ID   PLD; MATRIX.
AC   PS50035;
DT   01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   Phospholipase D phosphodiesterase active site profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-1.4560000; R2=0.0316000; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=975.8386230; R2=0.5719298; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=316; H_SCORE=1157; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=252; H_SCORE=1120; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MM=1; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-8,-23,-8,-10,-4,-9,-9,-10,-9,-8,-6,-7,-17,-10,-9,-5,-3,-8,-16,2,-11;
MA   /M: M=-8,0,-24,-1,-5,-9,-9,-7,-14,-6,-9,-6,0,-16,-6,-4,-5,-5,-13,-22,-7,-6;
MA   /M: M=-8,-10,-28,-11,-12,-9,-2,-10,-16,-6,-13,-9,-6,-16,-10,-2,-9,-11,-14,-6,-2,-12;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-19,-21,-22,-15,-3,-22,-17,3,-7,1,1,-15,-20,-12,-3,-9,-2,6,-14,-2,-15;
MA   /M: SY='H'; M=-12,-1,-23,-8,-7,-7,-19,9,-1,-11,1,6,5,-22,-2,-8,-10,-8,-8,-24,1,-6;
MA   /M: SY='H'; M=-19,5,-29,3,0,-20,-17,89,-29,-9,-21,-3,16,-20,9,0,-7,-17,-30,-31,15,0;
MA   /M: SY='S'; M=0,2,-19,-1,1,-18,-12,-3,-17,-4,-15,-10,3,-12,2,-2,6,5,-13,-28,-12,1;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,10,-30,-20,-10,-30,49,-30,-10,0,-10,10,32,-10,-10,-20,-20,-10,10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-23,-21,-28,-22,10,-20,-18,13,-23,15,9,-18,-24,-20,-19,-14,-4,9,-15,4,-22;
MA   /M: SY='M'; M=-7,-26,-20,-31,-24,15,-27,-15,17,-21,18,19,-24,-26,-19,-18,-19,-8,14,-8,9,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-28,-21,-32,-27,-1,-29,-27,30,-24,15,13,-23,-24,-22,-23,-15,-5,29,-19,-5,-26;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-25,-17,-29,-24,7,-29,-25,23,-22,9,8,-20,-23,-23,-21,-8,1,27,-22,-3,-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,45,-29,64,23,-39,-11,0,-39,1,-29,-29,18,-9,2,-9,1,-9,-29,-39,-20,13;
MA   /M: SY='D'; M=-10,23,-27,28,8,-31,3,-1,-31,-1,-27,-21,17,-14,2,-4,3,-8,-27,-33,-19,4;
MA   /M: SY='E'; M=-3,0,-23,1,11,-20,-16,-6,-20,8,-17,-11,-1,-11,3,5,0,-1,-14,-25,-12,6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-14,-19,-18,-13,4,-22,-4,5,-13,3,2,-12,-19,-9,-11,-8,0,3,-7,11,-13; D=-4;
MA   /I: DM=-21;
MA   /M: SY='A'; M=15,-16,-12,-21,-17,-8,-12,-21,3,-16,-2,-2,-13,-18,-16,-18,4,4,12,-25,-12,-17;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-21,-23,-25,-19,21,-29,6,4,-20,7,4,-16,-26,-16,-15,-17,-10,-2,-2,27,-19;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-20,-31,-26,2,-32,-25,31,-24,18,13,-23,-25,-22,-22,-15,-3,29,-22,-1,-26;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-24,-10,-16,-25,46,-18,-31,-17,-26,-16,0,-17,-15,-17,7,-6,-22,-24,-25,-16;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-17,-6,-9,-21,17,-15,-24,-12,-26,-17,5,-12,-9,-12,20,10,-14,-31,-21,-9;
MA   /M: SY='A'; M=16,-12,-12,-19,-13,-7,-11,-13,-5,-13,-5,-4,-8,-17,-12,-15,2,-1,0,-22,-10,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-11,40,-22,29,4,-24,-2,7,-24,0,-30,-22,50,-18,0,-2,9,-1,-29,-40,-20,2;
MA   /M: SY='L'; M=-12,-30,-26,-34,-25,17,-27,-19,14,-25,21,13,-26,-27,-21,-20,-26,-13,5,12,12,-22;
MA   /M: SY='B'; M=-6,14,-9,14,-2,-20,-6,-8,-22,-9,-20,-16,10,-17,-7,-12,4,-1,-17,-31,-15,-5;
MA   /M: SY='D'; M=-10,-1,-29,2,-1,-16,-3,-9,-23,-5,-20,-13,-3,-2,-6,-10,-6,-9,-22,-13,-10,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-3,-1,-23,-1,1,-22,-3,-10,-23,5,-20,-14,1,-13,-2,10,2,-1,-15,-26,-17,-2;
MA   /M: SY='H'; M=-5,-4,-22,-6,-7,-8,-12,13,-17,-5,-16,-10,2,-19,-2,1,3,-1,-15,-15,10,-7;
MA   /I: E1=0;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=415(230); /POSITIVE=413(228); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=2(2);
NR   /FALSE_NEG=10; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /TAXO-RANGE=??EPV; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=PLD phosphodiesterase;
CC   /VERSION=5;
DR   Q81V75    , CLS1_BACAN , T; Q81I00    , CLS1_BACCR , T;
DR   P45860    , CLS1_BACSU , T; Q5HGA3    , CLS1_STAAC , T;
DR   Q6GH88    , CLS1_STAAR , T; Q5HPM5    , CLS1_STAEQ , T;
DR   Q8CPD8    , CLS1_STAES , T; Q81TR2    , CLS2_BACAN , T;
DR   Q81GK4    , CLS2_BACCR , T; Q5HEB2    , CLS2_STAAC , T;
DR   Q6GEY7    , CLS2_STAAR , T; Q5HMD3    , CLS2_STAEQ , T;
DR   Q8CNK3    , CLS2_STAES , T; P71040    , CLSA_BACSU , T;
DR   B8D966    , CLSA_BUCA5 , T; P57361    , CLSA_BUCAI , T;
DR   Q8K9P9    , CLSA_BUCAP , T; B8D7H0    , CLSA_BUCAT , T;
DR   Q89AL5    , CLSA_BUCBP , T; A8AG50    , CLSA_CITK8 , T;
DR   A7MNA4    , CLSA_CROS8 , T; A7ZL20    , CLSA_ECO24 , T;
DR   B7UQD9    , CLSA_ECO27 , T; B7ML01    , CLSA_ECO45 , T;
DR   B7LHJ4    , CLSA_ECO55 , T; Q8XCC6    , CLSA_ECO57 , T;
DR   B5YYF4    , CLSA_ECO5E , T; B7NVL8    , CLSA_ECO7I , T;
DR   B7MU36    , CLSA_ECO81 , T; B7LY04    , CLSA_ECO8A , T;
DR   C4ZTU1    , CLSA_ECOBW , T; B1XAT9    , CLSA_ECODH , T;
DR   A7ZZI5    , CLSA_ECOHS , T; A1AAH3    , CLSA_ECOK1 , T;
DR   Q0TIC2    , CLSA_ECOL5 , T; P0A6H9    , CLSA_ECOL6 , T;
DR   B1ITK7    , CLSA_ECOLC , T; P0A6H8    , CLSA_ECOLI , T;
DR   B7N460    , CLSA_ECOLU , T; B6I9W2    , CLSA_ECOSE , T;
DR   B1LH51    , CLSA_ECOSM , T; Q1RCI7    , CLSA_ECOUT , T;
DR   C5BDA3    , CLSA_EDWI9 , T; A4WB84    , CLSA_ENT38 , T;
DR   B2VKV4    , CLSA_ERWT9 , T; B7LS29    , CLSA_ESCF3 , T;
DR   B5XQA9    , CLSA_KLEP3 , T; A6TAJ7    , CLSA_KLEP7 , T;
DR   Q6D4S2    , CLSA_PECAS , T; C6DGY3    , CLSA_PECCP , T;
DR   B4EWI7    , CLSA_PROMH , T; B7V5T6    , CLSA_PSEA8 , T;
DR   Q02DW8    , CLSA_PSEAB , T; Q9HTH0    , CLSA_PSEAE , T;
DR   Q1I2L0    , CLSA_PSEE4 , T; Q4K3D9    , CLSA_PSEF5 , T;
DR   C3K1C4    , CLSA_PSEFS , T; A5WB80    , CLSA_PSEP1 , T;
DR   B0KR91    , CLSA_PSEPG , T; Q88C19    , CLSA_PSEPK , T;
DR   P31048    , CLSA_PSEPU , T; B1JFN5    , CLSA_PSEPW , T;
DR   Q87TY7    , CLSA_PSESM , T; Q4ZL66    , CLSA_PSEU2 , T;
DR   B5F4L0    , CLSA_SALA4 , T; A9MPD5    , CLSA_SALAR , T;
DR   Q57NS0    , CLSA_SALCH , T; B5FU52    , CLSA_SALDC , T;
DR   B5R3N1    , CLSA_SALEP , T; B5R6L2    , CLSA_SALG2 , T;
DR   B4TJM2    , CLSA_SALHS , T; B4SUC9    , CLSA_SALNS , T;
DR   Q5PCS9    , CLSA_SALPA , T; A9MWP9    , CLSA_SALPB , T;
DR   C0Q393    , CLSA_SALPC , T; B5BIA8    , CLSA_SALPK , T;
DR   B4TX53    , CLSA_SALSV , T; P63799    , CLSA_SALTI , T;
DR   P63798    , CLSA_SALTY , T; A8GFA0    , CLSA_SERP5 , T;
DR   B2TZZ4    , CLSA_SHIB3 , T; Q31ZU1    , CLSA_SHIBS , T;
DR   Q32GV1    , CLSA_SHIDS , T; Q83RM8    , CLSA_SHIFL , T;
DR   Q3Z0W3    , CLSA_SHISS , T; Q2NT72    , CLSA_SODGM , T;
DR   Q8D2I8    , CLSA_WIGBR , T; A1JQ40    , CLSA_YERE8 , T;
DR   A7FI50    , CLSA_YERP3 , T; Q1C7R0    , CLSA_YERPA , T;
DR   B2K3U5    , CLSA_YERPB , T; Q8ZEI2    , CLSA_YERPE , T;
DR   A9R8K8    , CLSA_YERPG , T; Q1CJ46    , CLSA_YERPN , T;
DR   A4TJ85    , CLSA_YERPP , T; Q66AL9    , CLSA_YERPS , T;
DR   B1JKT9    , CLSA_YERPY , T; P45865    , CLSB_BACSU , T;
DR   P0AA85    , CLSB_ECO57 , T; Q8FJN9    , CLSB_ECOL6 , T;
DR   P0AA84    , CLSB_ECOLI , T; Q8Z883    , CLSB_SALTI , T;
DR   Q8ZQP4    , CLSB_SALTY , T; P59715    , CLSB_SHIFL , T;
DR   P75919    , CLSC_ECOLI , T; O66043    , CLS_ALKPO  , T;
DR   Q0TQG9    , CLS_CLOP1  , T; P0C2E2    , CLS_CLOPE  , T;
DR   Q0ST20    , CLS_CLOPS  , T; Q5L1S5    , CLS_GEOKA  , T;
DR   C5D794    , CLS_GEOSW  , T; A4IL76    , CLS_GEOTN  , T;
DR   Q9K8Z4    , CLS_HALH5  , T; Q927Z0    , CLS_LISIN  , T;
DR   C1KYS0    , CLS_LISMC  , T; Q71WS5    , CLS_LISMF  , T;
DR   B8DBK8    , CLS_LISMH  , T; Q8Y4E3    , CLS_LISMO  , T;
DR   A0ALI7    , CLS_LISW6  , T; Q8EM16    , CLS_OCEIH  , T;
DR   P63800    , CLS_STAAM  , T; P63801    , CLS_STAAN  , T;
DR   Q6G7M2    , CLS_STAAS  , T; P63802    , CLS_STAAW  , T;
DR   P0DW07    , DRMC_BACP9 , T; P36316    , F13_FOWPN  , T;
DR   P26579    , F13_MCV1   , T; P25392    , F13_MCV2   , T;
DR   A0A7H0DN15, PG042_MONPV, T; P20537    , PG042_VACCC, T;
DR   P18377    , PG042_VACCW, T; A0A7H0DN30, PG057_MONPV, T;
DR   O57179    , PG057_VACCA, T; P20638    , PG057_VACCC, T;
DR   P26653    , PG057_VACCI, T; P29885    , PG057_VACCP, T;
DR   P04021    , PG057_VACCW, T; P33815    , PG057_VAR67, T;
DR   Q2KJ28    , PGPS1_BOVIN, T; Q5ZHN9    , PGPS1_CHICK, T;
DR   Q9Z2Z7    , PGPS1_CRIGR, T; Q7KWX2    , PGPS1_DICDI, T;
DR   Q32NB8    , PGPS1_HUMAN, T; Q8BHF7    , PGPS1_MOUSE, T;
DR   Q5R8K7    , PGPS1_PONAB, T; P79001    , PGPS1_SACPS, T;
DR   P25578    , PGPS1_YEAST, T; O08684    , PLD1_CRIGR , T;
DR   Q13393    , PLD1_HUMAN , T; Q9Z280    , PLD1_MOUSE , T;
DR   P70496    , PLD1_RAT   , T; Q09706    , PLD1_SCHPO , T;
DR   Q0V8L6    , PLD2_BOVIN , T; O14939    , PLD2_HUMAN , T;
DR   P97813    , PLD2_MOUSE , T; P70498    , PLD2_RAT   , T;
DR   Q2KJJ8    , PLD3_BOVIN , T; Q8IV08    , PLD3_HUMAN , T;
DR   Q4R583    , PLD3_MACFA , T; O35405    , PLD3_MOUSE , T;
DR   Q5R4Y7    , PLD3_PONAB , T; Q5FVH2    , PLD3_RAT   , T;
DR   Q6PB03    , PLD3_XENLA , T; Q640B3    , PLD3_XENTR , T;
DR   Q96BZ4    , PLD4_HUMAN , T; Q8BG07    , PLD4_MOUSE , T;
DR   Q3UNN8    , PLD5_MOUSE , T; E1BE10    , PLD6_BOVIN , T;
DR   E2RD63    , PLD6_CANLF , T; A8IW99    , PLD6_CHLRE , T;
DR   Q8N2A8    , PLD6_HUMAN , T; Q5SWZ9    , PLD6_MOUSE , T;
DR   A1L1C2    , PLD6_XENLA , T; Q28DT3    , PLD6_XENTR , T;
DR   Q38882    , PLDA1_ARATH, T; O82549    , PLDA1_BRAOC, T;
DR   P86387    , PLDA1_CARPA, T; Q70EW5    , PLDA1_CYNCA, T;
DR   Q43270    , PLDA1_MAIZE, T; Q43007    , PLDA1_ORYSJ, T;
DR   Q41142    , PLDA1_RICCO, T; O04883    , PLDA1_SPUBR, T;
DR   P93400    , PLDA1_TOBAC, T; O04865    , PLDA1_VIGUN, T;
DR   Q9SSQ9    , PLDA2_ARATH, T; P55939    , PLDA2_BRAOC, T;
DR   P93844    , PLDA2_ORYSJ, T; P58766    , PLDA3_ARATH, T;
DR   Q9C888    , PLDA4_ARATH, T; Q54UK0    , PLDA_DICDI , T;
DR   P93733    , PLDB1_ARATH, T; O23078    , PLDB2_ARATH, T;
DR   Q54WR4    , PLDB_DICDI , T; Q54Z25    , PLDC_DICDI , T;
DR   Q9C5Y0    , PLDD1_ARATH, T; Q9T053    , PLDG1_ARATH, T;
DR   Q9T051    , PLDG2_ARATH, T; Q9T052    , PLDG3_ARATH, T;
DR   O17405    , PLDL_CAEEL , T; Q54K50    , PLDY_DICDI , T;
DR   Q9LRZ5    , PLDZ1_ARATH, T; Q9M9W8    , PLDZ2_ARATH, T;
DR   Q54SA1    , PLDZ_DICDI , T; Q5BMR2    , PLD_PHYIN  , T;
DR   Q1RK58    , PLD_RICBR  , T; Q92G53    , PLD_RICCN  , T;
DR   Q4UJZ1    , PLD_RICFE  , T; Q9ZCD8    , PLD_RICPR  , T;
DR   Q68VT0    , PLD_RICTY  , T; Q53728    , PLD_STRAT  , T;
DR   P0A7B2    , PPK1_ECO57 , T; Q8FF70    , PPK1_ECOL6 , T;
DR   P0A7B1    , PPK1_ECOLI , T; Q07411    , PPK1_KLEPN , T;
DR   Q8Z4R0    , PPK1_SALTI , T; O86090    , PPK1_SALTY , T;
DR   Q9KU07    , PPK1_VIBCH , T; Q87S51    , PPK1_VIBPA , T;
DR   Q8DEW2    , PPK1_VIBVU , T; Q7MNJ0    , PPK1_VIBVY , T;
DR   Q8ZCX2    , PPK1_YERPE , T; P23830    , PSS_ECOLI  , T;
DR   P44704    , PSS_HAEIN  , T; P36126    , SPO14_YEAST, T;
DR   Q9ZMP2    , Y190_HELPJ , T; P56117    , Y190_HELPY , T;
DR   P34001    , Y988_STRMU , T; P39369    , YJHR_ECOLI , T;
DR   Q9HDW1    , PGPS1_SCHPO, N; Q8N7P1    , PLD5_HUMAN , N;
DR   A3KNW0    , PLD6_DANRE , N; Q88CG4    , PPK1_PSEPK , N;
DR   Q87UP6    , PPK1_PSESM , N; Q5HLE0    , PPK1_STAEQ , N;
DR   Q8CR71    , PPK1_STAES , N; Q4L8X9    , PPK1_STAHJ , N;
DR   Q4A040    , PPK1_STAS1 , N; Q9VKD7    , ZUC_DROME  , N;
DR   Q39610    , DYHA_CHLRE , F; Q9TXV7    , TYDP1_CAEEL, F;
3D   1XDO; 1XDP; 2ZE4; 2ZE9; 3HSI; 4GGJ; 4GGK; 6KZ8; 6KZ9; 6OHM; 6OHO; 6OHP;
3D   6OHQ; 6OHS; 6U8Z; 7JRB; 7JRC; 7JRU; 7JRV; 7JRW; 7JS5; 7JS7; 7SVP; 8Q1K;
3D   8Q1X;
PR   PRU00153;
DO   PDOC50035;
//