7TEE6), END3_YARLI  (Q6C370), 
END3_YEAS7  (A6ZRZ6), END3_YEAST  (P39013), EP15R_HUMAN (Q9UBC2), 
EP15R_MOUSE (Q60902), EPS15_DICDI (Q54KI4), EPS15_HUMAN (P42566), 
EPS15_MOUSE (P42567), IRS4_ASHGO  (Q754G7), IRS4_ASPCL  (A1CBF3), 
IRS4_ASPFU  (Q4WVH0), IRS4_ASPNC  (A2RA84), IRS4_CANAL  (Q59SR6), 
IRS4_CANGA  (Q6FJW0), IRS4_CHAGB  (Q2H9M1), IRS4_COCIM  (Q1DKE6), 
IRS4_DEBHA  (Q6BRH9), IRS4_EMENI  (Q5BH85), IRS4_LODEL  (A5DZL0), 
IRS4_MAGO7  (A4QST9), IRS4_NEOFI  (A1DDY6), IRS4_NEUCR  (Q7SB65), 
IRS4_PICGU  (A5DBE7), IRS4_PICST  (A3LPY4), IRS4_SCHPO  (O14066), 
IRS4_YARLI  (Q6C449), ITSN1_HUMAN (Q15811), ITSN1_MOUSE (Q9Z0R4), 
ITSN1_RAT   (Q9WVE9), ITSN1_XENLA (O42287), ITSN2_HUMAN (Q9NZM3), 
ITSN2_MOUSE (Q9Z0R6), PAN1_AJECN  (A6R7X5), PAN1_ASHGO  (Q75AA0), 
PAN1_ASPCL  (A1CD74), PAN1_ASPFC  (B0YC95), PAN1_ASPFU  (Q4WG58), 
PAN1_ASPNC  (A2R180), PAN1_ASPOR  (Q2UDY8), PAN1_ASPTN  (Q0CPW4), 
PAN1_BOTFB  (A6S9N4), PAN1_CANAL  (Q5AHB1), PAN1_CANGA  (Q6FPQ7), 
PAN1_CHAGB  (Q2H922), PAN1_COCIM  (Q1DQC1), PAN1_DEBHA  (Q6BNL1), 
PAN1_EMENI  (Q5B5B0), PAN1_KLULA  (Q6CQX9), PAN1_LODEL  (A5DVD6), 
PAN1_MAGO7  (A4R8N4), PAN1_NEOFI  (A1DC51), PAN1_NEUCR  (Q7SAT8), 
PAN1_PICGU  (A5DP36), PAN1_PICST  (A3LN86), PAN1_PODAN  (B2AWS3), 
PAN1_SCHPO  (Q10172), PAN1_SCLS1  (A7EKZ0), PAN1_VANPO  (A7TSV7), 
PAN1_YARLI  (Q6C908), PAN1_YEAS7  (A6ZVS5), PAN1_YEAST  (P32521), 
REPS1_HUMAN (Q96D71), REPS1_MOUSE (O54916), REPS2_HUMAN (Q8NFH8), 
REPS2_MOUSE (Q80XA6), SYNRG_HUMAN (Q9UMZ2), SYNRG_MOUSE (Q5SV85), 
SYNRG_RAT   (Q9JKC9), UCP8_SCHPO  (O94685), YHLA_SCHPO  (Q9HGL2), 
YNJ6_CAEEL  (P34550)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
7 sequences

IRS4_BOTFB  (A6S9V4), IRS4_KLULA  (Q6CSC2), IRS4_SCLS1  (A7EDF3), 
IRS4_YEAS7  (A6ZZY3), IRS4_YEAST  (P36115), TAX4_YEAS7  (A6ZPP1), 
TAX4_YEAST  (P47030)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

SNTAN_BOVIN (Q0P561)

		
PDB
[Detailed view]
18 PDB

1C07; 1EH2; 1F8H; 1FF1; 1FI6; 1IQ3; 1QJT; 2JQ6; 2JXC; 2KFF; 2KFG; 2KFH; 2KGR; 2KHN; 2KSP; 2QPT; 3FIA; 4CID
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission