ID   ZINC_FINGER_C2H2_2; MATRIX.
AC   PS50157;
DT   01-DEC-2001 CREATED; 07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   Zinc finger C2H2 type domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=28;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=3; N2=26;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.6689000; R2=0.0207831; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1309.8804932; R2=0.9673913; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=442; H_SCORE=1737; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=345; H_SCORE=1644; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='Y'; M=-19,-21,-24,-25,-21,39,-28,10,-2,-17,2,0,-17,-28,-19,-13,-18,-10,-7,12,48,-21;
MA   /M: SY='K'; M=-4,-5,-23,-5,6,-20,-18,-9,-14,7,-15,-7,-5,-9,3,2,-2,-2,-9,-25,-12,4;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-24,3,6,-22,-11,-6,-20,1,-21,-14,4,-1,1,-3,5,2,-18,-29,-15,3;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
MA   /M: SY='E'; M=-9,-2,-26,1,14,-18,-17,-4,-13,-1,-11,-8,-5,-12,4,-5,-5,-8,-12,-24,-9,8;
MA   /M: SY='C'; M=-10,-20,119,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-29,-30;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-1,-28,-1,-7,-28,36,-11,-33,-11,-27,-18,4,-15,-10,-12,1,-13,-27,-24,-23,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,-2,-28,-3,8,-25,-19,-7,-26,36,-24,-8,-1,-12,10,27,-9,-9,-18,-19,-8,8;
MA   /M: SY='A'; M=8,-7,-9,-11,-7,-17,-7,-14,-16,-6,-16,-11,-4,-15,-6,-5,8,4,-7,-27,-15,-7;
MA   /M: SY='F'; M=-19,-29,-19,-37,-28,71,-29,-17,0,-28,9,0,-20,-30,-36,-19,-19,-9,-1,9,31,-28;
MA   /M: SY='S'; M=0,-5,-17,-9,-6,-16,-11,-10,-14,-3,-16,-10,0,-12,-4,0,8,7,-8,-27,-12,-6;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-3,-20,-4,0,-18,-17,2,-19,3,-16,-8,0,-17,8,9,-1,-3,-17,-19,-5,3;
MA   /M: SY='R'; M=-4,-4,-22,-6,0,-19,-13,-5,-18,7,-18,-9,1,-10,2,8,2,-2,-14,-25,-11,0;
MA   /M: SY='S'; M=2,-1,-16,-1,-1,-18,-4,-6,-19,-7,-22,-14,4,-12,-2,-7,16,7,-13,-29,-12,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-5,5,-20,1,0,-18,-10,8,-18,-5,-18,-11,9,-16,1,-4,4,-1,-17,-27,-7,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-29,-20,-30,-20,12,-29,-19,17,-27,43,18,-28,-29,-20,-18,-28,-10,9,-18,2,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-22,-10,-4,-15,-20,-8,-7,2,-9,-3,-2,-16,0,3,-3,0,-6,-24,-8,-3;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-6,-23,-7,0,-19,-17,-7,-14,7,-13,-6,-2,-16,4,12,-3,-3,-10,-24,-10,0;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,99,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,-10,-25,-12,1,-16,-22,-2,-6,1,-3,6,-9,-17,13,3,-9,-8,-9,-19,-4,6;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-8,-26,-9,0,-19,-19,-4,-21,20,-16,-6,-2,-17,6,35,-8,-7,-14,-21,-9,0;
MA   /I: I=-12; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-17,-21,-17,-6,-25,-20,11,-15,2,3,-12,-18,-14,-14,-2,9,13,-25,-7,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,97,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,19,0;
MA   /M: SY='T'; M=1,-2,-13,-8,-6,-14,-15,-15,-12,-7,-13,-9,0,-12,-6,-8,14,25,-5,-29,-12,-6;
MA   /M: SY='G'; M=-3,-4,-27,-4,-8,-27,34,-14,-32,-9,-25,-16,2,-15,-10,-9,0,-13,-24,-23,-23,-10;
MA   /M: SY='E'; M=-9,6,-27,12,33,-26,-17,-3,-24,7,-18,-15,-1,-6,12,0,-2,-8,-22,-28,-16,22;
MA   /M: SY='K'; M=-11,-1,-28,-2,6,-25,-17,-6,-27,32,-25,-10,1,-11,8,28,-7,-8,-19,-22,-11,6;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-14,-32,-9,-1,-24,-17,-15,-18,-7,-23,-15,-13,51,-7,-13,-6,-6,-23,-28,-22,-7;
MA   /I: E1=0;
PP   /COMPETES_HIT_WITH: PS51810; PS51811; PS51905; PS51906; PS51907; PS51908;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
CC   /FT_KEY=ZN_FING; /FT_DESC=C2H2-type;
CC   /VERSION=9;
PR   PRU00042;
DO   PDOC00028;
//