Entry: PS50144

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] MATH
Accession [info] PS50144
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JUN-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50144
Associated ProRule [info] PRU00129

Name and characterization of the entry

Description [info] MATH/TRAF domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=128;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=128;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2110271; R2=0.0255695; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6037.90196; R2=19.92157; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=246; N_SCORE=8.5; H_SCORE=10162; MODE=1; TEXT='R';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=158; N_SCORE=5.8; H_SCORE=8608; MODE=1; TEXT='RR';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -8,  6,-22,  6,  7,-21,-13, -5,-19,  0,-20,-14,  6, -5,  1, -4,  3, -1,-17,-29,-14,  3;
/M:         M= -6, -7,-22,-10,-10, -5,  0,-11,-17,-11,-14,-11, -1,-10,-12,-11, -2, -5,-14,-21,-10,-10;
/M: SY='T'; M= -2, -6,-17, -9, -5,-16,-16,-10,-11,  1,-14, -7, -4,-15, -3, -1,  6,  8, -2,-27,-11, -5;
/M: SY='F'; M=-15,-21,-23,-26,-20, 26,-27,  5,  2,-21, 10,  5,-15,-27,-18,-15,-18,-11, -2, -5, 22,-19;
/M: SY='T'; M= -3,-10,-13,-14,-10,-10,-19,-14, -4,-10, -7, -4, -6,-16, -8, -7,  7, 13,  2,-28, -9,-10;
/M: SY='W'; M=-17,-28,-34,-30,-21, 14,-23, -9,-11,-18, -6, -7,-26,-27,-17,-15,-27,-20,-16, 64, 22,-17;
/M: SY='T'; M= -5, -4,-19, -7, -3,-15,-20,-12,-10,  4,-13, -7, -3,-13, -4,  2,  3, 12, -3,-27, -9, -4;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-23,-33,-27,  6,-34,-26, 33,-25, 16, 15,-21,-23,-22,-24,-16, -6, 27,-20,  0,-26;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-25,  4, 12,-25,-15, -7,-24, 14,-21,-13,  1, -7,  6, 10, -3, -6,-19,-26,-14,  8;
/M: SY='N'; M= -9, 21,-22, 14,  1,-24,  2,  3,-25,  0,-27,-18, 29,-17,  1,  2,  6, -4,-25,-33,-18,  0;
/M: SY='F'; M=-15,-28,-22,-34,-27, 45,-30,-17,  9,-24, 11,  5,-22,-29,-29,-19,-19, -9,  7,  6, 25,-26;
/M: SY='S'; M=  6, -1,-13, -2, -1,-19, -2,-10,-18, -9,-25,-17,  7,-11, -2, -9, 28, 15,-10,-35,-18, -2;
/M: SY='Q'; M= -5,  1,-23, -2,  4,-21,-12, -3,-19,  5,-18, -9,  4,-13,  6,  6,  3,  0,-15,-27,-12,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-22,-17,-25,-16,  8,-27,-16,  8,-17, 18, 10,-20,-25,-15,-11,-17, -6,  6,-18,  0,-16;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='K'; M= -5, -3,-21, -3,  4,-16,-13, -7,-14,  6,-11, -5, -2,-11,  2,  3, -4, -5,-12,-19, -9,  2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -3,  2,-18,  3,  6,-19, -3, -5,-19,  4,-17,-11,  1, -7,  2, -1,  1, -4,-15,-20,-12,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-15,  3,  8,-15, -7, -4,-13,  4,-11, -8,  1, -5,  3,  2,  0, -3,-11,-17,-10,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -3, -6,-15, -7, -2, -9,-14, -6,-11,  0,-12, -6, -4, -6, -2, -1,  0, -2, -9,-18, -5, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Y'; M= -9,-17,-18,-19,-11,  0,-26,-10,  6,-13,  5,  3,-16,-22,-12,-13,-13, -7,  4,-15,  8,-13;
/M: SY='E'; M=-11, -2,-24, -2,  4,-10,-18, -1,-15, -2,-12, -8, -3,-14,  0, -4, -6, -6,-14,-17,  1,  1;
/M: SY='S'; M=  6,  1,-15,  2,  2,-22,  2, -8,-22, -8,-28,-19,  8, -9,  0, -9, 29, 12,-14,-37,-20,  1;
/M: SY='P'; M= -8,  3,-27,  6,  5,-24,-11, -7,-22,  0,-22,-15,  1,  9, -1, -3, -1, -4,-20,-29,-17,  0;
/M: SY='P'; M= -6,-10,-25,-10, -4,-14,-20,-12, -6, -6,-11, -6, -9,  4, -6, -8, -4, -1, -6,-25,-10, -7;
/M: SY='F'; M=-17,-26,-18,-34,-26, 59,-29,-17,  0,-25,  7,  0,-18,-28,-32,-17,-17, -9,  1,  4, 26,-26;
/M:         M= -5,-10,-19,-11, -6, -5,-16, -7, -8, -8, -7, -5, -7,-18, -6, -8,  0,  0, -4,-20,  0, -7;
/M: SY='V'; M=  3,-11,-15,-15,-15,-10,-19,-17,  6,-15, -4, -1, -8,-17,-13,-16,  4,  7, 11,-29,-10,-15;
/M: SY='G'; M= -1, -5,-25, -5,-10,-25, 29,-11,-28,-12,-23,-16,  0,-14,-12,-11,  1,-11,-21,-24,-21,-12;
/M: SY='G'; M= -3,  0,-27,  1, -2,-27, 24,-11,-29, -8,-24,-16,  3,-14, -7, -9,  1,-11,-23,-26,-22, -5;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='Y'; M=-12, -9,-10,-10, -6, -7,-20,  3,-14, -5,-10, -7, -6,-21, -5,  0, -8, -8,-11,-18,  5, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='K'; M= -9,  0,-21, -1,  2,-20, -9,  1,-24,  4,-22,-13,  3, -9,  0,  3, -1, -5,-20,-25, -9,  0;
/M: SY='W'; M=-19,-34,-37,-36,-28, 25,-24,-21,-12,-20,-10,-12,-32,-30,-22,-18,-32,-22,-20, 96, 34,-22;
/M: SY='R'; M=-10, -2,-22, -6, -3,-12,-17,  0,-18,  9,-17, -9,  5,-19,  0, 18, -4, -4,-15,-20, -3, -3;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-22,-32,-24,  4,-31,-23, 28,-26, 25, 17,-24,-24,-20,-22,-20, -8, 20,-20, -1,-24;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='R'; M= -9,-13,-21,-14, -6,-16,-19,-12, -9,  2, -7, -2,-10,-13, -2,  6,-10, -7, -7,-21, -9, -5;
/M: SY='I'; M= -4,-27,-21,-31,-24,  7,-26,-21, 16,-22, 14,  9,-24,-25,-21,-20,-17, -7, 15, -4,  4,-23;
/M: SY='Y'; M=-17,-15,-27,-18,-14, 20,-25, 11, -7, -9, -4, -2,-10,-25, -9, -5,-15,-10,-12, 10, 39,-13;
/M: SY='P'; M= -8,-19,-33,-14, -4,-20,-21,-17, -9,-10,-14, -8,-17, 45, -9,-16,-10, -8,-16,-27,-20,-10;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='K'; M= -8,  7,-22,  4,  4,-21,-13, -3,-19, 11,-20,-10, 10,-14,  5,  8,  0, -4,-17,-24,-11,  4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='G'; M= -2, -9,-20, -9,-12,-17, 28,-13,-19,-11,-16,-10, -3,-13,-12,-11, -2,-10,-14,-16,-17,-12; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='G'; M= -2,  0,-13, -1, -2,-11,  4, -6,-12, -2,-10, -7,  1, -7, -3, -3,  0, -3, -9,-14, -9, -3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='D'; M= -5,  4,-18,  5,  2,-18, -9, -8,-15, -4,-14,-11,  2,-11, -2, -5,  1, -2,-12,-25,-12,  0; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='N'; M= -6,  6,-25,  6,  4,-22, -3, -4,-25,  4,-22,-15,  8,-14,  1,  6,  0, -6,-20,-24,-14,  1;
/M: SY='N'; M= -6,  4,-22,  2,  2,-20, -9, -4,-21,  5,-21,-13,  7,-13,  1,  3,  3, -1,-17,-27,-12,  1;
/M: SY='N'; M= -4,  5,-23,  5,  0,-22, -4, -8,-21,  1,-21,-14,  6,-11, -3, -3,  3, -2,-16,-26,-14, -2;
/M: SY='D'; M=-10, 12,-25, 13,  4,-25,  1, -4,-26,  1,-23,-17, 12,-14, -2, -2,  0, -6,-22,-29,-16,  1;
/M: SY='Y'; M=-12, -9,-22,-12,-10,  6,-18, 14,-13, -9,-10, -5, -3,-22, -6, -6, -8, -9,-15, -6, 19, -9;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-15,-30,-22, 11,-29,-21, 18,-24, 23, 14,-24,-26,-21,-20,-19, -7, 15,-19,  0,-22;
/M: SY='S'; M=  6, -6,-13, -7, -5,-14,  2,-11,-18,-12,-22,-15,  2,-13, -6,-12, 20,  8,-10,-30,-14, -6;
/M: SY='L'; M= -6,-26,-20,-28,-21,  6,-27,-21, 20,-23, 24, 15,-24,-25,-19,-19,-19, -7, 18,-21, -2,-21;
/M: SY='Y'; M=-17,-20,-18,-24,-21, 34,-27,  3, -2,-18,  1, -1,-17,-28,-19,-15,-17, -9, -6, 10, 44,-21;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-19,-30,-21, 11,-29,-20, 20,-27, 35, 16,-27,-28,-20,-20,-23, -8, 14,-19,  1,-21;
/M: SY='H'; M=-10, -3,-17, -3,  3,-15,-16,  5,-17, -3,-12, -7, -1,-18,  2,  0, -4, -7,-15,-25, -5,  1;
/M: SY='C'; M= -6,-21,  9,-24,-20, -7,-25,-19,  3,-20,  5,  2,-18,-25,-17,-17,-12, -6,  7,-27,-10,-19;
/M:         M= -3, -1,-13, -2, -1,-17,-15,-10,-11, -8,-10, -7, -1,-13, -4,-10, -1, -4, -9,-29,-15, -3;
/M: SY='D'; M= -7, 12,-22, 14,  5,-26, -8, -7,-24,  3,-24,-17,  9, -7,  0, -3,  2, -4,-20,-31,-17,  2;
/M: SY='S'; M= -4, -2,-20, -3,  1,-19, -4, -7,-19, -5,-16,-12,  1, -9, -3, -7,  2, -3,-17,-27,-15, -1;
/M: SY='E'; M= -4,  1,-21,  2, 15,-23,-10, -7,-22,  3,-20,-14,  1, -6,  5, -1,  3, -4,-19,-28,-16,  9;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-15, -4, -2,-12,-11, -9,-16, -6,-14,-12,  0,-13, -6, -7,  1, -1,-13,-24,-10, -4;
/M:         M= -6, -2,-19,  0, -2,-14,-17,-10, -8,-11, -3, -7, -4,-14, -7,-12, -3, -2, -8,-28,-10, -5;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-26, -1,  1,-19,-11,-10,-18, -2,-18,-12, -2,  1, -3, -4, -1, -3,-16,-21,-13, -2;
/M:         M= -4, -6,-20, -6, -1,-15,-15,-10,-12, -7,-11, -8, -5, -6, -5, -7,  0, -1, -9,-27,-12, -4;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M= -5, -7,-19, -8, -5,-10,-10,-11, -8, -6, -5, -5, -6, -7, -6, -5, -4, -1, -7,-12, -7, -6; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -2, -3,-20, -3,  1,-19, -1,-11,-18, -1,-15,-10, -2, -9, -3, -5,  0, -3,-14,-19,-13, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='W'; M=-12,-21,-29,-21,-16,  0,-14,-17,-14, -9,-13,-10,-20,-19,-12,-11,-21,-16,-17, 54, 10,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-18, -2, -1,-15,-11,-10,-12, -4,-15,-11, -1, -1, -4, -6,  4,  1, -9,-20,-11, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='F'; M= -9,-15,-11,-18,-12,  4,-20,-10,  0, -9, -2,  0,-11,-15,-11, -5, -9, -6,  1,-12,  2,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='H'; M= -7,  0,-13,  0,  2, -9,-12,  3,-12,  1,-11, -7,  0,-10,  1,  3, -2, -4,-10,-14, -2,  0; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='A'; M= 14,-14, -5,-19,-16,-11,-12,-18, -1,-13, -5, -4,-12,-17,-15,-15,  1,  2,  9,-24,-13,-16; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -9,  2,-25,  4, 16,-25,-17, -1,-22, 12,-19,-11,  1,-11, 12, 11, -1, -6,-19,-27,-12, 13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M= -7,-25,-15,-31,-24, 28,-27,-15,  8,-23, 11,  4,-21,-27,-25,-19,-16, -6,  8, -4, 18,-24;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-23, -2,  5,-21,-16, -6,-19, 10,-19,-10,  0,-12,  5, 11,  3,  3,-13,-26,-11,  4;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-21,-34,-24, 29,-30,-20, 16,-28, 29, 14,-25,-27,-25,-20,-24,-10, 10,-10, 10,-24;
/M: SY='R'; M= -6, -8,-19,-12, -6, -8,-18,-12,-12,  2,-13, -7, -3,-16, -5,  8,  2,  8, -6,-22, -6, -7;
/M: SY='L'; M= -5,-27,-18,-30,-23,  5,-29,-23, 23,-24, 24, 15,-24,-26,-21,-20,-17, -4, 21,-22, -3,-23;
/M: SY='L'; M= -8,-24,-21,-25,-19,  6,-27,-15, 12,-16, 13,  8,-22,-23,-18,-13,-17, -7, 13,-14,  4,-19;
/M: SY='N'; M= -7, 25,-21, 20,  3,-23, -1,  2,-25, -2,-28,-20, 31,-15, -1, -3, 12,  1,-24,-37,-19,  1;
/M: SY='Q'; M= -2, -2,-25, -1,  6,-26,-11, -1,-19,  0,-19, -9, -2, -4, 18, -2,  2, -6,-20,-24,-12, 11;
/I:         I=-2; MD=-5;
/M: SY='N'; M= -3, -1,-12, -4, -3,-11, -8, -6,-11, -1,-11, -7,  3,-13, -4, -1,  0, -3, -9,-19, -8, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='N'; M= -3,  3,-13,  2,  0,-12, -3, -5,-11, -2,-11, -8,  4, -7, -2, -3,  3, -1, -9,-17, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-24,  4,  5,-21, -7, -4,-20,  3,-19,-12,  3, -3,  1,  0,  0, -4,-17,-24,-13,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N'; M= -5, -2,-21, -4, -3,-14, -6, -5,-16, -1,-14, -8,  2,-13, -3, -1, -1, -4,-14,-21, -7, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M:         M= -7, -6,-20, -6, -1,-16,-14, -5,-14, -1,-12, -8, -4, -4, -2, -2, -4, -6,-12,-23,-10, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-16, -6, -3,-14,-15, -4,-12, -3,-15, -8,  0,-13, -2, -1,  5,  3, -8,-26, -8, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='I'; M= -7,-16,-19,-20,-13,  2,-22,-11,  3,-11,  1,  2,-12,-20,-11, -8, -9, -2,  3,-14,  3,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='Q'; M= -2, -7,-19, -8, -1,-16,-15, -7, -9, -4,-10, -5, -4,-12,  4, -3,  3,  2, -7,-24, -9,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='K'; M= -3, -1,-21, -2,  1,-17,-12, -7,-15,  2,-15, -8,  0,-11, -1,  1, -1, -3,-11,-24,-11, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M:         M= -7, -1,-20, -2,  0,-13,-10, -8,-17,  0,-16,-11,  0,-14, -3, -1, -1, -3,-13,-19, -9, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M:         M= -4, -6,-20, -9, -5, -8,-14, -9, -8, -8, -9, -6, -3,-14, -5, -7,  0,  0, -7,-21, -7, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M:         M= -5, -5,-18, -6, -1,-12,-16, -6,-13, -3,-13, -8, -4,-13, -3, -4, -1, -2, -8,-19, -7, -3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='H'; M= -9, -5,-19, -8, -5,-13,-13,  6,-18, -2,-16, -8, -1,-15, -1, -2, -5, -5,-16,-15, -1, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='R'; M=-11, -9,-21,-10, -7, -8,-17, -8,-16,  0,-13, -9, -6,-17, -6,  5, -6, -3,-12, -6, -2, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='F'; M=-12,-17,-21,-22,-15, 29,-22,-13, -6,-16, -2, -4,-12,-19,-20,-12,-12, -6, -6, -2, 13,-16; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='N'; M= -8,  3,-14,  0, -5, -8,-10, -4,-17, -7,-15,-11,  6,-17, -8, -6,  1, -1,-13,-25, -8, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-5;
/M: SY='E'; M= -2,  2,-22,  0,  5,-19, -9, -7,-18,  0,-19,-13,  4, -7,  0, -3,  4, -2,-16,-27,-14,  1;
/M: SY='K'; M= -5,  3,-22,  1,  6,-20,-13, -8,-20,  9,-20,-12,  5,-11,  2,  6,  1, -1,-16,-26,-13,  3;
/M: SY='N'; M= -3,  3,-22,  2,  4,-21, -7, -7,-19, -1,-21,-13,  7, -4,  1, -5,  5,  0,-18,-29,-16,  2;
/M: SY='N'; M= -8, -1,-24, -3, -1,-14,-13, -7,-15, -2,-16,-11,  3, -7, -2, -2,  0, -1,-15,-23,-10, -2;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-23, -1, -3,-22,  9,-11,-21, -9,-19,-12,  1,-14, -5,-11,  4, -6,-16,-26,-17, -4;
/M: SY='W'; M=-15,-24,-29,-26,-19,  6,-19,-11,-13,-14,-12, -9,-21,-25,-14,-12,-21,-17,-16, 50, 18,-15;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-25, -9,-17,-28, 55,-19,-36,-18,-28,-19,  0,-18,-17,-18,  1,-16,-26,-23,-28,-17;
/M: SY='W'; M=-15,-22,-26,-25,-21, 22,-22, -9, -6,-17, -3, -5,-19,-26,-19,-14,-19,-11, -9, 28, 26,-19;
/M: SY='S'; M= -3, -5,-20, -6, -1,-18,-11,-11,-16, -5,-18,-12, -2,  1, -3, -6,  2, -1,-14,-26,-16, -3;
/M: SY='K'; M= -7,  4,-24,  3,  9,-24,-14, -6,-23, 14,-22,-12,  6,-11,  8,  9,  1, -2,-19,-25,-13,  8;
/M: SY='F'; M=-14,-26,-19,-33,-26, 47,-27,-16,  5,-24, 11,  6,-20,-28,-29,-18,-17, -8,  4, -1, 21,-25;
/M: SY='I'; M= -8,-25,-19,-31,-23,  3,-30,-20, 25,-23, 18, 18,-21,-22,-17,-21,-18, -9, 16,-20, -1,-22;
/M: SY='P'; M= -5, -5,-25, -4,  1,-21,-12,-10,-19,  1,-21,-14,  0,  8, -2,  2,  4,  0,-17,-29,-17, -2;
/M: SY='W'; M=-13,-25,-30,-26,-18,  3,-24,-12, -2,-16,  6,  1,-22,-23,-14, -9,-23,-14, -7, 26,  8,-16;
/M: SY='E'; M= -2,  9,-21, 10, 11,-23,-11, -6,-22,  1,-21,-16,  6,-10,  2, -3,  7,  2,-17,-30,-15,  6;
/M: SY='D'; M=-10,  8,-24, 11, 10,-23,-18, -7,-21,  9,-18,-12,  3,-11,  2,  3, -2, -2,-15,-28,-12,  6;
/M: SY='L'; M= -9,-27,-20,-31,-22, 13,-29,-19, 19,-25, 33, 20,-25,-27,-20,-18,-23, -7, 13,-18,  2,-21;
/M: SY='E'; M= -8, -2,-23, -3,  6,-16,-19, -4,-11,  0, -9, -6, -1,-13,  3, -1, -5, -4,-12,-25, -9,  4;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-20, 18, 13,-24,-10, -3,-25,  8,-22,-16, 10, -9,  4,  2,  1, -4,-20,-28,-15,  8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='P'; M= -1, -5,-18, -4,  4,-16,-11, -7,-13,  3,-13, -8, -5,  5,  2,  2, -1, -3,-11,-18,-11,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N'; M= -1,  1,-15,  0,  0,-15,  2, -5,-15,  1,-15, -9,  5, -7, -1, -1,  4, -1,-12,-18,-11, -1; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='G'; M= -6,  1,-23,  2, -7,-18, 17, -8,-24,-10,-20,-15,  2,-12,-10,-11, -1,-10,-19,-17,-12, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='Y'; M=-17,-24,-23,-28,-23, 39,-30, -1,  4,-20, 10,  3,-20,-29,-22,-16,-20,-10, -2,  9, 41,-23;
/M: SY='L'; M= -7,-24,-17,-26,-20,  3,-27,-19, 17,-22, 23, 13,-23,-26,-18,-16,-18, -7, 15,-22, -3,-20;
/M: SY='V'; M= -7,-10,-22, -9, -6,-13,-24,-14,  3, -4, -5, -1,-10,-15, -9, -7, -8, -5,  8,-26, -9, -9;
/M: SY='D'; M=-10, 27,-24, 28,  9,-28, -3,  1,-28,  0,-26,-21, 25,-14,  1, -3,  4, -6,-26,-35,-19,  5;
/M: SY='D'; M=-15, 35,-28, 48, 14,-36,  2, -3,-37, -1,-29,-26, 18,-12, -1, -9,  0,-11,-29,-36,-21,  6;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-14, -2,  2,-19,-12, -9,-17, -2,-18,-11,  1,-13, -1, -3, 10,  8,-10,-31,-15,  0;
/M: SY='I'; M= -6,-27,-14,-32,-25,  6,-30,-24, 23,-26, 22, 13,-24,-26,-23,-23,-18, -6, 20,-22, -3,-25;
/M: SY='V'; M= -7,-13,-17,-18,-12, -4,-24,-16,  4, -9, -1,  2, -9,-19,-11,-10, -5,  2,  5,-23, -4,-13;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-35,-28, 13,-34,-27, 32,-27, 19, 14,-23,-25,-25,-24,-18, -7, 27,-18,  1,-28;
/M: SY='E'; M= -7, -2,-24,  0, 18,-22,-10, -8,-20,  3,-17,-12, -3,-10,  4,  2, -1, -6,-16,-27,-16, 10;
/M: SY='V'; M= 14,-20,  5,-26,-21,-10,-18,-25,  5,-18, -1, -2,-18,-22,-20,-21, -4, -2, 15,-27,-15,-21;
/M: SY='E'; M=-11,  7,-25, 11, 17,-21,-18,  8,-24,  3,-18,-13,  2,-11,  7,  2, -1, -4,-21,-26, -6, 11;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-15,-32,-28,  6,-31,-27, 28,-23, 14, 13,-26,-27,-26,-21,-13, -3, 35,-24, -4,-28;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 125 in 124 different sequences
Number of true positive hits 125 in 124 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 5
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 96.15 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] MATH
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
124 sequences

BAT15_CAEEL (P34324), BAT36_CAEEL (Q9XWB9), BAT38_CAEEL (Q20681), 
BAT39_CAEBR (A8X2W2), BAT39_CAEEL (P90846), BAT40_CAEEL (Q9NF14), 
BAT41_CAEEL (P41886), BAT42_CAEEL (P34371), BAT43_CAEEL (P34568), 
BAT45_CAEEL (Q9XV51), BPM1_ARATH  (Q8L765), BPM2_ARATH  (Q9M8J9), 
BPM3_ARATH  (O22286), BPM4_ARATH  (Q9SRV1), BPM5_ARATH  (Q1EBV6), 
BPM6_ARATH  (A1L4W5), DG17_DICDI  (P11467), FNKC_DICDI  (Q8T126), 
MCC01_ARATH (Q9C870), MCC02_ARATH (Q9C869), MCC03_ARATH (Q9ZUA7), 
MCC04_ARATH (Q9SHT3), MCC05_ARATH (Q9SHT2), MCC06_ARATH (F4IN32), 
MCC07_ARATH (P0DKG4), MCC08_ARATH (P0DKG5), MCC09_ARATH (P0DKG6), 
MCC10_ARATH (P0DKG7), MCC11_ARATH (Q9LSD2), MCC12_ARATH (Q9LJB5), 
MCC13_ARATH (F4J4A0), MCC14_ARATH (F4J4A1), MCC15_ARATH (Q9M2J6), 
MCC16_ARATH (Q9M2J5), MCC17_ARATH (F4J4P8), MCC18_ARATH (Q9M2J2), 
MCC19_ARATH (Q9M2J1), MCC20_ARATH (Q9M2J0), MCC21_ARATH (Q9M2I9), 
MCC22_ARATH (Q58FV5), MCC23_ARATH (Q9M2I2), MCC25_ARATH (Q9M2I0), 
MCC26_ARATH (Q9M2H9), MCC27_ARATH (Q9M2H8), MCC28_ARATH (Q9M2H6), 
MCC29_ARATH (Q9M2H5), MCC30_ARATH (F4J5U9), MCC31_ARATH (Q9M2H2), 
MEL26_CAEEL (Q94420), MEP1A_HUMAN (Q16819), MEP1A_MOUSE (P28825), 
MEP1A_RAT   (Q64230), MEP1B_HUMAN (Q16820), MEP1B_MOUSE (Q61847), 
MEP1B_RAT   (P28826), MLRR1_PLAF7 (Q8I3Z1), RDX_DROME   (Q9VFP2), 
RTM3_ARATH  (D5K228), SPOLA_DANRE (Q5BL35), SPOLB_DANRE (A0JMG1), 
SPOPA_XENLA (Q7ZX06), SPOPB_XENLA (Q0IHH9), SPOPL_HUMAN (Q6IQ16), 
SPOPL_MOUSE (Q2M2N2), SPOPL_XENLA (Q6GR09), SPOP_BOVIN  (Q0VCW1), 
SPOP_DANRE  (Q7T330), SPOP_HUMAN  (O43791), SPOP_MOUSE  (Q6ZWS8), 
SPOP_PONAB  (Q5NVK7), SPOP_XENTR  (Q6P8B3), TDPZ1_MOUSE (Q717B3), 
TDPZ2_MOUSE (Q717B2), TDPZ3_MOUSE (Q717B4), TDPZ4_MOUSE (Q6YCH2), 
TDPZ5_MOUSE (Q6YCH1), TRAF1_HUMAN (Q13077), TRAF1_MOUSE (P39428), 
TRAF2_HUMAN (Q12933), TRAF2_MOUSE (P39429), TRAF3_HUMAN (Q13114), 
TRAF3_MOUSE (Q60803), TRAF4_HUMAN (Q9BUZ4), TRAF4_MOUSE (Q61382), 
TRAF5_HUMAN (O00463), TRAF5_MOUSE (P70191), TRAF6_BOVIN (Q3ZCC3), 
TRAF6_CERAT (B6CJY4), TRAF6_DANRE (Q6IWL4), TRAF6_HUMAN (Q9Y4K3), 
TRAF6_MACMU (B6CJY5), TRAF6_MOUSE (P70196), TRAF6_PIG   (A7XUJ6), 
TRAF6_RAT   (B5DF45), TRAF6_XENTR (Q28DL4), TRF6A_XENLA (Q3MV19), 
TRF6B_XENLA (Q6DJN2), TRI37_HUMAN (O94972), TRI37_MOUSE (Q6PCX9), 
UBP12_ARATH (Q9FPT1), UBP13_ARATH (Q84WU2), UBP15_YEAST (P50101), 
UBP21_SCHPO (Q9UTT1), UBP5_SCHPO  (Q09879), UBP7_CAEBR  (Q60MK8), 
UBP7_CAEEL  (Q7JKC3), UBP7_CHICK  (Q6U7I1), UBP7_DROME  (Q9VYQ8), 
UBP7_HUMAN  (Q93009), UBP7_MOUSE  (Q6A4J8), UBP7_RAT    (Q4VSI4), 
Y0883_DICDI (Q54FG0), Y0931_DICDI (Q54FD5), Y0971_DICDI (Q54FB9), 
Y2098_DICDI (Q55A66), Y2340_DICDI (Q86AY4), Y2348_DICDI (Q86KX6), 
Y3202_DICDI (Q54C11), Y3509_DICDI (Q557K0), Y5436_ARATH (Q8RY18), 
Y7243_DICDI (Q86K46), Y7754_DICDI (Q55GA0), Y8444_DICDI (Q1ZXR0), 
Y8514_DICDI (Q54NN4)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
5 sequences

BAT34_CAEEL (Q9XUM6), BAT47_CAEEL (O76612), Y0965_DICDI (Q54FC5), 
Y3435_DICDI (Q557K2), Y7813_DICDI (Q54YP8)
» More

PDB
[Detailed view]
52 PDB

1CA4; 1CA9; 1CZY; 1CZZ; 1D00; 1D01; 1D0A; 1D0J; 1F3V; 1FLK; 1FLL; 1KZZ; 1L0A; 1LB4; 1LB5; 1LB6; 1QSC; 1RF3; 1YY6; 1YZE; 1ZMS; 2CR2; 2F1W; 2F1X; 2F1Y; 2F1Z; 2FOJ; 2FOO; 2FOP; 2GKW; 2XXN; 3HQH; 3HQI; 3HQL; 3HQM; 3HSV; 3HU6; 3IVB; 3IVQ; 3IVV; 3MQR; 3MQS; 3ZJB; 4GHU; 4GJH; 4GWM; 4GWN; 4JJQ; 4K8U; 4KG9; 4M4E; 4O1V
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission