Entry: PS50901

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] FTSK
Accession [info] PS50901
Entry type [info] MATRIX
Date [info] MAR-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); MAR-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50901
Associated ProRule [info] PRU00289

Name and characterization of the entry

Description [info] FtsK domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=191;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=186;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4803104; R2=0.0182181; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=10646.98325; R2=32.05981; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=743; N_SCORE=16.0; H_SCORE=22124; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=127; N_SCORE=4.8; H_SCORE=14206; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='Q'; M= -7, -8,-26, -9, -5,-20,  1, -7,-13, -8, -6,  1, -6,-18,  4, -4, -7,-10,-14,-23,-13, -1;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-27,  6, 13,-27, -7, -5,-26,  5,-23,-15,  4, -5, 10,  4,  2, -4,-23,-27,-17, 11;
/M: SY='P'; M= -8, -5,-32, -1,  1,-23,-13,-12,-18, -6,-22,-16, -6, 33, -7,-13, -5, -6,-22,-26,-17, -6;
/M: SY='V'; M= -2,-27,-17,-29,-24,  4,-27,-23, 20,-20, 14, 10,-25,-26,-21,-18,-15, -4, 25,-16, -1,-23;
/M: SY='Y'; M= -7,-15,-18,-17, -9, -4,-23, -7, -4, -9, -5, -2,-14,-18, -8, -8, -8, -3,  0,-11,  2,-10;
/M: SY='W'; M= -5,-27,-21,-31,-24,  8,-21,-21,  8,-23,  9,  3,-24,-26,-21,-21,-19,-11,  5, 10,  7,-23;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='D'; M=-14, 32,-28, 41, 14,-33, -9,  3,-31,  0,-27,-23, 19, -8,  2, -7,  2, -8,-27,-36,-18,  7;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-21,-30,-22, 18,-27,-17, 14,-24, 24, 13,-23,-24,-21,-19,-20, -7,  8,-10,  8,-21;
/M: SY='R'; M= -1, -3,-23, -5, -3,-20, -4, -5,-18,  1,-16, -9,  0,-15, -1,  4,  1, -4,-14,-24,-12, -3;
/M: SY='E'; M= -3,  5,-23,  4,  8,-23, -7, -6,-23,  6,-21,-14,  6,-12,  2,  4,  5,  0,-17,-29,-16,  4;
/I:         I=-5; MD=-17;
/M: SY='B'; M= -5,  4,-18,  2, -1,-12,-12, -7,-11, -8,-12, -9,  4,-11, -7,-10,  1,  0, -9,-27,-11, -4; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='P'; M= -3, -8,-27, -6, -5,-23,  2,-15,-22, -9,-25,-17, -4, 26, -9,-12,  3, -2,-22,-27,-23, -9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-17;
/M: SY='H'; M=-17,  3,-28, -1, -3,-16,-14, 67,-24, -9,-19, -4, 14,-20,  4, -1, -7,-15,-26,-29, 11, -3;
/M: SY='L'; M= -4,-24,-23,-28,-22, -2,-14,-21, 13,-23, 17, 11,-21,-24,-18,-21,-17, -9,  8,-12, -5,-21;
/M: SY='L'; M= -2,-25,-19,-28,-20,  2,-21,-20, 16,-24, 29, 16,-24,-25,-18,-20,-19, -7, 11,-21, -5,-19;
/M: SY='I'; M= -5,-28,-17,-33,-28, -1,-31,-25, 32,-25, 15, 15,-23,-25,-22,-24,-16, -7, 31,-25, -5,-27;
/M: SY='A'; M=  5,-18,-15,-23,-18,  1, -8,-17, -2,-19, -1, -3,-14,-21,-18,-19, -5, -5,  1,-15, -4,-18;
/M: SY='G'; M=  1, -9,-29,-10,-19,-29, 65,-19,-39,-19,-30,-20,  0,-19,-19,-19,  2,-18,-29,-21,-29,-19;
/M: SY='S'; M=  4, -4,-21, -6, -2,-21, -2,-11,-19, -1,-17,-10, -1,-12, -1,  0,  5,  1,-13,-26,-17, -2;
/M: SY='T'; M=  1, -5,-20, -7, -2,-21,-13,-14,-17, -6,-21,-14, -3, 13, -1, -9, 13, 17,-14,-30,-18, -3;
/M: SY='G'; M= -4, -8,-29, -7, -8,-27, 41,-14,-35, -8,-27,-17,  0,-17, -6, -7, -1,-16,-28,-20,-24, -7;
/M: SY='S'; M=  3, -6, -1, -8, -8,-14, -4,-11,-19,-11,-22,-15,  0,-16, -7,-11, 20, 13,-10,-30,-10, -8;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-11,-20,-28, 68,-20,-39,-20,-29,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-29,-19,-29,-20;
/M: SY='K'; M=-11, -1,-30, -1,  9,-29,-20, -9,-30, 47,-29,-10,  0,-11, 10, 32, -9, -9,-20,-20,-10,  9;
/M: SY='T'; M=  5,  0,-11, -5, -5,-16, -5,-15,-17,-10,-22,-16,  5,-10, -5,-10, 30, 31, -7,-35,-16, -5;
/M: SY='T'; M= -2, -1,-18, -7, -4,-12,-18,-10, -8, -7,-11, -6,  1,-15, -3, -8,  6, 15, -4,-22, -5, -4;
/M: SY='F'; M=  2,-19,-12,-25,-18, 11,-20,-20,  2,-21,  9,  1,-16,-22,-19,-18, -7,  2,  5,-17, -1,-18;
/M: SY='L'; M= -5,-26,-21,-28,-19,  4,-26,-21, 18,-26, 32, 15,-24,-25,-17,-20,-21, -7, 11,-20, -3,-19;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-24,-11, -3,-16,-19,  4,-11,  2, -6,  2, -3,-18, 11, 12, -7, -7,-12,-21, -4,  2;
/M: SY='T'; M=  5, -3,-14,-10,-10,-10,-11,-14,-11,-10,-14,-11,  1,-15, -9,-11, 15, 20, -4,-23, -8, -9;
/M: SY='I'; M= -8,-29,-23,-35,-26, 12,-33,-24, 30,-28, 27, 16,-24,-25,-22,-24,-22, -9, 19,-17,  3,-25;
/M: SY='I'; M=  0,-25,-17,-30,-23, -2,-26,-24, 23,-23, 18, 14,-22,-23,-19,-22,-14, -4, 21,-23, -6,-23;
/M: SY='M'; M= -3,-14,-13,-18,-11, -6,-18,-11, -2,-11,  3,  6,-13,-20, -9, -9, -8, -4, -1,-22, -5,-10;
/M: SY='S'; M=  7,  3,-15,  1,  4,-23, -4, -7,-20, -5,-22,-15,  6,-12,  5, -8, 15,  4,-15,-30,-17,  4;
/M: SY='L'; M=  1,-25,-19,-29,-20,  5,-23,-20, 15,-24, 26, 13,-22,-24,-18,-20,-17, -7, 11,-20, -3,-19;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='A'; M= 19,-14, -5,-20,-14,-10, -9,-18, -1,-15,  3,  1,-13,-16,-12,-18, -2, -2,  3,-20,-13,-13; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='R'; M= -3, -9,-16,-10, -4, -6,-15, -7, -5, -2, -1, -1, -6,-14, -4,  5, -5, -2, -3,-16, -4, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-14;
/M: SY='T'; M= -4, -2,-13, -6, -3,-10,-13, -3, -9,  2, -8, -3,  0,-11,  1,  5,  1,  7, -6,-17, -5, -2; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='H'; M= -9, -1,-17, -4, -4, -2,-11, 22,-12, -3,-10, -4,  4,-13, -1, -1, -4, -5,-13,-10, 12, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='S'; M=  1, -3,-10, -5, -3,-14, -3, -9,-14, -6,-15,-11,  2, -7, -4, -4, 14, 12, -9,-25,-13, -4; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-14;
/M: SY='P'; M= -6,-12,-29, -8, -2,-23,-18,-11,-19, -6,-21,-15,-12, 37, -7, -9, -7, -7,-21,-24,-19, -8;
/M: SY='E'; M= -6,  6,-26,  8, 19,-25,-14,  3,-23,  3,-19,-13,  4, -6, 11,  1,  1, -5,-22,-27,-12, 14;
/M: SY='E'; M=-11,  7,-25, 10, 16,-26,-17, -1,-22,  6,-20,-12,  4, -6, 10,  5, -1, -6,-21,-29,-15, 12;
/M: SY='V'; M=  7,-20,-13,-24,-20, -5,-15,-21,  9,-19,  4,  2,-17,-23,-19,-19, -5, -2, 16,-23,-10,-20;
/M: SY='Q'; M= -9,  3,-25,  1,  4,-21,-16,  2,-17,  5,-17, -8,  5,-15,  8,  7, -1, -3,-15,-25, -8,  5;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-17,-34,-26, 22,-31,-22, 20,-27, 26, 14,-26,-28,-26,-21,-22, -8, 17,-15,  6,-25;
/M: SY='Y'; M=-10,-18,-21,-21,-20, 12,-24, -6,  3,-15,  1,  1,-17,-26,-16,-15,-15, -7,  2,  5, 23,-19;
/M: SY='L'; M=-10,-27,-11,-32,-25,  9,-26,-21, 17,-28, 19, 10,-22,-27,-23,-23,-20,-10, 13,-19,  0,-25;
/M: SY='I'; M= -1,-25,-15,-31,-24,  2,-26,-24, 22,-24, 13, 10,-20,-23,-21,-23,-12, -5, 20,-22, -5,-24;
/M: SY='D'; M=-18, 47,-29, 66, 18,-39, -8, -1,-39, -1,-30,-29, 20,-10, -1,-10,  0,-10,-29,-39,-20,  9;
/M: SY='P'; M=-11,-19,-19,-19,-15,  4,-13,-13,-11,-18, -8, -7,-16,  7,-18,-18,-12, -9,-13,-14,  1,-18;
/M: SY='K'; M= -7, -2,-28, -2,  1,-28,  3,-11,-31, 22,-28,-14,  1,-11,  1, 17, -4,-10,-22,-22,-16,  1;
/M: SY='G'; M= -4,  2,-23, -2, -6,-19, 11, -7,-25, -3,-22,-13,  9,-17, -6,  1,  4, -2,-20,-26,-17, -7;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G'; M=  3, -2,-18, -5, -9,-17, 12, -9,-17, -9,-17,-11,  4,-16, -9,-10,  4, -3,-11,-23,-15,-10; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-17;
/M: SY='G'; M=  2,  3,-21,  4,  2,-23, 10,-11,-23, -8,-18,-14,  2,-12, -4,-11,  5, -1,-17,-25,-19, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-17;
/M: SY='L'; M= -8,-25,-21,-27,-18, 11,-25,-16, 12,-24, 32, 15,-24,-24,-18,-18,-23, -9,  6,-16,  3,-18;
/M:         M=  0, -7,-22, -8, -4,-14,-13,-10, -9, -6, -5, -4, -6,-15, -4, -7, -4, -4, -7,-23, -8, -5;
/I:         I=-7; MD=-23;
/M: SY='P'; M= -1,  1,-20,  3,  0,-22,-10,-10,-18, -3,-18,-12, -2,  5, -4, -8,  0, -3,-15,-26,-16, -3; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='F'; M=-11,-24,-18,-27,-19, 17,-26,-17,  7,-21, 13,  6,-22,-21,-20,-17,-19, -9,  4,  1,  9,-19; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-23;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-22, -2,  2,-20, -5, -7,-18, -1,-16,-11,  0,-10, -1, -3,  1, -3,-14,-21,-12,  0; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-23;
/M: SY='D'; M=-10,  5,-29,  8,  4,-27, -4, -1,-26,  5,-24,-14,  3, -6,  2,  3, -4,-11,-23,-23,-13,  2;
/M: SY='L'; M= -8,-23,-21,-24,-16,  5,-26,-18, 12,-22, 26, 11,-21,-22,-16,-15,-18, -6,  6,-21, -3,-16;
/M: SY='P'; M= -2, -8,-25, -7, -1,-23,-12,-12,-17, -6,-21,-14, -6, 26, -7,-10, -3, -7,-19,-29,-21, -6;
/M: SY='H'; M=-12, -6,-24, -7, -1,-15,-18, 41,-20, -7,-12, -3, -1,-17,  4, -2, -9,-13,-20,-20,  8, -1;
/M: SY='V'; M= -5,-20,-16,-23,-18, -1,-24,-17, 11,-15,  6,  6,-18,-22,-17,-12, -9,  1, 17,-23, -4,-19;
/M: SY='A'; M=  7,-10,-17,-12, -6,-14, -2,-14,-14, -8,-10, -8, -8,-16, -9, -9,  0, -3, -7,-23,-14, -7;
/M: SY='A'; M=  7,  0,-22,  1, -3,-24,  6,-15,-21, -5,-18,-14, -2,-11, -8,-11,  2, -4,-13,-26,-19, -5;
/M: SY='Y'; M= -6,-15,-22,-18,-15, -3,-17, -8, -1,-12, -6, -2,-12,-16,-12,-10, -6, -2,  2,-13,  4,-15;
/M: SY='V'; M=  6,-18,-18,-22,-16, -2,-19,-19,  9,-17,  4,  2,-15,-20,-17,-18, -6, -3, 13,-22, -7,-17;
/I:         I=-5; MD=-16;
/M: SY='T'; M=  3, -7, -9,-11, -9,-10,-11,-13, -4,-10, -6, -4, -5,-12, -8,-12,  4,  8, -1,-22, -8, -9; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-16;
/M: SY='N'; M= -1, -2,-14, -6, -6, -9, -8, -4, -6, -4, -7, -3,  2, -9, -5,  0, -1, -2, -4,-18, -8, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='D'; M= -7,  8,-19, 12,  6,-14,-11, -3,-16, -2,-12,-12,  2,-11, -2, -5,  0, -1,-13,-19, -3,  2; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-16;
/M: SY='D'; M=-10, 17,-23, 22, 14,-23,-10,  0,-22,  1,-19,-15, 10,-10,  5, -3,  1, -6,-19,-27,-13,  9; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -1,-10,-22, -9, -3,-16, -8,-12,-12, -5,-12, -7, -8,  4, -5, -8, -1, -2,-10,-23,-14, -5; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-16;
/M: SY='E'; M= -6, 11,-24, 15, 17,-25,-14, -2,-23,  2,-19,-16,  5,-11,  5,  0,  2, -3,-18,-29,-14, 10;
/M: SY='K'; M= -6,  4,-25,  5,  7,-24, -9, -7,-23,  9,-17,-11,  2,-13,  4,  5, -2, -5,-18,-25,-13,  5;
/M: SY='V'; M=  2,-22,-18,-27,-22,  0,-24,-23, 19,-21, 12, 11,-20,-22,-19,-21,-10, -2, 20,-23, -6,-21;
/M: SY='E'; M= -1, -2,-23, -2,  7,-17,-16, -5,-12, -1, -9, -6, -3,-12,  1, -2, -3, -6,-11,-24,-10,  3;
/M: SY='R'; M= -8,  6,-25,  6, 14,-25,-15, -3,-25, 16,-22,-14,  8,-12, 11, 19,  1, -5,-20,-27,-15, 11;
/M: SY='M'; M=  0,-21,-10,-27,-19,  6,-23,-17,  8,-18, 12, 13,-19,-23,-16,-17,-12, -3,  9,-20, -3,-17;
/M: SY='L'; M= -5,-26,-18,-29,-22,  4,-28,-20, 21,-23, 23, 16,-24,-26,-20,-18,-17, -4, 21,-23, -3,-22;
/M: SY='D'; M= -3,  5,-24,  7,  6,-24, -9, -7,-23,  4,-18,-13,  3,-13,  4,  7,  2, -3,-17,-27,-16,  4;
/M: SY='E'; M= -2, -7,-24, -8,  5,-12,-17, -9,-13, -2,-11, -8, -7,-14,  0, -1, -3, -3,-12, -9, -4,  2;
/M: SY='L'; M= -6,-26,-18,-31,-22,  7,-29,-21, 21,-24, 26, 16,-22,-25,-19,-19,-20, -7, 15,-20, -1,-22;
/M: SY='A'; M=  2, -9,-12,-11, -7,-14,-17,-13, -7, -5, -8, -5, -9,-18, -6, -8, -2, -2,  0,-24,-11, -7;
/M: SY='E'; M=  5,  2,-22,  3,  6,-24, -3,-10,-21,  0,-19,-14,  0,-10, -1, -6,  2, -5,-15,-26,-17,  2;
/M: SY='E'; M=-10,  2,-27,  6, 27,-21,-19, -5,-17,  2,-10,-10, -3,-10,  7, -1, -6, -9,-17,-27,-14, 16;
/M: SY='M'; M= -9,-25,-23,-32,-23,  2,-29,-16, 28,-21, 24, 31,-22,-21,-13,-19,-20, -8, 17,-20,  0,-20;
/M: SY='E'; M= -7,  9,-26, 11, 14,-25,-14, -2,-23,  6,-21,-14,  7, -5,  7,  2,  1, -5,-22,-29,-15, 10;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-22, -6,  3,-19,-14, -7,-20,  9,-15, -9, -2,-15,  4, 17, -3, -6,-15,-23,-11,  2;
/M: SY='R'; M=-18,-11,-29,-11, -1,-20,-21, -3,-26, 24,-18, -9, -3,-14,  8, 57, -9, -8,-17,-21,-11, -1;
/M: SY='K'; M= -8, -5,-27, -6,  4,-14,-21, -4,-13,  7,-11, -5, -5,-13,  7,  3, -7, -7,-14,-16,  2,  4;
/M: SY='E'; M= -3, -1,-25, -1, 11,-23,-14, -5,-17,  4,-16, -9, -1, -7,  7,  1, -1, -5,-16,-25,-13,  8;
/M: SY='L'; M=  1,-17,-23,-19, -9, -8,-20,-16,  3,-16,  7,  1,-16,-11,-10,-16,-10, -5, -1,-19, -9,-11;
/M: SY='F'; M=-11,-26,-18,-30,-21, 21,-28,-19, 11,-24, 20, 11,-22,-19,-21,-19,-20, -8,  6,-14,  5,-21;
/M: SY='K'; M= -5,  0,-25,  0,  2,-23, -8, -3,-24, 11,-22,-12,  3,-11,  2, 11,  0, -5,-18,-25,-12,  1;
/M: SY='E'; M= -7,  4,-22,  6, 10,-24,-11, -4,-24,  5,-18,-13,  3,-13,  9,  6,  0, -5,-20,-26,-13,  9;
/M: SY='H'; M= -2, -8,-19,-12, -7,-10,-14,  1,-11, -7, -6, -4, -3,-19, -4, -1, -3, -4, -9,-22, -4, -7;
/M: SY='G'; M= -6, -2,-26, -2, -5,-23, 12, -5,-27, -2,-23,-14,  3,-13, -4,  1,  1, -7,-21,-24,-15, -5;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='V'; M= -3,-11,-19,-13, -9, -9,-16,-10, -1, -3, -6,  0, -8,-18, -6, -1, -5, -5,  4,-21, -6, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='R'; M= -3, -1,-20, -2,  0,-17,-10, -8,-16,  2,-14,-10, -1,-14,  0,  4, -1, -3,-11,-22,-10, -1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='N'; M= -2,  5,-19,  5,  2,-18, -8, -1,-16, -4,-15,-10,  6,-13,  0, -6,  6,  0,-13,-27,-11,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='I'; M= -2,-15,-22,-20,-15, -5,-18,-16,  6,-15,  5,  3,-12,-19,-10,-13,-11, -5,  2, -4, -3,-13; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='S'; M= -2,  1,-21,  1, -1,-20,  1, -7,-18, -2,-19,-11,  2,-11, -3, -5,  3, -4,-13,-22,-13, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -2, -1,-20, -1,  3,-14,-14, -7,-12,  2,-10, -4, -4, -9,  0,  0, -3, -4, -9,-18, -9,  1; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='Y'; M= -7, -8,-21,-11, -9,  6,-14,  1, -8, -8, -6, -5, -5,-15, -6, -7, -5, -4,-10, -3, 19, -9; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='R'; M=-11,  2,-22,  2,  1,-10,-14, -2,-15,  3,-12, -9,  3,-12,  0,  7, -6, -7,-15,-12, -1,  0; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -2,  1,-20,  1,  5,-15,-12, -6,-16,  3,-13,-10,  0, -7,  2,  2, -2, -5,-14,-15, -8,  3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M:         M= -4, -7,-18, -8, -2,-10,-15, -7, -6,  0, -6, -4, -6,-11, -3,  0, -4, -3, -4,-14, -4, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='R'; M= -4, -6,-15, -7, -3, -7, -9, -6, -9, -1,-10, -6, -2, -9, -3,  3,  1,  1, -7,-13, -2, -4; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='G'; M= -4, -1,-17, -1, -2, -8,  4, -7,-15, -3,-10, -8,  0,-11, -4, -2, -3, -7,-12,-13, -8, -3; D=-1;
/I:         I=-1; MD=-5;
/M: SY='E'; M= -2,  3,-13,  4,  8,-13, -5, -3,-11,  1, -9, -7,  3, -4,  3,  0,  0, -3,-11,-15, -9,  5; D=-1;
/I:         I=-1; MI=0; MD=-5; IM=0; DM=-5;
/M:         M= -5, -1, -9, -1, -4, -7, -9, -2, -7, -6, -4, -4, -2,-11, -5, -5, -3, -2, -5, -9, -4, -5; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -5, -2,-17,  2,  4,-15, -9, -6,-16, -2,-15,-12, -5,  8, -1, -5, -4, -7,-16, -5, -9,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -3, -4,-23, -2,  4,-22, -2,-10,-18, -3,-18,-12, -3,  9,  0, -6,  1, -4,-17,-23,-17,  1; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='M'; M= -9,-21,-20,-24,-18,  6,-17,-12,  9,-16, 14, 15,-18,-20,-14,-10,-17, -9,  5,-12,  2,-16; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='P'; M= -8,-14,-32, -8, -2,-25, -8,-17,-20, -7,-24,-16,-13, 53, -8,-12, -5, -6,-24,-26,-24, -8; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='Q'; M= -7, -4,-24, -2,  1,-13,-17, -1,-14, -2,-11, -7, -4, -2,  2,  0, -6, -7,-14,-20, -6,  0; D=-1;
/I:         I=-1; DM=-5;
/M: SY='I'; M= -9,-23,-24,-27,-19, -2,-31,-16, 23,-18, 16, 13,-18,-23,-14,-17,-17, -7, 17,-21,  0,-19;
/M: SY='F'; M= -9,-28,-18,-33,-27, 30,-29,-22, 15,-24, 14,  6,-24,-28,-29,-20,-16, -5, 18, -7, 11,-27;
/M: SY='V'; M= -6,-28,-15,-31,-26,  4,-30,-26, 26,-25, 22, 13,-25,-27,-24,-22,-17, -4, 27,-24, -4,-26;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-21,-34,-28,  9,-32,-27, 29,-25, 18, 13,-26,-26,-25,-23,-19, -7, 27,-13,  0,-27;
/M: SY='I'; M= -6,-29,-19,-35,-27,  6,-33,-27, 32,-27, 19, 14,-23,-25,-23,-25,-17, -7, 27,-21, -2,-27;
/M: SY='D'; M=-19, 47,-30, 66, 21,-39,-10,  0,-39,  0,-30,-29, 19,-10,  1,-10,  1, -9,-30,-40,-20, 11;
/M: SY='E'; M=-10, 18,-27, 25, 34,-29,-11, -1,-29,  4,-23,-21, 10, -7,  9, -1,  2, -8,-27,-32,-20, 21;
/M: SY='Y'; M=-10,-26,-21,-29,-23, 19,-26,-11,  5,-20,  6,  1,-23,-25,-20,-18,-20,-11,  0, 15, 26,-23;
/M: SY='A'; M=  3,  2,-22,  2,  3,-20,-11, -4,-16, -6,-14,-10, -1, -8,  0, -9,  1, -4,-13,-26,-12,  1;
/M: SY='A'; M=  5,  2,-21,  3,  5,-20, -4,-11,-17, -8,-13,-11,  0,-13, -3,-12,  4, -4,-13,-27,-17,  1;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-33,-24, 22,-30,-21, 18,-27, 28, 14,-26,-28,-24,-20,-23, -8, 12, -8,  8,-24;
/M: SY='M'; M= -4,-18,-21,-22,-15, -2,-19,-15,  2, -8,  2,  7,-15,-14,-12, -7,-10, -4,  4,-19, -4,-15;
/M: SY='A'; M=  5, -3,-21, -3,  4,-21, -8, -8,-17, -5,-13,-11, -2, -6, -1, -6,  4, -1,-13,-27,-16,  1;
/M: SY='S'; M=  1,  1,-22,  2,  4,-21, -4, -9,-20, -4,-18,-12,  1, -9,  0, -6,  6, -2,-15,-28,-17,  2;
/M:         M= -5, -6,-19, -8, -7, -4,-18, -5, -7,-12, -4, -2, -5,-14, -6,-12, -5, -4, -8,-22, -4, -7;
/M: SY='D'; M= -7,  4,-26,  6,  2,-21,  0, -8,-25, -5,-21,-16,  2, -4, -4, -8,  2, -4,-21,-27,-15, -2;
/M: SY='D'; M= -9,  6,-25,  8,  7,-21,-11, -2,-21,  3,-21,-14,  5,-10,  3, -1,  2, -2,-19,-25, -8,  4;
/M:         M= -8, -6,-22, -5, -2,-11,-16,-12,-14, -4, -9, -7, -7, -7, -5, -7, -7, -4,-12,-20, -9, -4;
/I:         I=-3; MD=-12;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-19,  2,  8,-15, -9, -5,-13,  2,-12, -7, -2, -4,  3,  1, -3, -6,-11,-17, -9,  5; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-12; IM=0; DM=-12;
/M: SY='I'; M= -5,-18,-12,-21,-16,  7,-20,-16, 14,-16,  9,  5,-15,-11,-15,-15,-10, -4, 12,-12,  0,-17; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-12;
/M: SY='M'; M= -3, -7,-19, -9, -1, -7,-15, -9, -2, -9,  2,  5, -8,-14, -3, -9, -6, -4, -3,-20, -7, -2; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-12;
/M: SY='B'; M=  0,  9,-21,  9,  6,-25, -4, -7,-22,  0,-20,-14,  7, -9,  4, -4,  6,  1,-18,-27,-17,  5; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-12;
/M: SY='A'; M=  2,-10,-19,-12, -3,-13,-15, -9, -7, -7, -1, -2, -8,-13, -3, -7, -6, -6, -7,-22, -9, -4; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-12;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-33,-24, 18,-30,-22, 21,-28, 33, 16,-27,-28,-24,-21,-24, -9, 16,-16,  3,-24;
/M: SY='T'; M= -3, -8,-19,-10, -6,-15,-16,-13, -5, -6, -9, -4, -6,-17, -4, -5, -1,  1, -1,-23,-11, -6;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-26,  0,  7,-22,-13, -4,-21,  5,-19,-11,  1, -9,  7,  5, -1, -4,-18,-21,-12,  6;
/M: SY='I'; M=-10,-28,-25,-33,-24,  5,-33,-20, 29,-27, 25, 17,-23,-22,-19,-23,-22, -9, 17,-15,  3,-24;
/M: SY='A'; M= 13,-18,-16,-23,-16, -9,-13,-20,  7,-17,  5,  4,-16,-19,-13,-18, -3, -1, 10,-24,-12,-15;
/M: SY='R'; M= -8, -6,-26, -8,  1,-21,-16, -3,-18,  7,-14, -7, -1, -8, 11, 20, -4, -6,-18,-23,-11,  4;
/M: SY='E'; M=-11, -3,-27, -2, 10,-18,-21,  0,-14,  7, -8, -3, -3,-14,  7,  7, -9,-10,-14,-24, -8,  7;
/M: SY='G'; M= 12, -8,-25,-11,-16,-27, 49,-19,-32,-17,-25,-18, -2,-17,-17,-20,  3,-14,-22,-21,-27,-16;
/M: SY='R'; M= -8,-11,-27,-11, -2,-20,-12, -7,-23, 14,-14, -8, -5,-14,  3, 34, -8, -9,-16,-21,-13, -2;
/M: SY='S'; M= 13,  3,-17,  2,  2,-25, -2, -9,-21, -3,-22,-15,  4,-11,  4, -8, 16,  3,-14,-29,-19,  3;
/M: SY='V'; M=  4,-21,-15,-25,-20,  4,-20,-16,  7,-18,  9,  4,-19,-23,-18,-17,-10, -3, 10,-14,  1,-19;
/M: SY='G'; M= -3, -6,-30, -6,-13,-28, 51,-15,-37,-12,-29,-19,  3,-19,-14,-12,  0,-17,-29,-20,-26,-14;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-13,-34,-28,  4,-33,-26, 30,-26, 18, 15,-23,-26,-23,-24,-17, -7, 27,-23, -3,-27;
/M: SY='H'; M=-13, -7,-25,-10, -7, -4,-21, 47,-15,-12,-11, -1,  0,-21, -2, -6, -7,-11,-15,-22, 15, -7;
/M: SY='L'; M= -5,-28,-15,-31,-24,  8,-29,-24, 22,-26, 29, 14,-27,-28,-23,-21,-20, -6, 21,-22, -3,-24;
/M: SY='I'; M= -9,-28,-23,-35,-26,  9,-33,-25, 31,-26, 19, 17,-23,-24,-22,-23,-19, -7, 24,-16,  1,-26;
/M: SY='L'; M= -3,-27,-12,-30,-23,  7,-27,-22, 17,-24, 20, 11,-25,-27,-22,-21,-17, -6, 18,-18, -2,-23;
/M: SY='A'; M= 20, -8,-10,-15,-11,-15, -7,-19, -8,-12,-12,-10, -5,-13,-11,-16, 14, 15,  1,-26,-14,-11;
/M: SY='T'; M=  6, -5,-10,-10,-10,-16, -6,-16,-15, -8,-13, -9, -3,-15, -9, -6,  9, 14, -6,-28,-15,-10;
/M: SY='Q'; M= -6,  1,-26,  0,  9,-31,-10,  0,-20,  2,-20, -7,  3, -9, 30,  2,  4, -3,-23,-25,-14, 19;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-25, -7, -1,-18,-15, -6,-21, 14,-17, -7, -1,-15,  4, 30, -2, -3,-15,-23,-11, -1;
/M: SY='P'; M= -3,-15,-29,-12, -6,-15,-13,-17,-14,-11,-15,-11,-15, 20, -9,-15, -7, -6,-15,-12,-13, -9;
/M: SY='N'; M= -4, 10,-22,  8, -1,-23,  4, -8,-22, -6,-20,-15, 13,-15, -4, -7,  7,  1,-19,-31,-18, -3;
/M: SY='A'; M= 11,-10,-19,-14, -5,-13, -8,-10,-11, -9,-10, -7, -8,-15, -7,-11,  1, -2, -5,-15, -9, -7;
/M: SY='D'; M= -5,  4,-21,  7,  3,-18,-12,-10,-12, -6,-12,-10,  0,-15, -5, -9,  1, -1, -7,-29,-13, -1;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-21, -8, -6,-15,-17,-11,-11,  4,-12, -7, -4,-16, -3, 10, -1,  0, -4,-25,-10, -6;
/M: SY='I'; M=  0,-18,-22,-22,-15, -5,-20,-17,  8,-14,  5,  6,-15,-14,-12,-13, -9, -4,  5,-20, -5,-15;
/M: SY='P'; M= -2, -6,-25, -6, -3,-22, -8,-14,-18, -3,-17,-12, -5,  5, -3, -7,  0, -1,-16,-23,-17, -4;
/I:         I=-6; MD=-21;
/M: SY='S'; M= -4, -1,-16, -2, -4,-10, -2, -7,-11, -6,-11, -6, -1, -9, -5, -7,  3,  3, -8,-17, -5, -5; D=-6;
/I:         I=-6; MD=-21;
/M: SY='D'; M=  0,  1,-14,  3,  1,-14, -2, -8,-11, -5,-10, -8, -1, -4, -4, -8,  3,  0, -8,-19,-11, -2; D=-6;
/I:         I=-6; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='I'; M= -7,-26,-20,-29,-22,  4,-30,-22, 24,-23, 21, 15,-23,-25,-19,-19,-16, -4, 21,-23, -3,-22;
/M: SY='R'; M=-15, -9,-28, -9, -1,-17,-18, -5,-21, 19,-12, -4, -5,-18,  4, 34,-11, -9,-15,-17, -6, -1;
/M: SY='D'; M=  8, 10,-20, 11,  7,-26, -8, -8,-21, -1,-21,-17,  7, -8,  2, -7,  9,  0,-16,-30,-18,  4;
/M: SY='N'; M= -7,  9,-23,  2,  2,-21,-10,  4,-14, -2,-15, -7, 17,-17, 12, -1,  1, -4,-19,-28,-11,  6;
/M: SY='F'; M=-11,-23,-18,-29,-21, 18,-28,-16, 12,-21, 17, 11,-19,-24,-20,-17,-16, -3,  8,-15,  6,-20;
/M: SY='S'; M=  0, -2,-24, -4, -3,-24,  3,-12,-22, -1,-22,-12,  2, -2, -3, -4,  4, -1,-18,-27,-19, -4;
/M: SY='T'; M=  0,-12,-15,-17,-13, -3,-14, -6, -7,-14, -3, -3, -8,-20,-11,-13, -2,  2, -5,-16,  1,-12;
/M: SY='R'; M=-14, -5,-27, -7,  0,-21,-17, -2,-23, 21,-19, -9,  1,-18,  7, 39, -6, -6,-16,-23,-11,  1;
/M: SY='I'; M= -3,-26,-22,-32,-25,  0,-29,-25, 28,-24, 17, 13,-21,-22,-20,-23,-15, -5, 21,-17, -2,-24;
/M: SY='A'; M= 13,-11, -8,-14, -7,-18, -6,-17,-11,-12,-11, -9,-11,-10, -9,-16,  2, -3, -3,-26,-17, -8;
/M: SY='L'; M=-12,-24,-22,-27,-19, 15,-28,-11, 12,-25, 27, 14,-22,-25,-18,-18,-22, -9,  6,-16,  6,-19;
/M: SY='R'; M= -7,-11,-26,-13,-10,-13,  1,-11,-19,  2,-14, -6, -6,-16, -7,  8, -7, -9,-14,-18, -8,-10;
/M: SY='L'; M= -4,-17, -9,-21,-16,  0,-22,-14,  3,-17,  7,  4,-14,-22,-14,-13, -9, -3,  6,-24, -5,-15;
/M: SY='N'; M= -3,  1,-22, -2, -6,-16, -8, -8,-11, -9,-11, -5,  2,-10, -6,-11,  0, -1,-10,-27,-12, -7;
/M: SY='D'; M= -7, 20,-22, 24,  8,-25, -7, -6,-27, -2,-25,-21, 13, -9, -1, -5, 10,  4,-20,-34,-18,  3;
/M: SY='P'; M=  2, -4,-27, -2,  3,-25, -8,-12,-20, -1,-22,-14, -4, 12, -1, -8,  0, -7,-18,-27,-20,  0;
/M: SY='D'; M= -5,  8,-23, 12,  7,-24,  0, -8,-23, -4,-21,-15,  4,-13, -3, -8,  5, -3,-16,-30,-17,  2;
/M: SY='E'; M= -6, 10,-26, 15, 22,-26, -9, -7,-25,  0,-18,-17,  3, -5,  3, -6,  1, -5,-21,-30,-19, 12;
/M: SY='S'; M=  3, -7,-19, -8, -7,-15, -3, -9,-15, -8,-16,-11, -2,-15, -3, -6, 10,  3,-10,-24, -8, -6;
/M: SY='R'; M= -6, -3,-21, -5,  0,-17,-17, -7,-13,  3,-13, -7,  0,-16,  3, 10, -2, -4,-10,-25,-11,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_04 which contains 544'996 sequence entries.


Total number of hits 144 in 123 different sequences
Number of true positive hits 144 in 123 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 1
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 99.31 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 3
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] FtsK
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
123 sequences

ECC1A_MYCTO (P9WNB2), ECC1A_MYCTU (P9WNB3), ECC1B_MYCTO (P9WNB0), 
ECC1B_MYCTU (P9WNB1), ECCC3_MYCTO (P9WNA8), ECCC3_MYCTU (P9WNA9), 
ECCC4_MYCTO (P9WNA6), ECCC4_MYCTU (P9WNA7), ECCC5_MYCTO (P9WNA4), 
ECCC5_MYCTU (P9WNA5), ESSC_STAAC  (Q5HJ86), ESSC_STAAE  (P0C048), 
ESSC_STAAM  (Q932J9), ESSC_STAAN  (Q99WT9), ESSC_STAAR  (Q6GK24), 
ESSC_STAAS  (Q6GCI5), ESSC_STAAW  (Q8NYF3), FTSK1_NEIMA (Q9JU31), 
FTSK1_NEIMB (Q9JZ36), FTSK1_RALSO (Q8XRH0), FTSK2_NEIMA (Q9JUK9), 
FTSK2_NEIMB (Q9JZG4), FTSK2_RALSO (Q8XWX9), FTSKL_DEIRA (Q9RXB5), 
FTSKL_NOSS1 (Q8ZS46), FTSK_AGRT5  (Q8U526), FTSK_AZOBR  (O83045), 
FTSK_BACAN  (Q81WP2), FTSK_BACCR  (Q81A03), FTSK_BACHD  (Q9KA95), 
FTSK_BIFLO  (Q8G4H3), FTSK_BORBU  (O51272), FTSK_BRADU  (Q89WR2), 
FTSK_BRUME  (Q8YJB8), FTSK_BRUSU  (Q8FYI0), FTSK_CAMJE  (Q0PA12), 
FTSK_CAMJJ  (A1VZM0), FTSK_CAUCR  (Q9A262), FTSK_CHLMU  (Q9PLI7), 
FTSK_CHLPN  (Q9Z726), FTSK_CHLTE  (Q8KBK0), FTSK_CHLTR  (O84744), 
FTSK_CLOAB  (Q97I41), FTSK_CLOPE  (Q8XJS8), FTSK_CLOTE  (Q895I8), 
FTSK_COREF  (Q8FPC1), FTSK_CORGL  (Q8NP53), FTSK_COXBU  (P39920), 
FTSK_ECO57  (Q8X5H9), FTSK_ECOL6  (Q8FJC7), FTSK_ECOLI  (P46889), 
FTSK_HAEDU  (P59836), FTSK_HAEIN  (P45264), FTSK_HELPJ  (Q9ZM87), 
FTSK_HELPY  (O25722), FTSK_LACLA  (Q9CF25), FTSK_LACLM  (A2RJB8), 
FTSK_LACPL  (Q88V72), FTSK_LEPIC  (Q72TG0), FTSK_LEPIN  (Q8F1W7), 
FTSK_LISIN  (Q92BW9), FTSK_LISMO  (Q8Y7A3), FTSK_MYCLE  (O05560), 
FTSK_MYCTO  (P9WNA2), FTSK_MYCTU  (P9WNA3), FTSK_OCEIH  (Q8EQS7), 
FTSK_PASMU  (Q9CP13), FTSK_PSEAE  (Q9I0M3), FTSK_PSEPK  (Q88FS8), 
FTSK_PSESM  (Q87ZS5), FTSK_PSEU2  (Q9Z3U1), FTSK_RHILO  (Q98EH3), 
FTSK_RHIME  (Q92L89), FTSK_RICBR  (Q1RK79), FTSK_RICCN  (Q92G50), 
FTSK_RICFE  (Q4UJY1), FTSK_RICPR  (Q9ZCD4), FTSK_RICTY  (Q68VS6), 
FTSK_SALTI  (Q8Z814), FTSK_SALTY  (Q8ZQD5), FTSK_SHEON  (Q8EER3), 
FTSK_SHIFL  (Q83S00), FTSK_SPOUR  (Q9RNV1), FTSK_STAAC  (Q5HGF5), 
FTSK_STAAM  (P64164), FTSK_STAAN  (P64165), FTSK_STAAR  (Q6GHF9), 
FTSK_STAAS  (Q6G9T7), FTSK_STAAW  (Q8NWY8), FTSK_STAEQ  (Q5HPR5), 
FTSK_STAES  (Q8CMM5), FTSK_STRA3  (Q8E418), FTSK_STRA5  (Q8CX05), 
FTSK_STRAW  (Q82K93), FTSK_STRCO  (O86810), FTSK_STRMU  (Q8DSX7), 
FTSK_STRP1  (Q9A155), FTSK_STRP3  (P0DB16), FTSK_STRP6  (Q5XDI2), 
FTSK_STRP8  (Q8P276), FTSK_STRPN  (P64166), FTSK_STRPQ  (P0DB17), 
FTSK_STRR6  (P64167), FTSK_THETN  (Q8R5S4), FTSK_TREPA  (O83964), 
FTSK_TROW8  (Q83MI4), FTSK_TROWT  (Q83MS8), FTSK_VIBCH  (Q84I33), 
FTSK_VIBPA  (Q87QP4), FTSK_VIBVU  (Q8D8M2), FTSK_XANAC  (Q8PL00), 
FTSK_XANCP  (Q8P993), FTSK_XYLFA  (Q9PDC9), FTSK_XYLFT  (Q87DL2), 
FTSK_YERPE  (Q8ZGC7), SFTA_BACSU  (C0SP86), SP3E_BACSU  (P21458), 
SPI_STRAJ   (Q53308), TRA_STRLI   (P22409), TRSA_STRAM  (Q07197), 
Y3709_CLOAB (Q04351), YDCQ_BACSU  (P96634), YUKB_BACSU  (C0SPA7)
» More

UniProtKB/Swiss-Prot
False negative sequences
1 sequence

GLCI1_MOUSE (Q8K3I9)

		
PDB
[Detailed view]
3 PDB

2IUS; 2IUT; 2IUU

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission