Entry: PS50827

General information about the entry

Entry name [info] DDT
Accession [info] PS50827
Entry type [info] MATRIX
Date [info] SEP-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAY-2015 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50827
Associated ProRule [info] PRU00063

Name and characterization of the entry

Description [info] DDT domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4578342; R2=0.0175576; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2268.04192; R2=28.14371; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; N_SCORE=8.5; H_SCORE=8741; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; N_SCORE=6.5; H_SCORE=8741; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='N'; M= -7,  2,-16,  0,  1,-17, -5, -8,-21, -8,-21,-13,  6, -2, -3,-10,  3, -2,-21,-29,-17, -1;
/M: SY='E'; M=  3,  3,-24,  5, 15,-20,-11, -1,-21, -4,-13,-12, -2,-11,  6, -9, -1, -9,-18,-24,-13, 10;
/M: SY='A'; M=  2, -4,-14, -5, -4,-18,-11, -9,-13,-13,-10,-10, -3, -4, -8,-15,  1, -2,-11,-30,-16, -7;
/M: SY='F'; M= -6,-21,-18,-27,-23, 24,-26,-21, 11,-22,  9,  6,-18,-24,-25,-19,-13, -4, 13,-13,  5,-23;
/M: SY='G'; M=  5,-10,-25,-11, -7,-22, 24,-15,-22,-13,-15, -7, -6,-10,-10,-16, -1,-11,-17,-23,-22, -9;
/M: SY='D'; M=-18, 39,-28, 48, 14,-34,-10,  6,-35,  5,-29,-24, 24,-13,  2,  0,  0, -9,-29,-37,-17,  7;
/M: SY='L'; M=  6,-24, -9,-28,-21,  4,-23,-21, 11,-22, 17,  6,-24,-26,-21,-20,-13, -5, 16,-20, -3,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-27,-19,-31,-22, 20,-27,-21, 14,-27, 30, 11,-25,-27,-24,-21,-21, -8, 10,-14,  3,-22;
/M: SY='M'; M= -4,-13,-19,-19, -8, -7,-20, -7,  4, -8,  2, 21,-13,-17,  3, -9, -6,  0,  3,-22, -5, -2;
/M: SY='V'; M=  1,-27,-17,-32,-27,  4,-28,-26, 27,-22, 11, 13,-23,-24,-23,-22,-12, -4, 31,-22, -5,-26;
/M: SY='Y'; M=-16,-24,-20,-26,-22, 18,-29, -1,  1,-16,  4,  1,-21,-29,-16,-11,-21,-12, -4, 15, 33,-21;
/M: SY='E'; M= -6,  7,-28, 13, 36,-31,-13, -1,-27,  6,-21,-16,  1, -5, 21,  2,  3, -8,-27,-28,-18, 28;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-12,-39,-30, 65,-31,-22,  3,-29,  9,  1,-21,-30,-38,-21,-19, -9,  4,  2, 22,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-28,  0,-31,-22,  8,-29,-21, 13,-28, 34, 16,-27,-31,-22,-21,-25, -9,  9,-23, -3,-22;
/M: SY='H'; M= -9,  4,-23, -1,  0,-21,-13, 15,-20,  2,-22,-10, 14,-16,  9, 13,  7,  0,-19,-30, -8,  2;
/M: SY='S'; M=  7,  2,-15, -4, -5,-14, -1,-11,-18, -7,-22,-15, 11,-13, -6, -9, 19, 12,-12,-30,-16, -5;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 70,-30,-12,  0,-26,  8,  0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 40,-28;
/M: SY='G'; M=  0, -6,-24, -7,-12,-26, 37, -9,-32,-13,-28,-17,  3,-16,-11,-13,  9, -6,-23,-26,-22,-12;
/M: SY='R'; M=-11,  3,-26,  5,  8,-21,-12, -2,-27, 11,-22,-13,  3,-13,  5, 13,  0, -2,-20,-25,-11,  6;
/M: SY='L'; M= -3,-15,-18,-16,-12, -4,-23,-17,  3,-12, 10,  4,-16,-21, -9,-12,-10,  0,  7,-23, -6,-10;
/M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22, 13,-31,-21, 23,-30, 44, 19,-28,-29,-21,-21,-28,-10, 12,-18,  2,-22;
/M: SY='G'; M=-11, -2,-17,  1, -8,-16,  5, -6,-26,-10,-18,-14, -2,-15,-11, -6, -5,-11,-20,-24,-11,-11;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-17,  5,-30,-17, 19,-24, 32, 19,-23,-25,-10,-17,-23,-10,  8,-19,  0,-14;
/M: SY='E'; M= -8,  2,-18,  3,  6,-17,-14, -7,-24,  0,-22,-18,  2,-15,  0, -1,  4,  0,-19,-11, -6,  3;
/M: SY='P'; M=-10,-13,-31, -8,  3,-22,-21, -1,-14, -4,-17,-10,-11, 26, -3, -6, -8, -9,-17,-28,-14, -3;
/M: SY='F'; M= -8,-26,-21,-32,-25, 40,-19,-21,  1,-25,  5, -1,-19,-20,-31,-21,-15, -9,  2, -4, 10,-25;
/M: SY='R'; M= -7,  1,-24, -1,  7,-23,-15, -7,-21,  5,-23,-14,  5,  4,  6,  8,  6,  6,-20,-29,-17,  5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='F'; M= -9,-29,-20,-34,-24, 32,-29,-21, 13,-29, 29, 11,-24,-28,-26,-21,-23, -9,  7, -9,  9,-24;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-27, 14, 18,-24,-13, -3,-24,  8,-21,-15,  4,-12,  7,  4, -1, -8,-20,-26,-11, 12;
/M: SY='D'; M=-10, 18,-25, 25, 18,-29,-14,  3,-24, -1,-22,-16,  9,-11,  9, -5,  4, -5,-19,-34,-15, 13;
/M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25, 40,-29,-18, 13,-27, 26, 17,-23,-28,-26,-19,-23,-10,  7, -6, 14,-24;
/M: SY='M'; M= -9,-16,  1,-20,-10,-11,-28,-11,  3,-16,  4,  6,-15,-22, -6,-15,-11, -5,  3,-28, -9, -9;
/M: SY='E'; M=  2,  3,-22,  3, 14,-23,-10, -8,-19, -1,-17,-14,  2, -9,  4, -3,  6,  2,-16,-28,-17,  9;
/M: SY='A'; M= 31,-10,-16,-17,-12,-19, 10,-20,-17,-12,-16,-13, -8,-13,-12,-19,  8, -1, -8,-12,-18,-12;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-30,-20,  9,-30,-20, 19,-24, 37, 16,-26,-28,-19,-14,-26, -9, 12,-19,  0,-20;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-13,-11, -9,-13,-20, -9, -8,  0, -9, -2, -8,-18, -7, -2, -3,  1, -1,-25, -6, -9;
/M: SY='C'; M=  1, -5, 21,-10,-12,-18, -6,-11,-25,-12,-22,-16, -2,-22,-13,-14,  3, -5,-14,-33,-18,-12;
/M: SY='N'; M=-11,  9,-24,  7,  6,-21,-15,  6,-21,  5,-19, -9, 11,-15,  8,  9,  1,  0,-20,-27, -7,  6;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='D'; M= -6, 17,-24, 20, 11,-29,  1, -3,-28, -3,-28,-21, 16, -6,  4, -7, 10, -3,-25,-34,-21,  7;
/M: SY='P'; M= -7,  2,-28,  2,  1,-27, -8, -1,-18, -6,-24,-13,  7, 10,  7, -8,  3, -5,-23,-31,-18,  2;
/M: SY='Y'; M=  1, -8,-13,-12, -6, -2,-16, -7, -9,-10, -6, -7, -5,-20, -9, -9, -1, -3, -7,-18,  2, -8;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='S'; M=  0, -6,-11, -5, -2,-19,  0,-13,-16,-11,-14, -9, -5, -9, -7,-14,  4, -2,-11,-29,-18, -5; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='L'; M= -6,-17,-23,-17, -5, -6,-24,-13,  2,-16, 11,  2,-17, -7, -7,-15,-11, -3, -4,-21, -3, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-23,-20,-26,-16,  9,-28,-18, 13,-18, 24, 15,-22,-24,-16,-14,-19, -6,  9,-19,  0,-16;
/M: SY='B'; M=  1,  5,-14,  4, -1,-23, -3, -9,-21, -6,-16,-11,  3,-15, -3, -7,  3, -2,-15,-29,-18, -2;
/M: SY='E'; M= -9, 15,-28, 23, 34,-32,-16,  0,-29,  7,-22,-18,  5, -6, 17,  3,  2, -8,-27,-30,-18, 25;
/M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-25,  5,-30,-20, 27,-23, 25, 21,-26,-27,-20,-20,-20, -7, 25,-20,  2,-24;
/M: SY='H'; M=-12,-17,-23,-18,-14, -5,-26, 24,  3,-20, 12,  9,-12,-24, -9,-13,-16,-10,  1,-26,  6,-14;
/M: SY='V'; M= -4,-23,-19,-26,-20,  0,-26,-20, 14,-12,  9,  9,-19,-24,-17, -8,-12, -5, 19,-23, -5,-19;
/M: SY='V'; M=  2,-16,-17,-19,-13, -9,-21,-18,  4, -8, -5,  0,-13,-20, -7, -8,  0,  1, 13,-25,-10,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-20,-19,-24,-19,  9,-26,-16, 14,-24, 33, 15,-17,-28,-18,-17,-23, -8,  7,-22, -2,-18;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21, 16,-30,-21, 18,-29, 40, 16,-27,-28,-22,-20,-25, -7, 10,-17,  3,-21;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-26, -8,  0,-21,-13,  0,-23, 13,-17, -8, -1,-16, 10, 28, -2, -1,-17,-23,-10,  2;
/M: SY='T'; M=  6,-10,-17,-17,-13, -7,-18,-18,  0, -9, -2, -2, -7,-17,-12,-11,  0,  8,  4,-24, -9,-13;
/M: SY='L'; M= -2,-21,-11,-25,-18, -5,-26,-20, 11,-18, 13,  7,-18,-22,-12,-14,-11, -1, 10,-24, -8,-16;
/M: SY='L'; M=-11,-22,-22,-25,-18, 10,-28,-16,  8,-15, 17,  7,-18,-24,-16, -6,-16, -2,  5,-15,  5,-18;
/M: SY='E'; M=-11,  9,-19, 10, 12,-29,-11,  2,-29, 11,-25,-15,  9,-13, 11,  9,  0, -8,-25,-30,-15, 11;
/M: SY='D'; M= -5,  7,-23, 11,  6,-18,-15,  2,-19, -5,-14,-12,  2,-13, -2, -8,  1, -3,-14,-29, -9,  1;
/M: SY='E'; M= -8, -8,-27, -6,  6,-19,-23,-12, -7, -1, -6, -5,-10, -5,  1,  1, -9, -8, -7,-25,-13,  2;
/M: SY='D'; M= -6,  4,-29,  8,  6,-29,  8, -4,-27, -1,-22,-14,  2,-13,  1, -6, -3,-13,-23,-25,-17,  3;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-25, 14, 28,-22,-16, -3,-24,  3,-17,-14,  1, -7, 10, -2,  2, -4,-21,-28,-15, 19;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2015_07 which contains 548'872 sequence entries.


Total number of hits 17 in 17 different sequences
Number of true positive hits 17 in 17 different sequences
Number of 'unknown' hits 0
Number of false positive hits 0
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 94.44 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] DDT
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
17 sequences

BAZ1A_HUMAN (Q9NRL2), BAZ1A_MOUSE (O88379), BAZ1B_DANRE (A2BIL7), 
BAZ1B_HUMAN (Q9UIG0), BAZ1B_MOUSE (Q9Z277), BAZ1B_XENLA (A8DZJ1), 
BAZ2A_HUMAN (Q9UIF9), BAZ2A_MOUSE (Q91YE5), BAZ2A_XENLA (B7ZS37), 
BAZ2B_CHICK (Q9DE13), BAZ2B_HUMAN (Q9UIF8), BPTF_HUMAN  (Q12830), 
ITC1_YEAST  (P53125), NU301_CAEEL (Q6BER5), NU301_DROME (Q9W0T1), 
Y2237_DICDI (Q54ST3), YP216_YEAST (Q08964)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

RSF1_HUMAN  (Q96T23)

		

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission