PROSITE entry PS50830
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | TNASE_3 |
| Accession [info] | PS50830 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-DEC-2001 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC00865 |
| Associated ProRule [info] | PRU00272 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | Thermonuclease domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=134; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=129; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.6719000; R2=0.0191183; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=8292.8398438; R2=6.2695923; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=828; H_SCORE=13484; N_SCORE=16.5; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=410; H_SCORE=10863; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='K'; M= 3, -4,-14, -7, -1,-24, -3, 0,-26, 5,-21,-12, 0,-15, -2, 3, -1, -7,-18,-25,-14, -3; /M: SY='E'; M= -9, -1,-28, 3, 9,-22,-16, -6,-19, 1,-16,-12, -6, -4, 1, 0, -6, -8,-16,-20,-13, 4; /M: M= -9,-13,-25,-14, -1, -1,-23, -9, -5, -7, -3, -3,-10,-12, -3, -3, -9, -7, -8,-16, 0, -3; /M: SY='R'; M=-10, -2,-25, -3, 3,-15,-20, -4,-15, 2,-15,-10, -1, -7, -1, 5, -1, 4,-12,-23, -5, -1; /M: SY='G'; M= 11,-15,-18,-19,-19,-17, 20,-19,-13,-18,-13, -9, -9,-19,-17,-21, -2,-11, -8,-18,-14,-19; /M: SY='R'; M=-10,-12,-25,-12, -5,-15,-19,-15, -6, 6, -7, -2, -9,-18, -5, 10,-10, -7, -1,-23,-10, -7; /M: SY='V'; M= -3,-28,-15,-30,-26, -2,-31,-27, 29,-20, 11, 11,-27,-27,-22,-20,-12, -3, 40,-27, -8,-25; /M: SY='E'; M= -4, -1,-21, -4, 3,-17,-20,-12, -5, 2,-11, -4, -1,-15, -4, -5, -4, -3, 0,-28,-13, -1; /M: SY='R'; M= -9, -8,-14,-10, -2,-14,-18, 6,-20, 6,-16, -3, -3,-18, 3, 13, -3, -6,-15,-23, -3, -1; /M: SY='V'; M= -1,-30,-16,-32,-29, 0,-30,-29, 28,-22, 11, 9,-28,-28,-27,-22,-13, -4, 38,-17, -6,-28; /M: SY='V'; M= -6,-23,-21,-26,-20, -1,-23,-20, 13,-16, 10, 6,-17,-23,-16, -7,-12, -6, 14,-22, -6,-20; /M: SY='D'; M=-14, 36,-26, 49, 12,-33, -6, -3,-33, -4,-26,-25, 17,-12, -2,-11, 5, -6,-25,-38,-19, 5; /M: SY='G'; M= 3,-10,-28,-10,-19,-29, 64,-20,-38,-19,-29,-20, 0,-19,-19,-20, 2,-17,-28,-21,-29,-19; /M: SY='D'; M=-14, 37,-19, 52, 14,-35, -9, -3,-36, -3,-30,-28, 16,-11, -1,-11, 7, -4,-25,-40,-20, 6; /M: SY='T'; M= 7, -3,-12,-12,-10,-13,-16,-17,-10, -6,-11, -9, -1,-12, -9, -4, 13, 30, -1,-28,-12,-10; /M: SY='I'; M= -7,-30,-21,-35,-28, 5,-35,-28, 36,-27, 22, 16,-25,-25,-24,-25,-19, -7, 31,-22, -2,-28; /M: SY='R'; M=-12, -8,-28, -8, 0,-14,-24, -3, -8, 0,-10, -5, -8,-16, -2, 3,-10, -7, -7,-11, -1, -3; /M: SY='V'; M= -1,-28,-11,-32,-26, 8,-28,-26, 21,-24, 16, 9,-25,-27,-26,-22,-14, -5, 27,-22, -4,-26; /M: SY='Y'; M= -9, -9,-24,-10, -4, -3,-20, -4,-10, -1, -2, 1, -9,-19, 0, 2,-10, -8,-10,-14, 5, -3; /I: I=-1; MD=-4; /M: SY='L'; M= -7,-13,-19,-14,-12, -2,-13,-10, -1, -9, 2, 1,-11,-19,-12, -9, -9, -5, 2,-17, -2,-13; D=-1; /I: I=-1; MD=-4; /M: SY='B'; M= -6, 7,-22, 7, 3,-21,-12, -5,-15, -1,-14, -8, 5, 1, 3, -5, -2, -5,-17,-26,-14, 2; D=-1; /I: I=-1; MD=-4; /M: SY='P'; M= -6, -4,-25, -2, -3,-23, 2,-12,-22, 1,-23,-14, -1, 11, -6, -2, -2, -6,-19,-23,-19, -6; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-4; IM=0; DM=-4; /M: SY='Q'; M= -9, -4,-18, -1, 6,-22,-13, 0,-19, 3,-19,-10, -4, 1, 7, 0, -3, -8,-18,-22, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; DM=-4; /M: SY='E'; M= -5, -7,-24, -5, 3,-15,-14, -8,-13, -7, -7, -7, -7, -7, 1, -9, -1, 0,-14,-22, -6, 1; /M: SY='I'; M=-10,-17,-27,-18, -5, -9,-27,-16, 6, -5, -3, 2,-15,-18, -6, -7,-13, -7, 4, -7, -2, -7; /M: SY='R'; M= -9, -3,-24, -6, 0,-21,-19,-10,-22, 16,-21,-11, 0, -3, 3, 19, 1, 10,-15,-25,-12, 0; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-36,-29, 12,-34,-27, 33,-27, 20, 14,-24,-26,-26,-24,-18, -7, 29,-19, 1,-29; /M: SY='R'; M=-17, -8,-28,-10, -2,-16,-20, 10,-20, 13,-11, -2, -1,-20, 11, 37,-11,-10,-18,-19, -2, 1; /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-22, 11,-31,-21, 23,-29, 43, 21,-28,-28,-20,-21,-28,-10, 12,-19, 1,-21; /M: SY='A'; M= 8,-10,-10,-15,-13,-11,-10,-14, -4,-14, -9, -7, -5,-19,-11,-13, 7, 2, 1,-26,-10,-13; /M: SY='G'; M= -1, 9,-23, 8, -4,-26, 24,-10,-29,-11,-25,-19, 13,-16, -8,-13, 7, -7,-23,-30,-23, -6; /M: SY='I'; M= -6,-30,-23,-36,-30, 0,-36,-30, 43,-26, 16, 16,-24,-24,-24,-26,-16, -6, 37,-24, -4,-30; /M: SY='D'; M=-18, 31,-29, 43, 15,-33,-13, -1,-35, 8,-27,-23, 15,-12, 3, 8, -1, -7,-26,-34,-17, 8; /M: SY='A'; M= 24,-10, 7,-19,-13,-17,-11,-21,-12,-14,-10,-11,-10,-11,-13,-19, 8, 9, -3,-28,-19,-13; /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10, -1,-30,-16,-20,-21,-10,-30,-20,-19, 85,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10; /M: SY='E'; M=-10, 6,-28, 11, 37,-26,-18, -1,-28, 13,-21,-17, 3, -6, 14, 14, 1, -5,-25,-29,-17, 25; /M: SY='T'; M= -7, -9,-23,-12, -3,-10,-14,-16, -9, -3, -6, -5, -7,-15, -7, -4, -3, 4, -6,-23, -9, -5; /M: SY='A'; M= 5,-12,-22,-15, -8, -9, -7, -9,-16, -3,-15,-10, -8,-17, -8, -1, -1, -6, -9, -8, -5, -8; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='R'; M= -9, -3,-22, -4, -1,-19, -6, 8,-20, 9,-18, -7, 3,-15, 5, 17, -2, -7,-15,-21, -7, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='P'; M= -9, -7,-23, -5, 0,-12,-17,-11,-11, -3,-11, -9, -7, 11, -6, 0, -6, -4,-10,-22,-13, -5; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='N'; M= -2, 4,-10, 0, -4,-18, -2, 0,-18, -6,-17,-12, 9, -6, -5, -8, 1, -5,-17,-27,-15, -6; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='T'; M= -1, -2, -8, -6, -6,-15,-15,-13,-10, -3,-10, -8, -1, -4, -7, -7, -1, 4, -8,-24,-13, -7; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='G'; M= 1, 0,-23, 2, -1,-24, 5, -8,-22, -4,-20,-13, 0, 5, 0, -5, 0, -8,-20,-21,-18, -2; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='D'; M= -5, 4,-13, 6, 3,-11, -6, -4,-13, -2, -9, -9, 1, -8, -1, -1, 3, 2, -9,-16, -6, 0; D=-2; /I: I=-2; MD=-11; /M: SY='K'; M= 1, -4,-13, -4, 3,-13, -5, -7,-10, 4,-10, -5, -3, -8, 2, 3, 0, -3, -5,-15, -9, 2; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11; /M: SY='Y'; M= -1, -2,-15, -1, 0, -7,-10, -2, -9, -2, -9, -7, -4, 1, -2, -3, -2, -2, -9, -8, 2, -2; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='D'; M= -1, 6,-20, 12, 7,-21, -8, -9,-15, -5,-12,-12, -2, -6, -2,-10, -2, -6,-10,-25,-15, 2; D=-2; /I: I=-2; DM=-11; /M: SY='E'; M=-11, -5,-29, -3, 19,-20,-24, -1,-11, 3, -7, -2, -7,-12, 19, 3, -8,-10,-17,-20, -5, 18; /M: SY='P'; M= -1,-10,-30, -6, 3,-27,-15,-15,-22, 2,-25,-17,-10, 38, -3, -3, -3, -6,-22,-27,-23, -3; /M: SY='F'; M=-18,-25,-17,-31,-22, 43,-29,-11, -2,-22, 2, -3,-21,-28,-25,-18,-20,-12, -5, 19, 33,-22; /M: SY='G'; M= 13,-10,-22,-13,-15,-24, 37,-17,-25,-16,-20,-10, -3,-16,-14,-18, 5,-10,-17,-22,-24,-15; /M: SY='E'; M=-10, 0,-27, -1, 9, -9,-18, -6,-21, 8,-19,-13, 1,-10, 1, 3, -6, -8,-20,-12, -4, 6; /M: SY='E'; M= -5, 3,-29, 8, 29,-28,-17, -6,-27, 14,-22,-16, -3, -2, 12, 6, -3,-10,-24,-20,-16, 20; /M: SY='A'; M= 40, -7,-10,-15, -7,-20, 0,-17,-13,-10,-15,-13, -5,-10, -7,-17, 18, 5, -3,-25,-20, -7; /M: SY='R'; M= -2, -6,-21, -8, -1,-19,-15,-10,-21, 15,-18,-10, -1,-14, 2, 23, 4, 5,-12,-25,-12, -1; /M: SY='E'; M= -7, 7,-25, 11, 16,-16,-17, -2,-20, -2,-14,-13, 2,-11, 4, -7, -1, -7,-18,-26,-10, 10; /M: SY='F'; M=-11,-23,-22,-30,-20, 42,-24,-13, -6,-17, 1, -2,-16,-25,-24, -8,-15, -8, -5, 8, 21,-20; /M: SY='L'; M= 2,-19,-16,-23,-16, 0,-22,-19, 8,-21, 24, 9,-19,-21,-15,-17,-10, 7, 6,-23, -6,-15; /M: SY='R'; M= -8, -1,-27, 0, 11,-24,-19, -7,-22, 20,-17,-10, -2,-13, 8, 21, -6, -8,-17,-23,-12, 8; /M: SY='K'; M= -2, 5,-23, 6, 11,-27,-10, -7,-26, 16,-26,-15, 5,-10, 7, 8, 6, -1,-19,-28,-16, 9; /M: SY='L'; M=-13,-17,-24,-18, -8, -2,-25, -4, -3, -2, 11, 8,-14,-23, -6, 7,-18,-10, -4,-20, -1, -8; /M: SY='L'; M= -7,-29,-18,-30,-23, 6,-31,-24, 25,-27, 34, 16,-28,-28,-22,-21,-22, -5, 23,-23, -3,-23; /M: SY='L'; M= -5,-15,-20,-18,-12, 0,-22,-16, 4,-16, 7, 1,-11,-15,-14,-14, -7, 0, 2,-22, -4,-13; /M: SY='G'; M= -3, -1,-28, -5, -5,-28, 17, -8,-23, -6,-23,-12, 7,-12, 5, -4, 0,-11,-24,-24,-20, -1; /I: I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32; /M: SY='R'; M=-11, 0,-27, 1, 8,-28,-17, 1,-28, 26,-25,-10, 3,-13, 16, 29, -1, -6,-21,-24,-10, 10; /M: SY='E'; M=-12, 3,-22, 5, 13,-15,-20, -5,-25, 10,-20,-14, 0, -6, 1, 4, -5, -5,-20,-24,-10, 7; /M: SY='V'; M= -1,-26,-12,-28,-27, -1,-29,-28, 26,-20, 9, 8,-25,-26,-26,-19, -7, 6, 40,-29, -9,-27; /M: SY='Q'; M=-11, -9,-20,-11, 0,-17,-22, -9,-14, -1,-10, -6, -7,-17, 9, 6, -7, -2,-16, -7, -7, 4; /M: SY='V'; M= -7,-29, -9,-33,-28, 8,-33,-27, 27,-26, 17, 11,-26,-28,-27,-23,-17, -6, 30,-23, -3,-28; /M: SY='E'; M= -2, -5,-24, -5, 9,-18,-20,-10,-11, -1,-12, -8, -7,-12, 1, -7, -2, 0, -8,-16,-10, 5; /M: SY='F'; M=-11,-22,-25,-23,-15, 7,-22,-15, 4,-15, 3, 1,-18,-13,-17,-11,-15, -9, 4,-13, 4,-18; /M: SY='D'; M=-10, 8,-29, 16, 14,-19,-13, -8,-24, 0,-15,-16, -2,-13, -1, -7, -8,-11,-21,-13, -9, 7; /I: I=-3; MD=-16; /M: SY='N'; M= -7, 3,-21, 1, 1,-13, -3, -2,-21, 2,-20,-13, 9,-15, 1, 4, 4, -3,-18,-20, -5, 0; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='T'; M= -5, -4,-21, -6, 2,-19,-18,-12,-15, 9,-17, -7, -2, -8, 1, 7, 5, 10, -9,-27,-12, 0; /M: SY='D'; M=-11, 32,-18, 41, 9,-29,-12, -4,-30, -4,-24,-23, 13,-13, -4,-11, 2, -3,-22,-33,-13, 2; /M: SY='R'; M=-11, -7,-25, -8, 0,-14,-18, -2,-24, 16,-21,-10, -1,-11, 4, 27, -1, -3,-17,-22, -7, 0; /M: SY='Y'; M=-11, -9,-26,-12,-13, 13,-21, 9, -7, -9, -9, -6, -4,-19, -6, -9, -7, -5,-14, 4, 38,-12; /M: SY='G'; M= -4, -1,-30, 0, -4,-32, 42,-12,-36,-11,-28,-18, 4,-16, -3,-13, 0,-16,-30,-23,-25, -4; /M: SY='R'; M=-18, 0,-28, -4, 0,-20,-16, 1,-28, 25,-22,-12, 12,-20, 8, 54, -6, -8,-22,-24,-12, 0; /M: SY='T'; M= -9, -8,-15,-13, -7, 6,-20,-14,-10,-10, -6, -5, -8,-17,-13,-11, -2, 7, -6,-18, 0, -9; /M: SY='L'; M= -8,-27, -6,-29,-23, 3,-30,-17, 17,-25, 24, 11,-26,-30,-22,-20,-20, -8, 18,-24, -1,-23; /M: SY='G'; M= 18,-10,-22,-14,-15,-25, 36,-19,-28,-13,-21,-15, -4,-16,-14,-14, 3,-11,-18,-20,-25,-15; /M: SY='Y'; M= -2,-10,-21,-13,-10, -6,-19, -7, -8, -6, -9, -4, -9,-18, -3, -4, 0, 7, -5, -6, 9, -8; /M: SY='V'; M= -5,-29,-10,-34,-29, 0,-34,-29, 32,-25, 15, 13,-26,-27,-25,-24,-16, -5, 35,-27, -7,-29; /M: SY='Y'; M=-14,-20,-26,-23,-19, 20,-26, -2, -3,-14, -2, -2,-17,-25,-16,-12,-14, -4, -5, 17, 32,-18; /M: SY='L'; M= -6,-20,-18,-24,-17, 1,-26, -5, 5,-14, 7, 4,-15,-23,-13, -7,-13, -6, 4,-17, 4,-17; /M: SY='G'; M= -5, 1,-29, 2, -1,-27, 9, -4,-28, -6,-27,-17, 4, 2, -4,-10, -1,-11,-27,-21,-18, -4; /M: SY='D'; M= -8, 10,-27, 12, -1,-27, 10,-10,-29, 0,-24,-16, 8,-10, -6, -6, 0, -7,-23,-28,-20, -4; /M: SY='G'; M= -5, 2,-27, 2, 4,-26, 5, -8,-25, -2,-22,-14, 3,-14, 5, -2, 0, -8,-23,-18,-16, 4; /I: I=-4; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18; /M: SY='N'; M=-10, 29,-21, 21, 1,-19, -5, 4,-19, -3,-24,-13, 35,-17, -1, -5, 7, -1,-23,-36,-16, 0; /M: SY='I'; M= -9,-30,-21,-35,-28, 15,-34,-27, 30,-27, 21, 14,-25,-26,-26,-24,-19, -7, 27,-18, 2,-28; /M: SY='N'; M= 11, 10,-18, 0, -6,-22, 10, -7,-20, -7,-23,-16, 21,-15, -5,-10, 12, 1,-18,-30,-21, -5; /M: SY='E'; M= -6, -5,-24, -1, 23,-19,-22, -9,-12, 1, -4, -7,-10,-12, 5, -1, -7, -8,-10,-26,-14, 14; /M: SY='A'; M= 2, -9,-24,-10, 2,-15, -3,-13,-16, -5,-11, -7, -8,-14, -4, -9, -2, -7,-13,-14,-12, -1; /M: SY='L'; M= -7,-27,-20,-30,-20, 6,-26,-15, 19,-24, 40, 29,-27,-27,-15,-18,-26,-10, 10,-20, -1,-17; /M: SY='V'; M= 0,-29,-15,-31,-27, 1,-29,-27, 28,-23, 18, 12,-27,-27,-25,-22,-14, -3, 36,-26, -7,-27; /M: SY='K'; M= 0, -1,-25, 0, 15,-26,-15, -4,-26, 20,-23,-13, 0, -9, 9, 14, 2, -5,-18,-25,-14, 11; /M: SY='E'; M= -6, 9,-26, 10, 24,-25,-14, 5,-24, 7,-22,-14, 9,-10, 14, 3, 2, -6,-24,-27,-12, 18; /M: SY='G'; M= 2,-10,-29,-10,-20,-30, 67,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-19,-29,-20,-30,-20; /M: SY='L'; M=-10,-21,-22,-24,-18, 10,-25, -4, 10,-22, 27, 16,-19,-27,-14,-15,-22,-10, 2,-14, 11,-17; /M: SY='A'; M= 40,-11,-10,-19,-11,-17, -3,-20, -7,-12, -8, -8,-10,-12,-11,-19, 10, 1, 2,-23,-18,-11; /M: SY='R'; M=-11,-16,-27,-17, -8,-10,-21,-15,-11, 3, -9, -3,-15,-15, -6, 6,-13, -6, -8, 5, -3, -7; /M: SY='V'; M= 7,-16, -3,-18,-17,-12,-20,-19, 1,-14, -4, -3,-17,-17,-18,-15, -4, -2, 14,-29,-15,-18; /M: SY='Y'; M=-12,-12,-26,-11, -8, -3,-25, 6, -5, -1, -7, -2,-10,-21, -5, 3,-12, -9, -3,-10, 18,-10; /M: SY='R'; M=-12, -3,-25, -2, 1, -1,-21, -3,-15, -2,-11, -9, -4,-17, -4, 2, -7, -7,-11,-18, 0, -2; /M: SY='Y'; M= -8,-13,-26,-16,-13, -7, -4, -6,-15, -9,-14, -8, -9,-20, -6, -4, -5, -3,-13, 1, 5,-11; /M: SY='R'; M= -8, -2,-26, -4, -4,-12,-15, 2,-19, 7,-18, -9, 1,-14, 0, 10, -4, -6,-17,-10, 4, -4; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='E'; M= -6, -3,-25, 0, 7,-18,-13,-11,-12, -3,-14,-10, -4, -1, -2, -6, -3, -7,-11,-25,-15, 1; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='K'; M= -2, 1,-21, 0, 0,-15, -7, -8,-17, 3,-17,-12, 3, -3, -4, 3, -2, -6,-14,-21,-13, -3; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='D'; M= -7, 12,-19, 15, 3,-18,-10, -3,-16, -3,-14,-12, 7, -9, 0, -3, 2, -1,-13,-24, -9, 1; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='N'; M= -8, 1,-11, -1, 2, -2,-10, -5,-13, -3,-10, -9, 3,-13, -5, -5, -3, -5,-13,-16, -3, -1; D=-2; /I: I=-2; MD=-13; /M: SY='Q'; M= -4, -2,-11, -3, 1, -8,-10, -4, -6, -2, -7, -3, -1, -3, 5, -3, 1, 4, -6,-13, -5, 3; D=-2; /I: I=-2; MI=0; MD=-13; IM=0; DM=-13; /M: SY='H'; M= -9, -6,-24, -6, -5, -9,-13, 10,-12, -8, -8, -5, -4,-20, -6, -6, -7, -6,-10,-18, 7, -7; /M: SY='Y'; M= -6, -2,-26, 0, 0,-14,-15, -3,-14, 1,-14, -9, -5,-17, 1, -1, -5, -8,-12,-14, 6, -1; /M: SY='D'; M= -8, 8,-27, 9, 6,-26,-11, -7,-18, -2,-20,-13, 7, 2, 4, -7, 0, -3,-20,-29,-17, 4; /M: SY='E'; M= -7, -1,-26, 1, 14,-22,-20, -3,-17, 8,-13, -8, -3,-12, 9, 6, -4, -5,-15,-26,-11, 11; /M: SY='L'; M=-13,-27,-23,-29,-22, 19,-30, -9, 16,-24, 30, 16,-25,-29,-18,-18,-25,-10, 6, -5, 23,-21; /M: SY='L'; M= -3,-13,-22,-14, -4, -9,-19,-10, -5, -8, 8, 0,-10,-16, -4, 1,-10, -6, -7,-22, -7, -5; /M: SY='N'; M= 3, 6,-20, 3, 7,-22,-11, -4,-18, 2,-20,-13, 8,-12, 6, -2, 8, 2,-15,-27,-13, 6; /M: SY='A'; M= 24,-14, -9,-21,-14,-11, -6,-18, -8,-15, -4, -7,-13,-17,-13,-19, 1, -1, -1,-14, -9,-14; /M: SY='E'; M=-10, 3,-29, 9, 39,-30,-21, 1,-21, 6,-15,-10, -3, -6, 28, 1, -2,-10,-24,-26,-15, 34; /M: SY='E'; M= -2, 4,-25, 3, 19,-22,-14, -3,-23, 11,-20,-13, 6,-10, 11, 9, 0, -7,-21,-25,-15, 15; /M: SY='Q'; M= -3, 2,-22, -1, 10,-19,-16, -4,-16, 3,-15, -9, 4,-13, 12, 1, 2, -2,-16,-26,-12, 11; /M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20, 0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10, 0, 0,-20,-20,-10; /M: SY='K'; M=-13, -5,-29, -5, 7,-21,-21, -6,-24, 31,-22, -8, -2,-13, 12, 30, -9,-10,-18,-19, -8, 9; /M: SY='K'; M= 1, 2,-23, 1, 11,-27, -9, -7,-25, 16,-25,-14, 4,-10, 10, 8, 6, -2,-19,-27,-16, 10; /M: SY='N'; M= 4, 6,-22, 1, 3,-24, -6, -6,-21, 9,-21,-12, 10,-14, 4, 6, 2, -5,-18,-26,-16, 3; /M: SY='R'; M=-12, -6,-30, -6, 1,-27, -3, -6,-31, 26,-25,-11, 0,-16, 8, 35, -7,-12,-23,-20,-14, 3; /M: SY='K'; M= -6,-13,-24,-13, -3,-14,-23,-15, -7, 12, -1, 0,-12,-18, -4, 8,-14, -8, -2,-22, -8, -4; /M: SY='G'; M= -6, 7,-27, 0,-10,-26, 34, -8,-32, -5,-29,-19, 19,-20, -9, -2, 2,-12,-29,-26,-24,-10; /M: SY='I'; M=-10,-28,-24,-33,-23, 3,-33,-23, 31,-25, 30, 20,-24,-24,-18,-21,-23,-10, 19,-20, -1,-23; /M: SY='W'; M=-20,-37,-46,-38,-29, 16,-21,-24,-18,-21,-17,-17,-36,-30,-21,-19,-37,-27,-27,128, 30,-20; /M: SY='S'; M= 7, 1,-18, -3, 3,-21, -8, -8,-18, 2,-21,-14, 8,-12, 1, 5, 13, 3,-13,-30,-17, 1; /M: SY='D'; M= -9, 10,-26, 14, 8,-17,-14, 5,-23, 0,-21,-16, 5,-15, 3, -3, 0, -6,-21,-15, 2, 5; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 128 in 98 different sequences |
| Number of true positive hits | 128 in 98 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 0 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 100.00 % |
Comments [info]
| Taxonomic range [info] | Archaea, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 4 |
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | TNase-like |
| Version [info] | 5 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
98 sequences
CAN1_ARATH (F4IZC5), CAN1_ORYSJ (Q942N7), CAN2_ARATH (F4IH31), CAN2_ORYSJ (Q2RBJ2), CAN3_ORYSJ (Q2QYR1), CAN4_ORYSJ (Q2QUS0), EXOI_RHIME (Q52928), HTP3_SAPPC (A0A067CMC7), LCL3_AJEDR (C5GB89), LCL3_ARTGP (E4V094), LCL3_ARTOC (C5FTB4), LCL3_ASPCL (A1CRW4), LCL3_ASPFC (B0XMZ5), LCL3_ASPFN (B8MY73), LCL3_ASPFU (Q4WK77), LCL3_ASPNC (A2Q8K8), LCL3_ASPOR (Q2URN2), LCL3_ASPTN (Q0CUT8), LCL3_BOTFB (A6RP27), LCL3_CANAL (Q5AKW3), LCL3_CANAW (C4YFU9), LCL3_CANDC (B9W9Z5), LCL3_CANGA (Q6FS62), LCL3_CANTT (C5MC60), LCL3_CLAL4 (C4Y4X4), LCL3_COCP7 (C5P0Z4), LCL3_COLGM (E3QWM6), LCL3_CRYGW (E6R427), LCL3_DEBHA (Q6BSY9), LCL3_EMENI (Q5BGS2), LCL3_EREGS (Q754Z2), LCL3_FUSV7 (C7YQ31), LCL3_KLULA (Q6CMM1), LCL3_KOMPG (C4QW04), LCL3_LACBS (B0D7T0), LCL3_LACTC (C5E2G4), LCL3_LEPMJ (E4ZVE5), LCL3_LODEL (A5E1Q5), LCL3_NAKDE (Q874L8), LCL3_NEOFI (A1D4S1), LCL3_PARBA (C1H492), LCL3_PARBD (C1GKM1), LCL3_PARBP (C0SEQ8), LCL3_PENRW (B6H1W0), LCL3_PHANO (Q0UVH1), LCL3_PICGU (A5DNZ8), LCL3_PICST (A3GI61), LCL3_PODAN (B2AU25), LCL3_PYRO7 (A4RMK0), LCL3_PYRTR (B2WC78), LCL3_SCHCM (D8QGA7), LCL3_SCHJY (B6JYT1), LCL3_SCHPO (O60168), LCL3_SCLS1 (A7ECE0), LCL3_TALMQ (B6QNP4), LCL3_UNCRE (C4JVW2), LCL3_VANPO (A7TE94), LCL3_VERA1 (C9SI22), LCL3_YARLI (Q6C427), LCL3_YEAS1 (B3LHF1), LCL3_YEAS2 (C7GW31), LCL3_YEAS6 (B5VIN9), LCL3_YEAS7 (A6ZU94), LCL3_YEAS8 (C8Z8G3), LCL3_YEAST (P53153), LCL3_ZYGRC (C5DZY8), NUC_SHIFL (P29769), NUC_STAAC (Q5HHM4), NUC_STAAM (Q99VJ0), NUC_STAAN (Q7A6P2), NUC_STAAR (Q6GIK1), NUC_STAAS (Q6GB41), NUC_STAAU (P00644), NUC_STAAW (Q8NXI6), NUC_STAHY (P43270), NUC_STAIN (P43269), PARB4_ECOLX (P22997), SND1_BOVIN (Q863B3), SND1_DANRE (Q7ZT42), SND1_DROME (Q9W0S7), SND1_HUMAN (Q7KZF4), SND1_MOUSE (Q78PY7), SND1_PONAB (Q5REU4), SND1_RAT(Q66X93), SND1_SCHPO (Q9Y7U7), TSN1_ARATH (Q8VZG7), TSN2_ARATH (Q9FLT0), Y1296_HAEIN (Q57519), Y133_MYCPN (P75265), Y1439_METJA (Q58834), Y186_MYCGE (P47432), Y38K_CAPSE (Q39635), Y6211_BACAN (Q9X397), YFI3_ECO57 (Q7BSX4), YFI3_ECOLX (Q99342), YHCR_BACSU (P54602), YNCB_BACSU (P94492), YOKF_BACSU (O32001)» more
|
| PDB [Detailed view] |
320 PDB
1A2T; 1A2U; 1A3T; 1A3U; 1A3V; 1AEX; 1ENA; 1ENC; 1EQV; 1EY0; 1EY4; 1EY5; 1EY6; 1EY7; 1EY8; 1EY9; 1EYA; 1EYC; 1EYD; 1EZ6; 1EZ8; 1F2M; 1F2Y; 1F2Z; 1IHZ; 1II3; 1JOK; 1JOO; 1JOQ; 1JOR; 1KAA; 1KAB; 1KDA; 1KDB; 1KDC; 1NSN; 1NUC; 1RKN; 1SNC; 1SND; 1SNM; 1SNO; 1SNP; 1SNQ; 1STA; 1STB; 1STG; 1STH; 1STN; 1STY; 1SYB; 1SYC; 1SYD; 1SYE; 1SYF; 1SYG; 1TQO; 1TR5; 1TT2; 1U9R; 2ENB; 2EXZ; 2EY1; 2EY2; 2EY5; 2EY6; 2EYF; 2EYH; 2EYJ; 2EYL; 2EYM; 2EYO; 2EYP; 2F0D; 2F0E; 2F0F; 2F0G; 2F0H; 2F0I; 2F0J; 2F0K; 2F0L; 2F0M; 2F0N; 2F0O; 2F0P; 2F0Q; 2F0S; 2F0T; 2F0U; 2F0V; 2F0W; 2F3V; 2F3W; 2HQE; 2HQX; 2KHS; 2LKV; 2M00; 2NUC; 2O4X; 2OEO; 2OF1; 2OXP; 2PQE; 2PW5; 2PW7; 2PYK; 2PZT; 2PZU; 2PZW; 2QDB; 2RBM; 2RDF; 2RKS; 2SNM; 2SNS; 2SOB; 2WAC; 3BDC; 3BDL; 3C1E; 3C1F; 3D4D; 3D4W; 3D6C; 3D8G; 3DHQ; 3DMU; 3E5S; 3EJI; 3ERO; 3ERQ; 3EVQ; 3H6M; 3HEJ; 3HZX; 3ITP; 3LX0; 3MEH; 3MHB; 3MVV; 3MXP; 3MZ5; 3NHH; 3NK9; 3NP8; 3NQT; 3NUC; 3NXW; 3OMC; 3OMG; 3OSO; 3OWF; 3P1H; 3P75; 3PMF; 3QB3; 3QOJ; 3QOL; 3R3O; 3RUZ; 3S9W; 3SHL; 3SK4; 3SK5; 3SK6; 3SK8; 3SR1; 3SXH; 3T13; 3T16; 3TME; 3TP5; 3TP6; 3TP7; 3TP8; 3U9O; 3V2T; 3VA5; 4DF7; 4DFA; 4DGZ; 4DU9; 4E6I; 4EQN; 4EQO; 4EQP; 4EVO; 4F7X; 4F8M; 4G57; 4H7B; 4HMI; 4HMJ; 4HTH; 4I65; 4IAL; 4ID6; 4IUN; 4IZ8; 4J1M; 4J6H; 4K14; 4K2K; 4K2L; 4K5V; 4K5W; 4K5X; 4K6D; 4K8I; 4K8J; 4KD3; 4KD4; 4KHV; 4KJN; 4KJO; 4KTA; 4KV6; 4KY5; 4KY6; 4KY7; 4LAA; 4ME5; 4MIU; 4N9P; 4N9T; 4NDX; 4NKL; 4NMZ; 4NP5; 4ODG; 4OL7; 4PMB; 4PMC; 4PNY; 4QB4; 4QF4; 4QMG; 4R8N; 4RKB; 4RKL; 4S3S; 4TRD; 4WOR; 4WRD; 4YIJ; 4ZQ3; 4ZUI; 4ZUJ; 5C3W; 5C3X; 5C4H; 5C4Z; 5C5L; 5C5M; 5C6A; 5CC4; 5CGK; 5CR3; 5CV4; 5CV5; 5CV6; 5CV7; 5CV8; 5CV9; 5DAU; 5DEH; 5E1F; 5E3F; 5EGT; 5EKK; 5EKL; 5F2D; 5HGT; 5HUR; 5I6W; 5I6Y; 5I9O; 5I9P; 5IGB; 5IGC; 5IGD; 5IGE; 5IGF; 5IGG; 5IIF; 5IOC; 5IOD; 5ISR; 5J1Z; 5J22; 5JAV; 5JOB; 5K5P; 5KEE; 5KGU; 5KIX; 5KRU; 5KYI; 5KYL; 5M9O; 5NUC; 6AMF; 6B8R; 6EEG; 6EEK; 6OK8; 6U0W; 6U0X; 6XSB; 6XSC; 6XSE; 6XSF; 6XSG; 6XSH; 6XSI; 7KNW; 7KNX; 9C11 » more |