PROSITE entry PS50827
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | DDT |
| Accession [info] | PS50827 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-SEP-2003 CREATED;
07-APR-2021 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50827 |
| Associated ProRule [info] | PRU00063 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | DDT domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=61; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=56; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4578342; R2=0.0175576; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2766.5402832; R2=3.4595959; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=345; H_SCORE=3960; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=231; H_SCORE=3566; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-9; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='N'; M= -7, 2,-16, 0, 1,-17, -5, -8,-21, -8,-21,-13, 6, -2, -3,-10, 3, -2,-21,-29,-17, -1; /M: SY='E'; M= 3, 3,-24, 5, 15,-20,-11, -1,-21, -4,-13,-12, -2,-11, 6, -9, -1, -9,-18,-24,-13, 10; /M: SY='A'; M= 2, -4,-14, -5, -4,-18,-11, -9,-13,-13,-10,-10, -3, -4, -8,-15, 1, -2,-11,-30,-16, -7; /M: SY='F'; M= -6,-21,-18,-27,-23, 24,-26,-21, 11,-22, 9, 6,-18,-24,-25,-19,-13, -4, 13,-13, 5,-23; /M: SY='G'; M= 5,-10,-25,-11, -7,-22, 24,-15,-22,-13,-15, -7, -6,-10,-10,-16, -1,-11,-17,-23,-22, -9; /M: SY='D'; M=-18, 39,-28, 48, 14,-34,-10, 6,-35, 5,-29,-24, 24,-13, 2, 0, 0, -9,-29,-37,-17, 7; /M: SY='L'; M= 6,-24, -9,-28,-21, 4,-23,-21, 11,-22, 17, 6,-24,-26,-21,-20,-13, -5, 16,-20, -3,-21; /M: SY='L'; M= -3,-27,-19,-31,-22, 20,-27,-21, 14,-27, 30, 11,-25,-27,-24,-21,-21, -8, 10,-14, 3,-22; /M: SY='M'; M= -4,-13,-19,-19, -8, -7,-20, -7, 4, -8, 2, 21,-13,-17, 3, -9, -6, 0, 3,-22, -5, -2; /M: SY='V'; M= 1,-27,-17,-32,-27, 4,-28,-26, 27,-22, 11, 13,-23,-24,-23,-22,-12, -4, 31,-22, -5,-26; /M: SY='Y'; M=-16,-24,-20,-26,-22, 18,-29, -1, 1,-16, 4, 1,-21,-29,-16,-11,-21,-12, -4, 15, 33,-21; /M: SY='E'; M= -6, 7,-28, 13, 36,-31,-13, -1,-27, 6,-21,-16, 1, -5, 21, 2, 3, -8,-27,-28,-18, 28; /M: SY='F'; M=-18,-29,-12,-39,-30, 65,-31,-22, 3,-29, 9, 1,-21,-30,-38,-21,-19, -9, 4, 2, 22,-30; /M: SY='L'; M=-10,-28, 0,-31,-22, 8,-29,-21, 13,-28, 34, 16,-27,-31,-22,-21,-25, -9, 9,-23, -3,-22; /M: SY='H'; M= -9, 4,-23, -1, 0,-21,-13, 15,-20, 2,-22,-10, 14,-16, 9, 13, 7, 0,-19,-30, -8, 2; /M: SY='S'; M= 7, 2,-15, -4, -5,-14, -1,-11,-18, -7,-22,-15, 11,-13, -6, -9, 19, 12,-12,-30,-16, -5; /M: SY='F'; M=-20,-28,-22,-36,-28, 70,-30,-12, 0,-26, 8, 0,-20,-30,-34,-18,-20,-10, -2, 14, 40,-28; /M: SY='G'; M= 0, -6,-24, -7,-12,-26, 37, -9,-32,-13,-28,-17, 3,-16,-11,-13, 9, -6,-23,-26,-22,-12; /M: SY='R'; M=-11, 3,-26, 5, 8,-21,-12, -2,-27, 11,-22,-13, 3,-13, 5, 13, 0, -2,-20,-25,-11, 6; /M: SY='L'; M= -3,-15,-18,-16,-12, -4,-23,-17, 3,-12, 10, 4,-16,-21, -9,-12,-10, 0, 7,-23, -6,-10; /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-32,-22, 13,-31,-21, 23,-30, 44, 19,-28,-29,-21,-21,-28,-10, 12,-18, 2,-22; /M: SY='G'; M=-11, -2,-17, 1, -8,-16, 5, -6,-26,-10,-18,-14, -2,-15,-11, -6, -5,-11,-20,-24,-11,-11; /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; /M: SY='L'; M=-10,-26,-23,-28,-17, 5,-30,-17, 19,-24, 32, 19,-23,-25,-10,-17,-23,-10, 8,-19, 0,-14; /M: SY='E'; M= -8, 2,-18, 3, 6,-17,-14, -7,-24, 0,-22,-18, 2,-15, 0, -1, 4, 0,-19,-11, -6, 3; /M: SY='P'; M=-10,-13,-31, -8, 3,-22,-21, -1,-14, -4,-17,-10,-11, 26, -3, -6, -8, -9,-17,-28,-14, -3; /M: SY='F'; M= -8,-26,-21,-32,-25, 40,-19,-21, 1,-25, 5, -1,-19,-20,-31,-21,-15, -9, 2, -4, 10,-25; /M: SY='R'; M= -7, 1,-24, -1, 7,-23,-15, -7,-21, 5,-23,-14, 5, 4, 6, 8, 6, 6,-20,-29,-17, 5; /I: I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='F'; M= -9,-29,-20,-34,-24, 32,-29,-21, 13,-29, 29, 11,-24,-28,-26,-21,-23, -9, 7, -9, 9,-24; /M: SY='E'; M=-11, 9,-27, 14, 18,-24,-13, -3,-24, 8,-21,-15, 4,-12, 7, 4, -1, -8,-20,-26,-11, 12; /M: SY='D'; M=-10, 18,-25, 25, 18,-29,-14, 3,-24, -1,-22,-16, 9,-11, 9, -5, 4, -5,-19,-34,-15, 13; /M: SY='F'; M=-15,-29,-21,-35,-25, 40,-29,-18, 13,-27, 26, 17,-23,-28,-26,-19,-23,-10, 7, -6, 14,-24; /M: SY='M'; M= -9,-16, 1,-20,-10,-11,-28,-11, 3,-16, 4, 6,-15,-22, -6,-15,-11, -5, 3,-28, -9, -9; /M: SY='E'; M= 2, 3,-22, 3, 14,-23,-10, -8,-19, -1,-17,-14, 2, -9, 4, -3, 6, 2,-16,-28,-17, 9; /M: SY='A'; M= 31,-10,-16,-17,-12,-19, 10,-20,-17,-12,-16,-13, -8,-13,-12,-19, 8, -1, -8,-12,-18,-12; /M: SY='L'; M=-11,-28,-21,-30,-20, 9,-30,-20, 19,-24, 37, 16,-26,-28,-19,-14,-26, -9, 12,-19, 0,-20; /M: SY='T'; M= -4, -9,-13,-11, -9,-13,-20, -9, -8, 0, -9, -2, -8,-18, -7, -2, -3, 1, -1,-25, -6, -9; /M: SY='C'; M= 1, -5, 21,-10,-12,-18, -6,-11,-25,-12,-22,-16, -2,-22,-13,-14, 3, -5,-14,-33,-18,-12; /M: SY='N'; M=-11, 9,-24, 7, 6,-21,-15, 6,-21, 5,-19, -9, 11,-15, 8, 9, 1, 0,-20,-27, -7, 6; /I: I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='D'; M= -6, 17,-24, 20, 11,-29, 1, -3,-28, -3,-28,-21, 16, -6, 4, -7, 10, -3,-25,-34,-21, 7; /M: SY='P'; M= -7, 2,-28, 2, 1,-27, -8, -1,-18, -6,-24,-13, 7, 10, 7, -8, 3, -5,-23,-31,-18, 2; /M: SY='Y'; M= 1, -8,-13,-12, -6, -2,-16, -7, -9,-10, -6, -7, -5,-20, -9, -9, -1, -3, -7,-18, 2, -8; /I: I=-15; MD=-32; /M: SY='S'; M= 0, -6,-11, -5, -2,-19, 0,-13,-16,-11,-14, -9, -5, -9, -7,-14, 4, -2,-11,-29,-18, -5; D=-15; /I: I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32; /M: SY='L'; M= -6,-17,-23,-17, -5, -6,-24,-13, 2,-16, 11, 2,-17, -7, -7,-15,-11, -3, -4,-21, -3, -7; /M: SY='L'; M=-10,-23,-20,-26,-16, 9,-28,-18, 13,-18, 24, 15,-22,-24,-16,-14,-19, -6, 9,-19, 0,-16; /M: SY='B'; M= 1, 5,-14, 4, -1,-23, -3, -9,-21, -6,-16,-11, 3,-15, -3, -7, 3, -2,-15,-29,-18, -2; /M: SY='E'; M= -9, 15,-28, 23, 34,-32,-16, 0,-29, 7,-22,-18, 5, -6, 17, 3, 2, -8,-27,-30,-18, 25; /M: SY='I'; M= -7,-28,-19,-31,-25, 5,-30,-20, 27,-23, 25, 21,-26,-27,-20,-20,-20, -7, 25,-20, 2,-24; /M: SY='H'; M=-12,-17,-23,-18,-14, -5,-26, 24, 3,-20, 12, 9,-12,-24, -9,-13,-16,-10, 1,-26, 6,-14; /M: SY='V'; M= -4,-23,-19,-26,-20, 0,-26,-20, 14,-12, 9, 9,-19,-24,-17, -8,-12, -5, 19,-23, -5,-19; /M: SY='V'; M= 2,-16,-17,-19,-13, -9,-21,-18, 4, -8, -5, 0,-13,-20, -7, -8, 0, 1, 13,-25,-10,-10; /M: SY='L'; M=-10,-20,-19,-24,-19, 9,-26,-16, 14,-24, 33, 15,-17,-28,-18,-17,-23, -8, 7,-22, -2,-18; /M: SY='L'; M=-11,-28,-20,-31,-21, 16,-30,-21, 18,-29, 40, 16,-27,-28,-22,-20,-25, -7, 10,-17, 3,-21; /M: SY='R'; M=-11, -6,-26, -8, 0,-21,-13, 0,-23, 13,-17, -8, -1,-16, 10, 28, -2, -1,-17,-23,-10, 2; /M: SY='T'; M= 6,-10,-17,-17,-13, -7,-18,-18, 0, -9, -2, -2, -7,-17,-12,-11, 0, 8, 4,-24, -9,-13; /M: SY='L'; M= -2,-21,-11,-25,-18, -5,-26,-20, 11,-18, 13, 7,-18,-22,-12,-14,-11, -1, 10,-24, -8,-16; /M: SY='L'; M=-11,-22,-22,-25,-18, 10,-28,-16, 8,-15, 17, 7,-18,-24,-16, -6,-16, -2, 5,-15, 5,-18; /M: SY='E'; M=-11, 9,-19, 10, 12,-29,-11, 2,-29, 11,-25,-15, 9,-13, 11, 9, 0, -8,-25,-30,-15, 11; /M: SY='D'; M= -5, 7,-23, 11, 6,-18,-15, 2,-19, -5,-14,-12, 2,-13, -2, -8, 1, -3,-14,-29, -9, 1; /M: SY='E'; M= -8, -8,-27, -6, 6,-19,-23,-12, -7, -1, -6, -5,-10, -5, 1, 1, -9, -8, -7,-25,-13, 2; /M: SY='D'; M= -6, 4,-29, 8, 6,-29, 8, -4,-27, -1,-22,-14, 2,-13, 1, -6, -3,-13,-23,-25,-17, 3; /M: SY='E'; M= -6, 9,-25, 14, 28,-22,-16, -3,-24, 3,-17,-14, 1, -7, 10, -2, 2, -4,-21,-28,-15, 19; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of true positive hits | 23 in 23 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 92.00 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes |
| Maximum number of repetitions [info] | 1 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | DDT |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
23 sequences
BAZ1A_HUMAN (Q9NRL2), BAZ1A_MOUSE (O88379), BAZ1B_DANRE (A2BIL7), BAZ1B_HUMAN (Q9UIG0), BAZ1B_MOUSE (Q9Z277), BAZ1B_XENLA (A8DZJ1), BAZ2A_HUMAN (Q9UIF9), BAZ2A_MOUSE (Q91YE5), BAZ2A_XENLA (B7ZS37), BAZ2B_CHICK (Q9DE13), BAZ2B_HUMAN (Q9UIF8), BAZ2B_MOUSE (A2AUY4), BAZ2_CAEEL (Q23590), BPTF_HUMAN (Q12830), ITC1_YEAST (P53125), NU301_CAEEL (Q6BER5), NU301_DROME (Q9W0T1), PTM_ARATH (F4JYC8), RLT1_ARATH (F4HY56), RLT2_ARATH (Q9FFH1), RLT3_ARATH (F4JRF5), Y2237_DICDI (Q54ST3), YP216_YEAST (Q08964)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
DDR4_ARATH (F4IDY7), RSF1_HUMAN (Q96T23) |