Entry: PS50085

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RAPGAP
Accession [info] PS50085
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50085
Associated ProRule [info] PRU00165

Name and characterization of the entry

Description [info] Rap GTPase activating proteins domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=217;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=212;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1181; R2=0.02066740; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5489.74261; R2=55.11536; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=382; N_SCORE=10.0; H_SCORE=23843; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=212; N_SCORE=6.5; H_SCORE=17174; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-1000; E1=-1000; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-32,-24,  5,-32,-24, 28,-26, 30, 17,-26,-27,-21,-19,-22, -8, 22,-21, -2,-24;
/M: SY='K'; M= -7,-10,-24,-10, -4,-17,-12, -9,-13, 10,-12, -1, -7,-17,  2,  8, -4, -6, -9,-22, -8, -1;
/M: SY='N'; M= -5,  0,-19, -7, -9, -9,-16, -2, -4, -5, -6, -4,  7,-21, -7, -6, -4, -1, -4,-25, -3, -9;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-22,-31,-22, 16,-31,-18, 18,-26, 35, 15,-26,-29,-21,-17,-26,-10, 10,-14,  7,-22;
/M: SY='D'; M=-19, 46,-30, 65, 20,-39, -7, -1,-40,  0,-30,-29, 18,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-39,-20, 10;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-23, -2, 16,-20,-18, -6,-13, -3, -8, -7, -4,-12, 12, -2,  3, -2,-15,-28,-13, 14;
/M: SY='R'; M=-13,-13,-27,-16, -6,-16,-25,  4, -3, -1, -3,  5, -7,-19,  9, 11,-10, -8, -6,-22, -3, -1;
/M: SY='P'; M= -7,-12,-29, -8,  2,-27,-16,-12,-14, -1,-21, -9,-11, 22,  7, -7, -4, -8,-15,-26,-19,  3;
/M: SY='C'; M= -6,-20, 32,-25,-21,-13,-23,-24, -6,-24, -5, -7,-17,-17,-21,-24, -7, -6, -1,-36,-19,-22;
/M: SY='R'; M=-13,-11,-25,-13, -8, -4,-20, -2,-15,  7,-14, -7, -3,-21, -1, 26, -3, -3,-10,-14,  6, -8;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-26, 14, 26,-19,-17, -4,-23,  0,-20,-18,  4, -1,  4, -6,  1, -4,-22,-28,-14, 15;
/M: SY='T'; M= -5,  0,-16, -7, -5, -8,-18, -9,-12, -7,-12, -9,  4,-14, -3, -5, 11, 24, -7,-27, -8, -3;
/M: SY='H'; M=-19, -4,-28, -4, -5, -3,-22, 53,-20,-11, -9, -1,  0,-22,  0, -3,-13,-16,-21,-20, 18, -5;
/M: SY='K'; M= -9,  0,-28, -1,  8,-28,-20,-11,-28, 45,-28,-10,  0,-10,  8, 27, -8, -5,-18,-21,-10,  8;
/M: SY='I'; M= -6,-28,-22,-35,-28, 11,-31,-26, 31,-25, 13, 14,-22,-24,-24,-24,-15, -7, 27,-18,  0,-28;
/M: SY='G'; M= 20,-12,-21,-17,-16,-17, 32,-20,-24,-16,-18,-14, -6,-16,-17,-20,  3,-11,-15,-18,-21,-16;
/M: SY='V'; M= -3,-30,-15,-32,-29,  1,-32,-29, 34,-23, 14, 13,-28,-28,-27,-22,-13, -3, 44,-27, -7,-29;
/M: SY='F'; M=-12,-29,-21,-36,-27, 30,-32,-22, 21,-28, 24, 15,-24,-27,-26,-22,-22, -9, 15,-11,  9,-26;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-21, 35,-30, 14,  1,-13,  3,  1,-20,-30,-14,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-21;
/M: SY='V'; M= -4,-23,  0,-28,-22, -8,-29,-22, 18,-19,  5, 10,-21,-25,-14,-19,-11, -5, 23,-28,-10,-19;
/M: SY='G'; M= 10, -7,-24,-10, -5,-26, 12,-15,-27, 11,-23,-13, -3,-14, -5,  4, -1,-10,-17,-20,-19, -5;
/M: SY='E'; M=  0,  1,-27,  4, 23,-23,-14, -4,-21,  0,-17,-15, -4,  3,  7, -8, -1, -8,-22,-23,-12, 14;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-29, -5,-12,-30, 55,-16,-38,-16,-29,-19,  1,-18,-12,-17,  2,-17,-29,-22,-28,-12;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-14,  0, 15,-19,-15, -9,-20,  1,-17,-14, -3,-12,  2, -1,  5,  3,-15,-28,-13,  8;
/M: SY='D'; M= -8, 22,-19, 23,  3,-23,-11, -7,-24, -3,-23,-19, 16,-12, -3, -5, 13, 16,-17,-35,-16,  0;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 13, 25,-27,-14, -2,-28, 19,-26,-17, 12, -9, 10, 11,  2, -6,-25,-30,-17, 17;
/M: SY='E'; M= -4,  1,  4,  3, 22,-27,-16, -6,-27, -3,-19,-17, -5,-13,  6, -9, -2,-10,-22,-31,-19, 14;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M=  1,  0,-24,  1, 18,-23,-17, -9,-11, -4,-14,-10, -2, -8,  9, -9,  4, -4,-12,-28,-15, 13;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-24,-33,-24,  0,-31,-21, 33,-25, 21, 23,-19,-21,-15,-23,-16, -7, 20,-22, -2,-22;
/M: SY='L'; M=-11,-23,-21,-25,-17, 17,-26,-13,  6,-18, 23,  8,-21,-26,-17,-13,-19, -7,  1,-10, 13,-17;
/M: SY='N'; M= -1,  6,-19,  2, -2,-19, -3, -6,-19, -1,-20,-14, 14,-16, -2,  2, 11,  4,-16,-32,-17, -3;
/M: SY='N'; M=-10, 30,-21, 15,  4,-18, -5,  6,-17, -2,-21,-16, 45,-19,  0, -2,  6,  0,-26,-37,-18,  2;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-21,  1, 14,-21,-17, -8,-16,  0,-17,-12,  2, -8,  6,  1,  8,  8,-12,-30,-16,  9;
/M: SY='E'; M=-10,  1,-26,  2, 15,-18,-15, 13,-22,  2,-18,-11,  3,-12,  7,  1,  0, -5,-21,-25, -4, 10;
/M: SY='G'; M=  5, -9,-22,-11, -9,-19, 18,-16,-19,-16,-11,-11, -4,-12,-12,-16,  1, -6,-15,-25,-20,-11;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S'; M=  3, -4,-16, -4, -2,-20,  0,-11,-19, -6,-21,-13,  3,-13,  2, -7, 21,  9,-12,-32,-17,  0;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-28, -5,  3,-21,-15, -6,-18, -2,-20,-13, -2, 19,  1, -4, -2, -6,-22,-23,-12,  0;
/M: SY='A'; M=  4, -6,-22, -7,  1,-19,-12, -2,-17, -2, -9, -8, -5,-11,  1,  3, -2, -5,-13,-24,-12,  0;
/M: SY='F'; M=-19,-20,-24,-23,-22, 48,-28, -6, -2,-21,  7, -1,-17,-28,-26,-16,-19,-10, -5,  9, 38,-23;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-22,  6,  8,-19,-18,-10,-13, -2, -7, -7, -4,-14,  0, -7, -2, -1, -9,-29,-13,  4;
/M: SY='E'; M= -8, 10,-26, 13, 30,-26,-16, -1,-25,  8,-20,-14,  6, -7, 12,  5,  2, -4,-23,-30,-17, 20;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-21,-36,-25, 63,-29,-17,  0,-26, 11,  2,-19,-28,-29,-17,-19,-10, -2,  5, 24,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-20, -7,-20,-18,  1,-28,-20, 10,-25, 29,  9,-23,-28,-20,-19,-21, -6,  9,-26, -6,-19;
/M: SY='S'; M= -2,  5,-18,  3,  0,-19,-12, -8,-18, -3,-16,-13,  7,-14, -1,  2, 11, 11,-12,-31,-14, -1;
/M: SY='G'; M= -5,-10,-23,-12, -5, -8,  4,-13,-15,-11, -6, -6, -5,-19,-10, -7, -5, -9,-12,-22,-12, -8;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-21,-26,-16,  3,-29,-18, 16,-25, 36, 16,-24,-26,-12,-17,-22, -5,  7,-21, -2,-14;
/M: SY='G'; M= -3,-10,-16,-11,-19,-28, 53,-10,-38,-20,-28,-18, -1,-22,-18,-19, -2,-19,-28,-24,-26,-19;
/M: SY='W'; M=-15, -2,-33,  0,  1,-19,-18,-10,-26,  7,-22,-15, -6,-16,  5, 10,-11, -8,-24, 17, -2,  3;
/M: SY='E'; M= -9,-10,-24, -9,  7,-13,-22,-11, -7, -2,  0, -3, -9,-16, -1,  4, -6, -4, -6,-26,-10,  2;
/M: SY='V'; M=  1,-25,-16,-31,-26,  2,-29,-28, 27,-21,  9,  9,-22,-24,-24,-22, -9,  1, 33,-24, -6,-26;
/M: SY='D'; M=-12,  7,-25, 10, 10,-24,-17,  9,-23,  6,-20,-12,  5,-14,  7, 10, -1, -4,-17,-30,-10,  7;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-28,-19, 11,-29,-20, 15,-21, 34, 14,-26,-28,-20,-15,-25, -9, 12,-19,  0,-19;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-28, -6,  1,-21,-10, -8,-19, 17,-20, -8, -2,-14,  3, 10, -6, -8,-16,-18, -5,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -3,  6,-25,  7, -3,-25,  9,-13,-23, -8,-20,-16,  4,-14, -8, -8,  1, -4,-17,-27,-19, -6;
/M: SY='H'; M= -7,-14, -4,-18,-16,  8,-21, 12,-14,-19, -8, -5,-10,-25,-17,-15,-10,-11, -8,-14,  6,-16;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M=-13,  9,-17, 14, 16,-20,-18, -6,-26,  1,-21,-17,  2, -4,  4, -4, -2, -7,-23,-29,-15, 10;
/M: SY='G'; M= -3, -7,-28, -7, -7,-25, 22,-10,-30,  3,-25,-13, -2,-17, -2, -2, -3,-13,-24,-16,-12, -5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='Y'; M=-18,-20,-28,-25,-20, 30,-28, -1,  0,-16,  0, -1,-15,-27,-13,-13,-18,-11, -8, 21, 41,-17;
/M: SY='R'; M= -2,-11,-21,-14, -3,-12,-19,-11, -9,  2,  1,  1,-10,-17, -2, 11, -8, -1, -6,-22, -9, -4;
/M: SY='G'; M=  1, -4,-28, -3, -9,-24, 42,-16,-34,-15,-25,-19,  0,-17,-15,-17,  0,-16,-25,-21,-24,-11;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-30, -9,-12,-28, 40, -7,-31,-11,-25,-13,  0,-18, -7,-12, -3,-18,-26,-21,-21,-11;
/M: SY='L'; M= -9,-26, -8,-27,-18,  1,-29,-18, 13,-24, 32, 16,-26,-28,-13,-18,-23, -9,  8,-23, -4,-16;
/M: SY='D'; M=-12, 23,-27, 35, 16,-32,-12, -4,-29, -3,-24,-21,  8, -1,  4, -9,  4, -5,-24,-36,-19, 10;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='T'; M= -7, -2,-18, -4, -8,-13,-21,-15, -2, -7, -7, -5, -4,-15, -8, -5,  1, 11,  5,-27,-10, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='K'; M= -8, -8,-13, -9,  2,-19,-21, -9,-17, 10,-13, -7, -7,-17,  3, 10, -5, -5,-11,-24, -9,  2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -7,  3,-10, -4,-10,-18,  6,  0,-25,-11,-24,-16, 12,-20, -8, -8,  2, -3,-22,-17,-13,-10; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='D'; M= -7, 18,-17, 23,  7,-28,  6, -6,-31, -4,-27,-22, 14,-13, -3, -9,  7, -5,-24,-33,-21,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='S'; M= -3, -1,-21, -1,  1,-17,-17, -8, -3,-10, -8, -5, -2,-12,  1,-12,  3,  1, -5,-26,-10, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='T'; M= -6,  5,-13,  2, -4,-11,-14, -9,-11, -4, -7, -8,  4,-11, -5, -1,  5, 17, -7,-23, -9, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='G'; M=  0, -8,-27, -8,-14,-28, 53,-16,-35,-16,-28,-17,  1,-17,-11,-16,  4,-15,-27,-21,-26,-12; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-13;
/M: SY='T'; M= -1,  1,-20, -3,  1,-19,-16, -7,-13,  0,-13, -8,  3,-13,  4, -3,  5,  9,-11,-27,-11,  2;
/M: SY='H'; M=-13, -7,-24,-10,  2,  5,-23,  9,-17, -3,-11, -6, -4,-16,  0,  0, -6, -3,-16,-16,  5,  2;
/M: SY='A'; M= 19, -7,-12,-12, -8,-17, -8,-16,-12, -7,-15,-11, -3,-13, -7, -7, 17, 14, -1,-29,-17, -8;
/M: SY='Y'; M=-10,-23,-26,-22,-19,  4,-19, -9,  4,-17,  4,  1,-22, -9,-17,-17,-16, -9,  2, -7, 16,-21;
/M: SY='Y'; M=-14,-16, -1,-18,-14, 11,-27,  2, -7,-14, -7, -6,-15,-27,-12,-14,-11, -7, -9,  0, 36,-16;
/M: SY='W'; M=-12,-11,-24,-12,-10,  2,-21,-10,-15,-11,-14,-12,-13,-20, -7,-12, -8,  0,-16, 25, 15, -8;
/M: SY='A'; M= 10, -4,-18,-10, -4,-11,-13,  0,-13, -4,-13, -8,  0,-15, -6, -8,  1,  0, -7,-23, -8, -5;
/M: SY='Y'; M=-16,  5,-26, 10, -7,  2,-21, -3,-14,-10,-11,-12, -5,-20,-12,-12, -8, -3,-11, -5, 17,-10;
/M: SY='E'; M=  2,  6,-25,  9, 11,-29,-12, -7,-25, 10,-23,-15,  1, -6,  9,  5,  2, -6,-19,-27,-17,  9;
/M: SY='B'; M= -7,  1,-24,  1, -6,-14, -7,-14, -7,-14, -7, -8,  1,-17,-11,-16, -5, -5, -7,-27,-13, -9;
/M: SY='M'; M= -8,-17,-21,-21,-15,  3,-24, -1,  2,-11,  7, 10,-14,-22,-11, -6,-12, -2,  2,-18,  5,-14;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-28,  8, 35,-30,-13, -2,-23,  5,-18,-12, -3, -7, 21, -1, -1,-10,-23,-27,-18, 28;
/M: SY='I'; M=  5,-26,-22,-33,-25, -3,-26,-26, 24,-21,  8, 10,-22,-21,-19,-23,-13, -7, 21, -7, -4,-23;
/M: SY='M'; M= -2,-18,-20,-23,-15, -8,-15,-15, 13,-14,  6, 20,-16,-19,-10,-16,-10, -5, 12,-23, -9,-13;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-37,-29, 64,-30,-19,  4,-28, 13,  3,-22,-30,-36,-20,-20, -9,  5,  5, 26,-29;
/M: SY='H'; M=-17,  1,-28,  3, -3,-21,-12, 69,-27,-11,-19, -4,  7,-20,  3, -4, -8,-17,-23,-30,  9, -3;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-10,-32,-29,  1,-30,-29, 24,-23, 11,  9,-29,-29,-26,-22,-16, -6, 33,-12, -5,-28;
/M: SY='S'; M= 15, -3,-14, -4,  3,-21, -5,-13,-18, -8,-23,-17,  2, -1, -2,-12, 24, 12,-11,-33,-20,  0;
/M: SY='T'; M=  1, -3,-10,-11,-11,-10,-19,-20, -7,-11,-10, -9, -2,-12,-11,-11, 19, 43,  4,-31,-11,-11;
/M: SY='M'; M=-13,-13,-25,-12, -9, -9,-22,  0, -2, -7, 10, 15,-13,-13, -5, -1,-18,-11, -6,-24, -4, -8;
/M: SY='L'; M= -9,-26, -7,-30,-22,  3,-26,-15, 16,-22, 30, 30,-26,-27,-15,-17,-23, -9, 12,-23, -3,-18;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-34, -6,  3,-28, -9,-16,-22, -9,-28,-19,-13, 59, -7,-16, -3, -8,-27,-29,-27, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='Y'; M= -7, -8,-17,-13,-12, 11,-18, -3, -9,-12, -9, -8, -3,-18,-11,-10,  6, 14, -7,-11, 16,-12; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='T'; M= -5, -1,-17, -6, -3,-11,-14,  3, -9, -1, -7,  1,  3,-13, -1,  0,  0,  5, -8,-23, -6, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-15, 12, 13,-29, -9, -9,-27, -1,-25,-19,  2,  1,  2, -8,  0, -8,-24,-32,-21,  6;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-23, -2, -8,-21, 16, -3,-22,-14,-19,-13,  5,-18, -9,-13,  5, -7,-16,-29,-17, -9;
/M: SY='D'; M=-15, 28,-26, 35, 11,-19,-12, -2,-26, -5,-18,-20, 17,-15, -4, -9, -1, -7,-23,-33,-14,  4;
/M: SY='K'; M= -5, -4,-27, -2,  5,-26,-16, -8,-18,  8,-20, -6, -5,  6,  7,  3, -2, -6,-16,-26,-16,  5;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='Q'; M= -4,  3,-24,  0,  3,-28,  4,  8,-22, -2,-22, -8,  9,-13, 19, -2,  4, -8,-25,-23,-13, 11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q'; M=-11,-11, -6,-14, -4,-23,-16, -7,-15, -1,-11, -1, -8,-20, 13,  6, -8,-11,-15,-25,-13,  3;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='L'; M= -6,-11,  1,-16,-15, -4,-21,-16,  0,-20, 11,  1, -7,-24,-15,-15, -7,  2,  0,-29,-10,-15; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='Q'; M=-10,  4,-25,  8,  9,-24,-10, -4,-18, -1,-10, -7,  1,-14, 12, -3, -5, -9,-19,-25,-13, 11; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='R'; M=-11, -3,-25, -3,  6,-24,-16, -4,-26, 30,-23, -9,  1,-12, 12, 35, -4, -6,-18,-20,-10,  7; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-28, -1,  3,-22,-20,-11,-24, 27,-20,-10, -2,-13,  3, 19, -8, -3,-16,-15, -8,  3;
/M: SY='R'; M=-13, -3,-26, -5, -1,-21, -7, -3,-29, 18,-24,-13,  7,-18,  5, 43,  0, -6,-20,-25,-14, -1;
/M: SY='H'; M=-17,  3,-30,  5,  2,-24,-11, 73,-31, -8,-22, -4,  9,-18, 11, -2, -7,-18,-30,-29,  9,  2;
/M: SY='I'; M= -6,-22,-23,-28,-21, -2,-29,-24, 26,-25, 15, 10,-15,-19,-16,-23, -8,  1, 16,-24, -4,-21;
/M: SY='G'; M=  4, -5,-26, -8,-17,-26, 50,-18,-33,-17,-26,-18,  4,-18,-17,-17,  4,-10,-25,-23,-26,-17;
/M: SY='N'; M= -9, 25,-23, 10, -3,-20,  3,  4,-19, -4,-26,-13, 41,-10, -3, -4,  5, -4,-27,-36,-20, -4;
/M: SY='D'; M=-19, 39,-30, 56, 16,-34,-13,  3,-35,  0,-26,-25, 15,-12,  5, -8, -2,-10,-28,-32,-10, 10;
/M: SY='F'; M=-12,-19,-25,-24,-11, 17,-30,-15, 11,-19,  9,  6,-16,-20,-16,-17,-14, -4,  4,-11, 10,-14;
/M: SY='V'; M=  8,-26,-11,-28,-26, -4,-24,-26, 22,-17,  7, 10,-26,-26,-24,-19, -7, -1, 38,-27,-11,-25;
/M: SY='T'; M=  0, -7,-15,-10, -6,-18,-17,  1,-15, -8,-17,-10, -4,  4, -6,-11,  6, 11,-11,-30,-11, -8;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-25,-31,-26, -1,-25,-23, 29,-24,  8, 10,-17,-22,-19,-24,-11, -7, 21,-19,  2,-26;
/M: SY='V'; M= -5,-26,-18,-30,-27,  2,-32,-24, 30,-21, 10, 10,-23,-25,-23,-21,-11,  0, 34,-21,  1,-27;
/M: SY='F'; M=-11,-28,-25,-33,-25, 37,-26,-15,  0,-22,  5, -2,-24,-28,-26,-18,-20,-12, -2, 28, 29,-24;
/M: SY='Q'; M= -6,  9,-22,  4, 10,-25,-13,  0,-19,  4,-20,-10, 14,-12, 18,  2,  8,  4,-21,-29,-14, 14;
/M: SY='E'; M= -9, 12,-26, 21, 36,-29,-17, -3,-25,  4,-20,-18,  2, -6, 13, -4,  3, -6,-21,-32,-18, 25;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P'; M= -4, -2,-24, -2,  2,-21,-15,  0,-15, -9,-20,-13,  1, 10, -2,-12,  8,  4,-15,-32,-14, -2;
/M: SY='G'; M= -2, -2,-20, -7,-14,-12, 19,-14,-20,-15,-21,-15,  8,-19,-15,-14,  8,  0,-14,-26,-18,-14;
/M: SY='E'; M= -4, -4,-22, -4, 11,-17,-18,  0,-17,  0, -9, -9, -3,-12,  3,  5,  1,  2,-14,-27,-11,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -7, -1,-26,  6,  5,-23,-19,-14,-13, -6,-17,-14, -8, 12, -7,-10, -3, -2, -8,-31,-19, -2;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-23,-29,-23, 42,-28, -7,  5,-22,  8,  2,-18,-27,-23,-17,-16, -7,  0,  7, 36,-23;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-15, -4,  0,-12,-17,-11,-19,  4,-18,-12,  1,-15, -4,  5,  4,  5,-10,-26,-11, -2;
/M: SY='P'; M=-14,-19,-30,-16, -7,-10,-23, -4,-12, -6, -3, -4,-15, 13, -7,  5,-16,-11,-15,-23, -9,-10;
/M: SY='D'; M= -6,  3,-23,  4, -5,-14,  1,-12,-16, -8,-15, -8,  1,-17,-10,-12, -2, -7,-11,-26,-14, -7;
/M: SY='T'; M= -4,-10,-14,-15,-12,-13,-20,-16, -2,-13, -8,  1, -7,  3, -9,-15,  5, 16, -3,-30,-13,-12;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-24,-28,-23, -4,-31,-24, 30,-24, 10, 10,-10,-19,-16,-23, -9, -1, 19,-25, -5,-23;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='R'; M= -1, -8,-25, -8,  0,-22,-14, -1,-22, 12,-21,-11, -4,  5,  2, 16, -3, -7,-17,-22,-12, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-16, -1, -6,-19,  5,-13,-19,-11,-20,-11,  4,-13, -6,-12, 19, 15,-11,-32,-18, -6;
/M: SY='H'; M= -9,  6,-28,  8, 12,-29,-15, 24,-25,  1,-24,-10,  8, -3, 18,  0,  1, -9,-27,-29, -8, 13;
/M: SY='F'; M=-16,-14,-20,-22,-20, 52,-23,-15, -7,-23, -1, -6, -7,-26,-29,-17,-10, -6, -6, -3, 17,-21;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='N'; M= -9,  4, -8,  0, -5,-16, -9, -6,-12,-11, -5, -6,  7,-20, -1, -9, -5, -5,-14,-28,-13, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='H'; M=-17, 10,-26, 11, -1, -4,-16, 31,-24,-10,-18,-11, 10,-19, -4, -8, -4,-10,-22,-24,  8, -4;
/M: SY='V'; M=  9,-20,-12,-23,-20, -7,-19,-23, 12,-17,  3,  2,-18,-22,-19,-18,  1,  4, 24,-29,-12,-20;
/M: SY='F'; M=-12, -7,-13,-10,-10, 12,-21, -1,-11,-16, -3, -6, -5,-22,-14,-13, -5, -2, -9,-17,  7,-12;
/M: SY='V'; M= -5,-17,-22,-19,-17,-10,-29,-21, 19,-13,  4,  7,-16,-21,-12,-16,-12, -6, 20,-25, -8,-16;
/M: SY='V'; M= -6,-23,-20,-26,-20, -5,-29,-23, 21,-13,  7,  8,-18,-22,-16,-10,-10, -4, 23,-25, -7,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-32,-27,  3,-32,-27, 31,-25, 25, 15,-28,-28,-25,-22,-19, -5, 33,-25, -5,-27;
/M: SY='R'; M=-10, -4,-24, -5,  5,-16,-20, -3,-20, 10,-17, -9, -2,-14,  9, 18,  2,  6,-16,-19, -1,  5;
/M: SY='P'; M= -5,-16,-31,-12, -4,-22,-20, -7,-13, -5,-19,-10,-15, 35, -6,-12, -9, -9,-15,-25,-14, -8;
/M: SY='L'; M= -8,-12,-22,-14, -6, -8,-22,  1,  0,-10,  7,  6, -9,-20, -5, -9, -9, -5, -3,-26, -4, -6;
/M: SY='D'; M= -5,  9,-24, 11,  2,-25,  2, -5,-25, -3,-19,-15,  8,-15, -2, -4,  3, -5,-20,-30,-17,  0;
/M: SY='R'; M=-11,  2,-27,  1,  3,-16,-14,  0,-19,  2,-18,-12,  7, -4,  2,  9, -4, -7,-22,-21, -5,  0;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='C'; M= -6, -1,  4, -2, -7,-12, -6,  0,-13, -8, -9, -7, -1,-15, -7, -8, -3, -6, -7,-21, -9, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='T'; M= -3, -3,-12, -4,  1, -9,-11, -3, -8, -4, -5, -5, -2, -5, -1, -2,  5,  9, -6,-18, -7, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='E'; M= -5, -4,-17, -1,  1,-14, -2, -8, -9, -4, -6, -5, -5, -3, -3, -6, -5, -7, -7,-16,-11, -1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='H'; M= -8,  5,-18,  1,  1,-15, -7, 15,-12, -2,-14, -6, 12, -7,  6,  0,  0, -6,-16,-20, -5,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='T'; M= -8,  0, -7, -2, -8,-16,-15, -6,-10, -7,-12, -8, -1,-14, -9, -9, -2,  1, -4,-28,-11, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='R'; M= -8,-10, -5,-13, -6, -6,-19,-10, -8, -5, -4, -1, -7,-19, -6,  4, -5, -2, -3,-23, -9, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='Y'; M=-14,-14,-25,-17,-15, 16,-22, -1, -5, -4, -7, -4,-11,-24,-12, -6,-15, -9, -7, 17, 33,-14; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-18;
/M: SY='R'; M=-10, -2,-24, -1,  1,-17,-15,  4,-19,  7,-16, -3,  1,-15,  3, 13,  0, -4,-14,-27, -8,  1;
/M: SY='V'; M= -6,-24,-18,-26,-18, -3,-29,-22, 21,-16, 12, 11,-23,-24,-18,-12,-14, -5, 27,-26, -8,-19;
/M: SY='K'; M=  2, -5,-20, -6,  1,-18,-13, -1,-16,  4,-17, -9, -3,-14,  1,  1,  4,  1, -9,-24, -7,  0;
/M: SY='V'; M= -1,-25,-19,-27,-24, -3,-17,-26, 14,-21,  5,  3,-22,-25,-22,-20,-10, -5, 20,-10, -7,-23;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-20,-12, -7,-11,-17,-12,-10, -4, -8, -4, -5, -9, -4,  1,  3,  6, -7,-26,-11, -6;
/M: SY='R'; M=  1, -3,-15, -4,  2,-21,-17,-11,-16,  3,-15,-10, -5,-15,  1,  7,  1,  0, -7,-27,-15,  0;
/M: SY='R'; M=-13,  2,-27,  5,  3,-21,-10,  6,-28, 12,-23,-13,  3,-16,  3, 18, -2, -7,-21,-22, -4,  1;
/M: SY='R'; M=-10,  3,-25,  6,  5,-23,-16, -6,-24,  7,-23,-15,  1, -1,  3, 10,  3,  3,-19,-27,-11,  2;
/M: SY='D'; M=-10, 15,-27, 24, 19,-29,-14, -4,-30,  5,-24,-21,  6, -1,  4,  5,  2, -4,-24,-32,-19, 10;
/M: SY='V'; M= -2,-17,-17,-17,-22, -9,-15,-25, 13,-18,  0,  1,-17,-24,-23,-19, -5, -2, 26,-29,-13,-23;
/M: SY='P'; M= -4,-14,-31,-10, -6,-20,-15,-16,-13,-12,-20,-14,-14, 40,-10,-18, -5, -5,-18,-23,-14,-11;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='F'; M= -4,-21,-24,-23,-14,  5,-23,-19,  1,-11, -3, -3,-17,-10,-16, -9,-11, -7,  2,-10, -3,-15;
/M: SY='F'; M=-13,-23,-21,-27,-19, 36,-24,-15, -5,-19,  1, -4,-15,-16,-24,-10,-10, -5, -4, -7, 12,-20;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-25, -4,-14,-26, 38,-18,-29,-14,-25,-17,  0,-18,-16,-16,  3, -9,-18,-25,-24,-15;
/M: SY='P'; M= -7,-16,-26,-12, -5,-24,-20,-19,-15, -9,-22,-15,-16, 44,-10,-13,-10,-10,-20,-22,-22,-11;
/M:         M= -3,-11,-24,-14, -7, -4,-20, -8, -4,-14, -2, -4, -8, -1,-10,-15, -7, -4, -8,-21, -5,-10;
/M: SY='L'; M= -3,-23,-21,-26,-18,  6,-17,-21,  5,-23, 17,  4,-20,-14,-20,-20,-15, -5,  2,-18, -5,-19;
/M: SY='P'; M=-12,  1,-33,  9,  5,-27,-17,-12,-25, -3,-26,-20, -4, 34, -4, -7, -4, -4,-26,-24,-21, -2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M:         M=  0, -3,-19, -4, -1,-14,-11,-14,-10, -5,-11, -9, -4,-16, -9, -9,  0, -1, -2,-27,-14, -5;
/M: SY='S'; M= -1,-13,-23,-13, -7,-12, -4,-13,-16, -9,-14,-10, -7, -1, -5, -5,  2, -4,-13,-24,-14, -7;
/M: SY='V'; M=  7,-14,-19,-17,-16,-13, -7,-22,  3,-17, -5, -3,-12,-15,-16,-19,  0, -1,  9,-27,-15,-17;
/M: SY='V'; M= -3,-17,-13,-18,-20, -9,-22,-23, 11,-14,  0,  1,-17,-23,-19,-12, -7, -2, 22,-28,-12,-21;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F'; M= -7,-24,-16,-29,-23, 27,-25,-19, 12,-22, 14,  8,-19,-23,-24,-17,-14, -3, 13,-10,  7,-22; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='A'; M=  2, -8,-18, -8,  1,-10,-14, -8,-11, -4, -6, -7, -7, -7, -3, -3,  1,  2, -9,-19, -5, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='R'; M= -8, -5,-21, -6, -4,-20,-19, -7,-14,  8,-16, -8,  0, -8, -2,  9, -5, -6,-11,-27,-12, -5;
/M: SY='G'; M= -2,-10,-19,-15,-14,-15,  3,  2,-11,-15,-12, -1, -3,-19, -6,-14, -3,-10,-11,-21, -5,-12;
/M: SY='A'; M=  4,  0,-23, -4, -2,-22,-14,-10,-10,  1,-13, -5,  1, -6,  2, -6, -2, -5,-11,-25,-14, -1;
/M: SY='B'; M= -5,  4,-16,  3,  3,-15,-17, -5,-10, -6,-10, -5,  0,-17, -3,-10, -4, -6, -7,-26, -7, -1;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='F'; M= -9,-23,-20,-28,-20, 28,-24,-17,  6,-22, 11,  7,-18,-13,-22,-18,-15, -7,  2, -9,  7,-20; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='R'; M= -3, -7,-23, -7,  3,-19,-14,  4,-18,  6,-15, -4, -3, -6,  5, 15, -2, -6,-15,-23,-10,  2; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='B'; M=  0,  8,-20,  8,  8,-21,-11, -2,-17,  0,-16,-12,  8,-11,  1, -5,  5, -1,-14,-28,-13,  4; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='F'; M=-13,-14,-22,-22,-17, 24,-21,-10,  0,-17,  2,  1, -7,-23,-14,-12,-14, -9, -5,  4, 12,-14; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-21,-21,-15, -1,-25, -2,  9,-17, 15,  8,-18,-15,-13,-11,-18, -9,  6,-19,  2,-16; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-19; MD=-19; IM=-19; DM=-19;
/M: SY='L'; M= -8,-18,-16,-20,-12, -3,-22,  3,  2,-15, 18, 12,-16,-22, -6, -6,-18,-10, -2,-21, -1,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='A'; M=  8, -9,-13,-14,-10, -2,-12, -6, -9,-10,-10, -7, -5,-14,-10, -8,  7,  8, -2,-21, -5,-10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-21, -6,  3,-11,-17,-10,-18, 14,-15, -8, -2,-12,  0, 13, -1,  2,-12,-20, -7,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='V'; M=  3,-21,-15,-25,-18, -6,-23,-11,  9,-17, 10,  6,-17,-22,-14,-12,-12, -7, 11,-24, -6,-18;
/M: SY='I'; M= -3,-17,-23,-24,-17, -5,-20,-15, 17,-18,  6, 14,-12,-19,-11,-19, -9, -6, 10,-21, -3,-16;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='N'; M=-11, 19,-21,  6, -4, -9,-11,  5,-12, -6,-18,-11, 30,-18, -2, -5,  3,  0,-18,-29, -9, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='A'; M= 13, -7,-16,-12,-10,-11, -2,-13,-15,-10,-14,-10, -5,-15,-12,-13,  7,  5, -6,-22,-12,-11;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-25,  7, 19,-23,-18,  4,-20,  3,-18,-12,  2, -9,  6, -1,  3, -2,-17,-29,-12, 11;
/M: SY='R'; M= -6, -4,-27, -8, -4,-16,-11, -6,-12,  4,-16, -8,  2,-11, -1,  6, -6, -8,-14,-19, -5, -5;
/M: SY='A'; M= 15,-16,-20,-20,-11, -9,-15,-15, -2,-12, -8, -6,-15, -7,-11,-18, -2, -2,  0, -7, -1,-13;
/M: SY='A'; M=  8, -9, -6,-11,  0,-18,-16,-17,-12, -8,-12,-11,-10, -6, -8,-13,  4,  4, -4,-29,-18, -4;
/M: SY='Y'; M= -9, -9,-23,-10, -4, -6,-17,  2,-14,  2,-13, -6, -6,-18, -4,  1, -2, -1, -9,-17,  7, -5;
/M: SY='K'; M= -7, -4,-15, -6,  1,-22,-17, -8,-25, 14,-24,-13, -1, -6,  0, 11, -2, -3,-18,-20,-13, -1;
/M: SY='A'; M=  8,-16,-21,-21,-14, -2,-13,-19, -8,-16, -5, -8,-13, -9,-14,-17, -4, -3, -8,  2, -6,-13;
/M: SY='E'; M= -9, -7,-27, -8,  8, -9,-22,-11, -7, -4, -6, -6, -5, -6, -3, -4, -8, -8,-11,-23,-10,  1;
/M: SY='K'; M=  1, -7,-24, -7,  2,-25, -9,-13,-19,  8,-21,-11, -6, -1,  2,  2,  0, -4,-13,-25,-17,  1;
/M: SY='F'; M=-13,-23,-24,-24,-15, 19,-24,-16, -4,-16,  6, -1,-17, -5,-19, -6,-14, -8, -6,-13,  2,-17;
/M: SY='Y'; M=  4,-16,-19,-20,-13,  2,-19, -8, -5, -9,  4, -1,-14,-20,-11, -6, -9, -3, -3,-12,  5,-13;
/M: SY='R'; M= -7, -9,-24,-12, -2, -6,-18,  2,-20,  6,-15, -7, -3,-17,  5, 15, -3, -5,-15,-18, -2,  1;
/M: SY='M'; M=-10, -8,-24,-10, -9,-12,-13,  0, -3, -9,  5, 12, -8,-20, -3, -8,-13,-10, -7,-24, -6, -7;
/M: SY='R'; M= -2,-13,-26,-15, -5, -9,-12,-14,-13,  0,-10, -7, -9, -7, -5,  3, -8, -9,-11,-18,-10, -6;
/M: SY='E'; M= -2, -6,-23, -6,  7,-15,-18, -7,-16,  4,-12, -9, -7, -8,  2,  2, -1, -1,-13,-19, -3,  3;
/M: SY='R'; M=-15,-11,-27,-14, -1, -8,-24, -8,-13, 10,-10, -3, -5,-17,  0, 28, -9, -5,-10,-19, -6, -3;
/M: SY='T'; M= -7, -4,-18, -5, -2, -8,-22,-16, -8,-10, -3, -7, -7,-10, -9, -9,  1, 16, -3,-27,-10, -6;
/M: SY='R'; M=-15,-13,-27,-13, -5,-16,-13, -6,-20, 11, -8, -5, -6,-21,  3, 37,-11, -8,-15,-20,-10, -4;
/M: SY='A'; M= 12,  1,-19, -2,  7,-25, -9, -6,-19,  0,-19,-12,  2,-10, 11, -1, 10,  1,-15,-27,-17,  8;
/M: SY='R'; M= -3, -7,-24, -8,  5,-21,-18, -7,-13,  9,-13, -4, -4,-13, 10, 11, -1, -5,-11,-24,-12,  6;
/M: SY='L'; M= -6,-20,-21,-21,-13,  3,-25,-11, 11,-17, 13,  8,-19,-23,-13,-16,-12, -5,  9,-15,  9,-14;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-18,-28,-17,  2,-30,-21, 18,-23, 30, 13,-24,-26,-17,-15,-23, -9, 13,-22, -4,-18;
/M: SY='E'; M=-12,  9,-31, 15, 26,-31,-17, -2,-28,  9,-24,-17,  3,  8, 15,  5, -3, -9,-28,-29,-19, 19;
/M: SY='D'; M= -5,  8,-22, 11,  6,-23, -6, -4,-19, -7,-19,-15,  4,-13, -3,-11,  5, -1,-12,-32,-16,  1;
/M: SY='L'; M= -7,-23,-21,-24,-19,  2,-29,-22, 20,-24, 30, 14,-23,-26,-19,-20,-22, -8, 15,-23, -4,-20;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 37 in 37 different sequences
Number of true positive hits 37 in 37 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Rap-GAP
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
37 sequences

GARL3_CHICK (Q5ZJY3), GARL3_DANRE (A5PF44), GARL3_HUMAN (Q5VVW2), 
GARL3_MOUSE (Q3V0G7), RGAP1_DICDI (Q75J96), RGAPB_DICDI (Q54SS8), 
RGPA1_HUMAN (Q6GYQ0), RGPA1_MOUSE (Q6GYP7), RGPA1_RAT   (O55007), 
RGPA2_HUMAN (Q2PPJ7), RGPA2_MOUSE (A3KGS3), RGPA2_RAT   (P86411), 
RLGPB_HUMAN (Q86X10), RLGPB_MOUSE (Q8BQZ4), RLGPB_RAT   (P86410), 
RPGP1_HUMAN (P47736), RPGP1_MOUSE (A2ALS5), RPGP2_CHICK (Q5ZMV8), 
RPGP2_HUMAN (Q684P5), RPGP2_MOUSE (Q5SVL6), SI1L1_HUMAN (O43166), 
SI1L1_MOUSE (Q8C0T5), SI1L1_RAT   (O35412), SI1L2_HUMAN (Q9P2F8), 
SI1L2_MOUSE (Q80TE4), SI1L2_RAT   (Q5JCS6), SI1L3_HUMAN (O60292), 
SIPA1_HUMAN (Q96FS4), SIPA1_MOUSE (P46062), TSC2_HUMAN  (P49815), 
TSC2_MOUSE  (Q61037), TSC2_RAT    (P49816), TSC2_SCHPO  (Q9UUG9), 
Y1510_DICDI (Q54EH3), Y1806_DICDI (Q55AN8), Y1809_DICDI (Q54TK4), 
Y5521_DROME (Q9VB98)
» More

PDB
[Detailed view]
2 PDB

1SRQ; 3BRW

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission