PROSITE entry PS50189
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | NTR |
| Accession [info] | PS50189 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-NOV-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50189 |
| Associated ProRule [info] | PRU00295 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | NTR domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=134; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2237029; R2=0.0172534; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5648.8452148; R2=5.4882631; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.1%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; H_SCORE=7647; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=248; H_SCORE=7010; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-40,-30,-29,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='P'; M= -2, -4,-24, -3, 2,-19,-10,-11,-20, -2,-22,-14, -1, 7, 0, -6, 6, 1,-18,-27,-16, 0; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='Q'; M= -3, -5,-18, -6, -1,-12,-11, -6, -9, 1, -9, -1, -4, -7, 4, 0, -2, -3, -9,-17, -7, 1; D=-14; /I: I=-14; MD=-29; /M: SY='Q'; M= -6, -3,-13, -3, 2,-11,-11, 3, -8, 4, -6, -1, -2, -6, 9, 4, -4, -4, -9,-10, -1, 5; D=-14; /I: I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29; /M: SY='C'; M=-10,-15, 73,-22,-19,-21,-26,-22,-26,-16,-20,-16,-14,-28,-17,-17, -8, -8,-12,-42,-24,-19; /M: SY='K'; M= -5, -1,-23, -1, 4,-22,-15, -7,-21, 14,-21,-10, 0,-10, 3, 11, 0, -3,-14,-26,-13, 3; /M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -5, 1,-21,-13,-10,-15, -2,-17,-10, -2, 10, -1, -5, -2, -4,-16,-27,-17, -2; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='E'; M= -4, -5,-18, -5, 2,-15,-16,-11,-11, -3,-12, -8, -5, -9, -3, -7, -1, -2, -7,-27,-13, -1; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='H'; M=-10, 0,-25, 1, 5,-20,-16, 10,-17, 6,-16, -6, 1, -6, 5, 5, -6, -8,-16,-23, -7, 3; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: M= -3, -5,-14, -6, -2,-13, -6,-10,-11, 0, -9, -6, -4, -8, -4, -2, -2, -3, -7,-18,-10, -4; D=-10; /I: I=-10; MD=-22; /M: SY='S'; M= -2, 0,-11, -2, -3,-10, -8, -7, -9, -3,-11, -7, 2,-11, -3, -3, 3, 2, -6,-16, -7, -4; D=-10; /I: I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22; /M: SY='K'; M= -6, 3,-21, 4, 5,-19, -5, -4,-18, 6,-16,-10, 3,-10, 2, 5, -2, -6,-15,-18,-10, 3; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='T'; M= -3, -1,-17, -2, 0,-12,-13, -7, -6, -5, -7, -4, -2,-10, -2, -7, 0, 2, -5,-21, -7, -2; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='R'; M=-11,-13,-26,-14, -8,-13,-22,-10, -5, -5, -2, -3, -8, -1, -6, 5,-10, -5, -8,-25,-11,-10; /M: SY='M'; M= -6,-13,-24,-15, -3,-12,-22, -7, -2, -4, 1, 8,-11,-15, 7, -4,-10, -7, -5,-21, -6, 2; /M: SY='E'; M= -8, 11,-24, 12, 15,-26,-12, -4,-25, 8,-22,-15, 8,-11, 8, 3, 3, 0,-20,-29,-15, 11; /M: SY='K'; M= -2, 0,-23, -4, 0,-16,-13, 5,-19, 6,-17, -8, 4,-15, 1, 2, 0, -2,-16,-23, -4, 0; /M: SY='F'; M= -1,-22,-19,-28,-21, 27,-21,-12, 2,-20, 9, 3,-18,-24,-21,-18,-13, -6, 1, -2, 18,-20; /M: SY='C'; M= -8,-19,108,-28,-28,-19,-28,-29,-28,-28,-19,-19,-18,-38,-28,-28, -8, -8, -9,-48,-28,-28; /M: SY='K'; M= -2, 3,-22, 1, 6,-19,-11, -3,-21, 9,-20,-12, 6,-14, 3, 7, 1, -4,-17,-24,-10, 4; /I: I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25; /M: SY='S'; M= 2, -5,-17, -7, -5,-14,-12, -8,-10, -5,-15, -7, 1,-11, -4, -6, 9, 4, -6,-27, -9, -6; /M: SY='D'; M=-14, 31,-27, 40, 17,-33,-10, 3,-33, 4,-28,-23, 18,-11, 4, -2, 3, -6,-27,-36,-17, 10; /M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-29,-24, 34,-30, -4, 7,-20, 8, 4,-21,-28,-21,-16,-19, -9, 2, 12, 39,-24; /M: SY='V'; M= 13,-19,-12,-21,-17, -9,-20,-24, 12,-14, 1, 1,-19,-21,-20,-18, -3, 0, 26,-27,-13,-19; /M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-30,-24, 14,-31,-14, 22,-22, 14, 10,-22,-26,-19,-20,-17, -7, 16, -7, 20,-24; /M: SY='R'; M= -7, -8,-26, -9, -1,-21,-16, -3,-18, 17,-16, -5, -4,-16, 5, 20, -7, -7,-11,-22, -9, 0; /M: SY='V'; M= 10,-19,-16,-24,-20, -3,-11,-19, 5,-17, 0, 3,-16,-20,-18,-18, -4, -2, 11,-18, -6,-19; /M: SY='K'; M= -9, -2,-25, -4, 5,-25,-19, -7,-24, 27,-23, -9, 0,-12, 8, 22, -3, 0,-16,-23,-10, 6; /M: SY='V'; M= -3,-29,-17,-33,-28, 5,-31,-27, 30,-24, 17, 13,-26,-27,-25,-22,-15, -5, 34,-23, -4,-28; /M: SY='V'; M= -5,-13,-21,-16,-11,-10,-22,-17, 3, -2, 1, 4,-12,-19, -9, -4, -8, 0, 6,-24, -8,-11; /M: SY='E'; M= -1, -2,-23, -3, 6,-22, -3,-12,-18, 0,-18,-12, 0,-12, -2, -3, 3, -3,-12,-27,-17, 1; /M: SY='V'; M= -4,-13,-21,-14, -5,-12,-21,-15, 0, -2, -2, 1,-11,-18, -7, -1, -7, -2, 5,-25,-10, -7; /M: SY='K'; M= -7, 2,-24, 3, 10,-24,-16, -7,-21, 11,-20,-12, 2, -9, 6, 8, 2, -1,-16,-28,-14, 8; /M: SY='E'; M= -6, -8,-24, -8, 4,-13,-21,-12, -7, -3, -4, -4, -9,-11, -2, -4, -5, -1, -6,-24, -9, 0; /M: SY='E'; M= -2, -3,-21, -2, 2,-18,-15,-11,-11, -2,-12, -8, -5,-13, -4, -5, 1, 2, -4,-28,-13, -2; /M: SY='B'; M= -5, 9,-21, 9, 1,-26, 3, -6,-26, -5,-25,-18, 9, -7, -3, -7, 4, -6,-22,-31,-20, -2; /I: I=-3; MD=-5; /M: SY='G'; M= -1, -2,-16, -1, 1,-18, 11, -7,-20, -2,-16,-11, 1, -9, 0, -2, 3, -5,-15,-17,-14, 0; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: M= -1, -1, -9, -2, -3, -9, -2, -7, -7, -7, -7, -5, -1, -6, -4, -8, -1, -3, -6,-14, -8, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-5; /M: SY='B'; M= -4, 4,-20, 4, 1,-17, -7, -1,-17, 0,-14,-10, 4,-12, -2, 0, 0, -4,-13,-23,-10, -1; D=-3; /I: I=-3; DM=-5; /M: SY='F'; M=-12, -8,-25,-11, -9, 7,-17, -6,-13, -8,-10, -6, -6,-20,-11, -6, -8, -6,-12, -1, 7, -9; /M: SY='M'; M= -9, -7,-24, -6, -8,-11,-20,-12, -2, -7, -2, 1, -9,-19, -7, -6,-10, -6, 0,-20, -6, -8; /M: SY='R'; M=-10, -7,-24,-10, -3,-13,-23, -7, -6, 1, -7, -3, -3,-17, 0, 6, -5, 0, -6,-23, -5, -3; /M: SY='Y'; M= -9,-20,-23,-23,-20, 21,-24, -1, 2,-16, 3, 0,-18,-25,-17,-15,-14, -6, -1, 6, 37,-21; /M: SY='E'; M= -4, 0,-21, 0, 8,-18,-19,-12,-12, 0,-12,-10, -2,-11, -1, -3, 3, 8, -7,-28,-13, 3; /M: SY='V'; M= 0,-20,-18,-25,-20, -3,-23,-20, 17,-18, 8, 13,-18,-18,-15,-19, -9, -2, 18,-23, -6,-19; /M: SY='K'; M= -6, 2,-24, 2, 10,-24,-16, -6,-22, 18,-21,-12, 3,-11, 7, 13, 0, -1,-16,-26,-13, 8; /M: SY='I'; M= -7,-22,-23,-25,-18, -8,-27,-16, 19,-13, 7, 11,-18,-22,-10,-14,-13, -7, 18,-23, -4,-16; /M: SY='K'; M= -9,-10,-25,-12, -1,-14,-24,-13, -2, 3, -1, 2, -9,-15, -1, -2,-10, -4, -4,-23, -8, -2; /M: SY='K'; M= -6, 4,-25, 5, 13,-26,-14, -6,-23, 15,-21,-12, 2,-11, 9, 8, 0, -3,-17,-26,-14, 10; /M: SY='V'; M= -3,-23,-17,-26,-21, -3,-26,-22, 22,-18, 8, 15,-22,-19,-18,-18,-10, -1, 27,-26, -8,-21; /M: SY='F'; M=-15,-27,-25,-31,-23, 29,-31,-12, 14,-24, 19, 9,-22,-27,-22,-18,-22,-10, 5, 1, 26,-23; /M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2, 7,-28,-20, -5,-27, 43,-27, -8, 0,-12, 10, 32,-10,-10,-19,-20, -9, 8; /M: SY='S'; M= -2, -6,-22, -6, 0,-19, -1,-10,-20, -2,-17,-10, -2,-10, -1, -3, 3, -2,-15,-25,-15, -1; /M: SY='G'; M= -4, -7,-26, -8,-11,-14, 22,-14,-27,-13,-23,-16, 0,-10,-13,-12, 2, -6,-22,-21,-17,-12; /M: SY='S'; M= -4, 0,-22, 1, 1,-22, -5,-12,-20, -3,-18,-13, 0, -6, -2, -6, 6, 4,-15,-29,-17, -1; /M: SY='D'; M= -7, 2,-24, 5, 0,-17,-18,-10,-11, -3, -5, -5, -4,-13, -4, -6, -6, -5, -8,-27,-11, -2; /M: SY='D'; M= -6, 0,-23, 1, 1,-18,-15, -8,-12, -1, -9, -5, -2,-13, -2, -2, -4, -5, -9,-27,-12, -1; /M: SY='V'; M= -6,-11,-24,-12,-11,-12,-17,-17, 1, -9, -3, 0,-10,-12,-11,-10, -9, -6, 2,-24,-10,-12; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='R'; M= -6, -6,-24, -5, 1,-18,-13,-10,-15, 2,-14, -8, -5, -1, 1, 3, -4, -5,-13,-23,-13, -1; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='R'; M= -5, 3,-21, 2, 6,-17,-13, -3,-17, 6,-16,-10, 3, -8, 4, 7, 0, -2,-15,-21, -9, 4; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='G'; M= 0, -3,-20, -2, -4,-17, 4,-12,-15, -8,-11, -9, -4, -7, -6,-10, -1, -5,-12,-19,-14, -6; D=-5; /I: I=-5; MD=-10; /M: SY='B'; M= -2, 4,-14, 4, 1,-16, 1, -6,-15, -1,-14,-10, 3, -4, -1, -4, 3, 1,-12,-17,-11, 0; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='E'; M= -6, 2,-19, 4, 7,-20,-11, -3,-16, 7,-15, -8, 0, -6, 6, 3, -1, -3,-13,-20,-10, 6; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='R'; M= -7, -7,-19, -8, -3,-12,-16, -8, -7, 4, -9, -3, -4,-11, -2, 8, -5, -2, -3,-18, -7, -4; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='R'; M= -8, -9,-22,-11, -4,-14,-17, -8, -7, -2, -5, 0, -6,-12, 4, 5, -5, -2, -8,-19, -8, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='F'; M= -9,-10,-20,-14,-12, 11,-20,-10, -4,-13, -4, -3, -7,-19,-13,-10, -4, 0, -3,-11, 6,-12; D=-5; /I: I=-5; DM=-10; /M: SY='L'; M= -7,-27,-21,-32,-23, 9,-30,-23, 24,-25, 26, 16,-24,-25,-20,-21,-20, -7, 18,-19, 0,-22; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='Y'; M=-12,-17,-26,-18,-13, 8,-21, -1, -7, -7, -4, -3,-15,-22, -8, -4,-15,-10,-10, 19, 24,-12; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='T'; M= -4,-15,-15,-18,-15, -2,-22,-17, 9,-14, 6, 3,-12,-13,-13,-12, -3, 10, 10,-20, -4,-15; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='P'; M= -5, -4,-21, -4, 1,-13,-12, -6,-14, 3,-16,-10, -1, 7, -2, 3, -3, -4,-14,-17, -9, -2; D=-9; /I: I=-9; MD=-18; /M: SY='A'; M= 3, -3,-12, -4, 0, -9, -6, -8, -9, -4, -8, -7, -3, -2, -3, -5, 3, 1, -6,-15, -9, -2; D=-9; /I: I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='S'; M= -2, 2,-13, 1, 1,-14, -8, -5,-13, 2,-14, -6, 3, -8, 1, -1, 6, 3,-10,-21, -9, 1; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='D'; M= -6, 9,-21, 12, 7,-20, -5, 4,-21, 0,-19,-14, 6, -8, 1, -3, 3, -4,-17,-24, -9, 3; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='A'; M= 8,-13,-17,-16, -9,-11,-12,-15, -2,-11, -3, -2,-10,-11, -8,-11, 1, -1, 1,-17,-11, -9; D=-9; /I: I=-9; DM=-18; /M: SY='S'; M= 0, -5,-20, -7, -5,-17, -8, -5,-13, -6,-12, -7, -1,-14, -3, -7, 4, 1, -8,-27,-12, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30; /M: SY='R'; M= -6, -7,-28, -7, -5,-24, 5,-12,-26, 4,-21,-12, -3, -5, -3, 8, -4, -7,-20,-23,-18, -5; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='C'; M= -2,-13, 40,-19,-17,-13,-19,-15,-14,-18,-10, -9,-12,-24,-15,-18, -4, -5, -3,-32,-16,-16; D=-10; /I: I=-10; DM=-22; /M: SY='P'; M= -7,-14,-28,-12, -4,-16,-20, -7,-10, -9, -6, -5,-12, 19, -8,-11,-11, -6,-14,-26,-13, -8; /M: SY='R'; M=-11, -1,-27, -2, 1,-19,-16, -4,-14, 4,-10, -6, 2,-12, 3, 6, -7, -7,-15,-25,-10, 1; /M: SY='L'; M= -9,-23,-21,-24,-15, 6,-27,-17, 15,-23, 26, 15,-22,-23,-16,-18,-19, -7, 9,-21, -2,-16; /M: SY='R'; M= -7, 1,-24, 1, 6,-22,-15, -6,-17, 7,-15, -9, 1,-15, 5, 8, -2, -4,-12,-26,-12, 5; /M: SY='N'; M= -5, -1,-24, -2, 0,-20,-10,-11,-14, -1,-16,-11, 3, -2, -5, -4, -2, -5,-13,-29,-17, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='G'; M= -3, 3,-26, 1, -5,-27, 24, -8,-30, -5,-27,-17, 10,-13, -6, -8, 3, -9,-25,-27,-22, -6; /M: SY='K'; M= -8, -2,-27, -2, 6,-22,-12, -2,-22, 15,-18, -8, 0,-14, 6, 13, -6, -7,-18,-22, -9, 5; /M: SY='E'; M= -8, 4,-25, 6, 15,-25,-16, 1,-20, 2,-19,-11, 3, -5, 11, -1, 3, 0,-18,-30,-14, 12; /M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-23,-22, 35,-30, 11, 2,-14, 5, 1,-21,-30,-15,-12,-20,-10, -6, 23, 66,-22; /M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-22, 8,-31,-22, 24,-29, 44, 19,-29,-29,-21,-21,-27, -9, 15,-21, -1,-22; /M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-36,-27, 5,-35,-26, 37,-28, 25, 19,-24,-24,-22,-25,-20, -8, 28,-21, -1,-27; /M: SY='M'; M= 1,-18,-18,-26,-18, -4,-16,-11, 7,-13, 8, 25,-17,-19, -8,-14,-11, -3, 5,-11, -3,-13; /M: SY='G'; M= 1,-10,-25,-11,-20,-29, 63,-20,-38,-20,-28,-19, -1,-20,-20,-20, 0,-18,-28,-21,-29,-20; /M: SY='R'; M= -9, -3,-26, -3, 5,-20,-17, 0,-19, 10,-16, -6, -1,-14, 11, 13, -3, -6,-17,-21, -5, 7; /M: M= -3, -3,-21, -2, 0,-15,-18,-11, -7, -3, -8, -5, -6,-16, -6, -7, -2, -2, -1,-27,-10, -3; /M: SY='D'; M= -5, -1,-24, 1, 1,-20, -7, -7,-18, -5,-16,-12, -2,-12, -2, -4, 0, -5,-13,-23,-12, -1; /M: SY='D'; M= -6, 11,-25, 15, 10,-26, -4, -6,-25, -1,-21,-17, 7,-10, -1, -4, 2, -5,-19,-30,-18, 4; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='N'; M= -4, 1,-21, 1, -2,-18, -2, -9,-16, -7,-12,-10, 2,-13, -5, -7, 1, -2,-13,-26,-14, -4; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: M= -7, -6,-22, -7, -4,-13, -8, -3,-13, -2,-13, -7, -4, -8, -1, -2, -4, -5,-13, -6, -3, -3; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='D'; M= -4, 0,-19, 2, -1,-15, -6, -5,-14, -1,-11, -8, -1,-10, -2, 1, -2, -4,-10,-19, -9, -2; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: M= -5, -6,-15, -6, -4, -8, -8, -5, -4, -6, 0, 0, -4,-12, -3, -3, -5, -4, -4,-16, -6, -4; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='G'; M= -5, -8,-15, -9, -8, -4, 1, -6, -9, -8, -6, -4, -6, -8, -7, -7, -4, -5, -9, -9, 0, -9; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='R'; M= -6, -1,-19, -2, 1,-17, -3, -3,-16, 8,-16, -7, 3,-11, 7, 9, -1, -6,-14,-16, -8, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='Y'; M=-10,-18,-19,-20,-15, 10,-21, -3, 8,-13, 13, 11,-18,-19,-10,-10,-16, -7, 3, 0, 21,-14; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='I'; M= -6,-17,-18,-20,-15, 0,-22, -5, 10,-14, 8, 9,-15,-15,-12,-13,-11, -5, 10,-18, 1,-15; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='L'; M= -5,-22,-18,-26,-19, 4,-26,-18, 22,-22, 23, 13,-19,-20,-16,-19,-17, -5, 15,-17, -1,-19; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='D'; M= -5, 7,-20, 9, -1,-20, 5, -6,-20, -8,-17,-13, 5, -9, -6, -9, 3, 0,-16,-25,-15, -4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -5, -5,-22, -4, 6,-15,-16, -8,-13, 1, -9, -7, -5, -2, 1, -1, -2, -3,-12,-23,-11, 3; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='C'; M= -9, 0, 8, -4, -8,-19,-13, -9,-19, -9,-15,-12, 3,-23, -8, -7, -3, -6,-13,-33,-16, -9; /M: SY='T'; M= 0, 7,-11, 3, -4,-16, -9, -8,-18, -8,-20,-15, 10,-13, -5, -9, 18, 19,-11,-33,-14, -5; /M: SY='W'; M=-12,-25,-28,-28,-22, 19,-23,-18, -4,-18, 0, -4,-21,-26,-19,-14,-20,-12, -7, 33, 17,-19; /M: SY='V'; M= -2,-27,-18,-31,-26, 0,-30,-25, 29,-22, 15, 13,-23,-25,-21,-21,-13, -4, 31,-24, -5,-25; /M: SY='E'; M= -7, -6,-24, -4, 14,-14,-22, -6, -9, -2, -6, -4, -9,-13, 1, -5, -7, -8, -7,-23, -7, 7; /M: SY='P'; M= -8, -9,-30, -7, 5,-18,-18, -1,-20, 4,-19,-10, -8, 9, 2, 1, -8, -9,-21,-15, -6, 2; /M: SY='W'; M=-17,-35,-44,-36,-27, 11,-21,-24,-15,-17,-15,-13,-34,-28,-18,-17,-34,-25,-23,114, 26,-18; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='P'; M= -8, -5,-23, -2, 5,-19,-14, -6,-17, 6,-18,-11, -5, 20, 1, 4, -4, -4,-17,-20,-14, 1; D=-6; /I: I=-6; MD=-12; /M: SY='T'; M= -3, 2,-12, 2, 1,-10, -7, -4, -9, -2, -9, -7, 3, -2, -2, -3, 3, 4, -8,-16, -8, -1; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='D'; M=-11, 13,-20, 17, 11,-23,-12, 1,-21, 6,-16,-11, 8,-10, 10, 7, -2, -7,-19,-23,-11, 10; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='K'; M= -3, 2,-19, 2, 6,-20,-12, -6,-19, 12,-17,-10, 2, -7, 4, 10, 1, 1,-13,-21,-11, 4; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='L'; M= -7,-18,-21,-20,-13, 0,-18,-13, -2, -9, 5, 2,-16,-16,-10, -7,-15, -8, -4, 2, 2,-11; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='C'; M= 1, -3, 10, -6, -6,-17,-10,-12,-17, -9,-17,-12, -1,-16, -6,-11, 7, 3, -9,-29,-14, -6; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='R'; M= -5, -5,-23, -5, -1,-15,-15, -9,-15, 5,-10, -7, -4,-10, 0, 8, -4, -4,-12,-22,-10, -1; D=-6; /I: I=-6; DM=-12; /M: SY='E'; M= -6, 2,-24, 2, 7,-21,-11, -5,-20, 4,-17,-11, 2,-11, 4, 5, 0, -4,-16,-27,-14, 5; /M: SY='L'; M= -9,-17,-23,-20, -9, 1,-25, -9, 4,-14, 10, 9,-15,-19, 0,-10,-14, -8, -1,-18, -1, -4; /M: SY='R'; M= -7, -1,-26, -2, 3,-24,-11, -2,-24, 17,-20, -9, 2,-14, 7, 19, -4, -8,-19,-23,-11, 4; /M: SY='R'; M=-10, 0,-25, 1, 10,-22,-17, -5,-25, 18,-20,-11, 1,-12, 10, 21, -4, -6,-20,-23,-11, 9; /M: SY='F'; M= -3,-20,-18,-26,-19, 15,-14,-19, -2,-20, 3, 0,-15,-22,-20,-17, -9, -5, -1, -9, 1,-19; /M: SY='L'; M= -3,-15,-20,-17, -9, -4,-21,-14, 3,-14, 6, 4,-14,-20, -6,-11, -8, -3, 3,-20, -6, -8; /M: SY='R'; M= -9, 6,-25, 3, 6,-21,-13, 0,-20, 8,-20, -9, 9,-12, 8, 11, 0, -3,-19,-27,-12, 6; /I: I=-11; MD=-23; /M: SY='R'; M= -9, 1,-24, 1, 5,-19,-16, 5,-21, 9,-19,-10, 4,-15, 7, 10, -2, -6,-18,-23, -5, 5; D=-11; /I: I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-17, -9, 0,-22, -7, 1,-10, 5, 6,-13,-20, -7, -5,-13, -7, -3, -7, 5, -9; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='R'; M=-12,-10,-25,-10, -4, -5,-20, -1,-12, 8,-10, -4, -7,-18, 0, 10, -9, -6,-11,-10, 10, -3; D=-11; /I: I=-11; DM=-23; /M: SY='H'; M= -4, -3,-22, -5, -1,-18,-16, 3,-14, 3,-13, -5, 0,-15, 2, 3, -1, -3,-10,-26, -8, 0; /M: M= -7,-10,-24,-14, -8, -5,-12, -2,-11, -6, -6, -1, -6,-18, -4, -2, -7, -7,-10,-18, -1, -7; /M: SY='G'; M= -4, -4,-28, -5, -4,-28, 20,-12,-30, 3,-26,-15, 2,-12, -3, 2, -2,-11,-24,-23,-21, -4; /M: SY='C'; M=-10,-20,113,-29,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-19,-19,-20,-39,-29,-28,-10,-10,-10,-49,-29,-29; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 120 in 120 different sequences |
| Number of true positive hits | 120 in 120 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | NTR |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
120 sequences
ATL5_HUMAN (Q6ZMM2), CO3_BOVIN (Q2UVX4), CO3_CAVPO (P12387), CO3_EPTBU (P98094), CO3_HUMAN (P01024), CO3_LETCA (Q00685), CO3_MOUSE (P01027), CO3_NAJNA (Q01833), CO3_ONCMY (P98093), CO3_PIG (P01025), CO3_RABIT (P12247), CO3_RAT (P01026), CO3_XENLA (P23667), CO4A_HUMAN (P0C0L4), CO4B_HUMAN (P0C0L5), CO4B_MOUSE (P01029), CO4_BOVIN (P01030), CO4_RAT (P08649), CO5_HUMAN (P01031), CO5_MOUSE (P06684), CO5_RAT (P08650), CQ058_HUMAN (Q2M2W7), CQ058_MOUSE (Q08AU9), CQ058_XENLA (A2BDC9), NCP_PINMG (H2A0N2), NET1_CHICK (Q90922), NET1_HUMAN (O95631), NET1_MOUSE (O09118), NET1_PIG(Q2HXW4), NET1_RAT(Q924Z9), NET3_CHICK (Q90923), NET3_HUMAN (O00634), NET3_MOUSE (Q9R1A3), NET4_HUMAN (Q9HB63), NET4_MOUSE (Q9JI33), NET4_PONAB (Q5RB89), NET5_HUMAN (Q8WTR8), NET5_MOUSE (Q3UQ22), NET5_RAT(D3ZT86), NETA_DROME (Q24567), NETB_DROME (Q24568), PCOC1_HUMAN (Q15113), PCOC1_MOUSE (Q61398), PCOC1_RAT (O08628), PCOC2_HUMAN (Q9UKZ9), PCOC2_MOUSE (Q8R4W6), SFRP1_BOVIN (O19116), SFRP1_CHICK (Q9DEQ4), SFRP1_HUMAN (Q8N474), SFRP1_MOUSE (Q8C4U3), SFRP1_RAT (Q9R168), SFRP2_CANLF (Q863H1), SFRP2_CHICK (Q9IA96), SFRP2_HUMAN (Q96HF1), SFRP2_MOUSE (P97299), SFRP3_BOVIN (Q95117), SFRP3_CHICK (Q9IA95), SFRP3_HUMAN (Q92765), SFRP3_MOUSE (P97401), SFRP3_PONAB (Q5RF67), SFRP4_HUMAN (Q6FHJ7), SFRP4_MACMU (Q7YRN1), SFRP4_MOUSE (Q9Z1N6), SFRP4_RAT (Q9JLS4), SFRP5_BOVIN (Q9XSC1), SFRP5_HUMAN (Q5T4F7), SFRP5_MOUSE (Q9WU66), TIMP1_BOVIN (P20414), TIMP1_CANLF (P81546), TIMP1_HORSE (O02722), TIMP1_HUMAN (P01033), TIMP1_MACMU (Q95KL9), TIMP1_MOUSE (P12032), TIMP1_PAPCY (P49061), TIMP1_PIG (P35624), TIMP1_PONAB (Q5RC60), TIMP1_RABIT (P20614), TIMP1_RAT (P30120), TIMP1_SHEEP (P50122), TIMP2_BOVIN (P16368), TIMP2_CANLF (Q9TTY1), TIMP2_CAVPO (Q9WUC6), TIMP2_CHICK (O42146), TIMP2_CRILO (Q60453), TIMP2_HORSE (O77717), TIMP2_HUMAN (P16035), TIMP2_MOUSE (P25785), TIMP2_RABIT (Q9TRZ7), TIMP2_RAT (P30121), TIMP3_BOVIN (P79121), TIMP3_CHICK (P26652), TIMP3_HORSE (Q9TUL9), TIMP3_HUMAN (P35625), TIMP3_MACFA (P61269), TIMP3_MACMU (Q5PXZ9), TIMP3_MOUSE (P39876), TIMP3_RABIT (O97590), TIMP3_RAT (P48032), TIMP3_SCYTO (Q9W6B4), TIMP3_XENLA (O73746), TIMP4_BOVIN (O97563), TIMP4_HUMAN (Q99727), TIMP4_MOUSE (Q9JHB3), TIMP4_RABIT (O97591), TIMP4_RAT (P81556), TIMPL_CAEEL (Q21265), TIMP_DROME (Q9VH14), UNC6_CAEEL (P34710), VCO31_AUSSU (Q0ZZJ6), VCO32_AUSSU (A0RZC6), VCO3_CROAD (J3S836), VCO3_NAJKA (Q91132), VCO3_OPHHA (I2C090), WFKN1_HUMAN (Q96NZ8), WFKN1_MOUSE (Q8R0S6), WFKN1_RAT (P0C5J5), WFKN2_BOVIN (Q08E66), WFKN2_HUMAN (Q8TEU8), WFKN2_MOUSE (Q7TQN3), WFKN_DANRE (Q6NUX0)» more
|
| PDB [Detailed view] |
92 PDB
1BQQ; 1BR9; 1BUV; 1D2B; 1GXD; 1OO9; 1UAP; 1UEA; 1XWE; 2A73; 2A74; 2E2D; 2I07; 2ICE; 2ICF; 2J0T; 2QKI; 2TMP; 2WII; 2WIN; 2XWB; 2XWJ; 3CKI; 3CU7; 3FRP; 3G6J; 3HRZ; 3HS0; 3KLS; 3KM9; 3L3O; 3L5N; 3MA2; 3NMS; 3OHX; 3PRX; 3PVM; 3T4A; 3V96; 4A5W; 4E0S; 4ILW; 5FO7; 5FO8; 5FO9; 5FOA; 5FOB; 5HCC; 5HCD; 5HCE; 5I5K; 5JPM; 5JPN; 5JTW; 5O32; 5O35; 6EHG; 6H03; 6H04; 6MAV; 6N9D; 6RQJ; 6RUR; 6RUV; 6S0B; 6XZU; 6YO6; 6YSQ; 7AD6; 7AD7; 7AKK; 7BAG; 7NOZ; 7NYC; 7NYD; 7QIV; 7S7L; 7S7M; 7TV9; 7ZGK; 8AYH; 8B0F; 8B0G; 8B0H; 8CEM; 8ENU; 8EOK; 8OQ3; 8OVB; 8SNP; 8UH2; 8UIN » more |