Entry: PS50042

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CNMP_BINDING_3
Accession [info] PS50042
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00691
Associated ProRule [info] PRU00060

Name and characterization of the entry

Description [info] cAMP/cGMP binding motif profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7862; R2=0.0194; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4375.64198; R2=26.27160; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=1; SCORE=398; N_SCORE=8.5; H_SCORE=14832; MODE=1; TEXT='!!';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=320; N_SCORE=7.0; H_SCORE=14832; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=268; N_SCORE=6.0; H_SCORE=11443; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-21,-32,-23, 16,-30,-22, 21,-28, 30, 15,-23,-26,-22,-21,-21, -6, 13,-17,  3,-23;
/M: SY='F'; M=-15,-28,-20,-34,-23, 47,-29,-19,  7,-28, 25,  9,-23,-29,-29,-19,-23,-10,  3, -4, 16,-23;
/M: SY='K'; M= -2,  0,-24, -2,  9,-25,-15, -3,-22, 16,-22, -9,  2,-11, 12, 12,  2, -3,-17,-25,-13, 10;
/M: SY='N'; M= -6, 11,-22,  8, -1,-23,  1,  8,-26, -3,-26,-17, 18,-13, -1,  0, 10,  0,-22,-33,-15, -2;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-10,-29,-20,  4,-29,-21, 16,-27, 36, 15,-27,-29,-19,-20,-24, -8, 11,-23, -4,-20;
/M: SY='D'; M= -9, 18,-25, 28, 19,-29,-13, -6,-28, -1,-24,-22,  6,  0,  2, -7,  6,  0,-23,-35,-19, 10;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-27,  1, 13,-24,-17, -8,-20,  5,-19,-12, -4,  7,  5,  2, -2, -5,-19,-27,-17,  7;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-26,  7,  8,-19,-10, -4,-21, -3,-21,-15,  3,-11,  4, -7,  3, -4,-21,-12, -6,  6;
/M: SY='E'; M= -9, -5,-25, -4, 15,-16,-22, -4,-11, -2, -6, -2, -7,-12, 13, -3, -5, -4,-13,-24, -9, 14;
/M: SY='L'; M=-13,-21,-25,-22,-13, -3,-27,-11,  2, -4, 14,  8,-17,-24, -7, 13,-19, -9,  1,-18, -1,-12;
/M:         M= -5, -5,-21, -6, -3, -8,-17, -8,-10, -5, -7, -4, -4,-17, -2, -2, -1, -2, -7,-24, -8, -3;
/M: SY='E'; M=-10,  7,-28, 10, 15,-27,-17, -6,-25, 14,-22,-14,  2,-11, 12,  5, -2, -5,-22,-17,-11, 14;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-20,-33,-26,  6,-32,-24, 30,-26, 29, 19,-26,-27,-22,-22,-21, -7, 25,-22, -2,-25;
/M: SY='V'; M=  7,-22,-15,-25,-20,  2,-21,-22, 12,-20, 12,  5,-20,-23,-20,-20, -8, -3, 17,-22, -6,-20;
/M: SY='D'; M=-12, 29,-25, 37, 11,-29,-12, -1,-28,  0,-21,-20, 15,-13, -1, -7,  1, -5,-22,-35,-16,  5;
/M: SY='A'; M= 14, -6, -3, -9, -8,-18,-13,-14,-12, -8,-13,-10, -7,-17,-11,-13,  3, -2, -1,-28,-16,-10;
/M: SY='L'; M= -6,-24,-15,-29,-20,  2,-25,-15, 18,-21, 28, 28,-23,-24,-13,-18,-20, -7, 11,-22, -3,-17;
/M: SY='E'; M=-13, -1,-27,  2, 11, -8,-17, -2,-19,  0,-13,-10, -4,-14,  1, -1, -7, -9,-17,-17,  0,  6;
/M: SY='E'; M= -4, -9,-25, -6,  7,-18,-16,-14,-15, -7,-10,-11,-10,  5, -4, -9, -3, -1,-14,-20,-15,  1;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-15,-10,  0,-17,-23, -8,-10,  5,-12, -5, -9,-18, -2,  6, -5, -3,  1,-28,-11, -2;
/M: SY='H'; M= -7, -5,-22, -7, -3,-11,-19,  2, -9, -3,-11, -5, -1,-17, -2, -3, -1,  0, -6,-23,  0, -3;
/M: SY='Y'; M=-16,-23,-25,-26,-22, 31,-30,  3,  5,-17,  6,  3,-20,-29,-19,-13,-18, -8,  1, 10, 46,-22;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; MD=-20; DM=-20;
/M: SY='E'; M= -5,  0,-28,  4, 10,-27,-15, -7,-20,  1,-21,-14, -2, 10,  5, -3,  0, -5,-20,-29,-17,  6;
/M: SY='P'; M=  7,  2,-24,  4,  4,-26,-11,-12,-21, -1,-21,-16, -2, 10, -3, -8,  3, -2,-16,-28,-20, -1;
/M: SY='G'; M= -3, -3,-29, -3,-12,-30, 45,-13,-37, -7,-30,-18,  4,-18,-12, -9, -1,-16,-28,-22,-24,-12;
/M: SY='E'; M= -7, 15,-25, 23, 30,-28,-14, -1,-27,  2,-22,-20,  6, -7,  8, -4,  6, -3,-22,-33,-18, 19;
/M: SY='Y'; M= -6, -6,-16,-10,-11, -4,-21,  1, -8, -9, -8, -5, -6,-19, -8, -9, -2,  7, -4,-17,  9,-11;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-18,-35,-29,  1,-35,-29, 37,-26, 20, 15,-25,-26,-24,-25,-18, -6, 34,-24, -4,-29;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-15,-37,-30,  8,-36,-28, 34,-28, 15, 13,-22,-25,-24,-27,-18, -8, 26,-19,  1,-30;
/M: SY='R'; M=-11, -4,-26, -3,  3,-20,-19,  7,-20, 12,-13, -5, -2,-17,  6, 20, -7, -8,-15,-23, -6,  3;
/M: SY='Q'; M= -5,  0,-28,  0, 21,-36,-18,  5,-21, 11,-20, -4, -1, -9, 45,  9,  0, -9,-27,-21,-12, 33;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-29, -6,-17,-29, 61,-17,-38,-17,-30,-20,  5,-20,-17,-17,  1,-18,-30,-22,-29,-17;
/M: SY='D'; M= -5, 25,-26, 36, 27,-33,-11, -3,-31,  1,-23,-23,  9, -7,  6, -8,  3, -7,-25,-33,-20, 16;
/M:         M= -3, -8,-26, -7, -1,-20,-14,-14, -9, -4,-13, -7, -9, -2, -4, -5, -5, -8, -8,-22,-15, -4;
/M: SY='G'; M=  9,-12,-24,-14,-17,-25, 41,-20,-28,-18,-21,-15, -5,-11,-17,-20,  0,-14,-20,-21,-26,-18;
/M: SY='D'; M=-11, 26,-24, 32, 13,-29,-12, -1,-29,  1,-24,-21, 14,-11,  2, -1,  5,  1,-22,-35,-16,  7;
/M: SY='B'; M= -4, 10,-22,  8,  5,-18, -8,  0,-20, -5,-18,-14, 10,-14, -1, -7,  6,  3,-17,-27, -8,  1;
/M: SY='F'; M=-14,-28,-18,-35,-25, 43,-29,-20,  9,-26, 17,  9,-23,-28,-29,-19,-20, -9,  8, -3, 14,-25;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-27,-25,-21, 43,-30,  9, -1,-15,  2,  0,-20,-29,-18,-13,-20,-10, -8, 23, 64,-22;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-35,-28, 12,-34,-24, 32,-25, 15, 12,-23,-25,-24,-24,-17, -7, 28,-15,  7,-28;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-23,-34,-26,  0,-34,-27, 37,-26, 19, 17,-23,-23,-21,-24,-17, -7, 30,-23, -3,-26;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-21, -2,  6,-16,-20,-13, -5, -6, -3, -5, -9,-15, -4,-10, -4, -4, -2,-28,-13,  1;
/M: SY='E'; M= -4,  4,-23,  5, 12,-23,-13, -5,-24, 11,-23,-14,  5,-11,  8,  9,  5, -2,-18,-27,-14,  9;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M= -3, -2,-16, -3,  7,-19,-16,-10,-21,  5,-18,-13, -1,-13,  3,  6,  3,  2,-15,-23,-13,  5;
/M: SY='V'; M=  2,-26,-11,-29,-25,  4,-26,-24, 19,-21, 12,  8,-25,-27,-24,-20,-12, -3, 28,-22, -4,-25;
/M: SY='D'; M= -7, 13,-25, 18, 16,-27,-14, -4,-25,  8,-21,-15,  6,-11,  5,  6,  0, -6,-19,-30,-16, 10;
/M: SY='V'; M= -4,-29,-16,-31,-28,  4,-31,-27, 30,-23, 13, 11,-26,-27,-25,-21,-13, -3, 37,-25, -5,-27;
/M: SY='Y'; M= -7,-16,-18,-20,-16,  7,-23,-12,  3,-15,  7,  2,-13,-22,-14,-11, -5,  6,  3,-15,  8,-16;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-23,-12, -5,-18,-20,-10, -4,  3, -9,  0, -7,-18,  4,  9, -6, -6,  0,-24,-11, -2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='K'; M=-10,  4,-22,  3,  8,-20,-15, -5,-19,  9,-17,-10,  5,-14,  5,  7, -3, -3,-16,-24, -9,  6; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D'; M= -8,  7,-19, 10,  0,-26,  0, -8,-26,  0,-22,-16,  4,-12, -2,  0,  2, -4,-18,-28,-17, -2; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D'; M= -6,  9,-20, 12, 12,-22, -6, -4,-21,  2,-20,-14,  6, -2,  5, -3,  5, -1,-18,-25,-15,  8; D=-2;
/I:         MD=-15;
/M: SY='D'; M= -6,  6,-17,  8,  6,-16,  3, -5,-16, -3,-13,-11,  4,  0, -2, -5, -1, -5,-15,-17,-13,  1; D=-2;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-20,  5,  8,-20,  1, -2,-20,  1,-16,-10,  1, -8,  6,  0,  0, -6,-17,-18,-11,  6; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-20,  7, 16,-17, -9, -6,-16,  0,-15,-12, -1,  4,  2, -6,  0, -4,-15,-20,-13,  8; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='K'; M= -2, -6,-18, -8, -4,-15,-15, -8, -7,  4,-10,  0, -5,-14, -1,  1, -2,  0, -1,-22, -9, -3; D=-2;
/I:         DM=-15;
/M: SY='V'; M= -8,-17,-21,-18, -9, -1,-26,-13,  6,-11,  2,  1,-16,-21,-11,-13,-11, -7,  8,-15,  2,-11;
/M: SY='V'; M= -6,-27,-18,-30,-23,  4,-30,-23, 24,-22, 21, 14,-26,-27,-20,-19,-17, -6, 26,-22, -3,-22;
/M: SY='G'; M=  6, -6,-15, -9, -8,-20,  8,-15,-20, -8,-18,-13, -2,-15, -9, -7,  6,  1,-10,-27,-19, -9;
/M: SY='T'; M= -7, -7,-22,-10, -3,-12,-21, -8, -7, -1,-10, -4, -5,-13, -2,  0,  0,  7, -4,-23, -4, -4;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-14,-29,-21,  9,-28,-17, 15,-25, 28, 13,-24,-27,-18,-19,-21, -7,  9,-16,  6,-20;
/M: SY='G'; M= -1, -1,-23, -2, -8,-23, 19, -6,-26, -8,-25,-16,  6,-14, -7, -9,  7, -6,-20,-28,-19, -8;
/M: SY='K'; M= -3, -2,-26, -1,  7,-25,-11, -8,-21,  9,-20,-10, -1, -2,  5,  6, -2, -7,-18,-25,-16,  5;
/M: SY='G'; M=  1, -6,-27, -7,-14,-26, 45,-12,-34,-14,-28,-18,  3,-19,-14,-13,  3,-14,-26,-19,-23,-14;
/M: SY='D'; M=-10, 19,-27, 27, 13,-32,  0, -4,-32,  3,-27,-20, 11,-11,  5, -3,  3, -7,-26,-31,-19,  9;
/M: SY='Y'; M= -5,-16,-19,-19,-17, 11,-21, -8,  0,-15, -5, -3,-12,-22,-14,-14, -1,  3,  2, -6, 19,-17;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 71,-30,-20,  4,-30, 14,  3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,  2,  6, 26,-29;
/M: SY='G'; M=  3,-10,-29,-11,-19,-29, 65,-20,-38,-19,-29,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-19,-28,-20,-29,-19;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 19, 57,-29,-20,  0,-29, 10,-19,-18,  0, -1, 19,  0, -1,-10,-29,-30,-19, 38;
/M: SY='L'; M= -5,-23,-21,-26,-18,  0,-27,-19, 18,-20, 25, 14,-20,-22,-15,-17,-20, -8, 11,-22, -4,-18;
/M: SY='A'; M= 33,-10,-15,-16, -8,-20,  7,-18,-14,-11,-12, -9, -8,-10, -9,-18,  8, -3, -6,-22,-20, -9;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-23,  6,-31,-22, 26,-27, 36, 20,-26,-28,-20,-21,-24, -8, 19,-22, -2,-22;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-31,-21, 12,-30,-18, 21,-25, 33, 20,-25,-27,-17,-19,-24, -9, 12,-17,  4,-19;
/M: SY='Y'; M=-12, -8,-18,-10,-11,  3,-18,  3, -8,-10, -5, -4, -7,-23, -9, -9, -8, -1,-11, -6, 25,-12;
/I:         I=-7; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='N'; M= -7, 21,-26, 19,  3,-24,  9, -1,-28, -4,-26,-20, 22,-16, -4, -8,  2, -8,-27,-28,-15, -1;
/M: SY='R'; M= -7, -2, -3, -4, -3,-20,-18,-11,-22,  4,-17,-11, -1,-17,  0,  9,  2,  6,-13,-30,-14, -3;
/M: SY='P'; M= -7,-15,-30,-10, -1,-25,-20,-17,-15, -6,-22,-14,-14, 48, -5,-13, -7, -5,-19,-29,-23, -6;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-29,-10,  0,-20,-16,  0,-28, 24,-19, -9, -1,-19, 11, 56, -8, -9,-20,-19, -9,  1;
/M: SY='A'; M= 22, -7,-14,-13, -7,-17, -9,-17,-11, -8,-13,-11, -6, -4, -7,-14, 11, 11, -4,-24,-15, -8;
/M: SY='A'; M= 37,-10,-11,-19,-11,-12, -4,-19, -9,-12,-10,-10, -9,-12,-12,-18, 11,  5,  0,-21,-15,-11;
/M: SY='T'; M=  0,  3,-15, -5, -7,-13,-13,-15,-14, -9,-17,-14,  6,-11, -8,-10, 17, 28, -8,-22,-12, -7;
/M: SY='V'; M=  2,-26,-13,-30,-26, -4,-27,-28, 27,-21,  8,  9,-24,-25,-24,-22,-10, -4, 35,-27, -9,-26;
/M: SY='V'; M= -6,-13,-22,-16,-10,-11,-24,-12,  1, -1, -4,  0,-10,-19, -7,  4, -7, -1,  5,-22, -5,-11;
/M: SY='A'; M= 35,-10, -7,-18,-11,-17, -5,-20, -9,-11,-10,-10, -9,-11,-11,-18, 11,  7,  2,-24,-18,-11;
/M: SY='K'; M= -8,-11,-24,-14, -5,-13,-23,-13, -4,  5, -5, -2, -8,-16, -4,  5, -7,  1, -2,-22, -6, -6;
/I:         I=-7; MI=-23; MD=-23; IM=-23;
/M: SY='S'; M=  3, -3,-17, -6, -1,-19,  2,-14,-19, -7,-19,-14,  1,-11, -5, -7, 14, 14,-11,-28,-17, -4; D=-4;
/I:         DM=-23;
/M: SY='D'; M= -7,  8,-26, 12,  6,-20,-11, -4,-21, -4,-16,-15,  3, -3, -3, -6, -3, -5,-20,-26,-11,  0;
/M: SY='C'; M= -2,-18, 22,-22,-22,-10,-19,-24, -2,-22, -2, -4,-17,-28,-22,-20, -4,  0, 10,-34,-17,-22;
/M: SY='K'; M= -7,  3,-25,  2,  9,-24,-17, -7,-20, 18,-20, -9,  4,-12,  8, 12, -1, -3,-15,-26,-13,  8;
/M: SY='L'; M= -9,-25, 17,-29,-24,  0,-30,-25,  9,-28, 19,  6,-24,-31,-24,-23,-19, -7, 11,-29, -9,-24;
/M: SY='W'; M= -4,-29,-26,-31,-22,  4,-22,-18,  0,-21,  7,  0,-28,-27,-18,-19,-23,-15, -3, 35,  8,-19;
/M: SY='A'; M=  8, -9,-20,-12, -4,-19, -7,-15,-13,  1,-13, -8, -7,-15, -5, -1,  1, -1, -4,-24,-15, -5;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-24,-35,-25,  5,-34,-23, 34,-28, 31, 23,-24,-24,-19,-24,-24,-10, 20,-20,  0,-24;
/M: SY='D'; M=-13, 32,-26, 44, 15,-33, -6, -1,-33, -3,-27,-25, 16, -9,  0,-10,  6, -5,-26,-38,-19,  7;
/M: SY='R'; M=-16,-11,-29,-10, -2,-17,-17, -3,-24, 24,-18, -9, -3,-20,  5, 48,-10,-10,-15,-18, -5, -2;
/M: SY='E'; M= -5,  4,-24,  5,  9,-25,-17, -5,-18,  5,-17,-10,  0, -8,  8,  1,  0, -2,-14,-27,-14,  8;
/M: SY='T'; M=  2, -5, -5, -8, -7,-18,-13,-12,-17, -3,-17,-12, -2,-16, -6,  0,  9, 10, -6,-31,-15, -7;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-21,-36,-27, 64,-30,-15,  3,-27, 14,  3,-21,-30,-33,-19,-21,-10,  0,  9, 33,-27;
/M: SY='R'; M=-13,  0,-27, -2, 10,-22,-19,  0,-19, 12,-14, -5,  5,-15, 15, 23, -5, -6,-19,-25,-12, 11;
/M: SY='R'; M=-12, -2,-26, -4,  6,-24,-18,  2,-23, 14,-19, -9,  4,-15, 18, 32,  0, -2,-20,-24,-11, 10;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-23,-34,-25,  4,-33,-26, 32,-28, 27, 16,-23,-24,-21,-25,-20, -7, 22,-20, -1,-25;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-32,-23,  5,-30,-19, 26,-25, 34, 27,-26,-26,-17,-20,-24, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='G'; M= -7,-14,-24,-18,-16,-11, 11, -6,-11,-13, -6, 11, -9,-20, -6,-10, -8,-12,-10,-20,-11,-11;
/M: SY='P'; M= -5, -5,-24, -3, -1,-26, -4,-13,-24,  2,-24,-16, -3, 11, -5,  1, -4, -8,-20,-27,-21, -5;
/M: SY='T'; M= -4,  0,  3, -7,-10,-12,-16, -7,-12,-14,-10,-10,  5,-20,-10,-13,  5,  8, -8,-33,-13,-10;
/M: SY='A'; M=  3, -1,-18, -4, -8,-21, -1,-13,-15,-10,-17, -9, -1, -3, -9,-13,  3,  0,-11,-29,-19, -9;
/M: SY='D'; M= -8,  7,-26, 13, 12,-19,-19, -7,-14, -7, -6, -9, -2,-13,  3,-10, -5, -7,-14,-27,-10,  7;
/M: SY='I'; M= -9,-18,-27,-22,-15,-10,-29,-18, 14, -6,  6,  8,-13,-19, -8, -3,-15, -9,  9,-21, -5,-14;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-26,-13, -4,-15,-18, -4,-12, 12, -3,  6, -8,-18,  3, 16,-13,-10,-10,-21, -6, -1;
/M: SY='R'; M=-15, -3,-29, -4,  4,-23,-20,  8,-22, 20,-18, -2,  1,-16, 13, 31, -9,-11,-19,-23, -7,  6;
/M: SY='R'; M= -7, -9,-25,-10,  2,-16,-19, -8,-20, 19,-14, -6, -5,-16,  2, 29, -8, -7,-12,-20, -9,  0;
/M: SY='M'; M= -9,  2,-23, -4, -1,-10,-17, -3, -1, -8,  1,  8,  5,-18, -2, -9, -9, -7, -9,-26, -7, -2;
/M: SY='Y'; M=-13,-15,-25,-17,-17, 12,-26,  0,  6,-14,  2,  4,-14,-23,-11,-14,-11, -3,  0,  0, 34,-17;
/M: SY='E'; M=  0,  5,-23,  8, 20,-26,-11, -5,-22,  1,-20,-14,  3, -6, 10, -3,  8, -2,-18,-30,-18, 14;
/M: SY='D'; M= -9, 17,-25, 19, 17,-27,-14,  5,-25,  1,-21,-15, 13,-11, 11, -2,  4, -2,-23,-32,-14, 14;
/M: SY='F'; M=-15,-24,-23,-29,-21, 38,-24, -8,  1,-20, 11,  6,-19,-27,-22,-14,-19,-10, -2,  4, 28,-21;
/M: SY='L'; M= -2,-12,-20,-15, -5, -3,-21,-11,  3,-17, 14,  3,-10,-20,-10,-15,-12, -7, -1,-24, -7, -8;
/M: SY='R'; M= -7, -3,-25, -2, 12,-23,-16, -3,-21, 15,-19, -5, -1,-12, 12, 19,  2, -4,-17,-26,-13, 11;
/M: SY='R'; M= -8, -3,-24, -2,  7,-14,-16, -5,-23, 11,-21,-12,  1,-13,  7, 14,  4, -2,-17,-22, -6,  6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 444 in 317 different sequences
Number of true positive hits 436 in 309 different sequences
Number of 'unknown' hits 1
Number of false positive hits 7 in 7 different sequences
Number of false negative sequences 21
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 98.42 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 95.40 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] NP_BIND
Feature description [info] cNMP
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
309 sequences

AADR_RHOPA  (Q01980), AKT1_ARATH  (Q38998), AKT1_ORYSI  (P0C550), 
AKT1_ORYSJ  (Q0JKV1), AKT2_ARATH  (Q38898), AKT2_ORYSJ  (Q75HP9), 
AKT3_ORYSJ  (Q8H569), AKT5_ARATH  (Q9SCX5), AKT6_ARATH  (Q8GXE6), 
ANR_PSEAE   (P23926), ANR_PSEFL   (O85222), CLP_XANAC   (Q8PQ45), 
CLP_XANC5   (Q3BYB3), CLP_XANC8   (Q4UZF6), CLP_XANCB   (B0RN01), 
CLP_XANCP   (P22260), CLP_XANOM   (Q2NYD9), CLP_XANOP   (B2SL05), 
CLP_XANOR   (Q5GV61), CMR_MYCTO   (P9WMH4), CMR_MYCTU   (P9WMH5), 
CNBD1_HUMAN (Q8NA66), CNBD2_HUMAN (Q96M20), CNBD2_MACFA (Q95JR6), 
CNBD2_MOUSE (Q9D5U8), CNG10_ARATH (Q9LNJ0), CNG11_ARATH (Q9SKD6), 
CNG12_ARATH (Q8GWD2), CNG13_ARATH (Q9LD40), CNG14_ARATH (Q9SJA4), 
CNG15_ARATH (Q9SL29), CNG16_ARATH (Q9SU64), CNG17_ARATH (Q8L7Z0), 
CNG18_ARATH (Q9LEQ3), CNG19_ARATH (Q9LDR2), CNG1_CHICK  (Q90805), 
CNG20_ARATH (Q9LD37), CNG3_CHICK  (Q90980), CNGA1_BOVIN (Q00194), 
CNGA1_CANFA (Q28279), CNGA1_HUMAN (P29973), CNGA1_MOUSE (P29974), 
CNGA1_RAT   (Q62927), CNGA2_BOVIN (Q03041), CNGA2_HUMAN (Q16280), 
CNGA2_MOUSE (Q62398), CNGA2_RABIT (Q28718), CNGA2_RAT   (Q00195), 
CNGA3_BOVIN (Q29441), CNGA3_HUMAN (Q16281), CNGA3_MOUSE (Q9JJZ8), 
CNGA4_HUMAN (Q8IV77), CNGA4_MOUSE (Q3UW12), CNGA4_RAT   (Q64359), 
CNGA_DROME  (Q24278), CNGB1_BOVIN (Q28181), CNGB1_HUMAN (Q14028), 
CNGB3_CANFA (Q8MJD7), CNGB3_HUMAN (Q9NQW8), CNGB3_MOUSE (Q9JJZ9), 
CNGC1_ARATH (O65717), CNGC2_ARATH (O65718), CNGC3_ARATH (Q9SKD7), 
CNGC4_ARATH (Q94AS9), CNGC5_ARATH (Q8RWS9), CNGC6_ARATH (O82226), 
CNGC7_ARATH (Q9S9N5), CNGC8_ARATH (Q9FXH6), CNGC9_ARATH (Q9M0A4), 
CNGK1_RHIEC (Q2K5E1), CNGK1_RHILO (Q98GN8), CNG_CAEEL   (Q03611), 
CNG_ICTPU   (P55934), CRP_ECO57   (P0ACK0), CRP_ECOL6   (P0ACJ9), 
CRP_ECOLI   (P0ACJ8), CRP_ENTAE   (P0A2T7), CRP_HAEIN   (P29281), 
CRP_MYCTO   (P9WMH2), CRP_MYCTU   (P9WMH3), CRP_PASMU   (O05689), 
CRP_SALTY   (P0A2T6), CRP_SHIFL   (P0ACK1), EGL4_CAEBR  (A8X6H1), 
EGL4_CAEEL  (O76360), ETRA_SHEON  (P46148), FIXK_BRADU  (P29286), 
FIXK_RHIME  (P13295), FLP_LACCA   (P29284), FNRA_PSEST  (P47200), 
FNRL_RHOS4  (P51007), FNR_AGGAC   (Q9EXQ1), FNR_BACSU   (P46908), 
FNR_ECO57   (P0A9E7), FNR_ECOL6   (P0A9E6), FNR_ECOLI   (P0A9E5), 
FNR_HAEIN   (P45199), FNR_KLEOX   (Q9AQ50), FNR_PASMU   (Q9CMY2), 
FNR_SALMS   (P0A2T9), FNR_SALTI   (Q8Z787), FNR_SALTY   (P0A2T8), 
FNR_SHIDY   (Q9LA24), FNR_SHIFL   (P0A9E8), FNR_VIBC3   (A5F890), 
FNR_VIBCH   (P0C6D0), FNR_YERPE   (Q8ZE82), GBPC_DICDI  (Q8MVR1), 
GBPD_DICDI  (Q54S40), GLSA1_BRADU (Q89NA7), GLSA2_BRADU (Q89KV2), 
GORK_ARATH  (Q94A76), HCN1_HUMAN  (O60741), HCN1_MOUSE  (O88704), 
HCN1_RABIT  (Q9MZS1), HCN1_RAT    (Q9JKB0), HCN2_HUMAN  (Q9UL51), 
HCN2_MOUSE  (O88703), HCN2_RAT    (Q9JKA9), HCN3_HUMAN  (Q9P1Z3), 
HCN3_MOUSE  (O88705), HCN3_RAT    (Q9JKA8), HCN4_HUMAN  (Q9Y3Q4), 
HCN4_MOUSE  (O70507), HCN4_RABIT  (Q9TV66), HCN4_RAT    (Q9JKA7), 
HLYX_ACTPL  (P23619), KAP0_BOVIN  (P00514), KAP0_CHICK  (Q5ZM91), 
KAP0_HUMAN  (P10644), KAP0_MESAU  (P86244), KAP0_MOUSE  (Q9DBC7), 
KAP0_PIG    (P07802), KAP0_PONAB  (Q5REL1), KAP0_RAT    (P09456), 
KAP1_HUMAN  (P31321), KAP1_MOUSE  (P12849), KAP1_RAT    (P81377), 
KAP2_BOVIN  (P00515), KAP2_HUMAN  (P13861), KAP2_MOUSE  (P12367), 
KAP2_PIG    (P05207), KAP2_RAT    (P12368), KAP3_BOVIN  (P31322), 
KAP3_HUMAN  (P31323), KAP3_MOUSE  (P31324), KAP3_RAT    (P12369), 
KAPR1_DROME (P16905), KAPR2_DROME (P81900), KAPR_APLCA  (P31319), 
KAPR_ASHGO  (Q75AM2), KAPR_ASPFU  (Q96UX3), KAPR_ASPNG  (Q9C196), 
KAPR_BLAEM  (P31320), KAPR_BLUGR  (Q9HEP7), KAPR_CAEEL  (P30625), 
KAPR_CANAL  (Q9HEW1), KAPR_CANGA  (Q6FQL6), KAPR_COLOR  (Q9C1C2), 
KAPR_COLTR  (O42794), KAPR_DEBHA  (Q6BZG7), KAPR_DICDI  (P05987), 
KAPR_EMENI  (O59922), KAPR_HYPAT  (Q86ZN7), KAPR_KLULA  (Q6CPK7), 
KAPR_MAGO7  (O14448), KAPR_MUCCL  (Q8TF77), KAPR_NEUCR  (Q01386), 
KAPR_SCHPO  (P36600), KAPR_STRPU  (Q26619), KAPR_USTMA  (P49605), 
KAPR_YARLI  (Q6C2X0), KAPR_YEAST  (P07278), KAT1_ARATH  (Q39128), 
KAT1_ORYSJ  (Q6K3T2), KAT2_ARATH  (Q38849), KAT2_ORYSJ  (Q5QNI1), 
KAT3_ARATH  (P92960), KAT3_ORYSJ  (Q5JM04), KAT4_ORYSJ  (Q652U9), 
KAT5_ORYSJ  (Q7XT08), KAT6_ORYSJ  (A2ZX97), KCNAE_DROME (Q02280), 
KCNH1_BOVIN (O18965), KCNH1_HUMAN (O95259), KCNH1_MOUSE (Q60603), 
KCNH1_RAT   (Q63472), KCNH2_CANFA (Q9TSZ3), KCNH2_CHICK (Q9PT84), 
KCNH2_HUMAN (Q12809), KCNH2_MOUSE (O35219), KCNH2_RABIT (Q8WNY2), 
KCNH2_RAT   (O08962), KCNH3_HUMAN (Q9ULD8), KCNH3_MOUSE (Q9WVJ0), 
KCNH3_RAT   (O89047), KCNH4_HUMAN (Q9UQ05), KCNH4_RAT   (Q9R1T9), 
KCNH5_HUMAN (Q8NCM2), KCNH5_MOUSE (Q920E3), KCNH5_RAT   (Q9EPI9), 
KCNH6_HUMAN (Q9H252), KCNH6_RAT   (O54853), KCNH7_HUMAN (Q9NS40), 
KCNH7_MOUSE (Q9ER47), KCNH7_RAT   (O54852), KCNH8_HUMAN (Q96L42), 
KCNH8_MOUSE (P59111), KCNH8_RAT   (Q9QWS8), KGP1_BOVIN  (P00516), 
KGP1_DROME  (Q03042), KGP1_HUMAN  (Q13976), KGP1_MOUSE  (P0C605), 
KGP1_RABIT  (O77676), KGP24_DROME (Q03043), KGP25_DROME (P32023), 
KGP2_HUMAN  (Q13237), KGP2_MOUSE  (Q61410), KGP2_RAT    (Q64595), 
KOR1_ORYSJ  (Q653P0), KOR2_ORYSJ  (Q7XUW4), NTCA_ANAVT  (P0A4U7), 
NTCA_NOSS1  (P0A4U6), NTCA_SYNE7  (P29283), NTCA_SYNY3  (P33779), 
NTE1_ASHGO  (Q756Z0), NTE1_ASPCL  (A1C9L6), NTE1_ASPFU  (Q4WA15), 
NTE1_ASPNC  (A2R350), NTE1_ASPOR  (Q2UDH2), NTE1_ASPTN  (Q0CNC7), 
NTE1_CANAL  (Q5A368), NTE1_CANGA  (Q6FKJ1), NTE1_CHAGB  (Q2H0D3), 
NTE1_COCIM  (Q1DLC7), NTE1_CRYNB  (P0CP37), NTE1_CRYNJ  (P0CP36), 
NTE1_DEBHA  (Q6BQK9), NTE1_EMENI  (Q5BAE9), NTE1_ENCCU  (Q8SVN8), 
NTE1_KLULA  (Q6CWC2), NTE1_LODEL  (A5E708), NTE1_MAGO7  (A4QVZ8), 
NTE1_NEOFI  (A1D9Y2), NTE1_NEUCR  (Q7S8J1), NTE1_PHANO  (Q0UJ42), 
NTE1_PICGU  (A5DHA3), NTE1_PICST  (A3LYZ4), NTE1_SCHPO  (Q9USJ4), 
NTE1_USTMA  (Q4PF83), NTE1_YARLI  (Q6CF18), NTE1_YEAST  (Q04958), 
P2C19_ARATH (Q9SL76), PAT_MYCS2   (A0R3F9), PAT_MYCTU   (O05581), 
PDE5_DICDI  (Q8MLZ3), PDE6_DICDI  (Q8MM62), PLPL6_HUMAN (Q8IY17), 
PLPL6_MOUSE (Q3TRM4), PLPL6_PONAB (Q5RDS0), PLPL7_HUMAN (Q6ZV29), 
PLPL7_MOUSE (A2AJ88), PLPL7_RAT   (Q5BK26), RPGF1_CAEEL (P34578), 
RPGF2_BOVIN (F1MSG6), RPGF2_CANFA (F1PBJ0), RPGF2_HUMAN (Q9Y4G8), 
RPGF2_MOUSE (Q8CHG7), RPGF2_RAT   (F1M386), RPGF3_HUMAN (O95398), 
RPGF3_MOUSE (Q8VCC8), RPGF3_RAT   (Q9Z1C8), RPGF4_HUMAN (Q8WZA2), 
RPGF4_MOUSE (Q9EQZ6), RPGF6_HUMAN (Q8TEU7), RPGF_CAEEL  (G5EDB9), 
SKOR_ARATH  (Q9M8S6), SL9C1_HUMAN (Q4G0N8), SL9C1_MOUSE (Q6UJY2), 
SL9C2_HUMAN (Q5TAH2), SWS_DROAN   (B3MRI9), SWS_DROER   (B3NY03), 
SWS_DROGR   (B4JLX2), SWS_DROME   (Q9U969), SWS_DROMO   (B4L535), 
SWS_DROPE   (B4H3U8), SWS_DROPS   (B5DKS8), SWS_DROSE   (B4IL64), 
SWS_DROVI   (B4M709), SWS_DROWI   (B4N1W9), SWS_DROYA   (B4Q0P3), 
VFR_PSEAE   (P55222), Y073_MYCTO  (P9WQK4), Y073_MYCTU  (P9WQK5), 
Y104_MYCTO  (P9WM60), Y104_MYCTU  (P9WM61), Y2564_MYCTO (P9WQI4), 
Y2564_MYCTU (P9WQI5), Y2565_MYCTO (P9WIY6), Y2565_MYCTU (P9WIY7), 
Y2593_MYCBO (P63402), Y2594_MYCBO (P0A643), Y4233_RHOPA (Q02006), 
Y804_HAEIN  (P44053), YCF28_PYRYE (Q1XDE5), YEIL_ECO57  (P0A9F0), 
YEIL_ECOLI  (P0A9E9), YOL4_CAEEL  (Q02331), YVL7_CAEEL  (Q21534)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
21 sequences

ARCR_STAA1  (A7X715), ARCR_STAA2  (A6U515), ARCR_STAA3  (Q2FDM8), 
ARCR_STAA8  (Q2FUY1), ARCR_STAA9  (A5IW58), ARCR_STAAB  (Q2YWH5), 
ARCR_STAAC  (Q5HCR6), ARCR_STAAE  (A6QKC0), ARCR_STAAM  (Q99R06), 
ARCR_STAAN  (Q7A381), ARCR_STAAR  (Q6GDH1), ARCR_STAAS  (Q6G643), 
ARCR_STAAT  (A8Z5D0), ARCR_STAAW  (Q8NUK9), ARCR_STAEQ  (Q5HKU6), 
ARCR_STAES  (Q8CML2), ARCR_STAHJ  (Q4L9J7), BTR_BORPE   (Q08530), 
FIXK_AZOC5  (P26488), FNRN_RHILV  (P24290), YCF28_PORPU (P51342)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Unknown' sequences
1 sequence

CNNM4_HUMAN (Q6P4Q7)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
7 sequences

MHQE_BACSU  (O34543), NINAB_GALME (A8Y9I2), PPNK_BLOPB  (Q492C6), 
SFSA_GEOSL  (P61664), UCRIB_SYNY3 (P26290), YA7B_SCHPO  (Q09764), 
YG35_YEAST  (P53273)
» More

PDB
[Detailed view]
115 PDB

1CGP; 1CX4; 1G6N; 1HW5; 1I5Z; 1I6X; 1J59; 1LB2; 1NE4; 1NE6; 1O3Q; 1O3R; 1O3S; 1O3T; 1O7F; 1Q3E; 1Q43; 1Q5O; 1RGS; 1RL3; 1RUN; 1RUO; 1U12; 1VP6; 1WGP; 1ZRC; 1ZRD; 1ZRE; 1ZRF; 2BYV; 2CGP; 2D93; 2GZW; 2K0G; 2KXL; 2OZ6; 2Q0A; 2QCS; 2QVS; 2WC2; 2XGX; 2XHK; 2XKO; 2XKP; 3BPZ; 3CF6; 3CL1; 3CLP; 3CO2; 3D0S; 3ETQ; 3FFQ; 3FHI; 3FWE; 3H3U; 3HIF; 3I54; 3I59; 3IDB; 3IDC; 3IIA; 3IWZ; 3IYD; 3J4Q; 3J4R; 3KCC; 3LA2; 3LA3; 3LA7; 3MZH; 3N4M; 3OCP; 3OD0; 3OF1; 3OGJ; 3OTF; 3PLQ; 3PNA; 3PVB; 3QOP; 3RDI; 3ROU; 3RPQ; 3RYP; 3RYR; 3SHR; 3TNP; 3TNQ; 3U0Z; 3U10; 3U11; 4AVA; 4AVB; 4AVC; 4BH9; 4BHP; 4CHV; 4CHW; 4DIN; 4F7Z; 4F8A; 4FT8; 4HBN; 4HZF; 4I01; 4I02; 4I09; 4I0A; 4I0B; 4JV4; 4JVA; 4KU7; 4KU8; 4LLO; 4MX3
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission