Entry: PS50104

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] TIR
Accession [info] PS50104
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50104
Associated ProRule [info] PRU00204

Name and characterization of the entry

Description [info] TIR domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=144;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=139;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6942; R2=0.01810583; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5319.19965; R2=34.26215; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=431; N_SCORE=8.5; H_SCORE=18202; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=320; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16317; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K'; M=-10, -7,-26, -7,  2,-19,-21,-11,-16, 21,-13, -5, -6,-16,  3, 16,-11, -8,-10,-18, -9,  2;
/M: SY='R'; M= -8, -9,-24, -9,  4,-15,-20,-11,-10,  2, -3, -4, -7,-15,  1,  6, -5,  0, -9,-24,-10,  2;
/M: SY='Y'; M=-19,-22,-29,-24,-21, 35,-28,  8, -2,-14, -1, -2,-20,-29,-14,-12,-20,-11,-10, 32, 63,-20;
/M: SY='D'; M=-19, 45,-29, 63, 20,-38,-10,  4,-39,  0,-29,-28, 19,-10,  1, -9,  1, -9,-29,-39,-18, 10;
/M: SY='A'; M= 28,-17,-12,-23,-16,-13, -9,-23,  4,-14, -3, -3,-16,-17,-16,-20,  2, -2, 15,-23,-16,-16;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-32,-26, 59,-30, -9,  1,-24,  7,  0,-19,-29,-30,-17,-20,-10, -2, 13, 42,-26;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-31,-23, -1,-32,-26, 27,-25, 18, 12,-25,-11,-22,-23,-18, -7, 23,-24, -7,-25;
/M: SY='S'; M=  3, -9, -3,-12, -9,-13,-12,-15, -7,-17, -9, -9, -2,-16, -9,-16, 14,  7, -4,-34,-16,-10;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-26,-27,-23, 48,-30,  7, -1,-18,  3,  0,-19,-30,-21,-14,-20,-10, -7, 19, 57,-23;
/M: SY='S'; M= -2, -9,-15, -9, -3,-21,-14,-11,-19, -4,-20,-13, -4,  5,  0,  2,  8,  3,-15,-31,-18, -3;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -2, -4,-11, -4, -4,-16, 17, -8,-18, -6,-15, -9, -1,-10, -3, -5,  2, -7,-13,-15,-14, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M:         M= -4, -3,-14, -5, -1, -5, -9, -7, -9, -3, -8, -7,  0, -5, -5,  0, -1,  0, -7,-16, -7, -3; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-10, 14,-27, 22,  7,-28, -6, 13,-29, -5,-25,-18,  7, -5, -1, -9,  2, -8,-24,-31,-11,  1;
/M: SY='T'; M= -3,  0,-20,  0,  3,-19,-17, -8,-15,  5,-17,-10, -1,-13,  0, -1,  4,  6, -6,-27,-10,  1;
/M: SY='D'; M=-14, 10,-23, 18,  8,-25,-17, -5,-25,  6,-18,-15,  3,-16,  1, 15, -3, -7,-15,-31,-15,  3;
/M: SY='E'; M=-13,  8,-29, 14, 18,-23,-19, 12,-23,  5,-19,-12,  2,-11, 10,  0, -4, -8,-22,-24, -2, 13;
/M: SY='T'; M= -1,  5,-19,  0,  3,-15,-15, -8,-14, -4,-16,-11,  6,-12,  1, -7,  8, 10,-12,-26, -9,  2;
/M: SY='F'; M=-18,-31,-23,-39,-29, 63,-30,-21,  3,-29, 14,  2,-23,-30,-35,-20,-23,-12,  0, 15, 25,-28;
/M: SY='V'; M=  2,-23, -9,-26,-24, -3,-23,-26, 16,-20, 10,  5,-22,-25,-23,-19, -7,  5, 28,-28,-10,-24;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-16,  0,  5,-13,-18, -6,-15, -7, -8, -9, -4,-16, -2, -6, -1, -4,-11,-28,-10,  2;
/I:         I=-6; MD=-33;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-15,  3,  7,-12, -9,  5,-12,  7,-10, -5,  5, -8,  6,  6, -3, -5,-13,-14, -4,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='H'; M=-12, -4,-25, -6,  4,-12,-22, 14,-10, -6, -9, -4,  0,-16,  0, -1, -5, -4,-11,-25,  0,  0;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21, 11,-30,-20, 22,-29, 45, 21,-28,-29,-20,-20,-28,-10, 11,-19,  1,-21;
/M: SY='Y'; M= -6,-22,-26,-22,-15, -3,-25,-13,  4,-12, -2, -1,-20,  3,-14,-11,-13, -7,  2,-14,  5,-18;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-30,  6, 21,-28,-14, -7,-26, 11,-22,-16, -3,  6,  7,  7, -4,-10,-23,-26,-18, 12;
/M: SY='V'; M=  4,-11,-18,-13, -4,-13,-19,-14,  1, -7, -6, -2, -9,-18, -3, -8, -2, -3,  8,-26,-12, -4;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 11,-30,-20, 20,-30, 49, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-19,  1,-20;
/M: SY='E'; M=-11, 13,-23, 20, 38,-28,-18, -2,-27,  7,-20,-19,  5, -7, 11,  0, -1, -9,-24,-32,-19, 24;
/M: SY='R'; M=-15,  3,-29,  4,  7,-26,-12, 16,-30, 17,-24,-11,  8,-16, 10, 25, -6,-12,-25,-25, -8,  6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='Q'; M= -8,  3,-19,  6,  8,-19,-11,  1,-15,  7,-14, -7,  1, -1, 12,  7, -3, -6,-14,-17, -9,  9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-30;
/M: SY='P'; M=-12,-13, -6,-12, -1, -7,-23,-10,-19, -3,-17,-11,-11,  1, -3, -3, -8, -9,-18,-19, -5, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-30;
/M: SY='G'; M= -5, -7,-28, -6, -4,-23, 15,-13,-29,  0,-27,-16,  0, -3, -5,  0,  1, -9,-23,-24,-20, -5;
/M: SY='Y'; M=-15,-26,-25,-31,-25, 28,-32, -9, 17,-22, 13, 10,-22,-27,-21,-19,-20, -9, 10,  2, 32,-25;
/M: SY='K'; M=-12,  5,-28,  2,  7,-27,-16,  5,-26, 25,-25, -9, 11,-14, 17, 25, -4, -7,-24,-24,-10, 11;
/M: SY='L'; M= -6,-23,-17,-26,-19,  4,-28,-22, 15,-24, 30, 12,-23,-25,-19,-18,-15,  5, 13,-24, -4,-19;
/M: SY='C'; M=-15,-26, 43,-35,-30, 26,-29,-24,-14,-29, -5, -8,-21,-34,-32,-24,-17,-11, -6,-10,  1,-29;
/M: SY='I'; M=-11,-19,-24,-26,-20,  2,-28,-17, 19,-16, 11, 13,-12,-23,-14,-11,-16, -8, 12,-21, -2,-18;
/M: SY='H'; M=-18, 11,-24, 16,  0, -5,-18, 19,-24, -9,-17,-13,  5,-19, -4, -9, -6,-10,-21,-20,  9, -3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D'; M=-10,  9,-24, 14,  5,-19,  2, -2,-22, -4,-16,-14,  4,-14, -1, -6, -3,-10,-19,-19, -7,  1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-18, -1,-29,  1,  5,-23,-19, 10,-28, 19,-21,-11,  4,-18, 10, 43, -7,-10,-21,-24, -9,  4;
/M: SY='D'; M=-15, 29,-28, 40, 13,-33, -1, -4,-34, -1,-26,-24, 14,-13, -2, -5,  0,-10,-25,-34,-20,  5;
/M: SY='L'; M=-12,-17,-26,-18,-13,  4,-26,-15,  7,-19,  8,  5,-17,-22,-15,-18,-17,-10,  3, -4,  2,-14;
/M: SY='L'; M=-11,-15,-25,-12,  0, -2,-26,-10, -1,-13,  6, -1,-17, -8,-10,-12,-15, -9, -3,-20, -2, -6;
/M: SY='P'; M= -7,-16,-29,-13, -6,-20,-18, -8,-15,  2,-18,-10,-12, 18, -6,  5, -9, -9,-11,-25,-14, -9;
/M: SY='G'; M=  0, -4,-26, -4,-12,-29, 47,-15,-35,-15,-29,-19,  4,-17,-10,-15,  7,-11,-26,-25,-26,-11;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-16, -1,  6,-27, -5, -3,-25,  3,-20,-12, -2,-14,  6,  1, -1, -7,-19,-26,-16,  5;
/M: SY='S'; M=  1, -2,-14, -3,  1,-13,-16,-10,-13, -6,-14,-11, -3,-13, -5,-11,  4,  2, -9,-24, -7, -2;
/M: SY='I'; M= -6,-26,-23,-33,-26,  1,-33,-22, 33,-25, 15, 16,-20,-22,-20,-24,-15, -5, 27,-22, -2,-26;
/M: SY='A'; M=  9,-13,-21,-15,-11,-17, -7,-19, -8,-11,-12, -8,-11, -4,-10,-14,  0, -1, -4,-17,-15,-11;
/M: SY='E'; M= -6,  6,-27, 13, 15,-28,-12, -5,-25, -1,-24,-18,  1, 10,  3, -6,  3, -4,-22,-31,-19,  8;
/M: SY='S'; M= -1, -1,-14, -4,  3,-17,-16,-11, -8, -8,-13,-10,  3,-11, -5,-11,  4,  1, -4,-32,-17, -2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28;
/M: SY='I'; M= -4,-25,-20,-29,-22,  2,-30,-24, 25,-25, 24, 13,-21,-23,-19,-21,-16, -2, 19,-21, -3,-22; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-28;
/M: SY='V'; M= -8,-11,-18,-13,-13, -7,-21, -9,  5,-16,  3,  2, -8,-21,-13,-15, -9, -4,  6,-27, -7,-14;
/M: SY='E'; M= -5,  1,-24,  4, 24,-25,-16, -4,-23,  8,-19,-13,  0, -8, 15,  7,  6,  0,-20,-28,-15, 19;
/M: SY='A'; M= 21, -6,-11,-13,-10,-15,  2,-15,-14,-12,-11,-11, -1,-16,-11,-15,  7, -1, -8,-25,-17,-10;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-24,-36,-28,  1,-34,-27, 39,-26, 16, 18,-21,-21,-21,-26,-16, -7, 29,-21, -2,-27;
/M: SY='E'; M= -9,  5,-29, 10, 29,-29,-18,  4,-29, 17,-22,-14,  1, -8, 16, 14, -3,-10,-25,-26,-13, 22;
/M: SY='E'; M= -7, 13,-27, 17, 19,-29,-15, -4,-26, 13,-21,-15,  7,-10, 10,  5, -1, -7,-22,-29,-15, 14;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='S'; M= 12, -3,  3, -5, -4,-20, -3,-13,-20,-12,-27,-19,  5,-13, -4,-13, 32, 15, -9,-39,-21, -4;
/M: SY='R'; M=-13,-10,-27,-11, -2,-18,-19, -3,-24, 22,-18, -9, -3,-19,  7, 50, -7, -7,-14,-20, -8, -2;
/M: SY='R'; M= -8,-15,-27,-19, -9,-13,-24,-12, -5, 10, -8, -1, -7,-18, -2, 26,-11, -9, -3,-19, -7, -9;
/M: SY='T'; M= -1,-15,-16,-18,-13, -3,-19,-14,  4,-17,  4,  2,-11,-19,-10,-14,  3,  6,  5,-24, -4,-12;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-29,  1,-36,-28, 41,-26, 19, 18,-24,-24,-22,-26,-18, -7, 34,-23, -3,-29;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-19,-33,-27,  5,-32,-27, 30,-23, 14, 13,-25,-20,-25,-23,-15, -5, 32,-23, -4,-27;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-18,-33,-29,  1,-33,-29, 36,-24, 18, 14,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 39,-26, -6,-29;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-32,-24, 19,-30,-21, 21,-28, 35, 17,-27,-29,-24,-20,-24, -9, 15,-17,  3,-23;
/M: SY='S'; M= 11, -4,-10, -5, -5,-17, -5,-14,-13,-11,-23,-15,  3,-12, -5,-12, 31, 19, -2,-37,-18, -5;
/M: SY='P'; M=-12, -2,-32,  3, 11,-29,-19, -8,-26, 14,-26,-15, -4, 17,  8, 13, -5, -8,-25,-26,-18,  7;
/M: SY='N'; M=-11, 31,-23, 23,  8,-24, -1, 12,-26, -1,-28,-20, 39,-16,  2, -3,  7, -4,-29,-37,-18,  4;
/M: SY='Y'; M=-17,-21,-25,-25,-21, 34,-28,  4,  1,-15,  4,  4,-19,-24,-16,-13,-17, -6, -5, 13, 49,-20;
/M: SY='A'; M= 14,-18,-16,-24,-17, -9,-13,-19,  8,-17,  5,  8,-15,-18,-13,-19, -3, -3, 10,-23,-11,-16;
/M: SY='S'; M= -1,  3,-17,  1,  1,-24, -3, -3,-22, -2,-22,-13,  8,-14,  6, -2, 11,  1,-18,-30,-16,  3;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-12, -6, -4, -6, -6,-10,-16,-11,-21,-15,  4,-12, -3,-10, 27, 16, -8,-29,-10, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-21,  2,  9,-21,-13, -2,-23,  5,-21,-14,  5,-11,  3,  5,  9,  8,-16,-30,-13,  5;
/M: SY='W'; M=-17,-28,-39,-28,-15,  1,-19,-23,-19,-12,-17,-16,-28,-24,-11,-14,-29,-23,-25, 90, 16,-10;
/M: SY='C'; M= -2,-15, 56,-24,-22,-13,-20,-23,-19,-23,-10,-12,-13,-31,-22,-21, -7, -7, -7,-37,-21,-22;
/M: SY='L'; M=-10,-16,-24,-16, -9, -7,-19, -9, -4, -8, 14,  4,-14,-23, -8,  5,-18,-11, -5,-22, -6,-10;
/M: SY='B'; M=-14,  4,-25,  4, -3, -1,-17, -3,-10, -9, -6, -3,  2,-19, -6, -9, -8, -8,-13,-19,  2, -5;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-28, 15, 50,-28,-19, -1,-27,  7,-18,-18, -1, -2, 19, -1,  2, -8,-27,-30,-19, 34;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-19,-25,-16, 18,-26,-16,  7,-23, 24,  8,-20,-25,-17,-16,-16, -3,  2,-15,  5,-16;
/M: SY='R'; M=  0, -9,-22, -8,  6,-17,-19,-11,-11,  6,-10, -6,-10,-15,  0,  7, -5, -6, -3,-23,-11,  2;
/I:         I=-5; MD=-26;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-22, -6, 11,-10,-18,-10, -9, -1, -8, -5, -4,-12,  0, -6, -2, -5,-10,-23,-10,  5; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26;
/M: SY='A'; M= 23, -9,-13,-14, -7,-14,  0,-12, -5,-10, -7, -5, -7, -9, -8,-15,  3, -4, -2,-16,-13, -8; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-26;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-17,-26,-19,  1,-29, -6, 15,-21, 18, 12,-19,-24,-14,-17,-19,-10, 11,-22,  1,-18; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-26;
/M: SY='H'; M=-15, -8, -9, -9, -6,-10,-22, 29,-19, -5,-14, -5, -4,-22, -1,  4, -8, -9,-15,-19, 13, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-26;
/M: SY='E'; M= -6,  8,-25,  7, 10,-21,-12,  2,-22,  3,-20,-14, 10,-13,  4,  0,  0, -6,-22,-15,-10,  7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-26;
/M: SY='A'; M= 11,-11, -2,-17, -8,-18,-14,-14,-11, -4, -8, -3,-10,-17, -3, -6,  0, -2, -5,-26,-15, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-17,-23,-16, -6,  0,-24,-15, -2,-10, 14,  3,-17,-16,-11, -8,-16, -8, -4,-20, -4, -9;
/M:         M= -7, -5,-19, -7, -2,-16,-16, -9, -7, -4, -9, -6, -1,-18, -5, -3, -3, -4, -5,-29,-12, -5;
/M: SY='Q'; M= -6, 10,-25, 13, 14,-29, -8, -1,-25,  3,-23,-15,  6,-11, 15,  2,  4, -6,-23,-28,-15, 14;
/M:         M=-11, -7,-25, -7, -6,-11, -7, -7,-13,-10, -1, -1, -6,-17, -5, -4,-10, -9,-13,-20, -9, -6;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-20, -3, -5,-26, 12,-11,-28,  2,-24,-15,  4,-17, -4,  4,  0, -8,-20,-25,-20, -5;
/M: SY='Q'; M= -7, -7,-21,-12, -4,-18,-16, -7, -8,  1,-12, -1, -1,-16,  9,  5, -3, -7,-10,-23,-10,  1;
/M: SY='R'; M=-11, -8,-27,-10, -1,-18,-18, -9,-14, 16,-13, -2, -3,-13,  2, 21, -9, -7,-12,-22,-10, -2;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-18,-33,-27,  5,-32,-26, 31,-25, 22, 17,-26,-27,-24,-22,-18, -6, 32,-23, -3,-27;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-25,-36,-28,  0,-32,-26, 39,-26, 19, 21,-22,-22,-20,-26,-19, -9, 27,-21, -3,-27;
/M: SY='P'; M= -8,-24,-26,-22,-14, -6,-25,-21,  5,-19,  6,  3,-23, 16,-17,-19,-15, -5,  1,-25,-12,-18;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-23,-36,-29,  1,-36,-29, 41,-27, 19, 17,-24,-24,-23,-26,-17, -7, 35,-23, -3,-29;
/M: SY='F'; M=-14,-15,-25,-16,  2, 20,-27,-12, -5,-11,  2, -3,-14,-19,-11,-11,-14,-10, -7,-10,  8, -3;
/M: SY='Y'; M=-16,-20,-27,-21,-15, 20,-25,  5,  2,-15, 11,  5,-20,-27,-12,-13,-20,-10, -6,  9, 44,-16;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-26,  8, 18,-27, -4, -4,-26,  4,-22,-13,  1, -5,  6, -3,  2, -4,-22,-28,-17, 12;
/M: SY='V'; M= -1,-10,-20, -9, -7,-16,-19,-17, -4, -2,-11, -4,-10, -6,-10, -6, -2, -1,  5,-29,-15, -9;
/M: SY='V'; M= -8, -2,-18, -1, -9,-15,-19,-16,  3,-14, -4, -1, -6,-19,-13,-17, -8, -7,  6,-30,-13,-12;
/M: SY='P'; M= -7, -9,-31, -5,  5,-27,-10,-14,-23,  3,-25,-15, -8, 30,  0, -6, -3, -5,-24,-27,-21,  1;
/M: SY='D'; M= -5, 14,-19, 18, 10,-29, -7, -5,-28,  3,-27,-19, 10, -8,  5, -2, 10, -1,-22,-34,-19,  7;
/M: SY='H'; M=-13,  1,-27,  4,  4, -8,-21,  9,-14, -4,-10, -6, -4,-17, -2, -5, -8, -8,-13,-17,  9, -1;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='V'; M=  3, -8,-13, -7, -4,-11,-17,-16,  1,-10, -4, -5,-10,-15,-11,-12,  3,  5, 11,-27,-12, -8; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='L'; M= -3, -7,-13, -8, -5, -3,-14,-10,  1, -5,  8,  2, -8,-13, -7, -6, -9, -3,  0,-14, -4, -6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-25;
/M: SY='R'; M=-15, -3,-27, -1,  0,-16,-20, -5,-16,  9,-12, -1, -5,-12,  2, 19,-10, -9,-12,-24,-10, -1;
/M: SY='P'; M= -7,  0,-29,  3,  7,-28,-16, -5,-24,  9,-27,-15,  0, 20,  3, -1, -1, -5,-23,-29,-17,  3;
/M: SY='Q'; M= -8,  6,-27, 11, 28,-32,-17,  1,-22,  4,-20,-11,  2, -7, 29,  0,  5, -6,-24,-28,-15, 28;
/M: SY='T'; M= -4,-12,-19,-16,-13, -7,-16,-15,  3,-14,  3,  1, -7,-19,-11,-13,  0,  5,  2,-25, -6,-13;
/M: SY='G'; M= -8, -7,-28, -8, -5,-21,  4, -9,-17, -1,-15, -8, -1,-17, -3,  2, -6,-12,-15,-23,-14, -6;
/M: SY='E'; M= -7, -8,-24, -6,  6,-23,-16, -3,-21,  5,-16, -9, -6,  2,  5,  6, -6, -8,-20,-25,-14,  4;
/M: SY='Y'; M=-15,-26,-25,-30,-24, 40,-29, -5,  4,-21, 11,  3,-22,-29,-22,-16,-21,-10, -3, 16, 42,-23;
/M: SY='M'; M= -7,-17,-25,-19,-11,-11,-13,-17,  2, -6,  3,  6,-14,-20,-10, -4,-14,-10,  2,-22, -9,-12;
/M: SY='K'; M= -8,  0,-26,  1,  7,-25,-17, -9,-25, 27,-22, -9,  0,-12,  6, 21, -3, -3,-16,-24,-12,  6;
/M: SY='V'; M=  0, -7,-19, -8, -8,-12,-18,-12, -1,-11, -3,  1, -9,-17, -2,-12, -1,  1,  2,-25, -8, -5;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='F'; M=-12,-13,-14,-19,-14, 20,-22, -8, -7, -9, -2, -1, -7,-23,-14, -7,-11, -7, -6,-11,  8,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-29;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-20,  3, 10,-16,-13,  9,-17,  4,-12, -8,  1, -6,  5,  3, -4, -7,-16,-18, -5,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='H'; M= -6, -2,-25, -4, -2,-20,  2,  8,-26, -1,-21,-11,  3,-15, -3, -1,  0, -1,-20,-23, -7, -4;
/M: SY='T'; M=  4,-10,-17,-14, -9, -8,-18,-11, -6, -6,-10, -7, -9,-13, -7, -8,  4, 10,  0,-18,  2,-10;
/M: SY='L'; M= -7,-17, -2,-24,-19, -6,-27,-21,  8,-16,  9,  4,-13,-24,-16,-14,-13, -5,  7,-27, -9,-19;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-21, -3, 12,-23,-19, -4,-23, 15,-19,-11, -4, -8,  6, 16, -4, -8,-17,-26,-13,  8;
/M: SY='W'; M=-17,-22,-28,-22,-17, 10,-22,-19,-16,-14,-12,-13,-23,-26,-17,-11,-23,-16,-18, 58, 16,-15;
/M: SY='S'; M= -3,  2,-18,  4,  2,-26, -3, -9,-27,  5,-26,-17,  3, -9, -1,  2,  7,  0,-18,-30,-17, -1;
/M: SY='E'; M= -6,  5,-29, 11, 13,-30,  6, -6,-31,  0,-25,-19,  1,  1, -1, -7, -1,-10,-26,-28,-21,  5;
/M: SY='E'; M=-10, 14,-29, 24, 27,-31,-15, -4,-29,  6,-24,-19,  4,  3,  9, -1,  1, -7,-25,-32,-19, 17;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E'; M=  1,  1,-14,  3,  4,-12, -5, -5,-10, -2, -7, -4, -3, -3, -1, -6, -2, -5, -9,-14, -7,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='K'; M= -6,  3,-19,  2,  5,-21,-10, -4,-19, 15,-19, -8,  4, -9, 11, 12,  2,  0,-15,-19,-10,  7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-17,-12, -9,-10,-10,-10, -1, -5, -5, -2, -4,-12, -6, -5,  0,  3,  0,-19, -7, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='R'; M=-15,-10,-30,-11,  0,-19,-21, -2,-17, 12,-13, -4, -5,-18, 17, 24,-11,-11,-19, -4, -2,  7;
/M: SY='F'; M=-18,-16,-23,-23,-14, 35,-24,-11,-12, -6, -5, -6, -7,-24,-18,  9,-12, -8,-10, -6, 11,-15;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30, 10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150, 30,-20;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-24, -4,  2,-21,-18, -9,-18, 21,-19, -5, -1,-14,  3, 18, -4, -4,-10,-24,-12,  2;
/M: SY='R'; M=-12,  6,-27,  2,  6,-25,-13,  2,-25, 18,-24,-11, 12,-15, 12, 22, -2, -6,-22,-26,-12,  7;
/M: SY='L'; M= 16,-20,-15,-24,-14, -5,-17,-21,  7,-19, 17,  5,-21,-21,-16,-19,-10, -4, 10,-22,-10,-15;
/M: SY='R'; M= -8,-19,-23,-21,-11, -7,-23,-11, -2, -3, 11,  7,-15,-23, -4, 15,-16, -9, -2,-20, -6, -9;
/M: SY='Y'; M= -7, -4,-22,-10, -9,  2,-20,  0, -8, -2,-10, -7, -1,-20, -7, -5, -4,  2, -9, -7, 20,-10;
/M: SY='H'; M=  4, -3,-22, -4, -1,-17,-14,  7,-13, -7, -8, -3, -4,-15,  1,-10, -3, -6,-11,-23, -4, -1;
/M: SY='M'; M= -6,-26,-20,-32,-24,  1,-28,-18, 29,-20, 21, 31,-23,-23,-15,-19,-19, -8, 23,-22, -3,-21;
/M: SY='P'; M= -2,-12,-29, -9, -5,-25,  3,-17,-20,-12,-23,-16, -8, 29,-11,-17,  0, -6,-20,-28,-25,-10;
/M: SY='N'; M= -2, 11,-21,  2, -6,-17,-11,  1, -8, -9,-15,-10, 19,-13, -7,-10,  1, -3,-11,-33,-14, -8;
/M: SY='I'; M=-11,-17,-29,-19, -8,-13,-24,-16,  3, -3,  0,  2,-12, -8, -3,  0,-13, -8, -3,-22, -9, -8;
/I:         E1=0;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 134 in 134 different sequences
Number of true positive hits 134 in 134 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 14
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 90.54 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] window20_shuffled
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] TIR
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
134 sequences

I18RA_HUMAN (O95256), I18RA_MOUSE (Q9Z2B1), IL18R_HUMAN (Q13478), 
IL18R_MOUSE (Q61098), IL1AP_HUMAN (Q9NPH3), IL1AP_MACMU (P59822), 
IL1AP_MOUSE (Q61730), IL1AP_RAT   (Q63621), IL1R1_HUMAN (P14778), 
IL1R1_MOUSE (P13504), IL1R1_RAT   (Q02955), ILRL1_HUMAN (Q01638), 
ILRL1_MOUSE (P14719), ILRL1_RAT   (Q62611), ILRL2_HUMAN (Q9HB29), 
ILRL2_MOUSE (Q9ERS7), ILRL2_RAT   (Q62929), IRL1A_DANRE (B6ZK76), 
IRL1B_DANRE (B6ZK77), IRPL1_HUMAN (Q9NZN1), IRPL1_MOUSE (P59823), 
IRPL1_PANTR (P60029), IRPL1_PONPY (Q7YQL9), IRPL1_RAT   (P59824), 
IRPL2_HUMAN (Q9NP60), IRPL2_MOUSE (Q9ERS6), MY88A_XENLA (Q9DF60), 
MY88B_XENLA (Q5FWM2), MYD88_BOVIN (Q599T9), MYD88_CERAT (B6CJX2), 
MYD88_CHICK (A5HNF6), MYD88_DANRE (Q5XJ85), MYD88_GORGO (B3Y680), 
MYD88_HUMAN (Q99836), MYD88_MACFA (B3Y682), MYD88_MACMU (B3Y683), 
MYD88_MOUSE (P22366), MYD88_ONCMY (Q4LBC6), MYD88_PANPA (B3Y679), 
MYD88_PANTR (B3Y678), MYD88_PIG   (A2TF48), MYD88_PONPY (B3Y681), 
MYD88_RAT   (Q6Y1S1), MYD88_SALSA (B3SRQ2), MYD88_SHEEP (C8BKC7), 
MYD88_TAKRU (A8QMS7), MYD88_XENTR (Q28DJ2), P2A05_ARATH (Q9C5Q9), 
P2A06_ARATH (Q9FHE8), P2A08_ARATH (Q9FHE9), RPS4C_ARATH (Q9XGM3), 
RPS4L_ARATH (Q9SCX6), RPS4R_ARATH (Q9SCX7), RPS4W_ARATH (C4B7M7), 
RPS6C_ARATH (F4KHH8), RPS6R_ARATH (P0DKH6), SARM1_CAEEL (Q86DA5), 
SIGIR_HUMAN (Q6IA17), SIGIR_MOUSE (Q9JLZ8), SIGIR_RAT   (Q4V892), 
SNC1_ARATH  (O23530), TCAM2_BOVIN (Q2LGB7), TCAM2_HUMAN (Q86XR7), 
TIRAP_HUMAN (P58753), TIRAP_MOUSE (Q99JY1), TIRA_DICDI  (Q54HT1), 
TIR_ARATH   (Q9SSN3), TLR10_BOVIN (Q6GV17), TLR10_HUMAN (Q9BXR5), 
TLR11_MOUSE (Q6R5P0), TLR12_MOUSE (Q6QNU9), TLR13_MOUSE (Q6R5N8), 
TLR1_HUMAN  (Q15399), TLR1_MOUSE  (Q9EPQ1), TLR21_CHICK (Q9DD78), 
TLR22_CHICK (Q9DGB6), TLR2_BISBI  (B2LT61), TLR2_BOSIN  (B5T267), 
TLR2_BOSTR  (Q2V897), TLR2_BOVIN  (Q95LA9), TLR2_BUBBU  (Q2PZH4), 
TLR2_CANFA  (Q689D1), TLR2_CAPHI  (Q0GC71), TLR2_CAPIB  (B2LT62), 
TLR2_CRIGR  (Q9R1F8), TLR2_GIRCA  (B2LT64), TLR2_GORGO  (B3Y615), 
TLR2_HORSE  (Q6T752), TLR2_HUMAN  (O60603), TLR2_MACFA  (Q95M53), 
TLR2_MACMU  (B3Y618), TLR2_MOUSE  (Q9QUN7), TLR2_PANPA  (B3Y614), 
TLR2_PANTR  (B3Y613), TLR2_SHEEP  (B2LT65), TLR3_BOSTR  (Q0PV50), 
TLR3_BOVIN  (Q5TJ59), TLR3_HUMAN  (O15455), TLR3_MOUSE  (Q99MB1), 
TLR4_BOSTR  (Q2V898), TLR4_BOVIN  (Q9GL65), TLR4_CRIGR  (Q9WV82), 
TLR4_FELCA  (P58727), TLR4_GORGO  (Q8SPE8), TLR4_HORSE  (Q9MYW3), 
TLR4_HUMAN  (O00206), TLR4_MOUSE  (Q9QUK6), TLR4_PANPA  (Q9TTN0), 
TLR4_PAPAN  (Q9TSP2), TLR4_PIG    (Q68Y56), TLR4_PONPY  (Q8SPE9), 
TLR4_RAT    (Q9QX05), TLR5_HUMAN  (O60602), TLR5_MOUSE  (Q9JLF7), 
TLR6_BOVIN  (Q704V6), TLR6_DASNO  (Q0ZUL9), TLR6_HUMAN  (Q9Y2C9), 
TLR6_MOUSE  (Q9EPW9), TLR7_HUMAN  (Q9NYK1), TLR7_MOUSE  (P58681), 
TLR8_HUMAN  (Q9NR97), TLR8_MOUSE  (P58682), TLR9_BOVIN  (Q5I2M5), 
TLR9_CANFA  (Q5I2M8), TLR9_FELCA  (Q5I2M7), TLR9_HUMAN  (Q9NR96), 
TLR9_MOUSE  (Q9EQU3), TLR9_PIG    (Q5I2M3), TLR9_SHEEP  (Q5I2M4), 
TMVRN_NICGU (Q40392), TOLL_DROME  (P08953), VAP14_ARATH (Q9SYC9), 
VICTR_ARATH (F4KHI3), Y4117_ARATH (O82500)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
14 sequences

P2A07_ARATH (Q9FHE5), SARM1_DROME (Q6IDD9), SARM1_HUMAN (Q6SZW1), 
SARM1_MOUSE (Q6PDS3), SARM1_PIG   (I3L5V6), TCAM1_BOVIN (Q4JF29), 
TCAM1_HUMAN (Q8IUC6), TCAM1_MOUSE (Q80UF7), TCAM2_MOUSE (Q8BJQ4), 
WR52C_ARATH (P0DKH5), WR52N_ARATH (E1B328), WR52R_ARATH (C4B7M6), 
WR52W_ARATH (C4B7M5), WRK16_ARATH (Q9FL92)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission