PROSITE entry PS50190
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | SEC7 |
| Accession [info] | PS50190 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50190 |
| Associated ProRule [info] | PRU00189 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | SEC7 domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=188; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=183; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2810000; R2=0.0090506; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=450.0130920; R2=27.0749073; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=971; H_SCORE=26740; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=750; H_SCORE=20756; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='E'; M= -7, 4,-25, 5, 17,-24,-17, -5,-20, 2,-17,-13, 3, -2, 11, 2, 2, 2,-20,-29,-16, 13; /M: SY='F'; M=-12,-15,-25,-16,-10, 8,-18, -3, -4,-17, 6, 1,-11,-22,-14,-10,-15,-12, -6,-17, 2,-12; /M: SY='E'; M= -3, -8,-21, -6, 12,-13,-19,-11,-13, -7,-10,-10, -8, -1, -2,-10, -1, -4,-13,-25,-12, 4; /M: SY='K'; M= -6, 6,-25, 3, 9,-26,-14, -7,-26, 29,-28,-13, 9,-11, 7, 18, 1, -3,-20,-26,-13, 8; /M: SY='S'; M= -2, -4,-22, -7, -5,-14,-17, -8, -7, -7,-11, -4, -1, -9, 0, -9, 1, 0, -8,-26,-10, -3; /M: SY='K'; M= -9, -7,-25, -9, 1,-15,-20,-11,-19, 24,-16, -5, -5,-15, 1, 21, -8, -5,-12,-20, -7, 1; /M: SY='Q'; M= -7, 8,-27, 10, 15,-30,-17, 3,-21, 8,-18, -9, 5,-11, 21, 2, -3, -9,-22,-26,-12, 18; /M: SY='R'; M=-15, -7,-28, -9, 1,-18,-21, 8,-22, 18,-16, -2, -2,-18, 14, 34, -8, -8,-18,-17, 1, 4; /M: SY='K'; M=-12, 1,-29, 1, 7,-24,-19, 3,-27, 33,-26,-10, 3,-14, 8, 25, -9,-10,-20,-21, -5, 6; /M: SY='R'; M= -5, -4,-24, -6, 3,-20,-17, -7,-20, 18,-16, -7, -1,-14, 5, 23, -3, -2,-14,-23,-11, 3; /M: SY='Q'; M= -9,-11,-25,-12, 4,-14,-25, -5, -1, -5, 3, 2,-11,-16, 5, -5,-10, -6, -6,-22, -5, 3; /M: SY='M'; M=-11,-26,-22,-31,-23, 13,-29,-11, 21,-21, 24, 26,-24,-26,-16,-17,-22, -9, 13,-12, 12,-20; /M: SY='E'; M= -3, -6,-19, -8, 1,-18,-20,-11, -4, -2, -9, -3, -4,-16, 0, 0, -3, -6, -2,-27,-13, -1; /M: SY='E'; M= -5, -5,-24, -9, 3,-15,-22, -8, -2, -2, -6, 0, -3,-14, 3, -7, -5, -2, -6,-23, -6, 2; /M: SY='G'; M= 6,-11,-12,-13,-18,-27, 47,-21,-34,-19,-26,-19, -4,-20,-19,-21, 0,-16,-23,-23,-28,-18; /M: SY='V'; M= -4,-17,-21,-21,-14, -9,-24,-19, 6,-10, 1, 1,-11,-14,-10, -2, -4, 4, 7,-25, -9,-15; /M: SY='E'; M= -9, 7,-25, 7, 16,-21,-16, -3,-21, 9,-18,-11, 8,-12, 11, 3, 0, -5,-21,-27,-13, 13; /M: SY='K'; M= -8,-11,-24,-12, -1,-13,-23,-10, -9, 6, 1, 0,-10,-17, -1, 6,-11, -3, -8,-22, -7, -2; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='F'; M=-19,-29,-20,-38,-29, 76,-29,-20, -1,-29, 8, -1,-19,-29,-38,-20,-17, -9, 0, 8, 28,-29; /M: SY='N'; M= -7, 36,-19, 17, -1,-20, 0, 8,-19, -1,-29,-19, 55,-19, -1, -1, 11, 1,-28,-39,-20, -1; /M: SY='Q'; M= -8, -4,-26, -5, 7,-16,-19, -2,-16, 8,-13, -2, -5,-14, 13, 11, -6, -7,-16,-18, -4, 9; /M: SY='K'; M=-11, 16,-27, 17, 9,-29,-13, -4,-29, 27,-30,-16, 15,-12, 6, 15, -1, -6,-23,-29,-14, 7; /M: SY='P'; M= -7,-18,-37,-10, 0,-29,-18,-19,-20,-10,-29,-20,-18, 81, -9,-19, -6, -8,-28,-30,-29, -9; /M: SY='K'; M= -8, 2,-27, 5, 15,-25,-17,-10,-24, 18,-23,-14, -2,-10, 6, 7, -3, -6,-18,-14,-11, 11; /M: SY='K'; M=-11, 2,-29, 4, 14,-28,-19, -2,-30, 36,-27,-12, 2,-10, 10, 26, -6, -9,-22,-23,-10, 12; /M: SY='G'; M= 3,-11,-21,-12,-20,-29, 60,-21,-37,-20,-28,-19, -2,-20,-20,-21, 0,-18,-27,-22,-29,-20; /M: SY='I'; M= -7,-30,-22,-35,-28, 2,-35,-28, 39,-27, 22, 17,-25,-25,-23,-25,-19, -7, 33,-23, -3,-28; /M: SY='Q'; M= -3, 7,-26, 8, 19,-32,-15, -1,-23, 10,-22,-11, 4, -5, 23, 3, 1, -6,-24,-26,-15, 21; /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-29,-23, 37,-28, 0, 0,-18, 5, 5,-19,-28,-19,-11,-21,-12, -5, 18, 38,-21; /M: SY='L'; M=-11,-30,-20,-32,-22, 17,-30,-20, 19,-30, 44, 18,-28,-30,-22,-20,-28,-10, 10,-17, 3,-22; /M: SY='I'; M= -4,-17,-25,-23,-13,-12,-27,-16, 16,-11, 4, 11,-12,-17, 1,-11, -8, -3, 8,-22, -6, -8; /M: SY='E'; M= 4, 2,-22, 5, 25,-26, -9, -7,-24, 5,-22,-17, 1, -6, 9, -2, 11, -1,-19,-29,-19, 17; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='R'; M=-10, 1,-25, -3, -1,-20,-16, 6,-22, 14,-22,-10, 7,-16, 4, 16, -2, -2,-17,-20, -7, 0; /M: SY='G'; M= -6, 2,-28, 2, -2,-29, 26, -4,-33, -2,-28,-16, 8,-16, -2, -4, 0,-13,-28,-25,-20, -2; /M: SY='F'; M=-13,-24,-23,-29,-22, 23,-30,-17, 14,-20, 17, 10,-18,-26,-22,-16,-20, -9, 9,-10, 12,-22; /M: SY='L'; M= -7,-27,-19,-30,-24, 3,-30,-23, 27,-25, 28, 17,-24,-27,-21,-21,-20, -7, 24,-24, -4,-23; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M= -2, 5,-26, 8, 8,-29, 3, -9,-28, 0,-24,-17, 3, -3, 2, -5, 3, -5,-23,-28,-20, 5; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M= -9, 21,-25, 22, 5,-27,-11, 4,-24, 2,-24,-17, 18,-11, 2, 0, 3, -3,-22,-33,-14, 3; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='S'; M= -4, 11,-19, 12, 3,-19,-10, -9,-22, -4,-23,-18, 9, -8, -3, -5, 16, 13,-15,-34,-15, 0; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='P'; M= -8,-15,-29, -9, -2,-26,-20,-18,-15,-11,-23,-14,-15, 58,-10,-19, -9, -9,-21,-30,-25, -9; /M: SY='Q'; M= -4, 1,-25, 3, 11,-27,-16, -7,-18, 10,-17, -7, -2,-11, 13, 4, -2, -5,-14,-25,-13, 11; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M= -2, 10,-19, 17, 17,-28, -4, -7,-27, -4,-20,-19, 3,-10, 2,-10, 6, -5,-21,-32,-20, 10; /M: SY='I'; M= -6,-29,-20,-33,-28, 5,-33,-28, 33,-25, 19, 14,-24,-25,-24,-23,-16, -4, 32,-23, -3,-28; /M: SY='A'; M= 45,-12,-10,-21,-12,-18, -3,-21, -6,-11, -8, -8,-12,-12,-12,-20, 8, 0, 5,-21,-19,-12; /M: SY='Q'; M= -8, -4,-21, -3, 11,-25,-18, 5,-21, 8,-16, -6, -2,-14, 18, 9, -1, -7,-20,-26,-10, 14; /M: SY='F'; M=-19,-31,-25,-38,-28, 60,-29,-21, -1,-26, 7, -1,-22,-29,-34,-17,-23,-13, -3, 26, 26,-27; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-32,-22, 15,-30,-19, 21,-28, 39, 22,-27,-28,-20,-20,-27,-10, 11,-17, 3,-21; /M: SY='Y'; M=-17,-19,-28,-22,-14, 14,-25, 1, -8, -3, -2, 1,-13,-24,-10, 9,-18,-12, -9, 1, 17,-13; /M: SY='E'; M= -3, 1,-11, 1, 10,-23,-12, -8,-23, 3,-20,-14, 1,-13, 5, -1, 3, -2,-18,-28,-15, 7; /M: SY='N'; M= -4, 8,-21, 1, 0,-20, 1, -8,-23, -2,-21,-15, 14,-14, -3, 2, 7, 9,-18,-29,-17, -2; /M: SY='E'; M= -6, 4,-27, 5, 18,-26,-15, -5,-26, 12,-24,-16, 5, 1, 7, 12, 1, -5,-23,-28,-18, 11; /M: SY='G'; M= -4, -3,-26, -3,-10,-26, 31,-13,-32, -7,-26,-17, 4,-17, -8, -2, 5, -7,-24,-25,-22, -9; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 9,-30,-20, 21,-29, 48, 21,-29,-29,-19,-20,-29,-10, 11,-20, 0,-20; /M: SY='N'; M= -6, 30,-19, 26, 5,-25, -3, 1,-25, -3,-30,-23, 35,-14, 0, -6, 17, 4,-24,-40,-20, 3; /M: SY='K'; M= -9, -6,-30, -7, 3,-23,-17,-12,-26, 33,-24,-10, -5,-14, 5, 23,-11,-11,-19, -6, -7, 4; /M: SY='T'; M= -4, 2,-20, 0, 3,-22,-17,-10,-18, 10,-20,-11, 2,-11, 5, 5, 7, 11,-11,-28,-13, 4; /M: SY='M'; M= 3,-14,-18,-21,-12, -7,-18,-12, 3, -4, 2, 16,-14,-17, -4, -7, -7, -1, 5,-21, -7, -8; /M: SY='I'; M= -9,-30,-25,-36,-28, 2,-36,-28, 40,-29, 26, 19,-24,-24,-21,-26,-21, -9, 28,-21, -1,-28; /M: SY='G'; M= 0,-10,-29,-10,-18,-29, 59,-18,-38,-15,-28,-19, 0,-20,-17,-12, 0,-18,-28,-20,-28,-18; /M: SY='D'; M=-14, 20,-29, 30, 28,-28,-18, -4,-23, -1,-16,-17, 5, -8, 5, -8, -3, -8,-21,-33,-17, 16; /M: SY='Y'; M=-18,-24,-26,-27,-23, 37,-31, 2, 6,-18, 10, 4,-21,-29,-19,-15,-21,-10, -2, 16, 53,-23; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22, 12,-31,-22, 23,-30, 42, 19,-28,-29,-21,-21,-27,-10, 14,-19, 1,-22; /M: SY='G'; M= -2, -5,-12, -4,-16,-28, 44,-19,-37,-18,-28,-21, 0,-20,-18,-19, 2,-13,-25,-27,-28,-17; /M: SY='E'; M=-11, 20,-27, 23, 24,-29,-10, 2,-29, 5,-24,-19, 14, -9, 9, -1, 2, -4,-27,-32,-17, 17; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='R'; M=-13, 1,-28, 0, 0,-24, -7, 10,-28, 10,-25,-13, 9,-10, 5, 23, -2, -8,-24,-27,-12, 0; /M: SY='D'; M=-12, 17,-27, 21, 14,-29, -9, -2,-30, 13,-27,-18, 13,-12, 7, 12, 1, -7,-25,-30,-17, 10; /I: I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='E'; M=-11, 12,-28, 19, 22,-29,-16, -3,-24, 6,-22,-16, 4, 6, 10, -1, -2, -8,-23,-29,-18, 15; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='F'; M=-13,-18,-18,-22,-17, 34,-24,-12, 2,-18, 6, 1,-14,-21,-22,-14,-13, -6, 2, -3, 15,-18; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='N'; M= -4, 16,-16, 12, 1,-22, -6, 5,-21, -5,-25,-17, 22, -3, -2, -7, 8, -1,-22,-33,-16, -2; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='L'; M= -5,-14,-20,-17, -8, -8,-20,-12, 4, -9, 10, 7,-11,-18, -3, -5, -9, -5, 1,-21, -6, -6; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='E'; M= 0, 4,-20, 6, 13,-22,-12, -2,-19, 9,-16,-10, 0, -8, 8, 2, 0, -5,-15,-21,-11, 10; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='V'; M= -1,-25,-11,-26,-25, -1,-27,-26, 26,-18, 8, 8,-24,-24,-24,-18, -8, 3, 39,-26, -8,-25; D=-4; /I: I=-4; DM=-21; /M: SY='L'; M=-11,-27,-20,-31,-21, 11,-27,-15, 19,-25, 40, 30,-27,-27,-16,-17,-27,-10, 9,-18, 2,-18; /M: SY='H'; M=-14, 16,-23, 18, 9,-25,-14, 25,-27, 1,-24,-14, 15,-15, 6, -2, 0, -9,-25,-32, -5, 6; /M: SY='A'; M= 13, -2, -5, -4, 1,-19,-11,-12,-18, -6,-14,-13, -4,-15, -5, -9, 4, -3,-11,-27,-15, -3; /M: SY='F'; M=-18,-27,-22,-32,-26, 53,-30, -9, 4,-23, 10, 2,-22,-30,-28,-17,-20, -9, 1, 11, 40,-26; /M: SY='V'; M= 2,-24,-14,-28,-25, -3,-28,-28, 24,-20, 7, 7,-22,-24,-24,-20, -6, 6, 35,-27, -9,-25; /M: SY='D'; M= -9, 24,-25, 32, 11,-31,-10, -6,-30, 6,-25,-19, 10,-11, 0, -2, 3, -2,-21,-33,-17, 5; /M: SY='E'; M= -2,-10,-12,-12, 1, -6,-19,-10, -9,-13, 1, -4, -9,-17, -4,-12, -1, 0, -8,-26, -9, -1; /M: SY='F'; M=-16,-20,-23,-26,-19, 25,-26, 16, 1,-20, 9, 16,-13,-25,-15,-13,-18,-13, -4,-12, 16,-17; /M: SY='D'; M=-13, 30,-27, 37, 16,-32,-10, -1,-32, 6,-29,-23, 20, -7, 3, -2, 4, -5,-27,-36,-19, 9; /M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 70,-30,-20, 4,-30, 14, 3,-21,-30,-37,-20,-21,-10, 2, 6, 26,-29; /M: SY='R'; M= -4, -1,-21, -3, 6,-23,-15, 1,-22, 10,-22,-11, 4,-12, 9, 12, 7, 2,-16,-28,-12, 6; /M: SY='G'; M= -7, 13,-26, 13, 4,-27, 18, -5,-31, -6,-27,-20, 15,-15, -3, -9, 5, -8,-27,-29,-20, 0; /M: SY='M'; M= -9,-20,-22,-23,-13, -5,-25,-12, 10, -9, 18, 22,-19,-22, -4, -7,-18, -7, 6,-21, -3, -9; /M: SY='R'; M=-14, 7,-29, 8, 11,-19,-17, -3,-24, 9,-21,-14, 6, -4, 6, 12, -5, -9,-23,-25,-13, 7; /M: SY='L'; M=-10,-30,-19,-33,-26, 23,-31,-22, 21,-27, 25, 12,-26,-29,-26,-21,-21, -8, 19,-14, 8,-26; /M: SY='D'; M=-12, 9,-24, 19, -2,-22,-16, -7,-13,-10,-12,-12, -3, -9,-11,-14, -7, -8, -4,-33,-15, -7; /M: SY='E'; M= -4, 6,-24, 8, 21,-25,-15, -5,-18, 0,-19,-14, 4, -2, 10, -5, 4, -3,-17,-31,-18, 15; /M: SY='A'; M= 46,-10,-11,-19,-10,-21, 4,-20,-12,-11,-12,-11, -9,-11,-10,-20, 11, 0, -2,-21,-21,-10; /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22, 8,-32,-22, 26,-30, 44, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 14,-20, 0,-22; /M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10, 0,-20,-20, 0,-30, 30,-20,-10, 0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10, 0; /M: SY='Q'; M=-10,-10,-26,-11, 4, -9,-23, -5, -7, 2, -3, 3,-10,-16, 7, 3,-10, -8,-10,-17, 0, 5; /M: SY='F'; M=-15,-27,-21,-34,-25, 53,-28,-13, 4,-25, 14, 6,-21,-29,-29,-18,-20,-10, 0, 6, 30,-25; /M: SY='L'; M=-11,-27,-21,-28,-17, 11,-29,-16, 14,-25, 38, 18,-26,-28,-13,-17,-26,-10, 5,-17, 2,-15; /M: SY='E'; M= -8, -5,-28, -5, 14,-16,-19, -6,-22, 7,-17,-11, -6,-12, 12, 9, -4, -6,-21, -6, -7, 13; /M: SY='S'; M= -4, -3,-17, -4, -6,-12, -4, 5,-23, -6,-21,-12, 2,-16, -6, -7, 6, 1,-16,-25, -6, -6; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='F'; M=-17,-28,-20,-38,-28, 63,-30,-20, 8,-28, 11, 3,-19,-27,-34,-20,-19, -9, 5, 5, 23,-28; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='R'; M=-17, -8,-27, -9, -1,-18,-20, 6,-24, 21,-17, -7, 0,-18, 7, 50, -8, -7,-17,-20, -6, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='L'; M= -3,-26,-18,-27,-18, 4,-25,-19, 15,-24, 35, 15,-26,-22,-18,-19,-22, -8, 10,-20, -4,-18; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='P'; M= -9,-17,-37, -9, 1,-29,-19,-17,-19, -8,-27,-17,-17, 78, -4,-17, -9, -9,-28,-27,-27, -6; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='G'; M= -1, -7,-28, -6,-11,-28, 54,-17,-36,-13,-27,-18, 0,-17,-14,-15, 0,-17,-28,-20,-26,-12; D=-2; /I: I=-2; MD=-10; /M: SY='E'; M= -9, 9,-28, 19, 56,-28,-19, 0,-28, 9,-19,-19, 0, 0, 19, 0, 0, -9,-28,-28,-19, 38; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10; /M: SY='A'; M= 31, -6,-11,-12, -7,-20, 6,-16,-15,-10,-17,-13, -3,-10, -7,-16, 17, 4, -6,-25,-20, -7; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='Q'; M= -7, 0,-28, 1, 21,-35,-18, 5,-20, 7,-19, -4, -2, -1, 44, 5, 0, -9,-27,-21,-12, 32; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='K'; M=-10, -4,-27, -4, 6,-20,-21, -5,-19, 28,-17, -5, -5,-13, 10, 16,-10, -9,-15,-15, -1, 8; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='I'; M= -9,-28,-26,-36,-27, 1,-36,-27, 43,-27, 21, 18,-20,-20,-20,-27,-19, -9, 28,-20, -1,-27; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='D'; M=-12, 27,-26, 36, 26,-29,-12, 2,-30, 2,-23,-21, 12, -8, 7, -5, 0, -8,-26,-31,-16, 17; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='R'; M=-16,-10,-26,-11, -2,-16,-19, -3,-23, 21,-13, -7, -2,-19, 6, 53, -8, -4,-15,-20, -9, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='I'; M= -8,-27,-21,-32,-24, 6,-31,-22, 30,-25, 28, 21,-24,-24,-19,-21,-21, -8, 21,-19, 0,-23; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='M'; M= -9,-24,-20,-31,-22, 2,-26,-13, 27,-19, 24, 35,-22,-22,-11,-17,-20, -9, 17,-20, -1,-18; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -9, 4,-26, 10, 40,-24,-20, -3,-21, 4,-12,-13, -3, -4, 16, -2, -1, -4,-22,-27,-15, 28; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='K'; M= 11, -4,-20, -8, 0,-22,-12, -6,-18, 16,-19, -8, -3,-10, 1, 5, 0, -3,-10,-21,-11, 0; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='F'; M=-19,-28,-19,-38,-28, 75,-28,-19, 0,-28, 9, 0,-19,-28,-38,-19,-19, -9, 0, 9, 28,-28; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='A'; M= 26, -5,-10,-10, -6,-19, 2,-15,-15,-10,-19,-14, 0,-10, -6,-14, 22, 9, -5,-27,-19, -6; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -5, 3,-22, 6, 21,-24,-15, 9,-21, -1,-17,-11, 2, -8, 15, -3, 7, -1,-20,-28,-11, 17; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='R'; M=-13, -8,-26, -8, 0,-17,-19, 12,-22, 17,-17, -6, -2,-18, 5, 36, -9,-10,-15,-20, -3, -1; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='Y'; M=-19,-23,-29,-25,-22, 35,-27, 6, -2,-14, 0, -2,-21,-28,-16,-12,-21,-12,-10, 38, 61,-21; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='C'; M= -5,-17, 43,-24,-21, -7,-23,-15,-13,-20, -8, -5,-15,-28,-18,-19, -8, -7, -5,-26, -8,-20; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='E'; M= -2, 1,-22, -1, 7,-19,-15, -7,-12, 5,-12, -5, 1,-12, 3, 0, -2, -5,-11,-25,-12, 4; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='C'; M= -5, -3, 43, -7, -7,-24,-19,-14,-24,-13,-19,-15, -6,-24, -4,-15, -2, -7,-15,-37,-21, -5; D=-2; /I: I=-2; DM=-10; /M: SY='N'; M= -9, 36,-20, 18, 1,-21, -1, 9,-20, 0,-29,-19, 54,-19, 4, 0, 10, 0,-29,-39,-19, 3; /M: SY='P'; M= -8,-13,-34, -7, -1,-27,-15,-16,-18,-10,-23,-16,-12, 56, -6,-17, -7, -8,-25,-29,-25, -7; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='G'; M= -4, 10,-25, 12, 3,-28, 18, -9,-31, -4,-28,-20, 11,-14, -5, -8, 7, -6,-25,-30,-22, -1; /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='I'; M= -4,-21,-20,-21,-16, -6,-24,-20, 12,-16, 9, 5,-18,-10,-15,-13,-10, -4, 12,-24, -9,-17; D=-4; /I: I=-4; DM=-22; /M: SY='F'; M=-16,-24,-22,-32,-23, 45,-28,-11, 4,-22, 10, 9,-18,-26,-21,-16,-18, -7, 0, 2, 25,-20; /M: SY='Q'; M= 3, -5,-23, -8, -1,-21, -7, -6,-21, 4,-20,-11, 0, -7, 6, 6, 4, -2,-17,-23,-14, 1; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='N'; M= -2, 19,-17, 12, 1,-21, -2, 7,-22, -6,-29,-19, 30,-15, 1, -5, 22, 7,-21,-39,-17, 1; /M: SY='A'; M= 20,-11,-18,-15, -7,-18,-10,-17,-11, -4,-15,-10,-10, 4, -9,-13, 5, 3, -5,-22,-15, -9; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M=-18, 47,-29, 66, 19,-39, -9, -1,-39, -1,-30,-29, 19,-10, 0,-10, 2, -8,-29,-40,-20, 9; /M: SY='T'; M= 19, -4,-11,-12, -7,-17,-11,-17,-11, -9,-12,-10, -3,-10, -4,-12, 16, 24, -3,-26,-14, -6; /M: SY='A'; M= 25,-18, 4,-26,-19,-14,-15,-25, 3,-17, -3, -3,-16,-19,-18,-23, 0, -3, 12,-26,-17,-19; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-27,-24,-21, 39,-29, 16, -3,-17, 2, 1,-17,-29,-17,-12,-19,-11, -9, 15, 55,-21; /M: SY='V'; M= -2,-23,-15,-27,-24, -3,-29,-26, 24,-19, 8, 8,-21,-24,-22,-18, -7, 6, 32,-27, -8,-24; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='A'; M= 31, -7, 1,-14, -8,-20, -3,-17,-15,-12,-18,-14, -4,-13, -8,-17, 19, 6, -4,-30,-21, -8; /M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30, 9, 0,-16, 3, 0,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -7, 24, 66,-23; /M: SY='A'; M= 23, -5,-11, -9, -4,-19, -2,-13,-14,-10,-18,-13, 0,-11, -2,-13, 23, 10, -6,-31,-19, -3; /M: SY='I'; M= -8,-28,-13,-35,-28, 0,-35,-28, 34,-27, 18, 14,-22,-24,-22,-26,-17, -6, 27,-25, -5,-28; /M: SY='I'; M=-10,-29,-29,-39,-29, 0,-39,-28, 48,-29, 20, 22,-20,-20,-19,-29,-20,-10, 29,-20, 0,-29; /M: SY='M'; M=-10,-22,-20,-30,-20, 2,-22, -4, 20,-14, 26, 52,-22,-22, -4,-12,-22,-10, 10,-20, 0,-12; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 47, 19,-30,-30,-21,-20,-29, -9, 13,-21, -1,-21; /M: SY='N'; M= -7, 31,-19, 15, 0,-20, -3, 6,-19, -1,-28,-18, 48,-18, 2, -1, 13, 5,-26,-38,-19, 1; /M: SY='T'; M= -1, -4,-12,-14,-13, -8,-22,-21, -2,-12, -6, -5, -4,-12,-11,-12, 14, 41, 5,-29, -9,-13; /M: SY='D'; M=-17, 40,-27, 56, 15,-35,-11, -2,-34, -3,-24,-25, 15,-11, -1,-11, 1, -7,-25,-39,-19, 7; /M: SY='L'; M= -1,-20,-20,-23,-11, -4,-23,-13, 8,-18, 25, 14,-20,-23, -3,-14,-17, -8, 1,-21, -5, -7; /M: SY='H'; M=-18, -1,-28, -2, -2,-16,-21, 84,-26,-10,-18, -1, 7,-20, 7, -2, -8,-13,-26,-26, 22, -2; /M: SY='N'; M= -3, 26,-17, 13, 0,-20, -1, 3,-20, -3,-29,-20, 43,-17, 0, -3, 20, 8,-23,-40,-20, 0; /M: SY='P'; M= -9,-15,-36, -8, 2,-27,-20,-12,-18, -8,-26,-17,-14, 64, -7,-16, -7, -8,-25,-30,-24, -7; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='N'; M= -9, 12,-23, 3, 2,-22,-11, 13,-16, 2,-19, -2, 21,-16, 15, 3, 3, -3,-21,-30,-11, 8; /M: SY='V'; M= 1,-25,-13,-28,-27, -2,-28,-27, 27,-20, 9, 9,-23,-27,-26,-20, -9, -2, 39,-28,-10,-27; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='K'; M=-11, -5,-30, -5, 5,-24,-20,-11,-26, 37,-24, -9, -4,-13, 6, 27,-11,-10,-19,-11, -8, 5; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='D'; M=-13, 19,-28, 23, 11,-30,-12, 1,-29, 7,-28,-19, 16, 1, 5, 4, 0, -7,-27,-33,-18, 7; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='K'; M=-11, -2,-30, -2, 8,-28,-19, -1,-29, 37,-27,-10, 0, -9, 11, 30, -8,-10,-21,-22, -9, 8; /M: SY='M'; M=-10,-17,-24,-24,-14, -7,-19, -2, 10, -9, 8, 41,-16, -2, 1,-10,-16,-10, 0,-22, -6, -8; /I: I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='T'; M= 2, -2,-14, -8, -6,-15,-12,-16,-15, -6,-18,-12, 1, -5, -6, -7, 20, 30, -6,-31,-14, -6; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='L'; M= -8,-17,-19,-19, -9, 1,-25,-16, -3, 0, 6, 3,-16,-22,-10, -3,-16, -9, -1,-18, -3, -8; /M: SY='E'; M= -3, 11,-26, 18, 32,-29,-14, -3,-28, 6,-21,-18, 3, -6, 13, 2, 4, -6,-24,-30,-19, 22; /M: SY='D'; M=-15, 23,-24, 33, 19,-35,-11, -1,-34, 7,-26,-20, 9,-11, 12, 2, -2,-10,-28,-32,-18, 15; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-35,-27, 66,-30,-11, 1,-26, 9, 1,-20,-30,-32,-18,-20,-10, -2, 13, 40,-27; /M: SY='I'; M= -7,-21,-19,-28,-21, -6,-31,-24, 22,-17, 5, 7,-14,-19,-15,-14, -8, 2, 18,-25, -6,-21; /M: SY='R'; M=-10, 3,-27, 0, 6,-24,-12, -4,-27, 24,-25,-13, 9,-15, 7, 31, -3, -7,-21,-25,-14, 5; /M: SY='N'; M=-10, 18,-20, 2, -7,-12, -8, 5, -6, -5,-11, 7, 31,-21, -1, -4, -1, -4,-16,-33,-13, -4; /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29; /M: SY='N'; M= -6, 6,-18, -4,-10, -8,-14, -6, -3,-13, 3, -3, 16,-23,-10,-10, -4, 1, -9,-31,-12,-10; /M: SY='R'; M=-12, -6,-28, -6, 5,-22,-18, -3,-28, 28,-21,-11, 0,-16, 9, 50, -6, -8,-19,-22,-12, 4; /M: SY='G'; M= -3, -8,-29, -9,-14,-28, 47,-12,-36,-13,-27,-16, 0,-19,-10, -9, 0,-14,-27,-21,-24,-13; /M: SY='I'; M= -2,-20,-11,-27,-22, -6,-28,-23, 21,-21, 9, 7,-15,-22,-16,-21,-10, -2, 18,-26, -8,-21; /M: SY='N'; M= -8, 28,-17, 24, 2,-22, -7, 1,-22, -5,-21,-19, 29,-18, -4, -8, 3, -4,-23,-35,-16, -1; /M: SY='D'; M=-13, 25,-29, 33, 19,-34, -4, -1,-32, 2,-27,-22, 15, -5, 7, -5, 0,-10,-30,-33,-20, 12; /I: I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='G'; M= -1, -6,-21, -5, -8,-25, 36,-11,-32,-10,-26,-17, 1,-16,-10,-12, 4,-11,-23,-23,-22, -9; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='K'; M= -3, 3,-24, 4, 10,-26, 1, -5,-27, 11,-23,-14, 3,-10, 4, 5, 0, -8,-21,-23,-16, 7; D=-4; /I: I=-4; DM=-23; /M: SY='D'; M=-12, 39,-17, 46, 10,-33, -8, -1,-32, -3,-28,-26, 25,-14, -3,-10, 3, -7,-27,-39,-21, 4; /M: SY='L'; M= -9,-29,-23,-35,-25, 23,-31,-23, 23,-29, 26, 13,-23,-26,-24,-23,-22, -9, 13,-12, 6,-25; /M: SY='P'; M= -9, 2,-31, 10, 6,-29,-15,-13,-24, -7,-28,-21, -3, 43, -5,-14, 1, -2,-26,-34,-25, -2; /M: SY='E'; M=-12, 0,-28, 3, 19,-22,-21, -5,-19, 8,-16,-11, -2, -7, 11, 12, -4, -6,-18,-25,-13, 14; /M: SY='E'; M=-13, 17,-30, 26, 34,-29,-14, -1,-31, 5,-24,-22, 7, -7, 9, -3, -1,-10,-29,-21,-16, 22; /M: SY='Y'; M=-14,-22,-23,-27,-18, 22,-27, -5, 7,-17, 14, 15,-19,-25,-11,-13,-18, -7, 0, -2, 23,-15; /M: SY='L'; M= -9,-30,-19,-30,-21, 9,-30,-21, 21,-29, 45, 19,-30,-30,-21,-20,-28, -9, 15,-21, -1,-21; /M: SY='E'; M= -2, -2,-22, -2, 6,-23, -2, -6,-21, -1,-19,-10, -1,-12, 2, 0, 5, -1,-15,-27,-16, 4; /M: SY='E'; M= -4, 5,-25, 6, 11,-24, 2, 2,-28, 0,-23,-16, 6,-12, 2, -3, 2, -8,-24,-27,-15, 6; /M: SY='I'; M= -9,-29,-23,-35,-26, 7,-33,-24, 33,-27, 26, 21,-24,-25,-21,-23,-21, -8, 24,-20, 0,-26; /M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-22,-21, 36,-30, 16, 0,-12, 1, 0,-20,-30,-13,-11,-20,-10, -9, 28, 74,-21; /M: SY='D'; M=-15, 23,-23, 32, 23,-31,-16, 5,-30, 1,-21,-19, 9,-11, 7, -5, -2, -8,-26,-34,-15, 15; /M: SY='S'; M= 2, 4,-20, 3, 8,-23, -8, -5,-23, 4,-23,-16, 8,-12, 6, 10, 13, 2,-17,-31,-17, 6; /M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30, 0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30; /M: SY='K'; M= -5, -6,-19, -6, 4,-23,-18, -9,-17, 15,-19, -8, -4,-15, 8, 12, 0, -4,-10,-26,-13, 6; /M: SY='K'; M= -4, 4,-23, 1, 3,-23,-11, -8,-17, 9,-20,-10, 7,-14, 4, 3, 1, -2,-12,-28,-15, 3; /M: SY='E'; M=-10, 15,-25, 14, 20,-25,-15, 0,-26, 12,-23,-17, 15,-10, 7, 7, 2, 0,-24,-31,-15, 13; /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 77 in 77 different sequences |
| Number of true positive hits | 77 in 77 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 97.47 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | K_Hofmann, N_Hulo |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | SEC7 |
| Version [info] | 7 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
77 sequences
BIG1_ARATH (F4JSZ5), BIG1_BOVIN (O46382), BIG1_HUMAN (Q9Y6D6), BIG1_MOUSE (G3X9K3), BIG1_RAT(D4A631), BIG2_ARATH (Q9LZX8), BIG2_HUMAN (Q9Y6D5), BIG2_MOUSE (A2A5R2), BIG2_RAT(Q7TSU1), BIG3_ARATH (Q9LPC5), BIG4_ARATH (F4JN05), BIG5_ARATH (F4IXW2), CYH1_CHLAE (Q76MZ1), CYH1_HUMAN (Q15438), CYH1_MOUSE (Q9QX11), CYH1_RAT(P97694), CYH2_BOVIN (Q2KI41), CYH2_CHLAE (Q76MY7), CYH2_HUMAN (Q99418), CYH2_MOUSE (P63034), CYH2_RAT(P63035), CYH3_HUMAN (O43739), CYH3_MOUSE (O08967), CYH3_RAT(P97696), CYH4_HUMAN (Q9UIA0), CYH4_MOUSE (Q80YW0), EFA6_CAEEL (G5EET6), FBX8_BOVIN (Q5E9G6), FBX8_HUMAN (Q9NRD0), FBX8_MOUSE (Q9QZN3), GBF1_CAEEL (G5EGS5), GBF1_CRIGR (Q9R1D7), GBF1_HUMAN (Q92538), GBF1_MOUSE (Q6DFZ1), GEA1_YEAST (P47102), GEA2_YEAST (P39993), GNL1_ARATH (Q9FLY5), GNL2_ARATH (F4K2K3), GNOM_ARATH (Q42510), GRP1_CAEEL (P34512), IQEC1_HUMAN (Q6DN90), IQEC1_MOUSE (Q8R0S2), IQEC1_RAT (A0A0G2JUG7), IQEC2_HUMAN (Q5JU85), IQEC2_MOUSE (Q5DU25), IQEC3_HUMAN (Q9UPP2), IQEC3_MOUSE (Q3TES0), IQEC3_RAT (Q76M68), PSD1_BOVIN (F1MUS9), PSD1_HUMAN (A5PKW4), PSD1_MOUSE (Q5DTT2), PSD1_RAT(Q9ESQ7), PSD2_HUMAN (Q9BQI7), PSD2_MOUSE (Q6P1I6), PSD3_HUMAN (Q9NYI0), PSD3_MOUSE (Q2PFD7), PSD4_HUMAN (Q8NDX1), PSD4_MOUSE (Q8BLR5), PSD_DROME (E1JIT7), SEC71_SCHPO (Q9UT02), SEC72_SCHPO (Q9P7V5), SEC74_SCHPO (Q10491), SEC7C_SCHPO (O13817), SEC7_YEAST (P11075), SECG_DICDI (Q54KA7), SYT1_YEAST (Q06836), YDYB_SCHPO (O13690), YEL1_EREGS (Q75D04), YEL1_LACTC (C5DE74), YEL1_VANPO (A7TDT6), YEL1_YEAS1 (B3LNJ6), YEL1_YEAS2 (C7GNA4), YEL1_YEAS7 (A6ZKN8), YEL1_YEAS8 (C8Z3N7), YEL1_YEAST (P34225), YEL1_ZYGRC (C5DQU9), YHV3_SCHPO (Q9P7R8)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
BIG3_HUMAN (Q5TH69), BIG3_MOUSE (Q3UGY8) |
| PDB [Detailed view] |
37 PDB
1BC9; 1KU1; 1PBV; 1R8M; 1R8Q; 1R8S; 1RE0; 1S9D; 2R09; 2R0D; 3L8N; 3LTL; 3SWV; 4A4P; 4C0A; 4JMI; 4JMO; 4JWL; 4JXH; 4L5M; 4OIY; 4Z21; 5NLV; 5NLY; 6BBP; 6BBQ; 6FAE; 6FNE; 6U3E; 6U3G; 7URO; 7URR; 7UT4; 7UTH; 7VMB; 8EZJ; 8EZQ » more |