Entry: PS50244

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] S5A_REDUCTASE
Accession [info] PS50244
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50244

Name and characterization of the entry

Description [info] Steroid 5-alpha reductase C-terminal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=81;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=76;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=-0.2548; R2=0.01876257; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1052.51220; R2=29.22561; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=466; N_SCORE=8.5; H_SCORE=13123; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=360; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11574; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-20; E1=-20; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=  9,-12,-25,-14,-18,-24, 45,-20,-28,-19,-18,-14, -5,-19,-18,-20, -1,-15,-20,-20,-25,-18;
/M: SY='F'; M=  3,-22,-17,-28,-20, 13,-21,-19,  9,-21, 12,  7,-18,-22,-20,-19, -9, -4,  9,-17, -1,-19;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-23,-26,-24, -3,  1,-24,  2,-22, -2, -2,-17,-23,-22,-22,-10,-11,  5, -7, -8,-23;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-22,-33,-24,  5,-33,-23, 30,-28, 36, 22,-26,-26,-20,-23,-25, -9, 19,-21, -1,-23;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-25,-35,-28, 61,-29,-12, -2,-24,  5, -2,-22,-30,-31,-18,-22,-12, -5, 29, 42,-27;
/M: SY='V'; M= -2,-27,  3,-32,-27,  1,-27,-27,  9,-24,  5,  1,-25,-28,-24,-23,-15, -9, 14, -6, -5,-25;
/M: SY='I'; M= -7,-23,-22,-30,-23, -1,-32,-25, 28,-25, 17, 12,-17,-20,-18,-23,-11,  3, 19,-23, -3,-23;
/M: SY='G'; M=  5,-11,  6,-14,-19,-26, 34,-21,-32,-20,-26,-19, -4,-22,-19,-21,  3,-11,-20,-28,-28,-19;
/M: SY='M'; M= -6, -4,-20,-10, -2, -8,-14, -2, -4, -6, -6, 14,  1,-15,  5, -7,  1, -2, -8,-26, -8,  2;
/M: SY='W'; M=-13,-29,-31,-32,-25, 10,-21,-19,  8,-24, 10,  3,-26,-27,-20,-21,-25,-15,  0, 28, 16,-23;
/M: SY='W'; M=-12,-16,-33,-18,-17, -9,-19,-23,  2,-12, -7, -4,-14,-19,-13,-16,-16,-11, -4, 15,  0,-16;
/M: SY='N'; M=-11, 23,-24, 12,  7,-27, -8, 16,-21,  3,-26,-12, 35,-16, 22,  4,  5, -5,-30,-32,-14, 14;
/M: SY='Y'; M=-15,-13,-16,-20,-18, 10,-27, 13,  2,-19, -2,  2, -3,-24,-14,-15,-13,-11, -4,-15, 15,-18;
/M: SY='H'; M= -3, -5,-23, -7, -2,-17,-18, 13,-17,  5,-17, -5, -3,-15,  6,  1, -1, -3,-12,-20,  3,  1;
/M: SY='S'; M=  1, -4,  0, -8, -8,-15,-10,-13,-10,-15,-15,-12,  5,-18, -7,-14, 18,  8, -6,-37,-17, -8;
/M: SY='H'; M=-12, 21,-28, 29,  8,-29,-13, 40,-32, -5,-23,-15, 12,-14,  3, -7, -3,-13,-26,-33, -3,  3;
/M: SY='H'; M=-11, -8,-24,-10,  2, -9,-24,  3, -2, -6, -2,  3, -7,-17, -2, -4, -9, -6, -4,-22,  1, -2;
/M: SY='I'; M= -5,-12,-26,-18,-10,-15,-26,  4,  5, -9, -4,  4, -6,-16,  1,-10, -7, -4,  0,-23, -1, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 24,-30, 46, 20,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 12,-20,  0,-21;
/I:         I=-5; MD=-24;
/M: SY='R'; M= -4,-11,-19,-14, -7,-11,-15, -7, -8,  8, -7,  0, -6,-15,  0, 25, -6, -6, -3,-16, -8, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-24; IM=0; DM=-24;
/M: SY='N'; M= -9, 11,-18,  8,  4,-13,-11,  3,-15,  1,-15,-10, 13,-12,  5,  3,  2,  2,-16,-18, -2,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='L'; M= -8,-20,-19,-22,-14,  0,-26,-16, 13,-20, 26, 12,-19,-21, -8,-15,-16, -2,  6,-19, -2,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='R'; M= -8, -7,-24, -8,  1,-20,-15, -4,-24, 25,-18, -9, -1,-15,  6, 44, -6, -8,-15,-18,-10,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-26, -1,  7,-27,-15, -7,-23, 27,-24, -9,  2, -1, 11, 15, -5, -8,-19,-20,-12,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-24;
/M: SY='P'; M=  1, -1,-28,  3,  4,-28, -4, -2,-26, -1,-24,-16, -3, 13, -3, -9, -3,-10,-23,-27,-18, -1;
/M: SY='G'; M= -6,  3,-28, -1,-11,-23, 31, -8,-29,-12,-28,-19, 15, -7,-12,-13,  0,-12,-29,-24,-19,-13;
/M: SY='E'; M=-11,  1,-25,  1,  8,-18,-12,  7,-20, -1,-10, -9,  4,-17,  2,  7, -4, -8,-19,-28,-10,  3;
/M: SY='S'; M=  4, -6,-17,-11,-12,-17,  1,-18,-11, -8,-15, -9, -1,-16,-12,-11,  8,  8, -2,-28,-16,-12;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-25, -9, -6,-22,  6,-14,-19, -1,-15, -8, -3,-16, -1, -4,  0, -4,-15,-23,-15, -4;
/M: SY='Y'; M=-18,-21,-30,-24,-20, 19,-31,  7,  9,-11,  3,  4,-18,-27,-10, -7,-19,-10, -2, 14, 54,-20;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-24, -9, -2,-18,-18,-10,-18, 18,-14, -7, -4,-17,  2, 26, -3, -4, -9,-24,-11, -2;
/M: SY='I'; M= -8,-22,-23,-29,-25, -1,-32,-24, 34,-24, 15, 13,-14,-23,-20,-23,-15, -7, 25,-25, -5,-25;
/M: SY='P'; M=-11,-21,-36,-14, -5,-18,-22,-15,-13,-12,-17,-13,-21, 61,-11,-19,-14,-10,-23,-22,-13,-12;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-13, -5,-22,-11, -6,  1,-20, -8,-18,  7,-14, -9,  2,-18, -4, 18, -3,  5,-13,-18, -3, -6;
/M: SY='G'; M= -2, -7,-28, -8,-11,-29, 42,-16,-34, -8,-27,-16,  0,-17, -7,-10,  1,-12,-26,-21,-24, -9;
/M: SY='G'; M= -8,-14,-31,-15,-18,-12, 34,-10,-32,-15,-23,-15, -5,-22,-17, -8, -8,-19,-25, -2,-12,-17;
/M: SY='L'; M=-13,-30,-11,-32,-24,  7,-29,-21,  8,-27, 21,  6,-29,-30,-20,-22,-28,-14,  0, 13,  8,-22;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 74,-30,-15,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 36,-29;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-25,  7, 20,-21,-16, -3,-22,  9,-16,-13, 11,-12,  7,  9, -1, -2,-21,-29,-15, 13;
/M: SY='Y'; M=-15,-27,-27,-27,-21, 18,-29, -6,  8,-21, 23,  8,-27,-30,-16,-16,-27,-12, -2, 19, 34,-20;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-34,-30,  8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30;
/M: SY='S'; M=  5, -5,  5, -8, -8,-16,-10,-16,-14,-13,-21,-15,  1,-15, -8,-13, 26, 20, -2,-38,-18, -8;
/M: SY='C'; M=  4,-15, 50,-22,-21,-22, -2,-24,-28,-19,-20,-17,-12,-28,-21,-18, -4,-10,-13,-35,-26,-21;
/M: SY='P'; M=  2,-18,-34,-12, -2,-28,-16,-20,-18,-10,-26,-18,-18, 71,-10,-20, -6, -8,-24,-28,-28,-10;
/M: SY='H'; M=-14, 26,-24, 13,  0,-20, -7, 42,-24, -4,-26,-13, 42,-20,  4,  0,  3, -7,-30,-36, -6,  0;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 41,-30, 12,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-16,-12,-20,-10, -8, 26, 69,-22;
/M: SY='F'; M= -7,-23,-17,-29,-20, 25,-26,-20,  6,-25, 23,  6,-20,-25,-23,-18,-15,  2,  4,-13,  6,-20;
/M: SY='G'; M= -9, -9,-28, -9,-18, -1, 29,-14,-27,-19,-18,-15, -4,-22,-21,-18, -6,-16,-21,-11, -6,-19;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-13,-35,-28, -2,-34,-29, 34,-27, 15, 13,-22,-23,-22,-27,-16, -7, 28,-24, -6,-28;
/M: SY='I'; M=-10,-26,-11,-33,-27, -3,-22,-24, 17,-24,  8, 13,-22,-25,-18,-24,-19,-12, 10, -6, -4,-24;
/M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -5, 14,-18,-22,-12, -1, -7, -9, -6, -6,-11,  4,-11,  2, -3, -3,-29,-13,  7;
/M: SY='W'; M=-20,-33,-43,-33,-26, 17,-24,-12,-13,-16,-13,-13,-33,-30,-16,-16,-33,-23,-23,108, 48,-20;
/M: SY='I'; M= -7,-22, -8,-29,-22, -4,-30,-25, 21,-25, 12,  8,-16,-22,-18,-23, -9,  1, 14,-27, -7,-22;
/M: SY='G'; M= -1,-11,-27,-12,-18,-22, 42,-20,-32,-18,-27,-19, -3,-19,-16,-18,  3, -8,-24, -6,-20,-16;
/M: SY='Y'; M=-16,-28,-27,-31,-24, 33,-30, -9,  9,-23, 15,  6,-24,-29,-22,-18,-24,-11,  0, 16, 36,-24;
/M: SY='A'; M= 27,-13,-12,-21,-13, -3, -9,-19, -6,-15, -2, -6,-11,-15,-14,-18,  5,  4,  1,-19,-11,-13;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-24,-31,-22, 10,-31,-23, 20,-27, 28, 13,-26,-14,-22,-22,-23, -9, 11,-19, -1,-23;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='V'; M=  9,-20,-14,-25,-19, -4,-18,-18, 16,-16, 11, 14,-19,-19,-14,-17, -9, -4, 18,-20, -8,-17; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-30;
/M: SY='T'; M= 10,-10,-13,-17,-13, -3, -9,-18, -3,-14, -6, -6, -6,-13,-13,-15,  7, 11,  1,-19, -8,-13; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-30; IM=0; DM=-30;
/M: SY='W'; M=-17,-24,-38,-24,-13,  2,-22,-12,-16, -9,-16,-11,-22,-11, -1, -6,-22,-18,-24, 52, 17, -6;
/M: SY='N'; M= -6, 14, -8, 12,  7,-24, -9,  8,-26, -6,-27,-19, 18,-15,  1, -7, 14,  1,-21,-39,-16,  3;
/M: SY='W'; M= -4,-26,-24,-28,-19,  4,-23,-20,  4,-19, 11,  3,-25,-25,-13,-17,-19,-11,  3, 13,  3,-15;
/M: SY='P'; M= -8,-16,-30,-13,  0, -7,-22,-10,-11,-10, -9, -8,-16, 21, -4,-13,-11, -9,-17,-16, -3, -4;
/M: SY='A'; M= 16,-19,-17,-25,-21, -4, -2,-23,  1,-19, -4, -3,-15,-19,-21,-21, -3, -6,  9,-19,-12,-21;
/M: SY='Y'; M= -4,-26,-24,-29,-23, 11,-26,-15, 11,-20,  9,  4,-24,-26,-19,-19,-18, -9,  8, 12, 19,-22;
/M: SY='L'; M= 10,-20,-18,-23,-15, -7,-12,-18,  0,-15, 14,  3,-18,-22,-14, -9,-11, -7,  2,-21,-10,-15;
/M: SY='F'; M=-15,-27,-18,-35,-28, 60,-29,-21,  2,-27,  8,  0,-19,-28,-35,-19,-14, -2,  6,  1, 21,-28;
/M: SY='A'; M= 14,-20,-17,-26,-16,  0,-17,-20,  7,-21, 14,  4,-17,-19,-16,-20, -7, -4,  6,-20, -7,-16;
/M: SY='F'; M= -9,-24,-21,-30,-25, 14,-19,-23, 14,-26, 14,  7,-19,-24,-24,-21,-14, -4, 11,-16,  1,-25;
/M: SY='F'; M=-15,-30,-26,-35,-28, 35,-26,-19,  4,-22,  3,  5,-27,-29,-26,-18,-23,-13,  3, 33, 22,-25;
/M: SY='T'; M= -2,-14,-14,-19,-18,  1,-14,-22,  1,-17, -6, -4, -9,-19,-18,-16,  7, 16, 10,-25, -8,-18;
/M: SY='L'; M= -9,-26, -8,-32,-25, 15,-31,-24, 16,-26, 18,  8,-22,-27,-25,-21,-16, -2, 17,-19,  1,-25;
/M: SY='C'; M=  8,-11, 49,-20,-18,-18,-18,-23,-20,-19,-17,-16,-10,-24,-18,-21,  7,  8, -6,-38,-22,-18;
/M: SY='N'; M= -9,  7,-21, -3, -4, -7,-14, -3, -8, -8,-15, -8, 19,-18,  3, -6,  4,  0,-15,-26, -8, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-18,-21,-25,-19,  2,-24,-11, 19,-20, 28, 28,-15,-25,-11,-16,-21, -9,  7,-22, -2,-16;
/M: SY='T'; M= -1,-12,-20,-16,-13, -6, -3,-13,-10,-13, -8, -6, -9,-19, -8,-13,  0,  3, -5,-17, -2,-11;
/M: SY='P'; M=  6,-16,-24,-20,-13,-15,-16,-21,  1,-15, -6, -3,-14, 12,-12,-20, -3,  2, -2,-24,-16,-15;
/M: SY='R'; M=-15,-19,-30,-21,-12, -1,-21,-13,-13,  0,-13, -8,-11,-22, -4, 18,-12,-10,-13, 14,  3, -9;
/M: SY='A'; M= 45, -9,-10,-18, -9,-20,  0,-19,-11,-10,-12,-11, -8,-10, -9,-19, 14,  2, -1,-22,-20, -9;
/M: SY='M'; M= -1,-13,-21,-16, -7, -8,-19,-12, -6,  1, -5,  2, -9,-17, -1,  1, -5, -5, -3,-20, -6, -4;
/I:         E1=0;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 53 in 53 different sequences
Number of true positive hits 53 in 53 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] K_Hofmann
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
53 sequences

CHO2_CANAL  (Q59LV5), CHO2_CANAW  (C4YL78), CHO2_CANDC  (B9WL59), 
CHO2_CLAL4  (C4Y206), CHO2_DEBHA  (Q6BY28), CHO2_LODEL  (A5DS78), 
CHO2_PICST  (A3LQW6), DET2_ARATH  (Q38944), DET2_GOSHI  (Q2QDF6), 
DET2_SOLLC  (Q5K2N1), DFG10_YEAST (P40526), ECR_ARATH   (Q9M2U2), 
POED1_ARATH (Q9CAH5), POED1_ORYSI (A2XWN6), POED1_ORYSJ (Q7XUH5), 
POED2_ARATH (Q9SI62), POED2_ORYSI (B8B6G5), POED2_ORYSJ (Q7F0Q2), 
PORED_AILME (D2HBV9), PORED_CAEBR (A8X8R3), PORED_CAEEL (Q17428), 
PORED_DANRE (Q5RIU9), PORED_DROME (Q9VLP9), PORED_HUMAN (Q9H8P0), 
PORED_MESAU (C7T2J9), PORED_MOUSE (Q9WUP4), PORED_RAT   (Q5RJM1), 
PORED_XENLA (Q8AVI9), PORED_XENTR (Q0P4J9), S5A1_BOVIN  (A5PJS2), 
S5A1_HUMAN  (P18405), S5A1_MACFA  (Q28891), S5A1_MOUSE  (Q68FF9), 
S5A1_RAT    (P24008), S5A2_HUMAN  (P31213), S5A2_MACFA  (Q28892), 
S5A2_MOUSE  (Q99N99), S5A2_PIG    (O18765), S5A2_RAT    (P31214), 
TECRL_BOVIN (Q3SZ89), TECRL_HUMAN (Q5HYJ1), TECRL_MOUSE (Q8BFZ1), 
TECR_BOVIN  (Q3ZCD7), TECR_CAEEL  (Q9N5Y2), TECR_DICDI  (Q55C17), 
TECR_HUMAN  (Q9NZ01), TECR_MOUSE  (Q9CY27), TECR_RAT    (Q64232), 
TSC13_YEAST (Q99190), YFP9_SCHPO  (O14264), YFY8_SCHPO  (Q9UT20), 
YJD4_SCHPO  (O74507), YN67_SCHPO  (O94511)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission