Entry: PS50842

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] EXPANSIN_EG45
Accession [info] PS50842
Entry type [info] MATRIX
Date [info] JAN-2002 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUN-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50842
Associated ProRule [info] PRU00079

Name and characterization of the entry

Description [info] Expansin, family-45 endoglucanase-like domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=111;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=106;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.1849; R2=0.00980635; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=-2374.42750; R2=34.65750; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=745; N_SCORE=8.5; H_SCORE=19945; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=542; N_SCORE=6.5; H_SCORE=16410; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='G'; M=  4, -6,-26, -8,-16,-28, 55,-17,-35,-17,-29,-19,  4,-18,-16,-18,  5,-14,-26,-23,-28,-16;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 40, -8,-12,-16, -8,-20, -2,-10,-13,-10,-13,-10, -6,-11, -7,-17, 12,  1, -4,-23,-17, -8;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M=  4,-10,-28,-11,-19,-29, 64,-20,-37,-19,-28,-19, -1,-19,-19,-20,  1,-18,-27,-20,-29,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-21,-29,-21,-21, 34,-30, 17,  0,-11,  1,  0,-20,-30,-12,-11,-20,-10, -9, 29, 76,-21;
/M: SY='G'; M= -3, -5,-29, -5,-12,-30, 45,-16,-36, -7,-29,-18,  1,-17,-10,-11,  0,-14,-27,-21,-25,-11;
/M: SY='N'; M= -9, 26,-23, 25,  9,-26, -7, -1,-25, -2,-28,-22, 27, -4,  0, -6, 11,  2,-25,-38,-20,  4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='L'; M= -2,-24,-17,-27,-21,  5,-24,-20, 14,-20, 19, 15,-23,-20,-19,-18,-15, -2, 15,-21, -4,-20;
/M: SY='A'; M=  5, -3,-21, -5, -7,-11, -8, -7,-11, -7,-11, -9, -5,-18, -9,-10, -2, -6, -5,-16,  1, -9;
/M: SY='K'; M= -2,  4,-23,  1,  2,-25, -8, -1,-24, 10,-23,-12,  8,-13,  8, 10,  4, -1,-19,-26,-13,  4;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='S'; M=  6, -2,-21, -2,  1,-22,-10,  0,-19, -3,-21,-12, -1, -2,  6, -8,  9, -1,-16,-25, -9,  2;
/M: SY='P'; M= -9,-18,-32,-16,-12,-10,  1,-19,-17,-15,-19,-13,-12, 24,-17,-16, -7,-11,-19,-20,-17,-16;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='F'; M=-18,-16,-23,-24,-21, 42,-26, -2, -1,-19,  5, -1, -9,-29,-22,-14,-17, -9, -7,  6, 36,-21;
/M: SY='G'; M=  3, -2,-22, -7,-10,-19, 17, -3,-22, -9,-21,-10,  7,-18, -7, -7,  5, -7,-18,-24,-14,-10;
/M: SY='G'; M=  6, -9,-12,-12,-13,-22, 20,-18,-25,-10,-20,-14, -3,-17,-13,-13,  5, -3,-15,-26,-22,-13;
/M: SY='H'; M=-10, -4,-23, -8, -1,-11,-16, 19, -8, -5, -6, 15,  0,-17,  4, -2, -4, -7,-11,-25,  0,  0;
/M: SY='V'; M= -2,-16,-14,-21,-20, -4,-25,-23, 15,-17,  4,  3,-13,-21,-19,-17,  0, 15, 23,-29, -9,-20;
/M: SY='A'; M= 28, -6,-12,-12, -8,-20,  6,-17,-16,-11,-18,-14, -2,-11, -8,-16, 19,  8, -6,-27,-20, -8;
/M: SY='A'; M= 29,-10,  3,-19,-14,-21,  6,-21,-18,-14,-15,-13, -9,-16,-14,-20,  7,  0, -6,-25,-22,-14;
/M: SY='A'; M= 11,-18,-19,-21,-18,-13, 11,-21, -7,-20,  2, -3,-15,-21,-18,-20, -7, -9, -1,-21,-17,-18;
/M: SY='S'; M=  3,  2,-18, -2, -7,-21, 14,-11,-19,-12,-26,-17, 14,-15, -6,-12, 20,  4,-15,-34,-21, -7;
/M: SY='P'; M= -6,-12,-29, -9, -2,-21,-10,-18,-20,-10,-24,-18,-11, 32, -9,-15,  1,  5,-21,-17,-19, -7;
/M: SY='S'; M=  6, -9,-20, -9, -2,-20,-12,-15,-13,  0,-19,-12, -5,  0, -4, -3,  9,  2, -6,-29,-17, -4;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,  8,-32,-22, 27,-30, 43, 20,-28,-28,-20,-22,-28,-10, 15,-20,  0,-22;
/M: SY='F'; M=-20,-28,-25,-35,-27, 62,-29,-10, -1,-24,  5, -1,-21,-30,-31,-17,-21,-11, -5, 25, 43,-27;
/M: SY='K'; M=-11,  8,-27,  4,  7,-26,-10, -2,-27, 23,-27,-13, 16,-14,  9, 23, -1, -7,-24,-26,-14,  7;
/M: SY='D'; M=-13, 31,-25, 34,  7,-26, -3, -1,-31,  0,-28,-23, 24,-14, -2, -3,  4, -6,-26,-35,-17,  3;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='K'; M=  2, -2,-22, -3,  5,-24,-16,-10,-19, 17,-18, -8, -3,-11,  5,  9, -1, -2,-11,-24,-13,  5;
/M: SY='G'; M=  1,-10,-26,-11,-17,-25, 47,-18,-29,-18,-25,-14,  0,-18,-15,-18,  5,-12,-21,-24,-25,-16;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='A'; M= 39, -9,-11,-17,-10,-19,  1,-19,-11,-11,-12,-11, -8,-11,-10,-18, 12,  4,  0,-23,-19,-10;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/M: SY='Y'; M=-20,-23,-27,-26,-23, 44,-30,  6,  1,-17,  5,  1,-20,-30,-19,-13,-20,-10, -6, 22, 62,-23;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-28,  2, 25,-32,-20,  3,-21, 10,-16, -5, -1, -9, 37, 10, -2, -7,-25,-23,-12, 31;
/M: SY='V'; M= -4,-30,-17,-33,-29,  1,-33,-29, 35,-24, 17, 14,-27,-27,-26,-23,-15, -4, 39,-26, -6,-29;
/M: SY='R'; M=-14, -7,-27, -8,  1,-21,-20, -6,-25, 30,-21, -9, -1,-16,  6, 46, -7, -3,-15,-21,-10,  1;
/M: SY='C'; M=-10,-20,120,-30,-30,-20,-30,-30,-30,-30,-20,-20,-20,-40,-30,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-30;
/I:         I=-5; MD=-25;
/M: SY='T'; M= -4,  1,-18, -1, -4,-16,-19,-15,-10,  2,-10, -7, -3,-13, -7, -4,  2, 13, -2,-26,-10, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-27, 23,  6,-29, -1, -1,-26,  0,-25,-18, 14,-13, -2, -6,  1, -9,-22,-32,-17,  1;
/M: SY='P'; M= -9, -9,-31, -7, -3,-23,-13, -3,-18, -6,-22,-13, -4, 31, -6,-11, -5, -6,-22,-29,-17, -8;
/M: SY='R'; M= -2, -6,-26, -4,  6,-26,-14, -8,-23, 11,-25,-14, -2,  7,  7, 12,  4, -3,-19,-27,-17,  5;
/M: SY='W'; M= -1,-23,-16,-27,-19, -2,-20,-13, -2,-20,  6,  1,-22,-24,-14,-19,-17,-12, -5, 15,  1,-16;
/M: SY='C'; M= -9,-19,111,-28,-28,-20,-28,-29,-29,-29,-21,-20,-18,-38,-28,-29, -7, -8,-10,-49,-29,-28;
/M: SY='S'; M=  0,  0,-16, -4, -6,-16, -5, -7,-14, -9,-17,-12,  9,-15, -5, -9, 17, 12,-10,-33,-14, -6;
/M: SY='K'; M= -3, -2,-25, -3,  3,-27,  2, -9,-26,  8,-25,-14,  3, -8,  5,  5,  4, -4,-21,-25,-18,  4;
/M: SY='G'; M= -2, -2,-26, -2,  4,-27, 10,-11,-29,  5,-26,-17,  2, -6, -1,  2,  3, -8,-23,-26,-21,  0;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='P'; M=  4, -8,-23, -8, -6,-24,  8,-17,-23, -9,-26,-17, -3, 12, -9,-13, 10,  3,-18,-28,-23, -9;
/M: SY='V'; M= -3,-28,-15,-31,-28, -1,-32,-29, 32,-22, 11, 11,-25,-26,-26,-22,-10,  1, 41,-27, -7,-28;
/M: SY='T'; M= -5,-12,-19,-18,-14, -6,-26,-19,  5, -7, -2,  0,-10,-16,-11, -9, -1, 17,  8,-22, -1,-14;
/M: SY='V'; M= -2,-30,-14,-32,-30,  0,-32,-30, 34,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 46,-28, -8,-30;
/M: SY='T'; M= -1,-12,-12,-19,-17, -6,-22,-20,  7,-13,  0,  6,-11,-17,-14,-13,  6, 25, 15,-29, -9,-15;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='V'; M= 12,-11,-18,-15,-15,-12,-18,-21, 11,-16,  0,  0,-12,-16,-14,-20, -4, -4, 13,-23,-11,-16; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='T'; M= -1,  2,-11, -5, -7,-11,-17,-16,-10, -9,-10, -7,  1,-10, -7, -9, 16, 37, -2,-29,-10, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='D'; M=-13, 38,-24, 40,  8,-29,  2,  2,-30, -2,-28,-24, 31,-14, -2, -7,  4, -7,-28,-36,-20,  3; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='E'; M=-10,-10,-22,-10,  7,  7,-21, -5, -7, -9,  0,  0,-10,-16, -5, -9, -7, -6, -9,-13,  6,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='C'; M= -8,-10, 60,-16,-16,-17,-15,-17,-25,-19,-20,-17, -7,-29,-18,-20, -3, -7,-14,-37,-19,-17; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -6,-15,-32,-10,  0,-23,-20,-18,-12,-10,-20,-14,-15, 55, -8,-17, -6, -4,-19,-27,-23, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='G'; M= -1, -6,-22, -4, -8,-20,  9,-16,-15,-12,-18,-12, -5,  6,-11,-15,  1, -5,-12,-23,-19,-11; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='G'; M= -2,  2,-16,  1, -4,-17, 20, -7,-19, -7,-15,-10,  4,-10, -3, -7,  2, -5,-15,-14,-13, -4; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='G'; M= -2,  0,-16,  2, -3,-17, 22, -9,-20, -8,-15,-12,  1, -9, -7, -9,  2, -5,-15,-14,-15, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='W'; M= -6,-10,-20,-10, -9,  1,-11, -7, -9, -9, -9, -8,-11, -8, -9,-10,-11,-10,-10, 26,  5, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='C'; M= -8,-16, 63,-23,-21,-12,-23,-21,-14,-20, -7, -9,-15,-28,-19,-16,-10, -8, -4,-33,-18,-21; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='N'; M= -1,  3,-13, -4, -7,-10, -9, -7, -4, -9, -7, -6,  9,-11, -8, -8,  4,  4, -3,-26,-12, -8; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -4, -7,-19, -7, -3,-10,-13,-11,-11, -1,-11, -8, -4,  8, -5, -5,  0,  1,-11,-21,-11, -5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='P'; M=  0, -1,-25,  2, 11,-24,-12,-11,-19, -4,-22,-17, -3, 27, -1,-11,  2, -2,-21,-28,-21,  3; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='R'; M= -7, -5,-25, -5,  1,-23,-13, -7,-25, 16,-25,-14,  3, -3,  4, 28,  4, -2,-18,-27,-15,  0;
/M: SY='T'; M=  0,-11,-20,-13, -6,-10,-20, -6, -9, -3,-10, -6, -9,-13, -6,  2, -1,  5, -2,-19, -1, -8;
/M: SY='H'; M=-15,  6,-28,  8,  1,-20,-18, 70,-28, -8,-19, -5,  8,-18,  6, -4, -8,-16,-26,-27, 15, -1;
/M: SY='F'; M=-17,-29,-21,-37,-28, 61,-23,-20,  2,-29, 12,  2,-20,-29,-35,-20,-20,-11,  0,  3, 21,-28;
/M: SY='D'; M=-17, 24,-28, 36,  9,-26,-16, -2,-26,  2,-21,-19,  7,-15, -2,  1, -4, -9,-18,-29, -8,  3;
/M: SY='L'; M= -4,-26,-18,-29,-20,  4,-25,-16, 19,-22, 34, 27,-26,-26,-15,-17,-23, -8, 13,-21, -2,-18;
/M: SY='S'; M=  9, -5,-14, -7, -4,-14, -5, -8,-14,-10,-21,-11,  1, -8, -3,-12, 24, 11, -8,-29,-10, -4;
/M: SY='G'; M=  4, -9,-24,-11,-10,-24, 22, -9,-23,-10,-20,-10, -1,-16, -4, -9,  4, -9,-18,-23,-19, -8;
/M: SY='P'; M=  1, -8,-26, -8,  1,-24,-17,-10,-19,  2,-22,-13, -8, 24, -3, -6,  0,  3,-17,-27,-17, -3;
/M: SY='A'; M= 33,-12,-14,-18,-12,-19, -1,-21, -9,-12,-11,-10,-11, -5,-12,-19,  7,  2,  0,-23,-20,-12;
/M: SY='F'; M=-17,-28,-22,-35,-27, 53,-28,-18,  1,-25,  5,  1,-21,-28,-31,-18,-18, -7,  1, 18, 26,-26;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-25, -9, -2,-16, 17,-16,-20,-14,-10,-11, -8,-17,-12,-15, -4,-10,-14,-22,-18, -7;
/M: SY='A'; M= 19, -4,-17,-10, -6,-22,  4,-14,-19, -2,-20,-13,  1,-13, -5, -4, 10,  1,-11,-25,-19, -6;
/M: SY='M'; M= -9,-25,-23,-31,-21,  0,-29,-15, 26,-20, 24, 31,-22,-23, -9,-17,-20, -9, 16,-21, -1,-16;
/M: SY='A'; M= 40, -7,-12,-14, -8,-19, -3,-18,-10,-11, -7, -9, -9,-11,-10,-19,  6, -1, -2,-22,-19, -9;
/M: SY='R'; M=-13, -9,-29,-11, -2,-16,-24, -8, -9, 16,-13, -3, -4,-17,  3, 20,-11, -9, -7,-18, -3, -2;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='P'; M= -9,-14,-28,-12, -6, -9,-18, -6,-15,  0,-18,-11,-11, 11, -5,  2, -6, -4,-17, -4,  6, -8; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='G'; M= -2, -4,-19, -6,-12,-17, 34,-11,-21,-13,-15,-11,  3,-15,-12,-12, -1,-11,-18,-16,-18,-12; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='Q'; M= -6, -3,-15, -3,  7,-13,-12, -1, -7,  7, -4,  4, -4, -7, 11,  4, -6, -6, -9,-13, -5,  9; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='S'; M=  7,  3,-11,  2,  1,-14,  6, -6,-14, -4,-13,-10,  5, -7, -2, -7,  8, -1,-10,-17,-13, -1; D=-3;
/I:         I=-3; MD=-17;
/M: SY='D'; M= -3, 11,-15, 16, 12,-19, -3, -2,-18,  0,-14,-12,  4, -5,  5, -4,  2, -4,-14,-18,-11,  9; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='Q'; M= -6, -4,-16, -5,  1,-13,-13, -3, -4,  2, -4,  0, -2, -5, 11,  3, -5, -5, -9,-13, -6,  5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='L'; M= -7,-15,-13,-15,-10,  5,-17, -2,  7,-15, 22,  9,-14,-17, -9,-10,-16, -6,  2,-10,  5,-10; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-17, -8, -5, -9,-14, -4, -7,  6, -5, -2,  0,-14, -1, 22, -7, -5, -5,-15, -6, -5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-17;
/M: SY='R'; M= -7,  6,-21,  4,  1,-21,-11,  2,-24,  9,-25,-15, 12,-14,  3, 15, 10,  5,-18,-31,-13,  1;
/M: SY='A'; M= 22, -9,-17,-15, -6,-15, -1,-14,-16, -6,-14,-10, -6,-13, -4, -6,  6, -2, -9,-20,-15, -5;
/M: SY='G'; M=  3, -8,-27, -9,-12,-28, 46,-17,-35,-11,-27,-18,  0,-17,-13,-11,  2,-15,-25,-21,-26,-13;
/M: SY='I'; M=  1,-19,-21,-24,-18, -7,-18,-22, 17,-20,  7,  8,-15,-20,-16,-21,-10, -7, 15,-24,-10,-19;
/M: SY='I'; M= -7,-25,-18,-29,-25,  5,-30,-23, 27,-23, 20, 15,-21,-27,-23,-20,-17, -5, 27,-24, -4,-25;
/M: SY='P'; M=-14, 11,-33, 21, 10,-30,-16, -7,-27,  0,-28,-22,  2, 27, -2, -7, -5, -9,-28,-30,-18,  2;
/M: SY='V'; M= -4,-28,-16,-30,-28,  2,-32,-26, 30,-22, 13, 11,-26,-27,-25,-21,-13, -1, 37,-24, -2,-28;
/M: SY='Q'; M=-10,  2,-27,  2, 20,-21,-19,  2,-18,  4,-17, -9,  3,-11, 22,  3,  0, -5,-22,-22, -7, 20;
/M: SY='Y'; M=-19,-22,-28,-24,-21, 34,-29, 12,  2,-13,  5,  5,-20,-29,-14,-12,-20,-10, -7, 22, 65,-21;
/M: SY='R'; M= -9, -5,-27, -6,  5,-25,-18, -5,-24, 27,-22, -8, -1,-14, 14, 34, -4, -7,-17,-22,-11,  7;
/M: SY='R'; M=-20,-11,-29,-11, -1,-14,-21, -2,-28, 27,-19, -9, -1,-20,  7, 62,-11,-10,-19,-18, -7, -1;
/M: SY='V'; M=  4,-25,-12,-28,-26, -3,-27,-28, 24,-19,  7,  7,-24,-25,-25,-20, -6,  4, 37,-28,-10,-26;
/M: SY='P'; M= -2,-13,-31, -8,  1,-27,-14,-17,-19,  2,-25,-15,-12, 39, -6, -8, -5, -7,-19,-27,-23, -5;
/M: SY='C'; M=-10,-19,110,-28,-27,-21,-29,-29,-30,-25,-21,-19,-19,-38,-27,-26,-10,-10,-11,-48,-29,-27;
/M: SY='R'; M=-14, -3,-28, -4,  7,-13,-16, -2,-22, 13,-16,-10,  1,-16,  6, 21, -8,-10,-20,-18, -4,  5;
/M: SY='Y'; M=-14,-14,-28,-15,-11,  9,-24, 13,-12,  4, -9, -4,-11,-23, -4,  7,-14,-10,-13,  6, 39,-11;
/M: SY='R'; M= -1,-10,-26,-11, -2,-21,-16,-11,-16,  5,-17,-11, -5,  6, -2, 15, -5, -7,-13,-25,-17, -5;
/M: SY='G'; M=  1, -5,-28, -5,-12,-29, 50,-17,-34,-16,-26,-16,  0,-18,-15,-18,  0,-17,-26,-22,-27,-13;
/M: SY='G'; M= -6,  7,-29, 10, -8,-31, 41,-13,-38, -9,-30,-21,  9,-17,-12,-12,  0,-16,-29,-26,-26,-10;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_07 which contains 546'000 sequence entries.


Total number of hits 112 in 112 different sequences
Number of true positive hits 112 in 112 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 3
Number of 'partial' sequences 2
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 97.39 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] N_Hulo
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Expansin-like Eg45
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
112 sequences

EGC1_ARATH  (Q9M0C2), EGC2_ARATH  (Q9ZV52), EGC_CITJA   (Q9ZP41), 
EXB10_MAIZE (Q1ZYQ8), EXB10_ORYSJ (Q8H7T4), EXB11_MAIZE (P0C1Y5), 
EXB11_ORYSJ (Q6H676), EXB12_ORYSJ (Q10G40), EXB13_ORYSJ (Q946J4), 
EXB14_ORYSJ (Q6H677), EXB15_ORYSJ (Q7XT40), EXB16_ORYSJ (Q0DZ85), 
EXB17_ORYSJ (Q7X6J9), EXB18_ORYSJ (Q5W6Z9), EXLA1_ARATH (Q9LZT4), 
EXLA1_ORYSJ (Q10S70), EXLA2_ARATH (Q9SVE5), EXLA2_ORYSJ (Q7XCL0), 
EXLA3_ARATH (Q9LZT5), EXLA3_ORYSJ (Q8H274), EXLA4_ORYSJ (Q5Z980), 
EXLB1_ARATH (O23547), EXLB1_ORYSJ (Q850K7), EXP10_ARATH (Q9LDR9), 
EXP10_ORYSJ (Q7XUD0), EXP11_ARATH (Q9LNU3), EXP11_ORYSJ (Q4PNY1), 
EXP12_ARATH (Q9LDJ3), EXP12_ORYSJ (Q7G6Z2), EXP13_ARATH (Q9M9P0), 
EXP13_ORYSJ (Q4PR52), EXP14_ARATH (Q9FMA0), EXP14_ORYSJ (Q4PR51), 
EXP15_ARATH (O80622), EXP15_ORYSJ (Q4PR50), EXP16_ARATH (Q9M2S9), 
EXP16_ORYSJ (Q69XV9), EXP17_ARATH (Q9ZSI1), EXP17_ORYSJ (Q4PR49), 
EXP18_ARATH (Q9LQ07), EXP18_ORYSJ (Q4PR48), EXP19_ORYSJ (Q7G6Z5), 
EXP20_ARATH (Q9SZM1), EXP20_ORYSJ (Q10RK1), EXP21_ARATH (Q9FL81), 
EXP21_ORYSJ (Q10KN4), EXP22_ARATH (Q9FL80), EXP22_ORYSJ (Q4PR44), 
EXP23_ARATH (Q9FL79), EXP23_ORYSJ (Q4PR43), EXP24_ARATH (Q9FL76), 
EXP24_ORYSJ (Q4PR42), EXP25_ARATH (Q9FL77), EXP25_ORYSJ (Q4PR41), 
EXP26_ARATH (Q9FL78), EXP26_ORYSJ (Q2QP13), EXP27_ORYSJ (Q7XE35), 
EXP28_ORYSJ (Q4PR40), EXP29_ORYSJ (Q4PR39), EXP30_ORYSJ (Q8W2X8), 
EXP31_ORYSJ (Q75I75), EXP32_ORYSJ (Q6YYW5), EXP33_ORYSJ (P0C1Y4), 
EXPA1_ARATH (Q9C554), EXPA1_ORYSJ (Q7XWU8), EXPA2_ARATH (Q38866), 
EXPA2_ORYSJ (Q40636), EXPA3_ARATH (O80932), EXPA3_ORYSJ (Q40637), 
EXPA4_ARATH (O48818), EXPA4_ORYSI (A2Y5R6), EXPA4_ORYSJ (Q0DHB7), 
EXPA5_ARATH (Q38864), EXPA5_ORYSJ (Q6ZGU9), EXPA6_ARATH (Q38865), 
EXPA6_ORYSJ (Q9M4X7), EXPA7_ARATH (Q9LN94), EXPA7_ORYSJ (Q852A1), 
EXPA8_ARATH (O22874), EXPA8_ORYSJ (Q9XHX0), EXPA9_ARATH (Q9LZ99), 
EXPA9_ORYSJ (Q4PR53), EXPB1_ARATH (Q9SKU2), EXPB1_MAIZE (P58738), 
EXPB1_ORYSJ (Q40638), EXPB2_ARATH (Q9SHY6), EXPB2_ORYSJ (O24230), 
EXPB3_ARATH (Q9M0I2), EXPB3_ORYSJ (Q336T5), EXPB4_ARATH (Q9SHD1), 
EXPB4_ORYSJ (Q94LR4), EXPB5_ARATH (Q9M203), EXPB5_ORYSJ (Q7XT39), 
EXPB6_ORYSJ (Q7XCA7), EXPB7_ORYSJ (Q9LD07), EXPB8_ORYSJ (Q10T32), 
EXPB9_MAIZE (Q07154), EXPB9_ORYSJ (Q7XCG7), EXPL1_DICDI (Q55G31), 
EXPL2_DICDI (Q54PA4), EXPL3_DICDI (Q7KWS2), EXPL5_DICDI (Q86AV4), 
EXPL6_DICDI (Q55G32), EXPL7_DICDI (Q54J35), EXPL8_DICDI (Q54C80), 
EXPL9_DICDI (Q54C78), GUN5_HYPJE  (P43317), MPAC1_CYNDA (O04701), 
MPAH1_HOLLA (P43216), MPAL1_LOLPR (P14946), MPAP1_PHAAQ (Q41260), 
MPAP1_PHLPR (P43213)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
3 sequences

EXPLY_DICDI (Q54C76), MPAO2_ORYSJ (P83466), YOAJ_BACSU  (O34918)

		
UniProtKB/Swiss-Prot
'Partial' sequences
2 sequences

EXPB1_PSEMZ (P85909), EXPB_PASNO  (P85293)

		
PDB
[Detailed view]
2 PDB

1N10; 2HCZ

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission