Entry: PS50179

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] VHS
Accession [info] PS50179
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); OCT-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50179
Associated ProRule [info] PRU00218

Name and characterization of the entry

Description [info] VHS domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=130;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=125;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1228; R2=0.01676418; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2668.61592; R2=37.67820; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=440; N_SCORE=8.5; H_SCORE=17135; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=320; N_SCORE=6.5; H_SCORE=14655; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 39,-11,-11,-19,-11,-17, -4,-20, -7,-12, -7, -8,-10,-12,-10,-19,  9,  2,  1,-22,-18,-11;
/M: SY='T'; M= -2,  1, -5, -6, -4,-13,-20,-18,-14, -9,-12,-12, -1,-11, -8,-10, 16, 39, -4,-31,-12, -6;
/M: SY='S'; M= -1, 15,-18, 16,  4,-21, -7, -6,-24, -4,-25,-20, 15,-12, -2, -5, 17,  7,-17,-35,-17,  1;
/M: SY='P'; M= -7, -1,-29,  3, 12,-26,-14, -9,-19, -3,-18,-12, -4, 13,  4, -6, -2, -7,-21,-29,-19,  6;
/M: SY='T'; M= -7, -6,-22, -8, -7, -9,-15, -8, -9, -8, -6, -2, -5, -8, -7, -9, -2,  3, -9,-24, -5, -8;
/M: SY='L'; M= -5, -8,-19,-16,-14, -2,-19,-12,  7,-18, 17,  8, -3,-24,-13,-14,-12, -3,  1,-26, -7,-14;
/M:         M= -1, -7,-22, -9, -6,-15,-11,-14,-11, -6, -8, -7, -5,-13, -5, -3, -2,  0, -7,-24,-12, -7;
/M: SY='E'; M= -4, 10,-22, 13, 17,-26, -4, -8,-25, -3,-22,-18,  5, -9,  3, -8,  9,  3,-19,-32,-19, 10;
/M: SY='P'; M=-10, -2,-31,  6, 22,-26,-20,-10,-20, -3,-17,-15, -8, 23,  4,-10, -5, -7,-22,-30,-20, 11;
/M: SY='D'; M=-17, 46,-27, 55, 17,-35, -8,  3,-35,  0,-30,-27, 29,-12,  1, -7,  3, -7,-30,-40,-20,  9;
/M: SY='W'; M=-17,-37,-42,-38,-28, 10,-23,-28, -8,-23, -2, -9,-37,-30,-20,-20,-37,-25,-18,104, 22,-20;
/M: SY='A'; M= 13, -2,-19, -3,  4,-25,  3,-12,-21, -7,-21,-16, -1, -5,  0,-12, 13,  2,-15,-28,-21,  2;
/M: SY='L'; M= -3,-19,-22,-21,-16, -5,-11,-15,  3,-16,  9,  6,-15,-22,-11,-15,-11, -7,  0,-18, -2,-14;
/M: SY='I'; M= -8, -2,-25,-16,-17, -5,-22,-12, 17,-17, -1,  2, 10,-20,-12,-17, -7, -6,  3,-24, -4,-17;
/M: SY='L'; M= -9,-24,-22,-29,-20,  2,-28,-16, 23,-22, 29, 26,-21,-24,-11,-17,-22, -9, 13,-21, -2,-17;
/M: SY='E'; M= -8, 16,-28, 23, 27,-31,-10,  1,-28,  2,-20,-17,  6, -8, 11, -4, -1,-10,-26,-30,-17, 19;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-19,-37,-29, 12,-36,-28, 34,-29, 18, 14,-22,-24,-25,-26,-19, -9, 25,-18,  2,-29;
/M: SY='C'; M=  1,-15, 79,-23,-22,-20,-21,-25,-25,-24,-20,-18,-13,-31,-22,-25,  1, -2, -8,-44,-26,-22;
/M: SY='D'; M=-18, 42,-30, 61, 28,-38,-12,  0,-38,  2,-28,-28, 16, -8,  4, -8,  0,-10,-30,-38,-20, 16;
/M: SY='M'; M= -6,-17,-23,-21,-11, -6,-23,-10,  6, -7,  7, 13,-15,-20,  0, -7,-12, -7,  2,-18,  0, -6;
/M: SY='I'; M= -5,-29,-18,-34,-28,  0,-34,-28, 35,-26, 19, 15,-24,-25,-23,-25,-17, -6, 31,-24, -5,-28;
/M: SY='N'; M= -8, 22,-22,  9, -2,-21,  0,  2,-23,  5,-27,-17, 37,-19,  0, 11,  5, -2,-25,-33,-18, -2;
/M: SY='E'; M= -4,  0,-21,  0, 12,-21,-12, -3,-19,  0,-17,-10,  3,-11, 10,  0, 10,  5,-16,-30,-14, 10;
/M: SY='D'; M= -9, 14,-23, 16,  8,-25, -8, -8,-26,  4,-22,-17,  9,-11, -1,  0,  5,  6,-19,-31,-16,  4;
/M: SY='P'; M=-10, -8,-29, -4,  6,-18,-17, -8,-19, -2,-18,-12, -8, 14,  1, -1, -4, -6,-18,-25,-15,  2;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='B'; M= -5,  5,-22,  4,  2,-18,-11,-11,-15, -4,-17,-14,  4,-15, -5, -5,  2,  1,-10,-21,-14, -2;
/M: SY='G'; M= -2,  0,-25, -2, -5,-26, 16, -9,-24, -9,-20,-12,  6,-12,  2,-10,  1, -7,-23,-25,-20, -1;
/M: SY='P'; M= 10,-14,-22,-13, -5,-25, -8,-19,-18,-11,-23,-17,-13, 39,-10,-19,  2, -3,-18,-28,-26,-10;
/M: SY='K'; M=-12, -4,-29, -4,  6,-26,-20, -7,-26, 34,-24, -9, -2,-10, 11, 33, -8, -7,-18,-21,-11,  7;
/M: SY='D'; M=-15, 20,-29, 31, 22,-24,-17,  2,-27, -2,-19,-19,  5, -6,  2, -8, -3, -8,-24,-30,-11, 12;
/M: SY='A'; M= 27,-14,  4,-21,-16,-16, -7,-22, -7,-15, -9, -8,-13,-18,-16,-20,  5, -1,  5,-27,-19,-16;
/M: SY='I'; M= -1,-23,-18,-27,-21, -1,-24,-20, 18,-19, 13, 15,-21,-17,-17,-19,-11, -3, 18,-24, -7,-20;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-28, -9, -1,-17,-19, -7,-22, 21,-18, -8, -2,-17,  5, 30, -8, -8,-17,-13, -7,  1;
/M: SY='A'; M= 21,-14, -7,-20,-14,-13, -7,-20, -4,-17,  0, -4,-12,-17,-13,-19,  3,  1,  1,-25,-15,-14;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-35,-26,  4,-35,-26, 36,-29, 31, 19,-25,-25,-21,-25,-23, -9, 24,-21, -1,-26;
/M: SY='K'; M= -3, -6,-25, -8,  4,-21,-18, -9,-18, 23,-15, -1, -6,-13,  5, 19, -8, -8,-12,-21,-11,  4;
/M: SY='K'; M=-12, -1,-29, -1,  7,-27,-19,  4,-30, 38,-27, -9,  2,-13, 10, 31, -8,-10,-21,-22, -7,  7;
/M: SY='R'; M=-17, -9,-29, -9,  1,-21,-21, -4,-27, 31,-18, -8, -2,-18,  8, 55,-11,-10,-18,-20, -9,  1;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-21,-34,-26,  4,-33,-24, 33,-26, 29, 21,-26,-26,-21,-23,-21, -8, 26,-22, -2,-25;
/M: SY='N'; M= -8, 10,-24,  5,  4,-24, -2,  2,-19,  0,-19, -9, 15,-16, 10, -2,  2, -5,-22,-29,-15,  7;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='H'; M= -6,  8,-22,  5,  0,-19, -8, 27,-22, -7,-22,-10, 15,-16,  5, -5,  8, -3,-21,-30, -2,  0;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-28,  0,  6,-26,-14, -8,-26, 20,-25,-13, -1, -1,  6, 15, -2, -5,-20,-23,-12,  5;
/M: SY='N'; M= -9, 26,-22, 20,  6,-25, -9,  2,-20, -1,-24,-16, 29,-15,  7, -3,  8,  2,-22,-35,-17,  6;
/M: SY='P'; M= -4,-10,-30, -5,  5,-22,-16,-11,-20, -8,-25,-18, -8, 44, -5,-14,  1, -3,-23,-30,-22, -3;
/M: SY='H'; M=-13,  4,-28, -1,  0,-20,-16, 34,-25,  6,-23, -8, 12,-18,  7,  9, -5, -9,-25,-18,  1,  2;
/M: SY='V'; M= -1,-17,-16,-16, -5, -9,-26,-21, 11,-12,  1,  1,-19,-20,-15,-14, -5,  2, 24,-29,-12,-10;
/M: SY='A'; M= 12,-12,-19,-16, -5,-21,-17,-12,  0, -7, -7,  0,-11,-15, 10,-10,  1, -4,  2,-23,-13,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-22,-28,-20,  5,-29,-14, 21,-22, 27, 21,-21,-26,-14,-17,-22, -9, 12,-17,  5,-18;
/M: SY='Y'; M=-13,-17,-25,-18, -9,  2,-25,  1, -2,-10, 10,  7,-15,-23,  1, -1,-15, -9, -7,-11, 13, -5;
/M: SY='A'; M= 37, -7,-10,-17,-10,-18, -4,-20,-10,-10,-11,-10, -7,-10,-10,-17, 14, 12,  0,-23,-18,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-31,-22,  9,-30,-22, 21,-29, 43, 18,-30,-29,-20,-21,-29,-11, 11,-12,  1,-21;
/M: SY='T'; M= -2, -3,-15, -7, -4,-14,-17,-11,-11, -4,-13, -9, -1,-13, -4, -6, 12, 22, -3,-29, -9, -4;
/M: SY='L'; M= -3,-29,-17,-30,-23,  4,-29,-24, 23,-26, 32, 15,-28,-28,-23,-21,-21, -6, 23,-23, -4,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-19,-27,-19,  6,-28,-19, 17,-26, 38, 19,-25,-26,-17,-18,-22, -1,  9,-21, -1,-18;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='E'; M=-11, 19,-27, 28, 29,-31, -8, -2,-28,  2,-22,-20,  8, -8,  9, -5,  0, -9,-25,-31,-19, 19; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='T'; M= 11,-10,-13,-18,-13,-11,-15,-18,  2,-13, -4,  1, -8,-13,-10,-15,  8, 15,  7,-26,-11,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='C'; M= -6,-23, 58,-29,-25, -9,-28,-25, -8,-28,  5, -4,-22,-33,-25,-25,-15, -9,  0,-36,-18,-25; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='V'; M=  0,-26,-16,-29,-25, -2,-26,-23, 23,-19,  9, 15,-24,-25,-21,-19,-10, -3, 31,-20, -7,-23;
/M: SY='K'; M= -4,  6,-26,  3, 12,-27,-15, -7,-26, 29,-26,-13,  7,-10,  9, 15, -1, -5,-20,-25,-14, 11;
/M: SY='N'; M=-10, 37,-20, 18,  0,-20, -1, 14,-21, -1,-29,-19, 56,-20,  1,  0, 10,  0,-29,-39,-18,  0;
/M: SY='C'; M= -5,-19, 92,-28,-28,-20,-19,-28,-26,-28,-19,-18,-18,-36,-27,-28, -8,-10,-10,-44,-28,-28;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-30, -7,-14,-30, 62,-18,-39,-17,-29,-20,  2,-19,-17,-18,  0,-19,-30,-21,-29,-15;
/M: SY='E'; M=-10,  2,-26,  6, 13,-20,-17,  8,-24,  8,-22,-13,  1, -9,  7,  4,  1, -3,-21,-23, -1,  8;
/M: SY='R'; M= -6,-10,-26,-12, -6,-15,-15, -2,-14,  0,-15, -8, -4, -2, -4,  5, -4, -5,-13,-23, -8, -8;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-20,-37,-29, 53,-31,-22, 11,-29, 16,  6,-23,-29,-34,-21,-20, -9, 11, -2, 18,-29;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='H'; M=-18, -6,-28, -7, -3,-15,-22, 59,-19, -7,-10,  2,  2,-20,  6,  6,-12,-16,-20,-24, 13, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='M'; M= -5, -8,-21, -8, -4,-12,-19, -8, -6, -5,  0,  1, -7,-18,  1, -6, -5, -4, -5,-25, -8, -2;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-28,  7, 32,-25,-19,  5,-20,  2,-11, -9,  0, -9, 20, -1, -4,-10,-24,-27,-13, 26;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-18,-34,-30,  5,-34,-29, 35,-24, 14, 13,-26,-26,-27,-24,-14, -4, 40,-24, -4,-30;
/M: SY='A'; M= 23,-11,  9,-18,-14,-19, -4,-20,-12,-15,-15,-12, -8,-17,-13,-20, 10,  1, -1,-30,-21,-14;
/M: SY='S'; M= -2, 10,-20, 11, 10,-25, -9, -6,-25,  6,-27,-18, 11,-10,  5,  3, 15,  5,-18,-33,-17,  7;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-27, -6,  7,-14,-20, -7,-25, 24,-19,-10, -3,-14,  6, 28, -7, -7,-18,-18, -7,  6;
/M: SY='D'; M=-14, 18,-29, 25, 24,-31,-12,  4,-32, 10,-25,-18, 11,-10, 12,  9, -2,-10,-28,-30,-16, 17;
/M: SY='F'; M=-16,-29,-19,-37,-28, 56,-30,-22,  8,-28, 14,  4,-21,-28,-34,-20,-18, -7,  8,  0, 20,-28;
/M: SY='L'; M= -4,-21,-19,-24,-12, -1,-25,-16, 14,-19, 24, 18,-21,-22,-12,-16,-17, -5, 10,-23, -5,-13;
/M: SY='B'; M=-10, 21,-24, 20, 12,-26, -9,  3,-26,  0,-26,-19, 21, -6,  3, -4,  7,  0,-25,-35,-17,  7;
/M: SY='E'; M=-10, 12,-27, 19, 31,-26,-15, -3,-27,  5,-18,-18,  5, -8,  8,  1,  1, -4,-24,-31,-17, 19;
/M: SY='L'; M= -9,-24,-19,-29,-21, 12,-26,-14, 17,-22, 30, 26,-23,-26,-17,-17,-22, -8, 11,-18,  1,-18;
/M: SY='V'; M= -7,-21,-20,-22,-15, -4,-28,-19, 13, -7,  6,  6,-19,-23,-14, -5,-13, -5, 18,-22, -3,-16;
/M: SY='K'; M= -2,  0,-24, -2,  3,-25,-13, -4,-22, 20,-23,-10,  2,-13,  6, 13, -1, -6,-14,-25,-12,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-13,-28,-20, -2,-30,-21, 15,-15, 17, 11,-22,-26,-17, -6,-18, -8, 15,-24, -6,-20;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='I'; M= -2,-23,-16,-28,-22,  9,-25,-22, 20,-21, 15,  9,-20,-22,-21,-19,-13, -3, 20,-17, -1,-22; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='P'; M= -3, -5,-15, -3,  0,-11, -7, -9, -8, -6, -7, -6, -4,  4, -4, -5,  1,  1, -8,-17,-10, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='K'; M= -9, -5,-22, -5, -2,-24, -9,-12,-23, 10,-22,-12, -1,  0, -3,  7, -5, -6,-19,-26,-17, -4;
/M: SY='N'; M= -3,  1,-24, -1,  4,-19,-14, -2,-19,  4,-21,-13,  6, -1,  0,  1,  3, -2,-18,-26,-11,  0;
/M: SY='K'; M= -9,  5,-26,  5,  6,-24,-11, -6,-24, 12,-23,-14,  6,-14,  6,  8,  0, -6,-21,-19,-12,  6;
/M: SY='A'; M=  5,-13,-20,-15,-10,-14,-11,-15, -9, -6,-12, -8, -9, -5, -9, -5,  2,  1, -3,-23,-11,-11;
/M: SY='H'; M=-11,  6,-26,  9,  3,-19,-16, 11,-19, -6,-18,-11,  4, -3,  3, -8,  0, -4,-19,-26, -3,  1;
/M: SY='E'; M= -6, -6,-25, -6,  3,-15,-15,-12, -9, -5, -9, -6, -5, -5, -2, -6, -5, -6, -9,-26,-13, -1;
/M: SY='K'; M= -9,  4,-28,  5, 11,-27,-18, -8,-21, 16,-23,-12,  3,  0,  8,  5, -3, -4,-20,-26,-14,  9;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-15,-30,-28,  0,-30,-27, 30,-22, 15, 13,-26,-28,-26,-21,-13, -3, 40,-28, -8,-28;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-18, -5,  5,-27,-18, -1,-26, 21,-24, -9,  0,-15, 16, 25, -2, -7,-20,-24,-12,  9;
/M: SY='E'; M= -9, 11,-25, 11, 20,-24,-10, -2,-22,  7,-19,-13, 11,-11,  7,  2,  0, -6,-22,-30,-17, 13;
/M: SY='K'; M= -8, -7,-27, -9,  1,-21,-20, -9,-20, 30,-16, -3, -5,-15,  4, 27,-11, -9,-12,-20, -9,  2;
/M: SY='I'; M= -1,-26,-19,-31,-25, -1,-29,-24, 29,-22, 16, 17,-22,-23,-19,-22,-13, -5, 27,-24, -6,-24;
/M: SY='L'; M=-11,-23,-23,-25,-16,  3,-29,-19, 11,-14, 25, 11,-20,-24,-14, -7,-21, -7,  6,-19, -1,-16;
/M: SY='E'; M= -6,  0,-22,  0,  7,-16,-18, -1,-12, -5,-10, -7,  1,-13,  2, -5,  3,  3,-11,-27, -8,  4;
/M: SY='L'; M= -6,-25,-20,-30,-21,  7,-27,-17, 19,-23, 28, 22,-24,-25,-17,-18,-20, -6, 14,-18,  2,-19;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-23,-34,-26,  4,-33,-24, 34,-27, 30, 22,-25,-25,-20,-23,-22, -9, 23,-21, -1,-25;
/M: SY='Q'; M=-13,  4,-28,  8, 13,-19,-21, -1,-19,  9,-17, -9, -2,-13, 14,  3, -6, -9,-18,-19, -1, 13;
/M: SY='E'; M=  4, -1,-13, -2, 11,-20,-14,-10,-17, -3,-15,-12,  0,-10,  3, -8, 10,  7,-12,-30,-16,  7;
/M: SY='W'; M=-18,-37,-45,-38,-28,  9,-21,-29,-15,-21,-12,-15,-37,-29,-20,-20,-37,-25,-25,125, 25,-20;
/M: SY='A'; M=  8, -4,-18, -9, -5,-15,-10,  0,-13, -6,-15, -8,  0,-15,  2, -7,  8,  5,-10,-21, -3, -2;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-24, 13, 14,-22,-19,  0,-16, -1,-14,-10,  2,-13,  6, -5, -2, -4,-13,-29,-10, 10;
/M: SY='A'; M= 17, -2,-17, -6, -3,-19, -2,-14,-17, -9,-17,-13, -2,-12, -6,-14, 10,  5,-10,-18,-16, -4;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-22,-30,-22, 46,-29,-17,  5,-25, 12,  3,-19,-27,-29,-19,-18, -8,  3, -2, 20,-23;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='C'; M= -4, -8,  1, -9, -6,-20, -6,-11,-23,  1,-22,-13, -4, -9, -3,  1,  1, -5,-16,-25,-14, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='N'; M= -7, 12,-24,  9,  1,-25, 10, -5,-27,  7,-26,-16, 17,-14, -2,  3,  1, -8,-23,-26,-18,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='D'; M= -7, 11,-22, 16, 10,-25, -8, -6,-22,  5,-19,-14,  5,-11,  3,  1,  1, -6,-16,-27,-15,  6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='P'; M= -7, -9,-26, -5,  0,-27, -7,-13,-23, -4,-26,-17, -7, 28, -4, -5, -2, -8,-23,-29,-24, -4;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-28, 16, 17,-29,-11, -3,-29,  9,-25,-16,  4, -6, 12,  5,  1, -6,-25,-27,-14, 14;
/M: SY='L'; M=-13,-19,-20,-20,-14, 13,-27, -4,  5,-20, 20, 11,-19,-26,-15,-15,-21,-10,  0,-13, 12,-15;
/M: SY='P'; M= -2, -3,-24, -3,  1,-23, -9,-12,-18, -2,-23,-14,  1,  8, -2, -5,  6,  0,-15,-30,-19, -2;
/M: SY='Y'; M= -6,-13,-24,-14, -6, -8,-14, -3, -8, -4, -3,  1,-11,-20,  1, -4, -9, -8, -8,-14,  4, -4;
/M: SY='I'; M=-10,-27,-24,-33,-27,  8,-33,-18, 31,-22, 14, 18,-22,-25,-19,-21,-18, -8, 25,-13, 12,-26;
/M:         M= -3, -9,-22,-11, -7,-12,-13, -5, -9, -3,-14, -7, -4,-15, -4, -1,  0, -2, -5,-20, -1, -8;
/M: SY='D'; M= -1, 14,-24, 19,  9,-26,-11, -4,-26, -1,-22,-18,  5,-11,  2, -8,  3, -2,-20,-21,-14,  6;
/M: SY='V'; M= 11,-17,-14,-23,-17, -6,-18,-19,  8,-16,  9,  9,-16,-19,-14,-17, -4,  5, 12,-24, -9,-16;
/M: SY='Y'; M=-18,-18,-29,-19,-17, 16,-29, 26,  0,-11, -2,  2,-15,-27, -8, -8,-17,-11, -7, 10, 55,-17;
/M: SY='Q'; M=-10,  8,-27, 10, 11,-27,-16,  5,-23, 11,-20, -9,  6,-13, 17,  8, -2, -8,-22,-25, -8, 13;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-24,  4,  7,-18,-17, -6,-13,  3, -7, -2,  2,-15,  1,  1, -5, -6,-13,-28,-12,  4;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-21,-31,-21,  8,-29,-18, 22,-27, 44, 26,-28,-28,-17,-19,-28,-10, 11,-20,  0,-19;
/M: SY='K'; M= -7, -9,-26, -9, -1,-21,-21,-14,-15, 25,-18, -6, -7, -9,  0, 18, -9, -7, -7,-23,-11, -2;
/M: SY='R'; M= -7, -3,-24, -3,  3,-15,-17, -3,-18,  9,-16, -9,  0,-16,  6, 14, -2, -5,-15,-20, -4,  3;
/M: SY='K'; M= -2, -1,-21, -1, 11,-28,-13, -6,-26, 17,-22,-12, -1,-12, 12, 16, -2, -8,-20,-24,-15, 10;
/M: SY='G'; M=  1, -7,-29, -7,-15,-30, 57,-17,-37,-17,-28,-19,  0,-18,-14,-18,  1,-18,-28,-21,-28,-15;
/M: SY='I'; M= -8,-24,-24,-27,-22,  7,-29,-10, 18,-20,  6,  6,-19,-18,-17,-19,-13, -6, 14,-11, 15,-23;
/M: SY='E'; M= -4, -2,-22, -1,  6,-18,-19,-10,-12,  3,-14, -9, -4,-13,  0, -2,  2,  3, -6,-25, -9,  2;
/M: SY='F'; M=-14,-25,-20,-34,-23, 57,-27,-18, -3,-21,  7,  0,-18,-27,-30,-15,-17, -9, -2,  3, 21,-23;
/M: SY='P'; M= -6,-16,-31,-10, -2,-26,-19,-18,-15, -8,-25,-15,-15, 53, -6,-15, -2, -3,-18,-30,-24, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_11 which contains 547'085 sequence entries.


Total number of hits 81 in 81 different sequences
Number of true positive hits 79 in 79 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 2 in 2 different sequences
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 97.53 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 98.75 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann, CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] VHS
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
79 sequences

GGA1_HUMAN  (Q9UJY5), GGA1_MOUSE  (Q8R0H9), GGA1_YEAST  (Q06336), 
GGA2_HUMAN  (Q9UJY4), GGA2_MOUSE  (Q6P5E6), GGA2_YEAST  (P38817), 
GGA3_HUMAN  (Q9NZ52), GGA3_MOUSE  (Q8BMI3), HGS_BOVIN   (Q0V8S0), 
HGS_HUMAN   (O14964), HGS_MOUSE   (Q99LI8), HGS_RAT     (Q9JJ50), 
HRS_DROME   (Q960X8), HSE1_ASHGO  (Q75DS3), HSE1_ASPCL  (A1CEK6), 
HSE1_ASPFU  (Q4WHP5), HSE1_ASPNC  (A2QW93), HSE1_ASPTN  (Q0CJU8), 
HSE1_CANAL  (Q5A895), HSE1_CANGA  (Q6FN49), HSE1_CHAGB  (Q2GT05), 
HSE1_COCIM  (Q1E878), HSE1_CRYNB  (P0CR79), HSE1_CRYNJ  (P0CR78), 
HSE1_DEBHA  (Q6BNP6), HSE1_EMENI  (Q5BBL4), HSE1_KLULA  (Q6CVA8), 
HSE1_MAGO7  (A4RF61), HSE1_NEOFI  (A1DFN5), HSE1_NEUCR  (Q7S6J4), 
HSE1_PHANO  (Q0U6X7), HSE1_PICST  (A3LXQ8), HSE1_SCHPO  (O74749), 
HSE1_USTMA  (Q4P5J4), HSE1_YARLI  (Q6C2N2), HSE1_YEAST  (P38753), 
LSB5_SCHPO  (P87308), STAM1_CAEEL (O01498), STAM1_HUMAN (Q92783), 
STAM1_MOUSE (P70297), STAM2_CHICK (O93436), STAM2_HUMAN (O75886), 
STAM2_MOUSE (O88811), STAM2_RAT   (Q5XHY7), TM1L1_HUMAN (O75674), 
TM1L1_MOUSE (Q923U0), TM1L1_RAT   (F1LM81), TM1L2_HUMAN (Q6ZVM7), 
TM1L2_MOUSE (Q5SRX1), TM1L2_XENLA (Q68FJ8), TOM1_CHICK  (O12940), 
TOM1_DICDI  (Q54GH3), TOM1_HUMAN  (O60784), TOM1_MOUSE  (O88746), 
VPS27_ASHGO (Q755J9), VPS27_ASPCL (A1CEK1), VPS27_ASPFU (Q4WHN8), 
VPS27_ASPNC (A2QWA2), VPS27_ASPTN (Q0CJV3), VPS27_CANAL (Q5ABD9), 
VPS27_CANGA (Q6FQJ1), VPS27_CHAGB (Q2GS33), VPS27_CRYNB (P0CS27), 
VPS27_CRYNJ (P0CS26), VPS27_DEBHA (Q6BSD6), VPS27_EMENI (Q5BBK9), 
VPS27_KLULA (Q6CL17), VPS27_MAGO7 (A4QTV1), VPS27_NEOFI (A1DFP5), 
VPS27_NEUCR (Q7RZJ2), VPS27_PHANO (Q0U4Z8), VPS27_PICST (A3LX75), 
VPS27_SCHPO (O13821), VPS27_USTMA (Q4P7Q1), VPS27_YARLI (Q6CFT4), 
VPS27_YEAST (P40343), Y3627_ARATH (Q9C5H4), YB0G_SCHPO  (P87157), 
YD85_SCHPO  (Q10410)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

LSB5_YEAST  (P25369)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
2 sequences

FES1_YARLI  (Q6C239), NHAK_BACA2  (A7Z8R4)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission