ID   TPR_REGION; MATRIX.
AC   PS50293;
DT   01-JAN-2004 CREATED; 01-JAN-2004 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
DE   TPR repeat region circular profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=34; TOPOLOGY=CIRCULAR;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=31;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.2877; R2=0.03368536; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=185; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=126; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='R?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-10;
MA   /I: I=-10; B1=0; E1=0; MI=-10; IM=-10;
MA   /M: SY='A'; M=8,-13,-19,-16,-11,-11,-12,-16,-4,-13,-7,-5,-11,-6,-12,-16,-1,-2,-1,-21,-10,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-7,1,-25,2,6,-18,-16,-5,-15,1,-13,-9,-1,-12,2,-1,-3,-5,-14,-23,-8,3;
MA   /M: SY='A'; M=13,-15,-13,-20,-14,-9,-12,-19,0,-16,-1,-3,-13,-15,-14,-18,-1,0,4,-22,-10,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-13,-21,-27,-22,-16,8,-25,0,-2,-13,5,2,-18,-25,-11,-10,-20,-12,-8,14,23,-15;
MA   /M: SY='Y'; M=-8,-12,-18,-17,-13,4,-20,-6,-2,-12,0,-1,-8,-22,-11,-10,-9,-4,-4,-13,9,-13;
MA   /M: SY='N'; M=-7,4,-22,-2,-3,-15,-9,-2,-15,-1,-14,-9,11,-18,-1,1,-2,-5,-16,-24,-10,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-21,-23,-23,-14,0,-26,-14,8,-11,18,10,-18,-23,-10,-3,-19,-8,3,-18,0,-13;
MA   /M: SY='G'; M=17,-10,-21,-14,-15,-24,37,-19,-26,-16,-21,-15,-4,-16,-15,-19,5,-10,-16,-21,-25,-15;
MA   /M: M=-4,-5,-20,-9,-5,-12,-18,-6,-6,-7,-4,-2,-3,-18,-4,-6,-5,-4,-6,-23,-7,-5;
MA   /M: SY='V'; M=3,-17,-5,-22,-15,-6,-21,-19,5,-17,4,2,-14,-21,-14,-17,-6,-2,7,-25,-9,-16;
MA   /M: SY='Y'; M=-12,-17,-23,-19,-13,12,-25,6,-3,-13,6,2,-15,-25,-9,-9,-16,-9,-8,0,29,-13;
MA   /M: SY='Y'; M=-7,-13,-21,-16,-8,1,-21,-7,-3,-9,1,1,-11,-20,-7,-7,-10,-6,-4,-14,4,-8;
MA   /M: SY='K'; M=-4,0,-24,0,6,-21,-14,-4,-18,7,-16,-8,1,-14,6,5,-2,-5,-15,-24,-10,5;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-10,-21,-13,-3,-11,-20,-8,-3,-5,4,4,-8,-18,1,-4,-9,-5,-6,-23,-7,-2;
MA   /M: SY='G'; M=-5,1,-27,1,-1,-28,24,-8,-32,-1,-27,-17,6,-16,-3,-4,0,-12,-26,-24,-21,-3;
MA   /I: I=-15; MI=-15; MD=-15; IM=-15; DM=-15;
MA   /M: SY='D'; M=-12,14,-27,17,15,-27,-15,1,-26,11,-22,-13,11,-12,10,9,-2,-8,-23,-29,-13,12;
MA   /M: SY='Y'; M=-14,-18,-25,-20,-15,14,-26,-1,-1,-13,1,0,-15,-19,-13,-12,-15,-8,-6,1,25,-15;
MA   /M: SY='E'; M=-5,10,-25,14,15,-27,-13,-4,-24,5,-20,-15,4,-8,6,0,1,-5,-19,-29,-15,10;
MA   /M: SY='E'; M=-7,3,-26,6,17,-25,-15,-3,-22,10,-17,-11,1,-10,11,6,-2,-7,-20,-26,-13,13;
MA   /M: SY='A'; M=41,-10,-8,-18,-10,-19,0,-19,-11,-11,-12,-11,-9,-12,-10,-19,11,1,-1,-22,-20,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-22,-21,-10,-4,-27,-16,11,-13,12,8,-17,-20,-10,-12,-14,-7,7,-21,-4,-11;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-25,6,13,-24,-15,-4,-21,8,-19,-12,2,-9,8,4,0,-5,-18,-26,-13,10;
MA   /M: SY='Y'; M=-5,-8,-12,-9,-9,-3,-20,-3,-8,-12,-4,-4,-9,-21,-10,-13,-7,-5,-7,-16,6,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-24,-16,-29,-23,31,-28,-7,3,-22,10,3,-21,-28,-22,-17,-19,-10,-1,5,31,-23;
MA   /M: SY='E'; M=-8,5,-24,5,13,-23,-16,-2,-21,7,-17,-11,5,-12,11,6,1,-3,-19,-26,-12,11;
MA   /M: SY='K'; M=-8,0,-26,0,12,-24,-18,-4,-22,17,-19,-9,0,-12,12,16,-4,-6,-19,-23,-11,11;
MA   /M: SY='A'; M=26,-14,-9,-21,-14,-13,-7,-20,-4,-14,-4,-5,-13,-16,-14,-19,3,-1,4,-22,-15,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-25,-20,-28,-19,3,-29,-18,19,-22,25,14,-22,-24,-16,-17,-19,-7,12,-20,0,-19;
MA   /M: SY='E'; M=-5,4,-24,5,14,-24,-15,-4,-21,8,-19,-12,3,-11,9,6,1,-3,-18,-26,-13,11;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-18,-21,-21,-14,-2,-25,-14,10,-15,15,9,-16,-22,-11,-12,-15,-6,6,-21,-2,-13;
MA   /M: SY='B'; M=-7,12,-21,12,4,-18,-11,-2,-21,-1,-18,-14,10,-15,0,-4,1,-4,-18,-27,-10,1;
MA   /M: SY='P'; M=-8,-10,-32,-4,3,-27,-16,-13,-21,-2,-26,-16,-9,43,-3,-9,-4,-7,-24,-28,-23,-3;
MA   /M: SY='B'; M=-8,11,-23,11,8,-22,-10,0,-23,3,-21,-14,11,-12,4,1,3,-2,-20,-28,-12,5;
MA   /M: SY='N'; M=-10,8,-20,5,-1,-10,-14,4,-16,-7,-15,-11,10,-17,-4,-7,-1,-4,-16,-25,-4,-3;
PP   /DEMOTED_BY: PS51375;
CC   /MATRIX_TYPE=repeat_region;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann, N_Hulo;
CC   /VERSION=4;
PR   PRU00339;
DO   PDOC50005;
//