ID   SAP; MATRIX.
AC   PS50800;
DT   01-FEB-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   SAP motif profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=35;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=32;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.1756001; R2=0.0199757; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1162.7791748; R2=1.5220884; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=317; H_SCORE=1645; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=217; H_SCORE=1493; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-8;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-18,-24,-20,-8,5,-27,-11,6,-8,10,8,-18,-22,-11,-9,-17,-9,3,-13,8,-10;
MA   /M: SY='T'; M=9,-6,-17,-11,-1,-16,-10,-14,-8,-9,-9,-3,-5,-11,-4,-13,7,11,-4,-26,-14,-3;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-10,-24,-8,-2,-19,-4,-7,-14,-10,-13,-9,-5,-1,-6,-12,3,-4,-14,-29,-15,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-25,-19,-28,-21,9,-25,-13,16,-21,25,23,-23,-26,-15,-16,-18,-6,12,-18,4,-18;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-5,-7,-10,-6,-17,-17,-14,-17,3,-18,-11,-1,-15,-3,8,10,15,-8,-30,-13,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-14,-18,-15,-12,-8,-24,-15,9,-12,0,4,-16,-21,-9,-14,-6,0,15,-23,-3,-11;
MA   /M: SY='S'; M=4,-2,-16,-3,2,-20,-9,-4,-20,-5,-23,-16,4,-5,0,-3,21,14,-13,-33,-15,0;
MA   /M: SY='E'; M=-3,5,-25,9,23,-22,-17,-6,-21,4,-16,-13,-2,-9,10,-4,-1,-8,-17,-25,-14,17;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,8,-28,-20,0,-27,30,-23,-7,0,-14,24,42,-7,-10,-23,-20,-10,14;
MA   /M: SY='D'; M=-8,12,-24,17,2,-26,-8,-8,-19,-4,-19,-11,4,-13,0,-8,4,-2,-13,-31,-16,1;
MA   /M: SY='M'; M=-1,-15,-22,-19,-8,-4,-23,-16,2,-4,5,6,-13,-17,-9,-8,-11,-5,0,-19,-5,-9;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-25,24,-29,-22,-2,-27,-23,2,-28,23,5,-25,-31,-22,-23,-20,-9,3,-29,-11,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-2,-26,0,10,-26,-5,-6,-28,16,-26,-14,2,-12,9,18,4,-5,-21,-26,-16,9;
MA   /M: SY='E'; M=2,-4,-22,-4,9,-15,-15,-1,-17,3,-17,-10,-3,-12,5,-2,3,-4,-13,-22,-6,7;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-14,-22,-17,-9,-1,-22,-9,-2,-5,5,4,-11,-23,-8,6,-13,-7,0,-19,-1,-10;
MA   /M: SY='G'; M=2,-8,-27,-8,-17,-28,59,-18,-37,-18,-30,-20,2,-18,-17,-18,7,-13,-27,-23,-28,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-25,-21,-26,-16,8,-28,-16,11,-19,30,13,-24,-27,-13,-7,-23,-9,6,-18,0,-15;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-1,-23,0,1,-24,-9,-9,-23,-1,-26,-18,3,10,-1,4,11,2,-18,-32,-20,-2;
MA   /M: SY='T'; M=1,-7,-4,-13,-10,-13,-19,-10,-11,-7,-10,-7,-5,-16,-9,-8,7,19,-2,-30,-10,-10;
MA   /M: SY='N'; M=-5,11,-21,7,1,-23,-3,9,-23,-6,-26,-16,18,-7,2,-6,13,4,-22,-34,-15,0;
MA   /M: SY='G'; M=1,-9,-28,-9,-18,-29,65,-19,-38,-19,-30,-20,1,-19,-18,-19,3,-17,-28,-22,-29,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-6,-25,-8,-5,-19,-11,-6,-18,2,-18,-10,-1,0,-4,5,-1,0,-14,-27,-14,-6;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-30,0,12,-28,-20,-8,-30,44,-28,-11,0,-11,11,34,-9,-10,-21,-21,-11,11;
MA   /M: SY='Q'; M=1,-7,-25,-9,2,-26,-16,5,-18,6,-17,-5,-5,-6,16,8,-3,-8,-16,-23,-10,7;
MA   /M: SY='E'; M=-12,0,-25,3,12,-14,-21,3,-12,-3,-6,-7,-2,-16,0,-1,-8,-8,-11,-25,-5,5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-22,7,-30,-20,23,-27,42,23,-28,-28,-19,-20,-27,-9,15,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='I'; M=-8,-20,-11,-24,-13,-8,-30,-19,15,-19,11,8,-18,-22,-7,-17,-13,-5,10,-25,-7,-12;
MA   /M: SY='D'; M=-11,11,-25,15,8,-26,-19,-8,-19,6,-18,-12,2,-12,4,2,-1,1,-13,-29,-13,5;
MA   /M: SY='R'; M=-12,-13,-15,-15,-6,-17,-21,-8,-20,16,-12,-7,-7,-22,0,40,-10,-9,-11,-23,-11,-6;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-16,-14,-19,-16,-4,-26,-2,7,-21,12,6,-15,-24,-13,-19,-16,-10,2,-21,4,-17;
MA   /M: SY='R'; M=-2,-5,-21,-10,-6,-14,-17,-11,-10,6,-5,-4,0,-19,-5,9,-6,-2,-6,-24,-11,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-10,8,-27,10,16,-29,-8,12,-29,10,-25,-13,9,-11,13,4,1,-9,-26,-28,-12,14;
MA   /M: SY='Y'; M=-4,-20,-26,-23,-18,5,-15,3,-7,-18,0,-2,-17,-24,-14,-15,-16,-13,-7,11,16,-17;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-16,-21,-18,-6,-1,-27,-17,7,-12,10,7,-16,-18,-11,-12,-11,1,7,-23,-5,-9;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=123(120); /POSITIVE=123(120); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=24; /PARTIAL=0;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=2;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SAP;
CC   /VERSION=5;
DR   Q6GZS7    , 049L_FRG3G , T; Q9UKV3    , ACINU_HUMAN, T;
DR   Q9JIX8    , ACINU_MOUSE, T; Q75CC0    , AIM34_EREGS, T;
DR   Q6CUC1    , AIM34_KLULA, T; C5DEP0    , AIM34_LACTC, T;
DR   Q6CFD4    , AIM34_YARLI, T; B3LLQ4    , AIM34_YEAS1, T;
DR   C7GLB5    , AIM34_YEAS2, T; B5VPC6    , AIM34_YEAS6, T;
DR   A6ZM65    , AIM34_YEAS7, T; C8ZEK9    , AIM34_YEAS8, T;
DR   Q03673    , AIM34_YEAST, T; C5DTC6    , AIM34_ZYGRC, T;
DR   P45951    , ARP_ARATH  , T; Q8IX12    , CCAR1_HUMAN, T;
DR   Q8CH18    , CCAR1_MOUSE, T; Q641G3    , CCAR1_XENLA, T;
DR   Q10423    , CCE1_SCHPO , T; Q7Z7J5    , DPPA2_HUMAN, T;
DR   O44406    , ERI1_CAEEL , T; Q8IV48    , ERI1_HUMAN , T;
DR   Q7TMF2    , ERI1_MOUSE , T; Q5FVR4    , ERI1_RAT   , T;
DR   Q08I43    , ERI1_SCHPO , T; Q9BUJ2    , HNRL1_HUMAN, T;
DR   Q8VDM6    , HNRL1_MOUSE, T; Q1KMD3    , HNRL2_HUMAN, T;
DR   Q00PI9    , HNRL2_MOUSE, T; Q00839    , HNRPU_HUMAN, T;
DR   Q8VEK3    , HNRPU_MOUSE, T; Q6IMY8    , HNRPU_RAT  , T;
DR   Q9FQ08    , KU70_ARATH , T; Q2MHH4    , KU70_ASPOR , T;
DR   Q2MHH3    , KU70_ASPSO , T; Q2H0I3    , KU70_CHAGB , T;
DR   Q1DU75    , KU70_COCIM , T; Q5AVC7    , KU70_EMENI , T;
DR   Q7SA95    , KU70_NEUCR , T; Q7F1M0    , KU70_ORYSJ , T;
DR   Q0U5F2    , KU70_PHANO , T; Q26228    , KU70_RHIAP , T;
DR   O94395    , KU70_SCHPO , T; Q6IDA6    , LOT1_ARATH , T;
DR   A7E346    , MASTR_BOVIN, T; Q6ZN01    , MASTR_HUMAN, T;
DR   Q0ZCJ7    , MASTR_MOUSE, T; Q969V6    , MRTFA_HUMAN, T;
DR   Q8K4J6    , MRTFA_MOUSE, T; Q8AYC2    , MRTFA_XENLA, T;
DR   Q9ULH7    , MRTFB_HUMAN, T; P59759    , MRTFB_MOUSE, T;
DR   Q8AYC1    , MRTFB_XENLA, T; Q8IZQ8    , MYCD_HUMAN , T;
DR   Q8VIM5    , MYCD_MOUSE , T; Q7YR76    , MYCD_PIG   , T;
DR   Q8R5I7    , MYCD_RAT   , T; Q9ZSV1    , PARP1_MAIZE, T;
DR   Q7EYV7    , PARP1_ORYSJ, T; Q11207    , PARP2_ARATH, T;
DR   O50017    , PARP2_MAIZE, T; Q9SWB4    , PARP3_SOYBN, T;
DR   O62203    , PHM2_CAEEL , T; O75925    , PIAS1_HUMAN, T;
DR   O88907    , PIAS1_MOUSE, T; O75928    , PIAS2_HUMAN, T;
DR   Q8C5D8    , PIAS2_MOUSE, T; Q6AZ28    , PIAS2_RAT  , T;
DR   Q9Y6X2    , PIAS3_HUMAN, T; O54714    , PIAS3_MOUSE, T;
DR   O70260    , PIAS3_RAT  , T; Q8N2W9    , PIAS4_HUMAN, T;
DR   Q9JM05    , PIAS4_MOUSE, T; F1R4C4    , PIS4A_DANRE, T;
DR   O94451    , PLI1_SCHPO , T; Q5Z8Q9    , PRP2A_ORYSJ, T;
DR   Q4WZJ6    , RAD18_ASPFU, T; Q5A4N5    , RAD18_CANAL, T;
DR   Q6FPI4    , RAD18_CANGA, T; Q6BLM3    , RAD18_DEBHA, T;
DR   Q02398    , RAD18_EMENI, T; Q75EN0    , RAD18_EREGS, T;
DR   Q9NS91    , RAD18_HUMAN, T; Q6CTZ8    , RAD18_KLULA, T;
DR   Q9QXK2    , RAD18_MOUSE, T; P33288    , RAD18_NEUCR, T;
DR   O74747    , RAD18_SCHPO, T; Q6CHI1    , RAD18_YARLI, T;
DR   P10862    , RAD18_YEAST, T; Q9C5J3    , RRC1_ARATH , T;
DR   Q15424    , SAFB1_HUMAN, T; D3YXK2    , SAFB1_MOUSE, T;
DR   Q5R452    , SAFB1_PONAB, T; O88453    , SAFB1_RAT  , T;
DR   Q14151    , SAFB2_HUMAN, T; Q80YR5    , SAFB2_MOUSE, T;
DR   P82979    , SARNP_HUMAN, T; Q9D1J3    , SARNP_MOUSE, T;
DR   Q5R4V4    , SARNP_PONAB, T; Q498U4    , SARNP_RAT  , T;
DR   Q13435    , SF3B2_HUMAN, T; Q3UJB0    , SF3B2_MOUSE, T;
DR   Q680Q4    , SIZ1_ARATH , T; Q6L4L4    , SIZ1_ORYSJ , T;
DR   Q04195    , SIZ1_YEAST , T; Q6ASW7    , SIZ2_ORYSJ , T;
DR   Q12216    , SIZ2_YEAST , T; Q9NWH9    , SLTM_HUMAN , T;
DR   Q8CH25    , SLTM_MOUSE , T; Q498L2    , SLTM_XENLA , T;
DR   P40040    , THO1_YEAST , T; O93257    , XRCC6_CHICK, T;
DR   P12956    , XRCC6_HUMAN, T; P23475    , XRCC6_MOUSE, T;
DR   Q54UW0    , Y0785_DICDI, T; Q54UV9    , Y0787_DICDI, T;
DR   Q54UV8    , Y0809_DICDI, T; Q54UG3    , Y1095_DICDI, T;
DR   Q54UG2    , Y1301_DICDI, T; O74871    , YCW3_SCHPO , T;
DR   Q338N2    , C3H62_ORYSJ, N; P35659    , DEK_HUMAN  , N;
DR   Q7TNV0    , DEK_MOUSE  , N; Q6AXS3    , DEK_RAT    , N;
DR   Q9CWH0    , DPPA2_MOUSE, N; Q54MA9    , KU70_DICDI , N;
DR   G2TRT4    , NEW25_SCHPO, N; Q1SGF1    , PARP3_MEDTR, N;
DR   Q8WZ73    , RFFL_HUMAN , N; Q6ZQM0    , RFFL_MOUSE , N;
DR   Q8CIN9    , RFFL_RAT   , N; Q5E9J6    , RNF34_BOVIN, N;
DR   Q969K3    , RNF34_HUMAN, N; Q99KR6    , RNF34_MOUSE, N;
DR   Q5NVC7    , RNF34_PONAB, N; Q6AYH3    , RNF34_RAT  , N;
DR   F4KIA8    , RRC1L_ARATH, N; Q7T293    , SDE2_DANRE , N;
DR   Q6IQ49    , SDE2_HUMAN , N; Q8K1J5    , SDE2_MOUSE , N;
DR   Q5RET9    , SDE2_PONAB , N; Q5BJN8    , SDE2_RAT   , N;
DR   Q6NRI5    , SDE2_XENLA , N; Q07G43    , SDE2_XENTR , N;
3D   1H1J; 1JEQ; 1JEY; 1JJR; 1KCF; 1V66; 1ZBH; 1ZBU; 1ZRJ; 2DO1; 2DO5; 2JX3;
3D   2KVU; 2KW9; 2RNN; 2RNO; 2WQG; 4L8R; 4QOZ; 4UZW; 5Z56; 5Z57; 5Z58; 6AH0;
3D   6AHD; 6FF4; 6FF7; 6QX9; 6Y50; 6Y53; 6Y5Q; 6ZHA; 6ZHE; 7ABG; 7ABH; 7ABI;
3D   7AXZ; 7DVQ; 7EVO; 7K0Y; 7K1J; 7K1K; 7K1N; 7LSY; 7LT3; 7NFC; 7NFE; 7ONB;
3D   7Q3L; 7Q4O; 7Q4P; 7QTT; 7SGL; 7SU3; 7VPX; 7Z6O; 7Z87; 7Z88; 7ZT6; 7ZVT;
3D   7ZWA; 7ZYG; 8AG4; 8AG5; 8BH3; 8BHV; 8BHY; 8BOT; 8CH6; 8EZA; 8EZB; 8HK1;
PR   PRU00186;
DO   PDOC50800;
//