To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50244

General information about the entry

Entry name [info] S5A_REDUCTASE
Accession [info] PS50244
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-APR-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-SEP-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50244

Name and characterization of the entry

Description [info] Steroid 5-alpha reductase C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2548000; R2=0.0187626; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4466.8530273; R2=6.4534535; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=467; H_SCORE=7481; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=361; H_SCORE=6797; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-20; E1=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=  9,-12,-25,-14,-18,-24, 45,-20,-28,-19,-18,-14, -5,-19,-18,-20, -1,-15,-20,-20,-25,-18;
/M: SY='F'; M=  3,-22,-17,-28,-20, 13,-21,-19,  9,-21, 12,  7,-18,-22,-20,-19, -9, -4,  9,-17, -1,-19;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-23,-26,-24, -3,  1,-24,  2,-22, -2, -2,-17,-23,-22,-22,-10,-11,  5, -7, -8,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-24,  5,-33,-23, 30,-28, 36, 22,-26,-26,-20,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-23;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-25,-35,-28, 61,-29,-12, -2,-24,  5, -2,-22,-30,-31,-18,-22,-12, -5, 29, 42,-27;
/M: SY='V'; M= -2,-27,  3,-32,-27,  1,-27,-27,  9,-24,  5,  1,-25,-28,-24,-23,-15, -9, 14, -6, -5,-25;
/M: SY='I'; M= -7,-23,-22,-30,-23, -1,-32,-25, 28,-25, 17, 12,-17,-20,-18,-23,-11,  3, 19,-23, -3,-23;
/M: SY='G'; M=  5,-11,  6,-14,-19,-26, 34,-21,-32,-20,-26,-19, -4,-22,-19,-21,  3,-11,-20,-28,-28,-19;
/M: SY='M'; M= -6, -4,-20,-10, -2, -8,-14, -2, -4, -6, -6, 14,  1,-15,  5, -7,  1, -2, -8,-26, -8,  2;
/M: SY='W'; M=-13,-29,-31,-32,-25, 10,-21,-19,  8,-24, 10,  3,-26,-27,-20,-21,-25,-15,  0, 28, 16,-23;
/M: SY='W'; M=-12,-16,-33,-18,-17, -9,-19,-23,  2,-12, -7, -4,-14,-19,-13,-16,-16,-11, -4, 15,  0,-16;
/M: SY='N'; M=-11, 23,-24, 12,  7,-27, -8, 16,-21,  3,-26,-12, 35,-16, 22,  4,  5, -5,-30,-32,-14, 14;
/M: SY='Y'; M=-15,-13,-16,-20,-18, 10,-27, 13,  2,-19, -2,  2, -3,-24,-14,-15,-13,-11, -4,-15, 15,-18;
/M: SY='H'; M= -3, -5,-23, -7, -2,-17,-18, 13,-17,  5,-17, -5, -3,-15,  6,  1, -1, -3,-12,-20,  3,  1;
/M: SY='S'; M=  1, -4,  0, -8, -8,-15,-10,-13,-10,-15,-15,-12,  5,-18, -7,-14, 18,  8, -6,-37,-17, -8;
/M: SY='H'; M=-12, 21,-28, 29,  8,-29,-13, 40,-32, -5,-23,-15, 12,-14,  3, -7, -3,-13,-26,-33, -3,  3;
/M: SY='H'; M=-11, -8,-24,-10,  2, -9,-24,  3, -2, -6, -2,  3, -7,-17, -2, -4, -9, -6, -4,-22,  1, -2;
/M: SY='I'; M= -5,-12,-26,-18,-10,-15,-26,  4,  5, -9, -4,  4, -6,-16,  1,-10, -7, -4,  0,-23, -1, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='R'; M= -4,-11,-19,-14, -7,-11,-15, -7, -8,  8, -7,  0, -6,-15,  0, 25, -6, -6, -3,-16, -8, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='N'; M= -9, 11,-18,  8,  4,-13,-11,  3,-15,  1,-15,-10, 13,-12,  5,  3,  2,  2,-16,-18, -2,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='L'; M= -8,-20,-19,-22,-14,  0,-26,-16, 13,-20, 26, 12,-19,-21, -8,-15,-16, -2,  6,-19, -2,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='R'; M= -8, -7,-24, -8,  1,-20,-15, -4,-24, 25,-18, -9, -1,-15,  6, 44, -6, -8,-15,-18,-10,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-26, -1,  7,-27,-15, -7,-23, 27,-24, -9,  2, -1, 11, 15, -5, -8,-19,-20,-12,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='P'; M=  1, -1,-28,  3,  4,-28, -4, -2,-26, -1,-24,-16, -3, 13, -3, -9, -3,-10,-23,-27,-18, -1;
/M: SY='G'; M= -6,  3,-28, -1,-11,-23, 31, -8,-29,-12,-28,-19, 15, -7,-12,-13,  0,-12,-29,-24,-19,-13;
/M: SY='E'; M=-11,  1,-25,  1,  8,-18,-12,  7,-20, -1,-10, -9,  4,-17,  2,  7, -4, -8,-19,-28,-10,  3;
/M: SY='S'; M=  4, -6,-17,-11,-12,-17,  1,-18,-11, -8,-15, -9, -1,-16,-12,-11,  8,  8, -2,-28,-16,-12;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-25, -9, -6,-22,  6,-14,-19, -1,-15, -8, -3,-16, -1, -4,  0, -4,-15,-23,-15, -4;
/M: SY='Y'; M=-18,-21,-30,-24,-20, 19,-31,  7,  9,-11,  3,  4,-18,-27,-10, -7,-19,-10, -2, 14, 54,-20;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-24, -9, -2,-18,-18,-10,-18, 18,-14, -7, -4,-17,  2, 26, -3, -4, -9,-24,-11, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-29,-25, -1,-32,-24, 34,-24, 15, 13,-14,-23,-20,-23,-15, -7, 25,-25, -5,-25;
/M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-14, -5,-18,-22,-15,-13,-12,-17,-13,-21, 61,-11,-19,-14,-10,-23,-22,-13,-12;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-13, -5,-22,-11, -6,  1,-20, -8,-18,  7,-14, -9,  2,-18, -4, 18, -3,  5,-13,-18, -3, -6;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-28, -8,-11,-29, 42,-16,-34, -8,-27,-16,  0,-17, -7,-10,  1,-12,-26,-21,-24, -9;
/M: SY='G'; M= -8,-14,-31,-15,-18,-12, 34,-10,-32,-15,-23,-15, -5,-22,-17, -8, -8,-19,-25, -2,-12,-17;
/M: SY='L'; M=-13,-30,-11,-32,-24,  7,-29,-21,  8,-27, 21,  6,-29,-30,-20,-22,-28,-14,  0, 13,  8,-22;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-25,  7, 20,-21,-16, -3,-22,  9,-16,-13, 11,-12,  7,  9, -1, -2,-21,-29,-15, 13;
/M: SY='Y'; M=-15,-27,-27,-27,-21, 18,-29, -6,  8,-21, 23,  8,-27,-30,-16,-16,-27,-12, -2, 19, 34,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-34,-30,  8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30;
/M: SY='S'; M=  5, -5,  5, -8, -8,-16,-10,-16,-14,-13,-21,-15,  1,-15, -8,-13, 26, 20, -2,-38,-18, -8;
/M: SY='C'; M=  4,-15, 50,-22,-21,-22, -2,-24,-28,-19,-20,-17,-12,-28,-21,-18, -4,-10,-13,-35,-26,-21;
/M: SY='P'; M=  2,-18,-34,-12, -2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 71,-10,-20, -6, -8,-24,-28,-28,-10;
/M: SY='H'; M=-14, 26,-24, 13,  0,-20, -7, 42,-24, -4,-26,-13, 42,-20,  4,  0,  3, -7,-30,-36, -6,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 12,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22;
/M: SY='F'; M= -7,-23,-17,-29,-20, 25,-26,-20,  6,-25, 23,  6,-20,-25,-23,-18,-15,  2,  4,-13,  6,-20;
/M: SY='G'; M= -9, -9,-28, -9,-18, -1, 29,-14,-27,-19,-18,-15, -4,-22,-21,-18, -6,-16,-21,-11, -6,-19;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-13,-35,-28, -2,-34,-29, 34,-27, 15, 13,-22,-23,-22,-27,-16, -7, 28,-24, -6,-28;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-11,-33,-27, -3,-22,-24, 17,-24,  8, 13,-22,-25,-18,-24,-19,-12, 10, -6, -4,-24;
/M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -5, 14,-18,-22,-12, -1, -7, -9, -6, -6,-11,  4,-11,  2, -3, -3,-29,-13,  7;
/M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26, 17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,108, 48,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-22, -8,-29,-22, -4,-30,-25, 21,-25, 12,  8,-16,-22,-18,-23, -9,  1, 14,-27, -7,-22;
/M: SY='G'; M= -1,-11,-27,-12,-18,-22, 42,-20,-32,-18,-27,-19, -3,-19,-16,-18,  3, -8,-24, -6,-20,-16;
/M: SY='Y'; M=-16,-28,-27,-31,-24, 33,-30, -9,  9,-23, 15,  6,-24,-29,-22,-18,-24,-11,  0, 16, 36,-24;
/M: SY='A'; M= 27,-13,-12,-21,-13, -3, -9,-19, -6,-15, -2, -6,-11,-15,-14,-18,  5,  4,  1,-19,-11,-13;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-31,-22, 10,-31,-23, 20,-27, 28, 13,-26,-14,-22,-22,-23, -9, 11,-19, -1,-23;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='V'; M=  9,-20,-14,-25,-19, -4,-18,-18, 16,-16, 11, 14,-19,-19,-14,-17, -9, -4, 18,-20, -8,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='T'; M= 10,-10,-13,-17,-13, -3, -9,-18, -3,-14, -6, -6, -6,-13,-13,-15,  7, 11,  1,-19, -8,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='W'; M=-17,-24,-38,-24,-13,  2,-22,-12,-16, -9,-16,-11,-22,-11, -1, -6,-22,-18,-24, 52, 17, -6;
/M: SY='N'; M= -6, 14, -8, 12,  7,-24, -9,  8,-26, -6,-27,-19, 18,-15,  1, -7, 14,  1,-21,-39,-16,  3;
/M: SY='W'; M= -4,-26,-24,-28,-19,  4,-23,-20,  4,-19, 11,  3,-25,-25,-13,-17,-19,-11,  3, 13,  3,-15;
/M: SY='P'; M= -8,-16,-30,-13,  0, -7,-22,-10,-11,-10, -9, -8,-16, 21, -4,-13,-11, -9,-17,-16, -3, -4;
/M: SY='A'; M= 16,-19,-17,-25,-21, -4, -2,-23,  1,-19, -4, -3,-15,-19,-21,-21, -3, -6,  9,-19,-12,-21;
/M: SY='Y'; M= -4,-26,-24,-29,-23, 11,-26,-15, 11,-20,  9,  4,-24,-26,-19,-19,-18, -9,  8, 12, 19,-22;
/M: SY='L'; M= 10,-20,-18,-23,-15, -7,-12,-18,  0,-15, 14,  3,-18,-22,-14, -9,-11, -7,  2,-21,-10,-15;
/M: SY='F'; M=-15,-27,-18,-35,-28, 60,-29,-21,  2,-27,  8,  0,-19,-28,-35,-19,-14, -2,  6,  1, 21,-28;
/M: SY='A'; M= 14,-20,-17,-26,-16,  0,-17,-20,  7,-21, 14,  4,-17,-19,-16,-20, -7, -4,  6,-20, -7,-16;
/M: SY='F'; M= -9,-24,-21,-30,-25, 14,-19,-23, 14,-26, 14,  7,-19,-24,-24,-21,-14, -4, 11,-16,  1,-25;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-26,-35,-28, 35,-26,-19,  4,-22,  3,  5,-27,-29,-26,-18,-23,-13,  3, 33, 22,-25;
/M: SY='T'; M= -2,-14,-14,-19,-18,  1,-14,-22,  1,-17, -6, -4, -9,-19,-18,-16,  7, 16, 10,-25, -8,-18;
/M: SY='L'; M= -9,-26, -8,-32,-25, 15,-31,-24, 16,-26, 18,  8,-22,-27,-25,-21,-16, -2, 17,-19,  1,-25;
/M: SY='C'; M=  8,-11, 49,-20,-18,-18,-18,-23,-20,-19,-17,-16,-10,-24,-18,-21,  7,  8, -6,-38,-22,-18;
/M: SY='N'; M= -9,  7,-21, -3, -4, -7,-14, -3, -8, -8,-15, -8, 19,-18,  3, -6,  4,  0,-15,-26, -8, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-18,-21,-25,-19,  2,-24,-11, 19,-20, 28, 28,-15,-25,-11,-16,-21, -9,  7,-22, -2,-16;
/M: SY='T'; M= -1,-12,-20,-16,-13, -6, -3,-13,-10,-13, -8, -6, -9,-19, -8,-13,  0,  3, -5,-17, -2,-11;
/M: SY='P'; M=  6,-16,-24,-20,-13,-15,-16,-21,  1,-15, -6, -3,-14, 12,-12,-20, -3,  2, -2,-24,-16,-15;
/M: SY='R'; M=-15,-19,-30,-21,-12, -1,-21,-13,-13,  0,-13, -8,-11,-22, -4, 18,-12,-10,-13, 14,  3, -9;
/M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-18, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 14,  2, -1,-22,-20, -9;
/M: SY='M'; M= -1,-13,-21,-16, -7, -8,-19,-12, -6,  1, -5,  2, -9,-17, -1,  1, -5, -5, -3,-20, -6, -4;
/I:         E1=0;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_09 which contains 555'594 sequence entries.


Total number of hits 54 in 54 different sequences
Number of true positive hits 54 in 54 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 10
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 84.38 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
54 sequences

CHO2_CANAL  (Q59LV5    ), CHO2_CANAW  (C4YL78    ), CHO2_CANDC  (B9WL59    ), 
CHO2_CLAL4  (C4Y206    ), CHO2_DEBHA  (Q6BY28    ), CHO2_LODEL  (A5DS78    ), 
CHO2_PICST  (A3LQW6    ), DET2_ARATH  (Q38944    ), DET2_GOSHI  (Q2QDF6    ), 
DET2_SOLLC  (Q5K2N1    ), DFG10_YEAST (P40526    ), PLMT_EMENI  (C8VRV0    ), 
POED1_ARATH (Q9CAH5    ), POED1_ORYSI (A2XWN6    ), POED1_ORYSJ (Q7XUH5    ), 
POED2_ARATH (Q9SI62    ), POED2_ORYSI (B8B6G5    ), POED2_ORYSJ (Q7F0Q2    ), 
PORED_AILME (D2HBV9    ), PORED_CAEBR (A8X8R3    ), PORED_CAEEL (Q17428    ), 
PORED_DANRE (Q5RIU9    ), PORED_DROME (Q9VLP9    ), PORED_HUMAN (Q9H8P0    ), 
PORED_MESAU (C7T2J9    ), PORED_MOUSE (Q9WUP4    ), PORED_RAT   (Q5RJM1    ), 
PORED_XENLA (Q8AVI9    ), PORED_XENTR (Q0P4J9    ), S5A1_BOVIN  (A5PJS2    ), 
S5A1_HUMAN  (P18405    ), S5A1_MACFA  (Q28891    ), S5A1_MOUSE  (Q68FF9    ), 
S5A1_RAT    (P24008    ), S5A2_HUMAN  (P31213    ), S5A2_MACFA  (Q28892    ), 
S5A2_MOUSE  (Q99N99    ), S5A2_PIG    (O18765    ), S5A2_RAT    (P31214    ), 
TECRL_BOVIN (Q3SZ89    ), TECRL_HUMAN (Q5HYJ1    ), TECRL_MOUSE (Q8BFZ1    ), 
TECR_ARATH  (Q9M2U2    ), TECR_BOVIN  (Q3ZCD7    ), TECR_CAEEL  (Q9N5Y2    ), 
TECR_DICDI  (Q55C17    ), TECR_HUMAN  (Q9NZ01    ), TECR_MOUSE  (Q9CY27    ), 
TECR_RAT    (Q64232    ), TECR_YEAST  (Q99190    ), YFP9_SCHPO  (O14264    ), 
YFY8_SCHPO  (Q9UT20    ), YJD4_SCHPO  (O74507    ), YN67_SCHPO  (O94511    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
10 sequences

PEMT1_DICDI (Q54SD5    ), PEMT2_DICDI (Q54H80    ), PEMT_BOVIN  (Q7YRH6    ), 
PEMT_HUMAN  (Q9UBM1    ), PEMT_MOUSE  (Q61907    ), PEMT_RAT    (Q08388    ), 
PLMT_ARATH  (Q9SAH5    ), PLMT_NEUCR  (Q7S5W9    ), PLMT_SCHPO  (O74827    ), 
PLMT_YEAST  (P05375    )
» more


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission