Entry: PS50189

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] NTR
Accession [info] PS50189
Entry type [info] MATRIX
Date [info] NOV-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50189
Associated ProRule [info] PRU00295

Name and characterization of the entry

Description [info] NTR domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=134;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2237029; R2=0.0172534; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=7087.7629; R2=19.9181; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=364; N_SCORE=8.5; H_SCORE=12027; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=248; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12027; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='C'; M=-10,-20,118,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-29,-20,-20,-20,-40,-30,-29,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='P'; M= -2, -4,-24, -3,  2,-19,-10,-11,-20, -2,-22,-14, -1,  7,  0, -6,  6,  1,-18,-27,-16,  0;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='Q'; M= -3, -5,-18, -6, -1,-12,-11, -6, -9,  1, -9, -1, -4, -7,  4,  0, -2, -3, -9,-17, -7,  1; D=-14;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='Q'; M= -6, -3,-13, -3,  2,-11,-11,  3, -8,  4, -6, -1, -2, -6,  9,  4, -4, -4, -9,-10, -1,  5; D=-14;
/I:         I=-14; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
/M: SY='C'; M=-10,-15, 73,-22,-19,-21,-26,-22,-26,-16,-20,-16,-14,-28,-17,-17, -8, -8,-12,-42,-24,-19;
/M: SY='K'; M= -5, -1,-23, -1,  4,-22,-15, -7,-21, 14,-21,-10,  0,-10,  3, 11,  0, -3,-14,-26,-13,  3;
/M: SY='P'; M= -4, -5,-27, -5,  1,-21,-13,-10,-15, -2,-17,-10, -2, 10, -1, -5, -2, -4,-16,-27,-17, -2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -4, -5,-18, -5,  2,-15,-16,-11,-11, -3,-12, -8, -5, -9, -3, -7, -1, -2, -7,-27,-13, -1; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='H'; M=-10,  0,-25,  1,  5,-20,-16, 10,-17,  6,-16, -6,  1, -6,  5,  5, -6, -8,-16,-23, -7,  3; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M:         M= -3, -5,-14, -6, -2,-13, -6,-10,-11,  0, -9, -6, -4, -8, -4, -2, -2, -3, -7,-18,-10, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='S'; M= -2,  0,-11, -2, -3,-10, -8, -7, -9, -3,-11, -7,  2,-11, -3, -3,  3,  2, -6,-16, -7, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MI=-22; MD=-22; IM=-22; DM=-22;
/M: SY='K'; M= -6,  3,-21,  4,  5,-19, -5, -4,-18,  6,-16,-10,  3,-10,  2,  5, -2, -6,-15,-18,-10,  3; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='T'; M= -3, -1,-17, -2,  0,-12,-13, -7, -6, -5, -7, -4, -2,-10, -2, -7,  0,  2, -5,-21, -7, -2; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='R'; M=-11,-13,-26,-14, -8,-13,-22,-10, -5, -5, -2, -3, -8, -1, -6,  5,-10, -5, -8,-25,-11,-10;
/M: SY='M'; M= -6,-13,-24,-15, -3,-12,-22, -7, -2, -4,  1,  8,-11,-15,  7, -4,-10, -7, -5,-21, -6,  2;
/M: SY='E'; M= -8, 11,-24, 12, 15,-26,-12, -4,-25,  8,-22,-15,  8,-11,  8,  3,  3,  0,-20,-29,-15, 11;
/M: SY='K'; M= -2,  0,-23, -4,  0,-16,-13,  5,-19,  6,-17, -8,  4,-15,  1,  2,  0, -2,-16,-23, -4,  0;
/M: SY='F'; M= -1,-22,-19,-28,-21, 27,-21,-12,  2,-20,  9,  3,-18,-24,-21,-18,-13, -6,  1, -2, 18,-20;
/M: SY='C'; M= -8,-19,108,-28,-28,-19,-28,-29,-28,-28,-19,-19,-18,-38,-28,-28, -8, -8, -9,-48,-28,-28;
/M: SY='K'; M= -2,  3,-22,  1,  6,-19,-11, -3,-21,  9,-20,-12,  6,-14,  3,  7,  1, -4,-17,-24,-10,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-17, -7, -5,-14,-12, -8,-10, -5,-15, -7,  1,-11, -4, -6,  9,  4, -6,-27, -9, -6;
/M: SY='D'; M=-14, 31,-27, 40, 17,-33,-10,  3,-33,  4,-28,-23, 18,-11,  4, -2,  3, -6,-27,-36,-17, 10;
/M: SY='Y'; M=-15,-25,-25,-29,-24, 34,-30, -4,  7,-20,  8,  4,-21,-28,-21,-16,-19, -9,  2, 12, 39,-24;
/M: SY='V'; M= 13,-19,-12,-21,-17, -9,-20,-24, 12,-14,  1,  1,-19,-21,-20,-18, -3,  0, 26,-27,-13,-19;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-23,-30,-24, 14,-31,-14, 22,-22, 14, 10,-22,-26,-19,-20,-17, -7, 16, -7, 20,-24;
/M: SY='R'; M= -7, -8,-26, -9, -1,-21,-16, -3,-18, 17,-16, -5, -4,-16,  5, 20, -7, -7,-11,-22, -9,  0;
/M: SY='V'; M= 10,-19,-16,-24,-20, -3,-11,-19,  5,-17,  0,  3,-16,-20,-18,-18, -4, -2, 11,-18, -6,-19;
/M: SY='K'; M= -9, -2,-25, -4,  5,-25,-19, -7,-24, 27,-23, -9,  0,-12,  8, 22, -3,  0,-16,-23,-10,  6;
/M: SY='V'; M= -3,-29,-17,-33,-28,  5,-31,-27, 30,-24, 17, 13,-26,-27,-25,-22,-15, -5, 34,-23, -4,-28;
/M: SY='V'; M= -5,-13,-21,-16,-11,-10,-22,-17,  3, -2,  1,  4,-12,-19, -9, -4, -8,  0,  6,-24, -8,-11;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-23, -3,  6,-22, -3,-12,-18,  0,-18,-12,  0,-12, -2, -3,  3, -3,-12,-27,-17,  1;
/M: SY='V'; M= -4,-13,-21,-14, -5,-12,-21,-15,  0, -2, -2,  1,-11,-18, -7, -1, -7, -2,  5,-25,-10, -7;
/M: SY='K'; M= -7,  2,-24,  3, 10,-24,-16, -7,-21, 11,-20,-12,  2, -9,  6,  8,  2, -1,-16,-28,-14,  8;
/M: SY='E'; M= -6, -8,-24, -8,  4,-13,-21,-12, -7, -3, -4, -4, -9,-11, -2, -4, -5, -1, -6,-24, -9,  0;
/M: SY='E'; M= -2, -3,-21, -2,  2,-18,-15,-11,-11, -2,-12, -8, -5,-13, -4, -5,  1,  2, -4,-28,-13, -2;
/M: SY='B'; M= -5,  9,-21,  9,  1,-26,  3, -6,-26, -5,-25,-18,  9, -7, -3, -7,  4, -6,-22,-31,-20, -2;
/I:         I=-3; MD=-5;
/M: SY='G'; M= -1, -2,-16, -1,  1,-18, 11, -7,-20, -2,-16,-11,  1, -9,  0, -2,  3, -5,-15,-17,-14,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M:         M= -1, -1, -9, -2, -3, -9, -2, -7, -7, -7, -7, -5, -1, -6, -4, -8, -1, -3, -6,-14, -8, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='B'; M= -4,  4,-20,  4,  1,-17, -7, -1,-17,  0,-14,-10,  4,-12, -2,  0,  0, -4,-13,-23,-10, -1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='F'; M=-12, -8,-25,-11, -9,  7,-17, -6,-13, -8,-10, -6, -6,-20,-11, -6, -8, -6,-12, -1,  7, -9;
/M: SY='M'; M= -9, -7,-24, -6, -8,-11,-20,-12, -2, -7, -2,  1, -9,-19, -7, -6,-10, -6,  0,-20, -6, -8;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-24,-10, -3,-13,-23, -7, -6,  1, -7, -3, -3,-17,  0,  6, -5,  0, -6,-23, -5, -3;
/M: SY='Y'; M= -9,-20,-23,-23,-20, 21,-24, -1,  2,-16,  3,  0,-18,-25,-17,-15,-14, -6, -1,  6, 37,-21;
/M: SY='E'; M= -4,  0,-21,  0,  8,-18,-19,-12,-12,  0,-12,-10, -2,-11, -1, -3,  3,  8, -7,-28,-13,  3;
/M: SY='V'; M=  0,-20,-18,-25,-20, -3,-23,-20, 17,-18,  8, 13,-18,-18,-15,-19, -9, -2, 18,-23, -6,-19;
/M: SY='K'; M= -6,  2,-24,  2, 10,-24,-16, -6,-22, 18,-21,-12,  3,-11,  7, 13,  0, -1,-16,-26,-13,  8;
/M: SY='I'; M= -7,-22,-23,-25,-18, -8,-27,-16, 19,-13,  7, 11,-18,-22,-10,-14,-13, -7, 18,-23, -4,-16;
/M: SY='K'; M= -9,-10,-25,-12, -1,-14,-24,-13, -2,  3, -1,  2, -9,-15, -1, -2,-10, -4, -4,-23, -8, -2;
/M: SY='K'; M= -6,  4,-25,  5, 13,-26,-14, -6,-23, 15,-21,-12,  2,-11,  9,  8,  0, -3,-17,-26,-14, 10;
/M: SY='V'; M= -3,-23,-17,-26,-21, -3,-26,-22, 22,-18,  8, 15,-22,-19,-18,-18,-10, -1, 27,-26, -8,-21;
/M: SY='F'; M=-15,-27,-25,-31,-23, 29,-31,-12, 14,-24, 19,  9,-22,-27,-22,-18,-22,-10,  5,  1, 26,-23;
/M: SY='K'; M=-12, -2,-30, -2,  7,-28,-20, -5,-27, 43,-27, -8,  0,-12, 10, 32,-10,-10,-19,-20, -9,  8;
/M: SY='S'; M= -2, -6,-22, -6,  0,-19, -1,-10,-20, -2,-17,-10, -2,-10, -1, -3,  3, -2,-15,-25,-15, -1;
/M: SY='G'; M= -4, -7,-26, -8,-11,-14, 22,-14,-27,-13,-23,-16,  0,-10,-13,-12,  2, -6,-22,-21,-17,-12;
/M: SY='S'; M= -4,  0,-22,  1,  1,-22, -5,-12,-20, -3,-18,-13,  0, -6, -2, -6,  6,  4,-15,-29,-17, -1;
/M: SY='D'; M= -7,  2,-24,  5,  0,-17,-18,-10,-11, -3, -5, -5, -4,-13, -4, -6, -6, -5, -8,-27,-11, -2;
/M: SY='D'; M= -6,  0,-23,  1,  1,-18,-15, -8,-12, -1, -9, -5, -2,-13, -2, -2, -4, -5, -9,-27,-12, -1;
/M: SY='V'; M= -6,-11,-24,-12,-11,-12,-17,-17,  1, -9, -3,  0,-10,-12,-11,-10, -9, -6,  2,-24,-10,-12;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='R'; M= -6, -6,-24, -5,  1,-18,-13,-10,-15,  2,-14, -8, -5, -1,  1,  3, -4, -5,-13,-23,-13, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='R'; M= -5,  3,-21,  2,  6,-17,-13, -3,-17,  6,-16,-10,  3, -8,  4,  7,  0, -2,-15,-21, -9,  4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='G'; M=  0, -3,-20, -2, -4,-17,  4,-12,-15, -8,-11, -9, -4, -7, -6,-10, -1, -5,-12,-19,-14, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-10;
/M: SY='B'; M= -2,  4,-14,  4,  1,-16,  1, -6,-15, -1,-14,-10,  3, -4, -1, -4,  3,  1,-12,-17,-11,  0; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-19,  4,  7,-20,-11, -3,-16,  7,-15, -8,  0, -6,  6,  3, -1, -3,-13,-20,-10,  6; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-19, -8, -3,-12,-16, -8, -7,  4, -9, -3, -4,-11, -2,  8, -5, -2, -3,-18, -7, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -8, -9,-22,-11, -4,-14,-17, -8, -7, -2, -5,  0, -6,-12,  4,  5, -5, -2, -8,-19, -8, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='F'; M= -9,-10,-20,-14,-12, 11,-20,-10, -4,-13, -4, -3, -7,-19,-13,-10, -4,  0, -3,-11,  6,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-10;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-21,-32,-23,  9,-30,-23, 24,-25, 26, 16,-24,-25,-20,-21,-20, -7, 18,-19,  0,-22;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='Y'; M=-12,-17,-26,-18,-13,  8,-21, -1, -7, -7, -4, -3,-15,-22, -8, -4,-15,-10,-10, 19, 24,-12; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='T'; M= -4,-15,-15,-18,-15, -2,-22,-17,  9,-14,  6,  3,-12,-13,-13,-12, -3, 10, 10,-20, -4,-15; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='P'; M= -5, -4,-21, -4,  1,-13,-12, -6,-14,  3,-16,-10, -1,  7, -2,  3, -3, -4,-14,-17, -9, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='A'; M=  3, -3,-12, -4,  0, -9, -6, -8, -9, -4, -8, -7, -3, -2, -3, -5,  3,  1, -6,-15, -9, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='S'; M= -2,  2,-13,  1,  1,-14, -8, -5,-13,  2,-14, -6,  3, -8,  1, -1,  6,  3,-10,-21, -9,  1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='D'; M= -6,  9,-21, 12,  7,-20, -5,  4,-21,  0,-19,-14,  6, -8,  1, -3,  3, -4,-17,-24, -9,  3; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='A'; M=  8,-13,-17,-16, -9,-11,-12,-15, -2,-11, -3, -2,-10,-11, -8,-11,  1, -1,  1,-17,-11, -9; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-18;
/M: SY='S'; M=  0, -5,-20, -7, -5,-17, -8, -5,-13, -6,-12, -7, -1,-14, -3, -7,  4,  1, -8,-27,-12, -4;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-28, -7, -5,-24,  5,-12,-26,  4,-21,-12, -3, -5, -3,  8, -4, -7,-20,-23,-18, -5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='C'; M= -2,-13, 40,-19,-17,-13,-19,-15,-14,-18,-10, -9,-12,-24,-15,-18, -4, -5, -3,-32,-16,-16; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-22;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-28,-12, -4,-16,-20, -7,-10, -9, -6, -5,-12, 19, -8,-11,-11, -6,-14,-26,-13, -8;
/M: SY='R'; M=-11, -1,-27, -2,  1,-19,-16, -4,-14,  4,-10, -6,  2,-12,  3,  6, -7, -7,-15,-25,-10,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-23,-21,-24,-15,  6,-27,-17, 15,-23, 26, 15,-22,-23,-16,-18,-19, -7,  9,-21, -2,-16;
/M: SY='R'; M= -7,  1,-24,  1,  6,-22,-15, -6,-17,  7,-15, -9,  1,-15,  5,  8, -2, -4,-12,-26,-12,  5;
/M: SY='N'; M= -5, -1,-24, -2,  0,-20,-10,-11,-14, -1,-16,-11,  3, -2, -5, -4, -2, -5,-13,-29,-17, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='G'; M= -3,  3,-26,  1, -5,-27, 24, -8,-30, -5,-27,-17, 10,-13, -6, -8,  3, -9,-25,-27,-22, -6;
/M: SY='K'; M= -8, -2,-27, -2,  6,-22,-12, -2,-22, 15,-18, -8,  0,-14,  6, 13, -6, -7,-18,-22, -9,  5;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-25,  6, 15,-25,-16,  1,-20,  2,-19,-11,  3, -5, 11, -1,  3,  0,-18,-30,-14, 12;
/M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-23,-22, 35,-30, 11,  2,-14,  5,  1,-21,-30,-15,-12,-20,-10, -6, 23, 66,-22;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-31,-22,  8,-31,-22, 24,-29, 44, 19,-29,-29,-21,-21,-27, -9, 15,-21, -1,-22;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-24,-36,-27,  5,-35,-26, 37,-28, 25, 19,-24,-24,-22,-25,-20, -8, 28,-21, -1,-27;
/M: SY='M'; M=  1,-18,-18,-26,-18, -4,-16,-11,  7,-13,  8, 25,-17,-19, -8,-14,-11, -3,  5,-11, -3,-13;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-25,-11,-20,-29, 63,-20,-38,-20,-28,-19, -1,-20,-20,-20,  0,-18,-28,-21,-29,-20;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-26, -3,  5,-20,-17,  0,-19, 10,-16, -6, -1,-14, 11, 13, -3, -6,-17,-21, -5,  7;
/M:         M= -3, -3,-21, -2,  0,-15,-18,-11, -7, -3, -8, -5, -6,-16, -6, -7, -2, -2, -1,-27,-10, -3;
/M: SY='D'; M= -5, -1,-24,  1,  1,-20, -7, -7,-18, -5,-16,-12, -2,-12, -2, -4,  0, -5,-13,-23,-12, -1;
/M: SY='D'; M= -6, 11,-25, 15, 10,-26, -4, -6,-25, -1,-21,-17,  7,-10, -1, -4,  2, -5,-19,-30,-18,  4;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='N'; M= -4,  1,-21,  1, -2,-18, -2, -9,-16, -7,-12,-10,  2,-13, -5, -7,  1, -2,-13,-26,-14, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M:         M= -7, -6,-22, -7, -4,-13, -8, -3,-13, -2,-13, -7, -4, -8, -1, -2, -4, -5,-13, -6, -3, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='D'; M= -4,  0,-19,  2, -1,-15, -6, -5,-14, -1,-11, -8, -1,-10, -2,  1, -2, -4,-10,-19, -9, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M:         M= -5, -6,-15, -6, -4, -8, -8, -5, -4, -6,  0,  0, -4,-12, -3, -3, -5, -4, -4,-16, -6, -4; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='G'; M= -5, -8,-15, -9, -8, -4,  1, -6, -9, -8, -6, -4, -6, -8, -7, -7, -4, -5, -9, -9,  0, -9; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='R'; M= -6, -1,-19, -2,  1,-17, -3, -3,-16,  8,-16, -7,  3,-11,  7,  9, -1, -6,-14,-16, -8,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='Y'; M=-10,-18,-19,-20,-15, 10,-21, -3,  8,-13, 13, 11,-18,-19,-10,-10,-16, -7,  3,  0, 21,-14; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='I'; M= -6,-17,-18,-20,-15,  0,-22, -5, 10,-14,  8,  9,-15,-15,-12,-13,-11, -5, 10,-18,  1,-15; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='L'; M= -5,-22,-18,-26,-19,  4,-26,-18, 22,-22, 23, 13,-19,-20,-16,-19,-17, -5, 15,-17, -1,-19; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='D'; M= -5,  7,-20,  9, -1,-20,  5, -6,-20, -8,-17,-13,  5, -9, -6, -9,  3,  0,-16,-25,-15, -4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-22, -4,  6,-15,-16, -8,-13,  1, -9, -7, -5, -2,  1, -1, -2, -3,-12,-23,-11,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='C'; M= -9,  0,  8, -4, -8,-19,-13, -9,-19, -9,-15,-12,  3,-23, -8, -7, -3, -6,-13,-33,-16, -9;
/M: SY='T'; M=  0,  7,-11,  3, -4,-16, -9, -8,-18, -8,-20,-15, 10,-13, -5, -9, 18, 19,-11,-33,-14, -5;
/M: SY='W'; M=-12,-25,-28,-28,-22, 19,-23,-18, -4,-18,  0, -4,-21,-26,-19,-14,-20,-12, -7, 33, 17,-19;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-18,-31,-26,  0,-30,-25, 29,-22, 15, 13,-23,-25,-21,-21,-13, -4, 31,-24, -5,-25;
/M: SY='E'; M= -7, -6,-24, -4, 14,-14,-22, -6, -9, -2, -6, -4, -9,-13,  1, -5, -7, -8, -7,-23, -7,  7;
/M: SY='P'; M= -8, -9,-30, -7,  5,-18,-18, -1,-20,  4,-19,-10, -8,  9,  2,  1, -8, -9,-21,-15, -6,  2;
/M: SY='W'; M=-17,-35,-44,-36,-27, 11,-21,-24,-15,-17,-15,-13,-34,-28,-18,-17,-34,-25,-23,114, 26,-18;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='P'; M= -8, -5,-23, -2,  5,-19,-14, -6,-17,  6,-18,-11, -5, 20,  1,  4, -4, -4,-17,-20,-14,  1; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='T'; M= -3,  2,-12,  2,  1,-10, -7, -4, -9, -2, -9, -7,  3, -2, -2, -3,  3,  4, -8,-16, -8, -1; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='D'; M=-11, 13,-20, 17, 11,-23,-12,  1,-21,  6,-16,-11,  8,-10, 10,  7, -2, -7,-19,-23,-11, 10; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='K'; M= -3,  2,-19,  2,  6,-20,-12, -6,-19, 12,-17,-10,  2, -7,  4, 10,  1,  1,-13,-21,-11,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='L'; M= -7,-18,-21,-20,-13,  0,-18,-13, -2, -9,  5,  2,-16,-16,-10, -7,-15, -8, -4,  2,  2,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='C'; M=  1, -3, 10, -6, -6,-17,-10,-12,-17, -9,-17,-12, -1,-16, -6,-11,  7,  3, -9,-29,-14, -6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='R'; M= -5, -5,-23, -5, -1,-15,-15, -9,-15,  5,-10, -7, -4,-10,  0,  8, -4, -4,-12,-22,-10, -1; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='E'; M= -6,  2,-24,  2,  7,-21,-11, -5,-20,  4,-17,-11,  2,-11,  4,  5,  0, -4,-16,-27,-14,  5;
/M: SY='L'; M= -9,-17,-23,-20, -9,  1,-25, -9,  4,-14, 10,  9,-15,-19,  0,-10,-14, -8, -1,-18, -1, -4;
/M: SY='R'; M= -7, -1,-26, -2,  3,-24,-11, -2,-24, 17,-20, -9,  2,-14,  7, 19, -4, -8,-19,-23,-11,  4;
/M: SY='R'; M=-10,  0,-25,  1, 10,-22,-17, -5,-25, 18,-20,-11,  1,-12, 10, 21, -4, -6,-20,-23,-11,  9;
/M: SY='F'; M= -3,-20,-18,-26,-19, 15,-14,-19, -2,-20,  3,  0,-15,-22,-20,-17, -9, -5, -1, -9,  1,-19;
/M: SY='L'; M= -3,-15,-20,-17, -9, -4,-21,-14,  3,-14,  6,  4,-14,-20, -6,-11, -8, -3,  3,-20, -6, -8;
/M: SY='R'; M= -9,  6,-25,  3,  6,-21,-13,  0,-20,  8,-20, -9,  9,-12,  8, 11,  0, -3,-19,-27,-12,  6;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='R'; M= -9,  1,-24,  1,  5,-19,-16,  5,-21,  9,-19,-10,  4,-15,  7, 10, -2, -6,-18,-23, -5,  5; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='M'; M=-10,-15,-24,-17, -9,  0,-22, -7,  1,-10,  5,  6,-13,-20, -7, -5,-13, -7, -3, -7,  5, -9; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='R'; M=-12,-10,-25,-10, -4, -5,-20, -1,-12,  8,-10, -4, -7,-18,  0, 10, -9, -6,-11,-10, 10, -3; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='H'; M= -4, -3,-22, -5, -1,-18,-16,  3,-14,  3,-13, -5,  0,-15,  2,  3, -1, -3,-10,-26, -8,  0;
/M:         M= -7,-10,-24,-14, -8, -5,-12, -2,-11, -6, -6, -1, -6,-18, -4, -2, -7, -7,-10,-18, -1, -7;
/M: SY='G'; M= -4, -4,-28, -5, -4,-28, 20,-12,-30,  3,-26,-15,  2,-12, -3,  2, -2,-11,-24,-23,-21, -4;
/M: SY='C'; M=-10,-20,113,-29,-29,-20,-29,-29,-29,-29,-19,-19,-20,-39,-29,-28,-10,-10,-10,-49,-29,-29;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 115 in 115 different sequences
Number of true positive hits 115 in 115 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] NTR
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
115 sequences

ATL5_HUMAN  (Q6ZMM2), CO3_BOVIN   (Q2UVX4), CO3_CAVPO   (P12387), 
CO3_EPTBU   (P98094), CO3_HUMAN   (P01024), CO3_LAMJA   (Q00685), 
CO3_MOUSE   (P01027), CO3_NAJNA   (Q01833), CO3_ONCMY   (P98093), 
CO3_PIG     (P01025), CO3_RABIT   (P12247), CO3_RAT     (P01026), 
CO3_XENLA   (P23667), CO4A_HUMAN  (P0C0L4), CO4B_HUMAN  (P0C0L5), 
CO4B_MOUSE  (P01029), CO4_BOVIN   (P01030), CO4_RAT     (P08649), 
CO5_HUMAN   (P01031), CO5_MOUSE   (P06684), NCP_PINMG   (H2A0N2), 
NET1_CHICK  (Q90922), NET1_HUMAN  (O95631), NET1_MOUSE  (O09118), 
NET1_PIG    (Q2HXW4), NET1_RAT    (Q924Z9), NET3_CHICK  (Q90923), 
NET3_HUMAN  (O00634), NET3_MOUSE  (Q9R1A3), NET4_HUMAN  (Q9HB63), 
NET4_MOUSE  (Q9JI33), NET4_PONAB  (Q5RB89), NET5_HUMAN  (Q8WTR8), 
NET5_MOUSE  (Q3UQ22), NETA_DROME  (Q24567), NETB_DROME  (Q24568), 
PCOC1_HUMAN (Q15113), PCOC1_MOUSE (Q61398), PCOC1_RAT   (O08628), 
PCOC2_HUMAN (Q9UKZ9), PCOC2_MOUSE (Q8R4W6), SFRP1_BOVIN (O19116), 
SFRP1_CHICK (Q9DEQ4), SFRP1_HUMAN (Q8N474), SFRP1_MOUSE (Q8C4U3), 
SFRP1_RAT   (Q9R168), SFRP2_CANFA (Q863H1), SFRP2_CHICK (Q9IA96), 
SFRP2_HUMAN (Q96HF1), SFRP2_MOUSE (P97299), SFRP3_BOVIN (Q95117), 
SFRP3_CHICK (Q9IA95), SFRP3_HUMAN (Q92765), SFRP3_MOUSE (P97401), 
SFRP3_PONAB (Q5RF67), SFRP4_HUMAN (Q6FHJ7), SFRP4_MACMU (Q7YRN1), 
SFRP4_MOUSE (Q9Z1N6), SFRP4_RAT   (Q9JLS4), SFRP5_BOVIN (Q9XSC1), 
SFRP5_HUMAN (Q5T4F7), SFRP5_MOUSE (Q9WU66), TIMP1_BOVIN (P20414), 
TIMP1_CANFA (P81546), TIMP1_HORSE (O02722), TIMP1_HUMAN (P01033), 
TIMP1_MACMU (Q95KL9), TIMP1_MOUSE (P12032), TIMP1_PAPCY (P49061), 
TIMP1_PIG   (P35624), TIMP1_PONAB (Q5RC60), TIMP1_RABIT (P20614), 
TIMP1_RAT   (P30120), TIMP1_SHEEP (P50122), TIMP2_BOVIN (P16368), 
TIMP2_CANFA (Q9TTY1), TIMP2_CAVPO (Q9WUC6), TIMP2_CHICK (O42146), 
TIMP2_CRILO (Q60453), TIMP2_HORSE (O77717), TIMP2_HUMAN (P16035), 
TIMP2_MOUSE (P25785), TIMP2_RABIT (Q9TRZ7), TIMP2_RAT   (P30121), 
TIMP3_BOVIN (P79121), TIMP3_CHICK (P26652), TIMP3_HORSE (Q9TUL9), 
TIMP3_HUMAN (P35625), TIMP3_MACFA (P61269), TIMP3_MACMU (Q5PXZ9), 
TIMP3_MOUSE (P39876), TIMP3_RABIT (O97590), TIMP3_RAT   (P48032), 
TIMP3_SCYTO (Q9W6B4), TIMP3_XENLA (O73746), TIMP4_BOVIN (O97563), 
TIMP4_HUMAN (Q99727), TIMP4_MOUSE (Q9JHB3), TIMP4_RABIT (O97591), 
TIMP4_RAT   (P81556), TIMPL_CAEEL (Q21265), TIMP_DROME  (Q9VH14), 
UNC6_CAEEL  (P34710), VCO31_AUSSU (Q0ZZJ6), VCO32_AUSSU (A0RZC6), 
VCO3_CROAD  (J3S836), VCO3_NAJKA  (Q91132), VCO3_OPHHA  (I2C090), 
WFKN1_HUMAN (Q96NZ8), WFKN1_MOUSE (Q8R0S6), WFKN1_RAT   (P0C5J5), 
WFKN2_BOVIN (Q08E66), WFKN2_HUMAN (Q8TEU8), WFKN2_MOUSE (Q7TQN3), 
WFKN_DANRE  (Q6NUX0)
» More

PDB
[Detailed view]
45 PDB

1BQQ; 1BR9; 1BUV; 1D2B; 1GXD; 1OO9; 1UAP; 1UEA; 1XWE; 2A73; 2A74; 2B39; 2E2D; 2HR0; 2I07; 2ICE; 2ICF; 2J0T; 2QKI; 2TMP; 2WII; 2WIN; 2XWB; 2XWJ; 3CKI; 3CU7; 3FRP; 3G6J; 3HRZ; 3HS0; 3KLS; 3L3O; 3L5N; 3MA2; 3NMS; 3OHX; 3PRX; 3PVM; 3T4A; 3V96; 4A5W; 4E0S; 4FXG; 4FXK; 4ILW
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission