Entry: PS50815

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] HORMA
Accession [info] PS50815
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAY-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50815
Associated ProRule [info] PRU00109

Name and characterization of the entry

Description [info] HORMA domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=197;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=192;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.6123738; R2=0.0212867; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=11399.84564; R2=27.35738; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=347; N_SCORE=10.0; H_SCORE=19607; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=183; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16406; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K'; M=-12,  4,-29,  6, 10,-27,-13,  2,-24, 16,-21, -8,  4,-13, 11, 14, -6,-11,-21,-25,-11,  9;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-26,  0,  1,-24,  3,-10,-20, -6,-19,-13,  0,-16,  0, -6, -1,-10,-16,-18,-16,  0;
/M: SY='S'; M=  4, -6,-13, -7, -7,-14, -9,-13, -8,-10,-15,-10,  2,-16, -7,-10, 20, 11,  0,-35,-16, -7;
/M: SY='A'; M=  8, -7,-19, -9, -2,-16, -9,-14, -8,-12, -2, -5, -8,-14, -4,-14,  1,  0, -6,-25,-14, -3;
/M: SY='Q'; M=-10,  8,-25,  7,  8,-24,-16, -2,-19,  9,-15, -4,  5,-13, 10,  8, -4, -5,-18,-27,-12,  9;
/M: SY='F'; M= -8,-23,-21,-28,-22, 11,-21,-21, 10,-23, 10,  6,-18,-23,-20,-19,-11, -1,  8,-10,  1,-21;
/M: SY='L'; M= -5,-27,-19,-30,-23,  6,-27,-22, 18,-22, 21, 16,-25,-26,-20,-19,-18, -5, 18,-12, -1,-21;
/M: SY='S'; M=  1, -8,-18,-11, -6,-16,-16,-12, -8,  2,-11, -3, -4,-16, -2,  3,  4,  4, -1,-27,-12, -4;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-23, 10, 17,-22,-15, -3,-20,  5,-19,-15, 11,-13,  4,  8,  3, -2,-16,-32,-17, 10;
/M: SY='F'; M= -8,-23,-13,-30,-22, 29,-26,-13,  2,-19, 10,  5,-19,-26,-22,-16,-17, -9,  1, -4, 18,-21;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-34,-25, 19,-30,-19, 23,-25, 28, 22,-25,-27,-21,-20,-22, -9, 16,-15,  5,-23;
/M: SY='E'; M= -7, -5,-26, -3, 10,-16,-17, -2,-19, 10,-14, -9, -5,-13,  3,  6, -5, -5,-14,-19, -2,  5;
/M: SY='V'; M= -8,-27, -3,-30,-27, 10,-31,-19, 17,-22, 11, 10,-25,-29,-24,-20,-16, -6, 21,-17,  7,-26;
/M: SY='A'; M= 24,-11,-15,-15,-12,-16,  7,-16,-13,-13,-13,-11, -7,-15,-11,-17, 10,  0, -4,-22,-15,-12;
/M: SY='I'; M= -6,-23,-22,-31,-25, 11,-30,-24, 26,-24, 11,  9,-16,-23,-23,-23,-12, -5, 21,-19,  0,-25;
/M: SY='N'; M= -4,  9,-19,  1, -5,-11, -4, 13,-19, -8,-22,-13, 21,-18, -4, -7, 10,  2,-19,-29, -5, -5;
/M: SY='C'; M= -2, -5,  7,-13,-12, -8,-15, -7,-11,-16, -8, -5,  1,-22,-11,-14,  3,  2, -8,-32,-12,-12;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-27,-38,-29,  1,-38,-29, 46,-29, 21, 19,-22,-22,-21,-28,-19, -9, 31,-21, -1,-29;
/M: SY='L'; M= -4,-23, -9,-26,-19,  2,-26,-21, 11,-25, 29, 10,-23,-26,-19,-19,-16, -1,  9,-25, -6,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-17,-28,-17,-17, 30,-28,  9, -6, -9, -2, -3,-15,-28,-13, -3,-18,-10,-10, 16, 54,-18;
/M: SY='L'; M= -6,-12,-22,-14, -6, -8,-23, -7,  2, -9,  4,  3, -9,-21,  1, -6,-10, -7, -1,-19,  0, -3;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 31,-21,-10,  0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='G'; M=  0,  0,-27, -4, -9,-27, 38,-12,-33, -8,-27,-18,  9,-18,-11, -8,  1,-14,-26,-24,-25,-10;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-22,-34,-27,  9,-34,-26, 32,-28, 27, 16,-26,-26,-24,-24,-21, -8, 26,-20,  0,-27;
/M: SY='Y'; M=-18,-25,-26,-28,-23, 40,-31,  1,  5,-19, 10,  3,-21,-29,-20,-15,-21,-10, -3, 16, 52,-23;
/M: SY='P'; M= -9,-13,-37, -3,  3,-30,-13,-17,-23, -9,-30,-21,-14, 67, -8,-18, -5, -9,-29,-31,-28, -6;
/M: SY='E'; M=  4,  1,-22,  4, 17,-27,-13, -7,-20,  2,-20,-14, -1, -3, 12, -5,  8, -2,-17,-29,-18, 14;
/M: SY='E'; M= -8, 11,-29, 17, 26,-30,-12,  2,-29,  9,-23,-17,  5, -4, 11,  3, -1,-10,-26,-29,-17, 17;
/M: SY='Y'; M=  0, -9,-13,-12,-13, -2,-19,-12, -3,-15, -4, -5, -9,-19,-13,-17, -1,  1, -2,-17,  5,-14;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-38,-29, 75,-30,-16,  0,-28,  9,  0,-20,-30,-37,-19,-20,-10, -1, 12, 35,-29;
/M: SY='E'; M= -6,  1,-23,  0,  4,-21,-13, -9,-14,  4,-16, -9,  2,-14,  4, -1,  1,  0,-11,-28,-14,  4;
/M: SY='D'; M=-12,  9,-25, 11,  5,-21,-17, -5,-22, 11,-20,-11,  4,-14,  1, 10, -1,  1,-15,-26, -8,  2;
/M: SY='R'; M= -4, -9,-20,-13, -6,-11,-19,-11, -8,  5,-10, -2, -6,-18, -3, 11, -4, -1, -1,-23, -9, -5;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='T'; M= -5, -5, -5, -6, -4, -5,-11, -3, -8, -3, -8, -5, -4, -4,  0, -1,  0,  3, -7, -9,  3, -3; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='R'; M=-11, -2,-25, -4,  0,-18,-20, -4,-17, 11,-15, -7,  1,-16,  8, 19, -3, -1,-14,-22, -5,  2;
/M: SY='K'; M= -7,  4,-28,  7,  7,-24, -8, -7,-22, 10,-20,-10,  0,-12,  3,  1, -4, -9,-18,-22, -9,  4;
/M: SY='Y'; M=-15,-14,-27,-15,-13, 11,-25,  4, -2, -2,  2,  9,-15,-24, -7, -5,-18,-10, -7,  2, 33,-12;
/M: SY='N'; M= -8,  4,-16, -2, -9,-19,  1, -9,-15, -6,-14, -9, 12,-21, -6, -7, -4, -8,-15,-29,-17, -8;
/M: SY='L'; M= -6,-22,-19,-23,-17, -2,-26,-21, 13,-16, 18,  9,-19,-23,-15,-14,-13, -2, 13,-24, -6,-17;
/M: SY='T'; M= -6,-10,-15,-12, -9,-19,-17,-19,-11, -1,-17, -9, -8,  4,-10, -7, -2,  6, -6,-28,-16,-11;
/M: SY='M'; M= -8,-20,-21,-24,-17, -4,-27,-15, 13, -9, 10, 15,-18,-22, -9, -7,-15, -4, 13,-20,  0,-14;
/M: SY='L'; M= -8,-21,-24,-24,-15,  3,-25,-11,  4,-19, 15,  6,-20,-23, -8,-15,-17, -5, -2, -1,  6,-12;
/M: SY='M'; M= -9,-19,-20,-21,-13, -3,-25,-13,  4, -5,  8, 12,-17,-22, -5,  1,-13, -4,  7,-21, -4, -9;
/M: SY='S'; M=  2, -5,-14, -6, -1,-23, -8,-13,-21, -7,-23,-16, -2,  9, -2, -8, 10,  5,-17,-31,-21, -3;
/M: SY='R'; M=-12,-10,-18,-13, -8,-12,-23, -2, -6,  0, -8,  3, -6,-19,  1,  5, -8, -6, -6,-23, -5, -5;
/M: SY='D'; M=-15, 20,-26, 25,  9,-23,-13, 20,-30,  0,-25,-17, 16,-14,  2,  0,  1, -8,-25,-33, -8,  4;
/M: SY='P'; M= -4, -3,-29, -1,  2,-23,-17,-13,-14, -4,-18,-13, -4, 22, -6, -9, -5, -7,-16,-29,-20, -4;
/M: SY='E'; M=-10, -4,-24,  0, 19,-28,-18, -4,-22,  4,-22,-13, -6, 13,  9, -4, -6,-11,-24,-28,-18, 13;
/M: SY='L'; M=  3,-19,-20,-19,-10, -8,-20,-18,  3,-15,  8,  1,-17, -9,-12,-13, -8, -4,  3,-25,-12,-12;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='N'; M= -6,  1, -9, -2, -2,-24, -6, -3,-24,  4,-22,-12,  5,-17,  3,  5, -1, -8,-18,-27,-15, -1; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='R'; M= -2,  6,-22,  3,  3,-21,-13, -5,-19,  6,-16, -9,  7,-14,  3,  8,  1, -1,-15,-27,-14,  2;
/M: SY='Y'; M=-14,-21,-26,-23,-15, 15,-27, -3,  1,-14,  7,  3,-18,-26, -7, -8,-17, -9, -6,  7, 29,-13;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-35,-27,  2,-35,-26, 38,-27, 25, 20,-24,-24,-21,-25,-21, -8, 28,-22, -2,-27;
/M: SY='D'; M= -3, 13,-23, 16,  8,-27,-11,  3,-24,  1,-22,-15,  9,-13,  5,  1,  5, -4,-18,-31,-15,  5;
/M: SY='W'; M= -9, -3,-30, -2, -1,-17, -9,-10,-24, -1,-25,-17, -2,-12,  0, -5, -2, -8,-23, 11, -3,  0;
/M: SY='L'; M= -1,-23,-19,-27,-20, -1,-25,-22, 14,-18, 16, 10,-22,-23,-17,-17,-14, -2, 14,-14, -4,-19;
/M: SY='L'; M= -4,-16,-20,-15,  1, -2,-24,-15,  4,-14, 13,  5,-18,-19,-10,-14,-12, -5,  5,-23, -7, -4;
/M: SY='K'; M= -8, -1,-25,  1,  9,-23,-17, -2,-20, 13,-15, -8, -1,-13,  9,  9, -1, -5,-17,-26,-10,  8;
/M: SY='G'; M=  2, -5,-18, -8, -7,-27, 20,-11,-25,-11,-21,-12,  1,-17,  2,-11,  4, -9,-22,-25,-21, -2;
/M: SY='V'; M=  2,-24,  1,-27,-23, -4,-25,-25, 13,-22, 11,  5,-23,-26,-22,-21, -9, -1, 22,-29,-11,-23;
/M: SY='Y'; M=-11,-13,-26,-14, -6,  1,-18,  7,-10, -6, -4, -2, -9,-20, -4, -3,-11,-10,-12,-11, 12, -6;
/M: SY='D'; M=-12, 20,-30, 32, 22,-31,-15, -3,-31,  6,-25,-22,  5,  3,  4, -3, -3,-10,-26,-30,-16, 12;
/M: SY='W'; M= 12,-19,-23,-23,-12, -4,-13,-20, -9,-14, -6, -8,-18,-18,-11,-17, -8, -8, -7, 19, -2,-10;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-23,-32,-23,  5,-32,-23, 28,-28, 35, 20,-24,-25,-19,-22,-23, -6, 16,-21, -1,-22;
/M: SY='Q'; M= -5, -3,-26, -3, 14,-21,-18, -2,-21, 11,-17, -9, -2,-12, 17, 13, -1, -6,-19,-21, -9, 15;
/M: SY='K'; M= -6,  0,-27,  0,  7,-26,-15, -8,-24, 23,-20, -9, -1,-12, 10, 17, -5, -6,-18,-22,-12,  8;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='G'; M= -7, -1,-23, -3, -3,-27, 14,-12,-32, 11,-27,-15,  5,-16, -4,  7, -3,-10,-24,-24,-19, -4;
/M: SY='Y'; M=-13,-11,-17,-12, -7,  4,-23,  1,-11, -5, -4, -2,-10,-22, -6, -4,-10, -8,-11,-11, 14, -7;
/M: SY='L'; M= -7,-30,-13,-31,-24,  5,-31,-24, 24,-27, 33, 16,-29,-30,-23,-21,-22, -7, 23,-24, -4,-24;
/M: SY='R'; M=-12,  1,-28,  1, 13,-26,-18,  7,-25, 20,-23, -9,  4,-13, 20, 21, -3, -8,-24,-21, -6, 15;
/M: SY='R'; M= -8, -5,-19, -7,  5,-22,-20, -8,-19, 15,-16, -5, -4,-14,  8, 19, -4, -3,-14,-24,-12,  5;
/M: SY='L'; M= -9,-30,-20,-33,-26, 13,-32,-25, 27,-28, 29, 15,-27,-28,-25,-22,-22, -8, 23,-19,  1,-26;
/M: SY='A'; M= 13,-15,-16,-20,-13,-11,-16,-20,  9,-15, -3,  1,-12,-16,-12,-18,  4,  1, 13,-27,-13,-13;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-33,-25, 14,-31,-22, 25,-26, 30, 19,-26,-28,-23,-21,-22, -8, 20,-19,  1,-24;
/M: SY='V'; M=  2,-18, -2,-19,-21,-10,-17,-24,  7,-18, -4, -2,-16,-24,-21,-19,  0,  0, 22,-32,-15,-21;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-26,-38,-30, 10,-37,-29, 41,-28, 17, 16,-22,-23,-24,-27,-18, -8, 29,-18,  2,-30;
/M: SY='Y'; M=-11,-13,-14,-18,-14,  9,-24, -4,  0,-15, -1,  0, -9,-22,-13,-14, -6,  1, -2,-12, 15,-15;
/M: SY='B'; M= -8, 19,-22, 19, 13,-25,-10, -2,-23,  1,-22,-17, 19,-12,  5, -3,  9,  1,-22,-35,-17,  9;
/M: SY='K'; M= -5,  1,-25, -1, 10,-23,-18,-10,-17, 15,-20,-11,  3, -6,  3,  5, -1, -3,-14,-27,-14,  6;
/M: SY='E'; M=-10,  1,-22,  7, 13,-22,-20, -4,-20,  2,-14,-12, -6, -2,  0, -5, -8, -9,-17,-26,-11,  6;
/M: SY='N'; M= -7, 14,-24, 11,  3,-25,  4,  0,-26, -5,-26,-18, 19, -8,  0, -7,  7,  0,-25,-32,-19,  1;
/M: SY='D'; M= -6,  5,-25,  7,  4,-25, -1,-10,-25,  1,-22,-16,  3, -8, -3,  0,  2, -2,-17,-29,-19, -1;
/I:         I=-6; MD=-12;
/M: SY='E'; M=-10,  1,-27,  7, 23,-22,-17, -7,-19,  1,-14,-13, -3, 15,  4, -6, -6, -8,-22,-26,-17, 12; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='V'; M= -2,-16, -7,-18,-16, -5,-20,-18, 11,-15,  6,  6,-16,-12,-15,-16, -9, -2, 13,-21, -8,-16; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-12;
/M: SY='I'; M= -6,-22,-20,-25,-18,  0,-28,-21, 22,-22, 21, 11,-19,-24,-18,-19,-15, -5, 18,-25, -6,-19;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='R'; M=-11, -7, -3, -9, -1,-19,-20,-10,-21,  9,-18,-11, -2,-20, -2, 21, -4, -3,-10,-29,-15, -3;
/M: SY='W'; M=-20,-28,-33,-31,-26, 39,-27, -5, -6,-19, -3, -6,-26,-30,-21,-16,-26,-16,-13, 57, 52,-23;
/M: SY='V'; M= -2, -9,-12,-12, -8,-17,-20,-13,  0, -6, -9,  0, -7,-18,  0, -9,  0, -2,  3,-28,-12, -5;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-22,-38,-28, 60,-28,-18,  3,-27, 14,  8,-22,-29,-32,-19,-22,-11,  0, 11, 23,-26;
/M: SY='B'; M= -6, 15,-22, 15,  9,-26,-10, -4,-26,  8,-27,-18, 15,-12,  6,  5, 12,  3,-20,-33,-17,  7;
/M: SY='F'; M=-13,-28,-21,-36,-28, 40,-31,-23, 16,-27, 13,  9,-20,-26,-30,-21,-17, -5, 14, -7, 13,-28;
/M: SY='S'; M= -1,  2,-19,  3,  5,-21,-16, -7,-13, -4,-16,-11,  0,-12,  1, -7,  9,  8, -7,-31,-13,  3;
/M: SY='Y'; M=-10,-13,-20,-15,-10,  4,-24,  6, -5, -8, -6, -1,-11,-21, -4, -7, -7,  0, -8, -2, 30,-10;
/M: SY='D'; M=-11,  0,-25,  1, -1, -6,-15,-12,-12, -8,-11, -9, -1,-12, -8,-10, -4, -5,-11,-23, -8, -4;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-27, 10, 11,-27,-13, -7,-24,  2,-24,-17,  4, 11,  4, -2,  2, -4,-23,-31,-19,  6;
/M: SY='E'; M= -2,  1,-21, -1,  6,-18, -9, -4,-15, -5,-14,-11,  5,-13, -1, -7,  6,  3,-14,-30,-14,  2;
/M: SY='G'; M= -1, -4,-14, -8,-15,-17,  2,-17,-11,-16,-12,-10,  0,-20,-15,-17, -3, -6, -7,-21,-16,-15;
/M: SY='S'; M= -1,  0,-23,  2,  2,-23,  0,-13,-21, -7,-21,-16,  1,  3, -6,-12,  6, -1,-17,-30,-21, -3;
/M:         M= -3, -1,-25,  0, -1,-21,-16,-14, -4, -7,-10, -6, -4,-10, -3,-13, -5, -8, -3,-27,-14, -3;
/M: SY='B'; M= -8,  2,-23,  2, -6, -6, -6,-11,-13,-11,-10, -8,  2,-18,-12,-12, -4, -7,-10,-24, -9, -8;
/M: SY='A'; M=  3, -8,-20, -8, -4,-16,-15,-15, -1,-12, -3, -4, -9,-16, -6,-15, -1, -3,  3,-27,-13, -6;
/M: SY='D'; M= -8, 11,-24, 12,  9,-19,-13, -3,-21,  2,-16,-11,  9,-14,  3,  3, -1, -6,-19,-28,-13,  6;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='I'; M= -6,-19,-17,-21,-15, -1,-22,-16, 19,-17, 14, 12,-16, -6,-12,-16,-14, -6, 11,-15, -3,-15; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='N'; M= -1,  5,-11,  0, -3,-12,  3, -4,-12, -3,-14, -7, 11, -9, -3, -4,  9,  5,-10,-20,-11, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M:         M= -6, -2,-12, -5, -3, -3,-11, -3, -2, -2,  0, -1,  0,-10, -3,  0, -4, -1, -4,-10,  0, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='N'; M= -1,  6,-12,  5,  2,-14,  5, -3,-15,  1,-14,-10,  8, -7, -1, -2,  3, -3,-12,-15,-11,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='E'; M=  2,  1,-10, -1,  6,-12, -7, -3, -7, -1, -9, -5,  1, -6,  6, -3,  4,  1, -6,-15, -8,  6; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='A'; M=  1, -2,-13, -5,  0,-10,-10, -4, -7,  0, -6, -4, -1, -5, -3, -3, -1,  1, -4,-16, -7, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='K'; M= -3,  1,-15,  1,  3,-14,-10, -1,-13,  8,-13, -7,  3, -9,  1,  7,  1, -1, -8,-18, -8,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='T'; M= -6, -5,-13, -6, -5,  0,-15, -5, -2, -7, -4, -3, -5,-12, -4, -7,  0,  5, -1,-10,  5, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='I'; M= -5,-13,-17,-16, -9, -5,-21,-16, 13, -7,  4,  5,-11,-13, -9, -9, -9, -2, 11,-17, -4,-10; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='S'; M= -3, 11,-16, 11,  5,-20, -3, -1,-21, -5,-22,-16, 12,-10, -1, -7, 15, 10,-16,-31,-15,  2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='L'; M= -6, -6,-20, -6,  1,-11,-12,-10, -6,-11,  2,  0, -6, -9, -4,-10, -5,  0, -8,-23,-11, -2; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='B'; M= -6,  6,-22,  5, -2,-17, -9, -8,-14, -4, -8, -6,  5,-11, -5, -7, -4, -4,-13,-27,-13, -4; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-2;
/M: SY='E'; M= -7, 13,-24, 18, 20,-27,-13, -3,-26,  4,-21,-17,  8,-10,  8,  2,  6, -2,-21,-32,-17, 14;
/M: SY='T'; M= -5,-17,-19,-22,-18,  0,-19,-16,  5,-18,  0,  3,-12,-13,-17,-17, -3,  8,  8,-23, -5,-18;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-26, -6,  5,-16,-20, -4,-18, 13,-15, -4, -4,-15, 15, 18, -7, -9,-16,-19, -7,  9;
/M: SY='Q'; M= -9,  7,-25, 10, 12,-27,-15, -3,-23,  9,-20,-12,  5,-12, 15,  8,  3, -2,-20,-28,-14, 13;
/M: SY='Q'; M= -6,  3,-26,  5, 21,-27,-17,  0,-15,  2,-14, -3,  1, -9, 22, -2,  0, -7,-19,-26,-14, 21;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='M'; M= -6,-24,-20,-31,-22, 12,-26,-18, 19,-22, 17, 20,-19,-22,-17,-19,-14, -4, 13,-17,  2,-20;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-10,-14, -6,-18,-21, -6,-18,  8,-15, -7, -6,-21,  6, 27, -6, -8,-11,-22, -8, -3;
/M: SY='S'; M=  9,  0,-19,  0,  3,-23, -6,-11,-20,  2,-19,-13,  0,-11,  1, -5, 10,  3,-13,-28,-16,  2;
/M: SY='L'; M= -4,-23,-17,-27,-21,  8,-25,-19, 15,-22, 17, 13,-20,-24,-18,-18,-11, -1, 14,-21, -2,-19;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-22,-35,-26, 12,-32,-22, 30,-26, 26, 22,-24,-25,-21,-22,-22, -9, 21,-18,  2,-25;
/M: SY='R'; M=-15,-10,-28,-12, -5,-14,-21,  1,-15, 13,-12, -5, -1,-20,  3, 35, -9, -8,-12,-20, -3, -5;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-24, -1, 11,-28,-17, -4,-23, 18,-23, -9,  2,-10, 21, 16,  5,  2,-20,-25,-12, 15;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='I'; M= -9,-26,-22,-32,-23,  8,-31,-22, 28,-26, 26, 17,-22,-23,-19,-22,-19, -5, 18,-18,  1,-23; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='T'; M=  1,-11,-16,-14, -9, -9,-17, -7, -3,-11, -4, -2, -7,-17, -5, -7,  4,  7,  1,-23, -4, -8; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='A'; M=  2, -9,-18,-14,-10, -7,-17, -7,  0,-10, -3, -1, -4,-19, -5, -7, -3, -3,  1,-23, -8, -8; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='C'; M= -3,-14, 10,-20,-17, -9,-22,-20, -1,-19,  1, -3,-10,-24,-16,-15, -3,  3,  2,-32,-13,-17;
/M: SY='V'; M= -3,-14,-17,-19,-16, -7,-25,-20, 10,-13,  6,  8,-14,-19,-13,-14, -5,  9, 13,-26, -7,-16;
/M: SY='S'; M= -2,  3,-19, -2,  4,-22,-13, -6,-18,  4,-20, -8,  7,-12, 10,  3, 11, 10,-14,-29,-14,  6;
/M: SY='F'; M=-10,-13,-21,-17,-14,  9,-18, -7, -6,-11, -2, -2, -8,-22,-13, -9, -7, -1, -3,-15,  6,-13;
/M: SY='L'; M= -7,-28,-19,-30,-21, 11,-28,-20, 18,-27, 40, 19,-28,-28,-20,-19,-26, -9, 12,-19,  0,-20;
/M: SY='P'; M=-10,  2,-32, 11, 19,-30,-12, -9,-28,  3,-27,-20, -3, 25,  2, -4, -2, -9,-28,-30,-23,  9;
/M: SY='P'; M= -8,-15,-26,-11, -1,-22,-21,-11,-15, -3,-13, -9,-15, 31, -5,-10,-12,-10,-19,-27,-18, -5;
/M: SY='L'; M=-11,-26,-21,-28,-20,  9,-29,-16, 19,-26, 40, 19,-24,-28,-17,-19,-26,-10,  8,-18,  4,-19;
/M: SY='P'; M=-10, -9,-27,  0, 10,-30,-20,-15,-24, -7,-27,-20,-13, 55, -5,-16, -6, -8,-28,-32,-27, -1;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-22,  4, 19,-27,-19, -4,-21,  6,-16,-10, -1, -7, 16,  3, -4, -9,-21,-27,-15, 17;
/M: SY='G'; M= -7, -2,-29,  0,  2,-27, 10,-12,-25, -4,-24,-16,  0,  0, -4, -7, -2,-11,-22,-27,-22, -2;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='C'; M= -7,-13, 21,-18,-16, -6,-18,-18, -9,-14, -5, -6, -9,-24,-16,-11, -6, -3, -3,-27,-12,-16; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='T'; M= -7,  1,-10, -1, -8, -8,-16,-13,-12, -9,-11,-10, -2,-15,-10, -7,  4, 13, -5,-24, -6,-10; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='F'; M= -7,-22,-13,-25,-21, 15,-24,-18, -2,-21,  3, -3,-21,-20,-22,-20,-18,-11, -3,  8,  9,-21;
/M: SY='T'; M= -2,  7,-16,  5,  5,-19,-13,-10,-17, -5,-19,-15,  8,-11,  0, -7, 17, 20,-10,-34,-15,  3;
/M: SY='F'; M=-10,-27,-20,-33,-25, 21,-28,-18, 17,-21, 14, 21,-23,-19,-22,-18,-18, -8, 16,-15,  4,-23;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-25, -5, -1,-19,-20,-10,-18, 14,-12, -6, -5, -9,  0, 17, -7,  0,-12,-24,-11, -2;
/M: SY='V'; M=  0,-28,-15,-30,-25, 10,-27,-25, 20,-24, 21, 10,-26,-27,-25,-20,-16, -5, 26,-21, -3,-25;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-15; IM=0; DM=-15;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-22,-14, -2, -2,-23, -5, -2,-13,  8,  4,-12,-18, -3,-11, -9, -2, -5,-19,  2, -3;
/M: SY='Y'; M= -8,-15,-22,-16,-16, 11,-24,  1,  0,-15,  3,  0,-14,-24,-13,-14,-10, -2, -2, -4, 28,-16;
/M: SY='Y'; M=-13, -2,-25, -4, -6, -7,-15,  1,-18,  3,-15,-10, -1,-19, -1,  9, -4,  2,-15,-10, 13, -6;
/M: SY='D'; M=-10, 25,-24, 29, 11,-28, -3, -5,-29, -1,-26,-22, 17,-11, -1, -7,  7,  2,-24,-35,-19,  5;
/M: SY='D'; M= -9, 19,-26, 25, 19,-31, -8, -4,-30,  6,-25,-20, 10,-10,  7,  1,  3, -5,-25,-31,-18, 12;
/M: SY='A'; M=  6,-12,-20,-14, -6,-11,-18,-16, -4, -4, -8, -2,-12,-10, -9, -7, -4, -4,  3,-23,-12, -8;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-17,  1,  5,-14,-16,-11,-10, -4, -7, -8, -5, -5, -4, -5,  0,  5, -5,-24,-12,  0; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='R'; M=  0, -8,-11,-10, -5,  1,-10, -7, -5,  0, -3, -2, -6,-10, -3,  4, -4, -3, -2, -7, -2, -4; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='P'; M= -8, -7,-36,  4,  5,-31,-17,-16,-23, -7,-28,-21,-12, 63, -7,-17, -7, -9,-28,-31,-27, -4;
/M: SY='E'; M= -4, -5,-25, -3,  9,-21, -9, -9,-20,  2,-17,-12, -5, -1,  2, -4,  1, -3,-18,-24,-13,  5;
/M: SY='D'; M=-11, 13,-25, 15,  5,-19,-17,  1,-18, -3,-12,-10,  7,-15,  2, -6, -5, -7,-17,-28, -9,  3;
/M: SY='W'; M=-17,-24,-36,-24,-16, 12,-24, -7,-12,-12,-11,-10,-24,-25, -7,-12,-23,-15,-20, 65, 37,-11;
/M: SY='Q'; M= -6, -4,-24, -4,  9,-22,-22, -8, -7, -1,-10, -4, -6,-12, 13, -2, -1,  1, -7,-26,-12, 10;
/M: SY='P'; M=-10, -8,-32, -1, 12,-23,-23,-14,-12, -5,-15,-12,-12, 28, -3,-12, -9, -9,-16,-29,-19,  2;
/M: SY='S'; M= -2, -1,-23,  3,  5,-18,-12,-13,-21, -5,-23,-18, -2,  5, -4,-10,  9,  5,-17,-21,-15,  0;
/M: SY='D'; M=-12,  8,-28, 13,  1,-15,  8, -9,-27,-11,-18,-17,  2,-12,-11,-14, -5,-13,-23,-22,-12, -5;
/M: SY='F'; M= -7,-23,-23,-28,-20, 28,-24,-16, -2,-20,  0, -4,-18,-10,-23,-18,-12, -5, -4,  3, 15,-21;
/M: SY='K'; M=-10, -8,-21, -7,  4,-20,-21,-11,-16, 10,-14, -8, -5, -5,  1, 10, -7, -7,-13,-26,-14,  1;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M:         M=-11, -2,-25,  0, -2,-13,-13, -9,-10, -8, -4, -6, -5,-11, -2, -7,-10, -9,-12,-14, -8, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-13;
/M: SY='I'; M= -1, -9,-10,-11,-10,-12,-12,-14,  1,-13, -5, -3, -6, -8, -6,-14, -1, -1, -1,-22,-10, -9; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -3,  3, -5,  3,  6,-14, -9, -5,-13, -3,-13,-10,  3, -1,  2, -5,  6,  4,-11,-20,-11,  4; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='E'; M= -2,  2,-13,  1,  6,-11,-10, -5, -8, -3, -5, -4,  0, -2,  0, -5,  0,  2, -8,-17, -9,  3; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M:         M= -4, -5,-15, -6, -4, -1, -6, -7,-10, -4, -7, -5, -5,-11, -1, -5, -4, -6, -9, -1, -1, -2; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Y'; M= -2, -8,-12, -8, -8,  0,-13, -4,  2, -7,  0,  0, -9,-14, -5, -8, -4, -2,  4, -7,  9, -8; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='T'; M= -1, -7,-12, -9, -6, -8,-13,-11, -2,  0, -6, -3, -6, -3, -6, -1,  0,  6,  2,-15, -7, -7; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='W'; M= -8,-13, -9,-16,-12,  6,-15, -8, -7,-11, -1, -4,-11,-16,-11, -6, -8, -2, -6,  7,  4,-11; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='Q'; M= -7,  3,-19,  1,  2,-19, -8, -1,-11,  0,-13, -3,  5, -4, 11,  0, -1, -3,-14,-19,-10,  6; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D'; M=-13,  7,-26, 10,  6,-20,-12,  1,-23,  1,-17,-12,  4, -6,  6,  2, -4, -8,-22,-25,-11,  5; D=-6;
/I:         I=-6; DM=-13;
/M: SY='D'; M=-14, 27,-26, 30,  8,-27,-12, -3,-23, -1,-21,-19, 20, -7, -2, -7,  0, -4,-23,-35,-17,  3;
/M: SY='P'; M= -5,-14,-31,-12, -6,-22,-12,-19, -7,-13,-18,-11,-10, 32,-11,-19, -4, -7,-13,-28,-21,-11;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-25,  1,  9,-19,-15, -4,-14, -1,-13, -9,  2,-14,  7,  1, -1, -4,-14,-25,-10,  7;
/M: SY='L'; M=  0,-12,-20,-14, -3,-10,-20,-10, -4, -6,  4,  2,-12,-17, -1, -5, -6,  0, -4,-21, -5, -3;
/M: SY='V'; M= -2,-15,-21,-17,-17, -8,-24,-15, 13,-18,  6,  6,-15,-15,-15,-19,-10, -3, 14,-26, -8,-18;
/M: SY='D'; M=-10,  6,-28, 10,  7,-26,-16, -4,-21,  0,-23,-15,  4,  9,  6, -3,  0, -3,-22,-28,-14,  5;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-20,-29,-24,  4,-26,-24, 24,-25, 22, 12,-21,-27,-23,-21,-18, -7, 22,-23, -4,-24;
/M: SY='G'; M= -5, -5,-29, -6, -7,-26, 21, -7,-33,  7,-26,-15,  3,-17, -5, 12, -4,-14,-24,-21,-19, -7;
/M: SY='S'; M=  1,  0,-18, -4, -2,-18, -7, -5,-15, -5,-20,-12,  8,-14, -3, -5, 14,  9,-10,-32,-14, -3;
/M: SY='F'; M= -9,-28,-17,-32,-26, 23,-30,-23, 17,-22, 17, 11,-25,-28,-27,-18,-17, -6, 22,-15,  4,-25;
/M: SY='N'; M= -7, 12,-12,  9,  0,-21,-11, -6,-20, -5,-21,-16, 15,-10, -1, -4, 10,  6,-18,-35,-18, -1;
/M: SY='T'; M= -1, -4,-17, -7, -8,-12,-11,-17,-13,-12,-17,-13, -1, -1,-10,-13, 15, 21, -8,-30,-14, -9;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P'; M= -6, -5,-29, -2,  0,-27,  6,-14,-26, -2,-25,-17, -3, 13, -6, -9, -1, -8,-24,-27,-22, -5;
/M: SY='H'; M=-13,-14,-20,-16,-13, -6,-21, 13, -6,-15, -7,  1, -9, -8,-11,-13,-13,-13, -8,-24,  0,-14;
/M: SY='H'; M=-16,-10,-27,-11, -8,-12,-18, 50,-13,-14, -1,  7, -3,-22,  0, -5,-15,-16,-15,-26,  9, -8;
/M: SY='K'; M= -3, -4,-12, -8, -3,-17,-16,-12,-18, 15,-20, -7, -1,-15, -2,  6,  0, -1,-10,-26,-11, -2;
/M: SY='V'; M= -3,-21,-17,-26,-22,  2,-20,-20, 15,-20, 14, 12,-18,-25,-20,-18,-12, -3, 17,-23, -6,-21;
/M: SY='B'; M= -7, 12,-24, 11, 10,-22,-11, -3,-23,  3,-21,-14, 10,-12,  9,  1,  4,  0,-21,-27,-14,  9;
/M: SY='L'; M= -1,-19,-12,-23,-16, -5,-23,-18, 10,-19, 13, 11,-17,-21,-11,-16, -8,  2, 10,-25, -7,-14;
/M: SY='Y'; M=-11,-16,-25,-18,-10,  4,-20,-10, -3, -9,  2,  1,-13,-22, -7, -9,-13, -9, -6, -4,  8, -8;
/M: SY='V'; M=  9,-25, -4,-28,-25, -5,-24,-27, 18,-20,  7,  5,-25,-26,-24,-21, -7, -2, 32,-28,-12,-25;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 33 in 33 different sequences
Number of true positive hits 33 in 33 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 97.06 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] HORMA
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
33 sequences

HOP1_YEAST  (P20050), HORM1_BOVIN (Q2KIY6), HORM1_CANFA (E2RSQ2), 
HORM1_DANRE (A2BF66), HORM1_HUMAN (Q86X24), HORM1_MACFA (Q4R8B9), 
HORM1_MOUSE (Q9D5T7), HORM1_PIG   (E2IUK4), HORM1_RAT   (D3ZWE7), 
HORM1_XENLA (Q5M7C8), HORM2_BOVIN (A6QQY4), HORM2_CANFA (E2QXH7), 
HORM2_HUMAN (Q8N7B1), HORM2_MOUSE (Q5SQP1), MAD2_ARATH  (Q9LU93), 
MAD2_MAIZE  (Q9XFH3), MAD2_SCHPO  (O14417), MAD2_YEAST  (P40958), 
MD2L1_DICDI (Q556Y9), MD2L1_HUMAN (Q13257), MD2L1_MOUSE (Q9Z1B5), 
MD2L2_BOVIN (Q2KIP7), MD2L2_CHICK (Q4KWZ6), MD2L2_DANRE (Q568H3), 
MD2L2_DICDI (Q54S00), MD2L2_HUMAN (Q9UI95), MD2L2_MOUSE (Q9D752), 
MD2L2_RAT   (D3Z8D9), MD2L2_XENLA (Q8QFR4), MD2L2_XENTR (Q28H85), 
REV7_ARATH  (Q94FL5), REV7_SCHPO  (Q0E7J8), REV7_YEAST  (P38927)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

HOP1_SCHPO  (Q9P7P2)

		
PDB
[Detailed view]
16 PDB

1DUJ; 1GO4; 1KLQ; 1S2H; 2QYF; 2V64; 2VFX; 3ABD; 3ABE; 3GMH; 3VU7; 4AEZ; 4EXT; 4FJO; 4GK0; 4GK5
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission