ID RDRP_SSRNA_NEG_SEG; MATRIX. AC PS50525; DT 01-NOV-2005 CREATED; 13-FEB-2019 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE RdRp of negative ssRNA viruses with segmented genomes catalytic domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=193; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=186; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5244743; R2=0.0084245; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=18282.5078125; R2=13.3647604; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=829; H_SCORE=29362; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=591; H_SCORE=26181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-80; I=-80; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='N'; M=17,-21,20,-7,-23,-12,-11,-15,-4,-9,-13,23,-22,-6,17,14,7,-4,-36,-19; MA /M: SY='R'; M=1,-26,-16,-9,-21,-1,21,-2,15,-12,20,-7,-21,13,27,3,3,-4,-30,-12; MA /M: SY='K'; M=-16,-31,-9,5,-31,-24,-9,-32,61,-30,-18,-2,-18,8,42,-10,-11,-27,-25,-17; MA /M: SY='M'; M=-15,-26,9,15,7,-24,-8,-7,-5,9,35,8,-21,22,3,-10,6,-10,-27,-8; MA /M: SY='C'; M=-3,39,-17,-4,21,-23,-17,16,-18,11,14,15,-27,-16,-22,-2,-8,8,-26,-7; MA /M: SY='G'; M=5,-23,-11,1,-24,28,-17,-2,1,-18,-14,9,-20,-8,4,14,5,4,-32,-21; MA /M: SY='D'; M=-14,29,31,-7,-20,-19,-10,7,3,-10,24,28,-24,-9,2,-1,-7,2,-39,-17; MA /M: SY='K'; M=-7,-25,12,10,-27,-13,12,-26,30,-16,-17,13,-17,17,3,28,-2,-23,-32,-16; MA /M: SY='G'; M=-2,-27,-12,1,10,23,12,-16,-8,-14,10,8,-23,8,4,2,-11,-8,-17,23; MA /M: SY='W'; M=7,-27,29,4,4,-18,17,-15,3,-15,5,9,-23,10,-10,-8,-11,-5,41,13; MA /M: SY='T'; M=-10,-20,-20,-18,9,-3,-22,1,-4,14,-2,-13,12,-18,-18,-5,34,12,-28,-11; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; MA /M: SY='C'; M=-25,18,-46,-44,5,-13,-36,6,-40,-1,10,-39,-45,-39,-41,-33,-25,17,-34,5; D=-15; MA /I: I=-15; DM=-47; MA /M: SY='C'; M=5,49,-9,12,-22,-17,-14,-27,-12,-26,-22,9,-23,-9,-19,22,15,-19,-32,4; D=-15; MA /I: I=-15; DM=-47; MA /M: SY='I'; M=-13,25,-28,-27,-2,-34,-25,33,-24,22,6,-21,-27,-23,-27,-13,22,23,-26,7; MA /M: SY='S'; M=3,-16,-6,-10,-25,-5,-12,-23,-9,-27,-20,16,-16,-4,-14,52,31,-15,-37,-19; MA /M: SY='G'; M=18,-25,31,-9,-24,42,-14,-27,-15,-25,0,-2,-20,-12,-21,6,-11,-21,-27,2; MA /M: SY='D'; M=-20,-33,83,17,-40,-17,-6,-39,-7,-37,-36,13,-19,-7,-16,-8,-10,-35,-56,-23; MA /M: SY='N'; M=28,-21,-5,-6,-27,-8,35,-21,-6,-20,9,38,-21,24,-9,1,-6,-17,-35,-15; MA /M: SY='S'; M=7,-18,-7,5,-26,-8,-13,-23,-5,-26,-20,1,-15,-2,2,47,29,-15,-35,-19; MA /M: SY='K'; M=-15,-29,-7,6,-31,-22,-10,-32,66,-31,-18,0,-15,8,24,-9,-10,-27,-25,-18; MA /M: SY='W'; M=-28,-49,-51,-32,23,-27,-42,-22,-25,-19,-22,-45,-32,-25,-27,-33,-37,-35,147,32; MA /M: SY='N'; M=-5,-20,3,-12,-30,28,-4,-30,-6,-35,-24,58,-22,-5,-13,29,1,-28,-39,-24; MA /M: SY='P'; M=15,-31,-3,35,-36,-17,-11,-27,-2,-27,-18,-12,51,35,-9,-5,-11,-23,-29,-25; MA /M: SY='C'; M=-7,63,-16,-17,-25,30,-17,-9,-11,-19,3,8,-24,6,0,13,2,-15,-34,-22; MA /I: I=-24; MI=0; MD=-77; IM=0; DM=-77; MA /M: SY='H'; M=-16,-27,4,-8,-11,-27,63,-3,-13,18,36,-9,-25,22,-11,-15,-15,0,-35,-2; MA /M: SY='C'; M=-15,64,8,-12,10,-20,31,-19,-13,-7,-11,20,-28,8,-16,1,4,-18,-24,22; MA /M: SY='P'; M=-13,26,-23,-16,-12,-24,-18,-5,-18,-16,-12,-23,71,-20,-25,-3,-8,12,-21,22; MA /M: SY='K'; M=9,-23,12,20,-4,-15,-12,-25,24,-24,-19,-3,-16,0,11,19,11,-18,-29,-15; MA /M: SY='Y'; M=7,-24,-22,-13,26,-24,-11,-4,25,7,13,-16,-25,-10,-3,-13,-11,2,-10,30; MA /M: SY='F'; M=-24,-25,-38,-34,70,-35,-16,18,-28,10,30,-28,-34,-31,-26,-25,-17,2,1,33; MA /M: SY='W'; M=1,-25,-30,-21,-4,-27,-19,17,-12,28,30,-23,-28,-13,15,-6,-12,3,49,-6; MA /M: SY='A'; M=26,25,-23,-19,-14,2,-21,4,-15,16,-2,-16,-25,-14,0,4,3,-2,-29,-17; MA /M: SY='M'; M=-16,-23,-37,-30,28,-34,-19,31,-25,24,56,-27,-29,-21,-25,-24,-12,22,-20,1; MA /M: SY='W'; M=5,-22,-33,-25,0,-27,-21,14,-24,37,34,-27,-28,-19,-24,-17,1,5,50,-5; MA /M: SY='C'; M=2,40,-18,-10,-19,-21,-13,-7,-7,-1,26,-10,-22,27,5,6,21,0,-32,-15; MA /I: I=-18; MD=-57; MA /M: SY='N'; M=-18,-31,-8,11,-12,-25,14,-14,-4,-14,22,26,-27,11,15,-13,-14,-7,-24,24; D=-18; MA /I: I=-18; MD=-57; MA /M: SY='L'; M=-24,-30,-38,-31,31,-39,-28,24,-31,31,6,-35,26,-30,-33,-29,-18,4,-20,-3; D=-18; MA /I: I=-18; MD=-57; MA /M: SY='T'; M=-15,-26,-20,-7,-9,-6,17,11,-20,13,-3,-15,-24,-17,-24,-9,27,-3,-29,9; D=-18; MA /I: I=-18; MD=-57; MA /M: SY='L'; M=-38,-47,-37,-10,-5,-52,-36,-9,3,4,-18,-37,-45,-26,-4,-39,-34,-23,-42,-27; D=-18; MA /I: I=-18; MI=-57; MD=-57; IM=-57; DM=-57; MA /M: SY='D'; M=-35,-45,27,-18,-46,-39,-29,-41,-7,-29,-37,1,-40,-25,-7,-23,3,-39,-60,-39; D=-18; MA /I: I=-18; DM=-57; MA /M: SY='P'; M=-8,-26,17,-7,-21,4,-11,-18,-10,-24,-17,12,38,7,-17,19,16,-7,-29,7; MA /M: SY='P'; M=-11,-33,6,-3,-35,16,-15,-29,10,-32,-21,-8,65,19,-10,4,1,-28,-31,-26; MA /M: SY='D'; M=-16,-29,32,31,6,-28,-10,3,-8,5,12,-10,-21,12,-13,-14,-12,-1,-24,8; MA /M: SY='W'; M=-22,-35,-8,-21,12,-30,-25,5,-7,19,-3,-28,9,-19,-20,-26,-21,-10,108,18; MA /M: SY='H'; M=-15,-28,-10,2,10,-21,45,-13,-7,-12,12,20,-25,8,4,0,-11,-6,42,30; MA /M: SY='P'; M=-1,-26,-15,-12,1,19,-16,-15,13,-8,-13,8,27,-9,5,9,-8,-6,-26,-15; MA /M: SY='F'; M=-5,-25,18,5,36,-24,-12,-7,9,14,14,4,-25,-11,-11,-15,-12,-10,-19,0; MA /M: SY='I'; M=-16,29,-1,-4,-1,-35,-22,32,-23,26,7,-23,-29,-20,-26,-22,-12,21,-25,11; MA /M: SY='C'; M=-16,30,2,4,13,-29,-13,8,24,0,-6,-14,-25,-9,-4,-16,-12,8,-16,26; MA /I: I=-15; MI=0; MD=-47; IM=0; DM=-47; MA /M: SY='C'; M=8,30,-14,-19,-23,9,-18,-19,-17,-2,-14,21,-25,-15,-22,19,14,-15,-38,-23; D=-15; MA /I: I=-15; DM=-47; MA /M: SY='C'; M=-18,58,-35,-31,-9,-39,-31,29,-24,21,3,-27,-34,-26,-6,-22,-1,14,-35,-17; D=-15; MA /I: I=-15; DM=-47; MA /M: SY='A'; M=17,-22,-24,-14,7,-19,-19,10,-16,9,16,-18,12,15,-18,5,-7,14,-25,-10; MA /M: SY='M'; M=-17,-26,-28,-20,13,-31,-18,19,-4,24,35,-23,29,-16,1,-20,-2,3,-23,-6; MA /M: SY='W'; M=-22,-35,-4,-21,26,-29,-18,3,-6,1,-7,-26,-31,-19,-18,-23,-20,-1,106,44; MA /M: SY='H'; M=-4,-25,-19,-16,24,-24,46,7,-16,6,23,5,-26,6,-15,-12,-1,4,-20,18; MA /M: SY='F'; M=-20,-25,1,-15,43,-28,34,-3,4,18,27,1,-28,-14,-12,-19,-15,-8,-17,8; MA /M: SY='C'; M=-12,68,-14,-6,-23,-21,32,-25,38,-11,-14,-5,-23,-3,5,8,-8,-21,-34,-15; MA /M: SY='K'; M=-3,-27,-5,0,-5,-17,-5,-27,36,-26,-16,32,-21,27,32,-5,-9,-25,-27,-14; MA /M: SY='K'; M=-15,-28,-21,-10,-9,-30,-14,19,28,5,24,-15,-24,10,14,-16,-11,14,-21,11; MA /M: SY='M'; M=-13,-23,-33,-28,35,-31,-18,25,-24,10,42,-24,-29,-22,-24,-7,-9,28,-15,20; MA /I: I=-8; MD=-26; MA /M: SY='C'; M=-15,25,-26,13,-45,-45,-36,-27,-8,-35,-32,-33,-39,0,-26,-29,-29,-5,-54,-41; D=-8; MA /I: I=-8; MD=-26; MA /M: SY='K'; M=-40,-54,-46,-36,-40,-57,-46,7,11,-29,-27,-38,-47,-31,-4,-42,-35,-10,-52,-39; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; MA /M: SY='L'; M=-16,-39,-51,-45,17,-48,-39,16,-43,18,10,-44,-46,-40,-43,-38,-29,-4,-33,-14; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='N'; M=-27,-42,-2,-7,-47,6,-22,-46,-17,-48,-38,30,6,-20,-3,-17,-7,-43,-53,-40; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='D'; M=-27,-40,20,-23,-28,-41,-34,1,-33,0,-17,-25,-41,-14,-36,-15,-22,9,-52,-30; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='D'; M=-31,-49,7,-21,-49,-38,-33,-45,0,-29,-38,-23,-42,-4,-24,4,-26,-43,-56,-40; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='L'; M=-20,-46,-39,-37,-9,-42,-35,-31,-12,-6,-26,-7,-50,-31,-8,-18,-31,-33,-47,-31; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='F'; M=-43,-49,-53,-43,15,-57,-39,-13,-14,4,3,-46,-53,-38,-8,-46,-39,-24,-38,-20; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='R'; M=-35,-52,-15,-22,-53,-44,-31,-52,8,-50,-41,-25,-43,-2,22,-14,-12,-47,-54,-40; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='L'; M=-37,-46,-43,-42,-29,-49,-40,-3,-17,9,-17,-12,-51,-36,-37,-20,-31,-20,-51,-35; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='F'; M=-17,-46,-45,-40,8,-45,-40,-10,-28,-30,-30,-36,-47,-35,5,-15,-10,-25,-42,-25; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='D'; M=-35,18,30,-19,-55,-38,-32,-53,-11,-53,-49,-1,-43,-29,-32,-11,-11,-48,-68,-45; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='Q'; M=-16,-48,-30,-5,-49,-40,-35,-20,-10,-40,-34,-28,-39,11,-27,-6,-10,-32,-53,-40; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='H'; M=-33,-48,-35,-43,-41,5,20,-12,-39,-34,-30,6,-48,-37,-43,-31,-32,-4,-61,-36; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='P'; M=-19,-50,-9,-10,-46,-14,-43,-14,-18,-37,-35,-33,1,-33,-37,-31,-20,-15,-56,-44; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='T'; M=16,-19,-19,-5,-15,0,-25,13,-17,3,-3,-14,-21,-17,-23,-3,26,25,-34,-17; MA /M: SY='L'; M=-15,-26,23,23,-11,-27,-13,-5,12,28,0,-11,-22,-4,-8,-6,-11,-9,-30,-14; MA /M: SY='A'; M=20,-22,-13,-3,5,-16,-14,10,4,-9,10,15,-21,6,5,-4,5,-3,-26,-11; MA /M: SY='F'; M=-18,-24,2,-1,38,-30,-12,6,-18,18,14,-17,-26,-17,-21,-14,14,-2,-10,31; MA /M: SY='M'; M=10,24,-16,1,-20,-16,-13,-11,3,0,32,-10,13,11,-11,15,5,-10,-30,-16; MA /M: SY='D'; M=-12,-27,42,12,-25,-18,-9,-5,14,-17,8,14,-20,-3,8,10,-5,-4,-38,-18; MA /M: SY='E'; M=-4,-27,15,35,-25,13,-11,-9,-3,-9,-15,10,-17,-1,5,2,1,-16,-33,-21; MA /M: SY='K'; M=-3,-27,20,9,14,0,-12,-20,32,-8,-13,-5,-20,-4,1,-9,0,-18,-21,4; MA /M: SY='I'; M=-15,29,-34,-29,1,-37,-23,34,-22,28,9,-28,-32,-22,-3,-23,-12,26,-23,13; MA /M: SY='R'; M=-1,-27,-12,-3,-26,-20,-9,-18,37,-20,5,9,-21,11,42,0,-9,-7,-29,-16; MA /M: SY='N'; M=-3,-27,12,-2,-24,3,-4,-29,26,-29,-19,34,-22,15,24,5,-7,-26,-27,5; MA /M: SY='V'; M=0,-23,-20,-1,11,-26,-18,17,-2,11,0,-17,-24,3,-15,-2,5,20,-21,13; MA /M: SY='F'; M=-21,-25,-21,-4,43,-31,30,10,-20,24,21,-1,-30,-17,-20,-21,-15,-2,-13,22; MA /I: I=-14; MI=0; MD=-45; IM=0; DM=-45; MA /M: SY='E'; M=-14,-33,18,43,-37,11,-11,-37,7,-33,-26,10,-17,14,2,-8,-3,-31,-36,-27; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-45; MA /M: SY='S'; M=10,-25,-11,14,-29,11,-16,-20,-11,-22,6,-8,-20,11,-16,28,-4,-8,-34,-22; D=-14; MA /I: I=-14; DM=-45; MA /M: SY='Y'; M=-17,-28,-12,3,16,-24,-3,-14,12,-3,-8,5,12,7,-6,-9,9,-15,-5,49; MA /M: SY='H'; M=-10,-29,25,20,-31,2,30,-34,24,-30,-21,1,-17,3,23,16,-7,-28,-35,-16; MA /M: SY='P'; M=-11,-26,-13,1,-20,25,-16,-3,-2,3,10,8,31,-12,-17,-7,12,-11,-30,-20; MA /I: I=-22; MD=-71; MA /M: SY='H'; M=-6,-31,-22,-4,6,-30,17,-16,-7,-7,-15,-18,-30,-17,-20,1,7,-7,-29,9; D=-22; MA /I: I=-22; MI=-71; MD=-71; IM=-71; DM=-71; MA /M: SY='N'; M=-26,-35,5,5,5,-34,-21,7,-6,8,-10,14,-33,-18,-22,-23,-19,-11,-35,-17; D=-22; MA /I: I=-22; DM=-71; MA /M: SY='E'; M=-14,-30,32,42,-1,-22,-8,-11,10,-22,-19,11,-16,3,7,2,-9,-19,-31,-15; MA /M: SY='F'; M=-16,-28,13,5,28,-26,-15,3,0,8,-5,-13,12,20,-12,-5,-11,1,-21,-3; MA /M: SY='F'; M=-15,-24,-29,-23,33,-7,-22,21,-22,27,6,-22,-29,7,-23,-17,0,16,-18,0; MA /M: SY='P'; M=7,-27,-13,13,-15,-24,15,4,-8,-1,-6,-15,24,9,2,-9,2,9,-27,5; MA /M: SY='P'; M=-14,-30,25,11,-29,-18,-10,-23,7,-14,-17,22,48,9,1,2,5,-23,-36,-22; MA /M: SY='W'; M=-6,-32,-20,-4,18,-21,-17,-16,-16,-6,-13,11,-27,-14,-20,-15,-5,-20,112,34; MA /M: SY='M'; M=-18,-25,-38,-32,36,-35,-20,36,-27,24,53,-27,-29,-23,-26,-26,-14,13,-17,4; MA /M: SY='Q'; M=-8,-27,-4,20,-29,-17,-9,-9,16,-22,-15,11,15,33,-2,17,15,-16,-31,-19; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; MA /M: SY='K'; M=-10,-34,20,-5,-36,-24,20,-30,23,-32,-23,20,-28,7,16,-13,-16,-19,-43,-22; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='G'; M=-10,-37,5,-6,-43,63,-26,-49,-24,-44,-35,-8,-26,-21,-32,-10,-25,-42,-35,-36; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='C'; M=-21,18,-33,-29,-25,1,14,0,-24,-5,6,-24,-36,-4,-8,-22,-8,4,-44,-23; D=-13; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-42; IM=0; DM=-42; MA /M: SY='N'; M=-15,-37,-27,-33,-39,-30,-30,-27,-29,-33,-2,14,-39,-27,-35,8,5,-14,-57,-37; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='H'; M=-13,-38,-28,-29,20,-7,47,-27,-27,-21,-17,-21,-37,-23,-26,-20,-8,-27,-15,43; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='I'; M=-16,30,-38,-35,11,-10,-34,36,-31,10,18,-29,-33,-30,-33,-24,-14,28,-30,-11; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='E'; M=-15,-32,-7,23,0,-23,-10,-26,8,-23,2,6,12,21,21,6,-12,-25,-29,-15; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-42; MA /M: SY='C'; M=-5,32,-23,-21,-11,-24,-25,15,-20,11,-1,-14,-24,-19,-24,16,25,27,-36,-15; MA /M: SY='R'; M=-9,-27,-8,19,-18,-21,-11,-7,18,-19,-14,-8,15,0,21,16,7,-5,-25,7; MA /M: SY='T'; M=-9,-23,-16,-16,-17,16,-14,-11,-7,9,13,8,9,-10,16,11,16,-12,-31,-16; MA /M: SY='G'; M=-8,-27,21,-13,-33,54,21,-38,-12,-36,-25,41,-22,-11,-19,-1,-12,-35,-37,-23; MA /M: SY='W'; M=-18,-29,-41,-28,15,-28,-17,3,-21,10,71,-29,-26,-15,-20,-26,-19,-5,102,8; MA /M: SY='M'; M=-14,-23,-32,-28,16,17,-16,7,-25,36,49,-23,-29,-19,-24,-21,-16,0,-21,-4; MA /M: SY='Q'; M=-12,-32,-13,6,-27,-22,-1,-12,2,-6,45,-7,-20,70,2,-6,-14,-16,-25,-10; MA /M: SY='G'; M=-1,-29,-17,-28,-35,77,-23,-43,-22,-39,-28,-3,-21,-20,-30,-2,-21,-37,-26,-30; MA /M: SY='M'; M=-15,-24,-16,-24,-8,-23,-12,38,-16,7,47,35,-25,-14,-20,-15,-7,11,-32,-11; MA /M: SY='F'; M=-7,-22,-33,-27,46,-32,17,7,-28,40,10,-28,-34,-24,-25,-24,-16,1,-14,8; MA /M: SY='H'; M=-18,-25,6,-8,-25,-10,76,-32,-4,-29,-15,62,-24,-1,-7,-2,-7,-34,-52,-6; MA /M: SY='Y'; M=-5,-25,-16,-19,18,-21,0,-5,0,5,37,24,-28,-10,-11,-12,-11,-9,-6,50; MA /M: SY='T'; M=2,31,-20,-20,-11,-23,-23,14,-18,16,-1,-11,-21,-18,-23,8,39,4,-34,-15; MA /M: SY='S'; M=5,-17,-10,-11,2,-3,-12,-24,-11,-26,-21,2,-17,-3,-15,59,10,-18,-30,-13; MA /M: SY='S'; M=1,-17,19,-6,-26,-8,-13,-22,-9,-26,-21,4,-15,-5,-15,46,35,-15,-39,-19; MA /M: SY='L'; M=-16,-21,-33,-28,28,-36,-20,14,-27,38,11,-29,-33,-25,-26,-21,1,24,-17,17; MA /M: SY='F'; M=-5,-23,-33,-28,39,-32,-14,9,-26,32,8,-30,-35,-24,-24,-21,-14,15,-6,39; MA /M: SY='H'; M=8,-26,-11,-13,-25,33,77,-33,-14,-25,-14,0,-20,-7,-14,7,0,-27,-39,-6; MA /M: SY='S'; M=11,-18,-19,-17,-12,-17,16,3,-17,13,-2,-11,-23,-13,-20,24,15,19,-34,-13; MA /M: SY='C'; M=0,67,-30,-27,-9,-26,-27,35,-25,11,17,-20,-28,-21,-28,6,-7,10,-32,-15; MA /M: SY='M'; M=24,-19,-21,-18,18,-15,13,3,-17,1,26,-12,-21,-13,-19,12,15,-2,-24,-5; MA /M: SY='M'; M=10,-21,-15,10,-13,-19,-13,-4,-11,20,29,-13,-21,15,-14,11,5,-5,-28,-13; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; MA /M: SY='C'; M=-15,30,4,7,-23,-2,-16,-6,-10,1,-11,5,-26,17,-1,0,1,-15,-36,-21; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='F'; M=-25,-29,-40,-35,56,-38,-18,2,-30,18,16,-33,-39,-31,-28,-29,-21,3,38,38; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='M'; M=5,-25,-21,-3,-12,-5,-19,4,-4,4,14,-18,-25,-14,-18,-1,2,9,-27,8; D=-8; MA /I: I=-8; MI=0; MD=-26; IM=0; DM=-26; MA /M: SY='I'; M=-38,-51,-39,-14,-28,-55,-38,0,-12,-16,-24,-40,-46,-31,-10,-38,-21,-8,-42,-2; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='C'; M=-12,47,-32,-32,-32,-32,-31,-17,-12,-29,-1,6,-41,-26,-13,-11,-23,-26,46,-28; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='M'; M=-6,-28,3,-15,11,-26,-12,2,-3,1,26,1,-28,3,-15,-14,0,-2,-20,22; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='K'; M=4,-29,-8,10,-35,-2,-13,-31,33,-31,-21,10,-20,24,3,1,2,-25,-32,-23; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='H'; M=-18,-32,-15,12,-19,-30,36,-3,9,9,-7,-16,27,-8,-11,-8,-14,-7,-35,-15; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='D'; M=-21,-29,31,3,22,-25,-10,-13,-16,6,10,17,-29,-14,-20,-6,-13,-17,-24,12; D=-8; MA /I: I=-8; DM=-26; MA /M: SY='P'; M=7,-27,23,8,-29,2,-13,-24,14,-15,-17,9,31,5,-7,4,4,-20,-33,-22; MA /M: SY='R'; M=1,-26,8,14,2,13,-15,-12,13,-8,-12,-9,-21,-5,15,-1,-10,3,-27,-14; MA /M: SY='Y'; M=-11,22,6,2,-3,-21,-9,-9,1,4,-7,-10,-1,-9,-13,15,5,-3,-16,35; MA /M: SY='D'; M=1,29,37,10,-30,15,-13,-28,1,-28,-23,14,-18,-8,-14,7,22,-21,-40,-23; MA /M: SY='C'; M=-12,66,-34,-31,14,-12,-27,18,-28,15,2,-26,-34,-29,-29,-19,-10,31,-25,10; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='W'; M=-17,-27,-28,-29,25,-31,-26,25,-24,4,14,0,-28,-24,-28,-6,12,9,45,-3; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='W'; M=-17,20,-30,-30,9,-5,-32,19,-26,-8,-9,-2,4,-27,-31,-19,-2,15,73,-7; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='D'; M=-15,-30,53,13,-34,-19,-11,-27,-7,-31,-27,13,-22,-7,3,10,5,-15,-48,-24; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='W'; M=-5,23,-24,-24,6,13,37,-15,-21,-11,31,2,-28,-17,-22,-4,-16,-11,48,-5; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='M'; M=6,-24,-35,-28,-2,-29,-17,9,-25,19,44,-29,-31,-20,-25,-20,-13,21,-22,21; D=-17; MA /I: I=-17; MD=-53; MA /M: SY='Q'; M=-16,-36,-9,23,-37,-6,20,-26,-7,-27,-19,-11,-23,42,-11,-9,4,-13,-39,-21; D=-17; MA /I: I=-17; MI=-53; IM=-53; DM=-53; MA /M: SY='H'; M=0,-21,-8,-9,-25,6,62,-30,-10,-27,-18,4,-18,-1,-11,47,3,-24,-39,-8; MA /M: SY='S'; M=7,-16,-8,-9,-27,-2,-11,-26,-9,-30,-23,3,-16,-1,-14,61,12,-19,-35,-19; MA /M: SY='D'; M=-20,-33,83,17,-40,-17,-6,-39,-7,-37,-36,13,-19,-7,-16,-8,-10,-35,-56,-23; MA /M: SY='D'; M=-20,-33,83,17,-40,-17,-6,-39,-7,-37,-36,13,-19,-7,-16,-8,-10,-35,-56,-23; MA /M: SY='F'; M=1,-22,-13,-13,42,-13,-8,-16,-11,-13,-12,21,-25,16,-14,25,-3,-16,-13,19; MA /M: SY='I'; M=18,-20,-21,-17,-15,-5,-22,21,-17,3,-3,-13,-22,5,-20,16,7,18,-31,-16; MA /M: SY='M'; M=-13,-21,-20,-17,24,-25,21,-3,-2,12,31,-11,-22,-13,-14,1,27,-5,-19,17; MA /M: SY='C'; M=-13,28,-3,-23,26,-3,-21,25,-23,13,23,-16,-27,-20,-25,6,-9,4,-22,-3; MA /M: SY='I'; M=-3,-25,-33,-30,36,-31,-24,40,-27,14,5,-24,-29,-25,-28,-6,-10,19,-13,19; MA /M: SY='C'; M=4,30,-14,-15,-19,4,-17,4,9,-4,-9,17,-23,-10,-11,19,-2,10,-34,-19; MA /M: SY='F'; M=16,-23,-26,-22,27,-1,-21,22,-20,-1,-2,-19,-26,-2,-23,-9,1,17,-16,16; MA /M: SY='P'; M=-1,-29,1,-7,-25,-17,-16,-5,6,-10,-13,-11,53,-7,18,16,-6,-14,-31,-21; MA /M: SY='N'; M=-6,-23,14,7,-28,18,-8,-25,5,-17,-18,32,-19,13,-9,23,7,-23,-35,-21; MA /M: SY='W'; M=-17,-27,6,-13,11,-23,19,-8,-2,4,-7,18,10,-13,-14,-11,6,-3,52,27; MA /M: SY='D'; M=-9,-26,35,10,-25,-17,-12,0,12,-18,-15,11,-19,12,-7,18,-3,6,-37,-18; MA /M: SY='D'; M=-12,-27,24,15,-22,-2,21,-3,18,-7,7,13,-20,-3,-5,1,-8,-3,-35,-15; MA /M: SY='M'; M=0,-24,10,4,-20,-6,-12,8,19,-11,22,19,-19,-5,-5,4,5,-6,-32,-16; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-40; IM=0; DM=-40; MA /M: SY='F'; M=-32,-44,-33,-24,19,-41,18,-29,-18,-12,-20,-26,-43,14,10,-15,-29,-32,-28,10; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-40; MA /M: SY='W'; M=-5,-40,8,-19,-24,-31,-27,-10,-7,-27,-24,-22,-35,1,-23,-8,-21,-10,50,5; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-40; MA /M: SY='S'; M=5,-32,-16,-3,-39,-2,-21,-34,-12,-35,-27,4,4,7,0,11,8,-27,-42,-31; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-40; MA /M: SY='A'; M=16,-31,-25,-8,1,-11,-26,-2,-23,-7,-14,-3,-32,1,-27,-15,-18,-3,-34,-20; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-40; MA /M: SY='E'; M=-7,-32,35,39,-37,-21,-7,-36,7,-33,-26,23,-19,17,10,-8,-12,-31,-40,-25; D=-13; MA /I: I=-13; DM=-40; MA /M: SY='W'; M=-5,29,-26,-18,8,-27,-15,11,-6,5,27,-18,-27,4,25,-14,0,-3,43,7; MA /M: SY='F'; M=-4,-25,-18,-11,35,-22,-10,-8,8,13,-3,4,-27,19,2,0,-11,-11,-13,18; MA /M: SY='Y'; M=-1,-24,-9,12,-6,-20,-5,-12,6,-1,22,8,-21,-3,8,4,11,-11,-17,29; MA /M: SY='W'; M=-1,-26,-24,-17,7,13,-17,-10,5,14,11,-16,-26,-10,24,-2,-14,-12,50,-6; MA /M: SY='Y'; M=1,-22,-21,-18,-4,-22,20,10,-14,7,-2,-14,-25,-12,1,14,6,20,-22,23; MA /M: SY='C'; M=-6,84,4,10,5,-25,-18,-14,-5,6,8,-14,-28,-14,-18,-2,-11,-12,-33,-15; MA /M: SY='K'; M=-16,-26,-22,-15,20,-6,18,8,24,23,2,-15,-26,-11,-4,-18,-14,3,-21,-3; MA /M: SY='W'; M=-3,-23,-29,-24,-3,-30,29,20,-24,29,7,-23,-29,-20,-24,-17,1,21,48,-4; MA /M: SY='F'; M=5,-22,-22,-7,48,-24,-17,11,-20,6,-3,-3,-28,-20,-22,-3,-9,13,-11,19; MA /M: SY='W'; M=1,-27,-21,-21,5,41,-18,-17,-6,-9,-14,-10,-24,-14,2,10,-12,-9,49,8; MA /M: SY='W'; M=-15,28,-6,-22,-4,-30,-21,30,-18,15,26,-20,-28,-17,-2,-6,-11,14,41,5; MA /M: SY='N'; M=-12,22,-3,-10,-1,-13,23,-7,3,-20,-14,46,-24,11,6,12,7,-17,-35,-12; MA /M: SY='M'; M=8,-22,-19,-14,6,-19,-9,-3,-2,-1,45,2,-23,10,3,1,5,3,-21,12; MA /M: SY='S'; M=-4,29,-8,6,-2,-12,-11,-22,13,-23,-18,12,-20,11,7,35,1,-12,-30,-14; MA /M: SY='M'; M=-15,-27,-18,-11,-13,-24,21,8,10,15,29,5,12,10,8,-4,-10,-5,-29,-10; MA /M: SY='W'; M=-14,-27,-7,16,6,-7,-12,-19,32,-1,-12,16,-20,-2,2,1,-10,-20,49,-8; MA /M: SY='K'; M=-80,-94,-72,-59,-96,-87,-76,-97,114,-96,-83,-65,-80,-57,-41,-74,-75,-92,-90,-83; MA /M: SY='S'; M=-5,31,-10,-1,16,-13,20,-18,-12,-9,-13,11,-22,-8,-16,34,11,-16,-25,6; MA /M: SY='Y'; M=-18,26,-30,-30,34,-10,-8,16,-24,12,18,-25,-33,-22,-23,-21,-15,7,0,55; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=152(152); /POSITIVE=152(152); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=1; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=S_Spirin, N_Hulo; CC /TAXO-RANGE=????V; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=RdRp catalytic; CC /VERSION=6; DR Q6XQI9 , L_ALLVP , T; Q9E005 , L_ANDV , T; DR V5IVB1 , L_BCCV , T; A0PJ24 , L_BCNVU , T; DR Q8JPR2 , L_BUNL8 , T; A5HC98 , L_BUNLC , T; DR P20470 , L_BUNYW , T; Q6TQR6 , L_CCHFI , T; DR B2C4J3 , L_CHAVB , T; Q6XQH2 , L_CPXVB , T; DR Q806Y6 , L_DOBV , T; Q66431 , L_DUGBA , T; DR Q6Q305 , L_EMARV , T; J7H8Q3 , L_GOGV , T; DR Q6UY70 , L_GTOVV , T; P23456 , L_HANTV , T; DR J3TRD1 , L_HTRV , T; Q27YE1 , L_IPPYV , T; DR Q6XQI4 , L_JUNIN , T; O09705 , L_LASSJ , T; DR Q6GWS6 , L_LASV , T; B2MW49 , L_LATVB , T; DR P14240 , L_LYCVA , T; Q6IUF8 , L_MACHU , T; DR Q27YE5 , L_MOBVC , T; Q6XQH7 , L_OLVVA , T; DR B2MW51 , L_PARVP , T; Q6RSS2 , L_PIRVV , T; DR P27176 , L_PUUMG , T; P0C760 , L_PUUMS , T; DR Q85431 , L_RSVT , T; A2SZS3 , L_RVFV , T; DR P27316 , L_RVFVZ , T; Q6UY61 , L_SABVB , T; DR H2AM11 , L_SBVBH , T; P27314 , L_SEOU8 , T; DR I0DF35 , L_SFTS , T; Q89709 , L_SINV , T; DR P20430 , L_TACVF , T; A9JR23 , L_TAMVU , T; DR P37800 , L_TOSV , T; P28976 , L_TSWV1 , T; DR Q9YQR5 , L_TULV , T; P33453 , L_UUKS , T; DR B2ZDY2 , L_WWAVU , T; P27153 , RDRP_DHVI1 , T; DR Q9IQ46 , RDRP_I000X , T; Q8QPH4 , RDRP_I00A0 , T; DR Q289L9 , RDRP_I00A1 , T; Q809M3 , RDRP_I01A0 , T; DR Q809M7 , RDRP_I01A1 , T; Q809M5 , RDRP_I01A2 , T; DR Q809L9 , RDRP_I01A3 , T; Q6DNS6 , RDRP_I02A1 , T; DR Q6DNS5 , RDRP_I02A2 , T; Q6DNS4 , RDRP_I02A3 , T; DR Q6DNS3 , RDRP_I02A4 , T; Q6J847 , RDRP_I02A5 , T; DR Q6DNS2 , RDRP_I02A6 , T; Q6DNQ9 , RDRP_I02A7 , T; DR Q6J856 , RDRP_I03A0 , T; Q6DNQ5 , RDRP_I03A1 , T; DR Q2LFH3 , RDRP_I05A1 , T; B4URE4 , RDRP_I06A0 , T; DR A8C8K2 , RDRP_I07A0 , T; Q3HM40 , RDRP_I18A0 , T; DR P03430 , RDRP_I33A0 , T; P03431 , RDRP_I34A1 , T; DR A4GCM7 , RDRP_I35A3 , T; A4GCJ4 , RDRP_I36A0 , T; DR Q0HD52 , RDRP_I40A0 , T; A4GCL6 , RDRP_I43A0 , T; DR A4U6W0 , RDRP_I45A0 , T; Q82571 , RDRP_I47A0 , T; DR Q0A440 , RDRP_I49A1 , T; A4U7B4 , RDRP_I51A0 , T; DR A4K151 , RDRP_I54A2 , T; P16502 , RDRP_I56A0 , T; DR Q20P14 , RDRP_I56A1 , T; Q0A429 , RDRP_I56A2 , T; DR Q1K9Q5 , RDRP_I57A0 , T; P26119 , RDRP_I57A1 , T; DR P26120 , RDRP_I57A2 , T; P26121 , RDRP_I57A3 , T; DR P16511 , RDRP_I57A5 , T; Q0A2G8 , RDRP_I59A0 , T; DR P21426 , RDRP_I60A0 , T; B3EUR4 , RDRP_I61A1 , T; DR Q0A2D9 , RDRP_I66A0 , T; Q0A451 , RDRP_I66A1 , T; DR Q6XU19 , RDRP_I67A0 , T; A8C8X1 , RDRP_I67A2 , T; DR Q0A461 , RDRP_I68A3 , T; Q910D6 , RDRP_I68A4 , T; DR P16506 , RDRP_I68A5 , T; P03432 , RDRP_I68A6 , T; DR Q6XT06 , RDRP_I69A0 , T; Q6XT02 , RDRP_I70A0 , T; DR Q3YPY7 , RDRP_I71A1 , T; Q1K9E3 , RDRP_I72A2 , T; DR Q463W7 , RDRP_I72A3 , T; Q2ICQ2 , RDRP_I72A4 , T; DR P16504 , RDRP_I73A4 , T; Q1PUD1 , RDRP_I73A5 , T; DR P26118 , RDRP_I73A6 , T; Q30NP3 , RDRP_I75A0 , T; DR P31341 , RDRP_I75A3 , T; Q2RF98 , RDRP_I76A6 , T; DR Q9EA41 , RDRP_I77A4 , T; A4GBY5 , RDRP_I77AA , T; DR Q1WP01 , RDRP_I77AB , T; P16512 , RDRP_I77AD , T; DR P16503 , RDRP_I77AF , T; P16508 , RDRP_I78A3 , T; DR Q2VNE5 , RDRP_I78A7 , T; Q2VNC5 , RDRP_I78A8 , T; DR Q0A3Q1 , RDRP_I78AC , T; P18882 , RDRP_I79A4 , T; DR Q20PL6 , RDRP_I79A7 , T; Q2VC92 , RDRP_I80A2 , T; DR Q2RCG8 , RDRP_I80A4 , T; Q08II5 , RDRP_I80A6 , T; DR P16513 , RDRP_I80A8 , T; A4GCK5 , RDRP_I80AA , T; DR Q20NV3 , RDRP_I80AD , T; P16510 , RDRP_I81A4 , T; DR P16509 , RDRP_I82A4 , T; A4GCI3 , RDRP_I83A1 , T; DR Q0A2F7 , RDRP_I83A4 , T; Q0A2H9 , RDRP_I83A5 , T; DR Q0A2D0 , RDRP_I83A6 , T; Q38SQ0 , RDRP_I83A8 , T; DR Q0A2Q6 , RDRP_I85A3 , T; P16505 , RDRP_I86A3 , T; DR P16507 , RDRP_I88A3 , T; P16514 , RDRP_I88A7 , T; DR O91741 , RDRP_I93A0 , T; Q9Q0V0 , RDRP_I96A0 , T; DR A3DRP8 , RDRP_I96A2 , T; Q07FH7 , RDRP_I96A3 , T; DR O89749 , RDRP_I97A0 , T; Q9WLS3 , RDRP_I97A1 , T; DR P13871 , RDRP_INBAC , T; P13872 , RDRP_INBAD , T; DR P07832 , RDRP_INBLE , T; O36430 , RDRP_INBP9 , T; DR Q6I7C3 , RDRP_INCAA , T; Q9IMP4 , RDRP_INCJH , T; DR P19703 , RDRP_INCJJ , T; Q8V3T6 , RDRP_ISAV8 , T; DR D0QX26 , RDRP_QRFVE , T; O41353 , RDRP_THOGV , T; DR P26144 , RDRP_I82A2 , P; 3D 5AMQ; 5AMR; 5D98; 5D9A; 6F5P; 6L42; 6QNW; 6QPG; 6QWL; 6QX3; 6QX8; 6QXE; 3D 6RR7; 6XZD; 6XZG; 6XZP; 6XZQ; 6XZR; 6Y0C; 6Y6K; 6Z6B; 6Z6G; 6Z8K; 7ALP; 3D 7EEI; 7NHA; 7NHC; 7NHX; 7NI0; 7NIK; 7NIL; 7NIR; 7NIS; 7NJ3; 7NJ4; 7NJ5; 3D 7NJ7; 7NK1; 7NK2; 7NK4; 7NK6; 7NK8; 7NKA; 7NKC; 7NKI; 7NKR; 7ORI; 7ORJ; 3D 7ORK; 7ORL; 7ORM; 7ORN; 7ORO; 7VGQ; 7VH1; 7VH2; 7VH3; 8C4S; 8C4T; 8C4U; 3D 8C4V; PR PRU00539; DO PDOC50507; //