ID GRAM_POS_ANCHORING; MATRIX. AC PS50847; DT 01-MAY-2002 CREATED; 26-FEB-2020 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE Gram-positive cocci surface proteins LPxTG motif profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY'; LENGTH=39; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9159126; R2=0.0060830; TEXT='-LogE'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=3385.1904297; R2=0.9610918; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=918; H_SCORE=4267; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=590; H_SCORE=3952; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-49; D=-100; I=-100; B1=-1000; E1=-1000; MI=-255; MD=-255; IM=-255; DM=-255; MA /I: B1=0; BI=-255; BD=-255; MA /M: SY='L'; M=-97,-99,-115,-107,-70,-116,-98,-62,-108,97,-58,-114,-114,-101,-105,-107,-93,-69,-101,-83; MA /M: SY='P'; M=5,-117,-97,-86,-115,-95,-99,-103,-93,-112,-99,-101,127,-95,-104,-24,-87,-105,-109,-112; MA /M: SY='D'; M=-12,-105,48,42,-104,-96,-3,-101,39,-31,-94,25,-95,41,-7,5,3,-33,-110,-16; MA /M: SY='T'; M=-21,-91,-88,-90,-98,-97,-98,-89,-87,-93,-90,-77,-89,-92,-96,-66,120,-81,-118,-96; MA /M: SY='G'; M=-27,-105,-93,-104,-112,104,-99,-119,-98,-115,-104,-9,-98,-96,-105,-32,-96,-112,-104,-107; MA /I: I=-26; MI=0; MD=-65; IM=0; DM=-65; MA /M: SY='E'; M=2,-102,60,61,-6,-93,-87,-101,-40,-75,-98,36,-94,-79,-41,32,22,-28,-113,-96; MA /M: SY='N'; M=-19,-101,5,42,-106,3,14,-32,30,-103,-96,53,-94,-38,-25,33,32,-52,-113,-97; MA /M: SY='D'; M=5,-103,49,4,-101,14,-89,11,-13,-46,-5,30,-30,13,-19,29,4,-64,-110,-17; MA /M: SY='N'; M=-29,-99,-17,9,-61,-38,-20,-25,-19,-50,8,62,7,-39,-90,43,51,-31,-108,14; MA /M: SY='N'; M=-1,-102,1,-19,16,-78,-10,0,-21,7,-17,54,11,5,-13,21,-55,11,-8,-38; MA /M: SY='F'; M=3,-102,-27,-61,34,-1,-93,13,-18,28,-81,26,8,-6,-19,-10,-7,-25,10,15; MA /M: SY='M'; M=18,-100,-101,-98,28,16,-95,-8,-43,40,53,-32,8,-41,-99,3,20,-80,-100,-28; MA /M: SY='T'; M=35,-97,-96,-34,2,-27,9,-36,-39,25,2,-56,6,-32,-96,-17,64,-16,9,-89; MA /M: SY='L'; M=33,-99,-107,-102,-16,-20,-102,32,-101,55,-24,-101,-105,-98,-103,-61,19,13,38,-24; MA /M: SY='G'; M=37,-100,-104,-101,29,38,-101,4,-101,30,-3,-97,19,-98,-104,-27,-88,24,-101,-88; MA /I: I=-20; MD=-50; MA /M: SY='G'; M=24,-105,-104,-105,30,68,-104,-48,-25,9,-91,-93,-105,-101,-105,-36,-22,-21,14,-93; D=-20; MA /I: I=-20; MD=-50; MA /M: SY='L'; M=38,-105,-73,-106,-94,37,-104,-28,-106,42,-1,-101,-109,-101,-108,2,-93,-4,-109,-28; D=-20; MA /I: I=-20; MD=-50; MA /M: SY='T'; M=21,-118,-125,-122,-43,-34,-124,-7,-120,-1,-6,-117,-123,-119,-124,-40,22,20,-130,-113; D=-20; MA /I: I=-20; MI=0; MD=-50; IM=0; DM=-50; MA /M: SY='M'; M=-9,-99,-109,-104,31,-16,-98,18,-103,60,63,-102,-107,-98,-103,-3,-24,9,-100,-81; MA /M: SY='L'; M=27,-98,-107,-102,13,-16,-99,6,-101,57,36,-100,-105,-97,-102,7,-21,23,-102,-85; MA /M: SY='G'; M=39,10,-99,-99,-25,44,-100,-5,-97,22,-12,-90,-100,-95,-102,16,31,4,-106,-94; MA /M: SY='L'; M=36,-98,-107,-102,-33,-9,-102,39,-102,54,5,-100,-105,-97,-103,0,-46,19,-104,-89; MA /M: SY='G'; M=26,-100,-100,-100,-7,59,-100,-13,-43,19,4,-90,-101,-95,-101,22,-17,12,-105,-94; MA /M: SY='G'; M=12,12,-95,-49,-30,78,-98,-29,-97,-7,-94,-85,-99,-94,-103,31,5,-95,-104,-24; MA /M: SY='L'; M=42,-98,-104,-99,-83,-63,9,12,-100,59,-17,-98,-104,-95,-101,7,12,0,-106,-44; MA /M: SY='F'; M=9,-17,-108,-104,48,7,-98,-1,-44,34,22,-101,-108,-100,-39,-47,-48,40,-95,23; MA /M: SY='L'; M=11,-102,-109,-105,14,-1,-100,36,-101,61,-71,-104,-109,-52,-15,-47,-58,-15,-98,8; MA /M: SY='Y'; M=-3,-104,-108,-102,35,-30,-95,21,-15,41,-12,-102,-37,-97,4,-48,-56,10,-6,55; MA /M: SY='K'; M=7,-104,-97,-90,-4,15,11,-39,48,-20,-5,-89,-102,-85,43,-22,-4,18,-102,15; MA /M: SY='R'; M=-24,-108,-91,-49,-15,-60,-88,-105,68,-49,-94,-28,-101,-15,84,-11,-29,-55,-105,-93; MA /M: SY='K'; M=-39,-109,-33,-80,-29,-37,-86,-109,76,-107,-97,30,-3,-75,75,-33,-90,-105,-105,-36; MA /M: SY='R'; M=-55,-110,-87,6,-108,-103,-3,-111,70,-106,-96,-27,-99,7,87,-88,-8,-105,-107,-95; MA /M: SY='K'; M=-14,-112,-5,32,-40,-104,-92,-47,79,-109,-100,-25,-24,-77,46,-91,-43,-105,-110,-100; MA /M: SY='N'; M=-56,-112,-12,29,-115,-7,-4,-44,-7,-60,-103,67,-106,34,9,17,-92,-63,-121,-105; MA /M: SY='N'; M=-24,-118,29,-24,-121,-16,14,-116,15,-73,-112,31,-113,-11,-58,25,-25,-24,-130,-112; MA /M: SY='K'; M=-120,-137,5,-21,-139,-26,-16,-135,38,-137,-129,0,-128,-108,-17,-7,-116,-38,-143,-128; MA /M: SY='K'; M=-6,-144,-11,-123,-146,-135,-131,-32,19,-140,-134,15,-141,-122,-13,-125,-127,-52,-153,-139; MA /M: SY='K'; M=-147,-160,-46,8,-18,-155,-140,-158,9,-155,-150,-30,-149,-129,-24,-140,-39,-155,-157,-143; MA /M: SY='H'; M=-162,-174,-60,-70,-164,-170,4,-160,-27,-30,-149,-64,-168,-1,-147,-155,-56,-162,-178,-156; MA /I: E1=0; IE=-255; DE=-255; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=204(204); /POSITIVE=204(204); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=2; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=???P?; /MAX-REPEAT=1; CC /FT_KEY=MOTIF; /FT_DESC=LPXTG sorting signal; CC /VERSION=8; DR P13050 , ARP4_STRPY , T; P17953 , ASA1_ENTFA , T; DR P27951 , BAG_STRAG , T; Q6GJA6 , BBP_STAAR , T; DR Q14U76 , BBP_STAAU , T; Q02192 , BCA_STRA1 , T; DR P58099 , C5AP_STRP1 , T; P0DD34 , C5AP_STRP3 , T; DR Q5X9R0 , C5AP_STRP6 , T; Q8NZ80 , C5AP_STRP8 , T; DR P0DD35 , C5AP_STRPQ , T; P15926 , C5AP_STRPY , T; DR Q8CJY7 , CHPA_STRCO , T; Q9X7U2 , CHPB_STRCO , T; DR Q9AD93 , CHPC_STRCO , T; Q2G015 , CLFA_STAA8 , T; DR Q5HHM8 , CLFA_STAAC , T; Q53653 , CLFA_STAAE , T; DR Q932C5 , CLFA_STAAM , T; Q99VJ4 , CLFA_STAAN , T; DR Q6GIK4 , CLFA_STAAR , T; Q6GB45 , CLFA_STAAS , T; DR Q8NXJ1 , CLFA_STAAW , T; Q2FUY2 , CLFB_STAA8 , T; DR Q5HCR7 , CLFB_STAAC , T; O86476 , CLFB_STAAE , T; DR Q99R07 , CLFB_STAAM , T; Q7A382 , CLFB_STAAN , T; DR Q6GDH2 , CLFB_STAAR , T; Q6G644 , CLFB_STAAS , T; DR Q8NUL0 , CLFB_STAAW , T; Q53654 , CNA_STAAU , T; DR P39653 , DEXT_STRDO , T; Q54443 , DEXT_STRMU , T; DR A1C3L3 , FAP1_STRPA , T; O70022 , FBE_STAEP , T; DR P18477 , FM1_ACTVI , T; P12616 , FM2_ACTNA , T; DR A7X6I5 , FNBA_STAA1 , T; Q2FE03 , FNBA_STAA3 , T; DR P14738 , FNBA_STAA8 , T; Q2YW62 , FNBA_STAAB , T; DR Q5HD51 , FNBA_STAAC , T; Q99RD2 , FNBA_STAAM , T; DR Q7A3J7 , FNBA_STAAN , T; Q6GDU5 , FNBA_STAAR , T; DR Q6G6H3 , FNBA_STAAS , T; Q8NUU7 , FNBA_STAAW , T; DR A0A0H2XKG3, FNBB_STAA3 , T; Q03174 , FRUA_STRMU , T; DR A9WNA0 , GH101_RENSM, T; Q2MGH6 , GH101_STRPN, T; DR Q8DR60 , GH101_STRR6, T; Q939N5 , GSPB_STRGN , T; DR A8AWU7 , HSA_STRGC , T; Q54873 , HYSA_STRPN , T; DR Q97QP7 , IGA1A_STRPN, T; Q54875 , IGA1B_STREE, T; DR Q59947 , IGA1_STRR6 , T; Q59986 , IGA1_STRSA , T; DR G2K3G6 , INLA_LISM4 , T; Q723K6 , INLA_LISMF , T; DR P0DJM0 , INLA_LISMO , T; Q723X5 , INLI_LISMF , T; DR Q8YA32 , INLI_LISMO , T; Q71VU0 , INLJ_LISMF , T; DR Q8Y3L4 , INLJ_LISMO , T; Q74K42 , INUS_LACJO , T; DR A7X148 , ISDA_STAA1 , T; A6U0U7 , ISDA_STAA2 , T; DR Q2FHV1 , ISDA_STAA3 , T; Q2FZE9 , ISDA_STAA8 , T; DR A5IS16 , ISDA_STAA9 , T; Q2YX95 , ISDA_STAAB , T; DR Q5HGV4 , ISDA_STAAC , T; A6QG31 , ISDA_STAAE , T; DR Q99UX4 , ISDA_STAAM , T; Q7A655 , ISDA_STAAN , T; DR Q6GHV6 , ISDA_STAAR , T; Q6GA85 , ISDA_STAAS , T; DR A8Z1R0 , ISDA_STAAT , T; P0C1S5 , ISDA_STAAU , T; DR Q7A152 , ISDA_STAAW , T; A7X146 , ISDB_STAA1 , T; DR A6U0U6 , ISDB_STAA2 , T; Q2FHV2 , ISDB_STAA3 , T; DR Q2FZF0 , ISDB_STAA8 , T; A5IS15 , ISDB_STAA9 , T; DR Q2YX96 , ISDB_STAAB , T; Q5HGV5 , ISDB_STAAC , T; DR A6QG30 , ISDB_STAAE , T; Q99UX5 , ISDB_STAAM , T; DR Q7A656 , ISDB_STAAN , T; Q6GHV7 , ISDB_STAAR , T; DR Q6GA86 , ISDB_STAAS , T; P0C7J5 , ISDB_STAAT , T; DR Q8NX66 , ISDB_STAAW , T; Q2FG07 , ISDH_STAA3 , T; DR Q2FXJ2 , ISDH_STAA8 , T; Q2YTF7 , ISDH_STAAB , T; DR Q5HF43 , ISDH_STAAC , T; Q931P4 , ISDH_STAAM , T; DR Q99TD3 , ISDH_STAAN , T; Q6G8J7 , ISDH_STAAS , T; DR Q8NW39 , ISDH_STAAW , T; Q70XJ9 , LSC_FRUSA , T; DR D3WYW0 , LSC_LACGS , T; P19401 , M12_STRPY , T; DR P50468 , M21_STRPY , T; P50469 , M22_STRPY , T; DR P12379 , M24_STRPY , T; P16947 , M49_STRP9 , T; DR P02977 , M5_STRP5 , T; Q5X9Q9 , M6A_STRP6 , T; DR P08089 , M6B_STRPY , T; A1A278 , MANA_BIFAA , T; DR P30141 , MRP4_STRPY , T; P32653 , MRP_STRSU , T; DR P16946 , MX_STRP9 , T; P62575 , NANA_STREE , T; DR P62576 , NANA_STRR6 , T; Q07596 , NISP_LACLL , T; DR O34313 , NTPES_BACSU, T; P16271 , P1P_LACLC , T; DR P15293 , P2P_LACLC , T; Q02470 , P2P_LACPA , T; DR P15292 , P3P_LACLS , T; Q9LBG3 , PAA_STRCG , T; DR Q51911 , PAB_FINMA , T; P11657 , PAC_STRMG , T; DR A8AZP4 , PADA_STRGC , T; Q9KW51 , PAS_STRIT , T; DR Q8CYC9 , PFBA_STRR6 , T; Q5HJU7 , PLS_STAAC , T; DR Q931E9 , PLS_STAAM , T; P61598 , PLS_STAAN , T; DR P80544 , PLS_STAAU , T; Q8NUV0 , PLS_STAAW , T; DR Q8CQD9 , PLS_STAES , T; A0A0H2URK1, PSRP_STRPN , T; DR Q9F930 , PULA_STREE , T; A0A0H2ZL64, PULA_STRP2 , T; DR A0A0H2UNG0, PULA_STRPN , T; Q2G2B2 , SASG_STAA8 , T; DR Q2FJ79 , SDRC_STAA3 , T; Q2G0L5 , SDRC_STAA8 , T; DR Q5HIB4 , SDRC_STAAC , T; O86487 , SDRC_STAAE , T; DR Q99W48 , SDRC_STAAM , T; Q7A781 , SDRC_STAAN , T; DR Q6GJA7 , SDRC_STAAR , T; Q6GBS6 , SDRC_STAAS , T; DR Q8NXX7 , SDRC_STAAW , T; Q2FJ78 , SDRD_STAA3 , T; DR Q2G0L4 , SDRD_STAA8 , T; Q5HIB3 , SDRD_STAAC , T; DR O86488 , SDRD_STAAE , T; Q99W47 , SDRD_STAAM , T; DR Q7A780 , SDRD_STAAN , T; Q6GBS5 , SDRD_STAAS , T; DR Q8NXX6 , SDRD_STAAW , T; Q2FJ77 , SDRE_STAA3 , T; DR Q5HIB2 , SDRE_STAAC , T; O86489 , SDRE_STAAE , T; DR Q932F7 , SDRE_STAAM , T; Q99W46 , SDRE_STAAN , T; DR Q6GBS4 , SDRE_STAAS , T; Q8NXX5 , SDRE_STAAW , T; DR Q9KI14 , SDRF_STAEP , T; Q8CMP4 , SDRF_STAES , T; DR Q9KI13 , SDRG_STAEP , T; Q8KWM1 , SDRI_STASA , T; DR P21979 , SPAA_STRDO , T; P23504 , SPAP_STRMU , T; DR P02976 , SPA_STAA8 , T; A0A0H3K686, SPA_STAAE , T; DR P0A015 , SPA_STAAM , T; P99134 , SPA_STAAN , T; DR P38507 , SPA_STAAU , T; P06654 , SPG1_STRSG , T; DR P19909 , SPG2_STRSG , T; P50470 , SPH_STRP1 , T; DR Q2FDK5 , SRAP_STAA3 , T; Q2FUW1 , SRAP_STAA8 , T; DR Q5HCP3 , SRAP_STAAC , T; Q99QY4 , SRAP_STAAM , T; DR Q7A362 , SRAP_STAAN , T; Q6GDE9 , SRAP_STAAR , T; DR Q6G620 , SRAP_STAAS , T; Q8VQ99 , SRAP_STAAU , T; DR Q8NUJ3 , SRAP_STAAW , T; Q4L9P0 , SRAP_STAHJ , T; DR A8AUS0 , SSPA_STRGC , T; A8AUS1 , SSPB_STRGC , T; DR P16952 , SSPB_STRGN , T; P49610 , STRH_STRPN , T; DR P18481 , TEE6_STRP6 , T; Q4A0V8 , UAFA_STAS1 , T; DR P11000 , WAPA_STRMU , T; Q8Y3W5 , Y2714_LISMO, T; DR P54602 , YHCR_BACSU , T; Q9L7Q2 , ZMPB_STRPN , T; DR Q8DQN5 , ZMPB_STRR6 , T; Q97T80 , ZMPC_STRPN , T; DR P83330 , M32_STRTR , P; P49054 , PAM_STRPY , P; PR PRU00477; DO PDOC00373; //