ID TNFR_NGFR_2; MATRIX. AC PS50050; DT 01-NOV-1997 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE TNFR/NGFR family cysteine-rich region domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=41; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=37; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-4.9359999; R2=0.0214000; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=538.8750000; R2=4.1875000; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=628; H_SCORE=3169; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=535; H_SCORE=2779; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=0; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MM=1; M0=-1; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='P'; M=-4,-2,-25,-1,3,-23,-13,-11,-19,-2,-21,-15,-1,13,-2,-4,3,4,-17,-30,-19,-1; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='P'; M=-4,-7,-25,-5,4,-24,-12,-3,-21,1,-20,-11,-5,5,3,0,-2,-7,-18,-24,-14,2; MA /M: SY='E'; M=-3,0,-27,4,11,-23,-12,-7,-21,-2,-20,-15,-4,11,-1,-9,-1,-6,-20,-27,-17,4; MA /M: SY='G'; M=-3,3,-27,1,-9,-28,39,-11,-34,-9,-29,-19,10,-17,-10,-10,4,-12,-27,-26,-25,-9; MA /I: II=-7; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0; MA /M: SY='Y'; M=-11,-7,-23,-9,1,0,-21,2,-12,-8,-7,-3,-6,-16,-1,-6,-4,1,-12,-14,4,0; MA /M: SY='Y'; M=-19,-22,-25,-26,-22,44,-29,7,-2,-17,2,0,-18,-29,-20,-13,-18,-10,-7,16,52,-22; MA /M: SY='C'; M=-6,-8,5,-12,-8,-14,-19,-11,-13,-12,-10,-8,-4,-18,-5,-10,1,3,-9,-27,-11,-7; MA /M: SY='D'; M=-5,10,-21,11,3,-21,-12,-1,-21,-3,-18,-15,7,-11,-1,-4,3,-1,-17,-29,-11,0; MA /M: SY='S'; M=-4,-3,-23,-3,1,-18,-8,-4,-17,-4,-14,-10,-2,-12,0,-5,2,0,-13,-24,-9,-1; MA /I: MD=-22; MA /M: SY='W'; M=-2,-5,-20,-6,-3,-13,-6,-8,-15,-2,-15,-11,-3,-10,-3,-5,-1,-3,-13,1,-6,-3; D=-4; MA /I: MD=-22; MA /M: SY='N'; M=0,6,-14,2,-1,-15,1,3,-15,-4,-17,-11,13,-8,-2,-4,7,0,-14,-23,-11,-2; D=-4; MA /I: MD=-22; MA /M: SY='H'; M=-3,-4,-13,-5,0,-5,-9,6,-8,-3,-6,-2,-2,-7,3,-1,-2,-3,-8,-7,2,1; D=-4; MA /I: II=-4; MI=0; IM=0; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0; MA /M: SY='C'; M=0,-10,9,-12,-9,-4,-14,-9,-6,-12,-3,-4,-8,-15,-10,-10,-1,1,0,-19,-7,-9; D=-4; MA /I: DM=-22; MA /M: SY='D'; M=-9,5,-27,7,7,-23,-4,-5,-26,2,-24,-16,6,-5,2,2,2,-5,-23,-27,-16,3; MA /M: SY='Q'; M=-5,-7,-24,-9,1,-15,-19,0,-10,-1,-10,-4,-4,-11,2,0,-3,-4,-10,-24,-7,0; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='R'; M=-4,-7,-16,-8,-3,-8,-16,-2,-6,-1,-4,-2,-5,-14,-2,3,-5,-2,-3,-17,-3,-4; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-20; MD=-20; IM=-20; DM=-20; MA /M: SY='P'; M=-4,-6,-21,-4,1,-17,-12,-7,-12,-3,-14,-9,-4,14,1,-1,0,-3,-14,-21,-14,-1; D=-6; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='C'; M=-12,-19,78,-26,-25,-17,-28,-14,-27,-25,-18,-16,-18,-36,-22,-24,-13,-13,-14,-28,-17,-24; MA /M: SY='T'; M=-4,-4,-19,-7,-4,-15,-15,-9,-16,2,-16,-9,0,-13,0,8,9,14,-9,-26,-9,-3; MA /I: II=-6; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0; MA /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-3,-16,-18,-2,-11,0,-12,-5,-2,-6,0,1,-4,-3,-11,-24,-8,-3; MA /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; MA /M: SY='E'; M=-7,3,-27,5,9,-24,-10,-6,-22,0,-21,-15,3,5,2,-4,1,-3,-21,-29,-18,4; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='P'; M=-6,-7,-28,-5,-1,-21,-11,-10,-16,-5,-17,-11,-5,19,-6,-9,-4,-6,-17,-27,-18,-5; D=-4; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='G'; M=-3,0,-26,-1,-7,-24,31,-11,-29,-10,-24,-16,5,-17,-10,-11,1,-11,-23,-23,-21,-9; D=-4; MA /I: MD=-15; MA /M: SY='Q'; M=-9,-5,-22,-6,0,-7,-12,0,-13,-8,-6,-2,-4,-16,1,-7,-4,-2,-13,-20,-2,0; D=-4; MA /I: II=-7; MI=0; IM=0; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0; MA /M: M=-6,-9,-20,-9,-3,-8,-7,-7,-10,-4,-10,-6,-7,-16,-6,0,-4,-6,-5,-17,-4,-5; D=-4; MA /I: DM=-15; MA /M: SY='V'; M=-4,-18,-11,-18,-8,-8,-23,-19,5,-13,3,3,-18,-18,-14,-14,-9,-4,11,-27,-11,-11; MA /M: SY='V'; M=-2,-12,-20,-15,-8,-11,-21,-14,0,-3,-2,2,-10,-18,-5,-5,-5,1,4,-24,-8,-7; MA /M: SY='Q'; M=-2,-4,-23,-7,3,-20,-15,-5,-16,7,-16,-6,-1,-13,10,7,2,-3,-13,-24,-11,6; MA /M: SY='P'; M=-8,-2,-28,1,2,-20,-14,-9,-16,-5,-16,-12,-3,12,-5,-9,-4,-6,-17,-28,-16,-3; MA /M: SY='C'; M=-4,-16,73,-23,-23,-22,-10,-22,-29,-24,-21,-18,-14,-32,-24,-24,-6,-11,-13,-41,-27,-24; MA /M: SY='T'; M=-1,0,-17,-4,-5,-17,-12,-15,-14,-7,-15,-12,2,-6,-6,-9,12,23,-8,-30,-14,-6; MA /M: SY='R'; M=1,-3,-24,-3,2,-22,-7,-9,-20,1,-18,-12,-2,-6,0,3,2,-3,-15,-24,-16,0; MA /I: MD=-20; MA /M: SY='T'; M=-5,4,-19,1,1,-17,-14,-8,-15,-1,-17,-11,6,-9,0,-4,7,12,-12,-26,-11,1; D=-6; MA /I: II=-7; MI=-8; IM=-8; MD=-15; DM=-15; I=0,0,-15,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0; MA /M: SY='S'; M=-2,0,-21,-2,1,-23,-4,-5,-22,1,-21,-12,4,-13,7,5,9,5,-17,-28,-14,3; MA /M: SY='D'; M=-12,34,-26,37,11,-30,-8,3,-29,1,-28,-23,26,-8,1,-5,4,-5,-27,-37,-19,6; MA /M: SY='T'; M=7,-7,-13,-14,-11,-12,-17,-19,-7,-8,-9,-8,-5,-11,-11,-7,11,25,4,-28,-13,-12; MA /M: SY='V'; M=-6,-16,-20,-16,-10,-11,-27,-15,10,-9,1,3,-16,-18,-10,-11,-9,-3,16,-27,-9,-11; MA /M: SY='C'; M=-9,-19,115,-29,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-20,-20,-18,-39,-29,-29,-9,-10,-10,-49,-30,-29; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=166(82); /POSITIVE=165(81); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1); NR /FALSE_NEG=19; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=K_Hofmann; CC /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=4; CC /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=TNFR-Cys; CC /VERSION=6; DR P24756 , A53R_VACCW , T; P21071 , A53_VACCC , T; DR Q9S7D9 , ACCR1_ARATH, T; Q9LX29 , ACR4L_ARATH, T; DR P26842 , CD27_HUMAN , T; P41272 , CD27_MOUSE , T; DR Q75J39 , CKI4_ORYSJ , T; O24585 , CRI4_MAIZE , T; DR P68636 , CRMB_CAMPM , T; P68637 , CRMB_CAMPS , T; DR O73559 , CRMB_CWPXG , T; P0DTN0 , CRMB_MONPV , T; DR P0DSV7 , CRMB_VAR67 , T; P0DSV8 , CRMB_VARV , T; DR O95407 , TNF6B_HUMAN, T; Q9Y6Q6 , TNR11_HUMAN, T; DR O35305 , TNR11_MOUSE, T; Q92956 , TNR14_HUMAN, T; DR Q80WM9 , TNR14_MOUSE, T; P18519 , TNR16_CHICK, T; DR P08138 , TNR16_HUMAN, T; Q9Z0W1 , TNR16_MOUSE, T; DR P07174 , TNR16_RAT , T; Q9NS68 , TNR19_HUMAN, T; DR Q9JLL3 , TNR19_MOUSE, T; O19131 , TNR1A_BOVIN, T; DR P19438 , TNR1A_HUMAN, T; P25118 , TNR1A_MOUSE, T; DR P50555 , TNR1A_PIG , T; P22934 , TNR1A_RAT , T; DR P20333 , TNR1B_HUMAN, T; P25119 , TNR1B_MOUSE, T; DR Q80WY6 , TNR1B_RAT , T; O75509 , TNR21_HUMAN, T; DR Q9EPU5 , TNR21_MOUSE, T; D3ZF92 , TNR21_RAT , T; DR Q9ER62 , TNR22_MOUSE, T; Q9ER63 , TNR23_MOUSE, T; DR Q93038 , TNR25_HUMAN, T; P83626 , TNR26_MOUSE, T; DR Q9HAV5 , TNR27_HUMAN, T; Q8BX35 , TNR27_MOUSE, T; DR P36941 , TNR3_HUMAN , T; P50284 , TNR3_MOUSE , T; DR P43489 , TNR4_HUMAN , T; P47741 , TNR4_MOUSE , T; DR P15725 , TNR4_RAT , T; Q28203 , TNR5_BOVIN , T; DR Q3LRP1 , TNR5_CALJA , T; Q7YRL5 , TNR5_CANLF , T; DR Q3ZTK5 , TNR5_HORSE , T; P25942 , TNR5_HUMAN , T; DR P27512 , TNR5_MOUSE , T; Q8SQ34 , TNR5_PIG , T; DR P51867 , TNR6_BOVIN , T; Q9BDN4 , TNR6_CERAT , T; DR P25445 , TNR6_HUMAN , T; Q9TSN4 , TNR6_MACFA , T; DR Q9BDP2 , TNR6_MACMU , T; Q9BDN0 , TNR6_MACNE , T; DR P25446 , TNR6_MOUSE , T; O77736 , TNR6_PIG , T; DR Q63199 , TNR6_RAT , T; P28908 , TNR8_HUMAN , T; DR Q60846 , TNR8_MOUSE , T; P97525 , TNR8_RAT , T; DR Q07011 , TNR9_HUMAN , T; O00220 , TR10A_HUMAN, T; DR O14763 , TR10B_HUMAN, T; Q9QZM4 , TR10B_MOUSE, T; DR O14798 , TR10C_HUMAN, T; Q9UBN6 , TR10D_HUMAN, T; DR A5D7R1 , TR11B_BOVIN, T; O00300 , TR11B_HUMAN, T; DR O08712 , TR11B_MOUSE, T; O08727 , TR11B_RAT , T; DR F5HAM0 , UL144_HCMVM, T; Q68396 , UL144_HCMVO, T; DR P29825 , VT2_MYXVL , T; P25943 , VT2_RFVKA , T; DR Q9VWS4 , WGN_DROME , T; DR O80963 , ACCR2_ARATH, N; P21106 , C22L_VACCC , N; DR Q9UNE0 , EDAR_HUMAN , N; Q9R187 , EDAR_MOUSE , N; DR Q90VY2 , EDAR_ORYLA , N; Q9NP84 , TNR12_HUMAN, N; DR Q9CR75 , TNR12_MOUSE, N; Q02223 , TNR17_HUMAN, N; DR O88472 , TNR17_MOUSE, N; Q9Y5U5 , TNR18_HUMAN, N; DR O35714 , TNR18_MOUSE, N; P20334 , TNR9_MOUSE , N; DR O14836 , TR13B_HUMAN, N; Q9ET35 , TR13B_MOUSE, N; DR Q96RJ3 , TR13C_HUMAN, N; Q9D8D0 , TR13C_MOUSE, N; DR Q969Z4 , TR19L_HUMAN, N; Q9N092 , TR19L_MACFA, N; DR Q8BX43 , TR19L_MOUSE, N; DR O15230 , LAMA5_HUMAN, F; 3D 1D0G; 1D4V; 1DU3; 1EXT; 1FT4; 1JMA; 1NCF; 1SG1; 1TNR; 1ZA3; 2AW2; 2H9G; 3D 2HEV; 2HEY; 2KN1; 3ALQ; 3BUK; 3IJ2; 3K51; 3ME2; 3ME4; 3MHD; 3MI8; 3QBQ; 3D 3QD6; 3QO4; 3THM; 3TJE; 3U3P; 3U3Q; 3U3S; 3U3T; 3U3V; 3URF; 3X3F; 4E4D; 3D 4FHQ; 4GIQ; 4I9X; 4J6G; 4KGG; 4KGQ; 4MSV; 4MXW; 4N90; 4OD2; 4RSU; 4YN0; 3D 5BNQ; 5CIR; 5DMI; 5DMJ; 5IHL; 5L36; 5T2Q; 5T2R; 5TL5; 5TLJ; 5TLK; 5WI8; 3D 5WIW; 5WJF; 6A3V; 6A3W; 6BWV; 6CPR; 6CU0; 6FAX; 6MGP; 6MHR; 6MI2; 6MKZ; 3D 6NG3; 6OGX; 6OKM; 6OKN; 6PE8; 6PE9; 6T3J; 6Y8K; 7D4B; 7KP7; 7KP8; 7KPB; 3D 7KX0; 7MSG; 7MSJ; 7P3I; 7X9G; 7YK4; 7YXU; 8AG1; 8DPX; 8DS5; 8GYE; 8HLB; PR PRU00206; DO PDOC00561; //