PROSITE

Home | Contact

	Home ScanProsite ProRule Documents Downloads Links Funding
	Entry: PS50821

General information about the entry

Entry name [info]

PAZ

Accession [info]

PS50821

Entry type [info]

MATRIX

Date [info]

01-MAY-2002 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 05-JUL-2017 INFO UPDATE.

PROSITE Doc. [info]

PDOC50821

Associated ProRule [info]

PRU00142

Name and characterization of the entry

Description [info]

PAZ domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.3211000; R2=0.0212500; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=5351.9135742; R2=7.8062282; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=338; H_SCORE=7990; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=244; H_SCORE=7257; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B0=-60; B1=-60; E0=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='H'; M=-13,  0,-16,  4,  5,-19,-19, 11,-21,-10,-11,-10, -4,-18,  1, -9, -8,-11,-20,-17, -5,  3;
/M: SY='E'; M=-10, -4,-28, -2, 20,-14,-23, -7,-17,  3,-14,-10, -6, -1, 10, -2, -4, -5,-19,-22,-10, 15;
/M: SY='V'; M= -6,-17,-16,-21,-24,  2,-27,-23, 21,-19,  5,  5,-15,-26,-24,-19,-10, -3, 29,-27, -7,-24;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-11,-28,-20,  8,-26,-15,  9,-19, 23, 13,-23,-28,-17,-12,-20, -8,  7,-17,  4,-19;
/M: SY='D'; M=-10, 13,-27, 19, 17,-28,-15, -2,-27, 10,-20,-12,  4,-11, 10, 11, -3, -9,-21,-28,-15, 12;
/M: SY='L'; M= -5,-13,-20,-18,-10,  5,-23,-17,  2,-11,  6,  1,-10,-20,-14,-11,-10, -1,  3,-20, -3,-12;
/M: SY='M'; M=-13,-16,-25,-20, -9,  3,-25,  4,  5, -9,  9, 22,-15,-20, -4, -8,-17,-11, -1,-16,  8, -8;
/M: SY='E'; M= -6,  4,-22,  4, 18,-23,-11, -6,-23,  2,-19,-15,  5, -9,  9,  2,  9,  9,-19,-29,-16, 13;
/M: SY='N'; M= -8,  7,-25,  5,  1,-22,-16, -5,-15,  6,-14, -8,  9,-16,  4,  8, -5, -7,-15,-27,-12,  2;
/M: SY='C'; M=-12, -3, 11, -5, -4,-14,-24,-10, -9,-13,-10, -5, -5,-22, -9,-16, -9, -9, -9,-29, -8, -8;
/M: SY='S'; M= -2, -6,-21, -7, -1,-16, -9,-13, -8,-12,-11, -9, -2, -7, -7,-13,  5, -1, -5,-31,-17, -5;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='N'; M= -7,  2,-20, -4,  1,-16,-16, -7, -9,  0,-11, -7,  7,-13,  3,  2,  3,  7,-10,-26,-11,  1; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='S'; M= -4, -3,-18, -6,  0,-15,-16,-10, -5, -3, -9, -5,  1,-14,  1, -5,  4,  4, -4,-27,-11,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='K'; M= -8, -3,-25, -2,  1,-20, -6, -6,-18,  7,-16, -1, -3, -4,  1,  7, -4, -7,-15,-24,-14,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='A'; M=  4, -1,-13, -1, -1,-13, -9,-10, -9, -2, -7, -7, -4,  1, -4, -6,  0,  2, -6,-16,-10, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-22;
/M: SY='R'; M=  3, -6,-10, -7, -3, -8, -6, -6, -7, -1, -5, -4, -2, -9, -1,  5,  4,  1, -4,-14, -7, -3; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M=-15,  3,-32,  9,  3,-25,-20,  2,-19,  1,-20,-12, -2,  7,  4,  0, -8,-11,-21,-25, -7,  1;
/M: SY='L'; M=-10, -7,-22, -6,  0, -6,-23,-12,  0,-16, 19,  3,-11,-21, -9,-13,-15, -5, -5,-26, -8, -4;
/M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -6,  0,-17,-14, -1,-13, -5,-17, -7, -2, -5, -2, -7, 11, 10, -8,-32,-12, -2;
/M: SY='D'; M= -9, 11,-23, 15,  6,-23,-15, -6,-23,  5,-17,-11,  4,-13,  1, 10,  1,  3,-16,-29,-14,  2;
/M: SY='R'; M= -1,  0,-22,  0,  6,-17,-14, -7,-22,  6,-19,-13,  0,-12,  5,  8,  5,  0,-16,-24,-12,  5;
/M: SY='D'; M= -9, 15,-27, 22,  7,-26,-15,  7,-25, -3,-21,-15,  4, -6,  8, -7, -1, -4,-22,-25, -5,  6;
/M: SY='R'; M=-11,-11,-29,-12, -6,-14,  3, -4,-22, -2,-13, -6, -6,-20,  7,  8, -8,-13,-21,-14, -4, -1;
/M: SY='V'; M= -7, -6,-10, -2, -8,-17,-21,-17, -8, -5,-10, -8,-10,-11,-12,-10, -5, -4,  2,-32,-15,-10;
/M: SY='F'; M=-14,-14,-24,-18, -8, 19,-24, -9,-11,  1, -6, -1,-11,-20,-11,  2,-12, -4, -8, -6, 13, -9;
/M: SY='V'; M=-10,-14, -6,-18,-19,  6,-26,-20,  6,-17,  2,  0,-12,-26,-22,-16,-12, -6, 10,-24, -4,-20;
/M: SY='A'; M=  4, -7,-21,-10, -5,-20, -7,-15,-19,  4,-17,-11, -5, -5, -5,  1,  3,  4,-12,-24,-16, -6;
/M: SY='E'; M=-11, -3,-13, -1, 19,-26,-22, -7,-24, 16,-20,-12, -4,-13, 10, 15, -6, -9,-18,-27,-15, 14;
/M: SY='D'; M= -3, 15,-24, 19,  7,-27, -7, -8,-24,  2,-21,-17,  7,-14, -3, -2,  0, -7,-15,-30,-18,  2;
/M: SY='F'; M= -9,-26,-21,-29,-25, 17,-21,-17, 13,-23, 14,  7,-23,-28,-25,-19,-17, -8, 14,-10, 12,-25;
/M: SY='Q'; M=-12, -8,-28, -9,  7,-22,-22, -3,-12, 13, -9,  3, -6,-14, 18, 17,-10,-10,-14,-21, -8, 11;
/M: SY='G'; M= -9, 11,-26, 15, -7,-20, 19,-11,-28,-12,-23,-19,  8,-19,-14,-15, -2,-12,-19,-27,-19,-10;
/M: SY='A'; M= 12,-20,-17,-25,-16, -7,-19,-20, 10,-13, 12, 10,-19,-19,-13,-16,-10, -5, 11,-21, -9,-15;
/M: SY='V'; M= -6,-21,-22,-24,-17, -8,-30,-23, 16, -3,  5,  8,-19,-22,-15, -8,-15, -6, 20,-24, -6,-17;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-15,-30,-27, -2,-31,-27, 27,-17,  9, 10,-25,-27,-24,-13,-12, -3, 40,-27, -8,-27;
/M: SY='M'; M= -9,-13,-24,-14,  0, -6,-24, -9,  0,-11,  5,  8,-14, -6, -4,-12,-10,  0, -5,-20, -1, -4;
/M: SY='T'; M=  5,-15, -9,-19,-13,-15,-20,-23, -4,-15,-11, -8,-14,  9,-15,-19,  1, 10,  1,-29,-17,-16;
/M: SY='P'; M= -7, -4,-30, -1, -3,-20,-17,-14,-21, -6,-21,-17, -8,  6, -3, -7, -5,  0,-20,  2,-10, -3;
/M: SY='H'; M=-18, -8,-28, -9, -9,  2,-24, 54,-15,-10,-11, -1, -4,-23,  0, -5,-11, -9,-19, -5, 42, -9;
/M: SY='R'; M=-13,  2,-13, -5, -6,-18,-16, -4,-18,  7,-20,-11, 14,-21,  0, 25, -1, -5,-16,-30,-14, -6;
/M: SY='N'; M= -4, 15,-24,  4, -7,-23, 21, -3,-27, -4,-28,-18, 29,-19, -6, -1,  5, -8,-27,-30,-22, -7;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='N'; M= -7,  8,-14,  1,  0, -7, -8,  2, -8, -3, -8, -4, 15,-13,  6, -1, -1, -3,-14,-17, -6,  3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
/M: SY='D'; M= -6, -1,-16,  3,  1,-12,-13, -6, -4, -5, -5,  2, -6,  0, -4, -8, -5, -5, -2,-19, -9, -2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='Q'; M= -6, -3,-19, -3,  2,-20,  4, -2,-19,  7,-15, -6,  0, -9, 13, 10, -2, -8,-17,-13,-10,  7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-27;
/M: SY='R'; M=-16, -9,-28, -9, -1,-17,-22,  5,-21, 21,-17, -6, -4,-19,  9, 37,-10,-10,-14,-16,  1,  1;
/M: SY='R'; M=-10, -7,-21,-12, -9, -4,-22,-10, -9,  6,-12, -6, -3,-20, -8,  9, -4,  4, -2,-19,  0, -9;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-27,-23, 47,-30,  7,  0,-17,  3,  0,-20,-30,-20,-13,-20,-10, -7, 23, 63,-23;
/M: SY='R'; M=-16,-12,-13,-13, -9, -5,-23,  2,-19, 10,-15, -9, -8,-23, -1, 23, -9, -8,-15, -8, 16, -9;
/M: SY='V'; M= -5,-27,-17,-32,-28,  7,-32,-28, 29,-23, 11, 10,-23,-25,-26,-22,-11,  1, 33,-23, -3,-28;
/M: SY='A'; M=  9,  5, -7,  4,  1,-23,-11,-13,-18, -2,-18,-15,  1,-15, -6,-10,  3, -3, -9,-31,-19, -3;
/M: SY='G'; M= -7, 13,-28, 18,  7,-31, 23, -8,-35, -7,-28,-22, 11,-13, -5,-12,  4,-11,-28,-30,-24,  1;
/M: SY='V'; M= -6,-30,-18,-33,-28,  9,-33,-27, 30,-26, 22, 14,-27,-27,-26,-23,-18, -6, 32,-22, -2,-28;
/M: SY='T'; M= -8, -3,  3, -3,-11,-13,-12,-15,-16,-16, -7,-11, -6,-21,-14,-16, -1,  4,-10,-29,-10,-13;
/I:         I=-6; MD=-32;
/M: SY='F'; M= -6, -8,-20,-12, -9,  4,-16, -9,-12, -8,-13,-10, -2,  1,-11, -5,  0,  3,-12,-15, -1,-11; D=-6;
/I:         I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='Q'; M= -6,  8,-26,  9,  8,-28, -8,  5,-24,  4,-21,-12,  7,-14, 10,  4, -1, -9,-20,-27,-13,  8;
/M: SY='P'; M= -4,-19,-26,-17, -8,-12,-18,-15, -6,-14, -2, -1,-17,  8, -5,-15, -8, -6,-11,-11,-11, -8;
/M: SY='T'; M= 12,  1,-13, -8, -6,-16, -9,-13,-14, -5,-16,-13,  5,-12, -6, -5, 17, 21, -7,-29,-15, -6;
/M: SY='P'; M= -3, -6,-29, -1, -1,-27, -5,-14,-25, -5,-27,-19, -6, 30, -6, -6,  2, -5,-23,-30,-24, -6;
/M: SY='E'; M=-11,  2,-25,  3, 10,-17,-18,  3,-16,  0, -6, -7,  2,-16,  2,  3, -6, -7,-16,-28,-10,  5;
/M: SY='S'; M=  0, -8, -2,-10, -7,-12,-13, -9,-13,-13,-13,-10, -3,-18, -2,-12, 15, 10, -8,-29, -7, -5;
/M: SY='T'; M= -8,-11, -8,-15,-10, -3,-22,-12,-11,  0, -7, -2, -9,-19, -9, -3, -4,  6, -6,-19,  1, -9;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-20,-39,-29, 73,-30,-20,  2,-30, 14,  2,-21,-30,-38,-20,-21,-10,  1,  7, 27,-29;
/M: SY='P'; M= -6,-13,-28,-10, -3,-23,-19,-19,-15, -5,-23,-15,-12, 42, -9,-12,  0,  5,-15,-30,-22, -9;
/M: SY='R'; M= -6, -6, -9, -6, -8,-18,-11,-14,-16, -2,-14,-10, -5,-19, -8,  2,  2,  1, -6,-30,-15, -9;
/M: SY='D'; M=-14, 17,-28, 21,  9,-29,-15, -3,-29, 13,-26,-17, 11, -6,  7, 13, -1, -4,-24,-30,-16,  7;
/M: SY='E'; M=-10, 11,-27, 12, 15,-26,  0,  6,-26, -3,-19,-14, 12,-13,  6, -5, -1,-11,-27,-29,-16, 10;
/I:         I=-5; MD=-27;
/M: SY='N'; M= -4,  0,-17, -2, -1,-16,  5, -6,-16, -1,-16,-11,  7,-13, -3,  3,  3, -4,-11,-22,-14, -3; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='E'; M=-15,  3,-28,  8, 14, -7,-21,  3,-18,  2,-13, -8, -4,-14,  4, -4, -9,-10,-19,-12, 11,  8;
/M: SY='Q'; M=-11, -9,-15,-12,  0,-17,-25,-12, -2, -2, -5, -1, -5,-17,  2, -1,-10, -9, -7,-26,-10, -1;
/M: SY='T'; M=  4,  0,-10, -6, -6,-14,-12,-16,-14,-10,-18,-14,  4,-10, -6,-10, 28, 38, -4,-34,-14, -6;
/M: SY='F'; M=-12,-27,-19,-30,-27, 34,-30,-13, 12,-20,  7,  4,-24,-30,-28,-17,-16, -6, 17,  0, 28,-27;
/M: SY='A'; M= 17,-13,-16,-21,-16,-13,-16,-21,  7,-10, -4, -1, -9,-17,-14,-16, -2, -3, 13,-24,-13,-16;
/M: SY='E'; M=-14, 19,-30, 31, 40,-33,-17,  9,-32,  5,-23,-19,  6, -5, 17, -2, -1,-11,-30,-32,-16, 28;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='Y'; M=-20,-24,-26,-28,-24, 49,-30,  5,  0,-18,  4,  0,-20,-30,-21,-14,-20,-10, -6, 22, 61,-24;
/M: SY='K'; M=-11,-12,-27,-12,  1,-13,-25, -6, -5,  5,  5,  3,-12,-17,  1,  1,-16,-11, -7,-22, -5,  0;
/M: SY='E'; M= -8,  5,-25,  8, 22,-27,-20, -6,-21, 11,-19,-11, -1, -9, 15,  3,  0,  0,-17,-27,-14, 18;
/M: SY='R'; M=-12, -1,-27, -4,  3,-23,-18, -6,-25, 33,-23, -6,  3,-14,  7, 34, -7, -5,-18,-22,-10,  4;
/M: SY='Y'; M=-20,-15,-30,-15,-15, 17,-27, 41, -8,-10, -5,  0,-12,-27, -5, -7,-17,-13,-15, 14, 64,-15;
/M: SY='N'; M= -6, 13,-26,  5, -6,-26, 24, -5,-30,  1,-30,-18, 26,-18, -6, -3,  3,-10,-28,-29,-22, -6;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-22,-35,-27, 14,-34,-25, 31,-28, 27, 16,-25,-26,-24,-24,-22, -8, 23,-18,  2,-27;
/M: SY='R'; M=-12,  0,-25,  1,  3,-21,-21, -8,-14,  5,-13, -8, -2,-15,  5, 16, -3,  0, -9,-26,-11,  2;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-25,-35,-25,  5,-35,-25, 34,-30, 36, 20,-25,-25,-20,-25,-25,-10, 20,-20,  0,-25;
/M: SY='R'; M=-14,  2,-27, -2,  3,-21,-17,  5,-21, 12,-19, -8,  9,-17, 20, 27, -2, -4,-23,-20, -4,  9;
/M: SY='Y'; M=-18, 10,-15, 10, -5, -2,-19, 15,-20, -9,-16,-13,  7,-23, -8,-10, -8,-10,-20,-16, 16, -8;
/M: SY='P'; M= -8,-13,-25,-13, -6,-16,-23, -8, -8, -8, -7, -4,-13, 10, -4,-10, -6,  3, -8,-27,-11, -7;
/M: SY='N'; M=-11, 22,-24, 16,  6,-26, -9, 19,-25,  4,-27,-14, 30,-16, 11,  2,  5, -5,-27,-34,-12,  8;
/M: SY='Q'; M=-10,-11,-26,-10,  8,-19,-24, -3, -5, -6,  8,  6,-12,-17, 24, -3,-12,-10,-14,-21, -7, 16;
/M: SY='P'; M= -8,-18,-37, -9,  0,-29,-18,-19,-20,-10,-30,-20,-17, 81, -9,-19, -6, -7,-28,-31,-29, -9;
/M: SY='C'; M=-10,-26, 35,-30,-24, -2,-30,-24,  0,-30, 22,  4,-26,-34,-24,-24,-22,-10,  2,-32,-12,-24;
/M: SY='L'; M= -8,-30,-20,-32,-24,  6,-32,-24, 27,-28, 37, 18,-28,-28,-22,-22,-24, -8, 21,-22, -2,-24;
/M: SY='Q'; M=-12,  6,-26,  7,  2,-21,-19, -4, -9, -3, -4,  1,  2,-16,  8, -5, -9, -9,-13,-27,-10,  5;
/M: SY='V'; M=  1,-18,-16,-18,-19,-12, -5,-23,  2,-11, -9, -3,-14,-23,-19,-13,  1, -1, 17,-29,-15,-19;
/M: SY='R'; M=-13,  7,-30, 12,  3,-30,  2, -7,-35, 17,-27,-17,  5,-15,  1, 21, -5,-12,-25,-25,-17,  1;
/M: SY='H'; M= -7,  5,-25, -2, -4,-15, -6, 22,-21, -8,-21,-10, 15, -8,  1, -7, -1, -9,-24,-27, -6, -3;
/M: SY='T'; M= -5, -8,-21,-11, -4,-17,-14,-16, -9, -7,-12, -8, -6, -3, -4, -6,  5, 12, -5,-27,-14, -5;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='D'; M= -6,  9,-19, 12,  9,-15,-10, -4,-22, -1,-22,-16,  8,-11,  4, -4, 11,  1,-17,-28,-12,  7; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='K'; M= -2, -3,-21, -6,  1,-18,-16, -7,-18, 15,-18, -8, -2,-11,  6, 10,  2,  5,-12,-18, -4,  3; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='R'; M= -4, -8,  4,-13, -9,-16,-16, -2,-18, -4,-11, -9, -3,-15, -6,  5, -6, -8,-13,-27,-13,-10; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L'; M= -7,-14,-18,-15,-11, -4,-10, -2,  2,-12, 11,  6,-11,-17, -9, -9,-14, -9, -2,-15, -2,-11; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='N'; M= -3, 17,-10,  9,  0,-11,  0,  3,-11, -1,-16,-11, 27,-10,  0, -1,  8,  2,-14,-21,-11,  0; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-21;
/M: SY='L'; M= -7,-12,-13,-13, -8,  9,-15, -5,  2, -6, 10,  4,-11,-14, -8, -4,-12, -5, -1, -3, 10, -8; D=-4;
/I:         I=-4; MI=-21; MD=-21; IM=-21; DM=-21;
/M: SY='L'; M= -6,-13,-12,-13, -9,  2,-15,  2,  5,-14, 19,  9,-12,-15, -8, -9,-14, -6,  1,-12,  2, -9; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-21;
/M: SY='Q'; M=  0, -5,-19, -8, -1,-21,-16, -8,-11,  2,-16, -6, -1,-15,  9,  4,  6,  3, -5,-27,-13,  3;
/M: SY='Y'; M= -5,-17,-25,-21,-13,  4,-17,-10,  5,-15,  0,  4,-13,-19,-12,-17,-10, -5,  0, -9, 12,-14;
/M: SY='L'; M= -9,-21,-21,-24,-18,  3,-17,-16, 11,-25, 33, 17,-19,-27,-16,-17,-23,-10,  3,-22, -5,-17;
/M: SY='P'; M= -3,-16,-28,-13, -8,-21,-19,-19, -7,-11,-19,-12,-14, 42,-14,-18, -6, -6, -8,-30,-23,-14;
/M: SY='P'; M= -9,-14,-29,-10, -7,-16,-21,-15, -4,-14, -5,  0,-16, 27,-10,-18,-11, -8,-11,-28,-16,-11;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 18, 56,-31,-20,  1,-29, 10,-20,-18,  0, -1, 24,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 40;
/M: SY='L'; M=  1,-27,-17,-29,-21,  9,-25,-21, 15,-25, 31, 12,-26,-27,-21,-20,-20, -7, 13,-19, -2,-21;
/M: SY='C'; M= -8,-23, 69,-31,-29,-13,-30,-27, -7,-26, -7, -4,-22,-34,-26,-26,-12, -8,  7,-41,-21,-28;
/M:         M= -4, -2,-19, -5, -8, -9,-16, -1, -9, -4,-11, -2,  0,-18, -7, -6,  0,  0, -3,-27, -6, -8;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-22,-34,-28,  4,-35,-24, 36,-24, 17, 14,-24,-25,-22,-24,-17, -7, 31,-18,  5,-28;
/M: SY='I'; M=-10,-20,-24,-24,-20, -6,-31, 12, 18,-21,  4, 11,-13,-23,-13,-17,-14,-10, 16,-26,  4,-20;
/M: SY='P'; M= -4,-16,-30,-10,  3,-22,-20,-18,-12, -6,-15,-11,-17, 37, -8,-13, -9, -8,-14,-27,-21, -5;
/I:         E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_07 which contains 555'100 sequence entries.

Total number of hits

95 in 95 different sequences

Number of true positive hits

95 in 95 different sequences

Number of 'unknown' hits

Number of false positive hits

Number of false negative sequences

Number of 'partial' sequences

Precision (true positives / (true positives + false positives))

100.00 %

Recall (true positives / (true positives + false negatives))

100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info]

protein_domain

Scaling database [info]

reversed

Author [info]

CJA_Sigrist

Taxonomic range [info]

Eukaryotes

Maximum number of repetitions [info]

Feature key [info]

DOMAIN

Feature description [info]

PAZ

Version [info]

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

95 sequences

AGO10_ARATH (Q9XGW1    ), AGO11_ORYSJ (Q10F39    ), AGO12_ORYSJ (Q7Y001    ),

AGO13_ORYSJ (Q852N2    ), AGO14_ORYSJ (Q6Z4F1    ), AGO15_ORYSJ (Q5NBN9    ), 
AGO16_ORYSJ (Q6YSJ5    ), AGO17_ORYSJ (Q6H6C3    ), AGO18_ORYSJ (Q69UP6    ), 
AGO1A_ORYSJ (Q6EU14    ), AGO1B_ORYSJ (Q7XSA2    ), AGO1C_ORYSJ (Q6K972    ), 
AGO1D_ORYSJ (Q5Z5B2    ), AGO1_ARATH  (O04379    ), AGO1_HUMAN  (Q9UL18    ), 
AGO1_MOUSE  (Q8CJG1    ), AGO1_SCHPO  (O74957    ), AGO2_ARATH  (Q9SHF3    ), 
AGO2_BOVIN  (Q6QME8    ), AGO2_DROME  (Q9VUQ5    ), AGO2_HUMAN  (Q9UKV8    ), 
AGO2_MOUSE  (Q8CJG0    ), AGO2_ORYSJ  (Q7XTS4    ), AGO2_RABIT  (O77503    ), 
AGO2_RAT    (Q9QZ81    ), AGO2_XENLA  (Q6DCX2    ), AGO2_XENTR  (Q6DJB9    ), 
AGO3_ARATH  (Q9SHF2    ), AGO3_BOMMO  (A9ZSZ2    ), AGO3_BOVIN  (Q6T5B7    ), 
AGO3_CHICK  (Q5ZLG4    ), AGO3_DANRE  (A3KPK0    ), AGO3_DROME  (Q7PLK0    ), 
AGO3_HUMAN  (Q9H9G7    ), AGO3_MOUSE  (Q8CJF9    ), AGO3_ORYSJ  (Q7XTS3    ), 
AGO4A_ORYSJ (Q9SDG8    ), AGO4B_ORYSJ (Q0JF58    ), AGO4_ARATH  (Q9ZVD5    ), 
AGO4_CHICK  (Q5ZMW0    ), AGO4_HUMAN  (Q9HCK5    ), AGO4_MOUSE  (Q8CJF8    ), 
AGO4_XENLA  (Q4KLV6    ), AGO5_ARATH  (Q9SJK3    ), AGO6_ARATH  (O48771    ), 
AGO7_ARATH  (Q9C793    ), AGO7_ORYSJ  (Q75HC2    ), AGO8_ARATH  (Q3E984    ), 
AGO9_ARATH  (Q84VQ0    ), AUB_DROME   (O76922    ), DCL1_ARATH  (Q9SP32    ), 
DCL1_ORYSJ  (Q8LMR2    ), DCL2A_ORYSJ (Q10HL3    ), DCL2B_ORYSJ (Q69LX2    ), 
DCL2_ARATH  (Q3EBC8    ), DCL3A_ORYSJ (Q5N870    ), DCL3B_ORYSJ (Q7XD96    ), 
DCL3_ARATH  (Q9LXW7    ), DCL4_ARATH  (P84634    ), DCL4_ORYSJ  (A7LFZ6    ), 
DCL_GIAIC   (A8BQJ3    ), DCR1_CAEEL  (P34529    ), DCR1_DROME  (Q9VCU9    ), 
DICER_BOVIN (Q6TUI4    ), DICER_CHICK (Q25BN1    ), DICER_CRIGR (A0MQH0    ), 
DICER_DANRE (Q6TV19    ), DICER_HUMAN (Q9UPY3    ), DICER_MOUSE (Q8R418    ), 
DICER_XENTR (B3DLA6    ), ERGO1_CAEEL (O61931    ), MEL1_ORYSJ  (Q851R2    ), 
NRDE3_CAEEL (Q21691    ), PIWI1_SCHMD (Q2Q5Y9    ), PIWI2_SCHMD (Q2Q5Y8    ), 
PIWIL_DUGJA (Q2PC95    ), PIWI_DROME  (Q9VKM1    ), PIWL1_CHICK (A6N7Y9    ), 
PIWL1_DANRE (Q8UVX0    ), PIWL1_HUMAN (Q96J94    ), PIWL1_MOUSE (Q9JMB7    ), 
PIWL2_DANRE (A2CEI6    ), PIWL2_HUMAN (Q8TC59    ), PIWL2_MOUSE (Q8CDG1    ), 
PIWL2_ONCMY (A6P7L8    ), PIWL2_XENTR (A8KBF3    ), PIWL3_HUMAN (Q7Z3Z3    ), 
PIWL4_HUMAN (Q7Z3Z4    ), PIWL4_MOUSE (Q8CGT6    ), PIWL4_RAT   (Q4G033    ), 
PNH1_ORYSJ  (Q69VD5    ), SIWI_BOMMO  (A8D8P8    ), TAG76_CAEEL (P34681    ), 
WAGO1_CAEEL (Q21770    ), YQ53_CAEEL  (Q09249    )

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

48 PDB

1R6Z; 1SI2; 1SI3; 1T2R; 1T2S; 1VYN; 2FFL; 2L5C; 2L5D; 2QVW; 2XFM; 3MJ0; 3O3I; 3O6E; 3O7V; 3O7X; 3QIR; 4F3T; 4KRE; 4KRF; 4KXT; 4NGB; 4NGC; 4NGD; 4NGF; 4NGG; 4NH3; 4NH5; 4NH6; 4NHA; 4OLA; 4OLB; 4W5N; 4W5O; 4W5Q; 4W5R; 4W5T; 4Z4C; 4Z4D; 4Z4E; 4Z4F; 4Z4G; 4Z4H; 4Z4I; 5GUH; 5JS1; 5JS2; 5KI6
» more

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

SIB Swiss Institute of Bioinformatics | Disclaimer

Back to the Top