ID   SOHO; MATRIX.
AC   PS50831;
DT   01-SEP-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE.
DE   SoHo domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.8877351; R2=0.0100598; TEXT='NScore';
MA   /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=4033.5085449; R2=13.5415220; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 0.5%';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=658; H_SCORE=12944; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=459; H_SCORE=10249; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-2,-17,5,-12,-14,-23,-19,5,-13,-4,-4,-12,-23,-19,-16,-6,-4,22,-34,-14,-16;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-23,-22,-16,-11,-30,-23,15,2,-1,6,-16,-20,-13,-5,-13,-7,19,-23,-7,-16;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-7,-30,-7,3,-23,-20,-3,-30,36,-23,-10,0,-17,10,58,-10,-10,-20,-20,-10,3;
MA   /M: SY='W'; M=12,-17,-24,-20,-14,-9,-7,-20,-17,-14,-20,-17,-14,-17,-10,-17,2,-4,-14,34,-2,-10;
MA   /M: SY='A'; M=14,-20,-19,-20,-14,-16,-17,-24,1,-14,-9,-6,-20,14,-17,-20,-3,-3,8,-27,-20,-17;
MA   /M: SY='H'; M=-13,0,-30,0,10,-30,-20,31,-27,18,-24,-4,3,-13,27,14,-7,-13,-26,-23,-1,17;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,3,-30,10,-7,7,-23,13,-13,-7,-10,-10,-7,-23,-7,-10,-13,-10,-17,7,47,-10;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-13,-30,-6,15,-17,-23,-13,-10,-10,0,-7,-16,18,-3,-13,-13,-10,-17,-27,-16,4;
MA   /M: SY='G'; M=3,-7,-23,-7,-13,-27,47,-17,-33,-17,-30,-20,3,-17,-13,-17,13,-7,-23,-27,-27,-13;
MA   /M: SY='I'; M=-13,-3,-30,-3,-13,-13,-30,-20,20,-20,3,3,-7,-17,-13,-23,-13,-10,10,-27,-7,-17;
MA   /M: SY='G'; M=0,-17,-23,-17,-23,-20,37,-23,-17,-20,-17,-10,-10,-23,-23,-20,-3,-13,-3,-23,-23,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,57,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-23,-23,-3,-27,-27,17,-17,3,3,-20,-23,-23,-17,0,17,33,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='E'; M=-10,10,-30,20,60,-30,-20,0,-30,10,-20,-20,0,0,20,0,0,-10,-30,-30,-20,40;
MA   /M: SY='S'; M=7,-10,-10,-10,-10,-13,-10,-17,-3,-13,-17,-10,-3,-17,-10,-13,23,13,10,-37,-17,-10;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-26,-26,-36,-26,0,-33,-19,39,-23,20,34,-20,-20,-13,-23,-20,-10,23,-20,0,-23;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20,90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='I'; M=-7,-21,-20,-27,-20,0,-30,-24,21,-24,21,11,-17,-20,-17,-20,-11,9,14,-23,-3,-20;
MA   /M: SY='A'; M=27,-10,-17,-17,-7,-20,-7,-13,-17,3,-13,-10,-7,-13,-3,10,3,-3,-7,-20,-17,-7;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-3,-30,-9,-9,-17,-20,-13,2,-13,-14,-8,7,19,-10,-16,-6,-7,-11,-30,-17,-13;
MA   /I: I=-13; MD=-27;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-7,-20,-7,0,-13,-13,0,-20,20,-13,-7,0,-13,7,47,-7,-7,-13,-13,-7,0; D=-13;
MA   /I: I=-13; MI=-27; MD=-27; IM=-27; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-7,-3,-3,-10,-6,-10,-10,-7,-14,-10,4,-7,-3,-7,20,23,-4,-24,-10,-3; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='T'; M=4,0,-7,-3,-3,-10,-6,-10,-10,-7,-14,-10,4,-7,-3,-7,20,23,-4,-24,-10,-3; D=-13;
MA   /I: I=-13; DM=-27;
MA   /M: SY='V'; M=0,-20,-10,-23,-23,-3,-27,-27,17,-17,3,3,-20,-23,-23,-17,0,17,33,-30,-10,-23;
MA   /M: SY='D'; M=-17,37,-30,53,33,-37,-13,0,-37,3,-27,-27,13,-7,7,-7,0,-10,-30,-37,-20,20;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-23,-6,0,-20,-13,-4,-26,16,-24,-14,4,-16,6,42,8,1,-16,-27,-14,0;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-13,-30,-7,0,-27,-13,-17,-20,-10,-30,-20,-10,57,-7,-17,7,0,-23,-33,-27,-7;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20;
MA   /M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20,30,-30,20,0,-10,0,0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10,30,80,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-4,-30,-4,6,-26,-20,-6,-30,43,-26,-10,0,-14,10,44,-10,-10,-20,-20,-10,6;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-4,-17,-10,-6,-14,-20,-13,-17,4,-14,-10,0,-14,-3,18,9,29,-7,-26,-10,-6;
MA   /M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,0,-20,0,20,-10,20,60,-20,-20,0,-10,-20,-10,10,-20,0,-10;
MA   /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30;
MA   /M: SY='K'; M=-10,0,-30,0,14,-34,-20,-3,-26,36,-26,-6,0,-10,28,23,-6,-10,-24,-20,-10,21;
MA   /M: SY='Q'; M=-10,0,-30,0,20,-40,-20,10,-20,10,-20,0,0,-10,60,10,0,-10,-30,-20,-10,40;
MA   /M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,0,-40,-30,50,-30,20,20,-20,-20,-20,-30,-20,-10,30,-20,0,-30;
MA   /M: SY='H'; M=-20,0,-30,0,0,-20,-20,100,-30,-10,-20,0,10,-20,10,0,-10,-20,-30,-30,20,0;
MA   /M: SY='R'; M=-14,-10,-27,-13,-3,-17,-20,-3,-14,24,-11,12,-6,-17,7,32,-13,-10,-11,-20,-7,0;
MA   /M: SY='V'; M=-7,-19,-20,-19,-12,-7,-26,-20,5,1,9,6,-19,-23,-12,-2,-17,-7,12,-23,-7,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-13,6,-23,-4,-7,-13,-13,34,-9,-7,-9,15,16,-20,3,-4,-7,-10,-16,-30,0,-4;
MA   /M: SY='R'; M=-13,-10,-34,-7,3,-27,-20,-10,-26,22,-27,-14,-7,22,3,26,-10,-10,-24,-24,-17,0;
MA   /I: I=-9; MD=-19;
MA   /M: SY='P'; M=-10,11,-23,22,7,-24,-10,-6,-20,-3,-20,-17,1,24,-3,-10,-3,-7,-20,-24,-16,0; D=-9;
MA   /I: I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
MA   /M: SY='D'; M=-16,36,-30,52,34,-36,-14,0,-36,4,-26,-26,13,-6,7,-6,0,-10,-30,-36,-20,21;
MA   /M: SY='D'; M=-20,50,-30,70,20,-40,-10,0,-40,0,-30,-30,20,-10,0,-10,0,-10,-30,-40,-20,10;
MA   /M: SY='D'; M=-16,25,-34,42,13,-36,-14,-7,-33,-4,-30,-26,6,25,-4,-14,-4,-10,-30,-36,-24,3;
MA   /M: SY='P'; M=0,-7,-21,-7,-3,-20,-13,-17,-17,-10,-24,-17,-4,25,-7,-14,16,19,-14,-33,-20,-7;
MA   /M: SY='D'; M=-16,32,-30,45,16,-36,-14,-4,-36,18,-30,-23,13,-10,4,4,-4,-10,-26,-33,-16,10;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-27,-13,-30,-27,0,-27,-21,27,-17,13,26,-27,-27,-21,-17,-13,-3,38,-27,-7,-24;
MA   /M: SY='H'; M=-13,-17,-23,-17,-17,3,-27,29,1,-14,-3,4,-14,-27,-10,-10,-13,-10,5,-11,28,-17;
MA   /M: SY='S'; M=4,12,-13,6,0,-20,0,-4,-20,-7,-30,-20,26,-13,0,-7,31,14,-16,-40,-20,0;
MA   /M: SY='P'; M=14,-10,-20,-14,-7,-20,-13,-20,-13,-10,-17,-13,-10,23,-10,-17,6,12,-10,-26,-20,-10;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-13,-33,-10,0,-23,-20,-6,-27,18,-23,-13,-6,14,4,42,-10,-10,-23,-23,-16,-3;
MA   /M: SY='Y'; M=5,-16,-23,-20,-16,12,-19,6,-4,-10,-4,-4,-16,-23,-10,-14,-9,-6,-6,12,45,-16;
MA   /M: SY='S'; M=7,0,-10,-3,-3,-17,-6,-13,-17,-10,-24,-17,7,-10,-3,-10,34,29,-7,-37,-17,-3;
MA   /M: SY='F'; M=-9,-16,-20,-20,-16,29,-19,-4,-7,-17,-7,-7,-9,-23,-16,-13,1,1,-7,-1,28,-16;
MA   /M: SY='S'; M=18,9,-13,-1,-4,-20,0,-7,-16,-7,-23,-16,18,-13,-4,-10,20,7,-13,-33,-20,-4;
MA   /M: SY='E'; M=5,17,-24,24,25,-30,-10,-6,-27,0,-20,-20,4,-6,4,-10,3,-7,-21,-30,-20,14;
MA   /M: SY='P'; M=-10,7,-34,17,0,-33,11,-13,-33,-10,-30,-23,0,22,-10,-17,-4,-13,-30,-30,-27,-6;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=2024_02,571282;
NR   /TOTAL=8(8); /POSITIVE=8(8); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0);
NR   /FALSE_NEG=1; /PARTIAL=1;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /AUTHOR=CJA_Sigrist;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=1;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=SoHo;
CC   /VERSION=5;
DR   Q9BX66    , SRBS1_HUMAN, T; Q62417    , SRBS1_MOUSE, T;
DR   O94875    , SRBS2_HUMAN, T; Q3UTJ2    , SRBS2_MOUSE, T;
DR   P28220    , SRBS2_PIG  , T; O35413    , SRBS2_RAT  , T;
DR   O60504    , VINEX_HUMAN, T; Q9R1Z8    , VINEX_MOUSE, T;
DR   P84109    , SRBS1_RAT  , P;
DR   G5EC32    , SRBS1_CAEEL, N;
PR   PRU00195;
DO   PDOC50831;
//