Entry: PS50208

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] CASPASE_P20
Accession [info] PS50208
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00864

Name and characterization of the entry

Description [info] Caspase family p20 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=123;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=118;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-.4252; R2=.01910565; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-4541.82790; R2=38.01462; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; N_SCORE=8.5; H_SCORE=17203; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=362; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9219; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-30; E1=-30; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M= -4, -9,-29, -6,  8,-25,-17, -9,-24, 13,-22,-14, -6, 12,  3, 20, -5, -8,-21,-24,-18,  3;
/M: SY='R'; M=-13, -2,-23, -2, -4,-16,-19, -5,-15,  6, -8,  2, -2,-17,  1, 20, -5,  2,-10,-25, -9, -4;
/M: SY='G'; M= -7, -8,-30, -8,-10,-27, 33,-13,-36,  4,-27,-16,  0,-18, -8, 11, -4,-16,-26,-20,-22,-10;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-20,-27,-20,  2,-29,-21, 19,-18, 28, 17,-25,-26,-18,-15,-22, -8, 17,-22, -3,-19;
/M: SY='C'; M= 28,-14, 38,-24,-17,-20,-11,-24,-17,-17,-14,-14,-14,-21,-17,-24,  3, -4, -4,-31,-24,-17;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 28,-30, 42, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 15,-20,  0,-23;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-39,-30,  0,-39,-30, 47,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 33,-21, -1,-30;
/M: SY='I'; M=-11,-28,-26,-37,-27,  8,-34,-22, 37,-26, 22, 26,-21,-22,-18,-24,-21,-10, 22,-17,  3,-25;
/M: SY='N'; M= -4, 13, 18,  2, -8,-20, -8, -6,-23,-10,-27,-20, 25,-22, -8,-10, 13,  3,-19,-43,-23, -8;
/M: SY='N'; M=-11, 36,-21, 18,  0,-20, -2, 18,-21, -1,-29,-18, 55,-20,  1,  0,  8, -2,-30,-39,-16,  0;
/M: SY='E'; M= -7, -4,  0, -5,  9,-21,-23,-15,-19,  6,-17,-12, -7,-15, -2, -2, -2,  2, -9,-31,-16,  3;
/M: SY='H'; M=-11, 13,-24, 10, 11,-23,-11, 25,-26,  3,-25,-14, 20,-14,  7,  6,  5, -5,-25,-33, -9,  7;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-37,-28, 72,-30,-14,  0,-27,  8,  0,-20,-30,-35,-18,-20,-10, -2, 13, 38,-28;
/M: SY='D'; M=-12,  8,-23, 12,  6,-15,-20,  5,-17, -7,-14,-11,  0,-15, -1, -8, -2, -2,-11,-28, -6,  2;
/I:         I=-5; MI=0; IM=0; DM=-20; MD=-20;
/M: SY='H'; M= -9,  1,-27,  2,  1,-26,  5, 28,-29, -8,-23,-10,  5,-15,  6, -6,  1, -8,-26,-28, -7,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-21,-31,-21,  6,-27,-13, 22,-23, 37, 35,-26,-26,-13,-17,-26,-10, 11,-20,  0,-17;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-31, -1,  7,-27,-12,-15,-23, -8,-27,-20, -8, 44, -5,-15,  2, -1,-25,-31,-25, -2;
/M: SY='E'; M= -4,-10,-23, -9,  6, -8,-20,-13,-13, -4,-13,-11, -9,  1, -6, -4, -1,  1, -9,-23,-12, -1;
/M: SY='R'; M=-18,-13,-28,-13, -3,-15,-22, -3,-22, 20, -9, -5, -5,-22,  5, 56,-13,-10,-15,-20, -8, -3;
/M: SY='N'; M= -7, 10,-19,  2, -3,-18, -9, -2,-18,  3,-23,-14, 22,-18, -1, 13, 11,  5,-14,-33,-16, -3;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-27,-10,-17,-26, 47,-18,-34,-14,-26,-17,  0,-18,-16,-10,  2, -8,-24,-22,-25,-17;
/M: SY='T'; M= 11, -7,-17,-13,-10,-18, -4,-20,-15,-11,-16,-13, -6,  5,-11,-15, 10, 19, -9,-26,-18,-11;
/M: SY='D'; M=-17, 22,-16, 31, 13,-32,-16, 17,-34,  2,-26,-18, 10,-14,  4, -4, -4,-12,-27,-35,-11,  8;
/M: SY='V'; M=  6,-20,  7,-24,-21, -5,-23,-23,  2,-11, -4, -2,-20,-25,-21,-15, -7, -4, 16,-25, -9,-21;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='A'; M= 12,-13,-21,-18,-10,-15,-16, -4, -4, -4, -4, -1, -9,-16, -6, -5, -5, -7, -2,-21, -8,-10;
/M: SY='D'; M= -1,  8,-21, 10, 10,-26,-15, -7,-20,  0,-18,-13,  2,-11,  8, -1,  6,  5,-14,-29,-15,  8;
/M: SY='N'; M=  1, 10,-19,  1, -2,-20,  3, -9,-21, -4,-21,-16, 17,-14, -5, -7,  9, 10,-18,-30,-18, -3;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-15, 20,-25, 42, 30,-27,-27,-15,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='T'; M=  1,-10,-18,-16,-10, -5,-19,-17,-10,  3,-10, -6, -8,-16, -9,  4,  0,  9,  0,-21, -7,-10;
/M: SY='E'; M=-12,  9,-25, 10, 11,-21,-17, -4,-20,  7,-14, -9,  6,-13,  3,  8, -3, -1,-18,-29,-13,  7;
/M: SY='L'; M=  0,-20, -3,-24,-17, -4,-24,-20,  3,-19, 16,  4,-18,-24,-15,-12,-12,  0,  3,-25, -9,-17;
/M: SY='F'; M=-16,-30,-20,-36,-26, 51,-30,-20,  8,-30, 27,  8,-24,-30,-32,-20,-24,-10,  4, -2, 18,-26;
/M: SY='Q'; M=-11, -4,-27, -4, 12,-27,-18,  1,-21, 17,-19, -2, -1,-13, 25, 25, -2, -7,-20,-23,-11, 17;
/M: SY='B'; M= -3,  5, -6,  5, -4,-22, -5,-12,-22, -3,-17,-14,  4,-18, -7, -8,  0, -6,-16,-32,-18, -6;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-20,-30,-20,  7,-27,-14, 20,-24, 42, 31,-27,-27,-14,-17,-27,-10, 10,-20,  0,-17;
/M: SY='G'; M= -4,  2,-28,  0,-11,-29, 42,-13,-35, -6,-30,-19, 11,-18,-12, -9,  0,-15,-29,-24,-25,-11;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 40,-30, 12,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 70,-22;
/M: SY='E'; M= -7, 14,-22, 15, 16,-25,-15, -7,-25,  7,-23,-18,  9, -8,  4, -1,  9,  9,-18,-32,-16, 10;
/M: SY='V'; M=  0,-25,-10,-27,-27, -2,-28,-28, 24,-18,  7,  7,-25,-27,-27,-18, -5,  8, 42,-30,-10,-27;
/M: SY='V'; M=-11, -9,-25, -8, -9,-15,-25, -2, -1,  1, -8, -1, -8,-20, -7,  3,-11, -9,  5,-26, -6,-10;
/M: SY='C'; M= -4,-10, 15,-15,-20,-11,-23,-21,  1,-17, -7, -6, -8,-27,-21,-17, -2,  5, 15,-36,-16,-21;
/M: SY='K'; M=-12,-13,-26,-13, -1, -2,-25, -9,-10,  9,  1,  0,-13,-19, -4,  3,-17,-10, -9,-13,  6, -3;
/M: SY='N'; M= -2, 18,-15, 12,  8,-23,-10,  1,-24,  3,-24,-17, 20,-15,  1, -3,  2, -5,-22,-31,-15,  4;
/M: SY='D'; M=-16, 46,-26, 51, 13,-33, -6,  4,-33,  0,-30,-26, 35,-14,  0, -6,  4, -6,-30,-40,-20,  6;
/M: SY='L'; M=-10,-25, -6,-27,-17,  0,-29,-18, 11,-25, 31, 13,-24,-28,-11,-18,-23,-10,  4,-23, -5,-14;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-12, -7, -6,-14,-16,-17,-14, -4,-15,-12,  2,-10, -6, -6, 21, 39, -4,-31,-12, -6;
/M: SY='A'; M= 18,-14, -2,-20,-14,-16, -3,-18,-14,-11, -5, -8,-12,-19,-12, -9, -3, -6, -6,-23,-18,-14;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-26,  9, 17,-25,-16, -3,-23,  6,-15,-12,  0,-12, 11, 10, -1, -7,-20,-27,-15, 13;
/M: SY='E'; M=-11, 13,-30, 23, 38,-32, -8, -4,-33,  9,-24,-21,  3, -5, 11, -1, -1,-11,-29,-29,-20, 24;
/M: SY='M'; M=-10,-22,-21,-31,-21,  1,-24, -6, 24,-15, 23, 51,-21,-21, -5,-14,-21,-10, 13,-20,  0,-14;
/M: SY='Q'; M= -9,-12,-23,-12,  1,-15,-23, -8, -5, -2,  2,  3,-11,-18,  9,  5, -8, -2, -4,-23, -8,  4;
/I:         I=-6; MI=-32; MD=-32; IM=-32;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-23,  5, 12,-11,-19, -3,-15, -1, -8, -9, -4,-13,  1, -5, -3, -2,-14,-18,  2,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M= -7,-13,-22,-15, -2,  2,-24,-15, -6, -3,  3, -1,-13,-18, -9, -5,-11, -2, -4,-18, -3, -5;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-34,-24,  5,-32,-21, 32,-27, 33, 25,-25,-25,-18,-22,-24,-10, 19,-20,  0,-23;
/M: SY='R'; M=-16, -2,-30,  0,  9,-26,-20,  9,-29, 25,-22, -9,  2,-15, 17, 40, -8,-11,-23,-22, -8, 10;
/M: SY='B'; M=  1, 10,-21, 10,  9,-23,-12, -8,-17,  2,-18,-14,  8,-13, -2, -5,  2, -4,-10,-31,-17,  3;
/M: SY='F'; M= -5,-25,-18,-32,-25, 41,-25,-15,  4,-22,  5,  0,-20,-27,-29,-18,-13, -7,  7,  1, 23,-25;
/M: SY='A'; M= 27, -5,-13,-10, -2,-23, -3,-12,-15, -7,-18,-12, -2,-10,  5,-12, 19,  5, -8,-27,-18,  1;
/M: SY='K'; M= -1,  0,-24, -2, 11,-26,-17, -2,-23, 20,-21, -9, -1,-10, 12, 10, -1, -1,-17,-23,-10, 11;
/M: SY='E'; M=-11,-10,-12, -9,  4,-12,-23, -5,-10, -6,  2, -3, -9,-20, -4,  2,-12, -9, -8,-28,-10, -1;
/M: SY='P'; M=-11,  1,-32, 10,  7,-27,-19,-13,-15, -8,-21,-16, -5, 28, -5,-16, -3, -7,-19,-32,-21, -1;
/M: SY='H'; M= -3,  0,-25,  0, 10,-24, -2, 27,-27, -7,-20,-11,  3,-12,  3, -7,  1, -8,-23,-28, -7,  5;
/M: SY='H'; M= -5,  5,-22,  1, -2,-19,-11, 46,-23, -8,-22, -9, 16,-17,  3, -4,  6, -3,-22,-33,  0, -2;
/M: SY='K'; M= -9,  5,-29,  5,  0,-29,  8, -8,-33, 18,-29,-16,  9,-15,  0, 14, -4,-12,-25,-24,-18, -1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0;
/M: SY='S'; M=  8, -3,-10, -6, -3,-13, -5, -9,-13, -2,-15,-10,  2, -9, -1,  2, 15, 11, -6,-22,-12, -3; D=-6;
/I:         DM=-29;
/M: SY='D'; M= -5, 24,-22, 34,  6,-29,-11, -8,-23, -6,-21,-20,  7,-13, -6,-13,  5, -3,-11,-36,-18,  0;
/M: SY='S'; M=  1, -7, 14, -9, -9,-12,-11, -9,-19,-14,-23,-17, -1,-19, -8,-14, 20,  9,-10,-31, -6, -9;
/M: SY='F'; M=  6,-16,  3,-26,-19, 17,-19,-21, -9,-19, -4, -8,-12,-21,-23,-19,  0,  8, -1,-16, -2,-19;
/M: SY='V'; M= -1,-28,-17,-33,-28, 18,-29,-26, 22,-23, 10,  7,-23,-26,-28,-22,-12, -5, 27,-17,  1,-28;
/M: SY='C'; M=-10,-27, 29,-32,-26, 10,-30,-25,  1,-29, 15,  2,-25,-33,-28,-23,-19, -9,  7,-27, -7,-26;
/M: SY='V'; M=  3,-26,-14,-28,-26,  2,-27,-21, 21,-18,  6,  6,-25,-27,-24,-19,-10, -2, 33,-19,  4,-26;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-22,-36,-26, 36,-32,-22, 18,-30, 28, 12,-24,-28,-28,-22,-24,-10, 10, -8, 12,-26;
/M: SY='L'; M= -8,-27,-18,-30,-22,  6,-27,-17, 22,-23, 36, 29,-27,-27,-17,-17,-24, -8, 16,-22, -2,-19;
/M: SY='S'; M=  8, -2,-13, -2, -3,-22, 11,-12,-23,-12,-30,-20,  8,-12, -3,-12, 34, 14,-13,-37,-22, -3;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='E'; M=-11, -8,-25, -6,  8, -2,-27,-14,  0,-11, -1, -4,-11,-15, -8,-14,-10, -9, -1,-22, -6,  0;
/M: SY='E'; M=-10,  2,-29,  8, 37,-26,-13, -3,-25,  4,-14,-14, -3, -7, 15,  2, -4,-11,-25,-27,-17, 26;
/M: SY='N'; M= -6,  8,-24,  4,  5,-22,  9, -7,-20, -6,-21,-15, 15,-17, -5, -8,  2, -8,-17,-31,-21,  0;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-21,-13,-18,-15,  9, -7, -8,-16,-11, -5, -1,-23,-16,-15, -4, -9, -2,-27,-15,-18;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-30,-35,-28, -5,-22,-28, 36,-28, 12, 14,-17,-20,-20,-28,-17,-12, 20,-20, -5,-28;
/M: SY='Y'; M=-15,-19,  9,-24,-19,  9,-30, -6, -5,-17, -5, -3,-17,-28, -9,-16,-14,-10, -7, -7, 22,-16;
/M: SY='G'; M=  3,-12, -4,-14,-21,-27, 48,-22,-36,-21,-27,-19, -4,-22,-21,-22, -1,-17,-24,-25,-29,-21;
/M: SY='Y'; M= -7,-14,-19,-17,-15, -1,-26,-11,  1, -2, -5, -1,-13,-20,-12, -6, -4,  9,  7,-13, 13,-15;
/M: SY='D'; M=-11, 22,-24, 28,  5,-24,-14, -7,-20, -4,-12,-15,  8,-15, -5, -9, -3, -3,-15,-33,-15,  0;
/M: SY='G'; M= -4, -5,-27, -4,-11,-17, 15,  6,-23,-16,-11, -9, -3,-20,-11,-15, -7,-15,-19,-20, -5,-12;
/I:         MD=-18;
/M: SY='K'; M= -3, -3,-18, -2, -3,-18,  1,-11,-15,  6,-17, -9,  0,-11, -3,  0,  2, -4, -8,-20,-12, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='I'; M= -7,-19,-22,-18,-14, -9,-23, -2,  7,-17,  1,  3,-15,  0,-12,-16,-10, -7,  5,-25, -6,-15; D=-4;
/I:         DM=-18;
/M: SY='L'; M= -7,-22,-21,-25,-16, -4,-29,-19, 18,-20, 20, 12,-20,-23, -8,-16,-15, -2, 12,-23, -4,-13;
/M: SY='P'; M=-10,  2,-30,  7, 11,-28,-17, -6,-20,  1,-19,-13, -2, 16,  9, -5, -4, -8,-24,-29,-18,  9;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-23,-25,-17, -1,-30,-15, 18,-19, 18, 12,-20,-24, -7,-16,-16, -5, 11,-17,  5,-13;
/M: SY='H'; M=-15, 12,-29, 14, 11,-31,-17, 28,-29, 12,-25, -9, 11,-13, 18,  8, -5,-12,-27,-28, -4, 13;
/M: SY='E'; M= -1,  7,-20,  9, 15,-23,-14,-10,-23,  4,-21,-16,  3, -8,  3, -3, 11, 12,-15,-31,-16,  9;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-34,-25,  3,-33,-22, 34,-26, 28, 25,-24,-24,-18,-23,-22, -9, 23,-21, -1,-24;
/M: SY='F'; M= -8,-14,-16,-21,-17, 27,-22,-14, -7,-18, -4, -7, -8,-20,-20,-14,  3, 15, -3, -9, 14,-17;
/M: SY='Q'; M= -2,  4,-23,  2,  1,-25, -4, -1,-17, -1,-17, -2,  6,-14, 12, -1,  2, -6,-18,-26,-15,  6;
/M: SY='L'; M=-14,-12,-24,-12,-13,  3,-25,  1,  5,-19, 16, 13,-14,-23,-12,-15,-19,-11, -1,-19,  6,-13;
/M: SY='F'; M=-17,-31,-25,-37,-27, 49,-28,-20,  2,-27, 13,  6,-25,-29,-30,-19,-25,-13, -2, 24, 22,-25;
/M: SY='N'; M=-14, 14,-25,  9,  0,-19,-13,  0,-20,  7,-15,-11, 20,-19,  0, 16, -4, -6,-20,-30,-13, -1;
/M: SY='G'; M=  2,  0,-21, -8,-13,-17, 16,-13,-18,-14,-12,-11,  8,-19,-13,-14,  2, -1,-16,-26,-19,-13;
/M: SY='D'; M=  3, 11,-21, 16,  3,-25, -9, -9,-23,  0,-17,-16,  3,-13, -2, -2,  5, -3,-14,-30,-17,  0;
/M: SY='N'; M=-13,  8,-26, -2, -5,-14,-16, -1,-10,  8,-18, -8, 20,-19, -1, 11, -4, -6,-15,-24, -4, -5;
/M: SY='C'; M= -5,-20, 82,-30,-28, -4,-26,-27,-23,-28,-14,-16,-19,-35,-29,-27, -9, -9, -7,-37,-19,-28;
/M: SY='P'; M=-14,-14,-33,-10, -1,-22,-21, -2,-21,  7,-18,-10,-10, 24, -1, 14,-12,-11,-22,-25,-14, -5;
/M: SY='S'; M=  1, -1,-16, -2, -1,-19, -8,  8,-22, -5,-25,-14,  8,-13,  2,  1, 24, 14,-13,-35,-11, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-25,-22,-25,-15,  4,-28,-18, 12,-17, 37, 15,-25,-27,-15,-12,-27,-10,  5,-20, -2,-15;
/M: SY='T'; M=  0, -9,-20,-13, -5,-16,-21,-15, -6,  4, -6, -2, -8,-15,  0, -2, -2,  7, -2,-23,-10, -3;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-29, 21,  7,-30,  8, -5,-31, -5,-29,-23, 17,  2, -4,-10,  1,-10,-30,-33,-24,  1;
/M: SY='K'; M=-12,  8,-30, 11, 12,-32,-18, -8,-32, 42,-30,-13,  3,-10,  8, 24, -8,-10,-22,-23,-12, 10;
/M: SY='P'; M=-10,-22,-37,-13, -3,-24,-22,-20,-14,-13,-17,-14,-22, 71,-12,-20,-13,-10,-24,-28,-25,-12;
/M: SY='K'; M=-10,  6,-28,  3,  8,-28,-17, -7,-28, 42,-30,-12, 10,-12,  8, 25, -7, -8,-22,-23,-12,  8;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-19,-31,-24,  5,-30,-22, 27,-25, 32, 23,-27,-27,-20,-20,-22, -7, 23,-23, -3,-23;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-21,-37,-28, 39,-33,-24, 19,-29, 19,  9,-23,-27,-31,-23,-20, -9, 15, -7, 13,-28;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-25,-38,-28, 30,-35,-25, 27,-30, 21, 13,-22,-25,-27,-25,-22,-10, 16, -9, 11,-28;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-36,-28,  2,-36,-28, 41,-28, 23, 18,-24,-24,-22,-26,-19, -8, 31,-22, -2,-28;
/M: SY='Q'; M=-12,  8,-30, 11, 20,-40,-18,  8,-23,  8,-22, -5,  3,-10, 50,  7,  0,-10,-30,-23,-12, 35;
/M: SY='A'; M= 42,-13,-10,-22,-13,-17, -5,-22, -4,-12, -7, -7,-13,-13,-13,-20,  7,  0,  8,-22,-18,-13;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-30, -8,-15,-30, 56,-18,-38, -9,-30,-18,  0,-18,-15,-12, -2,-18,-28,-20,-27,-15;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-21,  8, 10, -8,-14, -9,-20, -6,-15,-15,  5,-12, -5, -9,  3,  6,-16,-25,-10,  3;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-25,  2, 19,-23,-19, -5,-18, 11,-17,-11,  0,-12, 10,  9, -2, -6,-13,-27,-15, 14;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 68 in 68 different sequences
Number of true positive hits 68 in 68 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
68 sequences

CAS1A_XENLA (P55865), CAS1B_XENLA (P55867), CASP1_CANFA (Q9MZV7), 
CASP1_DROME (O02002), CASP1_FELCA (Q9MZV6), CASP1_HORSE (Q9TV13), 
CASP1_HUMAN (P29466), CASP1_MOUSE (P29452), CASP1_PIG   (Q9N2I1), 
CASP1_RAT   (P43527), CASP1_SPOFR (P89116), CASP2_CHICK (Q98943), 
CASP2_HUMAN (P42575), CASP2_MOUSE (P29594), CASP2_RAT   (P55215), 
CASP3_BOVIN (Q08DY9), CASP3_CANFA (Q8MKI5), CASP3_FELCA (Q8MJU1), 
CASP3_HUMAN (P42574), CASP3_MACFA (Q2PFV2), CASP3_MESAU (Q60431), 
CASP3_MOUSE (P70677), CASP3_PANTR (Q5IS54), CASP3_PIG   (Q95ND5), 
CASP3_RABIT (Q8MJC3), CASP3_RAT   (P55213), CASP3_SAIBB (Q5IS99), 
CASP3_XENLA (P55866), CASP4_BOVIN (Q5E9C1), CASP4_HUMAN (P49662), 
CASP4_MOUSE (P70343), CASP5_HUMAN (P51878), CASP6_BOVIN (Q3T0P5), 
CASP6_HUMAN (P55212), CASP6_MOUSE (O08738), CASP6_RAT   (O35397), 
CASP7_HUMAN (P55210), CASP7_MESAU (P55214), CASP7_MOUSE (P97864), 
CASP8_DROME (Q8IRY7), CASP8_DROPS (Q29IM7), CASP8_HUMAN (Q14790), 
CASP8_MOUSE (O89110), CASP9_HUMAN (P55211), CASP9_MOUSE (Q8C3Q9), 
CASPA_HUMAN (Q92851), CASPC_CANFA (Q075B4), CASPC_HUMAN (Q6UXS9), 
CASPC_MACMU (Q153Z0), CASPC_MOUSE (O08736), CASPC_RAT   (Q920D5), 
CASPD_BOVIN (O75601), CASPE_HUMAN (P31944), CASPE_MOUSE (O89094), 
CASPG_HUMAN (P0CB46), CASPG_MOUSE (Q6IE25), CASP_SFAVA  (Q5K5C1), 
CED3_CAEEL  (P42573), CED3_CAERE  (P45436), CFLAR_HUMAN (O15519), 
CFLAR_MOUSE (O35732), CFLAR_PONAB (Q5RD56), CSPL_HVAVE  (A4KXL9), 
CSPL_TNAVC  (Q06VK9), ICENC_DROME (Q9XYF4), ICE_DROME   (O01382), 
MALT1_HUMAN (Q9UDY8), MALT1_MOUSE (Q2TBA3)
» More

PDB
[Detailed view]
187 PDB

1BMQ; 1CP3; 1F1J; 1F9E; 1GFW; 1GQF; 1I3O; 1I4E; 1I4O; 1I51; 1IBC; 1ICE; 1JXQ; 1K86; 1K88; 1KMC; 1M72; 1NME; 1NMQ; 1NMS; 1NW9; 1PAU; 1PYO; 1QDU; 1QTN; 1QX3; 1RE1; 1RHJ; 1RHK; 1RHM; 1RHQ; 1RHR; 1RHU; 1RWK; 1RWM; 1RWN; 1RWO; 1RWP; 1RWV; 1RWW; 1RWX; 1SC1; 1SC3; 1SC4; 1SHJ; 1SHL; 2AR9; 2C1E; 2C2K; 2C2M; 2C2O; 2C2Z; 2CDR; 2CJX; 2CJY; 2CNK; 2CNL; 2CNN; 2CNO; 2DKO; 2FP3; 2FQQ; 2FUN; 2H48; 2H4W; 2H4Y; 2H51; 2H54; 2H5I; 2H5J; 2H65; 2HBQ; 2HBR; 2HBY; 2HBZ; 2J30; 2J31; 2J32; 2J33; 2K7Z; 2NN3; 2P2C; 2QL5; 2QL7; 2QL9; 2QLB; 2QLF; 2QLJ; 2WDP; 2XYG; 2XYH; 2XYP; 2XZD; 2XZT; 2Y0B; 2Y1L; 3D6F; 3D6H; 3D6M; 3DEH; 3DEI; 3DEJ; 3DEK; 3E4C; 3EDQ; 3EDR; 3GJQ; 3GJR; 3GJS; 3GJT; 3H0E; 3H11; 3H13; 3H1P; 3IBC; 3IBF; 3ITN; 3K7E; 3KJF; 3KJN; 3KJQ; 3NKF; 3NR2; 3NS7; 3OD5; 3P45; 3P4U; 3PCX; 3PD0; 3PD1; 3QNW; 3R5J; 3R5K; 3R6G; 3R6L; 3R7B; 3R7N; 3R7S; 3RJM; 3S70; 3S8E; 3SIP; 3SIR; 3UO8; 3UOA; 3V3K; 3V4L; 3V4O; 3V55; 3V6L; 3V6M; 4DCJ; 4DCO; 4DCP; 4EHA; 4EHD; 4EHF; 4EHH; 4EHK; 4EHL; 4EHN; 4EJF; 4FDL; 4FEA; 4FXO; 4HQ0; 4HQR; 4HVA; 4I1R; 4IYR; 4JB8; 4JJ7; 4JJ8; 4JJE; 4JQY; 4JQZ; 4JR0; 4JR1; 4JR2; 4M9R; 4N5D; 4N6G; 4N7J; 4N7M; 4NBK; 4NBL; 4NBN
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission