ID BSD; MATRIX. AC PS50858; DT 01-MAY-2003 CREATED; 10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE BSD domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=53; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=48; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=0.7419000; R2=0.0212828; TEXT='NScore'; MA /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2313.5722656; R2=2.2196531; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=365; H_SCORE=3124; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=271; H_SCORE=2915; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?'; MA /DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-60; E1=-60; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='W'; M=-11,-13,-24,-14,-12,-6,-16,-15,-14,-12,-10,-10,-13,-23,-8,-8,-16,-13,-15,25,0,-9; MA /M: SY='E'; M=-7,0,-17,1,5,-14,-20,-11,-12,-3,-9,-9,-2,-15,-3,-5,-2,0,-8,-28,-12,1; MA /M: SY='N'; M=-9,10,-24,10,7,-18,-11,-6,-18,-4,-14,-14,11,-7,-3,-7,0,-4,-20,-31,-16,2; MA /M: SY='E'; M=1,-2,-23,-3,4,-17,-8,-6,-19,0,-19,-12,0,-9,1,-2,4,-4,-16,-24,-13,2; MA /M: SY='F'; M=-12,-13,-22,-15,-7,13,-25,-14,-1,-12,5,1,-13,-21,-15,-11,-13,-6,-1,-15,4,-10; MA /M: SY='N'; M=-7,2,-18,0,-2,-18,-15,-8,-14,3,-13,-5,4,-16,1,2,2,1,-11,-29,-12,-1; MA /M: SY='L'; M=-8,-23,-18,-25,-20,11,-26,-18,10,-18,13,6,-19,-25,-19,-13,-12,-2,13,-17,4,-20; MA /M: SY='D'; M=-12,26,-26,33,26,-31,-12,-1,-31,6,-26,-22,15,-8,7,-2,4,-4,-26,-35,-19,17; MA /M: SY='A'; M=1,-12,-24,-15,-1,-12,-15,-14,-4,-6,-3,-1,-11,-15,-2,-10,-7,-8,-6,-16,-9,-2; MA /M: SY='Q'; M=-8,7,-25,6,6,-25,-16,-1,-20,9,-18,-7,7,-13,16,6,0,-2,-19,-25,-10,11; MA /M: SY='R'; M=-7,-5,-17,-6,-1,-16,-16,-5,-16,3,-15,-9,-2,-17,0,7,0,0,-11,-24,-7,-3; MA /M: SY='E'; M=-6,10,-27,15,28,-25,-12,-5,-27,5,-21,-18,3,-4,8,-3,0,-7,-24,-28,-17,18; MA /M: SY='E'; M=-9,-6,-26,-6,9,-15,-23,9,-7,-5,-2,1,-6,-16,7,-6,-9,-10,-11,-23,-3,7; MA /M: SY='I'; M=1,-20,-23,-25,-14,-9,-26,-18,17,-15,10,11,-16,-18,-5,-15,-12,-7,11,-21,-7,-11; MA /M: SY='E'; M=-6,-3,-18,-3,13,-17,-19,-5,-16,1,-11,-9,-4,-13,5,-1,0,-2,-13,-27,-12,9; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; MA /M: SY='A'; M=3,-7,-21,-8,-3,-17,-10,-13,-9,-5,-8,-6,-4,-15,-4,-6,1,-3,-6,-26,-14,-4; MA /M: SY='L'; M=-9,-26,-23,-30,-23,3,-32,-21,29,-26,31,22,-24,-25,-18,-22,-23,-9,19,-22,-2,-22; MA /M: SY='L'; M=-11,-22,-22,-23,-10,12,-27,-15,8,-22,26,11,-21,-24,-13,-16,-20,-9,2,-17,1,-11; MA /M: SY='E'; M=-5,5,-19,5,13,-27,-16,-5,-24,13,-21,-13,3,-12,11,10,0,-5,-19,-27,-15,12; MA /M: SY='E'; M=-8,5,-26,6,14,-24,-4,-3,-23,1,-17,-13,5,-12,5,-3,0,-6,-22,-28,-16,10; MA /M: SY='N'; M=-7,14,-23,12,1,-17,-12,7,-19,-1,-20,-14,15,-17,-2,-2,2,-4,-17,-26,-3,-2; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='P'; M=-8,-6,-31,-3,4,-27,-13,-13,-23,6,-29,-17,-4,39,-3,-4,-3,-7,-25,-28,-22,-2; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: SY='D'; M=-2,0,-22,3,3,-17,-7,-11,-13,-10,-8,-10,-3,-15,-6,-13,-2,-6,-9,-26,-12,-2; MA /M: SY='L'; M=-8,-28,-20,-28,-19,5,-30,-21,23,-25,34,17,-27,-27,-19,-20,-23,-8,18,-23,-3,-20; MA /M: SY='R'; M=-1,-8,-23,-10,0,-17,-16,-9,-17,14,-15,-5,-5,-15,5,17,-3,-5,-11,-21,-10,2; MA /M: SY='K'; M=1,-3,-24,-5,5,-25,-12,-2,-20,14,-18,-6,-1,-12,12,8,-2,-7,-17,-23,-11,8; MA /M: SY='L'; M=-5,-21,-20,-25,-18,1,-27,-14,13,-16,15,11,-20,-23,-14,-14,-15,-4,12,-19,1,-17; MA /M: SY='Y'; M=-17,-15,-27,-18,-13,13,-24,8,-8,-1,-5,3,-10,-24,-4,8,-15,-10,-10,0,29,-11; MA /M: SY='N'; M=-6,6,-23,1,3,-11,-16,-6,-14,1,-14,-10,8,-15,-1,-3,-2,-3,-15,-23,-7,1; MA /M: SY='E'; M=-11,9,-28,13,20,-26,-17,-1,-25,11,-19,-13,4,-11,13,10,-3,-8,-23,-25,-11,16; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19; MA /M: SY='L'; M=-7,-19,-18,-22,-19,1,-25,-13,17,-21,18,11,-15,-25,-17,-17,-14,-5,15,-23,-2,-19; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-19; MA /M: SY='V'; M=-1,-24,0,-26,-21,-5,-28,-25,17,-19,6,6,-25,-27,-23,-19,-10,-3,30,-30,-12,-22; MA /M: SY='P'; M=-6,-10,-31,-5,0,-26,-15,-15,-20,-7,-29,-19,-6,54,-7,-14,2,-1,-25,-32,-26,-7; MA /I: I=-6; MD=-32; MA /M: SY='K'; M=1,2,-21,1,1,-23,-5,3,-22,6,-22,-11,4,-13,2,2,4,-4,-15,-26,-12,1; D=-6; MA /I: I=-6; MI=-32; IM=-32; DM=-32; MA /M: M=-5,-10,-24,-11,-3,-12,-17,-4,-6,-3,-7,-2,-7,-15,-2,-5,-7,-7,-5,-19,-1,-4; MA /M: SY='I'; M=-7,-26,-18,-30,-23,5,-28,-19,24,-22,23,23,-24,-26,-18,-19,-17,-6,22,-23,-3,-21; MA /M: SY='S'; M=-2,7,-20,8,1,-19,-12,-11,-22,1,-24,-17,5,-4,-3,-5,13,11,-15,-31,-15,-1; MA /M: SY='E'; M=-8,5,-29,9,22,-20,-18,7,-21,-1,-18,-14,2,-1,5,-7,-3,-9,-23,-23,-4,12; MA /M: SY='E'; M=-6,10,-25,16,19,-26,-11,-2,-26,3,-24,-18,5,-6,4,-4,6,-4,-21,-30,-15,11; MA /M: SY='E'; M=-10,10,-20,14,19,-27,-18,0,-22,2,-18,-12,3,-11,11,-3,1,-2,-18,-31,-14,15; MA /M: SY='F'; M=-20,-30,-20,-40,-30,80,-30,-20,0,-30,10,0,-20,-30,-40,-20,-20,-10,0,10,30,-30; MA /M: SY='W'; M=-20,-40,-50,-40,-30,10,-20,-30,-20,-20,-20,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-30,150,30,-20; MA /M: SY='S'; M=2,-7,-15,-10,-4,-13,-13,-5,-19,3,-17,-10,-2,-15,-1,5,6,2,-11,-25,-9,-3; MA /M: SY='R'; M=-13,-2,-25,-7,-7,-12,-21,-9,-10,6,-13,-7,5,-17,-3,18,-4,2,-9,-24,-8,-7; MA /M: SY='Y'; M=-20,-20,-28,-22,-18,28,-28,6,-6,-6,0,-1,-16,-28,-12,5,-18,-10,-9,13,48,-18; MA /M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-35,-26,56,-30,-16,5,-24,11,3,-20,-28,-31,-18,-20,-10,2,6,29,-26; MA /M: SY='Y'; M=-11,-11,-26,-14,-9,-2,-21,0,-7,-7,-7,-3,-7,-16,0,-5,-8,-6,-12,-3,12,-5; MA /M: SY='L'; M=-2,-12,-20,-14,-7,-11,-18,-10,-6,-3,3,0,-8,-19,-4,0,-5,-3,-4,-25,-9,-6; MA /M: SY='V'; M=-9,-15,-22,-16,-8,-8,-25,-8,3,-5,6,4,-13,-22,-9,-1,-14,-8,7,-25,-6,-10; MA /M: SY='H'; M=-11,-6,-27,-6,-3,-10,-8,12,-17,-4,-10,-5,-2,-20,-2,3,-8,-11,-17,-16,7,-5; MA /M: SY='A'; M=1,-14,-10,-17,-10,-7,-16,-18,-10,-4,-9,-7,-11,-11,-11,-8,-3,-2,-4,-23,-11,-10; MA /M: SY='H'; M=-11,-10,-25,-12,-11,-5,-24,5,0,-10,-1,1,-6,-21,-8,-6,-11,-9,-2,-20,5,-12; MA /M: SY='E'; M=-1,-8,-23,-8,6,-15,-14,-10,-16,5,-9,-7,-6,-14,1,6,-3,-5,-11,-23,-12,3; MA /I: E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=32(23); /POSITIVE=32(23); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=window20_shuffled; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=2; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=BSD; CC /VERSION=5; DR Q6INU2 , BSC1A_XENLA, T; Q6NTW1 , BSC1B_XENLA, T; DR Q3SX22 , BSDC1_BOVIN, T; Q5ZIK6 , BSDC1_CHICK, T; DR A2BIJ3 , BSDC1_DANRE, T; Q9NW68 , BSDC1_HUMAN, T; DR Q80Y55 , BSDC1_MOUSE, T; Q5BJ78 , BSDC1_XENTR, T; DR P54858 , DOS2_YEAST , T; S7UIF3 , RASP3_TOXGG, T; DR Q960T2 , SAP47_DROME, T; Q96A49 , SYAP1_HUMAN, T; DR Q9D5V6 , SYAP1_MOUSE, T; Q55FP1 , TF2H1_DICDI, T; DR Q960E8 , TF2H1_DROME, T; P32780 , TF2H1_HUMAN, T; DR Q9DBA9 , TF2H1_MOUSE, T; Q3ECP0 , TFB1A_ARATH, T; DR Q9M322 , TFB1C_ARATH, T; Q9P5N7 , TFB1_NEUCR , T; DR O13745 , TFB1_SCHPO , T; P32776 , TFB1_YEAST , T; DR O13905 , YF3E_SCHPO , T; 3D 1X3A; 2DII; 5OQJ; 5OQM; 6GYM; 6NMI; 6O9L; 6O9M; 7AD8; 7BUL; 7EGB; 7EGC; 3D 7ENA; 7ENC; 7K01; 7K04; 7LBM; 7M2U; 7ML0; 7ML1; 7ML2; 7ML3; 7ML4; 7NVR; 3D 7NVW; 7NVX; 7NVY; 7NVZ; 7NW0; 7O4I; 7O4J; 7O4K; 7O4L; 7O72; 7O73; 7O75; 3D 7ZS9; 7ZSA; 7ZSB; 8BVW; 8BYQ; 8EBS; 8EBT; 8EBU; 8EBV; 8EBW; 8EBX; 8EBY; 3D 8GXQ; 8GXS; 8WAK; 8WAL; 8WAN; 8WAO; 8WAP; 8WAQ; 8WAR; 8WAS; PR PRU00036; DO PDOC50858; //