Entry: PS50190

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] SEC7
Accession [info] PS50190
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50190
Associated ProRule [info] PRU00189

Name and characterization of the entry

Description [info] SEC7 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=188;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=183;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2810; R2=0.00905059; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-14986.17822; R2=55.22030; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=970; N_SCORE=8.5; H_SCORE=32503; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=749; N_SCORE=6.5; H_SCORE=26374; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-25,  5, 17,-24,-17, -5,-20,  2,-17,-13,  3, -2, 11,  2,  2,  2,-20,-29,-16, 13;
/M: SY='F'; M=-12,-15,-25,-16,-10,  8,-18, -3, -4,-17,  6,  1,-11,-22,-14,-10,-15,-12, -6,-17,  2,-12;
/M: SY='E'; M= -3, -8,-21, -6, 12,-13,-19,-11,-13, -7,-10,-10, -8, -1, -2,-10, -1, -4,-13,-25,-12,  4;
/M: SY='K'; M= -6,  6,-25,  3,  9,-26,-14, -7,-26, 29,-28,-13,  9,-11,  7, 18,  1, -3,-20,-26,-13,  8;
/M: SY='S'; M= -2, -4,-22, -7, -5,-14,-17, -8, -7, -7,-11, -4, -1, -9,  0, -9,  1,  0, -8,-26,-10, -3;
/M: SY='K'; M= -9, -7,-25, -9,  1,-15,-20,-11,-19, 24,-16, -5, -5,-15,  1, 21, -8, -5,-12,-20, -7,  1;
/M: SY='Q'; M= -7,  8,-27, 10, 15,-30,-17,  3,-21,  8,-18, -9,  5,-11, 21,  2, -3, -9,-22,-26,-12, 18;
/M: SY='R'; M=-15, -7,-28, -9,  1,-18,-21,  8,-22, 18,-16, -2, -2,-18, 14, 34, -8, -8,-18,-17,  1,  4;
/M: SY='K'; M=-12,  1,-29,  1,  7,-24,-19,  3,-27, 33,-26,-10,  3,-14,  8, 25, -9,-10,-20,-21, -5,  6;
/M: SY='R'; M= -5, -4,-24, -6,  3,-20,-17, -7,-20, 18,-16, -7, -1,-14,  5, 23, -3, -2,-14,-23,-11,  3;
/M: SY='Q'; M= -9,-11,-25,-12,  4,-14,-25, -5, -1, -5,  3,  2,-11,-16,  5, -5,-10, -6, -6,-22, -5,  3;
/M: SY='M'; M=-11,-26,-22,-31,-23, 13,-29,-11, 21,-21, 24, 26,-24,-26,-16,-17,-22, -9, 13,-12, 12,-20;
/M: SY='E'; M= -3, -6,-19, -8,  1,-18,-20,-11, -4, -2, -9, -3, -4,-16,  0,  0, -3, -6, -2,-27,-13, -1;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-24, -9,  3,-15,-22, -8, -2, -2, -6,  0, -3,-14,  3, -7, -5, -2, -6,-23, -6,  2;
/M: SY='G'; M=  6,-11,-12,-13,-18,-27, 47,-21,-34,-19,-26,-19, -4,-20,-19,-21,  0,-16,-23,-23,-28,-18;
/M: SY='V'; M= -4,-17,-21,-21,-14, -9,-24,-19,  6,-10,  1,  1,-11,-14,-10, -2, -4,  4,  7,-25, -9,-15;
/M: SY='E'; M= -9,  7,-25,  7, 16,-21,-16, -3,-21,  9,-18,-11,  8,-12, 11,  3,  0, -5,-21,-27,-13, 13;
/M: SY='K'; M= -8,-11,-24,-12, -1,-13,-23,-10, -9,  6,  1,  0,-10,-17, -1,  6,-11, -3, -8,-22, -7, -2;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-29, 76,-29,-20, -1,-29,  8, -1,-19,-29,-38,-20,-17, -9,  0,  8, 28,-29;
/M: SY='N'; M= -7, 36,-19, 17, -1,-20,  0,  8,-19, -1,-29,-19, 55,-19, -1, -1, 11,  1,-28,-39,-20, -1;
/M: SY='Q'; M= -8, -4,-26, -5,  7,-16,-19, -2,-16,  8,-13, -2, -5,-14, 13, 11, -6, -7,-16,-18, -4,  9;
/M: SY='K'; M=-11, 16,-27, 17,  9,-29,-13, -4,-29, 27,-30,-16, 15,-12,  6, 15, -1, -6,-23,-29,-14,  7;
/M: SY='P'; M= -7,-18,-37,-10,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-29,-20,-18, 81, -9,-19, -6, -8,-28,-30,-29, -9;
/M: SY='K'; M= -8,  2,-27,  5, 15,-25,-17,-10,-24, 18,-23,-14, -2,-10,  6,  7, -3, -6,-18,-14,-11, 11;
/M: SY='K'; M=-11,  2,-29,  4, 14,-28,-19, -2,-30, 36,-27,-12,  2,-10, 10, 26, -6, -9,-22,-23,-10, 12;
/M: SY='G'; M=  3,-11,-21,-12,-20,-29, 60,-21,-37,-20,-28,-19, -2,-20,-20,-21,  0,-18,-27,-22,-29,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28,  2,-35,-28, 39,-27, 22, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 33,-23, -3,-28;
/M: SY='Q'; M= -3,  7,-26,  8, 19,-32,-15, -1,-23, 10,-22,-11,  4, -5, 23,  3,  1, -6,-24,-26,-15, 21;
/M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-29,-23, 37,-28,  0,  0,-18,  5,  5,-19,-28,-19,-11,-21,-12, -5, 18, 38,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-22, 17,-30,-20, 19,-30, 44, 18,-28,-30,-22,-20,-28,-10, 10,-17,  3,-22;
/M: SY='I'; M= -4,-17,-25,-23,-13,-12,-27,-16, 16,-11,  4, 11,-12,-17,  1,-11, -8, -3,  8,-22, -6, -8;
/M: SY='E'; M=  4,  2,-22,  5, 25,-26, -9, -7,-24,  5,-22,-17,  1, -6,  9, -2, 11, -1,-19,-29,-19, 17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-25, -3, -1,-20,-16,  6,-22, 14,-22,-10,  7,-16,  4, 16, -2, -2,-17,-20, -7,  0;
/M: SY='G'; M= -6,  2,-28,  2, -2,-29, 26, -4,-33, -2,-28,-16,  8,-16, -2, -4,  0,-13,-28,-25,-20, -2;
/M: SY='F'; M=-13,-24,-23,-29,-22, 23,-30,-17, 14,-20, 17, 10,-18,-26,-22,-16,-20, -9,  9,-10, 12,-22;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-19,-30,-24,  3,-30,-23, 27,-25, 28, 17,-24,-27,-21,-21,-20, -7, 24,-24, -4,-23;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -2,  5,-26,  8,  8,-29,  3, -9,-28,  0,-24,-17,  3, -3,  2, -5,  3, -5,-23,-28,-20,  5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -9, 21,-25, 22,  5,-27,-11,  4,-24,  2,-24,-17, 18,-11,  2,  0,  3, -3,-22,-33,-14,  3;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S'; M= -4, 11,-19, 12,  3,-19,-10, -9,-22, -4,-23,-18,  9, -8, -3, -5, 16, 13,-15,-34,-15,  0;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P'; M= -8,-15,-29, -9, -2,-26,-20,-18,-15,-11,-23,-14,-15, 58,-10,-19, -9, -9,-21,-30,-25, -9;
/M: SY='Q'; M= -4,  1,-25,  3, 11,-27,-16, -7,-18, 10,-17, -7, -2,-11, 13,  4, -2, -5,-14,-25,-13, 11;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D'; M= -2, 10,-19, 17, 17,-28, -4, -7,-27, -4,-20,-19,  3,-10,  2,-10,  6, -5,-21,-32,-20, 10;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-33,-28,  5,-33,-28, 33,-25, 19, 14,-24,-25,-24,-23,-16, -4, 32,-23, -3,-28;
/M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20,  8,  0,  5,-21,-19,-12;
/M: SY='Q'; M= -8, -4,-21, -3, 11,-25,-18,  5,-21,  8,-16, -6, -2,-14, 18,  9, -1, -7,-20,-26,-10, 14;
/M: SY='F'; M=-19,-31,-25,-38,-28, 60,-29,-21, -1,-26,  7, -1,-22,-29,-34,-17,-23,-13, -3, 26, 26,-27;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-22, 15,-30,-19, 21,-28, 39, 22,-27,-28,-20,-20,-27,-10, 11,-17,  3,-21;
/M: SY='Y'; M=-17,-19,-28,-22,-14, 14,-25,  1, -8, -3, -2,  1,-13,-24,-10,  9,-18,-12, -9,  1, 17,-13;
/M: SY='E'; M= -3,  1,-11,  1, 10,-23,-12, -8,-23,  3,-20,-14,  1,-13,  5, -1,  3, -2,-18,-28,-15,  7;
/M: SY='N'; M= -4,  8,-21,  1,  0,-20,  1, -8,-23, -2,-21,-15, 14,-14, -3,  2,  7,  9,-18,-29,-17, -2;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-27,  5, 18,-26,-15, -5,-26, 12,-24,-16,  5,  1,  7, 12,  1, -5,-23,-28,-18, 11;
/M: SY='G'; M= -4, -3,-26, -3,-10,-26, 31,-13,-32, -7,-26,-17,  4,-17, -8, -2,  5, -7,-24,-25,-22, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,  9,-30,-20, 21,-29, 48, 21,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 11,-20,  0,-20;
/M: SY='N'; M= -6, 30,-19, 26,  5,-25, -3,  1,-25, -3,-30,-23, 35,-14,  0, -6, 17,  4,-24,-40,-20,  3;
/M: SY='K'; M= -9, -6,-30, -7,  3,-23,-17,-12,-26, 33,-24,-10, -5,-14,  5, 23,-11,-11,-19, -6, -7,  4;
/M: SY='T'; M= -4,  2,-20,  0,  3,-22,-17,-10,-18, 10,-20,-11,  2,-11,  5,  5,  7, 11,-11,-28,-13,  4;
/M: SY='M'; M=  3,-14,-18,-21,-12, -7,-18,-12,  3, -4,  2, 16,-14,-17, -4, -7, -7, -1,  5,-21, -7, -8;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-36,-28,  2,-36,-28, 40,-29, 26, 19,-24,-24,-21,-26,-21, -9, 28,-21, -1,-28;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-29,-10,-18,-29, 59,-18,-38,-15,-28,-19,  0,-20,-17,-12,  0,-18,-28,-20,-28,-18;
/M: SY='D'; M=-14, 20,-29, 30, 28,-28,-18, -4,-23, -1,-16,-17,  5, -8,  5, -8, -3, -8,-21,-33,-17, 16;
/M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-27,-23, 37,-31,  2,  6,-18, 10,  4,-21,-29,-19,-15,-21,-10, -2, 16, 53,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22, 12,-31,-22, 23,-30, 42, 19,-28,-29,-21,-21,-27,-10, 14,-19,  1,-22;
/M: SY='G'; M= -2, -5,-12, -4,-16,-28, 44,-19,-37,-18,-28,-21,  0,-20,-18,-19,  2,-13,-25,-27,-28,-17;
/M: SY='E'; M=-11, 20,-27, 23, 24,-29,-10,  2,-29,  5,-24,-19, 14, -9,  9, -1,  2, -4,-27,-32,-17, 17;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='R'; M=-13,  1,-28,  0,  0,-24, -7, 10,-28, 10,-25,-13,  9,-10,  5, 23, -2, -8,-24,-27,-12,  0;
/M: SY='D'; M=-12, 17,-27, 21, 14,-29, -9, -2,-30, 13,-27,-18, 13,-12,  7, 12,  1, -7,-25,-30,-17, 10;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-28, 19, 22,-29,-16, -3,-24,  6,-22,-16,  4,  6, 10, -1, -2, -8,-23,-29,-18, 15; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='F'; M=-13,-18,-18,-22,-17, 34,-24,-12,  2,-18,  6,  1,-14,-21,-22,-14,-13, -6,  2, -3, 15,-18; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='N'; M= -4, 16,-16, 12,  1,-22, -6,  5,-21, -5,-25,-17, 22, -3, -2, -7,  8, -1,-22,-33,-16, -2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='L'; M= -5,-14,-20,-17, -8, -8,-20,-12,  4, -9, 10,  7,-11,-18, -3, -5, -9, -5,  1,-21, -6, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='E'; M=  0,  4,-20,  6, 13,-22,-12, -2,-19,  9,-16,-10,  0, -8,  8,  2,  0, -5,-15,-21,-11, 10; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='V'; M= -1,-25,-11,-26,-25, -1,-27,-26, 26,-18,  8,  8,-24,-24,-24,-18, -8,  3, 39,-26, -8,-25; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-31,-21, 11,-27,-15, 19,-25, 40, 30,-27,-27,-16,-17,-27,-10,  9,-18,  2,-18;
/M: SY='H'; M=-14, 16,-23, 18,  9,-25,-14, 25,-27,  1,-24,-14, 15,-15,  6, -2,  0, -9,-25,-32, -5,  6;
/M: SY='A'; M= 13, -2, -5, -4,  1,-19,-11,-12,-18, -6,-14,-13, -4,-15, -5, -9,  4, -3,-11,-27,-15, -3;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-32,-26, 53,-30, -9,  4,-23, 10,  2,-22,-30,-28,-17,-20, -9,  1, 11, 40,-26;
/M: SY='V'; M=  2,-24,-14,-28,-25, -3,-28,-28, 24,-20,  7,  7,-22,-24,-24,-20, -6,  6, 35,-27, -9,-25;
/M: SY='D'; M= -9, 24,-25, 32, 11,-31,-10, -6,-30,  6,-25,-19, 10,-11,  0, -2,  3, -2,-21,-33,-17,  5;
/M: SY='E'; M= -2,-10,-12,-12,  1, -6,-19,-10, -9,-13,  1, -4, -9,-17, -4,-12, -1,  0, -8,-26, -9, -1;
/M: SY='F'; M=-16,-20,-23,-26,-19, 25,-26, 16,  1,-20,  9, 16,-13,-25,-15,-13,-18,-13, -4,-12, 16,-17;
/M: SY='D'; M=-13, 30,-27, 37, 16,-32,-10, -1,-32,  6,-29,-23, 20, -7,  3, -2,  4, -5,-27,-36,-19,  9;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 70,-30,-20,  4,-30, 14,  3,-21,-30,-37,-20,-21,-10,  2,  6, 26,-29;
/M: SY='R'; M= -4, -1,-21, -3,  6,-23,-15,  1,-22, 10,-22,-11,  4,-12,  9, 12,  7,  2,-16,-28,-12,  6;
/M: SY='G'; M= -7, 13,-26, 13,  4,-27, 18, -5,-31, -6,-27,-20, 15,-15, -3, -9,  5, -8,-27,-29,-20,  0;
/M: SY='M'; M= -9,-20,-22,-23,-13, -5,-25,-12, 10, -9, 18, 22,-19,-22, -4, -7,-18, -7,  6,-21, -3, -9;
/M: SY='R'; M=-14,  7,-29,  8, 11,-19,-17, -3,-24,  9,-21,-14,  6, -4,  6, 12, -5, -9,-23,-25,-13,  7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-33,-26, 23,-31,-22, 21,-27, 25, 12,-26,-29,-26,-21,-21, -8, 19,-14,  8,-26;
/M: SY='D'; M=-12,  9,-24, 19, -2,-22,-16, -7,-13,-10,-12,-12, -3, -9,-11,-14, -7, -8, -4,-33,-15, -7;
/M: SY='E'; M= -4,  6,-24,  8, 21,-25,-15, -5,-18,  0,-19,-14,  4, -2, 10, -5,  4, -3,-17,-31,-18, 15;
/M: SY='A'; M= 46,-10,-11,-19,-10,-21,  4,-20,-12,-11,-12,-11, -9,-11,-10,-20, 11,  0, -2,-21,-21,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20,  0,-22;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='Q'; M=-10,-10,-26,-11,  4, -9,-23, -5, -7,  2, -3,  3,-10,-16,  7,  3,-10, -8,-10,-17,  0,  5;
/M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-34,-25, 53,-28,-13,  4,-25, 14,  6,-21,-29,-29,-18,-20,-10,  0,  6, 30,-25;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-28,-17, 11,-29,-16, 14,-25, 38, 18,-26,-28,-13,-17,-26,-10,  5,-17,  2,-15;
/M: SY='E'; M= -8, -5,-28, -5, 14,-16,-19, -6,-22,  7,-17,-11, -6,-12, 12,  9, -4, -6,-21, -6, -7, 13;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-17, -4, -6,-12, -4,  5,-23, -6,-21,-12,  2,-16, -6, -7,  6,  1,-16,-25, -6, -6;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-38,-28, 63,-30,-20,  8,-28, 11,  3,-19,-27,-34,-20,-19, -9,  5,  5, 23,-28; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='R'; M=-17, -8,-27, -9, -1,-18,-20,  6,-24, 21,-17, -7,  0,-18,  7, 50, -8, -7,-17,-20, -6, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='L'; M= -3,-26,-18,-27,-18,  4,-25,-19, 15,-24, 35, 15,-26,-22,-18,-19,-22, -8, 10,-20, -4,-18; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -9,  1,-29,-19,-17,-19, -8,-27,-17,-17, 78, -4,-17, -9, -9,-28,-27,-27, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='G'; M= -1, -7,-28, -6,-11,-28, 54,-17,-36,-13,-27,-18,  0,-17,-14,-15,  0,-17,-28,-20,-26,-12; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -9,  9,-28, 19, 56,-28,-19,  0,-28,  9,-19,-19,  0,  0, 19,  0,  0, -9,-28,-28,-19, 38; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='A'; M= 31, -6,-11,-12, -7,-20,  6,-16,-15,-10,-17,-13, -3,-10, -7,-16, 17,  4, -6,-25,-20, -7; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-28,  1, 21,-35,-18,  5,-20,  7,-19, -4, -2, -1, 44,  5,  0, -9,-27,-21,-12, 32; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='K'; M=-10, -4,-27, -4,  6,-20,-21, -5,-19, 28,-17, -5, -5,-13, 10, 16,-10, -9,-15,-15, -1,  8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-26,-36,-27,  1,-36,-27, 43,-27, 21, 18,-20,-20,-20,-27,-19, -9, 28,-20, -1,-27; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='D'; M=-12, 27,-26, 36, 26,-29,-12,  2,-30,  2,-23,-21, 12, -8,  7, -5,  0, -8,-26,-31,-16, 17; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='R'; M=-16,-10,-26,-11, -2,-16,-19, -3,-23, 21,-13, -7, -2,-19,  6, 53, -8, -4,-15,-20, -9, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-21,-32,-24,  6,-31,-22, 30,-25, 28, 21,-24,-24,-19,-21,-21, -8, 21,-19,  0,-23; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='M'; M= -9,-24,-20,-31,-22,  2,-26,-13, 27,-19, 24, 35,-22,-22,-11,-17,-20, -9, 17,-20, -1,-18; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -9,  4,-26, 10, 40,-24,-20, -3,-21,  4,-12,-13, -3, -4, 16, -2, -1, -4,-22,-27,-15, 28; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='K'; M= 11, -4,-20, -8,  0,-22,-12, -6,-18, 16,-19, -8, -3,-10,  1,  5,  0, -3,-10,-21,-11,  0; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='F'; M=-19,-28,-19,-38,-28, 75,-28,-19,  0,-28,  9,  0,-19,-28,-38,-19,-19, -9,  0,  9, 28,-28; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='A'; M= 26, -5,-10,-10, -6,-19,  2,-15,-15,-10,-19,-14,  0,-10, -6,-14, 22,  9, -5,-27,-19, -6; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-22,  6, 21,-24,-15,  9,-21, -1,-17,-11,  2, -8, 15, -3,  7, -1,-20,-28,-11, 17; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8,  0,-17,-19, 12,-22, 17,-17, -6, -2,-18,  5, 36, -9,-10,-15,-20, -3, -1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='Y'; M=-19,-23,-29,-25,-22, 35,-27,  6, -2,-14,  0, -2,-21,-28,-16,-12,-21,-12,-10, 38, 61,-21; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='C'; M= -5,-17, 43,-24,-21, -7,-23,-15,-13,-20, -8, -5,-15,-28,-18,-19, -8, -7, -5,-26, -8,-20; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -2,  1,-22, -1,  7,-19,-15, -7,-12,  5,-12, -5,  1,-12,  3,  0, -2, -5,-11,-25,-12,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='C'; M= -5, -3, 43, -7, -7,-24,-19,-14,-24,-13,-19,-15, -6,-24, -4,-15, -2, -7,-15,-37,-21, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='N'; M= -9, 36,-20, 18,  1,-21, -1,  9,-20,  0,-29,-19, 54,-19,  4,  0, 10,  0,-29,-39,-19,  3;
/M: SY='P'; M= -8,-13,-34, -7, -1,-27,-15,-16,-18,-10,-23,-16,-12, 56, -6,-17, -7, -8,-25,-29,-25, -7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='G'; M= -4, 10,-25, 12,  3,-28, 18, -9,-31, -4,-28,-20, 11,-14, -5, -8,  7, -6,-25,-30,-22, -1;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='I'; M= -4,-21,-20,-21,-16, -6,-24,-20, 12,-16,  9,  5,-18,-10,-15,-13,-10, -4, 12,-24, -9,-17; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-22;
/M: SY='F'; M=-16,-24,-22,-32,-23, 45,-28,-11,  4,-22, 10,  9,-18,-26,-21,-16,-18, -7,  0,  2, 25,-20;
/M: SY='Q'; M=  3, -5,-23, -8, -1,-21, -7, -6,-21,  4,-20,-11,  0, -7,  6,  6,  4, -2,-17,-23,-14,  1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N'; M= -2, 19,-17, 12,  1,-21, -2,  7,-22, -6,-29,-19, 30,-15,  1, -5, 22,  7,-21,-39,-17,  1;
/M: SY='A'; M= 20,-11,-18,-15, -7,-18,-10,-17,-11, -4,-15,-10,-10,  4, -9,-13,  5,  3, -5,-22,-15, -9;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D'; M=-18, 47,-29, 66, 19,-39, -9, -1,-39, -1,-30,-29, 19,-10,  0,-10,  2, -8,-29,-40,-20,  9;
/M: SY='T'; M= 19, -4,-11,-12, -7,-17,-11,-17,-11, -9,-12,-10, -3,-10, -4,-12, 16, 24, -3,-26,-14, -6;
/M: SY='A'; M= 25,-18,  4,-26,-19,-14,-15,-25,  3,-17, -3, -3,-16,-19,-18,-23,  0, -3, 12,-26,-17,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-27,-24,-21, 39,-29, 16, -3,-17,  2,  1,-17,-29,-17,-12,-19,-11, -9, 15, 55,-21;
/M: SY='V'; M= -2,-23,-15,-27,-24, -3,-29,-26, 24,-19,  8,  8,-21,-24,-22,-18, -7,  6, 32,-27, -8,-24;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='A'; M= 31, -7,  1,-14, -8,-20, -3,-17,-15,-12,-18,-14, -4,-13, -8,-17, 19,  6, -4,-30,-21, -8;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30,  9,  0,-16,  3,  0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 66,-23;
/M: SY='A'; M= 23, -5,-11, -9, -4,-19, -2,-13,-14,-10,-18,-13,  0,-11, -2,-13, 23, 10, -6,-31,-19, -3;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-13,-35,-28,  0,-35,-28, 34,-27, 18, 14,-22,-24,-22,-26,-17, -6, 27,-25, -5,-28;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29,  0,-39,-28, 48,-29, 20, 22,-20,-20,-19,-29,-20,-10, 29,-20,  0,-29;
/M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20,  2,-22, -4, 20,-14, 26, 52,-22,-22, -4,-12,-22,-10, 10,-20,  0,-12;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21;
/M: SY='N'; M= -7, 31,-19, 15,  0,-20, -3,  6,-19, -1,-28,-18, 48,-18,  2, -1, 13,  5,-26,-38,-19,  1;
/M: SY='T'; M= -1, -4,-12,-14,-13, -8,-22,-21, -2,-12, -6, -5, -4,-12,-11,-12, 14, 41,  5,-29, -9,-13;
/M: SY='D'; M=-17, 40,-27, 56, 15,-35,-11, -2,-34, -3,-24,-25, 15,-11, -1,-11,  1, -7,-25,-39,-19,  7;
/M: SY='L'; M= -1,-20,-20,-23,-11, -4,-23,-13,  8,-18, 25, 14,-20,-23, -3,-14,-17, -8,  1,-21, -5, -7;
/M: SY='H'; M=-18, -1,-28, -2, -2,-16,-21, 84,-26,-10,-18, -1,  7,-20,  7, -2, -8,-13,-26,-26, 22, -2;
/M: SY='N'; M= -3, 26,-17, 13,  0,-20, -1,  3,-20, -3,-29,-20, 43,-17,  0, -3, 20,  8,-23,-40,-20,  0;
/M: SY='P'; M= -9,-15,-36, -8,  2,-27,-20,-12,-18, -8,-26,-17,-14, 64, -7,-16, -7, -8,-25,-30,-24, -7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='N'; M= -9, 12,-23,  3,  2,-22,-11, 13,-16,  2,-19, -2, 21,-16, 15,  3,  3, -3,-21,-30,-11,  8;
/M: SY='V'; M=  1,-25,-13,-28,-27, -2,-28,-27, 27,-20,  9,  9,-23,-27,-26,-20, -9, -2, 39,-28,-10,-27;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='K'; M=-11, -5,-30, -5,  5,-24,-20,-11,-26, 37,-24, -9, -4,-13,  6, 27,-11,-10,-19,-11, -8,  5;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D'; M=-13, 19,-28, 23, 11,-30,-12,  1,-29,  7,-28,-19, 16,  1,  5,  4,  0, -7,-27,-33,-18,  7;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-30, -2,  8,-28,-19, -1,-29, 37,-27,-10,  0, -9, 11, 30, -8,-10,-21,-22, -9,  8;
/M: SY='M'; M=-10,-17,-24,-24,-14, -7,-19, -2, 10, -9,  8, 41,-16, -2,  1,-10,-16,-10,  0,-22, -6, -8;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='T'; M=  2, -2,-14, -8, -6,-15,-12,-16,-15, -6,-18,-12,  1, -5, -6, -7, 20, 30, -6,-31,-14, -6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='L'; M= -8,-17,-19,-19, -9,  1,-25,-16, -3,  0,  6,  3,-16,-22,-10, -3,-16, -9, -1,-18, -3, -8;
/M: SY='E'; M= -3, 11,-26, 18, 32,-29,-14, -3,-28,  6,-21,-18,  3, -6, 13,  2,  4, -6,-24,-30,-19, 22;
/M: SY='D'; M=-15, 23,-24, 33, 19,-35,-11, -1,-34,  7,-26,-20,  9,-11, 12,  2, -2,-10,-28,-32,-18, 15;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-27, 66,-30,-11,  1,-26,  9,  1,-20,-30,-32,-18,-20,-10, -2, 13, 40,-27;
/M: SY='I'; M= -7,-21,-19,-28,-21, -6,-31,-24, 22,-17,  5,  7,-14,-19,-15,-14, -8,  2, 18,-25, -6,-21;
/M: SY='R'; M=-10,  3,-27,  0,  6,-24,-12, -4,-27, 24,-25,-13,  9,-15,  7, 31, -3, -7,-21,-25,-14,  5;
/M: SY='N'; M=-10, 18,-20,  2, -7,-12, -8,  5, -6, -5,-11,  7, 31,-21, -1, -4, -1, -4,-16,-33,-13, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='N'; M= -6,  6,-18, -4,-10, -8,-14, -6, -3,-13,  3, -3, 16,-23,-10,-10, -4,  1, -9,-31,-12,-10;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-28, -6,  5,-22,-18, -3,-28, 28,-21,-11,  0,-16,  9, 50, -6, -8,-19,-22,-12,  4;
/M: SY='G'; M= -3, -8,-29, -9,-14,-28, 47,-12,-36,-13,-27,-16,  0,-19,-10, -9,  0,-14,-27,-21,-24,-13;
/M: SY='I'; M= -2,-20,-11,-27,-22, -6,-28,-23, 21,-21,  9,  7,-15,-22,-16,-21,-10, -2, 18,-26, -8,-21;
/M: SY='N'; M= -8, 28,-17, 24,  2,-22, -7,  1,-22, -5,-21,-19, 29,-18, -4, -8,  3, -4,-23,-35,-16, -1;
/M: SY='D'; M=-13, 25,-29, 33, 19,-34, -4, -1,-32,  2,-27,-22, 15, -5,  7, -5,  0,-10,-30,-33,-20, 12;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-21, -5, -8,-25, 36,-11,-32,-10,-26,-17,  1,-16,-10,-12,  4,-11,-23,-23,-22, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='K'; M= -3,  3,-24,  4, 10,-26,  1, -5,-27, 11,-23,-14,  3,-10,  4,  5,  0, -8,-21,-23,-16,  7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-12, 39,-17, 46, 10,-33, -8, -1,-32, -3,-28,-26, 25,-14, -3,-10,  3, -7,-27,-39,-21,  4;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-35,-25, 23,-31,-23, 23,-29, 26, 13,-23,-26,-24,-23,-22, -9, 13,-12,  6,-25;
/M: SY='P'; M= -9,  2,-31, 10,  6,-29,-15,-13,-24, -7,-28,-21, -3, 43, -5,-14,  1, -2,-26,-34,-25, -2;
/M: SY='E'; M=-12,  0,-28,  3, 19,-22,-21, -5,-19,  8,-16,-11, -2, -7, 11, 12, -4, -6,-18,-25,-13, 14;
/M: SY='E'; M=-13, 17,-30, 26, 34,-29,-14, -1,-31,  5,-24,-22,  7, -7,  9, -3, -1,-10,-29,-21,-16, 22;
/M: SY='Y'; M=-14,-22,-23,-27,-18, 22,-27, -5,  7,-17, 14, 15,-19,-25,-11,-13,-18, -7,  0, -2, 23,-15;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21,  9,-30,-21, 21,-29, 45, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 15,-21, -1,-21;
/M: SY='E'; M= -2, -2,-22, -2,  6,-23, -2, -6,-21, -1,-19,-10, -1,-12,  2,  0,  5, -1,-15,-27,-16,  4;
/M: SY='E'; M= -4,  5,-25,  6, 11,-24,  2,  2,-28,  0,-23,-16,  6,-12,  2, -3,  2, -8,-24,-27,-15,  6;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-23,-35,-26,  7,-33,-24, 33,-27, 26, 21,-24,-25,-21,-23,-21, -8, 24,-20,  0,-26;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 16,  0,-12,  1,  0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21;
/M: SY='D'; M=-15, 23,-23, 32, 23,-31,-16,  5,-30,  1,-21,-19,  9,-11,  7, -5, -2, -8,-26,-34,-15, 15;
/M: SY='S'; M=  2,  4,-20,  3,  8,-23, -8, -5,-23,  4,-23,-16,  8,-12,  6, 10, 13,  2,-17,-31,-17,  6;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30,  0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30;
/M: SY='K'; M= -5, -6,-19, -6,  4,-23,-18, -9,-17, 15,-19, -8, -4,-15,  8, 12,  0, -4,-10,-26,-13,  6;
/M: SY='K'; M= -4,  4,-23,  1,  3,-23,-11, -8,-17,  9,-20,-10,  7,-14,  4,  3,  1, -2,-12,-28,-15,  3;
/M: SY='E'; M=-10, 15,-25, 14, 20,-25,-15,  0,-26, 12,-23,-17, 15,-10,  7,  7,  2,  0,-24,-31,-15, 13;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 72 in 72 different sequences
Number of true positive hits 72 in 72 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 2
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 97.30 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann, N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] SEC7
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
72 sequences

BIG1_ARATH  (F4JSZ5), BIG1_BOVIN  (O46382), BIG1_HUMAN  (Q9Y6D6), 
BIG1_MOUSE  (G3X9K3), BIG1_RAT    (D4A631), BIG2_ARATH  (Q9LZX8), 
BIG2_HUMAN  (Q9Y6D5), BIG2_MOUSE  (A2A5R2), BIG2_RAT    (Q7TSU1), 
BIG3_ARATH  (Q9LPC5), BIG4_ARATH  (F4JN05), BIG5_ARATH  (F4IXW2), 
CYH1_CHLAE  (Q76MZ1), CYH1_HUMAN  (Q15438), CYH1_MOUSE  (Q9QX11), 
CYH1_RAT    (P97694), CYH2_BOVIN  (Q2KI41), CYH2_CHLAE  (Q76MY7), 
CYH2_HUMAN  (Q99418), CYH2_MOUSE  (P63034), CYH2_RAT    (P63035), 
CYH3_HUMAN  (O43739), CYH3_MOUSE  (O08967), CYH3_RAT    (P97696), 
CYH4_HUMAN  (Q9UIA0), CYH4_MOUSE  (Q80YW0), FBX8_BOVIN  (Q5E9G6), 
FBX8_HUMAN  (Q9NRD0), FBX8_MOUSE  (Q9QZN3), GBF1_CRIGR  (Q9R1D7), 
GBF1_HUMAN  (Q92538), GEA1_YEAST  (P47102), GEA2_YEAST  (P39993), 
GNL1_ARATH  (Q9FLY5), GNL2_ARATH  (F4K2K3), GNOM_ARATH  (Q42510), 
GRP1_CAEEL  (P34512), IQEC1_HUMAN (Q6DN90), IQEC1_MOUSE (Q8R0S2), 
IQEC2_HUMAN (Q5JU85), IQEC2_MOUSE (Q5DU25), IQEC3_HUMAN (Q9UPP2), 
IQEC3_MOUSE (Q3TES0), IQEC3_RAT   (Q76M68), PSD1_BOVIN  (F1MUS9), 
PSD1_HUMAN  (A5PKW4), PSD1_MOUSE  (Q5DTT2), PSD1_RAT    (Q9ESQ7), 
PSD2_HUMAN  (Q9BQI7), PSD2_MOUSE  (Q6P1I6), PSD3_HUMAN  (Q9NYI0), 
PSD3_MOUSE  (Q2PFD7), PSD4_HUMAN  (Q8NDX1), PSD4_MOUSE  (Q8BLR5), 
SEC74_SCHPO (Q10491), SEC7A_SCHPO (Q9UT02), SEC7B_SCHPO (Q9P7V5), 
SEC7C_SCHPO (O13817), SEC7_YEAST  (P11075), SECG_DICDI  (Q54KA7), 
SYT1_YEAST  (Q06836), YDYB_SCHPO  (O13690), YEL1_ASHGO  (Q75D04), 
YEL1_LACTC  (C5DE74), YEL1_VANPO  (A7TDT6), YEL1_YEAS1  (B3LNJ6), 
YEL1_YEAS2  (C7GNA4), YEL1_YEAS7  (A6ZKN8), YEL1_YEAS8  (C8Z3N7), 
YEL1_YEAST  (P34225), YEL1_ZYGRC  (C5DQU9), YHV3_SCHPO  (Q9P7R8)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
2 sequences

BIG3_HUMAN  (Q5TH69), BIG3_MOUSE  (Q3UGY8)

		
PDB
[Detailed view]
21 PDB

1BC9; 1KU1; 1PBV; 1R8M; 1R8Q; 1R8S; 1RE0; 1S9D; 2R09; 2R0D; 3L8N; 3LTL; 3SWV; 4A4P; 4C0A; 4JMI; 4JMO; 4JWL; 4JXH; 4L5M; 4OIY
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission