To improve security and privacy, we are moving our web pages and services from HTTP to HTTPS.
To give users of web services time to transition to HTTPS, we will support separate HTTP and HTTPS services until the end of 2017.
From January 2018 most HTTP traffic will be automatically redirected to HTTPS. [more...]
View this page in https
Entry: PS50827

General information about the entry

Entry name [info] DDT
Accession [info] PS50827
Entry type [info] MATRIX
Date [info] 01-SEP-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 25-OCT-2017 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info] PDOC50827
Associated ProRule [info] PRU00063

Name and characterization of the entry

Description [info] DDT domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4578342; R2=0.0175576; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2747.2917480; R2=3.7682292; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; H_SCORE=4047; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; H_SCORE=3618; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M= -7,  2,-16,  0,  1,-17, -5, -8,-21, -8,-21,-13,  6, -2, -3,-10,  3, -2,-21,-29,-17, -1;
/M: SY='E'; M=  3,  3,-24,  5, 15,-20,-11, -1,-21, -4,-13,-12, -2,-11,  6, -9, -1, -9,-18,-24,-13, 10;
/M: SY='A'; M=  2, -4,-14, -5, -4,-18,-11, -9,-13,-13,-10,-10, -3, -4, -8,-15,  1, -2,-11,-30,-16, -7;
/M: SY='F'; M= -6,-21,-18,-27,-23, 24,-26,-21, 11,-22,  9,  6,-18,-24,-25,-19,-13, -4, 13,-13,  5,-23;
/M: SY='G'; M=  5,-10,-25,-11, -7,-22, 24,-15,-22,-13,-15, -7, -6,-10,-10,-16, -1,-11,-17,-23,-22, -9;
/M: SY='D'; M=-18, 39,-28, 48, 14,-34,-10,  6,-35,  5,-29,-24, 24,-13,  2,  0,  0, -9,-29,-37,-17,  7;
/M: SY='L'; M=  6,-24, -9,-28,-21,  4,-23,-21, 11,-22, 17,  6,-24,-26,-21,-20,-13, -5, 16,-20, -3,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-27,-19,-31,-22, 20,-27,-21, 14,-27, 30, 11,-25,-27,-24,-21,-21, -8, 10,-14,  3,-22;
/M: SY='M'; M= -4,-13,-19,-19, -8, -7,-20, -7,  4, -8,  2, 21,-13,-17,  3, -9, -6,  0,  3,-22, -5, -2;
/M: SY='V'; M=  1,-27,-17,-32,-27,  4,-28,-26, 27,-22, 11, 13,-23,-24,-23,-22,-12, -4, 31,-22, -5,-26;
/M: SY='Y'; M=-16,-24,-20,-26,-22, 18,-29, -1,  1,-16,  4,  1,-21,-29,-16,-11,-21,-12, -4, 15, 33,-21;
/M: SY='E'; M= -6,  7,-28, 13, 36,-31,-13, -1,-27,  6,-21,-16,  1, -5, 21,  2,  3, -8,-27,-28,-18, 28;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-12,-39,-30, 65,-31,-22,  3,-29,  9,  1,-21,-30,-38,-21,-19, -9,  4,  2, 22,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-28,  0,-31,-22,  8,-29,-21, 13,-28, 34, 16,-27,-31,-22,-21,-25, -9,  9,-23, -3,-22;
/M: SY='H'; M= -9,  4,-23, -1,  0,-21,-13, 15,-20,  2,-22,-10, 14,-16,  9, 13,  7,  0,-19,-30, -8,  2;
/M: SY='S'; M=  7,  2,-15, -4, -5,-14, -1,-11,-18, -7,-22,-15, 11,-13, -6, -9, 19, 12,-12,-30,-16, -5;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 70,-30,-12,  0,-26,  8,  0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 40,-28;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-24, -7,-12,-26, 37, -9,-32,-13,-28,-17,  3,-16,-11,-13,  9, -6,-23,-26,-22,-12;
/M: SY='R'; M=-11,  3,-26,  5,  8,-21,-12, -2,-27, 11,-22,-13,  3,-13,  5, 13,  0, -2,-20,-25,-11,  6;
/M: SY='L'; M= -3,-15,-18,-16,-12, -4,-23,-17,  3,-12, 10,  4,-16,-21, -9,-12,-10,  0,  7,-23, -6,-10;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22, 13,-31,-21, 23,-30, 44, 19,-28,-29,-21,-21,-28,-10, 12,-18,  2,-22;
/M: SY='G'; M=-11, -2,-17,  1, -8,-16,  5, -6,-26,-10,-18,-14, -2,-15,-11, -6, -5,-11,-20,-24,-11,-11;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-17,  5,-30,-17, 19,-24, 32, 19,-23,-25,-10,-17,-23,-10,  8,-19,  0,-14;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-18,  3,  6,-17,-14, -7,-24,  0,-22,-18,  2,-15,  0, -1,  4,  0,-19,-11, -6,  3;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-31, -8,  3,-22,-21, -1,-14, -4,-17,-10,-11, 26, -3, -6, -8, -9,-17,-28,-14, -3;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-21,-32,-25, 40,-19,-21,  1,-25,  5, -1,-19,-20,-31,-21,-15, -9,  2, -4, 10,-25;
/M: SY='R'; M= -7,  1,-24, -1,  7,-23,-15, -7,-21,  5,-23,-14,  5,  4,  6,  8,  6,  6,-20,-29,-17,  5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='F'; M= -9,-29,-20,-34,-24, 32,-29,-21, 13,-29, 29, 11,-24,-28,-26,-21,-23, -9,  7, -9,  9,-24;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-27, 14, 18,-24,-13, -3,-24,  8,-21,-15,  4,-12,  7,  4, -1, -8,-20,-26,-11, 12;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-25, 25, 18,-29,-14,  3,-24, -1,-22,-16,  9,-11,  9, -5,  4, -5,-19,-34,-15, 13;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25, 40,-29,-18, 13,-27, 26, 17,-23,-28,-26,-19,-23,-10,  7, -6, 14,-24;
/M: SY='M'; M= -9,-16,  1,-20,-10,-11,-28,-11,  3,-16,  4,  6,-15,-22, -6,-15,-11, -5,  3,-28, -9, -9;
/M: SY='E'; M=  2,  3,-22,  3, 14,-23,-10, -8,-19, -1,-17,-14,  2, -9,  4, -3,  6,  2,-16,-28,-17,  9;
/M: SY='A'; M= 31,-10,-16,-17,-12,-19, 10,-20,-17,-12,-16,-13, -8,-13,-12,-19,  8, -1, -8,-12,-18,-12;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-30,-20,  9,-30,-20, 19,-24, 37, 16,-26,-28,-19,-14,-26, -9, 12,-19,  0,-20;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-13,-11, -9,-13,-20, -9, -8,  0, -9, -2, -8,-18, -7, -2, -3,  1, -1,-25, -6, -9;
/M: SY='C'; M=  1, -5, 21,-10,-12,-18, -6,-11,-25,-12,-22,-16, -2,-22,-13,-14,  3, -5,-14,-33,-18,-12;
/M: SY='N'; M=-11,  9,-24,  7,  6,-21,-15,  6,-21,  5,-19, -9, 11,-15,  8,  9,  1,  0,-20,-27, -7,  6;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -6, 17,-24, 20, 11,-29,  1, -3,-28, -3,-28,-21, 16, -6,  4, -7, 10, -3,-25,-34,-21,  7;
/M: SY='P'; M= -7,  2,-28,  2,  1,-27, -8, -1,-18, -6,-24,-13,  7, 10,  7, -8,  3, -5,-23,-31,-18,  2;
/M: SY='Y'; M=  1, -8,-13,-12, -6, -2,-16, -7, -9,-10, -6, -7, -5,-20, -9, -9, -1, -3, -7,-18,  2, -8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-11, -5, -2,-19,  0,-13,-16,-11,-14, -9, -5, -9, -7,-14,  4, -2,-11,-29,-18, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M= -6,-17,-23,-17, -5, -6,-24,-13,  2,-16, 11,  2,-17, -7, -7,-15,-11, -3, -4,-21, -3, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-20,-26,-16,  9,-28,-18, 13,-18, 24, 15,-22,-24,-16,-14,-19, -6,  9,-19,  0,-16;
/M: SY='B'; M=  1,  5,-14,  4, -1,-23, -3, -9,-21, -6,-16,-11,  3,-15, -3, -7,  3, -2,-15,-29,-18, -2;
/M: SY='E'; M= -9, 15,-28, 23, 34,-32,-16,  0,-29,  7,-22,-18,  5, -6, 17,  3,  2, -8,-27,-30,-18, 25;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-25,  5,-30,-20, 27,-23, 25, 21,-26,-27,-20,-20,-20, -7, 25,-20,  2,-24;
/M: SY='H'; M=-12,-17,-23,-18,-14, -5,-26, 24,  3,-20, 12,  9,-12,-24, -9,-13,-16,-10,  1,-26,  6,-14;
/M: SY='V'; M= -4,-23,-19,-26,-20,  0,-26,-20, 14,-12,  9,  9,-19,-24,-17, -8,-12, -5, 19,-23, -5,-19;
/M: SY='V'; M=  2,-16,-17,-19,-13, -9,-21,-18,  4, -8, -5,  0,-13,-20, -7, -8,  0,  1, 13,-25,-10,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-20,-19,-24,-19,  9,-26,-16, 14,-24, 33, 15,-17,-28,-18,-17,-23, -8,  7,-22, -2,-18;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21, 16,-30,-21, 18,-29, 40, 16,-27,-28,-22,-20,-25, -7, 10,-17,  3,-21;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-26, -8,  0,-21,-13,  0,-23, 13,-17, -8, -1,-16, 10, 28, -2, -1,-17,-23,-10,  2;
/M: SY='T'; M=  6,-10,-17,-17,-13, -7,-18,-18,  0, -9, -2, -2, -7,-17,-12,-11,  0,  8,  4,-24, -9,-13;
/M: SY='L'; M= -2,-21,-11,-25,-18, -5,-26,-20, 11,-18, 13,  7,-18,-22,-12,-14,-11, -1, 10,-24, -8,-16;
/M: SY='L'; M=-11,-22,-22,-25,-18, 10,-28,-16,  8,-15, 17,  7,-18,-24,-16, -6,-16, -2,  5,-15,  5,-18;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-19, 10, 12,-29,-11,  2,-29, 11,-25,-15,  9,-13, 11,  9,  0, -8,-25,-30,-15, 11;
/M: SY='D'; M= -5,  7,-23, 11,  6,-18,-15,  2,-19, -5,-14,-12,  2,-13, -2, -8,  1, -3,-14,-29, -9,  1;
/M: SY='E'; M= -8, -8,-27, -6,  6,-19,-23,-12, -7, -1, -6, -5,-10, -5,  1,  1, -9, -8, -7,-25,-13,  2;
/M: SY='D'; M= -6,  4,-29,  8,  6,-29,  8, -4,-27, -1,-22,-14,  2,-13,  1, -6, -3,-13,-23,-25,-17,  3;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-25, 14, 28,-22,-16, -3,-24,  3,-17,-14,  1, -7, 10, -2,  2, -4,-21,-28,-15, 19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2017_10 which contains 556'006 sequence entries.


Total number of hits 21 in 21 different sequences
Number of true positive hits 21 in 21 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 2
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 91.30 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DDT
Version [info] 5

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
21 sequences

BAZ1A_HUMAN (Q9NRL2    ), BAZ1A_MOUSE (O88379    ), BAZ1B_DANRE (A2BIL7    ), 
BAZ1B_HUMAN (Q9UIG0    ), BAZ1B_MOUSE (Q9Z277    ), BAZ1B_XENLA (A8DZJ1    ), 
BAZ2A_HUMAN (Q9UIF9    ), BAZ2A_MOUSE (Q91YE5    ), BAZ2A_XENLA (B7ZS37    ), 
BAZ2B_CHICK (Q9DE13    ), BAZ2B_HUMAN (Q9UIF8    ), BPTF_HUMAN  (Q12830    ), 
ITC1_YEAST  (P53125    ), NU301_CAEEL (Q6BER5    ), NU301_DROME (Q9W0T1    ), 
PTM_ARATH   (F4JYC8    ), RLT1_ARATH  (F4HY56    ), RLT2_ARATH  (Q9FFH1    ), 
RLT3_ARATH  (F4JRF5    ), Y2237_DICDI (Q54ST3    ), YP216_YEAST (Q08964    )
» more

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
2 sequences

DDR4_ARATH  (F4IDY7    ), RSF1_HUMAN  (Q96T23    )

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission