 |
|
| Entry: PS50078 |
General information about the entry
| Entry name [info] | POLO_BOX |
| Accession [info] | PS50078 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] | 01-DEC-2001 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 05-JUL-2017 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50078 |
| Associated ProRule [info] | PRU00154 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | POLO box domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=68; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=63; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.0098000; R2=0.0209326; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3314.5383301; R2=3.9161766; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=406; H_SCORE=4905; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=311; H_SCORE=4532; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-23,-27,-23, 36,-29, -3, 5,-19, 11, 3,-21,-29,-21,-15,-18, -5, 1, 8, 41,-23; /M: SY='R'; M= -4, -6,-20, -6, -1,-20,-12, -8,-21, 12,-23,-13, 2,-15, 3, 22, 12, 4,-10,-29,-14, -1; /M: SY='B'; M= -7, 18,-19, 12, -1,-17,-12, -5,-19, -1,-21,-16, 18,-14, -3, -4, 11, 16,-16,-30, -9, -2; /M: SY='K'; M=-12, 9,-28, 10, 8,-28,-17, -6,-30, 32,-27,-14, 8,-12, 7, 25, -5, -6,-21,-25,-12, 6; /M: SY='Y'; M=-11,-13,-17,-13, -8, -2,-22, 6,-11, -5,-13, -5,-10,-14, 0, -6, -5, -6,-11,-10, 17, -6; /M: SY='G'; M= 20,-11,-21,-16,-16,-18, 34,-20,-25,-16,-19,-14, -6,-16,-17,-20, 3,-11,-15,-18,-22,-16; /M: SY='F'; M=-12,-31,-24,-36,-27, 24,-32,-25, 21,-28, 21, 10,-25,-27,-26,-23,-23,-10, 15, 0, 9,-27; /M: SY='G'; M= 1,-17,-22,-21,-20,-13, 11,-17, -3,-18, -3, 8,-12,-20,-14,-18, -5, -9, 0,-23,-15,-17; /M: SY='Y'; M=-15,-21,-24,-26,-21, 25,-27, 1, 6,-16, 12, 15,-20,-26,-14,-13,-18, -5, -1, 5, 38,-19; /M: SY='Q'; M=-13, -5,-28, -4, 11,-26,-22, 22,-17, 2, -9, 1, -3,-15, 32, 7, -7,-12,-23,-23, -3, 20; /M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 21,-30,-20, 17,-30, 44, 17,-28,-30,-23,-20,-28,-10, 8,-15, 5,-22; /M: SY='S'; M= 4, 0, 11, -5, -6,-19, -8,-13,-20,-13,-26,-19, 8,-16, -6,-13, 26, 17,-10,-40,-20, -6; /M: SY='D'; M=-12, 36,-23, 40, 9,-29, -7, 0,-29, -2,-28,-24, 28,-13, -1, -7, 10, 2,-25,-39,-19, 4; /M: SY='G'; M= -6, 0,-29, 0, 0,-28, 33, -4,-35, -8,-27,-18, 7,-16, -6, -7, 0,-15,-29,-25,-23, -4; /M: SY='T'; M= 3, 0,-15, -4, -7,-17, -9,-15,-13, -9,-16,-12, 2,-12, -7, -8, 17, 22, -6,-31,-14, -7; /M: SY='V'; M= -6,-30,-15,-34,-30, 18,-31,-28, 26,-24, 11, 9,-26,-29,-31,-21,-14, -4, 36,-20, 0,-30; /M: SY='Q'; M= -3, -7,-30, -8, -1,-31, 15, -6,-27, -5,-23,-10, -4,-15, 20, -5, -3,-15,-28, -7,-15, 10; /M: SY='V'; M= -5,-30,-15,-33,-29, 12,-31,-28, 28,-23, 14, 11,-27,-29,-29,-21,-14, -3, 38,-22, -2,-29; /M: SY='N'; M=-11, 9,-21, -1, -6,-11,-13, 5, -6,-10, -1, 0, 19,-22, -1, -6, -6, -6,-15,-30, -9, -4; /I: I=-8; MI=0; IM=0; DM=-15; MD=-15; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28, 72,-30,-14, 0,-27, 8, 0,-20,-30,-35,-18,-20,-10, -2, 13, 38,-28; /M: SY='N'; M= -9, 20,-22, 8, -1,-21, -2, 10,-20, -1,-22,-13, 33,-19, 3, -1, 4, -4,-25,-33,-15, 1; /M: SY='D'; M=-19, 49,-29, 63, 17,-37, -9, 1,-37, 0,-30,-29, 26,-11, 0, -9, 1, -9,-30,-40,-20, 9; /M: SY='H'; M=-11, 2,-27, 2, -5,-23, 8, 42,-31,-12,-24,-10, 10,-18, -1, -7, -1,-12,-27,-29, -3, -6; /M: SY='T'; M= 1, -4,-13,-11, -9,-12,-17, -8,-10, -8,-11, -5, -2,-13, -6, -4, 14, 27, -1,-29, -9, -8; /M: SY='K'; M=-10, -1,-27, -2, 6,-26,-19, 6,-27, 29,-25, -9, 2,-12, 12, 24, -4, -5,-20,-23, -7, 8; /M: SY='L'; M= -8,-27,-20,-31,-23, 5,-29,-18, 26,-23, 32, 28,-26,-26,-17,-19,-23, -8, 19,-22, -2,-20; /M: SY='I'; M= 1,-24,-21,-31,-23, -2,-27,-23, 27,-22, 15, 17,-20,-21,-17,-22,-12, -5, 22,-23, -5,-22; /M: SY='L'; M=-11,-27,-23,-31,-21, 7,-31,-20, 21,-22, 29, 17,-23,-26,-18,-12,-23, -9, 14,-19, 0,-21; /M: SY='C'; M= -4,-10, 16,-11,-10,-14,-15,-13,-15,-17, -9,-10, -8,-23, -8,-16, 4, 0, -9,-32,-12, -9; /M: SY='P'; M= 8, -1,-25, -2, -2,-26, -3,-12,-20, -8,-24,-17, 1, 20, -4,-14, 4, -4,-20,-29,-23, -4; /I: I=-8; MI=-10; IM=-10; DM=-20; MD=-20; /M: SY='D'; M= -8, 12,-25, 14, 4,-24, -2, -6,-23, -5,-14,-14, 8,-15, 0, -5, -1, -5,-20,-29,-17, 2; /M: SY='A'; M= 3,-11,-22,-13, -6,-19, 0,-11,-12, -4,-12, 2, -8, -8, -2, -6, -2, -7, -8,-24,-16, -5; /M: SY='E'; M= -4, 2,-24, 3, 13,-23,-16, -7,-18, 9,-16,-11, 2,-11, 7, 5, 1, -5,-16,-27,-14, 10; /M: SY='A'; M= 6, -3,-18, -6, 6,-16,-14,-12,-11, -4, -8, -9, -3,-12, -3, -8, 5, 5, -7,-28,-15, 2; /I: I=-6; MI=-10; IM=-10; DM=-15; DM=-15; /M: SY='V'; M= -6,-30,-17,-33,-28, 8,-32,-27, 30,-25, 20, 13,-27,-28,-27,-22,-17, -5, 34,-23, -3,-28; /M: SY='T'; M= -6, -5,-21,-10, -5,-13,-20, 4,-12,-10,-13, -7, -2,-14, -1, -9, 6, 17,-10,-15, -2, -4; /M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-24,-23, 37,-30, 9, 2,-14, 3, 1,-21,-30,-17,-13,-19, -9, -4, 22, 64,-23; /M: SY='I'; M= -6,-21,-24,-30,-23, 0,-30,-20, 29,-22, 13, 14,-14,-21,-16,-22,-13, -3, 18,-19, 1,-23; /M: SY='D'; M= 0, 16,-22, 19, 10,-26, -8, -6,-23, -5,-22,-19, 12, -5, -1,-10, 9, -1,-19,-34,-19, 4; /M: SY='E'; M=-12, -3,-30, 0, 15,-23,-21, 2,-24, 13,-21,-11, -4, 3, 12, 11, -6, -7,-23,-21, -6, 12; /M: SY='D'; M=-10, 21,-25, 27, 15,-28,-11, -4,-27, 1,-23,-20, 13, -5, 2, -5, 5, -3,-23,-35,-19, 8; /I: I=-6; MI=-32; MD=-20; IM=-32; /M: SY='R'; M= -9, -4,-19, -4, 0,-15, -6, 3,-20, 16,-15, -6, 1,-11, 4, 25, -5, -8,-14,-13, -6, 0; D=-6; /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-20; /M: SY='D'; M= -9, 12,-26, 14, 8,-27, 0, -6,-24, -3,-22,-16, 10,-13, 2, -5, 3, -5,-21,-30,-18, 4; /M: SY='R'; M= -4, -8,-20,-12, -5, -6,-17,-11,-16, 5,-14, -5, -3,-15, -1, 9, 3, 7, -9,-21, -6, -3; /M: SY='E'; M= -9, -5, -3, -5, 9,-18,-23, -6,-18, -3,-11,-10, -6,-15, 0, -1, -1, 4,-11,-31,-13, 3; /M: SY='T'; M= -4, -4,-18, -9, -5,-10,-12, -9,-14, -8,-13,-10, -1,-13, -7, -5, 11, 21, -7,-27, -9, -7; /M: SY='Y'; M=-16,-21,-27,-22,-19, 23,-27, 3, -1,-11, 0, -1,-20,-28,-13,-11,-17, -9, -6, 23, 49,-19; /M: SY='R'; M=-12,-20,-27,-20,-12, 1,-17,-15, -9, -5, -4, -2,-15, -1,-13, 3,-14,-10, -8,-17, -6,-14; /M: SY='L'; M= 1,-16,-19,-18, -8, -1,-19,-15, -1,-17, 9, -1,-15,-12,-12,-16, -5, 2, -2,-20, -4,-10; /M: SY='S'; M= 2, -3,-15, -9, -8,-14,-13,-10, -3, -9,-12, -1, 3,-16, -2,-10, 12, 10, 0,-31,-13, -6; /M: SY='H'; M= -8, 0,-22, -1, 7,-15,-14, 14,-19, -7,-12, -9, 3,-14, 1, -7, 3, 5,-17,-26, -2, 2; /M: SY='L'; M= -3,-10,-21, -8, -9, -9,-19,-13, -2,-12, 3, -2,-11,-13,-10,-13, -6, -3, -1,-23, -4,-10; /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; /M: SY='E'; M= -3, -6,-14, -6, 4, -9,-12, -4, -1, -2, 1, 4, -6, -8, 4, -1, -5, -5, -4,-12, -5, 3; D=-4; /I: DM=-19; /M: SY='S'; M= -1, -1,-13, -3, -4, -9, -2, -4,-10, -8,-13, -9, 5, -5, -4, -8, 9, 3,-10,-19, -6, -5; D=-4; /I: DM=-19; /M: SY='G'; M= 2, -4,-19, -3, 0,-20, 25,-10,-23, -5,-18,-12, -1,-10, -6, -8, 0,-10,-18,-15,-17, -3; D=-4; /I: DM=-19; /M: SY='C'; M= -7,-20, 20,-25,-21, 0,-26,-11, -5,-16, -2, 0,-19,-29,-19,-16,-13, -8, 3,-22, 1,-21; /M: SY='P'; M= -4,-14,-10,-10, -4,-26,-16,-18,-21,-13,-29,-20,-11, 44,-10,-18, 4, -1,-22,-36,-27,-10; /M: SY='E'; M=-11, 0,-29, 4, 23,-25,-15, -6,-25, 14,-18,-13, 0, -3, 8, 11, -6,-10,-23,-26,-16, 15; /M: SY='E'; M= -4, 9,-23, 15, 17,-23,-13, -3,-23, 0,-19,-16, 3,-10, 7, -5, 6, -2,-19,-27,-10, 11; /I: I=-10; MI=-10; IM=-10; /M: SY='L'; M=-12,-30,-21,-33,-23, 22,-31,-21, 20,-30, 38, 16,-27,-29,-24,-21,-27,-10, 11,-14, 6,-23; /M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -6, -2,-17,-18, -5,-14, 10,-13, -4, -1,-17, 4, 17, -5, -6,-12,-21, -5, -1; /M: SY='Q'; M= -6, 2,-24, 2, 10,-27,-13, 3,-24, 10,-26,-12, 7, -5, 16, 9, 8, -1,-22,-29,-14, 12; /M: SY='R'; M=-14, -4,-30, -4, 7,-27,-20, 5,-29, 33,-24, -8, 1,-14, 16, 40, -9,-11,-22,-21, -8, 9; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22, 6,-30,-20, 25,-26, 38, 24,-27,-27,-18,-20,-25, -9, 17,-21, -1,-21; /M: SY='R'; M= -9, -1,-25, -2, 10,-24,-15, -7,-24, 15,-20,-11, 0,-11, 12, 18, 1, 4,-19,-24,-13, 10; /M: SY='Y'; M=-13,-25,-12,-26,-23, 14,-31, -6, 11,-20, 16, 7,-24,-30,-18,-17,-21, -9, 7, -3, 30,-23; /M: SY='L'; M= 12,-23,-17,-28,-19, -3,-21,-22, 15,-22, 22, 9,-22,-22,-17,-21,-13, -6, 13,-21, -8,-19; /M: SY='R'; M=-10, -2,-25, -1, 3,-22,-17, -7,-21, 18,-15, -8, 0,-15, 6, 20, -4, -6,-16,-25,-11, 3; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 66 in 45 different sequences |
| Number of true positive hits | 66 in 45 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.06 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 2 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | POLO box |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
45 sequences
CCR1_MAIZE (P0C8M8 ), CDC5_ENCCU (Q8SWM6 ), CDC5_YEAST (P32562 ), PLK1_BOVIN (Q2TA25 ), PLK1_CAEEL (P34331 ), PLK1_HUMAN (P53350 ), PLK1_MOUSE (Q07832 ), PLK1_RAT (Q62673 ), PLK1_XENLA (P70032 ), PLK1_XENTR (P62205 ), PLK2_CAEEL (Q9N2L7 ), PLK2_HUMAN (Q9NYY3 ), PLK2_MOUSE (P53351 ), PLK2_PONAB (Q5R4L1 ), PLK2_RAT (Q9R012 ), PLK3_CAEEL (Q20845 ), PLK3_HUMAN (Q9H4B4 ), PLK3_MOUSE (Q60806 ), PLK3_RAT (Q9R011 ), PLK4_AEDAE (Q16W24 ), PLK4_BOVIN (A2VDZ4 ), PLK4_DANRE (Q7ZVS3 ), PLK4_DROAN (B3M6I4 ), PLK4_DROER (B3NE99 ), PLK4_DROGR (B4J3F1 ), PLK4_DROME (O97143 ), PLK4_DROMO (B4KYX8 ), PLK4_DROPE (B4HBU3 ), PLK4_DROPS (Q2LYK3 ), PLK4_DROSE (B4IAQ8 ), PLK4_DROSI (B4QK53 ), PLK4_DROVI (B4LDJ6 ), PLK4_DROWI (B4MXR8 ), PLK4_DROYA (B4PDM5 ), PLK4_HUMAN (O00444 ), PLK4_MOUSE (Q64702 ), PLK4_NEMVE (A7SNN5 ), PLK4_PONAB (Q5R9Z7 ), PLK4_RAT (B2GUY1 ), PLK4_XENLA (Q6PAD2 ), PLK4_XENTR (B3DL84 ), PLK5_MOUSE (Q4FZD7 ), PLK_DICDI (Q86HN7 ), PLO1_SCHPO (P50528 ), POLO_DROME (P52304 )» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
PLK4_CULQU (B0WAU8 ), PLK5_HUMAN (Q496M5 ) |
| PDB [Detailed view] |
48 PDB
1MBY; 1Q4K; 1Q4O; 1UMW; 2N19; 2OGQ; 2OJX; 3BZI; 3C5L; 3FVH; 3HIH; 3HIK; 3P2W; 3P2Z; 3P34; 3P35; 3P36; 3P37; 3Q1I; 3RQ7; 4DFW; 4E67; 4E9C; 4E9D; 4H5X; 4H71; 4HAB; 4HCO; 4HY2; 4LKL; 4LKM; 4O56; 4O6W; 4O9W; 4RCP; 4RS6; 4WHH; 4WHK; 4WHL; 4X9R; 4X9V; 4X9W; 4XB0; 4YYP; 5DMS; 5DMV; 5DNJ; 5J19 » more |
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission