Entry: PS50830

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] TNASE_3
Accession [info] PS50830
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2001 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC00865
Associated ProRule [info] PRU00272

Name and characterization of the entry

Description [info] Thermonuclease domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=134;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6719; R2=0.01911830; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2738.16385; R2=31.20101; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=828; N_SCORE=16.5; H_SCORE=15499; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=410; N_SCORE=8.5; H_SCORE=15499; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='K'; M=  3, -4,-14, -7, -1,-24, -3,  0,-26,  5,-21,-12,  0,-15, -2,  3, -1, -7,-18,-25,-14, -3;
/M: SY='E'; M= -9, -1,-28,  3,  9,-22,-16, -6,-19,  1,-16,-12, -6, -4,  1,  0, -6, -8,-16,-20,-13,  4;
/M:         M= -9,-13,-25,-14, -1, -1,-23, -9, -5, -7, -3, -3,-10,-12, -3, -3, -9, -7, -8,-16,  0, -3;
/M: SY='R'; M=-10, -2,-25, -3,  3,-15,-20, -4,-15,  2,-15,-10, -1, -7, -1,  5, -1,  4,-12,-23, -5, -1;
/M: SY='G'; M= 11,-15,-18,-19,-19,-17, 20,-19,-13,-18,-13, -9, -9,-19,-17,-21, -2,-11, -8,-18,-14,-19;
/M: SY='R'; M=-10,-12,-25,-12, -5,-15,-19,-15, -6,  6, -7, -2, -9,-18, -5, 10,-10, -7, -1,-23,-10, -7;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-15,-30,-26, -2,-31,-27, 29,-20, 11, 11,-27,-27,-22,-20,-12, -3, 40,-27, -8,-25;
/M: SY='E'; M= -4, -1,-21, -4,  3,-17,-20,-12, -5,  2,-11, -4, -1,-15, -4, -5, -4, -3,  0,-28,-13, -1;
/M: SY='R'; M= -9, -8,-14,-10, -2,-14,-18,  6,-20,  6,-16, -3, -3,-18,  3, 13, -3, -6,-15,-23, -3, -1;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-16,-32,-29,  0,-30,-29, 28,-22, 11,  9,-28,-28,-27,-22,-13, -4, 38,-17, -6,-28;
/M: SY='V'; M= -6,-23,-21,-26,-20, -1,-23,-20, 13,-16, 10,  6,-17,-23,-16, -7,-12, -6, 14,-22, -6,-20;
/M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 49, 12,-33, -6, -3,-33, -4,-26,-25, 17,-12, -2,-11,  5, -6,-25,-38,-19,  5;
/M: SY='G'; M=  3,-10,-28,-10,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-29,-20,  0,-19,-19,-20,  2,-17,-28,-21,-29,-19;
/M: SY='D'; M=-14, 37,-19, 52, 14,-35, -9, -3,-36, -3,-30,-28, 16,-11, -1,-11,  7, -4,-25,-40,-20,  6;
/M: SY='T'; M=  7, -3,-12,-12,-10,-13,-16,-17,-10, -6,-11, -9, -1,-12, -9, -4, 13, 30, -1,-28,-12,-10;
/M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28,  5,-35,-28, 36,-27, 22, 16,-25,-25,-24,-25,-19, -7, 31,-22, -2,-28;
/M: SY='R'; M=-12, -8,-28, -8,  0,-14,-24, -3, -8,  0,-10, -5, -8,-16, -2,  3,-10, -7, -7,-11, -1, -3;
/M: SY='V'; M= -1,-28,-11,-32,-26,  8,-28,-26, 21,-24, 16,  9,-25,-27,-26,-22,-14, -5, 27,-22, -4,-26;
/M: SY='Y'; M= -9, -9,-24,-10, -4, -3,-20, -4,-10, -1, -2,  1, -9,-19,  0,  2,-10, -8,-10,-14,  5, -3;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='L'; M= -7,-13,-19,-14,-12, -2,-13,-10, -1, -9,  2,  1,-11,-19,-12, -9, -9, -5,  2,-17, -2,-13; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='B'; M= -6,  7,-22,  7,  3,-21,-12, -5,-15, -1,-14, -8,  5,  1,  3, -5, -2, -5,-17,-26,-14,  2; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-4;
/M: SY='P'; M= -6, -4,-25, -2, -3,-23,  2,-12,-22,  1,-23,-14, -1, 11, -6, -2, -2, -6,-19,-23,-19, -6; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4;
/M: SY='Q'; M= -9, -4,-18, -1,  6,-22,-13,  0,-19,  3,-19,-10, -4,  1,  7,  0, -3, -8,-18,-22, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-4;
/M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -5,  3,-15,-14, -8,-13, -7, -7, -7, -7, -7,  1, -9, -1,  0,-14,-22, -6,  1;
/M: SY='I'; M=-10,-17,-27,-18, -5, -9,-27,-16,  6, -5, -3,  2,-15,-18, -6, -7,-13, -7,  4, -7, -2, -7;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-24, -6,  0,-21,-19,-10,-22, 16,-21,-11,  0, -3,  3, 19,  1, 10,-15,-25,-12,  0;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-36,-29, 12,-34,-27, 33,-27, 20, 14,-24,-26,-26,-24,-18, -7, 29,-19,  1,-29;
/M: SY='R'; M=-17, -8,-28,-10, -2,-16,-20, 10,-20, 13,-11, -2, -1,-20, 11, 37,-11,-10,-18,-19, -2,  1;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22, 11,-31,-21, 23,-29, 43, 21,-28,-28,-20,-21,-28,-10, 12,-19,  1,-21;
/M: SY='A'; M=  8,-10,-10,-15,-13,-11,-10,-14, -4,-14, -9, -7, -5,-19,-11,-13,  7,  2,  1,-26,-10,-13;
/M: SY='G'; M= -1,  9,-23,  8, -4,-26, 24,-10,-29,-11,-25,-19, 13,-16, -8,-13,  7, -7,-23,-30,-23, -6;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30,  0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30;
/M: SY='D'; M=-18, 31,-29, 43, 15,-33,-13, -1,-35,  8,-27,-23, 15,-12,  3,  8, -1, -7,-26,-34,-17,  8;
/M: SY='A'; M= 24,-10,  7,-19,-13,-17,-11,-21,-12,-14,-10,-11,-10,-11,-13,-19,  8,  9, -3,-28,-19,-13;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, -1,-30,-16,-20,-21,-10,-30,-20,-19, 85,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='E'; M=-10,  6,-28, 11, 37,-26,-18, -1,-28, 13,-21,-17,  3, -6, 14, 14,  1, -5,-25,-29,-17, 25;
/M: SY='T'; M= -7, -9,-23,-12, -3,-10,-14,-16, -9, -3, -6, -5, -7,-15, -7, -4, -3,  4, -6,-23, -9, -5;
/M: SY='A'; M=  5,-12,-22,-15, -8, -9, -7, -9,-16, -3,-15,-10, -8,-17, -8, -1, -1, -6, -9, -8, -5, -8;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='R'; M= -9, -3,-22, -4, -1,-19, -6,  8,-20,  9,-18, -7,  3,-15,  5, 17, -2, -7,-15,-21, -7,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -9, -7,-23, -5,  0,-12,-17,-11,-11, -3,-11, -9, -7, 11, -6,  0, -6, -4,-10,-22,-13, -5; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='N'; M= -2,  4,-10,  0, -4,-18, -2,  0,-18, -6,-17,-12,  9, -6, -5, -8,  1, -5,-17,-27,-15, -6; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='T'; M= -1, -2, -8, -6, -6,-15,-15,-13,-10, -3,-10, -8, -1, -4, -7, -7, -1,  4, -8,-24,-13, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='G'; M=  1,  0,-23,  2, -1,-24,  5, -8,-22, -4,-20,-13,  0,  5,  0, -5,  0, -8,-20,-21,-18, -2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='D'; M= -5,  4,-13,  6,  3,-11, -6, -4,-13, -2, -9, -9,  1, -8, -1, -1,  3,  2, -9,-16, -6,  0; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='K'; M=  1, -4,-13, -4,  3,-13, -5, -7,-10,  4,-10, -5, -3, -8,  2,  3,  0, -3, -5,-15, -9,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='Y'; M= -1, -2,-15, -1,  0, -7,-10, -2, -9, -2, -9, -7, -4,  1, -2, -3, -2, -2, -9, -8,  2, -2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='D'; M= -1,  6,-20, 12,  7,-21, -8, -9,-15, -5,-12,-12, -2, -6, -2,-10, -2, -6,-10,-25,-15,  2; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='E'; M=-11, -5,-29, -3, 19,-20,-24, -1,-11,  3, -7, -2, -7,-12, 19,  3, -8,-10,-17,-20, -5, 18;
/M: SY='P'; M= -1,-10,-30, -6,  3,-27,-15,-15,-22,  2,-25,-17,-10, 38, -3, -3, -3, -6,-22,-27,-23, -3;
/M: SY='F'; M=-18,-25,-17,-31,-22, 43,-29,-11, -2,-22,  2, -3,-21,-28,-25,-18,-20,-12, -5, 19, 33,-22;
/M: SY='G'; M= 13,-10,-22,-13,-15,-24, 37,-17,-25,-16,-20,-10, -3,-16,-14,-18,  5,-10,-17,-22,-24,-15;
/M: SY='E'; M=-10,  0,-27, -1,  9, -9,-18, -6,-21,  8,-19,-13,  1,-10,  1,  3, -6, -8,-20,-12, -4,  6;
/M: SY='E'; M= -5,  3,-29,  8, 29,-28,-17, -6,-27, 14,-22,-16, -3, -2, 12,  6, -3,-10,-24,-20,-16, 20;
/M: SY='A'; M= 40, -7,-10,-15, -7,-20,  0,-17,-13,-10,-15,-13, -5,-10, -7,-17, 18,  5, -3,-25,-20, -7;
/M: SY='R'; M= -2, -6,-21, -8, -1,-19,-15,-10,-21, 15,-18,-10, -1,-14,  2, 23,  4,  5,-12,-25,-12, -1;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-25, 11, 16,-16,-17, -2,-20, -2,-14,-13,  2,-11,  4, -7, -1, -7,-18,-26,-10, 10;
/M: SY='F'; M=-11,-23,-22,-30,-20, 42,-24,-13, -6,-17,  1, -2,-16,-25,-24, -8,-15, -8, -5,  8, 21,-20;
/M: SY='L'; M=  2,-19,-16,-23,-16,  0,-22,-19,  8,-21, 24,  9,-19,-21,-15,-17,-10,  7,  6,-23, -6,-15;
/M: SY='R'; M= -8, -1,-27,  0, 11,-24,-19, -7,-22, 20,-17,-10, -2,-13,  8, 21, -6, -8,-17,-23,-12,  8;
/M: SY='K'; M= -2,  5,-23,  6, 11,-27,-10, -7,-26, 16,-26,-15,  5,-10,  7,  8,  6, -1,-19,-28,-16,  9;
/M: SY='L'; M=-13,-17,-24,-18, -8, -2,-25, -4, -3, -2, 11,  8,-14,-23, -6,  7,-18,-10, -4,-20, -1, -8;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-23,  6,-31,-24, 25,-27, 34, 16,-28,-28,-22,-21,-22, -5, 23,-23, -3,-23;
/M: SY='L'; M= -5,-15,-20,-18,-12,  0,-22,-16,  4,-16,  7,  1,-11,-15,-14,-14, -7,  0,  2,-22, -4,-13;
/M: SY='G'; M= -3, -1,-28, -5, -5,-28, 17, -8,-23, -6,-23,-12,  7,-12,  5, -4,  0,-11,-24,-24,-20, -1;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='R'; M=-11,  0,-27,  1,  8,-28,-17,  1,-28, 26,-25,-10,  3,-13, 16, 29, -1, -6,-21,-24,-10, 10;
/M: SY='E'; M=-12,  3,-22,  5, 13,-15,-20, -5,-25, 10,-20,-14,  0, -6,  1,  4, -5, -5,-20,-24,-10,  7;
/M: SY='V'; M= -1,-26,-12,-28,-27, -1,-29,-28, 26,-20,  9,  8,-25,-26,-26,-19, -7,  6, 40,-29, -9,-27;
/M: SY='Q'; M=-11, -9,-20,-11,  0,-17,-22, -9,-14, -1,-10, -6, -7,-17,  9,  6, -7, -2,-16, -7, -7,  4;
/M: SY='V'; M= -7,-29, -9,-33,-28,  8,-33,-27, 27,-26, 17, 11,-26,-28,-27,-23,-17, -6, 30,-23, -3,-28;
/M: SY='E'; M= -2, -5,-24, -5,  9,-18,-20,-10,-11, -1,-12, -8, -7,-12,  1, -7, -2,  0, -8,-16,-10,  5;
/M: SY='F'; M=-11,-22,-25,-23,-15,  7,-22,-15,  4,-15,  3,  1,-18,-13,-17,-11,-15, -9,  4,-13,  4,-18;
/M: SY='D'; M=-10,  8,-29, 16, 14,-19,-13, -8,-24,  0,-15,-16, -2,-13, -1, -7, -8,-11,-21,-13, -9,  7;
/I:         I=-3; MD=-16;
/M: SY='N'; M= -7,  3,-21,  1,  1,-13, -3, -2,-21,  2,-20,-13,  9,-15,  1,  4,  4, -3,-18,-20, -5,  0; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='T'; M= -5, -4,-21, -6,  2,-19,-18,-12,-15,  9,-17, -7, -2, -8,  1,  7,  5, 10, -9,-27,-12,  0;
/M: SY='D'; M=-11, 32,-18, 41,  9,-29,-12, -4,-30, -4,-24,-23, 13,-13, -4,-11,  2, -3,-22,-33,-13,  2;
/M: SY='R'; M=-11, -7,-25, -8,  0,-14,-18, -2,-24, 16,-21,-10, -1,-11,  4, 27, -1, -3,-17,-22, -7,  0;
/M: SY='Y'; M=-11, -9,-26,-12,-13, 13,-21,  9, -7, -9, -9, -6, -4,-19, -6, -9, -7, -5,-14,  4, 38,-12;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-30,  0, -4,-32, 42,-12,-36,-11,-28,-18,  4,-16, -3,-13,  0,-16,-30,-23,-25, -4;
/M: SY='R'; M=-18,  0,-28, -4,  0,-20,-16,  1,-28, 25,-22,-12, 12,-20,  8, 54, -6, -8,-22,-24,-12,  0;
/M: SY='T'; M= -9, -8,-15,-13, -7,  6,-20,-14,-10,-10, -6, -5, -8,-17,-13,-11, -2,  7, -6,-18,  0, -9;
/M: SY='L'; M= -8,-27, -6,-29,-23,  3,-30,-17, 17,-25, 24, 11,-26,-30,-22,-20,-20, -8, 18,-24, -1,-23;
/M: SY='G'; M= 18,-10,-22,-14,-15,-25, 36,-19,-28,-13,-21,-15, -4,-16,-14,-14,  3,-11,-18,-20,-25,-15;
/M: SY='Y'; M= -2,-10,-21,-13,-10, -6,-19, -7, -8, -6, -9, -4, -9,-18, -3, -4,  0,  7, -5, -6,  9, -8;
/M: SY='V'; M= -5,-29,-10,-34,-29,  0,-34,-29, 32,-25, 15, 13,-26,-27,-25,-24,-16, -5, 35,-27, -7,-29;
/M: SY='Y'; M=-14,-20,-26,-23,-19, 20,-26, -2, -3,-14, -2, -2,-17,-25,-16,-12,-14, -4, -5, 17, 32,-18;
/M: SY='L'; M= -6,-20,-18,-24,-17,  1,-26, -5,  5,-14,  7,  4,-15,-23,-13, -7,-13, -6,  4,-17,  4,-17;
/M: SY='G'; M= -5,  1,-29,  2, -1,-27,  9, -4,-28, -6,-27,-17,  4,  2, -4,-10, -1,-11,-27,-21,-18, -4;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-27, 12, -1,-27, 10,-10,-29,  0,-24,-16,  8,-10, -6, -6,  0, -7,-23,-28,-20, -4;
/M: SY='G'; M= -5,  2,-27,  2,  4,-26,  5, -8,-25, -2,-22,-14,  3,-14,  5, -2,  0, -8,-23,-18,-16,  4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='N'; M=-10, 29,-21, 21,  1,-19, -5,  4,-19, -3,-24,-13, 35,-17, -1, -5,  7, -1,-23,-36,-16,  0;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-21,-35,-28, 15,-34,-27, 30,-27, 21, 14,-25,-26,-26,-24,-19, -7, 27,-18,  2,-28;
/M: SY='N'; M= 11, 10,-18,  0, -6,-22, 10, -7,-20, -7,-23,-16, 21,-15, -5,-10, 12,  1,-18,-30,-21, -5;
/M: SY='E'; M= -6, -5,-24, -1, 23,-19,-22, -9,-12,  1, -4, -7,-10,-12,  5, -1, -7, -8,-10,-26,-14, 14;
/M: SY='A'; M=  2, -9,-24,-10,  2,-15, -3,-13,-16, -5,-11, -7, -8,-14, -4, -9, -2, -7,-13,-14,-12, -1;
/M: SY='L'; M= -7,-27,-20,-30,-20,  6,-26,-15, 19,-24, 40, 29,-27,-27,-15,-18,-26,-10, 10,-20, -1,-17;
/M: SY='V'; M=  0,-29,-15,-31,-27,  1,-29,-27, 28,-23, 18, 12,-27,-27,-25,-22,-14, -3, 36,-26, -7,-27;
/M: SY='K'; M=  0, -1,-25,  0, 15,-26,-15, -4,-26, 20,-23,-13,  0, -9,  9, 14,  2, -5,-18,-25,-14, 11;
/M: SY='E'; M= -6,  9,-26, 10, 24,-25,-14,  5,-24,  7,-22,-14,  9,-10, 14,  3,  2, -6,-24,-27,-12, 18;
/M: SY='G'; M=  2,-10,-29,-10,-20,-30, 67,-20,-39,-20,-29,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-19,-29,-20,-30,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-24,-18, 10,-25, -4, 10,-22, 27, 16,-19,-27,-14,-15,-22,-10,  2,-14, 11,-17;
/M: SY='A'; M= 40,-11,-10,-19,-11,-17, -3,-20, -7,-12, -8, -8,-10,-12,-11,-19, 10,  1,  2,-23,-18,-11;
/M: SY='R'; M=-11,-16,-27,-17, -8,-10,-21,-15,-11,  3, -9, -3,-15,-15, -6,  6,-13, -6, -8,  5, -3, -7;
/M: SY='V'; M=  7,-16, -3,-18,-17,-12,-20,-19,  1,-14, -4, -3,-17,-17,-18,-15, -4, -2, 14,-29,-15,-18;
/M: SY='Y'; M=-12,-12,-26,-11, -8, -3,-25,  6, -5, -1, -7, -2,-10,-21, -5,  3,-12, -9, -3,-10, 18,-10;
/M: SY='R'; M=-12, -3,-25, -2,  1, -1,-21, -3,-15, -2,-11, -9, -4,-17, -4,  2, -7, -7,-11,-18,  0, -2;
/M: SY='Y'; M= -8,-13,-26,-16,-13, -7, -4, -6,-15, -9,-14, -8, -9,-20, -6, -4, -5, -3,-13,  1,  5,-11;
/M: SY='R'; M= -8, -2,-26, -4, -4,-12,-15,  2,-19,  7,-18, -9,  1,-14,  0, 10, -4, -6,-17,-10,  4, -4;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='E'; M= -6, -3,-25,  0,  7,-18,-13,-11,-12, -3,-14,-10, -4, -1, -2, -6, -3, -7,-11,-25,-15,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='K'; M= -2,  1,-21,  0,  0,-15, -7, -8,-17,  3,-17,-12,  3, -3, -4,  3, -2, -6,-14,-21,-13, -3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='D'; M= -7, 12,-19, 15,  3,-18,-10, -3,-16, -3,-14,-12,  7, -9,  0, -3,  2, -1,-13,-24, -9,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='N'; M= -8,  1,-11, -1,  2, -2,-10, -5,-13, -3,-10, -9,  3,-13, -5, -5, -3, -5,-13,-16, -3, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-13;
/M: SY='Q'; M= -4, -2,-11, -3,  1, -8,-10, -4, -6, -2, -7, -3, -1, -3,  5, -3,  1,  4, -6,-13, -5,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13;
/M: SY='H'; M= -9, -6,-24, -6, -5, -9,-13, 10,-12, -8, -8, -5, -4,-20, -6, -6, -7, -6,-10,-18,  7, -7;
/M: SY='Y'; M= -6, -2,-26,  0,  0,-14,-15, -3,-14,  1,-14, -9, -5,-17,  1, -1, -5, -8,-12,-14,  6, -1;
/M: SY='D'; M= -8,  8,-27,  9,  6,-26,-11, -7,-18, -2,-20,-13,  7,  2,  4, -7,  0, -3,-20,-29,-17,  4;
/M: SY='E'; M= -7, -1,-26,  1, 14,-22,-20, -3,-17,  8,-13, -8, -3,-12,  9,  6, -4, -5,-15,-26,-11, 11;
/M: SY='L'; M=-13,-27,-23,-29,-22, 19,-30, -9, 16,-24, 30, 16,-25,-29,-18,-18,-25,-10,  6, -5, 23,-21;
/M: SY='L'; M= -3,-13,-22,-14, -4, -9,-19,-10, -5, -8,  8,  0,-10,-16, -4,  1,-10, -6, -7,-22, -7, -5;
/M: SY='N'; M=  3,  6,-20,  3,  7,-22,-11, -4,-18,  2,-20,-13,  8,-12,  6, -2,  8,  2,-15,-27,-13,  6;
/M: SY='A'; M= 24,-14, -9,-21,-14,-11, -6,-18, -8,-15, -4, -7,-13,-17,-13,-19,  1, -1, -1,-14, -9,-14;
/M: SY='E'; M=-10,  3,-29,  9, 39,-30,-21,  1,-21,  6,-15,-10, -3, -6, 28,  1, -2,-10,-24,-26,-15, 34;
/M: SY='E'; M= -2,  4,-25,  3, 19,-22,-14, -3,-23, 11,-20,-13,  6,-10, 11,  9,  0, -7,-21,-25,-15, 15;
/M: SY='Q'; M= -3,  2,-22, -1, 10,-19,-16, -4,-16,  3,-15, -9,  4,-13, 12,  1,  2, -2,-16,-26,-12, 11;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='K'; M=-13, -5,-29, -5,  7,-21,-21, -6,-24, 31,-22, -8, -2,-13, 12, 30, -9,-10,-18,-19, -8,  9;
/M: SY='K'; M=  1,  2,-23,  1, 11,-27, -9, -7,-25, 16,-25,-14,  4,-10, 10,  8,  6, -2,-19,-27,-16, 10;
/M: SY='N'; M=  4,  6,-22,  1,  3,-24, -6, -6,-21,  9,-21,-12, 10,-14,  4,  6,  2, -5,-18,-26,-16,  3;
/M: SY='R'; M=-12, -6,-30, -6,  1,-27, -3, -6,-31, 26,-25,-11,  0,-16,  8, 35, -7,-12,-23,-20,-14,  3;
/M: SY='K'; M= -6,-13,-24,-13, -3,-14,-23,-15, -7, 12, -1,  0,-12,-18, -4,  8,-14, -8, -2,-22, -8, -4;
/M: SY='G'; M= -6,  7,-27,  0,-10,-26, 34, -8,-32, -5,-29,-19, 19,-20, -9, -2,  2,-12,-29,-26,-24,-10;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-33,-23,  3,-33,-23, 31,-25, 30, 20,-24,-24,-18,-21,-23,-10, 19,-20, -1,-23;
/M: SY='W'; M=-20,-37,-46,-38,-29, 16,-21,-24,-18,-21,-17,-17,-36,-30,-21,-19,-37,-27,-27,128, 30,-20;
/M: SY='S'; M=  7,  1,-18, -3,  3,-21, -8, -8,-18,  2,-21,-14,  8,-12,  1,  5, 13,  3,-13,-30,-17,  1;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-26, 14,  8,-17,-14,  5,-23,  0,-21,-16,  5,-15,  3, -3,  0, -6,-21,-15,  2,  5;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 115 in 94 different sequences
Number of true positive hits 115 in 94 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 4
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] TNase-like
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
94 sequences

CAN1_ARATH  (F4IZC5), CAN1_ORYSJ  (Q942N7), CAN2_ARATH  (F4IH31), 
CAN2_ORYSJ  (Q2RBJ2), CAN3_ORYSJ  (Q2QYR1), CAN4_ORYSJ  (Q2QUS0), 
EXOI_RHIME  (Q52928), LCL3_AJEDR  (C5GB89), LCL3_ARTGP  (E4V094), 
LCL3_ARTOC  (C5FTB4), LCL3_ASHGO  (Q754Z2), LCL3_ASPCL  (A1CRW4), 
LCL3_ASPFC  (B0XMZ5), LCL3_ASPFN  (B8MY73), LCL3_ASPFU  (Q4WK77), 
LCL3_ASPNC  (A2Q8K8), LCL3_ASPOR  (Q2URN2), LCL3_ASPTN  (Q0CUT8), 
LCL3_BOTFB  (A6RP27), LCL3_CANAL  (Q5AKW3), LCL3_CANAW  (C4YFU9), 
LCL3_CANDC  (B9W9Z5), LCL3_CANGA  (Q6FS62), LCL3_CANTT  (C5MC60), 
LCL3_CLAL4  (C4Y4X4), LCL3_COCP7  (C5P0Z4), LCL3_COLGM  (E3QWM6), 
LCL3_CRYGW  (E6R427), LCL3_DEBHA  (Q6BSY9), LCL3_EMENI  (Q5BGS2), 
LCL3_KLUDE  (Q874L8), LCL3_KLULA  (Q6CMM1), LCL3_LACBS  (B0D7T0), 
LCL3_LACTC  (C5E2G4), LCL3_LEPMJ  (E4ZVE5), LCL3_LODEL  (A5E1Q5), 
LCL3_MAGO7  (A4RMK0), LCL3_NECH7  (C7YQ31), LCL3_NEOFI  (A1D4S1), 
LCL3_PARBA  (C1H492), LCL3_PARBD  (C1GKM1), LCL3_PARBP  (C0SEQ8), 
LCL3_PENCW  (B6H1W0), LCL3_PENMQ  (B6QNP4), LCL3_PHANO  (Q0UVH1), 
LCL3_PICGU  (A5DNZ8), LCL3_PICPG  (C4QW04), LCL3_PICST  (A3GI61), 
LCL3_PODAN  (B2AU25), LCL3_PYRTR  (B2WC78), LCL3_SCHCM  (D8QGA7), 
LCL3_SCHJY  (B6JYT1), LCL3_SCHPO  (O60168), LCL3_SCLS1  (A7ECE0), 
LCL3_UNCRE  (C4JVW2), LCL3_VANPO  (A7TE94), LCL3_VERA1  (C9SI22), 
LCL3_YARLI  (Q6C427), LCL3_YEAS1  (B3LHF1), LCL3_YEAS2  (C7GW31), 
LCL3_YEAS6  (B5VIN9), LCL3_YEAS7  (A6ZU94), LCL3_YEAS8  (C8Z8G3), 
LCL3_YEAST  (P53153), LCL3_ZYGRC  (C5DZY8), NUC_SHIFL   (P29769), 
NUC_STAAC   (Q5HHM4), NUC_STAAM   (Q99VJ0), NUC_STAAN   (Q7A6P2), 
NUC_STAAR   (Q6GIK1), NUC_STAAS   (Q6GB41), NUC_STAAU   (P00644), 
NUC_STAAW   (Q8NXI6), NUC_STAHY   (P43270), NUC_STAIN   (P43269), 
PARB4_ECOLX (P22997), SND1_BOVIN  (Q863B3), SND1_DANRE  (Q7ZT42), 
SND1_HUMAN  (Q7KZF4), SND1_MOUSE  (Q78PY7), SND1_PONAB  (Q5REU4), 
SND1_RAT    (Q66X93), SND1_SCHPO  (Q9Y7U7), Y1296_HAEIN (Q57519), 
Y133_MYCPN  (P75265), Y1439_METJA (Q58834), Y186_MYCGE  (P47432), 
Y38K_CAPSE  (Q39635), Y6211_BACAN (Q9X397), YFI3_ECO57  (Q7BSX4), 
YFI3_ECOLX  (Q99342), YHCR_BACSU  (P54602), YNCB_BACSU  (P94492), 
YOKF_BACSU  (O32001)
» More

PDB
[Detailed view]
229 PDB

1A2T; 1A2U; 1A3T; 1A3U; 1A3V; 1AEX; 1ENA; 1ENC; 1EQV; 1EY0; 1EY4; 1EY5; 1EY6; 1EY7; 1EY8; 1EY9; 1EYA; 1EYC; 1EYD; 1EZ6; 1EZ8; 1F2M; 1F2Y; 1F2Z; 1IHZ; 1II3; 1JOK; 1JOO; 1JOQ; 1JOR; 1KAA; 1KAB; 1KDA; 1KDB; 1KDC; 1NSN; 1NUC; 1RKN; 1SNC; 1SND; 1SNM; 1SNO; 1SNP; 1SNQ; 1STA; 1STB; 1STG; 1STH; 1STN; 1STY; 1SYB; 1SYC; 1SYD; 1SYE; 1SYF; 1SYG; 1TQO; 1TR5; 1TT2; 1U9R; 2ENB; 2EXZ; 2EY1; 2EY2; 2EY5; 2EY6; 2EYF; 2EYH; 2EYJ; 2EYL; 2EYM; 2EYO; 2EYP; 2F0D; 2F0E; 2F0F; 2F0G; 2F0H; 2F0I; 2F0J; 2F0K; 2F0L; 2F0M; 2F0N; 2F0O; 2F0P; 2F0Q; 2F0S; 2F0T; 2F0U; 2F0V; 2F0W; 2F3V; 2F3W; 2KHS; 2LKV; 2M00; 2NUC; 2OEO; 2OF1; 2OXP; 2PQE; 2PW5; 2PW7; 2PYK; 2PZT; 2PZU; 2PZW; 2QDB; 2RBM; 2RDF; 2RKS; 2SNM; 2SNS; 2SOB; 3BDC; 3BDL; 3C1E; 3C1F; 3D4D; 3D4W; 3D6C; 3D8G; 3DHQ; 3DMU; 3E5S; 3EJI; 3ERO; 3ERQ; 3EVQ; 3H6M; 3HEJ; 3HZX; 3ITP; 3LX0; 3MEH; 3MHB; 3MVV; 3MXP; 3MZ5; 3NHH; 3NK9; 3NP8; 3NQT; 3NUC; 3NXW; 3OSO; 3OWF; 3P1H; 3P75; 3PMF; 3QB3; 3QOJ; 3QOL; 3QON; 3R3O; 3RUZ; 3S9W; 3SHL; 3SK4; 3SK5; 3SK6; 3SK8; 3SR1; 3SXH; 3T13; 3T16; 3TME; 3TP5; 3TP6; 3TP7; 3TP8; 3U9O; 3V2T; 3VA5; 4DF7; 4DFA; 4DGZ; 4DU9; 4E6I; 4EQN; 4EQO; 4EQP; 4EVO; 4F7X; 4F8M; 4G57; 4H7B; 4HMI; 4HMJ; 4HTH; 4I65; 4IAL; 4ID6; 4IUN; 4IZ8; 4J1M; 4J6H; 4K14; 4K2K; 4K2L; 4K5V; 4K5W; 4K5X; 4K6D; 4K8I; 4K8J; 4KD3; 4KD4; 4KHV; 4KJN; 4KJO; 4KTA; 4KV6; 4KY5; 4KY6; 4KY7; 4LAA; 4ME5; 4MIU; 4N9P; 4N9T; 4NDX; 4NKL; 4NMZ; 4NP5; 4ODG; 4PNY; 5NUC
» More

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission