Entry: PS50280

General information about the entry
Entry name SET
Accession number PS50280
Entry type MATRIX
Date DEC-2001 (CREATED); NOV-2002 (DATA UPDATE); MAR-2013 (INFO UPDATE).
PROSITE Documentation PDOC50280
Associated ProRule PRU00190
Name and characterization of the entry
DescriptionSET domain profile.
Matrix / Profile
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=124;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=119;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7525; R2=0.01962526; TEXT='-LogE';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=370; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=292; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-50; E1=-50; MM=1; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-17,-10, -6, -9,-18,-10,-12, -3, -7, -6, -8,-16, -6,  1, -9, -7, -9,-20, -5, -7;
/M:         M= -5,-11,-19,-12, -8, -7,-21,-14, -4, -7, -6, -4,-10,-11, -8, -7, -7, -5, -2,-21, -7, -9;
/M: SY='R'; M= -9, -7,-25, -7, -2,-16,-17, -8,-13,  0,-13, -7, -5, -2, -3,  1, -7, -7,-13,-24,-10, -4;
/M: SY='L'; M= -6,-19,-19,-22,-15, -1,-25,-17, 11,-17, 14,  8,-16,-20,-14,-13,-12, -3,  9,-23, -5,-15;
/M: SY='E'; M= -6, -7,-21, -5,  9,-18,-21, -8, -9,  0, -6, -4, -8,-15,  5, -1, -6, -7, -7,-25,-10,  6;
/M: SY='V'; M= -7,-17,-20,-18, -9, -9,-25,-11,  4, -8,  0,  3,-14,-14, -8, -5, -9, -4,  6,-24, -5,-11;
/M: SY='F'; M= -7,-16,-16,-21,-16, 20,-19,-11, -8,-13, -7, -6,-10,-22,-17, -8, -4, -3, -4, -9,  9,-16;
/M: SY='R'; M= -4, -8,-22,-10, -3,-11,-15, -4,-15,  4,-12, -5, -4,-15, -1,  7, -1, -3,-11,-22, -7, -3;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='T'; M= -4, -4,-19, -5, -3,-15,-15,-13,-11, -4,-13,-10, -2, -8, -5, -3,  6,  8, -7,-28,-13, -5; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='E'; M= -4,  3,-21,  4,  7,-23,-11, -7,-19,  0,-20,-14,  3,  3,  0, -5,  1, -4,-17,-29,-18,  2; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='E'; M= -6, -2,-20, -2,  1,-20, -3,-10,-17, -1,-16,-11,  0,-11, -2, -4, -2, -6,-14,-24,-14, -1; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='K'; M= -5, -5,-22, -6,  0,-23,-12, -2,-20,  9,-19, -8, -3, -9,  1,  6, -4, -7,-15,-25,-12,  0;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-28, -7,-15,-27, 43,-16,-32,-10,-27,-17,  2,-19,-14, -9,  0,-15,-23,-23,-25,-15;
/M: SY='W'; M=-16,-25,-29,-27,-19, 14,-24,-14, -8,-15, -3, -6,-21,-26,-16, -7,-22,-15,-12, 40, 17,-16;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-23,-12,-18,-26, 53,-18,-34,-18,-26,-18, -2,-20,-18,-19,  1,-16,-25,-19,-23,-18;
/M: SY='I'; M= -5,-30,-18,-32,-26,  3,-31,-26, 29,-26, 27, 15,-27,-27,-24,-22,-19, -6, 29,-24, -4,-26;
/M: SY='Y'; M=-17,-22,-27,-24,-17, 13,-25, -7, -7, -4, -4, -3,-16,-26,-13, 13,-18,-11, -5,  8, 14,-16;
/M: SY='A'; M= 20, -8, -5,-14,-10,-15, -9,-18,-11,-13,-10,-10, -5,-13,-10,-16, 15, 15, -2,-29,-16,-10;
/M: SY='T'; M=  1, -6,-18, -9, -3,-14,-17,-14,-10,  1, -5, -3, -5,-14, -4, -3,  1,  7, -5,-26,-11, -4;
/M: SY='E'; M=-11,  2,-20,  4,  6,-18,-20, -5,-17,  4,-12, -7, -2,-16,  0,  3, -6, -5,-11,-27,-11,  3;
/M: SY='D'; M=-12,  6,-27, 10,  2,-13,-16, -2,-18, -6,-14,-13,  1, -5, -4,-10, -4, -7,-18,-24, -5, -2;
/M: SY='I'; M= -7,-27,-17,-35,-27,  3,-34,-27, 33,-28, 16, 13,-20,-22,-21,-27,-16, -8, 22,-21, -2,-27;
/M: SY='P'; M= -3, -9,-29, -4, 13,-24,-18,-12,-16, -3,-16,-12,-10, 22,  2, -9, -4, -7,-18,-28,-20,  5;
/M: SY='K'; M= -1, -7,-26, -8,  0,-23,-17,-13,-17, 18,-21, -9, -5,  0,  2,  8, -4, -5,-12,-23,-13,  0;
/M: SY='G'; M= -5,  4,-28,  3, -9,-29, 39, -7,-35,-11,-29,-19, 12,-18, -9,-10,  2,-13,-29,-26,-24,-10;
/M: SY='E'; M= -5,  2,-17,  2, 11,-22,-18, -9,-17,  1,-15,-10, -2,-11,  6, -2,  5,  8,-11,-29,-14,  8;
/M: SY='F'; M=-12,-23,-24,-27,-18, 21,-26,-16,  0,-13,  3,  4,-19, -8,-20, -9,-16, -9,  0,-10,  6,-19;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-37,-29, 14,-35,-27, 34,-28, 19, 14,-23,-25,-26,-25,-19, -8, 28,-17,  3,-29;
/M: SY='M'; M= -4,-19, -3,-23,-21,-11, -4,-19, -2,-21,  1,  3,-15,-24,-15,-19,-10, -9,  0,-24,-11,-19;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-30,  6, 33,-27,-20, -7,-22,  4,-20,-16, -6, 15,  9, -3, -2, -7,-22,-29,-20, 20;
/M: SY='Y'; M=-16,-22,-26,-24,-20, 26,-29,  5,  7,-15,  7,  7,-21,-28,-14,-13,-19, -9, -1, 12, 50,-19;
/M: SY='V'; M= -1,-12,-10,-18,-15,-11,-22,-19,  3, -9, -3, -2, -9,-17,-14, -9, -5,  3,  8,-28,-12,-16;
/M: SY='G'; M=  0, -9,-29, -9,-17,-30, 63,-19,-39,-17,-30,-20,  0,-19,-18,-18,  1,-18,-29,-21,-29,-17;
/M: SY='E'; M= -7,  1,-26,  7, 30,-24,-20, -3,-20,  5,-15,-13, -4, -5,  8,  1, -3, -8,-16,-29,-16, 18;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-22,-29,-22, -1,-31,-21, 25,-17, 14, 13,-21,-24,-16,-14,-16, -6, 22,-20,  0,-21;
/M: SY='I'; M= -8,-18,-14,-21,-18, -6,-28,-18, 12,-13,  4,  5,-15,-22,-14, -9,-11, -3, 12,-23, -3,-19;
/M: SY='T'; M= -6, -6,-21, -7, -2,-10,-14,-11,-15, -5,-13, -9, -4, -6, -5, -3,  4,  8,-11,-24, -9, -4;
/M: SY='N'; M= -6,  3,-23,  3,  3,-17,-13,  1,-17,  0,-18,-11,  4,-15,  3,  1,  3, -3,-14,-25, -6,  2;
/M: SY='D'; M= -8,  8,-25, 12, 10,-24,-14,  1,-22,  1,-19,-14,  5, -8,  2, -4,  2, -4,-20,-27,-12,  6;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-23,  1, 16,-19,-20, -8,-14,  2,-13, -9, -3, -8,  6, -2,  0, -1,-11,-28,-14, 11;
/M: SY='A'; M=  8,-12,-19,-14,-13, -3,-17,-12, -1,-13, -1, -3,-13,-19,-14,-16, -6, -4,  2,-11,  3,-14;
/M: SY='D'; M=-11,  8,-27, 11, 10,-20,-17, -3,-23,  5,-18,-12,  4, -7,  4,  3, -3, -6,-20,-27,-12,  7;
/M: SY='K'; M= -8,  1,-25,  2, 11,-22,-18, -6,-20, 14,-19,-10,  1,-12,  7, 14, -1, -3,-15,-25,-11,  8;
/M: SY='R'; M=-14,  2,-27,  5,  4,-19,-18, -3,-20,  9,-12,-10,  2,-17,  4, 21, -6, -7,-17,-25, -9,  2;
/M: SY='P'; M= -6, -7,-26, -4,  0,-18, -6,-12,-15, -8,-13, -9, -8,  2, -6,-10, -4, -8,-13,-26,-16, -4;
/M: SY='R'; M= -6, -2,-20, -5, -2,-18,-12, -6,-19,  5,-14, -8,  0,-17,  0,  6, -6, -7,-16,-18, -9, -2;
/M: SY='N'; M= -6,  0,-24, -5, -5,-14,-12, -6, -8, -6,-11, -6,  4,-14, -3, -6, -3, -4,-10,-23, -6, -5;
/M: SY='Y'; M= -3, -9,-25,-10, -7, -4,-15,  0, -8, -8, -9, -5,-10,-19, -4,-11, -7, -7, -9, -3, 17, -8;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='D'; M= -8,  6,-23,  9,  6,-16, -9, -1,-18, -1,-13,-11,  3,-13,  2, -4, -2, -6,-17,-18, -2,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='R'; M= -2,  0,-14,  0, -2,-16, -9, -7,-15,  4,-15,-10,  1,-14, -2,  5,  0, -4, -9,-21, -9, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='Q'; M= -6, -1,-14, -2,  2,-13,-14, -5, -7, -1, -7, -3, -1,-11,  3, -1, -2, -3, -8,-18, -5,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='M'; M= -4, -4,-16, -6, -6,-10, -1, -5, -6, -7, -3,  1, -3,-14, -4, -7, -6, -7, -6,-12, -7, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='A'; M=  1, -6, -5, -8, -6,-10, -3,-11, -9, -7, -9, -7, -4,-12, -7, -7,  0, -2, -6,-16, -9, -7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='N'; M= -1, -1,-15, -3, -5,-10,  1, -5,-13, -4,-12, -6,  2, -8, -5, -6,  2,  0,-10,-17, -9, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M:         M= -2, -4, -7, -5, -2,-13, -2, -1,-13, -2,-12, -7, -2, -3, -3, -3,  0, -3,-10,-16, -9, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='Y'; M=-12,-17,-25,-18,-14, 14,-25,  4, -3,-10, -5, -3,-15,-21,-12, -8,-12, -8, -4,  5, 33,-15;
/M: SY='F'; M=-11,-25,-19,-30,-22, 26,-27,-15,  8,-23, 16, 10,-20,-22,-22,-16,-18, -8,  4,-11,  9,-21;
/M: SY='F'; M=-12,-26,-22,-31,-24, 37,-28,-13,  5,-22,  9,  4,-21,-24,-25,-18,-18, -8,  3,  6, 26,-24;
/M: SY='D'; M=-14, 21,-27, 24, 12,-25,-13, 11,-27,  4,-22,-14, 16,-14,  6,  4, -2, -9,-25,-31,-11,  8;
/M: SY='L'; M= -6,-20,-18,-23,-15, -4,-24,-18, 12,-21, 15,  7,-17,-19,-14,-18,-11, -1,  9,-25, -7,-16;
/M: SY='D'; M=-10,  9,-27, 11,  0,-20, -9,  1,-20, -3,-17,-12,  5,-12, -2, -6, -4, -8,-19,-20, -6, -2;
/M:         M=-10, -4,-27, -4, -3,-13, -7, -7,-18, -4,-13, -9, -2,-14, -4, -3, -7, -8,-18,-10, -7, -4;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='E'; M= -5, -2,-15, -2,  2,-10, -8, -4,-11,  0, -7, -3, -3, -4,  0, -3, -1,  0, -9,-16, -7,  1; D=0;
/I:         DM=-2;
/M: SY='D'; M=-10,  0,-10,  1,  0,-22,-14, -5,-20, -5,-15,-12, -2, -9, -3, -7, -4, -5,-16,-31,-15, -3;
/M: SY='Y'; M=-12,-23,-23,-26,-19, 15,-27, -8, 10,-20, 12,  6,-20,-26,-18,-16,-17, -8,  7, -6, 16,-20;
/M: SY='C'; M= -7,-14,  6,-17,-19,  2,-23,-13, -4,-18, -7, -7,-13,-26,-19,-17, -5, -1,  4,-18,  3,-20;
/M: SY='I'; M= -4,-28,-21,-34,-27,  1,-33,-27, 35,-26, 21, 17,-24,-24,-21,-24,-17, -7, 29,-23, -4,-26;
/M: SY='D'; M=-17, 44,-28, 58, 16,-36, -9,  0,-36,  1,-29,-27, 22,-11,  0, -7,  2, -6,-28,-39,-19,  8;
/M: SY='A'; M= 20, -6,-19, -8, -5,-24,  0,-15,-18, -7,-18,-13, -6,  0, -5,-12,  6, -2,-11,-25,-21, -6;
/M: SY='R'; M= -8, -5,-23, -7, -2,-15,-18, -8,-18,  9,-16, -8, -3, -8,  1, 14,  0,  6,-13,-22, -6, -2;
/M: SY='R'; M= -8, -2,-25, -3,  2,-15,-13, -1,-15,  3,-11, -5, -1,-17,  1,  4, -6, -8,-13,-21, -4,  0;
/M: SY='K'; M= -6, -9,-23,-12, -3,-11,-17, -8,-11,  8,-12, -2, -7,-16, -1,  8, -5, -3, -6,-19, -3, -3;
/M: SY='G'; M= -1, -8,-28, -8,-11,-27, 46,-15,-34,-13,-27,-18, -1,-18,-11,-13,  1,-15,-27,-20,-22,-12;
/M: SY='N'; M= -7, 24,-21, 15, -1,-23,  5,  0,-23, -2,-28,-19, 35,-15, -3, -3, 10, -1,-24,-36,-21, -2;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='W'; M=-11,-21,-25,-22,-17,  4,-25,-20, -1,-12, -1, -3,-20,-17,-16,-13,-18,-11, -3, 13,  5,-16;
/M: SY='A'; M= 14,-11,-15,-17,-14,-16,  8,-18,-11,-16, -8, -5, -7,-16,-12,-18,  5,  1, -5,-24,-17,-13;
/M: SY='R'; M=-12, -7,-23, -8,  0,-21,-18, -2,-28, 24,-22,-11,  0,-17,  7, 46, -4, -6,-18,-23,-11,  0;
/M: SY='F'; M=-18,-26,-24,-32,-25, 49,-30, -8,  4,-21,  9,  3,-19,-28,-25,-13,-20,-10, -1, 10, 38,-25;
/M: SY='I'; M= -2,-27,-16,-33,-26,  2,-31,-27, 28,-25, 15, 12,-22,-24,-22,-24,-14, -5, 26,-22, -4,-26;
/M: SY='N'; M= -8, 20,-15,  7, -2,-20, -6,  2,-22,  3,-27,-18, 35,-16,  0, 11,  6, -1,-24,-35,-19, -2;
/M: SY='H'; M=-14, -4,-28, -4, -2,-17,-18, 61,-27, -5,-20, -5,  5,-16,  5,  4, -6,-13,-24,-23, 10, -2;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-33; IM=0; DM=-33;
/M: SY='S'; M=  9,  0,-11,  0, -2,-22,  2,-12,-21,-10,-25,-18,  5,-12, -3,-10, 25,  9,-11,-35,-20, -3;
/M: SY='C'; M= -9,-17, 88,-25,-23,-17,-28,-24,-26,-23,-17,-17,-17,-34,-24,-24, -9, -9,-10,-43,-24,-23;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-24,  7, 14,-20,-15, -2,-20,  2,-19,-12,  6,-12,  9,  2,  4, -1,-18,-25,-11, 11;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-36, -5,  2,-30,-13,-18,-22, -9,-29,-20,-15, 68, -9,-18, -6, -9,-28,-30,-28, -7;
/M: SY='N'; M=-10, 33,-21, 18,  4,-21, -4,  7,-21,  1,-27,-19, 48,-18,  2,  1,  9,  2,-27,-38,-19,  3;
/M: SY='C'; M=  2,-18, 25,-23,-17,-10,-23,-19, -6,-20, -2, -4,-17,-26,-17,-20, -7, -6,  3,-31,-15,-17;
/M: SY='Y'; M= -8, -5,-23, -7,  3, -9,-21, -3, -8, -1, -9, -4, -4,-17,  2, -2, -4, -3, -8,-17,  4,  1;
/M: SY='V'; M=  1,-16,-16,-21,-17, -5,-20,-14,  8,-17,  8,  6,-12,-19,-15,-16, -9, -3,  9,-25, -8,-17;
/M: SY='R'; M= -8,-10,-23,-11, -3,-10,-20,-10, -5,  1, -5, -2, -8,-19, -3,  2, -8, -6, -2,-22, -5, -4;
/M: SY='F'; M= -5,-16,-20,-19,-13,  2,-22,-13, -3, -8, -5, -3,-11,-12,-13, -5, -6, -2,  2,-20, -3,-14;
/M: SY='V'; M= -3,-21,-14,-23,-16, -4,-25,-20,  9,-16,  2,  3,-21,-19,-18,-17,-11, -5, 15,-14, -7,-17;
/M:         M= -6, -8,-19,-11, -1, -5,-16, -5,-12, -5, -6, -3, -6,-18, -3, -3, -6, -5,-11,-17, -3, -2;
/M: SY='V'; M= -6,-12,-18,-16,-11,-11,-16,-13,  1,-13, -6,  0, -8,-17, -6,-13, -5, -4,  2,-23,-10, -9;
/M: SY='B'; M= -6, 10,-24, 10,  2,-22, -6, -5,-18, -6,-16,-12, 10,-12, -3, -8,  1, -4,-17,-31,-16, -1;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='G'; M= -5,  4,-25,  4, -5,-24, 21, -3,-27, -9,-23,-16,  8,-13, -8, -9,  1, -9,-23,-24,-17, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-20,  4,  8,-12,-14,  1,-16,  1,-11, -7,  2,-11,  4,  1, -2, -4,-14,-20, -6,  6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='N'; M= -5,  7,-17,  6,  0,-15,-10,  6,-13,  0,-15, -9,  8, -8, -1,  0,  1, -2,-12,-21, -6, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -4,-12,-15,-12, -7, -3,-14,-11,  3, -8,  1,  3,-11,  5, -8, -9, -8, -5,  1,-14, -6, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='R'; M=-13, -3,-24, -3,  0,-16,-13, 11,-21, 12,-16, -7,  2,-15,  7, 24, -6, -9,-18,-15, -1,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-22,-33,-25,  9,-31,-22, 29,-25, 20, 19,-21,-22,-19,-22,-18, -8, 21,-18,  1,-24; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='V'; M= -3,-22,-20,-25,-22,  0,-14,-15,  9,-18,  2,  5,-17,-23,-19,-16,-11, -8, 12,-17,  0,-21;
/M: SY='F'; M=-13,-29,-24,-35,-27, 25,-33,-20, 25,-27, 22, 14,-23,-26,-24,-23,-22, -9, 15, -9, 14,-27;
/M: SY='F'; M=-17,-20,-22,-25,-18, 30,-27, -6, -6, -8, -2, -2,-14,-25,-18,  1,-14, -6, -4,  0, 24,-18;
/M: SY='A'; M= 25, -9, -8,-16,-11,-15, -8,-19, -7,-12,-10, -8, -7,-13,-10,-16, 14, 12,  3,-27,-17,-10;
/M: SY='L'; M= -6,-12,-20,-15,-10,-10,-22,-15,  0, -3,  2,  2, -9,-19, -7,  1, -6,  2,  2,-25, -8,-10;
/M: SY='R'; M=-12, -4,-28, -4,  6,-20,-18, -6,-25, 24,-19, -9, -2,-15,  7, 33, -8, -8,-18,-21,-10,  5;
/M: SY='D'; M= -9,  7,-29, 12,  3,-24,-14, -7,-24,  1,-23,-17,  2, 10, -3, -2, -3, -6,-21,-29,-16, -2;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-28,-39,-29,  1,-38,-29, 46,-29, 22, 20,-21,-21,-20,-28,-20,-10, 29,-20,  0,-29;
/M: SY='K'; M= -2, -5,-25, -5,  3,-16,-17,-10,-17,  6,-17,-11, -5, -2, -1,  4, -2, -4,-13,-22,-10,  0;
/M: SY='P'; M=  2,-11,-27,-11,  1,-21,-18,-14,-13,  2,-17,-10,-11, 13, -2, -3, -5, -5,-12,-22,-13, -3;
/M: SY='G'; M= -4,  3,-27,  4, -8,-28, 40,-12,-34,-13,-28,-20,  9,-17,-12,-13,  4,-13,-27,-27,-25,-10;
/M: SY='E'; M= -6,  8,-26, 12, 38,-27,-16,  0,-26,  5,-19,-16,  3, -4, 16, -2,  4, -1,-24,-30,-17, 27;
/M: SY='E'; M=-10,  8,-30, 17, 53,-30,-17, -1,-30,  8,-21,-19, -1,  2, 19, -1,  0,-10,-30,-29,-20, 36;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-24,  7,-33,-22, 30,-29, 36, 19,-26,-27,-20,-23,-25, -9, 18,-19,  3,-24;
/M: SY='T'; M= -3,-10,-10,-16,-14, -4,-20,-18, -3,-14, -1, -3, -8,-17,-13,-11,  7, 23,  3,-27, -7,-13;
/M: SY='F'; M=-13,-26,-21,-31,-25, 23,-28,-16, 15,-23, 13, 10,-21,-27,-23,-20,-19, -9, 10, -5, 17,-25;
/M: SY='D'; M=-14, 19,-29, 28,  5,-22,-11, -6,-30, -4,-25,-22,  6,-11, -5, -8, -1, -5,-24,-13,-10,  1;
/M: SY='Y'; M=-19,-24,-31,-25,-22, 30,-28,  8, -1,-14,  1,  0,-23,-30,-14,-13,-23,-13,-10, 40, 64,-21;
/M: SY='N'; M= -4,  5,-20,  3, -1,-26,  8, -8,-25,  0,-25,-15, 10,-16,  0, -3,  5, -5,-20,-29,-19, -1;
/M: SY='Y'; M= -9, -9,-25, -9,-11,  1,-12, -9,-14,-11,-11,-10, -8,-19,-12, -7, -6, -6,-12,  1,  7,-11;
/M: SY='D'; M= -8, 15,-25, 22, 12,-24,-10, -6,-25, -2,-22,-19,  7, -5, -1, -6,  2, -5,-19,-32,-18,  5;
/M: SY='Y'; M=-13,-11,-26,-10,-13,  7,-21, -8, -5,-11, -4, -5,-11,-19,-13,-10,-11, -7, -6, -3, 15,-14;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-25, -6,  1,-10,-13, -3,-15, -3,-13, -9, -4,-16, -3, -4, -4, -7,-14,-12, -2, -2;
/I:         E1=0;
Numerical results
  • UniProtKB/Swiss-Prot release number: 2013_05, total number of sequence entries in that release: 540052.
  • Total number of hits in UniProtKB/Swiss-Prot: 298 hits in 298 different sequences
  • Number of hits on proteins that are known to belong to the set under consideration: 298 hits in 298 different sequences
  • Number of hits on proteins that could potentially belong to the set under consideration: 0 hits in 0 different sequences
  • Number of false hits (on unrelated proteins): 0 hits in 0 different sequences
  • Number of known missed hits: 42
  • Number of partial sequences which belong to the set under consideration, but which are not hit by the pattern or profile because they are partial (fragment) sequences: 0
  • Precision (true hits / (true hits + false positives)): 100.00 %
  • Recall (true hits / (true hits + false negatives)): 87.65 %
Comments
  • MATRIX_TYPE: protein_domain
  • Scaling database: UniProtKB/Swiss-Prot: reversed
  • Matrix author: K_Hofmann, N_Hulo
  • Taxonomic range: Eukaryotes, Eukaryotic viruses
  • Maximum known number of repetitions of the pattern in a single protein: 1
  • FT_KEY: DOMAIN
  • FT_DESC: SET
  • VERSION: 2
Cross-references
UniProtKB/Swiss-Prot True positive hits:
ASH1L_HUMAN (Q9NR48), ASH1L_MOUSE (Q99MY8), ASH1_DROME  (Q9VW15), 
ASHH1_ARATH (Q84WW6), ASHH2_ARATH (Q2LAE1), ASHH3_ARATH (Q945S8), 
ASHH4_ARATH (Q9M1X9), ASHR1_ARATH (Q7XJS0), ASHR2_ARATH (Q9ZUM9), 
ASHR3_ARATH (Q949T8), ATX1_ARATH  (Q9C5X4), ATX2_ARATH  (P0CB22), 
ATX3_ARATH  (Q9M364), ATX4_ARATH  (Q9SUE7), ATX5_ARATH  (Q8GZ42), 
ATXR2_ARATH (Q5PP37), ATXR3_ARATH (O23372), ATXR4_ARATH (Q9FG08), 
ATXR5_ARATH (Q8VZJ1), ATXR6_ARATH (Q9FNE9), C1716_DROME (Q9VYD1), 
CLF_ARATH   (P93831), CLR4_SCHPO  (O60016), DIM5_NEUCR  (Q8X225), 
EHMT1_HUMAN (Q9H9B1), EHMT1_MOUSE (Q5DW34), EHMT2_HUMAN (Q96KQ7), 
EHMT2_MOUSE (Q9Z148), EZ1_MAIZE   (Q8S4P6), EZ2_MAIZE   (Q8S4P5), 
EZ3_MAIZE   (Q8S4P4), EZA1_ARATH  (Q9ZSM8), EZH1_BOVIN  (A7E2Z2), 
EZH1_HUMAN  (Q92800), EZH1_MOUSE  (P70351), EZH1_PONAB  (Q5RDS6), 
EZH2A_XENLA (Q98SM3), EZH2B_XENLA (Q4V863), EZH2_DANRE  (Q08BS4), 
EZH2_HUMAN  (Q15910), EZH2_MACFA  (Q4R381), EZH2_MOUSE  (Q61188), 
EZH2_XENTR  (Q28D84), EZ_DROME    (P42124), HKNMT_PLAF7 (C6KTD2), 
LIN59_CAEEL (O44757), MEDEA_ARATH (O65312), MES2_CAEEL  (O17514), 
MES4_CAEEL  (Q9NH52), MES4_DROME  (Q8MT36), MET2_CAEEL  (P34544), 
MLL1_HUMAN  (Q03164), MLL1_MOUSE  (P55200), MLL2_HUMAN  (O14686), 
MLL2_MOUSE  (Q6PDK2), MLL3_HUMAN  (Q8NEZ4), MLL3_MOUSE  (Q8BRH4), 
MLL4_HUMAN  (Q9UMN6), MLL4_MOUSE  (O08550), MLL5_HUMAN  (Q8IZD2), 
MLL5_MOUSE  (Q3UG20), MSTAA_DROME (O46040), MSTAB_DROME (P83501), 
NSD1_HUMAN  (Q96L73), NSD1_MOUSE  (O88491), NSD2_HUMAN  (O96028), 
NSD2_MOUSE  (Q8BVE8), NSD3_HUMAN  (Q9BZ95), NSD3_MOUSE  (Q6P2L6), 
PRD10_DANRE (A2BID7), PRD10_XENTR (B4F6U4), PRD11_HUMAN (Q9NQV5), 
PRD11_MOUSE (A2AGX3), PRD12_HUMAN (Q9H4Q4), PRD12_MOUSE (A2AJ77), 
PRD13_HUMAN (Q9H4Q3), PRD13_MOUSE (E9PZZ1), PRD14_HUMAN (Q9GZV8), 
PRD14_MOUSE (E9Q3T6), PRD15_HUMAN (P57071), PRD16_HUMAN (Q9HAZ2), 
PRD16_MOUSE (A2A935), PRDM1_HUMAN (O75626), PRDM1_MOUSE (Q60636), 
PRDM2_HUMAN (Q13029), PRDM2_RAT   (Q63755), PRDM4_HUMAN (Q9UKN5), 
PRDM4_MOUSE (Q80V63), PRDM4_PONAB (Q5R5M1), PRDM4_RAT   (Q9QZP2), 
PRDM5_HUMAN (Q9NQX1), PRDM5_MOUSE (Q9CXE0), PRDM6_BOVIN (A6QPM3), 
PRDM6_HUMAN (Q9NQX0), PRDM6_MOUSE (Q3UZD5), PRDM7_HUMAN (Q9NQW5), 
PRDM9_DANRE (Q6P2A1), PRDM9_HUMAN (Q9NQV7), PRDM9_MOUSE (Q96EQ9), 
PRDM9_RAT   (P0C6Y7), S421A_XENLA (Q6GP17), S421B_XENLA (Q5RJX8), 
SDG41_ARATH (Q3ECY6), SE1BA_DANRE (Q1LY77), SET1A_HUMAN (O15047), 
SET1B_CHICK (Q5F3P8), SET1B_HUMAN (Q9UPS6), SET1B_MOUSE (Q8CFT2), 
SET1B_XENLA (Q66J90), SET1B_XENTR (Q08D57), SET1_ASHGO  (Q75D88), 
SET1_ASPFU  (Q4WNH8), SET1_ASPOR  (Q2UMH3), SET1_CAEEL  (Q22795), 
SET1_CANAL  (Q5ABG1), SET1_CANGA  (Q6FKB1), SET1_CHAGB  (Q2GWF3), 
SET1_COCIM  (Q1DR06), SET1_CRYNB  (P0CO27), SET1_CRYNJ  (P0CO26), 
SET1_DEBHA  (Q6BKL7), SET1_DICDI  (Q54HS3), SET1_EMENI  (Q5B0Y5), 
SET1_GIBZE  (Q4I5R3), SET1_KLULA  (Q6CIT4), SET1_NEUCR  (Q8X0S9), 
SET1_SCHPO  (Q9Y7R4), SET1_USTMA  (Q4PB36), SET1_YARLI  (Q6CEK8), 
SET1_YEAST  (P38827), SET23_CAEBR (A8XI75), SET23_CAEEL (Q95Y12), 
SET2_ASHGO  (Q757Y8), SET2_ASPFU  (Q4WTT2), SET2_ASPOR  (Q2UTN6), 
SET2_CAEEL  (Q18221), SET2_CANAL  (Q59XV0), SET2_CANGA  (Q6FX50), 
SET2_CHAGB  (Q2H988), SET2_COCIM  (Q1DU03), SET2_CRYNB  (P0CO29), 
SET2_CRYNJ  (P0CO28), SET2_DEBHA  (Q6BM04), SET2_EMENI  (Q5ASA5), 
SET2_GIBZE  (Q4IB50), SET2_KLULA  (Q6CXP5), SET2_NEUCR  (Q7RZU4), 
SET2_SCHPO  (O14026), SET2_USTMA  (Q4PBL3), SET2_YARLI  (Q6C5G5), 
SET2_YEAST  (P46995), SET3_CAEEL  (P34318), SET3_SCHPO  (Q10362), 
SET3_YEAST  (P36124), SET4_YEAST  (P42948), SET5_ASHGO  (Q75BF1), 
SET5_CANAL  (Q5A1M3), SET5_CANGA  (Q6FTT0), SET5_CRYNB  (P0CR43), 
SET5_CRYNJ  (P0CR42), SET5_DEBHA  (Q6BSV3), SET5_KLULA  (Q6CX91), 
SET5_PICGU  (A5DQN2), SET5_PICST  (A3M0J3), SET5_SCHPO  (O74467), 
SET5_USTMA  (Q4PBP5), SET5_VANPO  (A7TPV3), SET5_YARLI  (Q6C9E7), 
SET5_YEAS7  (A6ZTB4), SET5_YEAST  (P38890), SET6_SCHPO  (O94256), 
SET6_YEAST  (Q12529), SET7_SCHPO  (Q9Y7Q6), SET8A_DANRE (Q071E0), 
SET8A_XENLA (Q08AY6), SET8B_XENLA (Q498E6), SET9_ASPFU  (Q4X1W8), 
SET9_ASPOR  (Q2TZH4), SET9_ASPTN  (Q0C9E6), SET9_CHAGB  (Q2H8D5), 
SET9_COCIM  (Q1E9C0), SET9_EMENI  (Q5AZY3), SET9_GIBZE  (Q4I8C9), 
SET9_NEUCR  (Q7SBJ9), SET9_PHANO  (Q0U3A4), SET9_SCHPO  (Q9USK2), 
SET9_YARLI  (Q6C519), SETB1_DROME (Q32KD2), SETB1_DROPS (Q28Z18), 
SETB1_HUMAN (Q15047), SETB1_MOUSE (O88974), SETB1_XENLA (Q6INA9), 
SETB2_DANRE (Q06ZW3), SETB2_HUMAN (Q96T68), SETB2_MOUSE (Q8C267), 
SETB2_XENLA (Q6YI93), SETB2_XENTR (A4IGY9), SETD2_HUMAN (Q9BYW2), 
SETD5_HUMAN (Q9C0A6), SETD5_MOUSE (Q5XJV7), SETD7_DANRE (Q6DHG0), 
SETD7_HALRO (Q7Z0G7), SETD7_HUMAN (Q8WTS6), SETD7_MOUSE (Q8VHL1), 
SETD7_XENTR (Q4QQN5), SETD8_BOVIN (Q2YDJ8), SETD8_DROME (Q9VFK6), 
SETD8_DROPS (Q297V5), SETD8_HUMAN (Q9NQR1), SETD8_MOUSE (Q2YDW7), 
SETD8_XENTR (Q0V9E9), SETMR_BOVIN (Q0VD24), SETMR_HUMAN (Q53H47), 
SETMR_MOUSE (Q80UJ9), SETMR_RAT   (Q5I0M0), SMY2A_DANRE (Q5BJI7), 
SMY2A_XENLA (Q7ZXV5), SMY2B_DANRE (Q5RGL7), SMY2B_XENLA (Q6GN68), 
SMYD1_HUMAN (Q8NB12), SMYD1_MOUSE (P97443), SMYD2_BOVIN (Q0P585), 
SMYD2_CHICK (E1C5V0), SMYD2_HUMAN (Q9NRG4), SMYD2_MOUSE (Q8R5A0), 
SMYD2_PIG   (C3RZA1), SMYD2_RAT   (Q7M6Z3), SMYD3_HUMAN (Q9H7B4), 
SMYD3_MOUSE (Q9CWR2), SMYD4_CHICK (Q5F3V0), SMYD4_HUMAN (Q8IYR2), 
SMYD4_MOUSE (Q8BTK5), SMYD4_PONAB (Q5R5X9), SMYD5_CHICK (Q5ZIZ2), 
SMYD5_HUMAN (Q6GMV2), SMYD5_MOUSE (Q3TYX3), SMYD5_XENLA (Q6GPQ4), 
STB1A_DANRE (Q1L8U8), STB1B_DANRE (Q08BR4), SUV39_DROME (P45975), 
SUV39_DROPS (Q294B9), SUV42_CAEBR (A8WTV9), SUV42_CAEEL (Q09265), 
SUV42_DROME (Q9W5E0), SUV91_BOVIN (Q2NL30), SUV91_HUMAN (O43463), 
SUV91_MOUSE (O54864), SUV91_PONAB (Q5RB81), SUV91_XENLA (Q6NRE8), 
SUV92_BOVIN (Q32PH7), SUV92_CHICK (Q5F3W5), SUV92_HUMAN (Q9H5I1), 
SUV92_MACFA (Q4R3E0), SUV92_MOUSE (Q9EQQ0), SUV92_XENTR (Q28CQ7), 
SUVH1_ARATH (Q9FF80), SUVH1_TOBAC (Q93YF5), SUVH2_ARATH (O22781), 
SUVH3_ARATH (Q9C5P4), SUVH3_CHLRE (Q5QD03), SUVH4_ARATH (Q8GZB6), 
SUVH5_ARATH (O82175), SUVH6_ARATH (Q8VZ17), SUVH7_ARATH (Q9C5P1), 
SUVH8_ARATH (Q9C5P0), SUVH9_ARATH (Q9T0G7), SUVHA_ARATH (Q3EC60), 
SUVR1_ARATH (Q946J2), SUVR2_ARATH (Q9FNC7), SUVR3_ARATH (Q9SRV2), 
SUVR4_ARATH (Q8W595), SUVR5_ARATH (O64827), SV421_BOVIN (Q29RP8), 
SV421_DANRE (Q5U3H2), SV421_HUMAN (Q4FZB7), SV421_MOUSE (Q3U8K7), 
SV421_RAT   (P0C2N5), SV422_HUMAN (Q86Y97), SV422_MOUSE (Q6Q783), 
SV422_RAT   (P0C2N6), SV422_XENLA (A0JMZ4), SV91A_DANRE (Q6DGD3), 
TRR_DROME   (Q8IRW8), TRX_DROME   (P20659), TRX_DROVI   (Q24742), 
TTL12_CAEBR (A8XXC0), TTL12_CAEEL (Q09512), Y1806_PHANO (P0CY36), 
Y2140_DICDI (Q54DL6), Y2454_DICDI (Q54D67), Y3443_DICDI (Q54R14), 
Y3589_DICDI (Q557F7), Y3591_DICDI (Q557F6), Y4059_DICDI (Q54Q80), 
Y7331_DICDI (Q54ZX8), Y8495_DICDI (Q54IV4), YL222_MIMIV (Q5UQB9), 
YL678_MIMIV (Q5UNT8)
False negative hits (sequences which belong to the set under consideration, but which have not been picked up by the pattern or profile):
EFM1_YEAST  (P38732), PRD10_HUMAN (Q9NQV6), PRD10_MOUSE (Q3UTQ7), 
PRD10_PONAB (Q5RAX9), PRDM8_HUMAN (Q9NQV8), PRDM8_MOUSE (Q8BZ97), 
RBCMT_ARATH (Q9XI84), RBCMT_PEA   (Q43088), RBCMT_TOBAC (P94026), 
RKM3_YEAST  (P38222), RKM4_SCHPO  (Q9P6L2), RKM4_YEAST  (Q12504), 
SDG40_ARATH (Q6NQJ8), SET10_SCHPO (O74738), SET11_SCHPO (O74405), 
SET8_SCHPO  (O14135), SETD3_CALJA (B0VX69), SETD3_CALMO (B1MTJ4), 
SETD3_CANFA (E2RBS6), SETD3_CHICK (Q5ZML9), SETD3_DANRE (Q7SXS7), 
SETD3_DASNO (C1FXW2), SETD3_HUMAN (Q86TU7), SETD3_MOUSE (Q91WC0), 
SETD3_OTOGA (B5FW36), SETD3_PAPAN (A9X1D0), SETD3_RHIFE (B2KI88), 
SETD3_XENTR (B7ZUF3), SETD4_HUMAN (Q9NVD3), SETD4_MOUSE (P58467), 
SETD6_BOVIN (E1BI64), SETD6_CHICK (Q5ZK17), SETD6_DANRE (Q803K4), 
SETD6_HUMAN (Q8TBK2), SETD6_MOUSE (Q9CWY3), SETD6_RAT   (D3ZSK5), 
SETD6_SALSA (C0H8I2), SETD6_XENLA (Q6INM2), SETD6_XENTR (A4QNG5), 
SETD9_HUMAN (Q8NE22), SETD9_PONAB (Q5RBW0), YBD1_SCHPO  (O42925)
Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:

[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color] [Clustal format, plain text] [Fasta format]

Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]
1H3I; 1ML9; 1MT6; 1MUF; 1MVH; 1MVX; 1N6A; 1N6C; 1O9S; 1PEG; 1XQH; 1ZKK; 2BQZ; 2C6V; 2F69; 2IGQ; 2JV0; 2O8J; 2QPW; 2R3A; 2RFI; 2W5Y; 2W5Z; 3BO5; 3CBM; 3CBO; 3CBP; 3DAL; 3EP0; 3F9W; 3F9X; 3F9Y; 3F9Z; 3FPD; 3HNA; 3K5K; 3M53; 3M54; 3M55; 3M56; 3M57; 3M58; 3M59; 3M5A; 3MEK; 3MO0; 3MO2; 3MO5; 3N71; 3OOI; 3OPE; 3OS5; 3OXF; 3OXG; 3OXL; 3PDN; 3QWP; 3QWV; 3QWW; 3RAY; 3RIB; 3RJW; 3RQ4; 3RU0; 3S7B; 3S7D; 3S7F; 3S7J; 3S8P; 3SW9; 3SWC; 3TG4; 3TG5; 4E47; 4FMU; 4H12; 4I51; 4IJ8; 4IJD;

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)


If you would like to retrieve all the Swiss-Prot entries referenced in the DR lines of this entry (with the exception of false positive hits) , you can enter a file name. These entries will then be saved to a file under this name. (Please note that this temporary file will only be kept for 1 week.)

File name:

Format: Swiss-Prot Fasta

or