Entry: PS50213

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] FAS1
Accession [info] PS50213
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50213
Associated ProRule [info] PRU00082

Name and characterization of the entry

Description [info] FAS1/BIgH3 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=130;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=125;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1190171; R2=0.0229535; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5341.52610; R2=23.58635; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=265; N_SCORE=8.2000; H_SCORE=10365; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=191; N_SCORE=6.5000; H_SCORE=9847; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -5, -8,-22, -8, -5,-13,-13, -7,-13, -7,-13, -8, -5,  0, -6, -8, -2, -3,-13,-22, -6, -7;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-23, -3, -1,-21, -6,-10,-16, -3,-17,-10,  1, -7, -1, -6,  2, -1,-13,-27,-15, -2;
/M: SY='N'; M= -7, 15,-21, 10,  1,-20, -9, -1,-20, -1,-22,-15, 19,-11, -1, -1,  9,  5,-18,-33,-15, -1;
/M: SY='I'; M= -3,-22,-18,-27,-22,  0,-27,-22, 21,-22, 16, 10,-18,-23,-19,-20,-13, -4, 19,-24, -6,-22;
/M: SY='L'; M= -7,-15,-21,-17,-10, -1,-23,-15,  4,-15,  7,  4,-15,-20,-12,-15,-11, -1,  4,-16, -3,-11;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-24,  8, 11,-22,-14, -5,-18,  1,-14,-10,  2,-11,  6, -3,  0, -2,-16,-27,-13,  8;
/M: SY='V'; M= -1,-15,-20,-18,-11, -4,-23,-19,  6,-11,  4,  2,-13,-18,-12,-11, -7,  0,  7,-22, -6,-12;
/M: SY='L'; M= -4,-25,-20,-28,-19,  5,-27,-20, 18,-24, 30, 15,-23,-24,-17,-19,-20, -7, 11,-20, -2,-18;
/M: SY='A'; M=  4, -5,-21, -5,  4,-18,-11, -9,-13, -1,-11, -8, -4,-13,  1, -3,  1, -4, -9,-24,-12,  2;
/M: SY='E'; M=  0,  3,-22,  4,  9,-22,-10, -8,-19,  0,-17,-13,  3, -9,  3, -3,  5, -1,-15,-29,-16,  5;
/M: SY='N'; M= -6,  9,-20,  7,  1,-17,-10, -2,-17, -3,-16,-11, 10,-16, -2, -5,  1, -3,-15,-28,-10, -1;
/M: SY='P'; M= -4, -3,-26, -3, -2,-21, -5,-10,-17, -5,-19,-12,  0,  2, -4, -7,  1, -5,-16,-28,-17, -4;
/M: SY='D'; M= -7,  7,-25,  9,  8,-26, -3,  0,-26,  1,-23,-15,  7, -8,  3,  1,  1, -7,-23,-28,-15,  4;
/M: SY='F'; M= -8,-24, -9,-30,-23, 31,-26,-17,  3,-24, 12,  3,-19,-27,-26,-19,-15, -4,  3, -8, 13,-23;
/M: SY='S'; M=  2,  0,-14, -3, -2,-18, -7, -9,-17, -6,-20,-13,  5,-12, -1, -6, 19, 14,-11,-32,-15, -2;
/M: SY='T'; M= -3, -7,-20,-13, -9,-11,-16,-15, -3, -8, -7, -1, -5,-14, -5, -9,  1,  8, -2,-24, -9, -7;
/M: SY='F'; M=-11,-25,-20,-32,-23, 37,-26,-18,  7,-25, 15,  7,-19,-26,-25,-18,-16, -6,  4, -6, 13,-22;
/M: SY='R'; M= -4,-13,-21,-16,-10, -6,-19, -8, -5, -4, -3, -1, -8,-20, -6,  5, -4, -2, -2,-19, -1,-10;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-24,  8,  9,-23,-11, -2,-23,  4,-19,-12,  4,-13,  6,  5,  2, -2,-19,-27,-12,  7;
/M: SY='L'; M= -1,-21,-22,-25,-17,  2,-23,-15,  8,-17, 15,  8,-20,-23,-13,-13,-16, -8,  4, -8,  3,-15;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L'; M= -5,-25,-19,-27,-21,  6,-26,-20, 19,-23, 24, 14,-23,-25,-18,-18,-18, -7, 16,-19, -1,-20; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='E'; M= -6,  3,-22,  1,  9,-21,-16, -5,-15,  7,-15, -8,  4,-11,  8,  6,  1, -1,-14,-25,-12,  8; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='S'; M=  1, -1,-20, -3,  0,-17, -7, -5,-18,  0,-18,-10,  1,-13,  3, -2,  5,  0,-13,-23,-11,  2; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='A'; M= 10, -4,-14, -9, -7,-15, -9,-12,-10, -9,-10, -8, -2,-12, -6,-11,  7,  7, -5,-25,-12, -7; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='G'; M= -8,  7,-26,  8,  2,-23, 10, -5,-27, -4,-21,-14,  8,-15, -2, -6, -1,-10,-23,-26,-17,  0; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-19,-27,-18,  9,-28,-16, 14,-23, 27, 12,-23,-25,-18,-18,-21, -7,  9,-18,  3,-18;
/M: SY='A'; M=  3,-11,-19,-15,-11, -7,-16,-16, -2,-11, -2, -4, -9,-16,-11,-10, -3,  0,  1,-21, -8,-11;
/M: SY='D'; M= -3,  7,-24, 10,  7,-26,-11, -4,-21,  0,-20,-14,  5, -4,  5, -4,  4, -2,-19,-30,-16,  6;
/M: SY='T'; M= -3, -9,-21,-12, -5,-11,-21, -8, -2,-10, -3,  1, -9,-14, -1,-11, -4,  2, -2,-20, -4, -4;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-22,-29,-21, 10,-30,-20, 20,-25, 28, 13,-22,-24,-19,-20,-21, -8, 12,-17,  2,-21;
/M: SY='N'; M= -6, 13,-23, 10,  6,-23, -6, -2,-23,  0,-23,-16, 16,-12,  4, -1,  7,  1,-22,-29,-15,  5;
/M: SY='D'; M= -2,  8,-24, 10,  5,-27,  3, -7,-25, -1,-23,-16,  8,-11,  1, -4,  4, -6,-20,-29,-19,  2;
/I:         I=-4; MD=-19;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-20, -1, -1,-15, -9, -8,-15, -7,-13,-11,  1, -7, -4, -8,  3,  1,-13,-24,-11, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G'; M= -5,  0,-25,  0,  1,-24,  9, -8,-26,  2,-22,-13,  3,-14,  2,  1,  1, -6,-21,-23,-16,  1; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='P'; M= -4, -2,-25, -2, -1,-22, -5, -8,-19, -5,-22,-14,  2,  7, -3, -6,  3, -3,-18,-28,-18, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-19;
/M: SY='Y'; M=-12,-24,-21,-27,-22, 18,-28, -8, 11,-19, 11,  7,-21,-27,-19,-16,-18, -8,  8, -4, 22,-21;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20, -9,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 48,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-20,-34,-27, 10,-32,-25, 29,-26, 22, 15,-25,-26,-24,-22,-19, -7, 26,-19,  0,-26;
/M: SY='F'; M=-16,-29,-15,-36,-26, 50,-30,-20,  6,-29, 21,  6,-23,-30,-32,-20,-22, -9,  4, -3, 17,-26;
/M: SY='V'; M= 18,-21,-11,-26,-21, -7,-17,-24, 11,-17,  3,  3,-21,-21,-20,-20, -4, -2, 21,-21,-12,-20;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-38,-11, -1,-28,-21,-20,-17,-11,-26,-18,-20, 81,-10,-20,-11,-10,-26,-30,-28,-10;
/M: SY='T'; M= -1,  1,-14, -5, -5,-15,-14,-12,-13, -6,-16,-12,  5,-11, -5, -6, 14, 21, -6,-30,-13, -6;
/M: SY='B'; M=-11, 35,-23, 34,  8,-27, -7,  2,-25, -1,-26,-21, 32,-15,  0, -6,  5, -3,-24,-38,-19,  4;
/M: SY='E'; M= -1,  7,-23,  9, 17,-24,-10, -6,-25,  6,-22,-17,  5, -9,  6,  3,  7, -2,-19,-29,-17, 11;
/M: SY='A'; M= 34, -7,-13,-15, -9,-20,  1,-17,-12,-10,-12,-11, -6,-11, -9,-16, 10,  1, -4,-23,-19, -9;
/M: SY='F'; M=-14,-26,-20,-33,-25, 41,-27,-20,  4,-25,  9,  3,-20,-27,-29,-19,-18, -9,  3,  7, 15,-24;
/M: SY='E'; M=  1,  4,-23,  5,  9,-25,-11, -5,-19,  2,-20,-12,  4, -6,  7, -3,  5, -3,-17,-29,-16,  7;
/M: SY='K'; M= -2,  3,-23,  2,  3,-21,-12, -8,-20,  8,-19,-12,  5,-11,  2,  4,  3, -2,-16,-27,-14,  2;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-19,-19,-14, -1,-21,-14,  5,-18, 12,  5,-15,-21,-11,-14,-12, -4,  1,-16, -1,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='P'; M= -5, -4,-25, -4, -2,-18, -9,-12,-18, -3,-20,-13, -1,  7, -6, -5,  2,  0,-16,-26,-15, -5;
/M: SY='P'; M= -2, -3,-25, -3,  0,-21,-10,-11,-16, -5,-17,-11, -2,  1,  0, -7,  1, -2,-15,-23,-16, -1;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='E'; M= -4,  4,-24,  4,  6,-24, -4, -5,-21,  0,-20,-14,  4, -6,  2, -2,  2, -4,-19,-27,-16,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='T'; M= -4, -4,-18, -6, -2, -9,-15, -8,-10, -4, -8, -7, -2,-10, -4, -4,  1,  5, -8,-22, -6, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='L'; M= -7,-11,-20,-11, -5, -7,-18,-10, -2, -5,  3,  1, -9,-12, -6, -3,-10, -5, -3,-17, -6, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='B'; M=  0,  3,-17,  3,  2,-16, -9, -8,-12, -4,-11, -9,  3,-10, -2, -5,  3, -1,-10,-23,-12,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='R'; M= -2,  0,-18,  0,  2,-13,-10, -7,-15,  3,-13, -9, -1,-11,  0,  4,  0, -2,-11,-15, -7,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='L'; M= -6,-11,-15,-12, -7,  1,-16, -8,  3,-11, 13,  5,-10,-16, -8, -8,-12, -5,  0,-11, -1, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M:         M= -6, -7,-15, -9, -4, -4,-14, -7, -3, -2,  0,  0, -5, -8, -3, -1, -6, -3, -4,-14, -3, -4; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='N'; M= -2,  1,-15,  0,  0,-14, -5, -3,-12,  0,-12, -7,  3, -3,  1, -1,  1, -1,-11,-17, -9,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-10;
/M: SY='D'; M= -4, 11,-14, 13,  7,-16, -3,  0,-15,  0,-14,-11,  8, -5,  2, -3,  2, -3,-14,-19,-10,  4; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-10; IM=0; DM=-10;
/M: SY='R'; M= -2, -4,-17, -4,  2,-14,-11, -6,-12,  4,-11, -7, -3,  1,  3,  5, -2, -3,-11,-13, -8,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -1,  3,-16,  3,  4,-16, -7, -6,-13,  0,-13, -9,  2, -6,  1, -1,  3,  0,-10,-19,-10,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M=  0, -1,-16, -2,  1,-16,-11, -6,-13,  0,-10, -7, -1,-11,  1, -2, -1, -4,-10,-21,-10,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='L'; M= -7,-19,-19,-20,-14,  1,-21,-14,  8,-15, 18,  9,-17,-18,-12,-11,-15, -6,  4,-17, -1,-13; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='K'; M= -3, -5,-23, -6,  4,-20,-14, -8,-16,  7,-15, -7, -2,-10,  6,  7, -1, -3,-12,-24,-13,  4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-10;
/M: SY='E'; M= -3,  7,-23,  6,  9,-23,-12, -5,-22,  7,-20,-13,  8,-10,  7,  4,  3, -2,-19,-27,-14,  7;
/M: SY='I'; M= -8,-23,-21,-27,-22,  8,-30,-21, 22,-24, 21, 12,-20,-25,-20,-21,-17, -6, 17,-20,  0,-22;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-18,-30,-23,  8,-30,-21, 21,-25, 30, 16,-26,-28,-20,-20,-21, -7, 17,-19,  0,-22;
/M: SY='R'; M= -8, -4,-25, -5,  3,-17,-18, -5,-17,  9, -9, -5, -2,-14,  3, 13, -6, -4,-14,-24, -9,  2;
/M: SY='Y'; M=-10,-10,-24,-14,-12,  7,-16,  6, -9, -9, -5, -4, -5,-23, -7, -5, -9, -6,-12, -4, 23,-11;
/M: SY='H'; M=-20, -1,-30, -1, -1,-18,-20, 90,-29,-10,-19, -1,  7,-20,  8,  0,-11,-20,-29,-23, 20, -1;
/M: SY='V'; M= -3,-27,-19,-32,-27,  3,-29,-26, 29,-23, 15, 15,-23,-25,-23,-22,-14, -5, 30,-23, -4,-26;
/M: SY='I'; M= -4,-26,-19,-30,-25,  2,-30,-23, 26,-23, 17, 12,-22,-24,-21,-21,-14, -1, 26,-22, -2,-25;
/M: SY='P'; M= -5, -7,-27, -6, -1,-20,-13,-10,-15, -5,-15,-11, -5, 13, -4, -8, -3, -5,-16,-27,-16, -4;
/M: SY='G'; M= -3,  5,-21,  5,  1,-25,  9, -7,-25, -7,-22,-16,  6,-14, -3, -9,  4, -5,-20,-28,-18, -1;
/M: SY='Y'; M= -7, -7,-23, -9, -4, -8,-19, -5,-10, -3, -7, -4, -5,-19,  0,  1, -5, -3, -9,-16,  2, -3;
/M: SY='Y'; M= -9,-17,-23,-19,-12,  1,-25, -8,  3,-11,  5,  3,-16,-21, -9, -8,-14, -7,  2,-12,  6,-11;
/M:         M= -5,-10,-11,-11,-10, -8,-19,-12, -4,-15, -1, -4, -9,-17,-11,-14, -4, -1, -3,-23, -5,-11;
/M:         M= -3,-11,-17,-13, -6, -5,-18,-10, -6,-11, -2, -2, -9,-15, -7,-11, -2,  0, -5,-20, -4, -7;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-18, -1,  3,-19, -9, -8,-19,  0,-17,-12,  2,-12,  0, -3,  4, -1,-15,-24,-13,  1;
/M: SY='D'; M= -6, 12,-23, 15,  8,-25, -9, -3,-22, -1,-20,-14,  8,-10,  4, -5,  5,  0,-18,-31,-14,  5;
/M: SY='L'; M= -8,-16,-22,-17,-14,  1,-24,-17,  8,-19, 17,  6,-16,-22,-15,-16,-15, -5,  4,-19, -2,-15;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M:         M= -6,-10,-22,-11, -6, -9,-18,-10, -5, -4, -4, -1, -8,-15, -4, -2, -5, -4, -3,-22, -6, -6; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='N'; M= -1,  1,-14, -1, -2,-15,  0, -8,-15, -7,-13,-10,  3,-13, -4, -8,  1, -4,-12,-22,-12, -3; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='S'; M= -3, -6,-21, -8, -4,-17, -3, -9,-12, -5,-13, -6, -1,-10, -4, -4,  2, -1, -9,-25,-14, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='S'; M= -3, -6,-23, -9, -3,-20, -5,-11,-15, -1,-14, -7, -2,-10,  1,  0,  2,  1,-12,-25,-14, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='T'; M= -2, -8,-20,-10, -5,-15,-15,-10, -9, -4,-10, -6, -4,-13, -2, -2,  3,  5, -5,-25,-10, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='I'; M= -5,-22,-21,-26,-19,  6,-24,-16, 10,-19, 10,  6,-19,-21,-17,-15,-13, -5,  9,-13,  3,-19;
/M: SY='E'; M= -2, -1,-22, -2,  6,-20,-15, -9,-18,  1,-16,-12, -1, -5,  2, -1,  4,  6,-14,-25,-13,  3;
/M: SY='T'; M=  0,  2,-15, -3, -2,-14,-13,-12,-13, -7,-13, -9,  4,-11, -5, -7, 14, 21, -7,-30,-12, -4;
/M: SY='L'; M= -7,-17,-22,-18,-12, -4,-20,-14,  5,-14, 17, 10,-16,-22,-10,-11,-16, -7,  2,-22, -5,-12;
/M: SY='Q'; M= -2, -1,-23, -2,  2,-18,-10, -5,-15, -6,-12, -9,  1, -7,  4, -8,  1, -4,-16,-25,-12,  2;
/M: SY='G'; M= -3, -3,-28, -3,-10,-28, 37,-12,-32, -9,-27,-17,  4,-15,-11,-11,  0,-14,-26,-24,-23,-11;
/M: SY='N'; M= -3,  2,-23,  1,  0,-19, -3, -6,-18, -4,-17,-11,  5,-11, -1, -6,  3, -2,-16,-26,-13, -1;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-23,  0,  4,-20,-16, -7,-19,  5,-19,-12,  0, -4,  2,  1,  3,  3,-14,-26,-11,  3;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-23,-29,-22,  6,-29,-19, 21,-23, 22, 12,-22,-23,-19,-18,-20, -8, 15,-18,  2,-22;
/M: SY='T'; M= -6, -5,-21, -7, -3,-12,-15, -9,-12, -4,-11, -8, -2,-14, -4,  1,  1,  2, -8,-22, -9, -4;
/M: SY='I'; M= -8,-27,-17,-32,-25, 10,-31,-24, 23,-25, 18, 12,-24,-26,-23,-22,-18, -6, 20,-14,  2,-25;
/M: SY='N'; M= -5,  1,-20, -5, -5, -9,-12, -8,-14, -2,-15,-10,  7,-16, -5,  0,  5,  7,-11,-25, -8, -6;
/M: SY='V'; M= -7,-13,-14,-17,-13, -5,-21,-14, -2, -5, -5, -1, -8,-22,-11,  0, -8, -5,  4,-24, -8,-12;
/I:         I=-3; MD=-16;
/M: SY='B'; M= -7,  4,-23,  4,  3,-16,-10, -3,-18, -1,-17,-12,  4,-13,  1, -3,  2,  0,-15,-22, -4,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-16;
/M: SY='N'; M= -4, -1,-23, -2,  1,-22,  0, -4,-22, -2,-20,-13,  4, -8,  0, -1,  4, -2,-18,-27,-15, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='K'; M= -5, -2,-19, -2,  2,-14,-15, -4,-11,  3,-11, -6, -2, -9,  3,  1, -1,  0, -9,-18, -4,  2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M: SY='I'; M= -6,-23,-18,-26,-23,  1,-29,-21, 22,-21, 12, 10,-21,-19,-20,-19,-15, -5, 21,-21, -2,-23; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M: SY='T'; M= -3,-11,-16,-17,-12,  4,-18,-13, -7, -9, -6, -5, -7,-19,-12, -9, -1,  6, -4,-14,  3,-12; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-18,-30,-25,  6,-29,-25, 24,-22, 15, 10,-24,-25,-24,-20,-13, -3, 27,-20, -2,-25; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M: SY='N'; M= -5, 13,-23,  8,  2,-22,  5, -4,-23, -4,-23,-16, 21,-14, -1, -6,  6, -3,-23,-29,-18,  0; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M:         M= -4, -2,-15, -4,  0,-17,-11, -8,-16, -1,-14, -8,  0,-16, -3, -3, -3, -6,-12,-25,-13, -2;
/M: SY='A'; M= 14,-12,-15,-16,-10,-12,-14,-16, -4,-11, -8, -6,-10,-13, -9,-14,  4,  2,  3,-22,-12,-10;
/M: SY='R'; M= -7, -8,-22, -9, -3,-17,-18, -8, -9, -1,-10, -4, -5, -7, -3,  1, -4, -3, -7,-27,-12, -5;
/M: SY='I'; M= -6,-19,-19,-23,-20, -2,-29,-21, 20,-20,  9,  7,-15,-23,-18,-19,-11, -3, 20,-25, -5,-21;
/M: SY='V'; M= -3,-12,-19,-15,-10, -7,-19,-16,  4,-12, -1,  0,-10,-17,-12,-13, -3,  5,  7,-25, -7,-12;
/M: SY='K'; M= -6, -3,-22, -2,  1,-20,-11, -7,-18,  2,-16, -9, -2,-10,  2,  1, -2, -5,-14,-25,-12,  1;
/M: SY='A'; M=  7, -7,-13,-10, -7,-17,-10,-12,-15, -8,-14,-11, -6, -6, -7,-11,  3,  1,-10,-23,-14, -7;
/M: SY='D'; M=-11, 20,-24, 23,  3,-23,-10, -4,-17, -6,-16,-14, 14,-15, -5, -9, -1, -5,-15,-34,-16, -2;
/M: SY='I'; M=-10,-18,-20,-23,-17, -3,-27,-12, 12,-15,  4,  6,-14,-19,-13,-13,-12, -6,  8,-20,  0,-17;
/M:         M= -2, -5,-22, -7, -2,-16,-17,-10, -7, -5, -9, -3, -4, -3, -4, -8, -2, -1, -7,-27,-13, -4;
/M: SY='A'; M= 12, -9, -8,-14,-11,-10, -6,-17,-13,-12,-11,-10, -7,-15,-11,-14,  4,  2, -5,-23,-13,-10;
/M: SY='T'; M= -4,  3,-18,  0,  0,-18,-11, -8,-18, -3,-20,-14,  6, -7, -3, -6,  8,  9,-14,-30,-14, -2;
/M: SY='N'; M= -8, 17,-23,  7, -1,-21, -4,  3,-20, -1,-26,-16, 29,-10,  2, -1,  5, -3,-24,-31,-16,  0;
/M: SY='G'; M=  2,-12,-26,-13,-17,-24, 40,-19,-25,-18,-20,-13, -4,-19,-16,-18,  1,-13,-17,-22,-24,-17;
/M: SY='V'; M=  1,-21, -8,-25,-21, -5,-25,-23, 15,-17,  3,  4,-19,-24,-20,-17, -5,  2, 24,-27, -9,-21;
/M: SY='I'; M= -3,-28,-16,-33,-27,  2,-31,-26, 30,-24, 17, 16,-25,-25,-23,-23,-15, -6, 30,-23, -5,-26;
/M: SY='H'; M=-18, -6,-27, -7, -5, -7,-22, 63,-20,-11,-12,  0,  1,-22,  5, -4,-12,-16,-22,-16, 24, -4;
/M: SY='V'; M= -3,-20,-20,-23,-18, -4,-14,-19,  9,-17,  3,  5,-16,-20,-14,-17, -8, -3, 11,-21, -6,-17;
/M: SY='I'; M= -7,-29,-23,-35,-27,  2,-33,-27, 36,-27, 21, 17,-23,-24,-22,-25,-18, -7, 29,-22, -3,-27;
/M: SY='D'; M=-13, 35,-26, 46, 16,-34, -7,  0,-33, -1,-28,-25, 19, -9,  2, -8,  6, -5,-27,-38,-19,  9;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-23, -1,  5,-21, -8, -5,-23,  8,-21,-12,  3,-14,  5,  8,  2, -3,-18,-25,-13,  4;
/M: SY='V'; M= -3,-26,-17,-26,-22, -3,-28,-25, 20,-20, 10,  8,-24,-15,-22,-19,-11, -1, 27,-28,-10,-23;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-20,  5,-30,-19, 21,-24, 35, 18,-24,-26,-16,-17,-25,-10, 11,-20,  0,-19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 122 in 59 different sequences
Number of true positive hits 122 in 59 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 4
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 96.83 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria), Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 7
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] FAS1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
59 sequences

096L_IIV6   (O55719), BGH3_HUMAN  (Q15582), BGH3_MOUSE  (P82198), 
BGH3_PIG    (O11780), BGH3_RABIT  (Q95215), FAS1_DROME  (P10674), 
FAS1_SCHAM  (P10675), FLA10_ARATH (Q9LZX4), FLA11_ARATH (Q8LEJ6), 
FLA12_ARATH (Q8LEE9), FLA13_ARATH (Q9FFH6), FLA14_ARATH (Q9LTW9), 
FLA15_ARATH (Q9FT45), FLA16_ARATH (Q8RWC5), FLA17_ARATH (Q66GR0), 
FLA18_ARATH (Q93W32), FLA19_ARATH (Q5Q0H2), FLA1_ARATH  (Q9FM65), 
FLA20_ARATH (Q9FGW0), FLA2_ARATH  (Q9SU13), FLA3_ARATH  (Q9ZQ23), 
FLA4_ARATH  (Q9SNC3), FLA5_ARATH  (O49586), FLA6_ARATH  (Q9SIL7), 
FLA7_ARATH  (Q9SJ81), FLA8_ARATH  (O22126), FLA9_ARATH  (Q9ZWA8), 
FLA_JATCU   (C0HJG5), FSC1_SCHPO  (O94439), HDP_PLAF7   (Q8IL04), 
MP70_MYCBO  (P0A669), MP70_MYCKA  (Q49614), MP70_MYCTO  (P9WNF4), 
MP70_MYCTU  (P9WNF5), MP83_MYCBO  (P0CAX7), MP83_MYCBT  (C1AFY9), 
MP83_MYCTO  (P9WNF2), MP83_MYCTU  (P9WNF3), POSTN_HUMAN (Q15063), 
POSTN_MOUSE (Q62009), STAB1_HUMAN (Q9NY15), STAB1_MOUSE (Q8R4Y4), 
STAB2_HUMAN (Q8WWQ8), STAB2_MOUSE (Q8R4U0), STAB2_RAT   (Q8CFM6), 
Y1483_SYNY3 (P74615), Y1735_SYNY3 (P73392), Y175_SYNP2  (O33752), 
Y4891_SELML (P0DH64), YFAS1_ASHGO (Q755Y4), YFAS1_ASPFU (Q4WC84), 
YFAS1_CANGA (Q6FJ69), YFAS1_DEBHA (Q6BHU6), YFAS1_EMENI (Q5BD53), 
YFAS1_KLULA (Q6CMY2), YFAS1_SCHPO (Q9Y801), YFAS1_YARLI (Q6C7M4), 
YFAS1_YEAST (Q12331), YL001_YEAST (Q07895)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
4 sequences

081L_IIV3   (Q196X9), FLA21_ARATH (Q9FL53), YFAS1_CANAL (Q5AI48), 
YFAS1_NEUCR (Q6MV78)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1NYO; 1O70; 1X3B; 2LTB; 2LTC; 2VXP

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission