Entry: PS50254

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] REL_2
Accession [info] PS50254
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00924
Associated ProRule [info] PRU00265

Name and characterization of the entry

Description [info] NF-kappa-B/Rel/dorsal domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=178;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=175;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.5397109; R2=0.0186128; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-8111.30830; R2=54.38339; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=428; N_SCORE=8.5; H_SCORE=25389; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=321; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9291; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='A'; M= 10, -8,-22,-11, -7,-22,  3,-14,-19, -3,-19,-13, -2, -4, -6, -3,  5, -4,-14,-25,-19, -8;
/M: SY='S'; M=  2,  1,-19,  1, -1,-20,-11,  0,-18, -6,-22,-14,  3, -4, -1, -9, 12,  5,-13,-29,-10, -2;
/M: SY='L'; M= -7,-10,-23,-11,-11,-13,  0,-14, -7,-13,  1, -2, -6,-22,-11,-10,-10, -8, -7,-24,-13,-11;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='Y'; M=-11,-14,-31,-12, -4, -4,-22, 15,-14, -8,-14, -7,-12,  8, -1,-10,-11,-11,-20, -6, 20, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-19,-31,-23,  7,-31,-23, 25,-28, 38, 18,-29,-29,-22,-21,-25, -8, 21,-22, -2,-23;
/M: SY='E'; M=-12, 11,-27, 18, 23,-27,-18, -3,-23,  8,-19,-15,  3,-11,  8,  8, -3, -8,-18,-30,-16, 15;
/M: SY='W'; M=-13,-33,-36,-40,-30,  3,-34,-30, 29,-27,  8,  8,-26,-23,-20,-27,-26,-16, 12, 32,  9,-27;
/M: SY='I'; M= -7,-20,-24,-23,-16, -6,-27,-22, 10,-17, -1,  1,-18,  5,-14,-18, -8,  2,  8,-24,-10,-17;
/M: SY='E'; M=-10, -2,-27,  5, 36,-18,-23, -6,-15, -2,  1, -8, -9, -9,  8, -6, -9,-10,-18,-27,-14, 22;
/M: SY='Q'; M= -8, -4,-30, -1, 17,-35,-18,  1,-21,  4,-23, -8, -4, 13, 37,  1,  1, -7,-28,-25,-16, 26;
/M: SY='P'; M= -5,-12,-31, -7, -1,-26,-15,-17,-19,-10,-29,-19, -9, 59, -8,-17,  2,  1,-24,-32,-26, -8;
/M: SY='K'; M= -9, -4,-26, -5,  3,-24,-20, 12,-21, 17,-20, -5, -1,-15, 12, 16, -5, -6,-15,-23, -5,  6;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-25, -4, 10,-20,-13,  1,-19, -1,-19, -8, -2, -8, 24, -2,  6, -4,-22,-20, -5, 16;
/M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -4,  2,-25,  2, -6,-32, 18,-25,-14,  4,-17,  3, 32, -6,-12,-24,-22,-16,  0;
/I:         I=-6; MD=-33;
/M: SY='G'; M=  2, -9,-25,-10, -9,-25, 24,-14,-21,-12,-21,-12, -3, -7, -3,-14,  2,-10,-19,-21,-20, -7; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='F'; M=-13,-24,-12,-31,-23, 22,-27, -9, 10,-20, 16, 22,-21,-26,-17,-16,-20, -8,  5, -9, 16,-20;
/M: SY='R'; M=-17, -5,-30, -1, 17,-23,-20, -1,-30, 23,-20,-13, -1,-10, 12, 46, -7,-10,-23,-23,-14, 11;
/M: SY='F'; M=-17,-30,-20,-36,-27, 58,-30,-19,  6,-29, 21,  6,-23,-30,-33,-20,-23,-10,  3,  2, 23,-27;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10,  0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='Y'; M=-17,-23,-30,-26,-23, 21,-33,  5, 15,-16,  6,  6,-20,-27,-13,-16,-20,-10,  2, 15, 57,-23;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-28,  6, 29,-28,-17, -7,-25, 21,-21,-13, -3, -8, 12,  9, -5,-10,-19,-26,-15, 20;
/M: SY='C'; M= -5,-21, 71,-27,-27,-14,-27,-28,-12,-25,-12,-11,-20,-35,-27,-25, -6, -5,  7,-43,-23,-27;
/M: SY='E'; M=-10,  7,-30, 14, 48,-33,-20,  3,-27, 10,-20,-14,  0, -3, 32,  3,  0,-10,-30,-27,-17, 40;
/M: SY='G'; M= -4,-14,-32,-12,-14,-27, 36,-18,-29,-16,-26,-13, -7, 12,-15,-19, -5,-16,-27,-23,-27,-16;
/M: SY='R'; M=-16, -8,-31, -7,  2,-24,-20,  4,-29, 26,-24,-10, -2, -3,  7, 44,-10,-11,-22,-22,-10,  1;
/M: SY='S'; M=  9, -3,-10, -5, -4,-20,  0,-14,-20,-11,-26,-18,  4, -4, -5,-13, 27, 16,-11,-35,-21, -5;
/M: SY='H'; M= 18, -5,-18,-11, -6,-19,-10, 26,-18,-10,-14, -6, -1,-14, -2,-11,  3, -2,-11,-25, -4, -6;
/M: SY='G'; M= -7, -7,-30, -7,-13,-27, 40, 21,-37,-17,-27,-13,  3,-20,-10,-13, -3,-20,-30,-23,-13,-13;
/M: SY='S'; M=  0, -5,-19, -5, -4,-22,  8, -9,-27, -1,-27,-17,  5,-15, -1,  9, 19,  4,-17,-31,-19, -4;
/M: SY='I'; M=  7,-22,-22,-31,-21, -6,-25,-25, 25,-23, 12,  9,-16,-18,-16,-25, -9, -5, 17,-22, -7,-21;
/M: SY='P'; M=-13,-16,-33,-11, -4,-19,-22, 15,-15,-14,-11, -6,-13, 34, -6,-14,-14,-13,-22,-28,-10, -9;
/M: SY='G'; M= -6, -9,-29,-10,-18,-13, 38, -7,-28,-16,-22,-15, -1,-23,-16,-16, -5,-16,-25, -8,  0,-18;
/M: SY='E'; M=  0, -2,-24,  1, 26,-22,-12, -9,-15, -1,-12, -9, -7, -9,  4, -8, -2, -8,-11,-27,-18, 15;
/M: SY='N'; M= -1,  8,-17,  0, -3,-18,-10,  3,-19, -2,-21,-13, 16,-14, -1,  1, 14, 14,-15,-32,-12, -3;
/M: SY='S'; M=  2,  6,-16,  5, 14,-21, -8, -7,-21, -4,-25,-19, 10, -8,  4, -7, 25, 14,-15,-36,-19,  9;
/M: SY='T'; M=  0, -1,-18, -5, -3,-19,  6,-16,-22,-10,-19,-15,  1,-11, -8,-11, 15, 20,-13,-29,-18, -5;
/M: SY='E'; M=  3,  8,-21, 11, 13,-27, -9, -9,-25,  6,-26,-18,  4, -5,  3, -2, 12,  1,-18,-32,-18,  8;
/M: SY='R'; M= -7,  3,-25,  1, 11,-22, -8,  1,-26,  9,-21,-14,  9,-14,  5, 20,  1, -4,-22,-27,-15,  6;
/M: SY='N'; M= -3,  4,-22, -2, -6,-22, 10,  4,-25, -6,-24,-14, 13,-16, -3, -4,  8,  1,-21,-29,-15, -5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='K'; M= -8, -4,-30, -4,  1,-29,  4,-12,-33, 29,-29,-13,  0,-14,  2, 21, -7,-13,-23,-20,-15,  1;
/M: SY='T'; M=  0, -3,-15,-10,-12,-16,  5,-20,-18,-13,-16,-13,  0,-13,-12,-13, 16, 30, -8,-28,-16,-12;
/M: SY='Y'; M=-19,-17,-26,-20,-16, 24,-26, 32, -8,-18,  2,  2,-11,-26,-13,-11,-18,-14,-12, -3, 35,-16;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='T'; M=  4, -8,-14,-10, -4,-14,-17,-17, -3,-10,-10, -7, -6,-14, -6,-12, 12, 16,  5,-30,-14, -5;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-20,-35,-30,  0,-35,-30, 40,-25, 15, 15,-25,-25,-25,-25,-15, -5, 40,-25, -5,-30;
/M: SY='Q'; M=-10,  2,-28,  3, 23,-32,-20, -1,-25, 23,-23, -9,  0, -8, 27, 15, -2, -5,-24,-23,-12, 25;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-26,  4,-34,-26, 33,-28, 30, 18,-26,-26,-22,-24,-22, -8, 26,-22, -2,-26;
/M: SY='C'; M=-13,-12, 13,-17,-16,-11,-24, 13,-10,-18, -1,  2, -6,-28,-11,-12,-13,-11, -8,-33, -5,-15;
/M: SY='G'; M= -6, 16,-25,  7, -8,-25, 31, -1,-30,-10,-30,-20, 29,-20, -9,-10,  4,-10,-30,-30,-23, -9;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-12,-21,-21, 24,-30, 14, -4,-12, -2, -2,-20,-31,-12,-12,-19,-10,-10, 20, 67,-21;
/M: SY='R'; M=-10,  1,-24,  4,  3,-17,-14, -5,-17,  1,-13, -7, -1,-16,  3,  5, -1, -3,-13,-25, -8,  2;
/M: SY='G'; M=  0, -5,-29, -3,  1,-30, 43,-15,-36,-12,-26,-20,  0,-14, -9,-15,  0,-16,-29,-23,-27, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='P'; M= -3, -7,-30, -4, 12,-27,-17,-12,-22, 13,-23,-12, -8, 22,  3,  3, -6, -9,-21,-25,-19,  5;
/M: SY='A'; M= 10,-19,-21,-20,-15,-17, -6,-23, -3,-15,-11, -7,-18,  9,-18,-20, -4, -6,  4,-26,-20,-18;
/M: SY='V'; M= -9,-19,-23,-20,-12, -9,-28,-14,  8, -5,  6,  6,-16,-21, -8, -2,-14, -6, 10,-23, -6,-11;
/M: SY='V'; M= -4,-21,-19,-27,-25, -4,-22,-24, 24,-20,  7, 10,-17,-24,-21,-20,-10, -2, 27,-26, -9,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-19,-21,-20,-11, -6,-27,-16,  5, -7,  9,  4,-16,-23,-10,  6,-13, -3,  9,-24, -7,-12;
/M: SY='V'; M=  1,-15, -8,-18,-11,-16,-22,-16,  4,-12, -6,  0,-12,-19,  1,-13,  0, -1,  9,-28,-12, -6;
/M: SY='C'; M= -4, -8, 17,-12,-12,-16,-19,-15,-10,-16,-10, -3, -7,-21, -8,-16,  4,  4, -5,-35,-16,-11;
/M: SY='L'; M=-11,-29, -5,-33,-25, 24,-30,-22, 11,-29, 27,  9,-26,-31,-28,-21,-23, -9, 11,-16,  4,-25;
/M: SY='V'; M= -4,-26,-16,-31,-27,  5,-31,-28, 28,-22, 10,  9,-23,-25,-26,-21, -9,  3, 34,-24, -4,-27;
/M: SY='T'; M= -4, -7,-24,-12,-10,-18,  4,-18,-22, -5,-20,-13, -5,-15, -6, -7,  2, 10,-16, -4,-10, -7;
/I:         I=-6; MD=-33;
/M: SY='K'; M= -7,  3,-21,  0,  8,-20,-16, -1,-21, 14,-20,-11,  4,-10,  4,  9,  4,  8,-15,-25, -9,  6; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-33; IM=-33; DM=-33;
/M: SY='D'; M=  7, 15,-21, 16, -1,-27,  8,-10,-26, -8,-23,-20, 10,-13, -7,-13,  8, -1,-18,-30,-21, -4;
/M: SY='D'; M=-14, 16,-32, 25, 12,-29,-14, -8,-29, -1,-27,-23,  5, 12, -2, -9, -3, -8,-28,-20,-17,  5;
/M: SY='P'; M=-12, -4,-34,  6, 16,-25,-20,-10,-21, -5,-20,-17,-10, 39, -1,-13, -8,-10,-26,-28,-19,  5;
/M: SY='H'; M=-19, -5,-30, -3, -3,-11,-21, 36,-25,  2,-17, -7,  0,-13,  2, 17,-11,-14,-23,-19, 11, -4;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-27, -8, -3,-16,-17, -1,-18, 16,-16, -7,  1,-18,  2, 25, -7, -8,-15,-20, -4, -3;
/M: SY='P'; M= -6,-23,-27,-19,-10,-13,-24,-20,  1,-17,  2, -1,-23, 24,-12,-18,-15, -8, -4,-26,-16,-13;
/M: SY='H'; M=-19, -2,-30, -2,  1,-21,-20, 73,-30,  2,-21, -3,  7,-19, 10, 15,-10,-17,-27,-27, 12,  1;
/M: SY='P'; M= -1,-17,-34,-10, -1,-28,-16,-19,-19,-10,-28,-19,-17, 70, -9,-19, -4, -7,-25,-30,-28, -9;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='N'; M=  8,  7,-21,  4,  3,-23,  0, -8,-22, -5,-22,-17,  9,-13,  1,-10,  8, -3,-19,-19,-17,  2;
/M: SY='L'; M=-13,-30,-20,-33,-23, 28,-30,-20, 15,-30, 39, 15,-27,-30,-25,-20,-27,-10,  7,-12,  8,-23;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-15,-27,-27,  8,-30,-17, 22,-17,  7,  7,-27,-30,-25,-17,-13, -3, 34,-14, 14,-27;
/M: SY='G'; M= -2, -8,-27, -8, -9,-30, 34,-12,-28,-11,-24,-12, -2,-18,  2,-11,  2,-13,-23,-22,-23, -4;
/M: SY='K'; M= -8, -9,-25, -9, -2,-21,-23,-14,-14, 29,-18, -5, -8,-16, -1, 21,-10, -7, -2,-23,-10, -2;
/M: SY='H'; M=-16, 13,-30, 20, 19,-25,-16, 28,-31,  2,-22,-13,  7,-12, 11, -1, -5,-13,-28,-29, -5, 14;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='C'; M=-13, -9, 59,-14,-16,-22,-24,-18,-30,-10,-22,-18, -8,-31,-15,  0, -7, -8,-15,-41,-23,-17;
/M: SY='K'; M=-11, -4,-28, -4,  4,-20,-24, -8, -8,  9,-13, -5, -3,-13,  3,  8, -7, -7, -8,-24, -9,  1;
/M: SY='B'; M= -7, 13,-22, 13,  3,-23,-14, -5,-23,  6,-20,-15,  9,-13, -1,  3,  5,  8,-16,-31,-13,  0;
/M: SY='G'; M= -2, -6,-30, -4,-16,-31, 61,-18,-39,-18,-30,-21,  1,-16,-18,-19,  0,-19,-30,-22,-29,-17;
/M: SY='V'; M= -9,-18,-23,-21,-16, -1,-28,-14, 10, -2,  0,  4,-15,-23,-13, -6,-14, -7, 12,-15,  8,-16;
/M: SY='C'; M=-11,-16, 47,-24,-23, -4,-27,-13,-15,-20,-10, -8,-16,-30,-19,-20, -7,  2, -7,-24,  4,-22;
/M: SY='E'; M= -4, -4,-19, -2,  6,-18,-21,-13, -7, -4, -9, -7, -8,-14,  0, -6,  1,  6,  2,-29,-13,  3;
/M: SY='A'; M= 15,-17,-14,-20,-15,-12,-16,-22,  3,-11, -3, -3,-16,-10,-16,-16,  0,  3, 13,-26,-15,-16;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-23,  3, 18,-20,-19,  0,-20,  4,-17,-13,  3, -9,  6,  3,  5,  9,-17,-29,-12, 11;
/M: SY='L'; M=  1,-16,-19,-21,-17,  3,-24,-21, 10,-21, 13,  4,-16,-21,-18,-20,-10,  1,  9,-21, -4,-18;
/M: SY='N'; M= -2,  2,-17, -2, -6,-21, 10, -9,-22,-10,-23,-16, 12,-11, -4, -8, 12,  0,-20,-32,-21, -6;
/M: SY='P'; M= -9,-12,-31, -7, -1,-19,-17,  6,-19, -8,-24,-13, -8, 31,  0,-12, -1, -5,-23,-23, -4, -4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-26, 11, 27,-26,-15, -7,-26, 10,-20,-16,  0, -7,  8,  4,  1, -2,-20,-28,-17, 17;
/M: SY='R'; M= -2,  1,-22,  0, -1,-21,-10,-11,-18,  3,-17,-12,  2,-14, -3,  6,  2,  2,-11,-27,-15, -3;
/M: SY='M'; M= -8,-20,-15,-25,-17, -6,-25,-11,  9,-11,  2, 17,-16,-12, -8, -8,-12, -6,  5,-20, -2,-15;
/M: SY='V'; M= -5,-19,-19,-20,-16, -9,-24,-19,  7, -7, -2,  1,-14,-16,-13, -1, -4,  2, 14,-27,-10,-16;
/M: SY='H'; M=  5,-12,-20,-15,-11, -8, -9, 11,-10,-14, -4, -3, -8,-20, -8,-13, -3, -6, -7,-19,  4,-11;
/M: SY='S'; M= -1, -1,-13, -6, -6,-16, -3,-10,-15, -9,-20,-12,  6,-16,  0, -9, 14,  8,-10,-30,-15, -3;
/M: SY='F'; M=-14,-22,-17,-31,-24, 52,-27,-20, -1,-25,  7, -1,-15,-25,-31,-17,-10,  6,  1, -2, 18,-24;
/M: SY='Q'; M= -4,  5,-24,  0,  5,-26,-13, -3,-17, 11,-23, -9, 12,-13, 16,  6,  5, -3,-18,-27,-13, 10;
/M: SY='N'; M= -7, 19,-18,  6, -7,-15, -9, -2, -7, -2,-19,-11, 33,-22, -7, -3,  4, -1, -8,-36,-17, -7;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-30,-21,  9,-29,-19, 21,-28, 45, 22,-29,-29,-19,-19,-28, -9, 12,-21, -1,-20;
/M: SY='G'; M= -3, -5,-30, -2,  1,-30, 46,-15,-37,-12,-27,-20,  0,-15, -9,-15,  0,-17,-30,-23,-27, -4;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-28,-39,-29,  0,-38,-28, 47,-28, 19, 22,-21,-21,-19,-28,-19, -9, 30,-21, -1,-29;
/M: SY='Q'; M=-10,-10,-29,-10,  5,-26,-23, -5,-10, -2,-10, -1, -9,  6, 23, -1, -6, -6,-18,-23,-12, 12;
/M: SY='C'; M=-12,-19, 54,-24,-21,-12,-28, -2,-17,-26, -2, -6,-17,-33,-20,-21,-15,-12, -9,-38,-12,-21;
/M: SY='V'; M=  0,-24,-13,-24,-19, -2,-27,-25, 18,-18, 13,  7,-24,-25,-22,-18,-10,  1, 30,-27, -9,-20;
/M: SY='K'; M= -5, -7,-29, -6,  2,-26,-18,-14,-23, 20,-25,-13, -6, 15,  1, 12, -5, -2,-19,-24,-16,  0;
/M: SY='K'; M=-10,  2,-30,  3, 19,-30,-20, -8,-30, 42,-28,-12,  0, -8, 12, 26, -8,-10,-22,-22,-12, 15;
/M: SY='K'; M=-11,  7,-27,  2,  4,-24,-15, -4,-24, 29,-24,-11, 14,-15,  6, 24, -6, -7,-21,-25,-12,  4;
/M: SY='D'; M=-12, 24,-26, 26, 23,-24,-12,  3,-27,  4,-25,-20, 20,-11,  6, -2,  3, -5,-27,-31,-12, 14;
/M: SY='M'; M= -7,-26,-20,-32,-25,  1,-28,-17, 30,-19, 20, 33,-24,-24,-15,-18,-18, -7, 26,-23, -3,-21;
/M: SY='E'; M= -9, -3,-25, -1, 16,-11,-18, -5,-21,  8,-14, -8, -3,-12,  4, 12, -4, -7,-17,-22, -9, 10;
/M: SY='E'; M= 16,  3,-21,  4, 18,-27, -4,-10,-23, -2,-18,-16, -2, -7,  3,-11,  6, -5,-17,-26,-20, 11;
/M: SY='A'; M= 23, -4,-13,-11, -4,-17, -8,-16, -9, -9,-13,-11, -2,-11, -7,-14, 13, 10, -2,-27,-17, -6;
/M: SY='I'; M= -9,-29,-24,-35,-26,  4,-34,-24, 35,-28, 30, 22,-25,-25,-20,-24,-22, -9, 24,-21, -1,-25;
/M: SY='D'; M= -9,  8,-15, 12,  6,-24,-17, -6,-20,  1,-18,-14,  3,-15, -2,  1, -2, -7,-13,-32,-15,  1;
/M: SY='C'; M= -6,-10, 14,-12,  0,-18,-23,-12,-18, -5, -7, -8,-11,-21, -4, -7, -8, -6,-12,-31,-15, -2;
/M: SY='R'; M=  1, -8,-25,-10,  0,-22,-15, -8,-25, 24,-20,-10, -3,-15,  5, 37, -5, -7,-15,-20,-13,  0;
/M: SY='M'; M= -7,-14,-28,-16, -7,-17, -2,-15, -3,-11, -1,  2,-10,-18, -2,-12,-11,-13, -7,-21,-12, -6;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='I'; M= -9,-14,-26,-15,  0,-13,-26,-13,  5, -5,  2,  3,-11,-17,  1, -1,-10, -8,  1,-24, -8, -1;
/M: SY='L'; M= -7,-20,-20,-25,-17,  4,-27,-20, 10,-17, 18,  7,-17,-22,-15,-10,-13,  3,  7,-20, -2,-17;
/M: SY='K'; M=-10,  6,-28,  3,  9,-27, -4, -3,-29, 20,-26,-14, 11,-14,  9, 19, -3, -9,-25,-25,-16,  8;
/M: SY='I'; M= -4,-20,-21,-26,-21, -2,-26,-19, 21,-19, 18, 15,-15,-24,-16,-16,-16, -7, 16,-23, -5,-20;
/M: SY='D'; M=-16, 27,-27, 30, 14,-28,-11,  3,-31,  9,-26,-21, 23,-14,  5, 15,  0, -7,-27,-34,-17,  8;
/M: SY='P'; M=-11, -3,-32, -2,  0,-25,-15, -9,-20, -3,-25,-17,  4, 40, -3, -3, -5, -7,-27,-31,-23, -5;
/M: SY='F'; M= -9,-17,-20,-22,-14, 30,-20,-11,-10,-12, -6, -7,-10,-22,-18, -3, -4, -4, -7, -6, 12,-14;
/M: SY='D'; M=-14, 21,-28, 23, 14,-28,-11, -1,-27, 10,-25,-18, 18,-13,  6,  8, -1, -8,-25,-31,-17,  9;
/M: SY='I'; M=  5,-21,-18,-28,-22, -4,-26,-25, 22,-21, 11,  8,-18,-20,-18,-22, -7,  4, 21,-24, -7,-22;
/M: SY='E'; M= -5, -3,-29,  2, 14,-28, 11,-10,-31,  0,-26,-19, -1,  0,  1, -2,  2,-10,-27,-26,-23,  7;
/M: SY='F'; M=-11,-17,-23,-19, -6, 10,-24, -5, -2,-15,  9,  4,-14,-18, -8,-11,-13, -8, -6,-17,  3, -7;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-28,  0, 10,-23, -7, -7,-26,  8,-17,-13, -3,-14,  4, 15, -6,-10,-21,-18,-14,  6;
/M: SY='H'; M= -5, -1,-28, -1, 11,-28,-18, 19,-26, 18,-22, -7,  1,-12, 17, 12, -5,-11,-23,-23, -5, 13;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-23,-13,-11,-16,  5,-14,-14, -5, -5, -5, -5,-20, -9, -4, -8,-10,-11,-22,-15,-10;
/M: SY='E'; M=-12,  4,-29,  7, 22,-23,-17, 12,-25,  8,-17,-10,  1,-11, 14,  5, -6,-12,-25,-25, -8, 18;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-17,  3, 12,-17,-16, -6,-13, -2, -8, -7,  0, -8,  8, -3,  4, 10,-12,-22,-10, 10; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-23;
/M: SY='D'; M=-10,  3,-24,  7, -1,-17,-17,-11, -7, -6, -9, -8, -4,  6, -6,-11, -7, -5, -9,-23,-11, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='E'; M= -5, -5,-28, -5,  1,-23, -8,-14, -9,  0,-14, -6, -4,-13,  0, -7, -5,-10,-10,-24,-14, -1;
/M: SY='D'; M= -5,  8,-25, 14, 11,-28,  8,-10,-29, -3,-25,-19,  4,-12, -2, -9,  5, -7,-20,-31,-21,  4;
/M: SY='M'; M=-13,-21,-18,-26,-19, -2,-28, -9, 10, -6,  3, 14,-16,-24, -8,  4,-16, -9,  8,-16,  6,-17;
/M: SY='D'; M=-16, 35,-29, 45, 15,-35,-11, -1,-35, 13,-30,-23, 20,-11,  3,  2, -1, -9,-27,-35,-17,  9;
/M: SY='L'; M=-11,-10,-21,-16,-14, -1,-21, -9,  6,-17, 22, 11, -4,-26,-11, -8,-17, -7, -2,-25, -6,-13;
/M: SY='N'; M= -5, 20,-16,  7, -4,-14, -7,  0,-16, -5,-23,-16, 32,-16, -3, -5, 15, 16,-18,-33,-11, -4;
/M: SY='R'; M=  3,-14,-20,-17, -7,-15,-20,-14, -2, -1, -7, -3,-11,-18, -3,  7, -3, -3,  6,-24,-12, -7;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-11,-30,-29,  1,-30,-29, 29,-21, 12, 11,-30,-30,-29,-20,-11, -1, 48,-29, -9,-29;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-26,-11, -1,-20,-20, -1,-30, 28,-20,-10, -1,-21,  9, 67,-10,-10,-20,-21,-11, -1;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-16,-31,-21,  8,-31,-21, 21,-30, 45, 19,-29,-29,-20,-21,-29,-10, 11,-21, -1,-21;
/M: SY='C'; M= -8,-22, 64,-29,-27,-13,-29,-26,-10,-22, -9, -7,-21,-35,-26,-19,-10, -7,  8,-40,-21,-27;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-39,-29, 77,-30,-18,  0,-29,  9,  0,-20,-30,-38,-19,-20,-10, -1, 11, 33,-29;
/M: SY='Q'; M=-11, -3,-27, -3, 13,-29,-19,  3,-21, 12,-18, -4,  0,-12, 34, 22,  0, -4,-23,-22,-11, 22;
/M: SY='V'; M= 19,-22,-10,-26,-22, -5,-18,-26, 13,-16,  2,  2,-22,-22,-22,-20, -2,  0, 28,-25,-13,-22;
/M: SY='F'; M=-16,-18,-23,-23,-18, 35,-23, 14,-11,-21, -5, -3, -9,-24,-19,-13,-10, -8,-10, -2, 22,-17;
/M: SY='I'; M= -9,-26,-16,-29,-22,  3,-31,-20, 21,-19, 21, 14,-24,-27,-19,-17,-20, -8, 18,-19,  2,-22;
/M: SY='P'; M=-11,-10,-32, -6,  7,-24,-21,-13,-17,  0,-21,-14, -8, 32, -2,  1, -5, -4,-21,-28,-20, -1;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='D'; M= -7, 15,-25, 23, 13,-30,  5, -4,-29, -2,-23,-18,  6, -9,  6, -7,  2, -9,-24,-26,-18, 10; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='P'; M= -6,  0,-24,  5, 14,-26,-13, -5,-19, -1,-21,-13, -2, 19, 12, -6,  4, -4,-22,-25,-17, 11; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-28; IM=0; DM=-28;
/M: SY='N'; M= -6,  4,-16,  3,  0,-16, -5,  5,-15,  3,-14, -7,  8,-12,  3,  7,  0, -5,-12,-19, -8,  1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-28;
/M: SY='G'; M=  2, -6,-20, -6,-11,-21, 41,-13,-26,-12,-21,-14,  0,-13,-10,-13,  3,-11,-20,-16,-20,-11; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-28;
/M: SY='G'; M=  1,  1,-21, -3, -7,-23, 19, -9,-27, -5,-27,-18, 12,-17, -6,  1, 11, -3,-21,-29,-22, -7;
/M: SY='F'; M=-12,-19,-27,-23,-20, 17,  4,-15,-18,-16,-11, -9,-11,-24,-19, -9,-10,-13,-15,  5,  6,-18;
/M: SY='T'; M= -6, -6,-19,-11, -6,-15,-20,-14,-12,  8,-12, -4, -5,-11, -4,  8,  2, 16, -4,-26,-10, -6;
/M: SY='V'; M= -8,-16,-17,-16, -6, -9,-25,-15,  0, -8,  0, -2,-14,-12, -9, -3, -8,  0,  3,-25, -8, -9;
/M: SY='P'; M= -2,-17,-26,-15, -8,-16,-20,-17, -6,-10, -4, -5,-17, 15, -9, -8,-10, -7, -6,-25,-16,-11;
/M: SY='L'; M=  0,-20,-17,-22,-15, -1,-20,-17,  9,-22, 21,  8,-17,-22,-14,-17, -7, -1,  6,-26, -7,-14;
/M: SY='P'; M= -8, -7,-26, -3, -4,-19,-18,-16,-11,-10, -9, -9,-11, 16, -8,-14, -6,  0,-12,-29,-17, -8;
/M: SY='P'; M=-10,-15,-37, -8,  4,-30,-20,-12,-19, -5,-26,-14,-15, 60,  8,-12, -8,-10,-29,-26,-23,  3;
/M: SY='V'; M=  3,-27,-13,-30,-27, -2,-28,-28, 27,-20, 10,  9,-25,-26,-25,-21, -9,  0, 39,-27, -9,-27;
/M: SY='V'; M=  9,-23,-15,-27,-21, -2,-23,-21, 16,-19, 12,  6,-22,-23,-20,-20, -9, -2, 21,-20, -3,-21;
/M: SY='S'; M=  9, -1,-11,  0,  0,-20, -1,-10,-20,-10,-30,-20,  9, -7,  0,-10, 39, 19,-11,-40,-20,  0;
/M: SY='B'; M=-11, 22,-24, 22, 10,-26,-12,  2,-19, -2,-22,-15, 21,-14,  5, -5,  3, -5,-20,-35,-16,  7;
/M: SY='P'; M= -3,-20,-35,-15, -5,-25,-20,-21,-10,-13,-21,-14,-19, 64,-11,-21, -9, -9,-19,-27,-25,-13;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-28,-39,-30,  0,-39,-30, 48,-29, 19, 19,-21,-21,-21,-29,-19, -9, 32,-21, -1,-30;
/M: SY='Y'; M=-17, -7,-28, -7,  3, 12,-24, 16,-12, -6, -8, -7, -6,-21, -3, -7,-12,-10,-17,  2, 36, -2;
/M: SY='D'; M=-15, 27, 10, 35,  3,-33,-10, -8,-36, -9,-27,-26, 11,-19, -9,-15, -2,-10,-25,-41,-23, -3;
/M: SY='K'; M= -3,  7,-20,  3,  3,-23, -9, -5,-24, 16,-29,-16, 15,-13,  4, 12, 13,  3,-18,-31,-16,  3;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='K'; M=-11, -2,-28, -2, 10,-29,-19, -2,-26, 33,-24, -7,  0,-11, 23, 31, -7, -9,-21,-19, -9, 15; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='A'; M= 18, -7,-15,-11, -4,-19, -5,-11,-17,  1,-17,-12, -1,-12, -1,  8, 12,  3, -8,-24,-16, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='P'; M=  3, -7,-17, -6, -2,-17, -9,-13,-13, -8,-19,-13, -4, 23, -5,-12, 11,  8,-12,-25,-17, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-28;
/M: SY='N'; M=  9, 10,-14,  0, -3,-18,  4, -3,-14, -4,-17,-11, 17,-12,  0, -6,  7, -2,-15,-23,-15, -1; D=-5;
/I:         E1=0;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 38 in 38 different sequences
Number of true positive hits 37 in 37 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits 1
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 1
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 97.37 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] RHD
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
37 sequences

DIF_DROME   (P98149), DORS_DROME  (P15330), NFAC1_BOVIN (P98201), 
NFAC1_HUMAN (O95644), NFAC1_MOUSE (O88942), NFAC1_PIG   (O77638), 
NFAC2_HUMAN (Q13469), NFAC2_MOUSE (Q60591), NFAC3_HUMAN (Q12968), 
NFAC3_MOUSE (P97305), NFAC4_HUMAN (Q14934), NFAC4_MOUSE (Q8K120), 
NFAT5_HUMAN (O94916), NFAT5_MOUSE (Q9WV30), NFAT5_RAT   (D3ZGB1), 
NFKB1_CANFA (Q6F3J0), NFKB1_CHICK (Q04861), NFKB1_DROME (Q94527), 
NFKB1_HUMAN (P19838), NFKB1_MOUSE (P25799), NFKB2_CHICK (P98150), 
NFKB2_HUMAN (Q00653), NFKB2_MOUSE (Q9WTK5), NFKB2_XENLA (O73630), 
RELB_CHICK  (P51509), RELB_HUMAN  (Q01201), RELB_MOUSE  (Q04863), 
RELB_XENLA  (P51510), REL_AVIRE   (P01126), REL_CHICK   (P16236), 
REL_HUMAN   (Q04864), REL_MELGA   (P01125), REL_MOUSE   (P15307), 
TF65_CHICK  (P98152), TF65_HUMAN  (Q04206), TF65_MOUSE  (Q04207), 
TF65_XENLA  (Q04865)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
1 sequence

NFKB1_RAT   (Q63369)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
False positive sequences
1 sequence

HELZ_DANRE  (Q6NYU2)

		
PDB
[Detailed view]
32 PDB

1A02; 1A3Q; 1A66; 1GJI; 1IKN; 1IMH; 1LE5; 1LE9; 1LEI; 1MDI; 1MDJ; 1MDK; 1NFA; 1NFI; 1NFK; 1OOA; 1OWR; 1P7H; 1PZU; 1RAM; 1S9K; 1SVC; 1VKX; 2AS5; 2I9T; 2O61; 2O93; 2RAM; 2V2T; 3DO7; 3GUT; 3QRF
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission