PROSITE entry PS50901
View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission
General information about the entry
| Entry name [info] | FTSK |
| Accession [info] | PS50901 |
| Entry type [info] | MATRIX |
| Date [info] |
01-MAR-2003 CREATED;
10-MAY-2017 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. |
| PROSITE Doc. [info] | PDOC50901 |
| Associated ProRule [info] | PRU00289 |
Name and characterization of the entry
| Description [info] | FtsK domain profile. |
| Matrix / Profile [info] |
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=191; /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=186; /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4803104; R2=0.0182181; TEXT='NScore'; /NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10818.7890625; R2=14.2324362; PRIORITY=1; TEXT='Heuristic 5.0%'; /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=743; H_SCORE=21393; N_SCORE=16.0; MODE=1; TEXT='!'; /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=128; H_SCORE=12641; N_SCORE=4.8; MODE=1; TEXT='?'; /DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; ... A B C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y Z /I: B1=0; BI=-105; BD=-105; /M: SY='Q'; M= -7, -8,-26, -9, -5,-20, 1, -7,-13, -8, -6, 1, -6,-18, 4, -4, -7,-10,-14,-23,-13, -1; /M: SY='E'; M= -7, 4,-27, 6, 13,-27, -7, -5,-26, 5,-23,-15, 4, -5, 10, 4, 2, -4,-23,-27,-17, 11; /M: SY='P'; M= -8, -5,-32, -1, 1,-23,-13,-12,-18, -6,-22,-16, -6, 33, -7,-13, -5, -6,-22,-26,-17, -6; /M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-29,-24, 4,-27,-23, 20,-20, 14, 10,-25,-26,-21,-18,-15, -4, 25,-16, -1,-23; /M: SY='Y'; M= -7,-15,-18,-17, -9, -4,-23, -7, -4, -9, -5, -2,-14,-18, -8, -8, -8, -3, 0,-11, 2,-10; /M: SY='W'; M= -5,-27,-21,-31,-24, 8,-21,-21, 8,-23, 9, 3,-24,-26,-21,-21,-19,-11, 5, 10, 7,-23; /I: I=-6; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22; /M: SY='D'; M=-14, 32,-28, 41, 14,-33, -9, 3,-31, 0,-27,-23, 19, -8, 2, -7, 2, -8,-27,-36,-18, 7; /M: SY='L'; M= -8,-26,-21,-30,-22, 18,-27,-17, 14,-24, 24, 13,-23,-24,-21,-19,-20, -7, 8,-10, 8,-21; /M: SY='R'; M= -1, -3,-23, -5, -3,-20, -4, -5,-18, 1,-16, -9, 0,-15, -1, 4, 1, -4,-14,-24,-12, -3; /M: SY='E'; M= -3, 5,-23, 4, 8,-23, -7, -6,-23, 6,-21,-14, 6,-12, 2, 4, 5, 0,-17,-29,-16, 4; /I: I=-5; MD=-17; /M: SY='B'; M= -5, 4,-18, 2, -1,-12,-12, -7,-11, -8,-12, -9, 4,-11, -7,-10, 1, 0, -9,-27,-11, -4; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='P'; M= -3, -8,-27, -6, -5,-23, 2,-15,-22, -9,-25,-17, -4, 26, -9,-12, 3, -2,-22,-27,-23, -9; D=-5; /I: I=-5; DM=-17; /M: SY='H'; M=-17, 3,-28, -1, -3,-16,-14, 67,-24, -9,-19, -4, 14,-20, 4, -1, -7,-15,-26,-29, 11, -3; /M: SY='L'; M= -4,-24,-23,-28,-22, -2,-14,-21, 13,-23, 17, 11,-21,-24,-18,-21,-17, -9, 8,-12, -5,-21; /M: SY='L'; M= -2,-25,-19,-28,-20, 2,-21,-20, 16,-24, 29, 16,-24,-25,-18,-20,-19, -7, 11,-21, -5,-19; /M: SY='I'; M= -5,-28,-17,-33,-28, -1,-31,-25, 32,-25, 15, 15,-23,-25,-22,-24,-16, -7, 31,-25, -5,-27; /M: SY='A'; M= 5,-18,-15,-23,-18, 1, -8,-17, -2,-19, -1, -3,-14,-21,-18,-19, -5, -5, 1,-15, -4,-18; /M: SY='G'; M= 1, -9,-29,-10,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20, 0,-19,-19,-19, 2,-18,-29,-21,-29,-19; /M: SY='S'; M= 4, -4,-21, -6, -2,-21, -2,-11,-19, -1,-17,-10, -1,-12, -1, 0, 5, 1,-13,-26,-17, -2; /M: SY='T'; M= 1, -5,-20, -7, -2,-21,-13,-14,-17, -6,-21,-14, -3, 13, -1, -9, 13, 17,-14,-30,-18, -3; /M: SY='G'; M= -4, -8,-29, -7, -8,-27, 41,-14,-35, -8,-27,-17, 0,-17, -6, -7, -1,-16,-28,-20,-24, -7; /M: SY='S'; M= 3, -6, -1, -8, -8,-14, -4,-11,-19,-11,-22,-15, 0,-16, -7,-11, 20, 13,-10,-30,-10, -8; /M: SY='G'; M= 0,-10,-30,-11,-20,-28, 68,-20,-39,-20,-29,-20, 0,-20,-20,-20, 0,-20,-29,-19,-29,-20; /M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1, 9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10, 0,-11, 10, 32, -9, -9,-20,-20,-10, 9; /M: SY='T'; M= 5, 0,-11, -5, -5,-16, -5,-15,-17,-10,-22,-16, 5,-10, -5,-10, 30, 31, -7,-35,-16, -5; /M: SY='T'; M= -2, -1,-18, -7, -4,-12,-18,-10, -8, -7,-11, -6, 1,-15, -3, -8, 6, 15, -4,-22, -5, -4; /M: SY='F'; M= 2,-19,-12,-25,-18, 11,-20,-20, 2,-21, 9, 1,-16,-22,-19,-18, -7, 2, 5,-17, -1,-18; /M: SY='L'; M= -5,-26,-21,-28,-19, 4,-26,-21, 18,-26, 32, 15,-24,-25,-17,-20,-21, -7, 11,-20, -3,-19; /M: SY='R'; M= -7, -7,-24,-11, -3,-16,-19, 4,-11, 2, -6, 2, -3,-18, 11, 12, -7, -7,-12,-21, -4, 2; /M: SY='T'; M= 5, -3,-14,-10,-10,-10,-11,-14,-11,-10,-14,-11, 1,-15, -9,-11, 15, 20, -4,-23, -8, -9; /M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-35,-26, 12,-33,-24, 30,-28, 27, 16,-24,-25,-22,-24,-22, -9, 19,-17, 3,-25; /M: SY='I'; M= 0,-25,-17,-30,-23, -2,-26,-24, 23,-23, 18, 14,-22,-23,-19,-22,-14, -4, 21,-23, -6,-23; /M: SY='M'; M= -3,-14,-13,-18,-11, -6,-18,-11, -2,-11, 3, 6,-13,-20, -9, -9, -8, -4, -1,-22, -5,-10; /M: SY='S'; M= 7, 3,-15, 1, 4,-23, -4, -7,-20, -5,-22,-15, 6,-12, 5, -8, 15, 4,-15,-30,-17, 4; /M: SY='L'; M= 1,-25,-19,-29,-20, 5,-23,-20, 15,-24, 26, 13,-22,-24,-18,-20,-17, -7, 11,-20, -3,-19; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='A'; M= 19,-14, -5,-20,-14,-10, -9,-18, -1,-15, 3, 1,-13,-16,-12,-18, -2, -2, 3,-20,-13,-13; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='R'; M= -3, -9,-16,-10, -4, -6,-15, -7, -5, -2, -1, -1, -6,-14, -4, 5, -5, -2, -3,-16, -4, -5; D=-4; /I: I=-4; MD=-14; /M: SY='T'; M= -4, -2,-13, -6, -3,-10,-13, -3, -9, 2, -8, -3, 0,-11, 1, 5, 1, 7, -6,-17, -5, -2; D=-4; /I: I=-4; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; /M: SY='H'; M= -9, -1,-17, -4, -4, -2,-11, 22,-12, -3,-10, -4, 4,-13, -1, -1, -4, -5,-13,-10, 12, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='S'; M= 1, -3,-10, -5, -3,-14, -3, -9,-14, -6,-15,-11, 2, -7, -4, -4, 14, 12, -9,-25,-13, -4; D=-4; /I: I=-4; DM=-14; /M: SY='P'; M= -6,-12,-29, -8, -2,-23,-18,-11,-19, -6,-21,-15,-12, 37, -7, -9, -7, -7,-21,-24,-19, -8; /M: SY='E'; M= -6, 6,-26, 8, 19,-25,-14, 3,-23, 3,-19,-13, 4, -6, 11, 1, 1, -5,-22,-27,-12, 14; /M: SY='E'; M=-11, 7,-25, 10, 16,-26,-17, -1,-22, 6,-20,-12, 4, -6, 10, 5, -1, -6,-21,-29,-15, 12; /M: SY='V'; M= 7,-20,-13,-24,-20, -5,-15,-21, 9,-19, 4, 2,-17,-23,-19,-19, -5, -2, 16,-23,-10,-20; /M: SY='Q'; M= -9, 3,-25, 1, 4,-21,-16, 2,-17, 5,-17, -8, 5,-15, 8, 7, -1, -3,-15,-25, -8, 5; /M: SY='L'; M=-11,-29,-17,-34,-26, 22,-31,-22, 20,-27, 26, 14,-26,-28,-26,-21,-22, -8, 17,-15, 6,-25; /M: SY='Y'; M=-10,-18,-21,-21,-20, 12,-24, -6, 3,-15, 1, 1,-17,-26,-16,-15,-15, -7, 2, 5, 23,-19; /M: SY='L'; M=-10,-27,-11,-32,-25, 9,-26,-21, 17,-28, 19, 10,-22,-27,-23,-23,-20,-10, 13,-19, 0,-25; /M: SY='I'; M= -1,-25,-15,-31,-24, 2,-26,-24, 22,-24, 13, 10,-20,-23,-21,-23,-12, -5, 20,-22, -5,-24; /M: SY='D'; M=-18, 47,-29, 66, 18,-39, -8, -1,-39, -1,-30,-29, 20,-10, -1,-10, 0,-10,-29,-39,-20, 9; /M: SY='P'; M=-11,-19,-19,-19,-15, 4,-13,-13,-11,-18, -8, -7,-16, 7,-18,-18,-12, -9,-13,-14, 1,-18; /M: SY='K'; M= -7, -2,-28, -2, 1,-28, 3,-11,-31, 22,-28,-14, 1,-11, 1, 17, -4,-10,-22,-22,-16, 1; /M: SY='G'; M= -4, 2,-23, -2, -6,-19, 11, -7,-25, -3,-22,-13, 9,-17, -6, 1, 4, -2,-20,-26,-17, -7; /I: I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17; /M: SY='G'; M= 3, -2,-18, -5, -9,-17, 12, -9,-17, -9,-17,-11, 4,-16, -9,-10, 4, -3,-11,-23,-15,-10; D=-5; /I: I=-5; DM=-17; /M: SY='G'; M= 2, 3,-21, 4, 2,-23, 10,-11,-23, -8,-18,-14, 2,-12, -4,-11, 5, -1,-17,-25,-19, -1; D=-5; /I: I=-5; DM=-17; /M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-27,-18, 11,-25,-16, 12,-24, 32, 15,-24,-24,-18,-18,-23, -9, 6,-16, 3,-18; /M: M= 0, -7,-22, -8, -4,-14,-13,-10, -9, -6, -5, -4, -6,-15, -4, -7, -4, -4, -7,-23, -8, -5; /I: I=-7; MD=-23; /M: SY='P'; M= -1, 1,-20, 3, 0,-22,-10,-10,-18, -3,-18,-12, -2, 5, -4, -8, 0, -3,-15,-26,-16, -3; D=-7; /I: I=-7; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23; /M: SY='F'; M=-11,-24,-18,-27,-19, 17,-26,-17, 7,-21, 13, 6,-22,-21,-20,-17,-19, -9, 4, 1, 9,-19; D=-7; /I: I=-7; DM=-23; /M: SY='E'; M= -1, -2,-22, -2, 2,-20, -5, -7,-18, -1,-16,-11, 0,-10, -1, -3, 1, -3,-14,-21,-12, 0; D=-7; /I: I=-7; DM=-23; /M: SY='D'; M=-10, 5,-29, 8, 4,-27, -4, -1,-26, 5,-24,-14, 3, -6, 2, 3, -4,-11,-23,-23,-13, 2; /M: SY='L'; M= -8,-23,-21,-24,-16, 5,-26,-18, 12,-22, 26, 11,-21,-22,-16,-15,-18, -6, 6,-21, -3,-16; /M: SY='P'; M= -2, -8,-25, -7, -1,-23,-12,-12,-17, -6,-21,-14, -6, 26, -7,-10, -3, -7,-19,-29,-21, -6; /M: SY='H'; M=-12, -6,-24, -7, -1,-15,-18, 41,-20, -7,-12, -3, -1,-17, 4, -2, -9,-13,-20,-20, 8, -1; /M: SY='V'; M= -5,-20,-16,-23,-18, -1,-24,-17, 11,-15, 6, 6,-18,-22,-17,-12, -9, 1, 17,-23, -4,-19; /M: SY='A'; M= 7,-10,-17,-12, -6,-14, -2,-14,-14, -8,-10, -8, -8,-16, -9, -9, 0, -3, -7,-23,-14, -7; /M: SY='A'; M= 7, 0,-22, 1, -3,-24, 6,-15,-21, -5,-18,-14, -2,-11, -8,-11, 2, -4,-13,-26,-19, -5; /M: SY='Y'; M= -6,-15,-22,-18,-15, -3,-17, -8, -1,-12, -6, -2,-12,-16,-12,-10, -6, -2, 2,-13, 4,-15; /M: SY='V'; M= 6,-18,-18,-22,-16, -2,-19,-19, 9,-17, 4, 2,-15,-20,-17,-18, -6, -3, 13,-22, -7,-17; /I: I=-5; MD=-16; /M: SY='T'; M= 3, -7, -9,-11, -9,-10,-11,-13, -4,-10, -6, -4, -5,-12, -8,-12, 4, 8, -1,-22, -8, -9; D=-5; /I: I=-5; MD=-16; /M: SY='N'; M= -1, -2,-14, -6, -6, -9, -8, -4, -6, -4, -7, -3, 2, -9, -5, 0, -1, -2, -4,-18, -8, -6; D=-5; /I: I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16; /M: SY='D'; M= -7, 8,-19, 12, 6,-14,-11, -3,-16, -2,-12,-12, 2,-11, -2, -5, 0, -1,-13,-19, -3, 2; D=-5; /I: I=-5; DM=-16; /M: SY='D'; M=-10, 17,-23, 22, 14,-23,-10, 0,-22, 1,-19,-15, 10,-10, 5, -3, 1, -6,-19,-27,-13, 9; D=-5; /I: I=-5; DM=-16; /M: SY='P'; M= -1,-10,-22, -9, -3,-16, -8,-12,-12, -5,-12, -7, -8, 4, -5, -8, -1, -2,-10,-23,-14, -5; D=-5; /I: I=-5; DM=-16; /M: SY='E'; M= -6, 11,-24, 15, 17,-25,-14, -2,-23, 2,-19,-16, 5,-11, 5, 0, 2, -3,-18,-29,-14, 10; /M: SY='K'; M= -6, 4,-25, 5, 7,-24, -9, -7,-23, 9,-17,-11, 2,-13, 4, 5, -2, -5,-18,-25,-13, 5; /M: SY='V'; M= 2,-22,-18,-27,-22, 0,-24,-23, 19,-21, 12, 11,-20,-22,-19,-21,-10, -2, 20,-23, -6,-21; /M: SY='E'; M= -1, -2,-23, -2, 7,-17,-16, -5,-12, -1, -9, -6, -3,-12, 1, -2, -3, -6,-11,-24,-10, 3; /M: SY='R'; M= -8, 6,-25, 6, 14,-25,-15, -3,-25, 16,-22,-14, 8,-12, 11, 19, 1, -5,-20,-27,-15, 11; /M: SY='M'; M= 0,-21,-10,-27,-19, 6,-23,-17, 8,-18, 12, 13,-19,-23,-16,-17,-12, -3, 9,-20, -3,-17; /M: SY='L'; M= -5,-26,-18,-29,-22, 4,-28,-20, 21,-23, 23, 16,-24,-26,-20,-18,-17, -4, 21,-23, -3,-22; /M: SY='D'; M= -3, 5,-24, 7, 6,-24, -9, -7,-23, 4,-18,-13, 3,-13, 4, 7, 2, -3,-17,-27,-16, 4; /M: SY='E'; M= -2, -7,-24, -8, 5,-12,-17, -9,-13, -2,-11, -8, -7,-14, 0, -1, -3, -3,-12, -9, -4, 2; /M: SY='L'; M= -6,-26,-18,-31,-22, 7,-29,-21, 21,-24, 26, 16,-22,-25,-19,-19,-20, -7, 15,-20, -1,-22; /M: SY='A'; M= 2, -9,-12,-11, -7,-14,-17,-13, -7, -5, -8, -5, -9,-18, -6, -8, -2, -2, 0,-24,-11, -7; /M: SY='E'; M= 5, 2,-22, 3, 6,-24, -3,-10,-21, 0,-19,-14, 0,-10, -1, -6, 2, -5,-15,-26,-17, 2; /M: SY='E'; M=-10, 2,-27, 6, 27,-21,-19, -5,-17, 2,-10,-10, -3,-10, 7, -1, -6, -9,-17,-27,-14, 16; /M: SY='M'; M= -9,-25,-23,-32,-23, 2,-29,-16, 28,-21, 24, 31,-22,-21,-13,-19,-20, -8, 17,-20, 0,-20; /M: SY='E'; M= -7, 9,-26, 11, 14,-25,-14, -2,-23, 6,-21,-14, 7, -5, 7, 2, 1, -5,-22,-29,-15, 10; /M: SY='R'; M= -5, -6,-22, -6, 3,-19,-14, -7,-20, 9,-15, -9, -2,-15, 4, 17, -3, -6,-15,-23,-11, 2; /M: SY='R'; M=-18,-11,-29,-11, -1,-20,-21, -3,-26, 24,-18, -9, -3,-14, 8, 57, -9, -8,-17,-21,-11, -1; /M: SY='K'; M= -8, -5,-27, -6, 4,-14,-21, -4,-13, 7,-11, -5, -5,-13, 7, 3, -7, -7,-14,-16, 2, 4; /M: SY='E'; M= -3, -1,-25, -1, 11,-23,-14, -5,-17, 4,-16, -9, -1, -7, 7, 1, -1, -5,-16,-25,-13, 8; /M: SY='L'; M= 1,-17,-23,-19, -9, -8,-20,-16, 3,-16, 7, 1,-16,-11,-10,-16,-10, -5, -1,-19, -9,-11; /M: SY='F'; M=-11,-26,-18,-30,-21, 21,-28,-19, 11,-24, 20, 11,-22,-19,-21,-19,-20, -8, 6,-14, 5,-21; /M: SY='K'; M= -5, 0,-25, 0, 2,-23, -8, -3,-24, 11,-22,-12, 3,-11, 2, 11, 0, -5,-18,-25,-12, 1; /M: SY='E'; M= -7, 4,-22, 6, 10,-24,-11, -4,-24, 5,-18,-13, 3,-13, 9, 6, 0, -5,-20,-26,-13, 9; /M: SY='H'; M= -2, -8,-19,-12, -7,-10,-14, 1,-11, -7, -6, -4, -3,-19, -4, -1, -3, -4, -9,-22, -4, -7; /M: SY='G'; M= -6, -2,-26, -2, -5,-23, 12, -5,-27, -2,-23,-14, 3,-13, -4, 1, 1, -7,-21,-24,-15, -5; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='V'; M= -3,-11,-19,-13, -9, -9,-16,-10, -1, -3, -6, 0, -8,-18, -6, -1, -5, -5, 4,-21, -6, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='R'; M= -3, -1,-20, -2, 0,-17,-10, -8,-16, 2,-14,-10, -1,-14, 0, 4, -1, -3,-11,-22,-10, -1; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='N'; M= -2, 5,-19, 5, 2,-18, -8, -1,-16, -4,-15,-10, 6,-13, 0, -6, 6, 0,-13,-27,-11, 1; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='I'; M= -2,-15,-22,-20,-15, -5,-18,-16, 6,-15, 5, 3,-12,-19,-10,-13,-11, -5, 2, -4, -3,-13; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='S'; M= -2, 1,-21, 1, -1,-20, 1, -7,-18, -2,-19,-11, 2,-11, -3, -5, 3, -4,-13,-22,-13, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='E'; M= -2, -1,-20, -1, 3,-14,-14, -7,-12, 2,-10, -4, -4, -9, 0, 0, -3, -4, -9,-18, -9, 1; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='Y'; M= -7, -8,-21,-11, -9, 6,-14, 1, -8, -8, -6, -5, -5,-15, -6, -7, -5, -4,-10, -3, 19, -9; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='R'; M=-11, 2,-22, 2, 1,-10,-14, -2,-15, 3,-12, -9, 3,-12, 0, 7, -6, -7,-15,-12, -1, 0; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='E'; M= -2, 1,-20, 1, 5,-15,-12, -6,-16, 3,-13,-10, 0, -7, 2, 2, -2, -5,-14,-15, -8, 3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: M= -4, -7,-18, -8, -2,-10,-15, -7, -6, 0, -6, -4, -6,-11, -3, 0, -4, -3, -4,-14, -4, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='R'; M= -4, -6,-15, -7, -3, -7, -9, -6, -9, -1,-10, -6, -2, -9, -3, 3, 1, 1, -7,-13, -2, -4; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='G'; M= -4, -1,-17, -1, -2, -8, 4, -7,-15, -3,-10, -8, 0,-11, -4, -2, -3, -7,-12,-13, -8, -3; D=-1; /I: I=-1; MD=-5; /M: SY='E'; M= -2, 3,-13, 4, 8,-13, -5, -3,-11, 1, -9, -7, 3, -4, 3, 0, 0, -3,-11,-15, -9, 5; D=-1; /I: I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5; /M: M= -5, -1, -9, -1, -4, -7, -9, -2, -7, -6, -4, -4, -2,-11, -5, -5, -3, -2, -5, -9, -4, -5; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='P'; M= -5, -2,-17, 2, 4,-15, -9, -6,-16, -2,-15,-12, -5, 8, -1, -5, -4, -7,-16, -5, -9, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='P'; M= -3, -4,-23, -2, 4,-22, -2,-10,-18, -3,-18,-12, -3, 9, 0, -6, 1, -4,-17,-23,-17, 1; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='M'; M= -9,-21,-20,-24,-18, 6,-17,-12, 9,-16, 14, 15,-18,-20,-14,-10,-17, -9, 5,-12, 2,-16; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='P'; M= -8,-14,-32, -8, -2,-25, -8,-17,-20, -7,-24,-16,-13, 53, -8,-12, -5, -6,-24,-26,-24, -8; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='Q'; M= -7, -4,-24, -2, 1,-13,-17, -1,-14, -2,-11, -7, -4, -2, 2, 0, -6, -7,-14,-20, -6, 0; D=-1; /I: I=-1; DM=-5; /M: SY='I'; M= -9,-23,-24,-27,-19, -2,-31,-16, 23,-18, 16, 13,-18,-23,-14,-17,-17, -7, 17,-21, 0,-19; /M: SY='F'; M= -9,-28,-18,-33,-27, 30,-29,-22, 15,-24, 14, 6,-24,-28,-29,-20,-16, -5, 18, -7, 11,-27; /M: SY='V'; M= -6,-28,-15,-31,-26, 4,-30,-26, 26,-25, 22, 13,-25,-27,-24,-22,-17, -4, 27,-24, -4,-26; /M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-28, 9,-32,-27, 29,-25, 18, 13,-26,-26,-25,-23,-19, -7, 27,-13, 0,-27; /M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-35,-27, 6,-33,-27, 32,-27, 19, 14,-23,-25,-23,-25,-17, -7, 27,-21, -2,-27; /M: SY='D'; M=-19, 47,-30, 66, 21,-39,-10, 0,-39, 0,-30,-29, 19,-10, 1,-10, 1, -9,-30,-40,-20, 11; /M: SY='E'; M=-10, 18,-27, 25, 34,-29,-11, -1,-29, 4,-23,-21, 10, -7, 9, -1, 2, -8,-27,-32,-20, 21; /M: SY='Y'; M=-10,-26,-21,-29,-23, 19,-26,-11, 5,-20, 6, 1,-23,-25,-20,-18,-20,-11, 0, 15, 26,-23; /M: SY='A'; M= 3, 2,-22, 2, 3,-20,-11, -4,-16, -6,-14,-10, -1, -8, 0, -9, 1, -4,-13,-26,-12, 1; /M: SY='A'; M= 5, 2,-21, 3, 5,-20, -4,-11,-17, -8,-13,-11, 0,-13, -3,-12, 4, -4,-13,-27,-17, 1; /M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-24, 22,-30,-21, 18,-27, 28, 14,-26,-28,-24,-20,-23, -8, 12, -8, 8,-24; /M: SY='M'; M= -4,-18,-21,-22,-15, -2,-19,-15, 2, -8, 2, 7,-15,-14,-12, -7,-10, -4, 4,-19, -4,-15; /M: SY='A'; M= 5, -3,-21, -3, 4,-21, -8, -8,-17, -5,-13,-11, -2, -6, -1, -6, 4, -1,-13,-27,-16, 1; /M: SY='S'; M= 1, 1,-22, 2, 4,-21, -4, -9,-20, -4,-18,-12, 1, -9, 0, -6, 6, -2,-15,-28,-17, 2; /M: M= -5, -6,-19, -8, -7, -4,-18, -5, -7,-12, -4, -2, -5,-14, -6,-12, -5, -4, -8,-22, -4, -7; /M: SY='D'; M= -7, 4,-26, 6, 2,-21, 0, -8,-25, -5,-21,-16, 2, -4, -4, -8, 2, -4,-21,-27,-15, -2; /M: SY='D'; M= -9, 6,-25, 8, 7,-21,-11, -2,-21, 3,-21,-14, 5,-10, 3, -1, 2, -2,-19,-25, -8, 4; /M: M= -8, -6,-22, -5, -2,-11,-16,-12,-14, -4, -9, -7, -7, -7, -5, -7, -7, -4,-12,-20, -9, -4; /I: I=-3; MD=-12; /M: SY='E'; M= -7, 0,-19, 2, 8,-15, -9, -5,-13, 2,-12, -7, -2, -4, 3, 1, -3, -6,-11,-17, -9, 5; D=-3; /I: I=-3; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12; /M: SY='I'; M= -5,-18,-12,-21,-16, 7,-20,-16, 14,-16, 9, 5,-15,-11,-15,-15,-10, -4, 12,-12, 0,-17; D=-3; /I: I=-3; DM=-12; /M: SY='M'; M= -3, -7,-19, -9, -1, -7,-15, -9, -2, -9, 2, 5, -8,-14, -3, -9, -6, -4, -3,-20, -7, -2; D=-3; /I: I=-3; DM=-12; /M: SY='B'; M= 0, 9,-21, 9, 6,-25, -4, -7,-22, 0,-20,-14, 7, -9, 4, -4, 6, 1,-18,-27,-17, 5; D=-3; /I: I=-3; DM=-12; /M: SY='A'; M= 2,-10,-19,-12, -3,-13,-15, -9, -7, -7, -1, -2, -8,-13, -3, -7, -6, -6, -7,-22, -9, -4; D=-3; /I: I=-3; DM=-12; /M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-33,-24, 18,-30,-22, 21,-28, 33, 16,-27,-28,-24,-21,-24, -9, 16,-16, 3,-24; /M: SY='T'; M= -3, -8,-19,-10, -6,-15,-16,-13, -5, -6, -9, -4, -6,-17, -4, -5, -1, 1, -1,-23,-11, -6; /M: SY='E'; M= -7, 0,-26, 0, 7,-22,-13, -4,-21, 5,-19,-11, 1, -9, 7, 5, -1, -4,-18,-21,-12, 6; /M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-33,-24, 5,-33,-20, 29,-27, 25, 17,-23,-22,-19,-23,-22, -9, 17,-15, 3,-24; /M: SY='A'; M= 13,-18,-16,-23,-16, -9,-13,-20, 7,-17, 5, 4,-16,-19,-13,-18, -3, -1, 10,-24,-12,-15; /M: SY='R'; M= -8, -6,-26, -8, 1,-21,-16, -3,-18, 7,-14, -7, -1, -8, 11, 20, -4, -6,-18,-23,-11, 4; /M: SY='E'; M=-11, -3,-27, -2, 10,-18,-21, 0,-14, 7, -8, -3, -3,-14, 7, 7, -9,-10,-14,-24, -8, 7; /M: SY='G'; M= 12, -8,-25,-11,-16,-27, 49,-19,-32,-17,-25,-18, -2,-17,-17,-20, 3,-14,-22,-21,-27,-16; /M: SY='R'; M= -8,-11,-27,-11, -2,-20,-12, -7,-23, 14,-14, -8, -5,-14, 3, 34, -8, -9,-16,-21,-13, -2; /M: SY='S'; M= 13, 3,-17, 2, 2,-25, -2, -9,-21, -3,-22,-15, 4,-11, 4, -8, 16, 3,-14,-29,-19, 3; /M: SY='V'; M= 4,-21,-15,-25,-20, 4,-20,-16, 7,-18, 9, 4,-19,-23,-18,-17,-10, -3, 10,-14, 1,-19; /M: SY='G'; M= -3, -6,-30, -6,-13,-28, 51,-15,-37,-12,-29,-19, 3,-19,-14,-12, 0,-17,-29,-20,-26,-14; /M: SY='I'; M= -8,-28,-13,-34,-28, 4,-33,-26, 30,-26, 18, 15,-23,-26,-23,-24,-17, -7, 27,-23, -3,-27; /M: SY='H'; M=-13, -7,-25,-10, -7, -4,-21, 47,-15,-12,-11, -1, 0,-21, -2, -6, -7,-11,-15,-22, 15, -7; /M: SY='L'; M= -5,-28,-15,-31,-24, 8,-29,-24, 22,-26, 29, 14,-27,-28,-23,-21,-20, -6, 21,-22, -3,-24; /M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-35,-26, 9,-33,-25, 31,-26, 19, 17,-23,-24,-22,-23,-19, -7, 24,-16, 1,-26; /M: SY='L'; M= -3,-27,-12,-30,-23, 7,-27,-22, 17,-24, 20, 11,-25,-27,-22,-21,-17, -6, 18,-18, -2,-23; /M: SY='A'; M= 20, -8,-10,-15,-11,-15, -7,-19, -8,-12,-12,-10, -5,-13,-11,-16, 14, 15, 1,-26,-14,-11; /M: SY='T'; M= 6, -5,-10,-10,-10,-16, -6,-16,-15, -8,-13, -9, -3,-15, -9, -6, 9, 14, -6,-28,-15,-10; /M: SY='Q'; M= -6, 1,-26, 0, 9,-31,-10, 0,-20, 2,-20, -7, 3, -9, 30, 2, 4, -3,-23,-25,-14, 19; /M: SY='R'; M=-10, -6,-25, -7, -1,-18,-15, -6,-21, 14,-17, -7, -1,-15, 4, 30, -2, -3,-15,-23,-11, -1; /M: SY='P'; M= -3,-15,-29,-12, -6,-15,-13,-17,-14,-11,-15,-11,-15, 20, -9,-15, -7, -6,-15,-12,-13, -9; /M: SY='N'; M= -4, 10,-22, 8, -1,-23, 4, -8,-22, -6,-20,-15, 13,-15, -4, -7, 7, 1,-19,-31,-18, -3; /M: SY='A'; M= 11,-10,-19,-14, -5,-13, -8,-10,-11, -9,-10, -7, -8,-15, -7,-11, 1, -2, -5,-15, -9, -7; /M: SY='D'; M= -5, 4,-21, 7, 3,-18,-12,-10,-12, -6,-12,-10, 0,-15, -5, -9, 1, -1, -7,-29,-13, -1; /M: SY='R'; M= -5, -6,-21, -8, -6,-15,-17,-11,-11, 4,-12, -7, -4,-16, -3, 10, -1, 0, -4,-25,-10, -6; /M: SY='I'; M= 0,-18,-22,-22,-15, -5,-20,-17, 8,-14, 5, 6,-15,-14,-12,-13, -9, -4, 5,-20, -5,-15; /M: SY='P'; M= -2, -6,-25, -6, -3,-22, -8,-14,-18, -3,-17,-12, -5, 5, -3, -7, 0, -1,-16,-23,-17, -4; /I: I=-6; MD=-21; /M: SY='S'; M= -4, -1,-16, -2, -4,-10, -2, -7,-11, -6,-11, -6, -1, -9, -5, -7, 3, 3, -8,-17, -5, -5; D=-6; /I: I=-6; MD=-21; /M: SY='D'; M= 0, 1,-14, 3, 1,-14, -2, -8,-11, -5,-10, -8, -1, -4, -4, -8, 3, 0, -8,-19,-11, -2; D=-6; /I: I=-6; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21; /M: SY='I'; M= -7,-26,-20,-29,-22, 4,-30,-22, 24,-23, 21, 15,-23,-25,-19,-19,-16, -4, 21,-23, -3,-22; /M: SY='R'; M=-15, -9,-28, -9, -1,-17,-18, -5,-21, 19,-12, -4, -5,-18, 4, 34,-11, -9,-15,-17, -6, -1; /M: SY='D'; M= 8, 10,-20, 11, 7,-26, -8, -8,-21, -1,-21,-17, 7, -8, 2, -7, 9, 0,-16,-30,-18, 4; /M: SY='N'; M= -7, 9,-23, 2, 2,-21,-10, 4,-14, -2,-15, -7, 17,-17, 12, -1, 1, -4,-19,-28,-11, 6; /M: SY='F'; M=-11,-23,-18,-29,-21, 18,-28,-16, 12,-21, 17, 11,-19,-24,-20,-17,-16, -3, 8,-15, 6,-20; /M: SY='S'; M= 0, -2,-24, -4, -3,-24, 3,-12,-22, -1,-22,-12, 2, -2, -3, -4, 4, -1,-18,-27,-19, -4; /M: SY='T'; M= 0,-12,-15,-17,-13, -3,-14, -6, -7,-14, -3, -3, -8,-20,-11,-13, -2, 2, -5,-16, 1,-12; /M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -7, 0,-21,-17, -2,-23, 21,-19, -9, 1,-18, 7, 39, -6, -6,-16,-23,-11, 1; /M: SY='I'; M= -3,-26,-22,-32,-25, 0,-29,-25, 28,-24, 17, 13,-21,-22,-20,-23,-15, -5, 21,-17, -2,-24; /M: SY='A'; M= 13,-11, -8,-14, -7,-18, -6,-17,-11,-12,-11, -9,-11,-10, -9,-16, 2, -3, -3,-26,-17, -8; /M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-27,-19, 15,-28,-11, 12,-25, 27, 14,-22,-25,-18,-18,-22, -9, 6,-16, 6,-19; /M: SY='R'; M= -7,-11,-26,-13,-10,-13, 1,-11,-19, 2,-14, -6, -6,-16, -7, 8, -7, -9,-14,-18, -8,-10; /M: SY='L'; M= -4,-17, -9,-21,-16, 0,-22,-14, 3,-17, 7, 4,-14,-22,-14,-13, -9, -3, 6,-24, -5,-15; /M: SY='N'; M= -3, 1,-22, -2, -6,-16, -8, -8,-11, -9,-11, -5, 2,-10, -6,-11, 0, -1,-10,-27,-12, -7; /M: SY='D'; M= -7, 20,-22, 24, 8,-25, -7, -6,-27, -2,-25,-21, 13, -9, -1, -5, 10, 4,-20,-34,-18, 3; /M: SY='P'; M= 2, -4,-27, -2, 3,-25, -8,-12,-20, -1,-22,-14, -4, 12, -1, -8, 0, -7,-18,-27,-20, 0; /M: SY='D'; M= -5, 8,-23, 12, 7,-24, 0, -8,-23, -4,-21,-15, 4,-13, -3, -8, 5, -3,-16,-30,-17, 2; /M: SY='E'; M= -6, 10,-26, 15, 22,-26, -9, -7,-25, 0,-18,-17, 3, -5, 3, -6, 1, -5,-21,-30,-19, 12; /M: SY='S'; M= 3, -7,-19, -8, -7,-15, -3, -9,-15, -8,-16,-11, -2,-15, -3, -6, 10, 3,-10,-24, -8, -6; /M: SY='R'; M= -6, -3,-21, -5, 0,-17,-17, -7,-13, 3,-13, -7, 0,-16, 3, 10, -2, -4,-10,-25,-11, 0; /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;» more |
Numerical results [info]
| Total number of hits | 160 in 130 different sequences |
| Number of true positive hits | 160 in 130 different sequences |
| Number of 'unknown' hits | 0 |
| Number of false positive hits | 0 |
| Number of false negative sequences | 2 |
| Number of 'partial' sequences | 0 |
| Precision (true positives / (true positives + false positives)) | 100.00 % |
| Recall (true positives / (true positives + false negatives)) | 98.77 % |
Comments [info]
| Matrix type [info] | protein_domain |
| Scaling database [info] | reversed |
| Author [info] | CJA_Sigrist |
| Taxonomic range [info] | Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria) |
| Maximum number of repetitions [info] | 3 |
| Feature key [info] | DOMAIN |
| Feature description [info] | FtsK |
| Version [info] | 6 |
Cross-references [info]
| UniProtKB/Swiss-Prot True positive sequences |
130 sequences
ECC1A_MYCTO (P9WNB2), ECC1A_MYCTU (P9WNB3), ECC1B_MYCS2 (A0QNJ2), ECC1B_MYCSE (L8FPJ2), ECC1B_MYCTO (P9WNB0), ECC1B_MYCTU (P9WNB1), ECCC3_MYCS2 (A0QQ40), ECCC3_MYCTO (P9WNA8), ECCC3_MYCTU (P9WNA9), ECCC4_MYCTO (P9WNA6), ECCC4_MYCTU (P9WNA7), ECCC5_MYCMM (B2HST4), ECCC5_MYCTO (P9WNA4), ECCC5_MYCTU (P9WNA5), ECCC_GEOTN (A4IKE7), ECCC_THECD (D1A4G7), ESSC_STAA8 (Q2G184), ESSC_STAAC (Q5HJ86), ESSC_STAAE (P0C048), ESSC_STAAM (Q932J9), ESSC_STAAN (Q99WT9), ESSC_STAAR (Q6GK24), ESSC_STAAS (Q6GCI5), ESSC_STAAW (Q8NYF3), FTSK1_NEIMA (Q9JU31), FTSK1_NEIMB (Q9JZ36), FTSK1_RALN1 (Q8XRH0), FTSK2_NEIMA (Q9JUK9), FTSK2_NEIMB (Q9JZG4), FTSK2_RALN1 (Q8XWX9), FTSKL_DEIRA (Q9RXB5), FTSKL_NOSS1 (Q8ZS46), FTSK_AGRFC (Q8U526), FTSK_AZOBR (O83045), FTSK_BACAN (Q81WP2), FTSK_BACCR (Q81A03), FTSK_BIFLO (Q8G4H3), FTSK_BORBU (O51272), FTSK_BRADU (Q89WR2), FTSK_BRUME (Q8YJB8), FTSK_BRUSU (Q8FYI0), FTSK_CALS4 (Q8R5S4), FTSK_CAMJE (Q0PA12), FTSK_CAMJJ (A1VZM0), FTSK_CAUVC (Q9A262), FTSK_CHLMU (Q9PLI7), FTSK_CHLPN (Q9Z726), FTSK_CHLTE (Q8KBK0), FTSK_CHLTR (O84744), FTSK_CLOAB (Q97I41), FTSK_CLOPE (Q8XJS8), FTSK_CLOTE (Q895I8), FTSK_COREF (Q8FPC1), FTSK_CORGL (Q8NP53), FTSK_COXBU (P39920), FTSK_ECO57 (Q8X5H9), FTSK_ECOL6 (Q8FJC7), FTSK_ECOLI (P46889), FTSK_HAEDU (P59836), FTSK_HAEIN (P45264), FTSK_HALH5 (Q9KA95), FTSK_HELPJ (Q9ZM87), FTSK_HELPY (O25722), FTSK_LACLA (Q9CF25), FTSK_LACLM (A2RJB8), FTSK_LACPL (Q88V72), FTSK_LEPIC (Q72TG0), FTSK_LEPIN (Q8F1W7), FTSK_LISIN (Q92BW9), FTSK_LISMO (Q8Y7A3), FTSK_MYCLE (O05560), FTSK_MYCTO (P9WNA2), FTSK_MYCTU (P9WNA3), FTSK_OCEIH (Q8EQS7), FTSK_PASMU (Q9CP13), FTSK_PSEAE (Q9I0M3), FTSK_PSEPK (Q88FS8), FTSK_PSESM (Q87ZS5), FTSK_PSEU2 (Q9Z3U1), FTSK_RHILO (Q98EH3), FTSK_RHIME (Q92L89), FTSK_RICBR (Q1RK79), FTSK_RICCN (Q92G50), FTSK_RICFE (Q4UJY1), FTSK_RICPR (Q9ZCD4), FTSK_RICTY (Q68VS6), FTSK_SALTI (Q8Z814), FTSK_SALTY (Q8ZQD5), FTSK_SHEON (Q8EER3), FTSK_SHIFL (Q83S00), FTSK_SPOUR (Q9RNV1), FTSK_STAAC (Q5HGF5), FTSK_STAAM (P64164), FTSK_STAAN (P64165), FTSK_STAAR (Q6GHF9), FTSK_STAAS (Q6G9T7), FTSK_STAAW (Q8NWY8), FTSK_STAEQ (Q5HPR5), FTSK_STAES (Q8CMM5), FTSK_STRA3 (Q8E418), FTSK_STRA5 (Q8CX05), FTSK_STRAW (Q82K93), FTSK_STRCO (O86810), FTSK_STRMU (Q8DSX7), FTSK_STRP1 (Q9A155), FTSK_STRP3 (P0DB16), FTSK_STRP6 (Q5XDI2), FTSK_STRP8 (Q8P276), FTSK_STRPN (P64166), FTSK_STRPQ (P0DB17), FTSK_STRR6 (P64167), FTSK_TREPA (O83964), FTSK_TROW8 (Q83MI4), FTSK_TROWT (Q83MS8), FTSK_VIBCH (Q84I33), FTSK_VIBPA (Q87QP4), FTSK_VIBVU (Q8D8M2), FTSK_XANAC (Q8PL00), FTSK_XANCP (Q8P993), FTSK_XYLFA (Q9PDC9), FTSK_XYLFT (Q87DL2), FTSK_YERPE (Q8ZGC7), SFTA_BACSU (C0SP86), SP3E_BACSU (P21458), SPI_STRAJ (Q53308), TRA_STRLI (P22409), TRSA_STRAM (Q07197), Y3709_CLOAB (Q04351), YDCQ_BACSU (P96634), YUKB_BACSU (C0SPA7)» more
|
| UniProtKB/Swiss-Prot False negative sequences |
2 sequences
GLCI1_MOUSE (Q8K3I9), RAD51_ARATH (P94102) |
| PDB [Detailed view] |
19 PDB
2IUS; 2IUT; 2IUU; 4LYA; 4N1A; 4NH0; 5FV0; 6J17; 6J18; 6J19; 6JD4; 6T8B; 6T8G; 6T8O; 7NP7; 7NPR; 7NPT; 7NPU; 7NPV » more |