ID LNR; MATRIX. AC PS50258; DT 01-JAN-2006 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE LNR (Lin-12/Notch) repeat profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=42; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=1; N2=42; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.3577006; R2=0.0056736; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=1700; N_SCORE=12.0; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=1083; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='RR'; MA /DEFAULT: M0=-20; D=-80; I=-80; B1=-200; E1=-200; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='C'; M=-41,146,-58,-45,-51,-56,-59,-58,-55,-49,-49,-28,-70,-62,-62,-43,-28,-46,-80,-61; MA /M: SY='P'; M=-14,-53,-10,28,-56,-35,-38,-28,16,-45,-6,40,49,11,-16,17,27,-36,-61,-49; MA /M: SY='P'; M=24,-55,-13,-5,-41,-44,-38,-13,14,-13,-38,-15,46,29,-14,16,-35,-28,1,39; MA /M: SY='P'; M=6,-13,4,-15,-51,16,20,-16,-4,-14,-41,1,46,-10,11,22,-18,-23,-59,-27; MA /I: I=-14; MD=-45; MA /M: SY='Y'; M=-14,-73,-71,-69,-36,-34,-60,0,-32,-1,-49,-23,-76,-62,-26,-12,-36,-19,-62,39; D=-14; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; MA /M: SY='C'; M=-25,65,-24,-1,-26,-9,16,-50,4,-47,-8,12,-19,40,23,-12,-31,-40,-43,60; MA /M: SY='C'; M=-14,141,-58,-41,-29,-54,-58,-37,-54,-48,-47,-47,-4,-33,-60,-42,-40,-44,-75,-58; MA /M: SY='W'; M=22,-58,-16,16,-31,-39,-1,-23,4,-18,-1,11,-18,9,-6,-18,-26,-46,114,-8; MA /M: SY='D'; M=-11,-56,57,29,-52,-13,-24,-52,9,-28,2,-2,-47,-1,29,7,-19,-35,39,-20; MA /M: SY='H'; M=-39,-57,-14,-31,13,-53,59,-39,29,15,-32,-28,-54,-10,30,-9,-42,-18,58,43; MA /M: SY='F'; M=19,-51,-54,-49,75,-33,-42,9,-6,-9,-31,-47,-56,-27,-4,-1,-39,-14,-32,40; MA /I: I=-24; MD=-77; MA /M: SY='G'; M=18,-52,-31,-41,-58,61,16,-59,15,-58,-14,37,-48,-17,0,6,-34,-54,-58,-50; D=-24; MA /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; MA /M: SY='N'; M=-45,-53,85,-21,-62,-37,-27,-61,-31,-64,-56,86,-49,-32,-40,-29,-31,-60,-79,-51; MA /I: I=-24; MD=-77; MA /M: SY='G'; M=-30,-57,-28,-48,-60,83,-16,-66,14,-50,-52,-17,-48,-26,-34,-4,-24,-60,-55,-32; D=-24; MA /I: I=-24; MI=-77; IM=-77; DM=-77; MA /M: SY='H'; M=-21,-55,-46,-24,23,-54,50,22,-3,-28,-10,-6,-53,35,24,-18,-32,25,-6,27; MA /M: SY='C'; M=-41,147,-61,-61,-51,-56,-61,-58,-57,-49,-49,-47,-72,-64,-63,-44,-41,-46,-81,-62; MA /M: SY='D'; M=-46,-58,101,-3,-65,-41,4,-64,-33,-63,-59,48,-47,-32,-41,-23,-35,-62,-81,-49; MA /M: SY='Q'; M=-12,-58,-13,39,-52,-35,-36,-35,28,-19,-27,-10,47,47,3,0,-24,-36,-54,-1; MA /I: I=-22; MI=0; MD=-71; IM=0; DM=-71; MA /M: SY='E'; M=24,-54,15,53,-22,27,-5,-55,-29,-31,-21,-3,-44,43,-30,-7,-38,-49,-57,-46; MA /M: SY='C'; M=-41,147,-61,-61,-51,-56,-61,-58,-57,-49,-49,-47,-72,-64,-63,-44,-41,-46,-81,-62; MA /M: SY='N'; M=-37,-48,25,-33,-10,-33,-15,-54,-16,-59,-28,103,-52,-15,-36,8,-27,-55,-69,-33; MA /M: SY='N'; M=-30,-46,-27,-40,-10,-18,-33,-27,-35,-22,-41,85,-49,-35,-41,26,42,-12,-63,-14; MA /M: SY='H'; M=33,-53,-14,44,-29,-45,44,-13,-15,-14,-27,-25,35,-32,-40,-2,-27,-14,-54,12; MA /M: SY='E'; M=40,-52,10,61,-60,32,-40,-57,-9,-46,-49,-5,-29,-21,-39,-10,-37,-49,-58,-52; MA /M: SY='C'; M=-40,146,-60,-61,-50,-29,-60,-58,-56,-49,-49,-46,-71,-63,-63,-43,-41,-46,-78,-38; MA /M: SY='G'; M=-40,-54,20,2,-18,41,-6,-40,-8,36,-32,30,-52,15,-15,-31,-41,-43,-56,-42; MA /M: SY='W'; M=-54,-62,-66,-59,80,-58,-26,-38,-52,-32,-37,-41,-62,-54,-39,-54,-53,-45,129,63; MA /M: SY='D'; M=-47,-61,111,-11,-68,-44,-33,-66,-34,-64,-63,-15,-47,-34,-43,-35,-37,-63,-83,-50; MA /M: SY='G'; M=-13,-54,-13,-49,-61,86,-45,-65,-21,-63,-53,33,-48,-42,-32,-19,-43,-49,-56,-55; MA /M: SY='G'; M=-31,-54,-49,-54,44,68,-2,-43,-36,12,17,-15,-53,-47,-22,-31,-38,-44,-44,-5; MA /M: SY='D'; M=-47,-61,107,24,-67,-45,-33,-66,-33,-63,-62,-16,-45,-31,-42,-35,-37,-62,-80,-50; MA /M: SY='C'; M=-41,147,-61,-61,-51,-56,-61,-58,-57,-49,-49,-47,-72,-64,-63,-44,-41,-46,-81,-62; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; MA /M: SY='Q'; M=6,-51,1,23,-54,-23,-21,-34,4,-35,-18,-1,-30,54,-14,49,4,-39,-57,-18; MA /M: SY='N'; M=-20,-52,-9,5,-26,22,-39,-31,16,22,-36,35,-1,2,2,13,-7,-42,-57,-44; MA /M: SY='N'; M=-19,-12,24,15,-54,25,24,-43,17,-47,-35,51,0,-8,-36,2,0,-22,-62,-19; MA /M: SY='S'; M=-28,-11,-25,3,6,-16,-4,-3,-9,1,-1,-4,4,13,-17,21,20,18,10,-16; MA /M: SY='P'; M=-12,-56,1,11,-1,20,-12,-34,8,-51,-8,30,47,17,-1,-1,-16,-25,-55,-20; MA /I: I=-19; E1=0; MD=-61; MA /M: SY='D'; M=0,15,42,16,-47,-34,14,-42,-31,-54,-19,-11,18,19,-4,-16,5,-12,-67,-14; D=-19; MA /I: I=-19; E1=0; MI=0; MD=-61; IM=0; DM=-61; MA /M: SY='C'; M=-32,88,-34,-16,-4,-29,-46,-24,2,-20,-10,-13,66,-11,2,1,-15,-34,-60,-48; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; MA /M: SY='W'; M=-16,-32,-11,-11,-38,-33,-44,1,6,-6,-40,44,19,-29,-8,-5,-9,-36,109,-7; MA /M: SY='P'; M=25,21,-26,-8,-17,-23,-42,-16,23,-7,-26,-42,38,-4,-16,-10,-22,-4,19,33; MA /M: SY='N'; M=-17,28,20,3,-44,6,2,-9,16,-12,-40,57,-27,-19,-9,-22,-30,-24,6,17; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=60(21); /POSITIVE=60(21); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20; CC /AUTHOR=V_Lesaux; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=3; CC /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=LNR; CC /VERSION=3; DR P13508 , GLP1_CAEEL , T; Q5RGJ8 , GNPTA_DANRE, T; DR Q3T906 , GNPTA_HUMAN, T; Q69ZN6 , GNPTA_MOUSE, T; DR P14585 , LIN12_CAEEL, T; G3I6Z6 , NOTC1_CRIGR, T; DR P46530 , NOTC1_DANRE, T; P46531 , NOTC1_HUMAN, T; DR Q01705 , NOTC1_MOUSE, T; Q07008 , NOTC1_RAT , T; DR P21783 , NOTC1_XENLA, T; A2RUV0 , NOTC1_XENTR, T; DR Q04721 , NOTC2_HUMAN, T; O35516 , NOTC2_MOUSE, T; DR Q9QW30 , NOTC2_RAT , T; Q9UM47 , NOTC3_HUMAN, T; DR Q61982 , NOTC3_MOUSE, T; Q9R172 , NOTC3_RAT , T; DR Q99466 , NOTC4_HUMAN, T; P31695 , NOTC4_MOUSE, T; DR P07207 , NOTCH_DROME, T; 3D 1PB5; 2OO4; 3ETO; 3I08; 3L95; 4ZLP; 5CZV; 5CZX; 6XSW; 7ABV; 7S05; 7S06; PR PRU00525; DO PDOC50258; //