Entry: PS50132

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RGS
Accession [info] PS50132
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50132
Associated ProRule [info] PRU00171

Name and characterization of the entry

Description [info] RGS domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=120;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=115;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.0460; R2=.02222375; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4151.31166; R2=27.57170; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=380; N_SCORE=8.5; H_SCORE=13388; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=290; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12147; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='S'; M=  3,  1,-16, -3, -3,-18, -9,-10,-16,  0,-22,-14,  9,-12, -1, -1, 19, 14,-10,-33,-15, -3;
/M: SY='F'; M=-16,-29,-12,-36,-26, 47,-30,-21,  6,-30, 24,  7,-24,-31,-32,-21,-23,-10,  3, -5, 15,-26;
/M: SY='D'; M= -7, 24,-27, 33, 29,-31,-12,  3,-31,  2,-23,-22, 11, -7,  7, -6,  1, -9,-26,-33,-18, 17;
/M: SY='K'; M=-11,  7,-27,  6,  7,-22,-13,  2,-26, 17,-23,-13,  8,-14,  4, 12, -3, -4,-21,-23, -5,  5;
/M: SY='I'; M= -9,-26,-23,-31,-24,  3,-32,-24, 31,-27, 29, 17,-21,-26,-20,-23,-21, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-20,-32,-22, 25,-29,-17, 15,-27, 36, 21,-26,-29,-22,-19,-26,-10,  8,-13,  7,-21;
/M: SY='K'; M= -1,  3,-23, -2,  2,-23,-10, -4,-19, 10,-22,-11,  9,-14,  4,  8,  3, -2,-16,-27,-14,  2;
/M: SY='Q'; M=-12, 13,-26, 17, 12,-29,-15,  9,-23,  3,-22,-11,  9,-13, 21,  0,  1, -7,-23,-29,-11, 16;
/M: SY='P'; M= -8, -8,-31, -3,  3,-28,-17, -7,-22,  7,-26,-14, -7, 27,  3,  1, -3, -7,-21,-28,-18,  1;
/M: SY='I'; M=  1,-17,-22,-22,-17, -7,-18,-19, 10,-17,  5,  3,-12,-14,-14,-18, -7, -3,  6,-23, -7,-17;
/M: SY='G'; M=  1,-14,-27,-15,-19,-22, 46,-19,-26,-20,-14, -9, -6,-21,-18,-19, -5,-17,-20,-20,-23,-19;
/M: SY='R'; M=-16,-13,-28,-14, -3, -6,-23, -2,-15, 11, -6, -2, -8,-20,  7, 25,-13,-10,-14,-12,  5,  0;
/M: SY='L'; M= -8,-14,-22,-15, -7, -5,-22, -6, -3, -9, 11,  3,-11,-21, -5, -3,-11, -4, -5,-21, -1, -7;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-16,-24,-18,  7,-26, -9, 10,-23, 26, 10,-22,-27,-16,-17,-18, -5,  6,-16,  9,-18;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 74,-30,-20,  2,-30, 13,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  8, 28,-29;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-27,-12, -3,-16,-17, -2,-19, 15,-13, -5, -4,-18,  6, 31, -9,-10,-15,-19, -7, -1;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-27, 15, 24,-30,-17, -3,-22,  6,-19,-13,  1, -9, 16,  1,  0, -8,-20,-28,-16, 20;
/M: SY='F'; M=-20,-27,-22,-36,-27, 70,-29, -9, -2,-27,  7,  0,-18,-29,-34,-18,-19,-11, -3, 10, 34,-27;
/M: SY='C'; M= -8,-26, 26,-30,-23, -1,-29,-23,  4,-29, 22,  5,-25,-32,-23,-24,-21,-10,  4,-29,-10,-23;
/M: SY='K'; M=-10,  2,-27,  5, 13,-20,-19, -6,-23, 15,-14,-10, -2,-13,  6, 14, -8, -9,-18,-23,-11,  9;
/M: SY='S'; M= -1,  5,-18, -1,  1,-17, -8, -9,-20,  2,-22,-14, 11,-13,  0, -2, 12, 11,-15,-29,-14,  1;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-25,  5, 18,-22,-18,  5,-21,  6,-19,-12,  4,-10,  7,  6,  2, -2,-18,-29,-11, 11;
/M: SY='Y'; M=-12,-12,-26,-11, -5,  4,-23, -4, -5,-15,  1, -4,-11, -6,-11,-14,-11, -8,-10,-15,  7, -9;
/M: SY='S'; M=  0,  1,  5,  0,  6,-25, -8,-12,-26, -6,-23,-18,  1,-15, -1,-10,  9,  0,-17,-34,-21,  2;
/M: SY='E'; M=-10,  2,-26,  9, 20,-21,-17,  3,-17, -5, -6, -9, -4,-13,  5, -7, -6,-10,-17,-29,-11, 12;
/I:         I=-10; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='E'; M=-11,  4,-27, 11, 30,-29,-18, -4,-27,  5,-23,-18,  0, 12, 12,  2, -2, -9,-28,-30,-20, 20;
/M: SY='N'; M= -8, 11, -8,  0, -5,-16,-13,  4,-15, -7,-14,-10, 21,-21,  1, -6,  0, -2,-19,-31,-10, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-16,-33,-24,  0,-33,-24, 29,-26, 24, 17,-24,-25,-18,-23,-20, -8, 22,-23, -4,-23;
/M: SY='E'; M= -5, -1,-26,  1, 15,-25,-18, -4,-21, 12,-14, -8, -3,-12, 15, 11, -4, -8,-19,-24,-13, 14;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-30, 72,-30,-21,  3,-29, 12,  1,-21,-30,-39,-20,-20, -9,  3,  6, 26,-30;
/M: SY='W'; M=-17,-32,-34,-32,-25, 21,-26,-14, -2,-21,  7, -2,-31,-30,-19,-18,-31,-18,-11, 62, 34,-21;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-27,  1, 11,-17,-22, -9, -8, -6, -2, -3, -7,-14,  3, -9, -8, -7,-11,-20, -9,  7;
/M: SY='A'; M= 13,  2,-21,  3, 12,-26, -1, -5,-23, -2,-19,-15, -1, -9,  2, -9,  5, -6,-17,-26,-18,  7;
/M: SY='V'; M= -6,-27, 13,-33,-30, -5,-32,-29, 22,-25,  6,  8,-24,-29,-26,-25,-13, -6, 29,-31,-11,-29;
/M: SY='E'; M= -1,  3,-19,  6, 23,-28,-17, -7,-24, 12,-21,-14, -2, -8, 11,  2,  0, -7,-19,-27,-17, 17;
/M: SY='E'; M=-11, 11,-29, 19, 33,-29,-13, -4,-30, 11,-21,-18,  3, -7, 10,  4, -1, -9,-25,-29,-18, 21;
/M: SY='F'; M=-18,-26,-24,-30,-24, 43,-30, -4,  5,-22, 15,  5,-22,-30,-23,-16,-22,-10, -2, 11, 43,-24;
/M: SY='E'; M=-11,  6,-28,  9, 28,-26,-19, -5,-26, 20,-20,-14,  2, -8, 11, 13, -4, -7,-23,-26,-15, 19;
/M: SY='K'; M= -2, -3,-21, -5, -1,-21,-17,-14,-17, 18,-20, -9, -3,-13, -1, 11,  1,  3, -6,-25,-12, -1;
/M: SY='T'; M= -1, -4,-13, -8,  0,-14,-17, -9,-11, -5, -8, -3, -3,-15,  1, -7,  4,  8, -9,-26, -9,  0;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-28,  4, 10,-13,-19, -8,-19,  3,-15,-10, -5,  2, -1, -2, -7, -8,-18,-22, -8,  3;
/M: SY='D'; M= -8, 16,-15, 17,  1,-22,-12,  2,-20, -8,-20,-16, 15,-15, -4,-10,  9,  6,-16,-36,-14, -2;
/I:         MD=-17;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-19,  0,  8,-14,-13, -1,-11,  0,-10, -7, -3, -1,  3, -4, -2, -5,-11,-17, -6,  4; D=-3;
/I:         I=-4; MI=-5; IM=-5; DM=-17;
/M: SY='E'; M=-11, 21,-28, 28, 29,-33,-14,  5,-30,  6,-23,-18, 11, -8, 17,  1,  1, -9,-28,-31,-17, 23;
/M: SY='E'; M= -8,  8,-26, 13, 17,-26,-17, -7,-23, 14,-17,-11,  0,-10,  5,  4, -5, -8,-17,-28,-14, 11;
/M: SY='R'; M=-10,-16,-23,-17,-10,-11,-23,-12, -5,  6, -2,  3,-11,-21, -4, 20,-10, -4,  2,-23, -8, -9;
/M: SY='E'; M= -3, -4,-24, -3,  2,-20, -7,-12,-16, -3,-15,-11, -2, -3, -5, -5,  0, -5,-13,-29,-18, -2;
/M: SY='E'; M=  1,  7,-12,  6,  8,-24,-14, -2,-20,  0,-19,-14,  4,-14,  1, -6,  2, -4,-14,-31,-15,  4;
/M: SY='R'; M=-12,-12,-10,-15, -7,-10,-23, -6,-15,  9, -7,  0, -9,-21, -4, 11,-13, -7,-10,-21, -3, -7;
/M: SY='A'; M= 20, -9,-17,-12, -8,-22, 12,-18,-17,-10,-18,-13, -5,-14,-10,-15, 10, -2, -7,-25,-21, -9;
/M: SY='R'; M=-10, -2,-26, -1,  7,-23,-18, -6,-25, 19,-19,-11,  0,-14,  8, 30, -3, -2,-17,-24,-12,  5;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-24,  0, 16,-22,-18, -7,-12, -3,-13,-10, -4, -5,  6, -8,  2, -5,-12,-28,-15, 10;
/I:         I=-3; MI=-5; IM=-5; DM=-15; MD=-15;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-27,-38,-28,  2,-38,-28, 44,-29, 25, 21,-22,-22,-20,-28,-21,-10, 27,-20,  0,-28;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-27,-24,-20, 23,-28,  3,  2,-13,  6,  4,-21,-28,-13, -9,-19, -7, -4, 17, 47,-19;
/M: SY='D'; M= -6, 19,-23, 22, 18,-28,-11, -2,-26,  2,-24,-19, 14, -9,  9, -3,  9,  1,-23,-33,-18, 14;
/M: SY='B'; M=  1,  7,-14,  6,  4,-22,-12, -5,-21,  0,-19,-15,  6,-13, -1, -3,  6,  3,-15,-31,-15,  1;
/M: SY='F'; M=-20,-24,-25,-29,-24, 51,-30,  3,  0,-20,  6,  1,-19,-30,-24,-15,-20,-10, -5, 16, 51,-24;
/M: SY='I'; M=-11,-27,-24,-32,-23,  8,-33,-18, 27,-27, 25, 16,-22,-25,-18,-22,-21,-10, 16,-18,  3,-22;
/M: SY='S'; M=  5, -2,-17, -6, -2,-16, -6, -4,-11, -8,-12,  3,  0,-13, -1,-10, 10,  3, -8,-30,-13, -2;
/M: SY='P'; M= -8, -8,-27, -7,  0,-20,-21, -9, -8,  0,-15, -5, -7,  6, -3, -5, -3, -4, -9,-28,-13, -4;
/M: SY='E'; M= -8,  0,-27,  1, 10,-24, -2, -8,-20, -1,-15,-11,  1, -9,  4, -5, -4, -8,-21,-26,-17,  6;
/M: SY='A'; M= 15, -8,-15,-13, -7,-14, -4,-14, -8,-12, -6, -4, -4,-14, -7,-14,  9,  4, -5,-27,-15, -7;
/M: SY='P'; M= -2,-15,-28,-12, -5,-18,-20,-18, -9,-13, -6, -8,-17, 30, -9,-17, -9, -3,-14,-26,-18, -9;
/M: SY='N'; M=  2,  4,-12, -1, -4,-17,-11, -8,-16,  1,-18,-12,  8,-16, -5, -4,  6,  2,-11,-28,-11, -5;
/I:         I=-4; MI=-10; MD=-17; IM=-10;
/M: SY='E'; M= -8, -7, -5, -7,  4, -4,-15, -1,-14, -8, -9, -8, -7, -9, -2, -8, -5, -7,-13,-11, -4,  1; D=-3;
/I:         DM=-17;
/M: SY='V'; M=  3,-16, -7,-20,-12,-12,-21,-19,  4,-16, -1,  1,-13,-14, -9,-18, -1,  0,  5,-28,-13,-12;
/M: SY='H'; M= -4, -7,-21,-10,-10,-12,-17,  4, -4,-13,-11, -5,  0, -9, -8,-12,  3,  0, -4,-29, -6,-11;
/M: SY='N'; M=-11,  1,-25, -3,  1, -6,-19, -8, -7,-10, -8, -7,  6, -7, -4,-11, -5, -6,-14,-25, -9, -2;
/M: SY='L'; M=-13,-11,-23, -9,-15,  6,-26,-14,  7,-19, 13,  5,-15,-24,-18,-17,-17, -9,  6,-19,  4,-16;
/M: SY='S'; M= -5,  0,-24,  4, -1,-19, -3, -1,-25, -8,-26,-17,  2,  5, -5,-11,  9, -2,-20,-30,-15, -4;
/M: SY='R'; M= -4, -4,-18, -4,  1,-21,-15, -3,-24, 11,-23,-12,  0,-11,  4, 14,  2, -4,-17,-26,-12,  1;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='D'; M= -5, 11,-19, 12, 12,-22, -6,  8,-20,  2,-18,-11,  8, -8,  9, -2,  2, -6,-19,-22,-10, 10; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='V'; M=  5,-21,-14,-24,-19, -3,-22,-22, 13,-20, 14,  5,-19,-22,-18,-19, -6,  4, 18,-26, -9,-19;
/M: SY='R'; M=-12,-18,-22,-20,-14, -6,-25,-10,  0,  3, -3,  2,-14,-23, -8, 18,-11, -4,  7,-19,  0,-14;
/M: SY='E'; M=  2,  6,-22,  6, 24,-26,-13, -4,-21,  2,-19,-15,  5, -7, 14, -4,  9,  3,-20,-29,-17, 19;
/M: SY='H'; M= -5, -3,-23, -7, -1,-17,-15,  6, -9, -6,-12, -5,  3,-16,  0, -4,  1, -3, -8,-29, -8, -2;
/M: SY='V'; M= -2,-22,  3,-28,-24, -5,-28,-26, 16,-21,  6,  7,-20,-24,-21,-21, -7,  5, 22,-29,-10,-24;
/M: SY='Q'; M=  2,  2,-21, -1, 12,-24,-13, -5,-17,  1,-18,-11,  5,-10, 13,  1,  7,  2,-16,-27,-15, 12;
/M: SY='S'; M= -3,  4,-22,  4,  4,-23, -8, -6,-21,  2,-20,-13,  4,-13,  7,  0,  8,  3,-17,-27,-12,  5;
/M: SY='H'; M=-13,  2,-27, -3, -2,-17,-10, 17,-19,  3,-17, -7, 11,-18,  1,  8, -5, -8,-19,-25, -3, -3;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-20,-30,-21,  2,-26,-17, 22,-22, 27, 26,-23,-23,-14,-19,-19, -6, 14,-21, -3,-18;
/M: SY='x'; M= -4, -8,-15, -8, -3,-18, -9,-13,-14, -3, -6, -5, -8,-18, -1, -6, -5, -5,-11,-26,-13, -2;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-27, 14, 17,-28,-16,  3,-27, 14,-21,-13,  5,-11, 12, 10, -3, -8,-23,-28,-13, 14;
/I:         MD=-13;
/M: SY='A'; M=  5,  1,-15, -1,  5,-16, -3, -6,-14,  4,-14, -9,  2, -1,  2, -2,  1, -4,-12,-16,-12,  3; D=-3;
/I:         MD=-13;
/M: SY='Q'; M= -5,  3,-17,  2, 10,-20, -5,  1,-16,  6,-15, -7,  5, -7, 17,  6,  2, -4,-17,-16,-10, 13; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='P'; M= -6,-18,-25,-13, -5,-16,-20,-18, -2,-11,-11, -7,-18, 36,-12,-16, -9, -6, -5,-24,-18,-11; D=-3;
/I:         DM=-13;
/M: SY='T'; M= -5, -4, -5, -7, -9,-16,-12,-14,-12,-11,-14,-11, -1, -2,-10,-11,  3,  5, -9,-30,-17,-11; D=-3;
/I:         DM=-13;
/M: SY='R'; M= -3,-10,-23,-10, -3,-19,-16, -7,-13,  4,-17, -6, -6,  3, -1,  5,  0, -3, -9,-25,-13, -4; D=-3;
/I:         DM=-13;
/M: SY='D'; M=-11, 10,-27, 14,  9,-23,-10, -3,-24,  0,-21,-16,  4,-12,  2, -5,  0, -2,-20,-20, -9,  5;
/M: SY='L'; M= -3,-19, -9,-22,-13, -3,-24,-13,  4,-22, 19,  6,-18,-23,-14,-17,-12,  0,  2,-25, -6,-14;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30, 77,-30,-20,  1,-30, 12,  1,-20,-30,-39,-20,-20,-10,  0,  9, 29,-30;
/M: SY='E'; M= -8, 10,-26, 16, 22,-29,-17,  2,-24,  3,-18,-13,  3, -9, 17,  1,  2, -4,-23,-29,-14, 19;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-29,  6, 19,-25,-19,-10,-19, -1,-18,-13, -5, 17,  2, -8, -3, -4,-20,-29,-19,  9;
/M: SY='A'; M= 19,-16, -4,-22,-15, -7,-14,-14, -5,-14, -3, -5,-16,-15,-14,-19, -4, -4,  0,-14,  1,-16;
/M: SY='Q'; M= -4,-12,-23,-16, -5,-16,-24,-10,  3, -7, -3,  3,-10,-16, 10, -8, -4, -1, -2,-20, -4,  1;
/M: SY='R'; M=-11,  4,-25,  4, 13,-22,-18, -1,-22, 12,-17,-11,  5,-12,  8, 15, -2,  0,-19,-27,-12, 10;
/M: SY='E'; M=  0, -4,-22, -3, 14,-21,-17,  6,-15, -3,-10, -7, -4,-12,  8, -4,  0, -6,-13,-27,-10, 10;
/M: SY='I'; M= -3,-25,-12,-32,-27, -3,-32,-27, 29,-23, 10, 13,-21,-23,-21,-23,-11, -1, 29,-26, -7,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-18,  3,-21,-16, 13,-28, 10,-11,-16, -3, -4,-15,-29,-14,-11,-16,-11,-11, -7, 26,-17;
/M: SY='E'; M= -8,  5,-18,  4, 10,-21,-17, -5,-23,  6,-19,-12,  3,-13, 10,  6,  2,  1,-19,-26,-12, 10;
/M: SY='L'; M=-11,-17,-23,-18,-13,  3,-25, -1,  4,-15, 17,  7,-14,-26, -7, -8,-17, -8, -2,-14, 12,-11;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-20,-30,-20,  6,-26,-12, 20,-22, 37, 37,-26,-26,-12,-16,-26,-10, 10,-20,  0,-16;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-25, -2,  7,-23,-11,  4,-26, 13,-22,-12,  5,-14,  8, 21,  1, -4,-20,-26,-12,  6;
/M: SY='G'; M= -6,  8,-25,  6, -5,-26, 17, -7,-28, -3,-26,-17, 15,-18, -4, -1,  4, -8,-22,-29,-21, -5;
/M: SY='D'; M= -7, 32,-26, 43, 17,-34,-10, -4,-33,  4,-26,-24, 13, -9,  1, -6,  1, -8,-24,-34,-19,  9;
/M: SY='P'; M= -1,-12,-23,-10, -5,-18,-15,-14, -9,-12,-21,-12, -7, 18, -5,-15, 10,  3,-10,-30,-15, -7;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-23,-32,-26, 53,-30, -8,  3,-23, 11,  3,-22,-30,-28,-17,-21,-10,  0, 11, 41,-26;
/M: SY='P'; M= -3, -9,-28, -7,  6,-27,-18, -1,-17,  0,-19, -8, -8, 15, 13, -4, -3, -8,-20,-25,-15,  8;
/M: SY='R'; M=-15,  3,-30,  7, 16,-27,-19, -3,-31, 29,-24,-14,  2,-12, 11, 36, -7,-10,-23,-24,-13, 12;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29, 73,-30,-14,  0,-27,  9,  0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 13, 37,-29;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-21,-27,-17,  3,-27,-17, 15,-22, 33, 17,-23,-25,-13,-14,-22, -6,  7,-21, -2,-16;
/M: SY='E'; M= -9, 10,-28, 16, 29,-30,-17, -2,-29, 13,-22,-16,  3, -8, 16, 11,  0, -7,-25,-28,-16, 21;
/M: SY='S'; M=  7,  2,-12,  3,  0,-20, -2,-10,-21, -8,-28,-20, 10,-10,  0, -8, 35, 19,-11,-39,-19,  0;
/M: SY='D'; M=-10,  7,-26, 11,  8,-21,-16, -5,-12, -7,-13, -7,  2, -4, -1,-11,  0, -5,-13,-32,-14,  2;
/M: SY='Y'; M=-12,-16,-26,-19,-13,  7,-27, -6,  1, -1, -3,  1,-14,-22, -8, -4,-13, -6, -2, -4, 22,-12;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-25,-29,-24, 51,-29,  1, -1,-19,  4, -1,-19,-29,-23,-15,-18, -9, -5, 19, 55,-24;
/M: SY='H'; M= -9, -1,-22, -4, -3,-16,-19,  4,-14,  0,-10, -5,  2,-16,  0,  2, -1,  4,-12,-28, -6, -2;
/M: SY='R'; M=-10, 10,-26, 11,  8,-25,-12, -2,-28, 12,-22,-16,  9,-15,  7, 24, -1, -5,-22,-27,-15,  5;
/M: SY='F'; M=-11,-27,-20,-33,-25, 42,-28,-17,  7,-25, 16,  5,-21,-28,-28,-19,-18, -7,  5, -1, 21,-25;
/M: SY='L'; M= -7,-25, 14,-28,-21, -1,-27,-21,  6,-27, 24,  9,-24,-30,-20,-21,-18, -7,  6,-29, -9,-21;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 172 in 164 different sequences
Number of true positive hits 172 in 164 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.29 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] RGS
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
164 sequences

AKA10_HUMAN (O43572), AKA10_MOUSE (O88845), AKA10_PIG   (P57770), 
ARBK1_BOVIN (P21146), ARBK1_DIDVI (O97627), ARBK1_HUMAN (P25098), 
ARBK1_MESAU (Q64682), ARBK1_MOUSE (Q99MK8), ARBK1_RAT   (P26817), 
ARBK2_BOVIN (P26818), ARBK2_HUMAN (P35626), ARBK2_MOUSE (Q3UYH7), 
ARBK2_RAT   (P26819), ARHGB_HUMAN (O15085), ARHGB_RAT   (Q9ES67), 
AXIN1_CHICK (O42400), AXIN1_DANRE (P57094), AXIN1_HUMAN (O15169), 
AXIN1_MOUSE (O35625), AXIN1_RAT   (O70239), AXIN1_XENLA (Q9YGY0), 
AXIN2_DANRE (P57095), AXIN2_HUMAN (Q9Y2T1), AXIN2_MOUSE (O88566), 
AXIN2_RAT   (O70240), AXLP1_CAEBR (A8XFZ3), AXLP1_CAEEL (Q3LRZ3), 
AXNR_XENLA  (Q9PTP2), AXN_DROME   (Q9V407), EGL10_CAEEL (P49809), 
FLBA_EMENI  (P38093), GPRK1_DROME (P32865), GPRK2_DROME (P32866), 
GRK1_CAEBR  (Q622Z7), GRK1_CAEEL  (Q09537), GRK2_CAEEL  (Q09639), 
GRK4_HUMAN  (P32298), GRK4_MOUSE  (O70291), GRK4_RAT    (P70507), 
GRK5_BOVIN  (P43249), GRK5_HUMAN  (P34947), GRK5_MOUSE  (Q8VEB1), 
GRK5_RAT    (Q62833), GRK6_HUMAN  (P43250), GRK6_MOUSE  (O70293), 
GRK6_RAT    (P97711), GRK7A_DANRE (Q49HM9), GRK7A_XENLA (B6CZ17), 
GRK7B_DANRE (Q1XHL7), GRK7B_XENLA (B6CZ18), GRK7_BOVIN  (Q8WMV0), 
GRK7_HUMAN  (Q8WTQ7), GRK7_PIG    (Q8WP15), GRK7_SPETR  (Q9Z2G7), 
PRY1_CAEBR  (A8XU52), PRY1_CAEEL  (O62090), RCKA_DICDI  (Q54XQ2), 
RGS10_BOVIN (Q2KHW7), RGS10_CAEEL (O45523), RGS10_HUMAN (O43665), 
RGS10_MOUSE (Q9CQE5), RGS10_RAT   (P49806), RGS11_CAEEL (O45524), 
RGS11_HUMAN (O94810), RGS11_MOUSE (Q9Z2H1), RGS12_HUMAN (O14924), 
RGS12_MOUSE (Q8CGE9), RGS12_RAT   (O08774), RGS13_HUMAN (O14921), 
RGS13_MOUSE (Q8K443), RGS14_HUMAN (O43566), RGS14_MOUSE (P97492), 
RGS14_RAT   (O08773), RGS16_BOVIN (O46471), RGS16_HUMAN (O15492), 
RGS16_MOUSE (P97428), RGS16_RAT   (P56700), RGS17_CHICK (Q9PWA0), 
RGS17_HUMAN (Q9UGC6), RGS17_MOUSE (Q9QZB0), RGS18_HUMAN (Q9NS28), 
RGS18_MOUSE (Q99PG4), RGS18_RAT   (Q4L0E8), RGS19_BOVIN (Q08DC7), 
RGS19_HUMAN (P49795), RGS19_MOUSE (Q9CX84), RGS19_RAT   (O70521), 
RGS1_ARATH  (Q8H1F2), RGS1_CAEEL  (P34295), RGS1_HORSE  (Q6RG78), 
RGS1_HUMAN  (Q08116), RGS1_MOUSE  (Q9JL25), RGS1_RAT    (P97844), 
RGS1_SCHPO  (Q09777), RGS1_XENLA  (A1A643), RGS1_XENTR  (Q5M8L6), 
RGS20_BOVIN (P79348), RGS20_CHICK (Q9PWA1), RGS20_HUMAN (O76081), 
RGS20_MOUSE (Q9QZB1), RGS21_HUMAN (Q2M5E4), RGS22_HUMAN (Q8NE09), 
RGS22_MOUSE (G3UYX5), RGS2_BOVIN  (Q0P5H5), RGS2_CAEEL  (P49808), 
RGS2_HUMAN  (P41220), RGS2_MOUSE  (O08849), RGS2_PIG    (Q3S853), 
RGS2_RAT    (Q9JHX0), RGS2_YEAST  (Q99188), RGS3_CAEEL  (Q18312), 
RGS3_HUMAN  (P49796), RGS3_MOUSE  (Q9DC04), RGS3_RAT    (P49797), 
RGS4_BOVIN  (Q29RM9), RGS4_CHICK  (Q7SZC6), RGS4_HUMAN  (P49798), 
RGS4_MACFA  (Q4R525), RGS4_MOUSE  (O08899), RGS4_PONAB  (Q5R747), 
RGS4_RABIT  (Q0R4E4), RGS4_RAT    (P49799), RGS5_BOVIN  (Q3T0T8), 
RGS5_CAEEL  (Q10955), RGS5_HUMAN  (O15539), RGS5_MOUSE  (O08850), 
RGS5_PIG    (Q864Z2), RGS5_RAT    (P49800), RGS6_CAEEL  (Q18563), 
RGS6_HUMAN  (P49758), RGS6_MOUSE  (Q9Z2H2), RGS6_RAT    (P49801), 
RGS7_BOVIN  (O46470), RGS7_CAEEL  (Q8WQC0), RGS7_HUMAN  (P49802), 
RGS7_MOUSE  (O54829), RGS7_RAT    (P49803), RGS8_DANRE  (Q6DGI0), 
RGS8_HUMAN  (P57771), RGS8_MACFA  (Q95K68), RGS8_MOUSE  (Q8BXT1), 
RGS8_RAT    (P49804), RGS9_BOVIN  (O46469), RGS9_CAEEL  (Q23376), 
RGS9_HUMAN  (O75916), RGS9_MOUSE  (O54828), RGS9_RAT    (P49805), 
RGS9_TAMST  (Q80ZD1), RGS_DROME   (Q9VCX1), RK_BOVIN    (P28327), 
RK_HUMAN    (Q15835), RK_MOUSE    (Q9WVL4), RK_RAT      (Q63651), 
ROC10_DICDI (Q6XHA6), SNX12_SCHPO (Q9USN1), SNX13_HUMAN (Q9Y5W8), 
SNX13_MOUSE (Q6PHS6), SNX14_HUMAN (Q9Y5W7), SNX14_MOUSE (Q8BHY8), 
SNX14_PONAB (Q5R903), SNX25_HUMAN (Q9H3E2), SNX25_MOUSE (Q3ZT31), 
SST2_YEAST  (P11972), Y9847_DICDI (Q55GG4)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

RAX1_SCHPO  (Q9P7S8), RAX1_YEAST  (Q08760), RGSL_HUMAN  (A5PLK6)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

RGS11_RAT   (P49807)

		
PDB
[Detailed view]
64 PDB

1AGR; 1CMZ; 1DK8; 1EMU; 1EZT; 1EZY; 1FQI; 1FQJ; 1FQK; 1HTJ; 1OMW; 1YM7; 1ZV4; 2A72; 2ACX; 2AF0; 2BCJ; 2BT2; 2BV1; 2CRP; 2D9J; 2DLR; 2DLV; 2EBZ; 2ES0; 2GTP; 2I59; 2IHB; 2IHD; 2IK8; 2JM5; 2JNU; 2ODE; 2OJ4; 2OWI; 2PBI; 2V4Z; 3C4W; 3C4X; 3C4Y; 3C4Z; 3C50; 3C51; 3C7K; 3C7L; 3CIK; 3CX7; 3CX8; 3KRW; 3KRX; 3NYN; 3NYO; 3PSC; 3PVU; 3PVW; 3QC9; 3T8O; 3UZS; 3UZT; 3V5W; 4EKC; 4EKD; 4L9I; 4MK0
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission