Entry: PS50826

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] RUN
Accession [info] PS50826
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50826
Associated ProRule [info] PRU00178

Name and characterization of the entry

Description [info] RUN domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=135;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=130;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.5367; R2=0.02185705; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8314.71688; R2=23.60260; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=319; N_SCORE=9.5; H_SCORE=14758; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; H_SCORE=12587; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='B'; M= -7,  3,-24,  3,  2,-17,-15, -1,-15, -7,-12,-10,  2,-15, -4, -7, -2,  0,-12,-21, -9, -1;
/M: SY='E'; M= -5, -3,-21, -2,  4,-15,-14, -6, -7,-10, -7, -7, -2,-16, -5,-11,  1, -3, -4,-31,-13, -1;
/M: SY='E'; M= -8, -1,-23,  0,  4,-17,-15, -7,-14, -3, -9, -9, -2,-12, -3, -1, -2,  1,-10,-29,-13,  0;
/M: SY='D'; M= -7,  4,-13,  5, -2,-15,-10, -3,-17,-11,-13,-12,  3,-17, -6,-11,  5,  3,-14,-28, -6, -4;
/M:         M= -4, -7, -3, -7,  0,-17,-13,-14,-15,-10,-12,-11, -8,-12, -8,-13, -1, -3,-10,-28,-13, -5;
/M:         M= -5,-13,-24,-12,-11,-14, -1,-11, -6,-15, -8, -4,-10,-16,-11,-15, -4, -8, -2,-24,-10,-12;
/M: SY='V'; M= -7,-14,-21,-16,-10, -5,-24,-15,  1, -8,  3,  1,-12,-20, -8,  0, -7, -1,  5,-23, -7,-10;
/M: SY='Q'; M= -3,  1,-17,  0,  1,-24,-10,-11,-18,  1,-18,-10,  1,-14,  4, -4,  3,  1,-13,-28,-15,  2;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-20, -4, -2,-21,  0, -8,-20, -3,-19,-13,  8,-15,  1,  2,  9,  4,-16,-28,-17, -1;
/M: SY='L'; M=-12,-30,-20,-32,-22, 23,-30,-19, 16,-29, 41, 18,-28,-30,-23,-20,-28,-10,  8,-14,  6,-21;
/M: SY='C'; M=  1,-21, 68,-29,-27,-12,-25,-28,-14,-25,-11,-12,-20,-33,-27,-26, -7, -6,  3,-39,-22,-27;
/M:         M= -5, -3,-24, -4, -2,-18, -9,-12,-12, -5,-12, -9, -1, -8, -6, -4, -2, -4,-10,-27,-15, -6;
/M: SY='A'; M= 21, -8, -8,-14,-10,-16,-10,-15, -7,-13, -8, -8, -7,-15,-10,-17,  7,  5,  0,-27,-15,-11;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-19,-31,-23, 10,-29,-19, 23,-26, 35, 23,-27,-28,-20,-19,-24, -9, 17,-20,  0,-21;
/M: SY='E'; M=-12,  9,-30, 17, 39,-30,-19,  5,-30, 14,-22,-16,  2, -6, 20, 10, -2,-10,-28,-28,-15, 29;
/M: SY='Q'; M= 14, -5,-13,-10,  3,-26,-11,  1,-18, -1,-16, -8, -4,-13, 15, -2,  4, -5,-15,-24,-14,  8;
/M: SY='L'; M= -1,-25,  6,-31,-24, -3,-29,-25, 15,-27, 17,  8,-23,-27,-21,-25,-17, -8, 14,-27, -9,-24;
/M: SY='F'; M=-14,-30,-24,-35,-25, 29,-30,-20, 16,-27, 25, 15,-25,-28,-24,-21,-25,-11,  7,  2, 11,-24;
/M: SY='Q'; M= -3, -7,-22, -6,  4,-15,-18, -7, -6, -7, -3, -1, -7,-15,  5, -8, -1, -4, -8,-24, -7,  4;
/M: SY='H'; M=-19,  3,-23,  6,  0,-18,-20, 63,-26,-10,-16, -4,  5,-20,  6, -4,-10,-16,-25,-27, 14, -1;
/M: SY='G'; M= -2, -9,-30, -9,-17,-30, 60,-17,-38,-16,-29,-18,  0,-19,-14,-13, -1,-19,-29,-20,-28,-16;
/M: SY='L'; M=-12,-29,-21,-31,-21, 18,-30,-19, 16,-26, 38, 17,-26,-29,-20,-15,-27,-10,  8,-16,  4,-20;
/M: SY='R'; M=-14, -7,-30, -7,  4,-24,-21,  0,-22, 25,-18, -5, -2,-16, 16, 35,-10,-10,-18,-20, -8,  8;
/M: SY='E'; M= -2,  2,-24,  4,  9,-24,-14, -7,-19,  4,-19,-13,  1, -8,  4,  7,  3, -4,-15,-28,-16,  5;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='K'; M= -6, -4,-17, -3,  1,-18,-15,-10,-21,  5,-20,-14, -1,  3, -2,  5,  0, -4,-17,-26,-15, -2; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='A'; M=  7,-10,-18,-14, -6, -8,-13, -3,-11, -3, -6, -4, -7,-15, -1,  1, -2, -3, -8,-18, -6, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='L'; M= -2,-18,-20,-19,-12, -1,-11,-18,  0,-16, 10,  2,-16,-14,-15,-15,-12, -6, -1,-18, -7,-13; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='F'; M= -3, -9,-10,-12,-11,  1, -8,-12,-11,-10, -7, -7, -7,-17,-13, -8, -1,  0, -5,-16, -3,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='A'; M=  1,-11,-18,-14,-10, -5, -3, -7,-10, -8, -2, -3, -8,-16, -9, -6, -5, -4, -7,-14, -3,-10; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M:         M= -4,-11,-18,-13, -7, -1, -5,-12,-11, -7, -8, -7, -6, -9,-10, -3, -2, -3, -8,-15, -6, -9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-13, -9, -5, -2,-12, -6, -7,  1, -7, -2, -2,-12, -2,  6, -1,  1, -4,-14, -4, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='S'; M=  1,  0, -9, -2, -3,-10,  3, -6, -9, -5,-12, -8,  5, -7, -3, -3, 10,  5, -6,-17, -9, -3; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M:         M= -2, -6,-14, -5, -4, -7, -6, -7, -6, -6, -6, -5, -7,  0, -4, -8, -4, -4, -6, -3, -3, -4; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-7;
/M: SY='A'; M=  1, -6,-11, -8, -5, -4, -4, -7, -5,  0, -6, -1, -3, -8, -4, -1,  0, -2, -3,-11, -5, -5; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-7; IM=0; DM=-7;
/M: SY='N'; M=  0,  8,-21,  3,  6,-23,-11, -3,-17,  3,-17, -9, 12,-13,  9,  1,  5, -1,-18,-29,-15,  7;
/M: SY='T'; M=  1,-12,-13,-15,-10,-12,-16,-14, -7, -8,-10, -3,-10, -4, -8, -8,  4,  7, -3,-26,-10,-10;
/M: SY='S'; M=  2, -3,-12, -5, -8,-14, -4,  8,-20,-12,-19,-12,  2,-17, -7,-12,  9,  0,-13,-28, -6, -8;
/M: SY='F'; M= -7,-25,-25,-28,-19, 19,-26,-18,  6,-22, 10,  2,-21, -4,-22,-20,-17, -9,  0, -9,  7,-21;
/M: SY='W'; M=-19,-39,-46,-39,-29, 14,-21,-29,-15,-21,-12,-15,-38,-30,-21,-20,-38,-27,-25,126, 27,-21;
/M: SY='D'; M= -5, 10,-23, 14,  8,-26,-10, -3,-22, -5,-20,-15,  4, -4,  3, -9,  6,  1,-18,-32,-16,  5;
/M: SY='F'; M=-14,-23,-24,-26,-19, 23,-28, -9,  3,-15,  6,  5,-19,-15,-19,-13,-18,-10,  0, -6, 17,-19;
/M: SY='I'; M= -7,-29, -7,-34,-28,  3,-34,-28, 29,-27, 18, 12,-25,-27,-25,-25,-18, -7, 28,-25, -5,-28;
/M: SY='E'; M= -3, -7,-23, -6, 11,-19,-15, -9,-13,  1, -5, -3, -8,-13,  6, -1, -5, -5,-12,-24,-13,  8;
/M: SY='K'; M= -3, -2,-23, -2,  1,-19,-18, -2,-17,  8,-12, -7, -4,-15,  1,  4, -5, -3,-11,-22, -6,  0;
/M: SY='F'; M=  0,-18,-18,-23,-19,  9,-22, -9,  6,-18, -1,  0,-13,-21,-17,-17, -3,  0,  9,-16,  6,-19;
/M: SY='C'; M= -4, -9,  8,-14, -8,-14,-20,-10,-13, -7,-11, -5, -7,-21, -3, -7, -2,  1, -8,-25, -7, -6;
/M: SY='H'; M= -9, -1,-27,  0,  0,-20, -8,  5,-25,  0,-24,-14,  2, -5, -1,  1,  1, -3,-21,-18, -6, -2;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-22,-13, -7, -1,-19, -9, -3, -5,  3, -1,-13, -8, -8, -4,-14, -8, -6, -4,  4, -8; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-2;
/M: SY='A'; M=  4, -7,-13, -8, -2, -7, -7, -9, -9,  0,-10, -6, -5,-11, -5, -3,  1, -2, -3,-14, -5, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-2; IM=0; DM=-2;
/M: SY='Q'; M= -6, -5,-28, -5,  6,-22, -5, -7,-22,  5,-20,-11, -1, -5,  7,  7, -4,-10,-21,-22,-15,  5;
/M: SY='H'; M=-10, -3,-24, -5,  4,-12,-19, 13,-13, -8, -9, -5,  0,-12,  5, -6, -3, -5,-16,-25, -2,  4;
/M: SY='L'; M= -4,-16,-14,-18,-12, -3,-26,-18,  9,-19, 10,  3,-16,-21,-15,-19,-12, -7,  7,-23, -4,-14;
/M: SY='L'; M= -6,-21, -6,-26,-20,  3,-26,-18,  8,-19, 11,  6,-18,-24,-17,-15,-10,  1,  9,-20,  1,-20;
/M: SY='R'; M= -5, -2,-16, -1,  4,-23,-15, -2,-23,  9,-20,-11,  1,-14,  7, 11,  5, -1,-16,-29,-13,  4;
/M: SY='Q'; M= -4, -2,-23, -3,  4,-19,-15,  4,-18,  0,-14, -7,  1,-14, 11,  3,  2, -2,-17,-25, -8,  7;
/M: SY='V'; M= -4,-26,-17,-29,-26,  0,-31,-25, 27,-18, 11, 12,-24,-25,-22,-18,-12, -1, 34,-24, -3,-25;
/M: SY='Q'; M= -7,  1,-27,  3, 18,-28,-13,  3,-22,  7,-17, -7,  0,-10, 21,  5, -1, -7,-22,-25,-12, 19;
/M: SY='E'; M= -7,  6,-19,  6, 11,-22,-10, -1,-21,  1,-17,-11,  6,-14,  2,  0,  0, -6,-18,-31,-16,  6;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-23,-35,-26,  7,-33,-23, 33,-27, 29, 22,-24,-25,-20,-23,-23, -9, 22,-19,  1,-25;
/M: SY='N'; M= -5,  3,-24,  1,  4,-21,-10, -8,-12, -4,-14,-10,  6,-10,  1, -8,  1, -2,-13,-29,-16,  2;
/M: SY='Q'; M= -2,  3,-24,  2,  8,-23, -7, -2,-22,  2,-21,-12,  4, -8,  9, -3,  3, -6,-20,-26,-15,  8;
/M: SY='I'; M= -5,-18,-20,-23,-16, -6,-26,-19, 16,-18, 10, 10,-15,-19, -8,-16, -6,  4, 12,-25, -6,-13;
/M: SY='H'; M= -4, -3,-25, -4, -2,-20,-15, 14,-21,  0,-18,-10,  0, -6,  0,  1, -2, -5,-18,-20, -6, -3;
/M: SY='T'; M= -3,  2,-19,  0,  6,-18,-15,-11,-18,  0,-16,-13,  2, -6, -1,  0, 10, 15,-12,-30,-15,  2;
/M: SY='N'; M=  1, 10,-23, 10, 10,-26, -1, -6,-25, -3,-25,-19, 11, -2,  0, -6,  7, -4,-22,-31,-21,  4;
/I:         I=-3; MD=-5;
/M: SY='V'; M= -3, -6, -5, -6, -6, -6,-12, -7, -3, -1, -3, -2, -7,-11, -6, -1, -6, -4,  1,-11, -2, -7; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M: SY='B'; M= -8,  4,-22,  4, -5,-17,-18,-10, -6, -4, -9, -6,  2,-17, -5,  0, -4, -3, -2,-28,-12, -6; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='G'; M= 13,-12,-19,-14,-15,-21, 24,-19,-18,-15,-18,-12, -7,-12,-16,-18,  4, -7, -8,-23,-22,-16; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M: SY='R'; M=-12, -8,-26, -9, -1,-17,-21,  3,-16, 20,-13, -1, -5,-17,  5, 22,-11, -9,-10,-19, -2,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-5;
/M:         M= -2,-16, -9,-20,-15,  0, -8,-13,-14,-13, -8, -7,-12,-22,-14,-13, -7, -9, -9,-12, -5,-14;
/M: SY='R'; M=-16, -6,-30, -5,  7,-20,-21,  9,-25, 21,-17, -7, -1,-17, 13, 37,-10,-11,-21,-20, -3,  7;
/M: SY='A'; M= 24,-15,-14,-22,-14,-11,-12,-20,  3,-15,  2,  0,-13,-15,-12,-19,  2,  1,  7,-23,-13,-14;
/M: SY='W'; M=-18,-34,-35,-38,-28, 29,-25,-24, -5,-24,  3, -3,-32,-29,-24,-19,-32,-20,-13, 73, 23,-22;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28,  6,-34,-27, 34,-27, 23, 16,-25,-26,-24,-24,-19, -7, 30,-22, -2,-28;
/M: SY='R'; M=-14,-12, -1,-13, -4,-17,-22, -2,-23,  7,-15, -9, -6,-23,  1, 27, -8, -9,-14,-26, -9, -5;
/M: SY='L'; M=  0,-16,-20,-17, -8, -8,-19, -6,  2,-16, 10,  4,-15,-20, -8,-14,-11, -6,  3,-24, -7, -9;
/M: SY='A'; M= 24,-10,-15,-15,-12,-18,  8,-19,-13,-14,-11,-10, -7,-15,-12,-18,  9,  1, -5,-24,-19,-12;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-30,-21,  7,-29,-20, 21,-28, 43, 20,-28,-28,-19,-20,-26, -9, 13,-21, -1,-20;
/M: SY='N'; M=-13, 11,-25,  2,  0,-14,-13,  5,-13,  3,-17, -5, 22,-19,  4, 10, -2, -6,-19,-25, -5,  0;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-28, 17, 35,-25,-19, -1,-26,  6,-17,-16,  1, -7, 12,  0,  0, -6,-24,-27,-13, 23;
/M: SY='H'; M=-11,  5,-28,  2,  5,-27,-13, 20,-28, 20,-27, -9, 10,-14, 12, 13, -4,-10,-24,-26, -5,  7;
/M: SY='V'; M= -5,-17, -6,-19,-12,-10,-22,-16, -2, -8,  2,  0,-14,-23, -9, -1, -8, -4,  3,-27,-11,-12;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-31,-21, 12,-30,-19, 21,-28, 43, 23,-28,-29,-19,-20,-28,-10, 11,-18,  2,-20;
/M: SY='H'; M= -6,  3,-22,  6,  6,-23,-10, 12,-23, -7,-23,-14,  4, -3,  0, -9, 10,  2,-17,-34,-11,  2;
/M: SY='E'; M= -2, -7, -9, -7,  3,-20,-13, -7,-19,  0,-12, -9, -5,-16,  0,  0,  0, -3,-14,-28,-14,  1;
/M: SY='W'; M=-17,-26,-35,-27,-20,  8,-26,  1, -3,-17, -3, -2,-24,-27,-10,-15,-25,-17,-11, 47, 32,-16;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-33,-24, 13,-32,-22, 26,-28, 34, 19,-26,-27,-22,-22,-24, -9, 18,-18,  2,-24;
/M: SY='K'; M= -8,  6,-18,  5,  6,-24,-12, -6,-24,  8,-21,-14,  8,-10,  3,  8,  0, -4,-20,-29,-16,  3;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-22,-18,-13, -2,-22, -6,  2,-16,  8,  2,-13,-12,-10,-14,-10, -2, -3,-17,  5,-13;
/M: SY='L'; M= -8,-28,-22,-32,-22, 11,-28,-19, 19,-25, 31, 21,-25,-26,-18,-20,-24,-10, 10,-10,  3,-20;
/M: SY='L'; M=  0,-21, -7,-25,-16, -4,-24,-18,  5,-16, 12,  5,-19,-24,-11,-10,-13, -7,  5,-22, -8,-15;
/M: SY='S'; M= -4,  2,-22,  4,  7,-20, -8, -5,-20, -1,-17,-13,  3,-14,  3,  1,  8,  0,-16,-28,-12,  4;
/M: SY='B'; M= -6, 19, -8, 17,  6,-25,-10, -6,-26,  0,-25,-20, 17,-14, -2, -6,  8,  2,-20,-36,-19,  2;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='K'; M= -4, -5,-23, -5,  3,-19,-12,  0,-18,  4,-14, -8, -4, -3,  2,  3, -2, -2,-15,-23,-11,  1; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='E'; M= -3, -5,-22, -4,  7,-21,-10, -8,-14,  2,-15, -8, -4, -7,  7,  2,  2, -3,-11,-24,-14,  6; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-22;
/M: SY='L'; M= -1,-13,-13,-14,-10, -3,-16, -5,  3,-10,  8,  3,-12,-16, -7, -7, -7,  0,  5,-15,  0, -9; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='L'; M= -3,-21,-10,-25,-19, -2,-27,-22, 11,-19, 16,  6,-19,-24,-18,-14,-10,  6, 14,-26, -7,-19;
/M: SY='H'; M= -4,  3,-23,  3,  7,-24,-12, 12,-25,  6,-23,-13,  7,-13,  7, 11,  6, -3,-20,-29,-10,  5;
/M: SY='K'; M=-10,  0,-26,  2, 12,-24,-19, -1,-23, 16,-18, -7,  0,-12, 11, 16, -3, -3,-18,-25,-10, 11;
/M: SY='Y'; M=-16,-25,-18,-30,-24, 33,-28, -5,  4,-20, 12, 10,-22,-29,-20,-16,-22,-11, -2, 10, 35,-22;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='E'; M= -8, 11,-23, 13, 14,-25,-15,  0,-22,  4,-20,-14,  8,-11,  7, -1,  5,  1,-18,-31,-14, 10;
/M: SY='P'; M= -6,  3,-28,  8, 12,-27,-14, -8,-26,  6,-26,-18,  2, 14,  2,  4,  2, -4,-23,-30,-20,  5;
/M: SY='W'; M= -8,  3,-28,  3, -2,-14, -9, -9,-20, -8,-21,-17,  3,-12, -7,-11, -4, -5,-20,  4, -4, -4;
/M: SY='A'; M= 35, -7,-11,-13, -7,-20,  3,-17,-15,-10,-17,-14, -3,-10, -7,-17, 19,  6, -5,-26,-20, -7;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-22,-34,-25, 42,-31,-17, 11,-28, 26,  9,-24,-29,-28,-20,-24,-10,  5, -2, 21,-25;
/M: SY='L'; M= -8,-29,-19,-31,-24,  9,-29,-20, 24,-25, 32, 23,-27,-28,-20,-19,-23, -8, 20,-21, -1,-22;
/M: SY='R'; M= -1,-15,-17,-18, -9,-12,-15,-12,-11,  1,  0, -1,-11,-20, -5, 14, -9, -7, -7,-22,-11, -9;
/M: SY='D'; M= -9, 11,-17, 15,  5,-23,-12, -6,-25,  0,-20,-17,  8,-15,  0,  5,  7,  1,-17,-34,-16,  1;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='P'; M= -1,  1,-24,  5,  3,-23,-13, -3,-20, -6,-19,-15, -2, 13, -3, -9,  3,  0,-18,-29,-16, -2; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='E'; M=  0,  5,-21,  8, 11,-23, -2, -9,-21, -3,-19,-15,  2,-11, -1, -6,  4, -3,-14,-28,-19,  5; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='H'; M= -4, -4,-17, -3,  1, -7, -4,  3,-13, -5, -7, -6, -3,-11, -3, -5, -3, -7,-11,-13, -1, -1; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='G'; M= -2,-14,-18,-15,-15,-10,  2,-17,-16,-11, -9, -6,-11,-21,-14,-10, -8,-10,-11, -7,-10,-14;
/M: SY='E'; M= -2,  0,-21, -2, 10,-20,-17,-10,-19,  4,-17,-13,  0, -5,  1,  5,  6, 10,-13,-28,-15,  5;
/M: SY='Q'; M=-11,-10,-26,-12, -3, -6,-25, -5, -1, -9,  0,  1, -9,-17,  2, -7, -9, -6, -6,-19,  1, -2;
/M: SY='L'; M= -6,-27,-20,-31,-22, 12,-29,-22, 20,-27, 29, 13,-24,-26,-22,-21,-19, -7, 15,-19,  0,-22;
/M: SY='A'; M=  5,-17,-21,-21,-13, -7,-19,-18, -1,-10,  4, -1,-15,-14,-11,-11, -7, -1, -1,-11, -4,-13;
/M: SY='R'; M= -4, -8, -9,-10, -5,-16, -6,-12,-21, -1,-17,-12, -4,-17, -4,  3,  2,  1,-14,-24,-11, -5;
/M: SY='L'; M=-10,-19,-22,-21,-15,  2,-26, -8, 13,-21, 22, 17,-18,-23,-12,-17,-18, -9,  6,-22, -1,-14;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-20,-31,-22,  6,-29,-19, 24,-26, 37, 25,-28,-28,-18,-19,-25, -9, 17,-21, -1,-21;
/M: SY='Q'; M=-11, -2,-25,  1,  6,-19,-22, -5, -9,  0, -8, -2, -6,-16,  7,  0, -6, -7, -7,-24, -7,  6;
/M: SY='G'; M=  6,-10,-14,-11,-11,-22, 15,-18,-21,-16,-21,-15, -5, -4,-13,-17,  9, -1,-14,-29,-23,-13;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-23,-27,-17,  7,-29,-20, 13,-27, 37, 13,-28,-12,-19,-20,-27,-10,  4,-20, -3,-19;
/M: SY='S'; M= -3,  5,  8,  2,  4,-23,-11, -4,-24, -9,-25,-18,  8,-16,  0,-10, 15,  5,-17,-39,-19,  2;
/M: SY='A'; M= 10, -5,-13, -7, -1,-16,-13,-13,-12, -5, -9, -6, -7,-15, -4, -8,  1, -4, -5,-25,-14, -3;
/M: SY='F'; M= -9,-28,-14,-32,-26, 23,-30,-20, 16,-26, 19,  9,-24,-28,-26,-21,-19, -8, 14,-11, 11,-26;
/M: SY='D'; M= -6,  9,-23, 12, 10,-24,-14, -2,-20, -3,-19,-15,  6, -3,  1, -6,  5,  1,-17,-33,-16,  5;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='F'; M=-12,-22,-19,-28,-21, 41,-25,-12,  4,-20,  6,  2,-16,-23,-22,-15,-14, -8,  2,  4, 24,-20; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='N'; M= -4, 11,-15,  9,  5,-17, -7,  6,-18, -1,-17,-12, 12, -9,  2, -1,  8,  3,-15,-25,-10,  3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-22,-31,-21, 12,-28,-20, 17,-24, 26, 14,-23,-20,-19,-18,-21, -9,  9,-16,  1,-21;
/M: SY='S'; M= -4, -2,  2, -2, -2,-23,-16,-14,-22, -4,-23,-17, -2, -2, -7, -7,  5,  2,-14,-35,-20, -5;
/M: SY='L'; M= -5,-19,-18,-24,-19,  5,-25,-16, 12,-19, 15, 11,-17,-24,-15,-16,-12,  1, 12,-20,  0,-17;
/M: SY='D'; M= -6, 13,-24, 16,  8,-24,-13, -6,-23,  6,-17,-15,  7,-13,  1,  3,  0, -2,-18,-30,-15,  4;
/M: SY='S'; M= -2, -2,-21, -5, -9, -8, -5,-14,-13,-14,-12,-11,  2,-12,-12,-14,  3,  1,-12,-20,-11,-10;
/M: SY='E'; M=  2,  2,-21,  4, 16,-24,-13,  2,-21, -3,-20,-14,  1, -5,  6, -7, 10,  2,-16,-31,-15, 10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 62 in 57 different sequences
Number of true positive hits 62 in 57 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] RUN
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
57 sequences

DEN5A_HUMAN (Q6IQ26), DEN5A_MOUSE (Q6PAL8), DEN5B_DANRE (Q6NXD8), 
DEN5B_HUMAN (Q6ZUT9), DEN5B_MOUSE (A2RSQ0), FYCO1_HUMAN (Q9BQS8), 
FYCO1_MOUSE (Q8VDC1), PKHM1_HUMAN (Q9Y4G2), PKHM1_MOUSE (Q7TSI1), 
PKHM1_RAT   (Q5PQS0), PKHM2_HUMAN (Q8IWE5), PKHM2_MOUSE (Q80TQ5), 
RUBIC_HUMAN (Q92622), RUBIC_MOUSE (Q80U62), RUFY1_HUMAN (Q96T51), 
RUFY1_MOUSE (Q8BIJ7), RUFY2_HUMAN (Q8WXA3), RUFY2_MOUSE (Q8R4C2), 
RUFY2_PONAB (Q5R5R4), RUFY3_HUMAN (Q7L099), RUFY3_MOUSE (Q9D394), 
RUFY3_PONAB (Q5R4V2), RUFY3_RAT   (Q5FVJ0), RUFY4_HUMAN (Q6ZNE9), 
RUFY4_MOUSE (Q3TYX8), RUN3A_BOVIN (Q17QK1), RUN3A_DANRE (A7YDW0), 
RUN3A_HUMAN (Q59EK9), RUN3A_MOUSE (O08576), RUN3A_PONAB (Q5R565), 
RUN3A_XENTR (Q0V9V7), RUN3B_BOVIN (Q08E29), RUN3B_DANRE (Q5U3W3), 
RUN3B_HUMAN (Q96NL0), RUN3B_MACFA (Q4R7B9), RUN3B_MOUSE (Q6PDC0), 
RUN3B_PONAB (Q5NVC2), RUN3B_RAT   (Q3B7K9), RUND1_HUMAN (Q96C34), 
RUND1_MOUSE (Q0VDN7), RUSC1_HUMAN (Q9BVN2), RUSC1_MOUSE (Q8BG26), 
RUSC2_HUMAN (Q8N2Y8), RUSC2_MOUSE (Q80U22), SGSM1_HUMAN (Q2NKQ1), 
SGSM1_MOUSE (Q8BPQ7), SGSM2_HUMAN (O43147), SGSM2_MOUSE (Q80U12), 
SGSM3_BOVIN (Q2KI13), SGSM3_DANRE (Q7T2D0), SGSM3_HUMAN (Q96HU1), 
SGSM3_MOUSE (Q8VCZ6), SGSM3_RAT   (Q6P6R7), SGSM3_XENLA (A6H8I2), 
SNX29_BOVIN (Q08DX0), SNX29_HUMAN (Q8TEQ0), SNX29_MOUSE (Q9D3S3)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

2CXF; 2CXL; 2DWG; 2DWK; 3CWZ; 4GIW

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission