Entry: PS50060

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MAM_2
Accession [info] PS50060
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-1997 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00604
Associated ProRule [info] PRU00128

Name and characterization of the entry

Description [info] MAM domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=163;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=158;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.2332; R2=.01627989; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=9798.58327; R2=21.91183; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=507; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19571; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=384; N_SCORE=6.5; H_SCORE=18235; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=-10, -3,-28,  0,-10,-16,  4, -8,-16,-12,-12, -6, -4,-12,-12,-14, -8,-13,-13,-24,-13,-12;
/M: SY='S'; M=  1,  4,-19,  1, -3,-23,  3,  2,-24, -7,-24,-15, 10,-14,  0, -5, 14,  6,-18,-31,-15, -2;
/M: SY='C'; M= -9,-17,101,-27,-27,-19,-29,-29,-27,-27,-19,-19,-17,-36,-27,-27, -6, -1, -9,-47,-27,-27;
/M: SY='D'; M=-10, 27,-23, 30,  6,-26,-10, -4,-25, -2,-21,-19, 19,-14, -2, -7,  5,  1,-20,-36,-17,  2;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 80,-30,-20,  0,-30, 10,  0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,  0, 10, 30,-30;
/M: SY='E'; M=-11, 15,-30, 26, 50,-31,-13, -1,-32,  7,-22,-21,  3, -3, 15, -3,  0,-11,-30,-31,-21, 32;
/M: SY='D'; M= -9,  8,-25, 14,  8,-23,-15, -8,-23,  1,-17,-15,  2,-13,  3, -1,  2, -1,-18,-21,-12,  5;
/M: SY='G'; M=  1,  4,-26,  5,  4,-28, 16,-12,-29, -8,-25,-19,  4, -4, -6,-13,  4, -6,-24,-28,-24, -2;
/I:         MD=-23;
/M: SY='N'; M= -3,  9,-17,  8,  0,-14, -6, -1,-14, -4,-18,-13, 11,  1, -3, -7,  5, -1,-15,-21, -7, -2; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V'; M=  1,-18,-16,-23,-16,  7,-21,-18,  9,-17,  7,  3,-15,-19,-14,-16, -6,  1, 10,-16, -2,-15; D=-4;
/I:         DM=-23;
/M: SY='C'; M= -9,-19, 98,-27,-29,-21,-15,-29,-31,-29,-21,-20,-17,-37,-29,-29, -9,-11,-13,-46,-30,-29;
/M: SY='G'; M= -5, -2,-28,  0,-12,-20, 36,-15,-33,-16,-26,-19,  3,-11,-16,-17,  0,-14,-26,-23,-22,-14;
/M: SY='W'; M=-18,-32,-39,-35,-26, 15,-22,-16, -8,-17, -7,  1,-32,-28,-15,-16,-32,-22,-17, 89, 31,-18;
/M: SY='I'; M= -6,-10,-23,-12, -1,-16,-22, -2,  2,-11, -8, -1, -5,-14,  2,-12,  2,  0,  0,-28, -7, -2;
/M: SY='Q'; M= -9,  5,-28,  7, 13,-34,-17, 14,-23,  3,-21, -6,  2, -6, 35,  2,  0, -7,-27,-25,-10, 23;
/M: SY='D'; M= -1,  0,-23,  2, -4,-20,  2,-14,-13,-14,-10,-10, -2,-15, -9,-17,  1, -6,-10,-28,-17, -7;
/I:         MD=-18;
/M: SY='S'; M= -3, -4,-18, -4,  1,-14,-15, -7,-10,-11, -8, -8, -2, -7, -4,-11,  9,  9, -8,-30,-12, -2; D=-4;
/I:         MD=-18;
/M:         M= -7, -6,-25,-10, -7,-14, -2, -9,-14, -7,-13, -8, -1,-17, -1, -3, -2, -3,-15,-11, -6, -5; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='D'; M=-11, 25,-24, 36,  6,-25,  1, -6,-31, -6,-24,-23, 11,-12, -5,-11,  5, -4,-22,-31,-16,  1; D=-4;
/I:         DM=-18;
/M: SY='D'; M=-12, 19,-27, 28,  4,-29,  5, -6,-33,  0,-27,-22, 10,-13, -3, -4,  0,-10,-25,-21,-16,  1; D=-4;
/I:         DM=-18;
/M: SY='F'; M=  3,-11,-19,-17,-14,  5, -5,-10, -8,-13, -2, -5, -6,-20,-14,-10, -6, -5, -7,-10,  3,-14; D=-4;
/I:         DM=-18;
/M: SY='D'; M=-12, 11,-26, 15, 13,-22,-15,  5,-23,  3,-18,-13,  6, -6,  7,  1, -2, -7,-22,-25, -7,  9; D=-4;
/I:         DM=-18;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-22, -1, 10,-22,-18, -3,-15,  2,-12, -7, -4,-12, 10,  1, -1, -1,-12,-26,-12,  9;
/M: SY='R'; M=-17,-10,-30,-10,  0,-20,-21, 14,-24, 15,-18, -6, -2,-20, 14, 39,-10,-12,-20,-12, -3,  3;
/M: SY='V'; M=  0,-10,-18,-12,-12,-13,-11,-17,  2,-14, -3, -2, -8,-21,-10,-14, -3, -3,  8,-28,-13,-11;
/M: SY='N'; M= -7, 13,-21, 10,  7,-18, -9, -1,-22,  1,-25,-17, 19,-14,  5,  1, 11,  1,-21,-32,-14,  6;
/M: SY='S'; M= 10, -1,-17, -6, -4,-23,  4,-12,-20, -5,-22,-14,  4,-12,  1, -8, 16,  8,-13,-28,-18, -1;
/M: SY='A'; M=  8, -8,-18,-12, -7,-18, -9, -8, -8, -7,-10, -5, -4,-17, -1, -9,  3, -1, -3,-26,-13, -4;
/M: SY='T'; M=  1, -3,-19, -6,  2,-19, -6,-13,-17, -8,-14,-11, -2, -7,  0,-10, 10, 14,-12,-28,-16,  1;
/M: SY='S'; M= -3, -8,-24, -7, -6,-10,  1,-15,-22, -8,-23,-16, -3,  3,-11, -9,  5, -3,-18,-24,-14, -9;
/I:         MD=-19;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-27,-14,-10,-17,  2,-10, -9,-16, -9, -2,-10,  4,-10,-17, -6,-10,-12,-24,-15,-12; D=-4;
/I:         MD=-19;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-18, -1, -1,-15, -7, -1,-11, -3,-12, -7, -4, 11,  0, -2, -4, -6,-11,-16,-10, -2; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G'; M= -5, -8,-20, -9,-10,-12, 15,-10,-19, -4,-16,-10, -4,-13, -8, -3, -4, -6,-15,  1, -5, -9; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='P'; M= -5,-13,-23, -7, -1,-17,-13,-13,-11, -8,-16,-11,-12, 45, -7,-13, -4, -4,-16,-21,-18, -7; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-26,  1,  6,-16,-17,  6,-20, -3,-18,-11,  0, -8,  5, -3, -2, -7,-18,-17, -7,  5;
/M:         M= -9,-14,-24,-14,-10, -7,-15, -6, -9, -8,-13, -6, -7, -5, -7, -2, -3, -5, -6,-22, -5,-11;
/M: SY='D'; M=-19, 35,-32, 50, 15,-32,-13, -5,-32, -3,-25,-25, 11,-12, -2,-12, -5,-12,-26,-22,-14,  7;
/M: SY='H'; M=-15, -3,-26, -5, -4,-16,-19, 69,-20,-10,-14,  7,  5,-19,  6, -3, -6,-11,-21,-29, 12, -2;
/M: SY='T'; M= -1, -2,-16, -7, -7,-14,-16,-16,-12,-11,-14,-12,  1,  3, -8,-11, 15, 28, -8,-32,-15, -8;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-21,-12, -9, -2,-13, -9,-13, -3, -9, -7,  2,-20, -6,  7, -2,  0,-10,-22, -6, -8;
/I:         MD=-19;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-24, -9,-15,-20, 31,-12,-21,-11,-17, -6,  4,-19,-13,-12, -3,-13,-17,-22,-20,-14; D=-4;
/I:         MD=-19;
/M: SY='G'; M=  3,  4,-12, -2, -5,-14, 10, -8,-15, -7,-15,-11,  9,-10, -6, -8,  9,  6,-11,-20,-14, -6; D=-4;
/I:         MD=-19;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-16,  2, 11,-19, -9, -3,-14,  1,-12, -8, -2,  3, 10, -2,  1, -5,-14,-16,-12, 10; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-19, -3,  0,-18,  1, -8,-17, -7,-15,-11, -3, -5,  0,-10,  5, -3,-14,-20,-11,  0; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-26, -9,-17,-26, 61,-17,-35,-17,-26,-17,  0,-17,-17,-17,  0,-17,-26,-17,-26,-17; D=-4;
/I:         DM=-19;
/M: SY='F'; M=-15,-13,-24,-18,-15, 24,-21, 20,-13,-18, -9, -5, -4,-24,-14,-11, -9, -9,-14, -1, 22,-14;
/M: SY='F'; M=-20,-26,-24,-31,-25, 55,-30, -2,  1,-21,  7,  1,-20,-30,-26,-16,-20,-10, -4, 18, 51,-25;
/M: SY='M'; M= -7,-23,-21,-31,-21,  0,-24,-10, 24,-17, 22, 43,-21,-21, -7,-16,-20, -9, 13,-20, -1,-15;
/M: SY='F'; M= -6,-18,-19,-21,-16, 11,-22, -3, -1,-16,  3,  1,-13,-24,-14,-10, -7, -4,  3,-16,  7,-15;
/M: SY='F'; M= -7,-23,-16,-27,-22, 19,-25,-20, 10,-22, 14,  8,-20,-25,-23,-17,-10,  1, 14,-18,  2,-21;
/M: SY='D'; M=-12, 19,-27, 23, 15,-28, -8, -3,-26,  1,-24,-20, 14, -4,  1, -2,  1, -7,-23,-34,-20,  8;
/M: SY='T'; M=  7, -4,-15,-10, -6,-16,-15,-18,-14, -6,-16,-12, -3,  3, -8,-10, 14, 27, -6,-29,-15, -8;
/M: SY='S'; M=  2,  3,-20,  4,  1,-25, -1, -3,-23,  0,-25,-13,  5,-12,  3, -4, 15,  2,-16,-31,-16,  2;
/M: SY='P'; M= -7, -4,-26, -4, -4,-19, -8,-12,-15, -7,-19,-11,  0,  4, -7,-11, -1, -4,-16,-18,-15, -6;
/M: SY='G'; M= -2,-11,-26,-13,-14,-16, 22,-10,-24,-11,-16,-11, -3,-15,-14, -8, -5,-13,-18,-21,-16,-15;
/M: SY='N'; M= -2,  0,-24, -1, -2,-24, -2, -5,-21, -1,-21,-12,  3, -2, -1, -6,  2, -3,-18,-28,-17, -3;
/M: SY='E'; M= -5,-10,-27, -7,  7,-18,-17,-10,-15, -3,-10, -9,-10,  6,  1, -2, -5, -4,-15,-23,-12,  2;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-28,-10, -7,-27, 23,-13,-30, -4,-24,-15, -3, -6, -5,  3, -2,-13,-24,-21,-23, -8;
/I:         MD=-25;
/M: SY='E'; M= -1, -1,-23,  0, 13,-26,  0, -6,-22,  1,-21,-12,  0, -9, 11, -1,  6, -5,-19,-25,-17, 11; D=-5;
/I:         MD=-25;
/M: SY='Q'; M=  0, -3,-18, -5,  3,-19, -9, -6,-16,  6,-14, -7, -2,-10,  9,  9,  2,  2,-11,-18,-11,  5; D=-5;
/I:         I=-6; MI=0; IM=0; DM=-25;
/M: SY='A'; M= 23,-14,-14,-20,-13, -8,-10,-16, -6, -8, -8, -7,-11,-17,-12, -7,  4, -1,  4,-19, -9,-13;
/M: SY='A'; M=  2,-13,-20,-16,-11,-12,-10,  1, -9, -9, -1,  1, -9,-19, -6,  0, -6, -5, -6,-23, -8,-10;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-22,-30,-21, 11,-29,-18, 17,-28, 43, 17,-30,-30,-19,-19,-30,-11,  7, -8,  7,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-13,-21,-13,  1, -8,-23,-12,  0,-11, 12,  5,-14,-18, -3, -7, -9,  0, -2,-25, -8, -2;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-16, -7, -5,-17, -5,-14,-15,-13,-18,-14, -1,  0, -6,-13, 20, 12,-10,-34,-18, -6;
/M: SY='P'; M=-11,-12,-30, -8,  5,-22,-20,-11,-20,  3,-18,-13,-10, 24, -1, 11, -6, -4,-20,-27,-18, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-19,-25,-19, -7, -6,-27,-18,  6,-16,  4,  1,-18,  1,-10,-16,-11, -3,  2,-23, -9,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-22,-24,-24,-15,  1,-21, -8,  7,-19, 16, 14,-19,-18, -8,-15,-18,-11,  1,-17,  2,-12;
/M: SY='Y'; M=-11,-10,-20, -7, -4,-15,-16, -6,-17,  0,-16,-10,-10, -1, -2, -3, -8, -9,-16,-17,  1, -5;
/I:         MD=-22;
/M: SY='P'; M= -2,-10,-20, -6, -1,-16,-10,-10,-12, -4,-16,-11, -9, 36, -4, -7, -2, -4,-14,-17,-16, -5; D=-4;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-17, -3,  9,-15,-14, -9,-12,  5, -9, -7, -4, -9,  1,  0,  2,  2, -7,-21,-10,  5; D=-4;
/I:         DM=-22;
/M: SY='R'; M= -4, -4,-20, -7, -5,-15,-14, -9,-12,  3,-14, -9,  2, -7, -3, 11,  1,  1, -8,-26,-14, -6; D=-4;
/I:         DM=-22;
/M: SY='S'; M=  5,  3,-22,  5,  3,-26,  4,-12,-26, -1,-24,-18,  2, -7, -3, -5,  9, -1,-18,-29,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -1,-13,-23,-14, -7, -8,-19,-13, -9, -8,-13, -8,-12,  7, -5,-11,  0,  3, -7,-20, -6, -7;
/M: SY='H'; M= -3, -2,-17, -6, -1,-23,-10, 19,-18, -8,-17, -6,  3,-16,  8, -7,  0, -6,-17,-28, -7,  2;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-21,-24,-12,  4,-28,-19, 15,-23, 26, 10,-22,-24,-16,-18,-18, -7, 10,-22, -3,-14;
/M: SY='S'; M= -7,  1,-21,  3,  4,-14,-15, -2,-17, -7,-12,-10,  1,-14,  4, -4,  7,  4,-14,-28, -9,  3;
/M: SY='F'; M=-18,-25,-21,-33,-24, 56,-28,-11, -3,-24,  8,  0,-16,-27,-30,-13,-17, -7, -2,  0, 22,-24;
/M: SY='W'; M=-13,-21,-29,-24,-18, 13,-20,  0,-11,-17, -7, -4,-17,-24,-13,-14,-14, -9,-14, 34, 21,-15;
/M: SY='Y'; M=-18,-22,-28,-23,-21, 28,-29,  7,  0,-14,  4,  0,-21,-29,-14,-12,-19, -7, -8, 26, 59,-20;
/M: SY='Y'; M=-18,-14,-28,-15,-11, 12,-26, 28,-10, -7, -5,  0,-10,-24, -2, -4,-16,-12,-15,  2, 39, -9;
/M: SY='M'; M=-12,-15,-22,-21,-18,  5,-22,  5, 10,-13, 12, 26,-13,-24, -7,-11,-17, -9,  3,-12, 16,-14;
/M: SY='Y'; M= -7, -8,-19,-10,-11,  5,-14, -3,-11,-14, -9, -8, -5,-19,-11,-12,  5, 10, -8,-15, 11,-12;
/M: SY='G'; M= -5, -5,-26, -5,-10,-17, 26,  1,-30,-15,-24,-14,  2,-18, -8,-13,  2,-12,-24,-22,-14, -9;
/I:         MD=-27;
/M: SY='R'; M= -3, -4,-13, -4, -1,-12, -3, -5,-11,  2, -9, -5, -2, -3,  2,  4,  1, -2, -9,-13, -8,  0; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='S'; M=  5, -3,-19, -3,  2,-22,  4, -3,-23, -4,-24,-15,  3, -7, -1, -4, 14,  1,-16,-29,-17,  0; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='N'; M= -9,  5,-29,  6,  8,-28,  0,  7,-26, -3,-25,-14,  9,  3,  9, -5, -1,-11,-29,-27,-16,  7; D=-5;
/I:         DM=-27;
/M: SY='A'; M=  8,-12,-16,-17,-14, -9,-11,-12, -1,-14, -6, -3, -8,-19,-10,-15,  2, -2,  6,-25,-11,-12;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-24, 11, -4,-21,  6, -2,-25, -8,-23,-18, 12,-12, -7,-11,  4, -4,-22,-25,-10, -6;
/M: SY='K'; M=-10, -5,-29, -5,  4,-21,-12, -8,-23,  8,-22,-11, -2,  5,  7,  6, -4, -4,-22,-22,-14,  4;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-22,-25,-20,  5, -4,-20,  1,-26, 22,  6,-20,-26,-21,-20,-19,-12, -1,-17, -6,-20;
/M: SY='T'; M= -2, -4,-11, -8, -2,-15,-16,-11,-11, -5,-10, -8,  0,-17, -2, -1,  5,  8, -6,-30,-14, -3;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-32,-24,  6,-32,-24, 28,-28, 37, 18,-28,-28,-22,-22,-25, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='N'; M= -6, -2,-24, -8, -9, -4,-14, -5,-12, -3,-11, -6,  3,-20, -6, -1, -7, -7,-14, -4,  2, -8;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-16,-30,-27,  1,-31,-26, 29,-22, 18, 15,-26,-26,-24,-21,-14, -1, 35,-26, -6,-26;
/M: SY='R'; M=-11,-13,-24,-14, -8, -5,-17, -6,-12,  3, -8, -4, -9,-21, -2, 12, -7, -4, -9,-13,  5, -7;
/M: SY='E'; M=  0, -8,-21, -9,  1,-14,-17, -4,-10, -3,-10, -7, -6,-11, -4,  0, -1, -4, -4,-25, -9, -3;
/M: SY='D'; M=-10,  7,-26, 11, 10,-22,-11, -3,-23,  3,-22,-15,  4, -7,  4, -1,  2, -5,-20,-25, -9,  6;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-19, -6, -7,-19, -1,-13,-10,-10,-12, -3, -6,-17, -5,-12,  3, -1, -2,-28,-16, -6;
/I:         MD=-16;
/M: SY='N'; M= -2,  6,-18,  0,  3,-14, -6, -5,-12, -7, -9, -7, 11,-15, -3, -8,  3,  1,-14,-28,-14,  0; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='N'; M= -2,  5,-17,  3,  2,-18,  4, -5,-18, -1,-18,-12,  9, -4,  0, -4,  4, -1,-16,-20,-14,  1; D=-3;
/I:         MD=-16;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-14, -1, -6,-14, 15, -3,-15, -7,-12, -5,  2,-10, -4, -7,  0, -4,-12,-14,-10, -5; D=-3;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M:         M= -4,-13,-20,-15, -7, -1,-18,-13, -2,-11, -1,  0,-10, -3, -8,-11, -5, -2, -4,-19, -7, -7; D=-3;
/I:         DM=-16;
/M:         M= -7, -5,-27, -4, -1,-18,-13,-12,-11, -7, -6, -7, -5, -4, -3, -4, -8, -6,-13,-26,-14, -4;
/M: SY='T'; M= -4, -3,-12, -8, -3,-16,-18,-10,-12,  0,-10, -7,  1,-18, -2,  3,  0,  4, -7,-29,-13, -3;
/M: SY='T'; M= -3,-13,-22,-14, -6,-13,-20,-16, -6, -5, -1, -3,-11, -2, -5, -7, -4,  4, -6,-25,-11, -6;
/M: SY='L'; M= -9,-22,-24,-24,-14, -4,-30,-11, 17,-18, 19, 12,-19,-23,-10,-15,-18, -9, 12,-23, -2,-14;
/M: SY='W'; M=-17,-25,-36,-27,-16,  8,-22,-19,-16,-11,-12,-11,-23,-24, -9, -4,-23,-15,-20, 63, 15,-10;
/M: SY='Q'; M= -6,  5,-22,  2, 13,-23,-15,  3,-18, -2,-16, -9,  8,-12, 16, -2,  8,  4,-19,-30,-12, 14;
/M: SY='V'; M= -8,-20,-24,-25,-17,  4,-26,-18,  6, -6, -1,  2,-13,-21,-13,  2,-10, -7,  7,-17, -2,-17;
/M: SY='S'; M= -1, -3,-20, -2,  4,-23, -7, -3,-20, -2,-24,-13,  2, -5,  5, -3, 15,  5,-14,-32,-15,  4;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-29, -5,-12,-30, 56,-17,-38,-17,-29,-20,  1,-18,-15,-18,  3,-16,-29,-23,-28,-14;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='B'; M=-11,  9,-24,  9,  5,-18,-15,  6,-16, -5,-17,-11,  9, -8,  5, -7,  1, -4,-17,-28, -9,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -8,-10,-28, -7, -2,-19,-15, -4,-15, -9,-15, -9, -9, 17,  3,-11, -3, -4,-19,-23, -9, -2;
/M: SY='G'; M= -3, -4,-26, -4,-12,-23, 27,-17,-29,-13,-24,-18,  0,-17,-12,-12,  5, -3,-21,-17,-20,-12;
/M: SY='D'; M=-11,  1,-28,  3, -2,-21,  2, -1,-28, -5,-23,-15,  3, -2, -4, -1, -2, -6,-24,-26,-15, -5;
/M: SY='N'; M=  1,  7,-21,  4,  5,-25, -4, -5,-22, -2,-23,-15, 11, -7,  7, -3, 11,  2,-20,-30,-18,  5;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='Q'; M=-10, -5,-24, -8, -2,-17,-20,  1,-10,  0, -5, -1, -1,-13,  6,  2, -8, -5,-12,-25, -8,  1;
/M: SY='R'; M=-12,-12,-28,-12, -2,-12,-19, -7, -7, -4, -1, -2, -8,-11,  1,  4,-12,-10,-12,-19, -4, -2;
/M: SY='A'; M= 10, -7,-20,-10, -9,-17, -3, -4,-13, -8,-13, -8, -7,-17, -6, -9,  0, -4, -6,-21, -8, -9;
/M: SY='Q'; M= -9, -2,-26, -1, 12,-20,-17, 10,-23,  5,-21,-11,  0,-13, 13,  8,  2, -3,-21,-16, -2, 11;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-15,-32,-28,  2,-32,-28, 32,-24, 19, 14,-28,-28,-26,-22,-16, -4, 39,-26, -6,-28;
/M: SY='T'; M=  7,  2,-14, -7, -6,-13,-13,-13, -8, -9,-10, -9,  6,-15, -8,-11, 10, 17, -3,-30,-14, -7;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-25,  7,-33,-21, 28,-26, 30, 16,-27,-27,-21,-22,-22, -8, 22,-18,  4,-25;
/M: SY='N'; M= -6,  9,-23,  6,  3,-26, -5,  7,-23,  0,-26,-13, 15, -8, 10, -2,  9,  1,-23,-31,-14,  6;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15;
/M:         M= -4,-11,-25,-11,  0,-13,-17, -8,-11, -7,-14, -8, -9,-11, -3, -6, -1, -3, -9, -5, -7, -2;
/M: SY='Q'; M= -3, -4,-24, -4, 10,-25,-17, -6,-17,  1,-18, -8, -3,  4, 15,  0,  5,  5,-18,-27,-15, 11;
/M: SY='Q'; M= -9,  0,-27, -2,  5,-23, -6, -1,-22,  5,-22,-11,  3,-15,  7,  1, -4, -8,-20,-14,-11,  6;
/M: SY='E'; M= -9,  0,-30,  5, 15,-23,-19, -8,-24, 12,-23,-14, -4, 10,  8,  2, -6,-10,-24,-23,-14, 11;
/M: SY='F'; M=-19,-28,-25,-35,-27, 53,-30,-11,  4,-24,  8,  4,-21,-29,-28,-18,-21,-11, -1, 17, 38,-26;
/M: SY='Q'; M=-13, -3,-30, -3, 13,-33,-20,  4,-24, 23,-22, -4,  0,-13, 38, 29, -4,-10,-26,-20,-10, 24;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-17,-31,-27, 11,-31,-23, 25,-23, 17, 11,-27,-29,-26,-20,-16, -5, 31,-18,  5,-27;
/M: SY='I'; M= -2,-21,-19,-25,-18, -4,-28,-24, 21,-20, 12,  8,-19,-20,-17,-20, -9,  2, 21,-25, -7,-19;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-19,-38,-29, 65,-30,-21,  5,-29, 16,  3,-22,-30,-37,-20,-21, -9,  4,  3, 23,-29;
/M: SY='E'; M= -3,  0,-23,  3, 24,-20,-19, -6,-14, -1,-12,-11, -3,-10,  7, -6,  1, -2,-11,-28,-14, 15;
/M: SY='G'; M= 20,-11,-19,-15,-16,-23, 31,-20,-22,-16,-19,-14, -5,-16,-16,-19,  6, -8,-11,-22,-24,-16;
/M: SY='T'; M= -6,-15,-17,-18,-10,  1,-25,-18,  5,-14,  6,  3,-14,-19,-14,-11, -4, 11,  9,-24, -5,-12;
/M: SY='R'; M= -7,-10,-21,-11, -8, -9,-19,-15,-11,  6,-10, -5, -8,-19, -8, 10, -6,  1, -1,-22, -8, -9;
/M: SY='G'; M=  1,  6,-24,  5, -8,-27, 34,-12,-32,-13,-29,-21, 12,-16,-11,-14,  9, -8,-25,-29,-25, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-25; IM=0;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-19, -6, -5,-20, 17, -9,-22,  1,-18,-10, -1,-11, -1,  0,  0, -6,-16,-15,-14, -3; D=-5;
/I:         DM=-25;
/M: SY='G'; M=  0, -3,-23, -7, -9,-20,  6,-13,-14, -9,-18,-11,  3, -3, -7,-12,  2, -2,-13,-25,-18, -9; D=-5;
/I:         DM=-25;
/M: SY='S'; M= -3, -8,-24, -8, -2,-17,-10,  4,-17, -8,-19,-11, -2,  1, -1, -7,  6, -1,-16,-26, -8, -3;
/M: SY='Q'; M= -1, -7,-22, -8,  1,-14,-11,  1,-15, -8, -7, -5, -4,-16,  4, -5,  0, -4,-13,-24, -8,  2;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-28,-10,-14,-23, 41,-17,-32,-16,-27,-17, -2,-10,-12,-17,  3,-13,-26,-22,-24,-13;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-25, -5,-13, -9,  9,-11,-19,-14,-16,-13, -7,-14,-15,-16, -4, -8,-14,-13, -1,-15;
/M: SY='I'; M= -3,-28,-21,-33,-26,  0,-31,-25, 32,-24, 21, 19,-24,-24,-20,-23,-17, -7, 28,-23, -4,-25;
/M: SY='A'; M= 30,-10,-16,-16,-12,-17, 10,-15,-16,-12,-15,-12, -7,-14,-11,-18,  8, -3, -7,-17,-13,-12;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-21,-33,-25,  5,-33,-25, 31,-28, 33, 18,-27,-27,-22,-23,-23, -8, 24,-22, -2,-25;
/M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 65, 18,-39, -5, -1,-40, -1,-30,-29, 19,-11, -1,-11,  0,-11,-30,-39,-21,  8;
/M: SY='D'; M=-13, 36,-27, 49, 16,-29,-10, -2,-33, -2,-25,-25, 16,-11, -2,-10,  0, -8,-26,-35,-17,  8;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-22,-35,-28,  1,-34,-26, 39,-25, 19, 21,-24,-24,-21,-24,-18, -7, 33,-23, -3,-27;
/M: SY='S'; M= -1, -1,-20, -5,  2,-18,-16,-11,-10, -1,-13, -8,  3,-12,  1, -5,  8,  8, -9,-29,-13,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-24, 10,-31,-20, 25,-26, 30, 19,-26,-27,-21,-21,-23, -8, 20,-18,  4,-24;
/M: SY='T'; M=  1, -9,-19,-14, -9,-11,-15,-12, -8, -8, -4, -3, -5,-17, -4, -3,  2,  6, -7,-17, -9, -7;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-27, 13, 11,-23, -7,  2,-25, -4,-23,-18,  7,  1,  0, -9,  1, -5,-24,-27,-11,  4;
/I:         MD=-22;
/M: SY='G'; M= -5, -5,-20, -7,-10,-15, 15, 10,-22,-11,-16, -9,  1,-15, -7, -9,  1, -2,-17,-17, -4,-10; D=-4;
/I:         MD=-22;
/M: SY='P'; M= -7,-12,-23,-10, -4,-15,-16,-12, -5, -5,-12, -6, -9, 23, -2, -4, -4, -2,-10,-19,-13, -6; D=-4;
/I:         I=-7; MI=0; IM=0; DM=-22;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -7, -1,-29, -2,  0,-22, -7,-11,-20, -1,-22,-15,  3,  5, -4, -2, -3, -5,-21,-20,-17, -4;
/M: SY='Q'; M= -1, -9,-23,-10, -1,-19,-11, -2,-15, -4, -9, -6, -7, -8,  1, -2, -4, -3,-12,-24,-11, -1;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 158 in 59 different sequences
Number of true positive hits 158 in 59 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 37
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MAM
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
59 sequences

AEGP_HUMAN  (Q6UXC1), AEGP_MOUSE  (A2AJA7), AEGP_RAT    (Q63191), 
ALK_HUMAN   (Q9UM73), ALK_MOUSE   (P97793), EGFL6_HUMAN (Q8IUX8), 
EGFL6_MOUSE (Q9JJZ5), EGFL6_XENLA (Q8AVH7), ENTK_BOVIN  (P98072), 
ENTK_HUMAN  (P98073), ENTK_MOUSE  (P97435), ENTK_PIG    (P98074), 
MALR1_HUMAN (Q5VYJ5), MAMC2_HUMAN (Q7Z304), MAMC2_MOUSE (Q8CG85), 
MDGA1_CHICK (Q0WYX8), MDGA1_HUMAN (Q8NFP4), MDGA1_MOUSE (Q0PMG2), 
MDGA1_RAT   (P85171), MDGA2_HUMAN (Q7Z553), MDGA2_MACFA (Q9GMT4), 
MDGA2_MOUSE (P60755), MDGA2_RAT   (P60756), MEP1A_HUMAN (Q16819), 
MEP1A_MOUSE (P28825), MEP1A_RAT   (Q64230), MEP1B_HUMAN (Q16820), 
MEP1B_MOUSE (Q61847), MEP1B_RAT   (P28826), MFP1_ACRMI  (B3EX02), 
MLRP1_ACRMI (B3EWZ5), MLRP2_ACRMI (B3EWZ6), NPNT_HUMAN  (Q6UXI9), 
NPNT_MOUSE  (Q91V88), NPNT_PONAB  (Q5RBP1), NRP1A_DANRE (Q8QFX6), 
NRP1_CHICK  (P79795), NRP1_HUMAN  (O14786), NRP1_MOUSE  (P97333), 
NRP1_RAT    (Q9QWJ9), NRP1_XENLA  (P28824), NRP2_HUMAN  (O60462), 
NRP2_MOUSE  (O35375), NRP2_RAT    (O35276), PTPRK_HUMAN (Q15262), 
PTPRK_MOUSE (P35822), PTPRM_HUMAN (P28827), PTPRM_MOUSE (P28828), 
PTPRT_HUMAN (O14522), PTPRT_MOUSE (Q99M80), PTPRU_CHICK (Q6YI48), 
PTPRU_DANRE (B3DK56), PTPRU_HUMAN (Q92729), PTPRU_MOUSE (B1AUH1), 
THIB_XENLA  (Q91641), ZAN_HUMAN   (Q9Y493), ZAN_MOUSE   (O88799), 
ZAN_PIG     (Q28983), ZAN_RABIT   (P57999)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

2C9A; 2V5Y; 4GWM; 4GWN

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission