Entry: PS50904

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] PRELI_MSF1
Accession [info] PS50904
Entry type [info] MATRIX
Date [info] APR-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50904
Associated ProRule [info] PRU00158

Name and characterization of the entry

Description [info] PRELI/MSF1 domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=172;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=167;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4669; R2=0.01454465; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=14451.79540; R2=39.39898; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=414; N_SCORE=8.5; H_SCORE=22686; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=277; N_SCORE=6.5; H_SCORE=22686; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='M'; M= -1,-17,-18,-23,-17, -9,-12,-11,  8,-11,  4, 24,-16,-20, -5,-12, -8, -3, 10,-23, -9,-11;
/M: SY='K'; M= -4, -7,-24, -7,  1,-22,-19,-13,-18, 27,-18, -7, -5,-14,  2, 17, -6, -6, -9,-23,-11,  1;
/M: SY='I'; M= -5,-21,-23,-27,-21,  4,-29,-16, 19,-21, 15,  9,-18,-21,-16,-20,-13,  1, 11,-13, 11,-21;
/M: SY='W'; M=-16,-25, -8,-29,-22, 13,-25,-11,-12,-19, -9, -8,-23,-29,-16,-16,-21,-16,-11, 33, 16,-17;
/M: SY='D'; M= -7,  6,-22,  9,  7,-23,-14, -7,-22,  4,-18,-14,  4,-12,  5,  7,  8,  6,-16,-31,-14,  5;
/M: SY='S'; M=  0,  1,-18,  1, -2,-22, -3,-11,-17, -9,-24,-15,  5, -4, -1,-10, 17,  8,-11,-34,-19, -2;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -8,  3,-15,  3, 19,-23,-19,  4,-20,  2,-19,-12,  2,-12,  8, -2,  1, -3,-17,-31,-14, 13;
/M: SY='H'; M=-12, -2,-24, -5, -2,-16,-19, 39,-22, -4,-17, -5,  4,-17,  8,  4,  1,  2,-19,-25,  8,  0;
/M: SY='V'; M= -4,-19,-18,-19,-17, -6,-27,-23, 20,-18,  6,  5,-19,-23,-19,-19, -8, -2, 27,-29,-10,-19;
/M: SY='F'; M=-18,-28,-22,-35,-27, 60,-30,-13,  3,-26, 14,  3,-22,-30,-32,-18,-22,-10,  0,  9, 34,-27;
/M: SY='D'; M=-12, 11,-30, 12,  7,-30, -8, -3,-27, 10,-28,-16, 12,  2,  9,  6, -2, -9,-27,-29,-18,  7;
/M: SY='Y'; M=-11,-11,-25,-12,-11,  5,-22, 35,-12,-10,-10, -3, -7,-23, -3, -8, -7, -5,-14, -1, 41,-11;
/M: SY='P'; M= -4, -6,-29,  1,  6,-28,-13,-14,-22, -8,-29,-21, -6, 45, -4,-15,  7, -1,-24,-34,-25, -2;
/M: SY='W'; M=-20,-36,-38,-40,-30, 39,-24,-26,-12,-24, -8,-12,-32,-30,-28,-20,-32,-22,-18, 92, 30,-24;
/M: SY='E'; M= -9, 20,-27, 28, 32,-29,-14, -1,-27,  3,-20,-16,  8, -7,  9, -5,  0, -9,-25,-32,-18, 20;
/M: SY='Q'; M= -7,  0,-21, -3,  6,-21,-18, -5,-15,  0,-12, -6,  2,-13, 16,  3,  6, 10,-15,-27,-11, 11;
/M: SY='V'; M= -1,-30,-12,-31,-30,  0,-31,-30, 32,-21, 11, 11,-29,-29,-29,-21,-11, -1, 48,-29, -9,-30;
/M: SY='T'; M=  7,-13,-13,-19,-15, -4,-15,-18,  2,-15, -6,  0, -9,-17,-13,-16,  9, 10,  9,-27,-10,-14;
/M: SY='A'; M= 22, -8,-16,-13, -3,-23, -8,-12,-12, -4,-14, -8, -6,-12,  6, -6, 10,  0, -5,-24,-16,  1;
/M: SY='A'; M= 44,-11,  3,-21,-12,-20, -3,-21,-12,-12,-11,-11,-11,-13,-12,-21,  8, -1, -1,-23,-21,-12;
/M: SY='F'; M= -3,-16,-22,-23,-18, 24,-18, -3, -8,-17, -6, -7,-10,-23,-18,-15, -8, -7, -9,  8, 21,-17;
/M: SY='W'; M=-17,-30,-36,-32,-19, 15,-23,-22, -8,-20,  0, -4,-30,-26,-17,-17,-30,-20,-16, 70, 18,-15;
/M: SY='R'; M=-15,  5,-27,  3,  4,-24,-16,  1,-26, 18,-22,-12, 11,-16, 13, 36, -2, -4,-22,-25,-12,  6;
/M: SY='R'; M=-15, -5,-30, -5,  5,-25,-20, -5,-30, 40,-25,-10,  0,-15, 10, 49,-10,-10,-20,-20,-10,  5;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-24,-22, 39,-30, 13,  0,-14,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 26, 71,-22;
/M: SY='P'; M= -5,-19,-38,-11, -1,-29,-18,-20,-19,-10,-28,-19,-19, 82,-10,-20, -8, -9,-28,-29,-29,-10;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='N'; M=-11, 35, -7, 19, -1,-22, -4,  5,-23, -3,-29,-21, 49,-21, -3, -4,  7, -2,-28,-41,-21, -2;
/M: SY='P'; M= -8,-14,-36, -5,  8,-29,-18,-17,-21, -7,-29,-20,-15, 70, -5,-17, -5, -8,-28,-31,-28, -3;
/M: SY='Y'; M=-12,-15,-24,-18,-10,  2,-24, 13,  3,-13,  8, 15,-13,-22, -4,-11,-14, -9, -4,-13, 18, -9;
/M: SY='S'; M=  6, 10,-16,  4, -3,-19, -6, -8,-13, -9,-21,-15, 16,-13, -4,-11, 18,  8,-11,-35,-17, -4;
/M: SY='P'; M= -9, -9,-28, -8,  0,-22,-21,-15,-19, 12,-19,-11, -8, 18, -3,  6, -5,  2,-17,-25,-15, -3;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='H'; M=-12,  2,-24, -1, -2,-18,-14, 59,-22, -9,-19,  0, 12,-18,  6, -3,  1, -9,-22,-32,  6, -1;
/M: SY='V'; M= -5,-30,-17,-34,-30,  8,-33,-29, 33,-24, 13, 12,-26,-27,-28,-23,-14, -4, 39,-23, -3,-30;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-21,-32,-25,  3,-33,-25, 31,-27, 28, 16,-24,-25,-21,-23,-19, -4, 24,-22, -2,-25;
/M: SY='S'; M=  9, -4,-18, -6, -4,-22, 17,-15,-24,-11,-23,-17,  2,-12, -7,-14, 18,  7,-15,-29,-21, -6;
/M: SY='V'; M=  1,-14,-18,-15, -3,-11,-23,-20,  8,-12, -2, -1,-14,-17,-11,-15, -1,  1, 15,-29,-13, -8;
/M: SY='D'; M=-19, 45,-30, 63, 19,-39,-11, -1,-39,  5,-30,-28, 18,-10,  1, -6, -1,-10,-29,-38,-19, 10;
/M: SY='T'; M= -1,-15,-12,-21,-20, -5,-26,-25, 12,-16,  1,  1,-14,-19,-19,-16,  4, 24, 24,-29, -9,-20;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-17,-32,-26,  4,-32,-26, 29,-26, 29, 16,-28,-28,-24,-22,-20, -6, 29,-24, -4,-26;
/M: SY='E'; M= -9,  9,-26, 12, 24,-28,-14,  8,-27,  8,-24,-15,  9, -9, 18,  6,  5, -5,-25,-30,-14, 20;
/M: SY='R'; M=-17, -5,-30, -3, 13,-23,-20,  1,-29, 25,-20,-11,  0,-15, 16, 52, -7,-10,-23,-22,-12, 11;
/M: SY='K'; M=-12, -1,-27, -2, 12,-12,-20, -3,-22, 15,-18,-10,  1,-13,  8, 14, -5, -5,-20,-18, -2,  9;
/M: SY='V'; M= -5,-24,-18,-25,-20, -4,-29,-24, 18, -9, 12,  9,-23,-25,-19,-11,-15, -5, 26,-25, -7,-20;
/M: SY='D'; M=-11, 16,-23, 24,  8,-25,-15, -8,-23,  1,-18,-17,  5,-13, -2, -2,  3,  3,-15,-33,-15,  3;
/I:         I=-14; MD=-29;
/M: SY='D'; M= -8, 10,-20, 16, 15,-22, -5, -4,-21,  0,-17,-14,  3,  2,  5, -5,  1, -3,-19,-22,-14, 10; D=-14;
/I:         I=-14; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
/M: SY='D'; M= -6, 16,-24, 19,  9,-27,  0, -8,-29, -2,-23,-20,  9,-12, -2, -4,  4,  0,-22,-31,-19,  3;
/M: SY='G'; M=  3, -4,-27, -7,-12,-29, 45,-15,-33,-11,-27,-17,  4,-18, -9,-13,  1,-15,-26,-22,-25,-11;
/M: SY='K'; M= -9,-10,-23,-13, -8,-14,-23,-15, -4, 10, -7, -1, -6,-19, -6, 10, -9, -2,  2,-24, -9, -8;
/M: SY='L'; M=-11,-27,-24,-30,-21,  5,-32,-11, 23,-28, 36, 18,-24,-26,-17,-21,-26,-11, 11,-21,  2,-21;
/M: SY='Y'; M=-14,-20,-23,-21,-18,  9,-27, 14,  2,-14,  5,  5,-16,-27,-13, -7,-16,-10,  4,-10, 23,-18;
/M: SY='T'; M= -1, -4,-14,-11, -9,-12,-17,-17, -8, -8,-13, -9,  0,-12, -7, -4, 18, 31, -1,-30,-11, -9;
/M: SY='E'; M=-11,  0,-26,  2, 21,-22,-21, -1,-23, 13,-15,-11, -2,-10,  8, 13, -3, -1,-19,-26,-11, 14;
/M: SY='R'; M=-19, -9,-30, -9,  1,-21,-20, -1,-30, 32,-21,-10,  0,-19, 10, 67,-10,-10,-20,-20,-10,  1;
/M: SY='L'; M= -6,-26,-22,-29,-19,  3,-28,-20, 18,-22, 33, 15,-24,-26,-16,-13,-23, -9, 10,-20, -3,-19;
/M: SY='L'; M= -4,-27, -8,-32,-23,  1,-30,-24, 21,-27, 26, 13,-24,-26,-21,-24,-20, -8, 15,-24, -5,-23;
/M: SY='T'; M= -2, -8,-18,-12, -6,-16,-20,-15, -4, -1,-12, -4, -5,-14,  0, -4,  7, 13,  2,-28,-11, -4;
/M: SY='K'; M= -6,-11,  1,-14, -8,-17,-22,-18,-12,  6,-12, -6, -8,-19, -7, -1, -4, -1, -4,-29,-13, -8;
/M: SY='H'; M=-10,  6,-25,  7, 11,-28,-18, 19,-25,  5,-21, -9,  5,-11, 19,  3,  3, -1,-23,-28, -6, 14;
/M: SY='G'; M= -4, -3,-26,-10,-12,-12,  6,-11,-17,-11,-19,-12,  5,-21, -6,-11, -4,-11,-18, -1,-10, -8;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='R'; M= -6, -7,-27, -4, -5,-21, -5,-10,-21,  2,-21,-13, -5, -1, -5,  7, -3, -8,-15,-23,-13, -7;
/M: SY='V'; M= -1,-26,-17,-29,-24,  3,-19,-22, 16,-22, 18, 12,-24,-26,-22,-20,-15, -7, 20,-21, -6,-23;
/M: SY='P'; M=-10,-20,-40,-10,  0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-20, 90,-10,-20,-10,-10,-30,-30,-30,-10;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-27, -6,  5,-20,-17, -7,-26, 19,-23,-13, -2,-15,  6, 30, -2, -3,-19,-11, -9,  4;
/M: SY='W'; M=-17,-36,-40,-38,-28, 15,-24,-27, -5,-24, -2, -8,-35,-29,-22,-21,-35,-23,-15, 93, 22,-22;
/M: SY='I'; M=  6,-22,-19,-27,-21, -5,-17,-24, 15,-22, 14,  7,-19,-21,-19,-22,-11, -4, 14,-22, -9,-21;
/M: SY='R'; M= -4, -5,-22, -6,  2,-19,-16,  6,-19,  7,-15, -4, -1,-14,  4, 11,  1, -1,-14,-26, -8,  1;
/M: SY='R'; M= -6, -3,-27, -3,  2,-24,-17, -7,-24, 24,-21, -8, -3, -7,  4, 27, -7, -9,-17,-22,-13,  1;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-22,-34,-25, 16,-31,-21, 26,-26, 28, 22,-24,-26,-21,-21,-23, -9, 17,-16,  4,-24;
/M: SY='L'; M= -2,-20,-19,-25,-18,  6,-25,-18, 11,-21, 14,  5,-16,-21,-16,-19, -8,  3,  7,-17,  3,-18;
/M: SY='G'; M= -8,  4,-29,  4, -9,-26, 23,-12,-26,-11,-24,-17,  9,-10,-11,-10, -2,-13,-23,-27,-23,-11;
/M: SY='V'; M= -1,-13,-20,-18,-16, -7, -4,-18, -2,-16, -3, -2, -7,-21,-13,-15, -4, -1,  1,-22,-11,-15;
/I:         I=-13; MD=-27;
/M: SY='S'; M=  5,  0,-10, -4, -3,-11, -6, -8, -6, -1,-10, -6,  3, -7, -2, -4,  7,  4, -4,-17, -9, -3; D=-13;
/I:         I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27;
/M: SY='B'; M=-10, 10,-25, 10,  2,-26,-10,  1,-21, -2,-22,-13,  9, -5,  4, -5,  1,  0,-19,-30,-14,  2;
/M: SY='T'; M= -9, -3,-24, -1, -3,-12,-21,-10, -6, -6, -7, -4, -7, -8, -6,-10, -4,  1, -5,-24, -4, -6;
/M: SY='V'; M= -2,-17, 13,-22,-19,-11,-25,-23,  3,-18, -6, -3,-15,-24,-15,-18,  1,  6, 14,-34,-15,-18;
/M: SY='Y'; M=-17,-16,-32,-15,-10,  8,-25, 19,-12, -5,-11, -4,-14,-15, -1, -6,-16,-13,-18, 15, 40, -9;
/M: SY='I'; M= -4,-26, -9,-32,-26,  5,-30,-26, 23,-25, 11,  8,-20,-25,-23,-24,-12, -5, 22,-23, -4,-26;
/M: SY='V'; M= -9,-18,-22,-19,-10, -8,-26, -9,  6, -9,  4,  4,-14,-22, -9,  1,-11, -6,  9,-25, -6,-12;
/M: SY='E'; M=-10,  9,-30, 18, 56,-31,-20,  1,-29, 10,-20,-18,  0, -1, 24,  1,  0,-10,-30,-29,-19, 40;
/M: SY='E'; M=-11,  3,-24,  7,  9,-19,-19,  2,-19,  5,-17,-12, -1,-15,  1,  6, -1, -3,-12,-26, -5,  4;
/M: SY='S'; M=  6,  4,-11,  0, -2,-18, -3,-10,-18, -9,-27,-18, 13,-11, -2, -9, 34, 23,-10,-38,-18, -2;
/M: SY='V'; M= -3,-26,-17,-27,-25,  0,-26,-24, 17,-19,  2,  3,-24,-26,-23,-19, -8,  1, 28, -9, -1,-24;
/M: SY='V'; M= -6,-29,-17,-31,-26,  5,-32,-23, 28,-23, 22, 13,-28,-28,-24,-21,-18, -5, 31,-21,  2,-26;
/M: SY='D'; M=-15, 43,-26, 55, 15,-35, -7,  1,-35, -1,-30,-27, 26,-12,  0, -8,  6, -5,-28,-40,-20,  7;
/M: SY='P'; M= -7,-18,-31,-13, -5,-20,-13,-18,-13,-10,-12,-10,-16, 36,-10,-15, -9, -8,-18,-27,-21,-10;
/M: SY='K'; M= -2, -6,-20, -8,  0,-20,-18,-10,-10,  6,-14, -6, -3,-16,  6,  5,  1,  0, -3,-27,-13,  2;
/M: SY='K'; M= -4,  6,-24,  4, 13,-25,-12, -5,-26, 19,-26,-15, 10,-11,  7, 16,  4, -3,-20,-28,-16,  9;
/M: SY='R'; M=-12, -3,-29, -3,  7,-27,-19, -4,-28, 33,-25, -9,  1,-13, 17, 38, -5, -8,-21,-21,-11, 10;
/M: SY='T'; M= -3,  5,-18,  1,  8,-20,-15, -9,-19,  5,-20,-13,  7, -9,  4,  0, 13, 19,-14,-30,-14,  6;
/M: SY='M'; M=-12,-25,-20,-32,-22, 16,-25,-11, 17,-21, 30, 35,-24,-25,-14,-15,-24,-10,  8,-15,  5,-17;
/M: SY='T'; M=  1, -4,-18, -8,  0,-18,-18, -3,-12,  1,-14, -7, -3,-13,  1, -3,  6, 11, -4,-27,-10,  0;
/M: SY='L'; M= -5,-18,-18,-23,-17, -1,-26,-20, 13,-21, 17, 10,-15,-20,-14,-17, -6, 11,  9,-25, -5,-17;
/M: SY='Y'; M=-13,-11,-14,-13, -2,  4,-24, -7,-14, -2, -7, -7,-10,-20, -7,  3, -8, -1,-11,-13,  8, -5;
/M: SY='T'; M=  7, -1,-10, -9, -8,-13,-13,-18,-12,-10,-15,-12,  1,-10, -8,-11, 24, 38, -2,-31,-13, -8;
/M: SY='R'; M=-15, -9,-18,-13, -8, -5,-20,  4,-21,  4,-17,-10, -3,-22, -3, 17, -7, -6,-17, -6,  5, -8;
/M: SY='N'; M=-10, 34, -6, 15, -3,-20, -3,  6,-21, -3,-29,-20, 52,-22, -3, -3,  8, -1,-28,-41,-21, -3;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-22,-27,-15,  3,-31,-21, 23,-25, 33, 15,-25,-25,-17,-20,-23, -9, 14,-22, -3,-17;
/M: SY='T'; M= -3, 13,-16,  8, -3,-19, -5,-11,-20, -8,-21,-17, 14,-12, -6, -9, 17, 23,-13,-34,-16, -5;
/M: SY='H'; M=-16,-19,-27,-22,-17, 12,-17, 19, -8,-19,  3,  8,-13,-25,-12,-12,-19,-16,-11,  0, 14,-15;
/M: SY='T'; M=  3, -8,  3,-14,-12,-14,-17,-20, -8,-10,-14,-10, -5,-16,-11,-12, 12, 18,  1,-32,-15,-12;
/M: SY='N'; M= -8, 11,-25,  7,  4,-26, -5, -2,-26, 14,-28,-15, 17,-14,  8, 14,  5, -4,-23,-29,-16,  5;
/M: SY='L'; M=-14,-22,-25,-27,-19, 14,-29,-13, 11,-17, 16,  8,-15,-26,-16, -5,-20, -9,  4,-12, 10,-19;
/M: SY='L'; M= -3,-26,-19,-31,-23,  7,-26,-19, 21,-22, 23, 23,-24,-24,-18,-19,-18, -7, 18,-19, -1,-21;
/M: SY='R'; M= -7, -7,-24, -7,  3,-21,-18, -9,-14, 12,-18, -8, -2,-14,  7, 16,  2, -2, -9,-26,-12,  3;
/M: SY='V'; M= -3,-29,-14,-31,-28,  1,-30,-26, 30,-21, 15, 17,-28,-28,-25,-20,-14, -3, 41,-27, -7,-27;
/M: SY='D'; M=-15, 18,-28, 22, 16,-23,-16,  9,-23,  1,-20,-16, 14,-13,  4,  1, -3, -9,-23,-29, -8,  8;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='R'; M=-14, -9,-26,-10, -2,-10,-24,  5,-13,  7,-12, -5, -5,-18,  1, 18, -7, -3,-10,-16,  6, -4;
/M: SY='C'; M= -4,-20, 20,-24,-21, -7,-25,-24,  2,-23,  3, -2,-17,-27,-20,-21, -4,  2, 11,-34,-14,-21;
/M: SY='V'; M= -6,-17, -3,-22,-19, -6,-26,-20,  4,-11, -3, -1,-15,-23,-16, -4, -3, 10, 14,-26, -6,-19;
/M: SY='Y'; M=-20,-22,-28,-23,-22, 39,-30, 13,  0,-13,  2,  0,-20,-30,-15,-12,-20,-10, -8, 27, 71,-22;
/M: SY='T'; M= -5,  0, -9, -2,  0,-20,-17,-12,-17, -1,-18,-12,  1,-13,  1,  0,  9, 11,-10,-31,-14,  0;
/M: SY='P'; M= -7,-14,-28, -9,  5,-17,-21,-15,-12, -8,-18,-12,-14, 28, -4,-13, -4, -6,-12,-27,-18, -1;
/M: SY='H'; M= -6,  6,-23,  5,  2,-23,-11, 42,-25, -7,-23,-10, 12,-15,  8, -4,  7, -5,-23,-33, -2,  3;
/M: SY='P'; M= -5,-11,-28, -6,  3,-24,-16, -8,-17, -5,-25,-15, -9, 32, -4,-11,  2, -3,-17,-31,-20, -3;
/M: SY='E'; M= -8, 23,-27, 35, 36,-33,-14, -2,-32,  4,-24,-23,  8, -5,  9, -6,  3, -8,-27,-34,-20, 23;
/M: SY='N'; M=-10, 31,-22, 22,  0,-22,  0,  2,-22, -4,-23,-19, 37,-18, -4, -6,  5, -1,-25,-36,-19, -2;
/M: SY='P'; M= -1, -7,-15, -3,  9,-27,-14,-12,-22, -7,-26,-18, -6, 22,  2,-12,  8, -1,-21,-33,-23,  4;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='S'; M=  4, 10,-18,  8,  5,-24,  1, -4,-21, -4,-23,-16, 14,-11,  4, -7, 15,  2,-18,-30,-18,  4; D=-10;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='W'; M= -7,-11,-26,-13, -8, -8,-13, -3,-15,  3,-15, -5, -8,-16, -3, -2,-14,-13,-16, 29,  5, -5; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='T'; M=  0,  0,-10,-10,-10,-10,-20,-20,-10,-10,-10,-10,  0,-10,-10,-10, 20, 50,  0,-30,-10,-10;
/M: SY='V'; M= -9,-15, -9,-15, -8, -8,-29,-20, 10,-18,  9,  3,-17,-22,-15,-19,-14, -8, 11,-29,-10,-12;
/M: SY='F'; M= -3,-26, -6,-33,-25, 23,-26,-23,  9,-25, 14,  4,-22,-27,-27,-22,-15, -7, 12,-14,  3,-25;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-24,  3,  5,-21,-20, -2,-11,  0,-11, -6, -2,-14,  5, -4, -3, -3, -9,-28, -9,  4;
/M: SY='Q'; M=-10, -2,-27, -3, 11,-31,-19,  4,-22, 12,-20, -5,  1,-12, 38, 21,  2, -3,-24,-22,-11, 24;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-24,  8, 23,-23,-17, -6,-21,  4,-18,-15,  2, -8,  7,  5,  6,  1,-17,-30,-16, 14;
/M: SY='A'; M= 30,-14,-12,-20,-16,-16, -2,-22, -4,-13, -7, -6,-13,-16,-16,-19,  5,  2,  8,-23,-18,-16;
/M: SY='R'; M= -8,-11,-25,-14, -7,-12,-20,-11,-10,  3,-14, -7, -6,-16,  0,  7, -1,  2, -9, -8,  0, -5;
/M: SY='I'; M= -9,-30,-22,-36,-29, 13,-35,-28, 34,-27, 19, 14,-24,-25,-26,-25,-18, -7, 29,-18,  2,-29;
/M: SY='S'; M=  0,  2,-15,  2,  1,-18,-12,-12,-17, -5,-20,-15,  4,-12, -3, -4, 20, 19, -7,-34,-16, -1;
/M: SY='I'; M=  5,-18,-19,-24,-18, -9,-21,-23, 18,-20,  0,  3,-11,-17,-14,-21,  4,  2, 17,-27,-10,-18;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='K'; M= -6, -7,-19, -9, -5, -7,-11,-10,-12,  4,-10, -6, -6, -4, -6,  0, -4,  2,-10,-13, -2, -6; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='S'; M=  1, -3, -6, -4, -5,-11, -2,-10,-15,-11,-12,-10, -2,-14, -4,-11,  6, -1,-10,-22,-12, -4; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='L'; M= -4,-17, -9,-23,-19,  0,-11,-17, -1,-18,  6,  3,-12,-25,-18,-12,-12, -9,  0,-22, -8,-19;
/M: SY='F'; M= -7,-20,-24,-25,-19, 14, -8,-18, -6,-14, -5, -1,-14,-14,-20,-11,-11,-10, -4,-11, -1,-19;
/M: SY='G'; M= -1,-10,-25,-11,-11,-16, 20,-15,-28, -6,-23,-15, -2,-12,-11, -2,  2, -9,-20,-21,-18,-12;
/M: SY='L'; M=-12,-28,-20,-33,-24, 24,-29,-18, 18,-26, 30, 21,-25,-28,-22,-19,-24, -9, 12,-13,  7,-22;
/M: SY='S'; M=  8,  1, -9, -3,  0,-23,  5,-11,-24, -6,-25,-18,  7,-13, -4,-10, 16,  2,-16,-32,-21, -2;
/M: SY='N'; M= -7,  5, -8,  4,  3,-22,-11,  1,-26,  1,-25,-17, 11,-16,  2,  9, 11,  1,-19,-35,-16,  1;
/M: SY='Y'; M= -2,-14,-23,-17,-11, -5,-22,-10, -3,  2, -5, -1,-12,-19, -7,  0, -8, -2,  0,-12,  9,-11;
/M: SY='V'; M= -7,-27, -8,-31,-26,  3,-30,-20, 23,-22, 17, 16,-26,-28,-21,-20,-17, -6, 26,-22,  0,-25;
/M: SY='E'; M=-11,  7,-30, 15, 49,-31,-20,  2,-28, 12,-20,-16,  0, -3, 25,  7, -1,-10,-29,-28,-18, 37;
/M: SY='K'; M= -5, 10,-25, 13, 13,-30,-15, -6,-26, 16,-24,-14,  4, -9, 12,  6,  2, -1,-20,-27,-14, 12;
/M: SY='W'; M=-14,-27,-27,-31,-23, 23,-27,-20,  3,-18,  5,  0,-23,-26,-22,-15,-21, -9,  0, 24, 17,-21;
/M: SY='A'; M=  8,-13, -5,-17,-14, -9,  1,-17,-12,-17, -7, -5, -8,-19,-13,-17,  5, -1, -6,-26,-14,-13;
/M: SY='L'; M=  2,-20,-17,-24,-17, -4,-21,-18, 10,-16, 14, 10,-17,-21,-13,-12, -8, -1, 10,-24, -8,-16;
/M: SY='E'; M= -2,  5,-21,  3, 10,-23,-14, -7,-19,  6,-19, -8,  5,-10,  6,  0,  7,  6,-15,-29,-14,  8;
/M: SY='R'; M=-11,-10,-26,-13, -6,-12, -9,-10,-19,  8,-16, -7, -3,-17,  1, 18, -5, -4,-14,-18, -8, -4;
/M: SY='F'; M=-18,-28,-23,-36,-27, 54,-31,-14,  9,-27, 14,  5,-21,-29,-30,-20,-21,-10,  3,  7, 32,-27;
/M: SY='K'; M= -6, -1,-13, -2,  0,-23,-10, -9,-23,  9,-22, -8,  1,-14,  4,  7,  5,  1,-15,-28,-15,  1;
/M: SY='Q'; M=  0,  1,-22,  2, 18,-28,-13, -4,-22,  8,-23,-12,  2, -8, 19,  2, 10,  2,-19,-28,-15, 19;
/M: SY='N'; M= -7, 26,-22, 13,  0,-23,  4,  4,-23,  1,-29,-18, 42,-18,  3,  0,  9, -2,-28,-35,-20,  2;
/M: SY='A'; M= 20,-17,-16,-23,-17,-12, -9,-22,  6,-17,  0, -1,-14,-17,-16,-21,  0, -3, 10,-23,-14,-17;
/M: SY='N'; M= -1,  8,-22,  2,  2,-25, -6, -6,-23, 12,-26,-13, 15,-13,  6,  5,  7,  1,-19,-28,-16,  4;
/M: SY='K'; M= -9,  3,-28,  1,  8,-28,-17, -8,-28, 40,-29,-12,  6,-11,  8, 27, -4, -7,-20,-23,-12,  8;
/M: SY='G'; M=  5, -7,-22, -9,-15,-25, 40,-19,-30,-16,-25,-18,  1,-16,-15,-17, 10, -1,-20,-25,-25,-15;
/M: SY='R'; M=-12,-11,-27,-14, -5,-16,-20,-10,-15, 15,-15, -3, -6,-17,  2, 25, -8, -4,-11,-10, -6, -4;
/M: SY='E'; M= -7,  0,-26, -1, 15,-24,-17, -1,-20, 15,-16, -2,  1,-11, 15, 15, -5, -8,-19,-24,-13, 14;
/M: SY='G'; M=  2,-16,-27,-18,-22,-21, 35,-23,-14,-21,-15, -9, -7,-20,-20,-22, -4,-15,-10,-21,-22,-22;
/M: SY='F'; M=-12,-27,-21,-35,-25, 25,-29,-17, 20,-24, 23, 24,-23,-26,-21,-19,-21, -9, 14,-12,  8,-23;
/M: SY='E'; M= -7,  7,-26, 12, 34,-17,-18, -4,-22,  1,-13,-15,  1, -8,  7, -5, -2, -8,-22,-27,-14, 21;
/M: SY='W'; M=-12,-20,-30,-21,-13, 11,-21, -3, -9, -9, -7, -3,-18,-23, -9, -6,-16,-12,-13, 32, 30,-11;
/M: SY='V'; M= -6,-27,-19,-29,-25,  1,-31,-22, 26,-17, 12, 11,-24,-26,-21,-17,-15, -5, 30,-20,  2,-25;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-12,-34,-24,  4,-34,-24, 27,-30, 34, 17,-26,-27,-21,-24,-25,-10, 15,-22, -2,-24;
/M: SY='E'; M= -7,  3,-28,  6, 19,-30,-12, -2,-28, 17,-22,-12,  1,-10, 19, 16, -3,-10,-24,-24,-15, 18;
/M: SY='Q'; M=-12, -4,-28, -2, 12,-20,-22, 13,-19, 11,-14, -5, -4,-15, 15, 10, -8,-11,-18,-20,  0, 12;
/M: SY='M'; M=-10,-19,-23,-23,-13, -1,-25,-12,  7,-10, 14, 15,-16,-21, -4, -5,-15, -8,  2,-20, -2, -9;
/M: SY='E'; M=-11, -1,-10, -3, 12, -2,-20, -7,-20, -3,-15,-13,  1,-16, -1, -5, -3, -7,-19,-23, -8,  7;
/M: SY='E'; M=  0, -4,-26, -3,  9,-26,  6,-10,-24, -2,-21,-11, -3, -3,  3, -7,  2, -6,-21,-25,-20,  5;
/M: SY='E'; M=  2,  5,-22,  8, 21,-25,-13, -8,-20, -2,-20,-17,  2, -1,  3, -9,  7, -2,-16,-32,-20, 12;
/M: SY='S'; M=  0,-14,-22,-14,-11,-13, -8,-15,-11, -6,-17,-10,-10, -9,-10, -6,  2, -2, -4,-13, -8,-12;
/M:         M= -4, -5,-23, -9,  0, -8,-18,-12, -5, -9, -3, -5, -1, -8, -7,-11, -5, -5, -9,-25,-11, -4;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 34 in 34 different sequences
Number of true positive hits 34 in 34 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] PRELI/MSF1
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
34 sequences

PREL_DROME  (Q9V579), PRLD1_BOVIN (Q32KN9), PRLD1_CHICK (Q90673), 
PRLD1_HUMAN (Q9Y255), PRLD1_MOUSE (Q8R107), PRLD2_HUMAN (Q8N945), 
PRLD2_MOUSE (Q0VBB0), PRLD2_XENLA (Q6NTS7), PRLD2_XENTR (Q5BKH5), 
RETM_AEDAE  (Q16KN5), RETM_ANOGA  (Q7PWB1), RETM_DROME  (Q9VMD6), 
RETM_DROPS  (Q29JQ0), S14L1_HUMAN (Q92503), S14L5_HUMAN (O43304), 
S14L5_XENTR (Q0V9N0), SLMO1_HUMAN (Q96N28), SLMO1_MOUSE (Q8VE85), 
SLMO1_XENLA (Q6GM21), SLMO2_BOVIN (Q58DB0), SLMO2_CRIGR (Q6TMK8), 
SLMO2_HUMAN (Q9Y3B1), SLMO2_MACFA (Q4R5S9), SLMO2_MOUSE (Q9CYY7), 
SLMO2_PIG   (A5GFX0), SLMO2_RAT   (Q6P9U4), SLMO_DICDI  (Q54G07), 
SLMO_DROME  (Q9V3U9), UPS1_SCHPO  (Q9UT07), UPS1_YEAST  (Q05776), 
UPS2_SCHPO  (O59707), UPS2_YEAST  (P35200), UPS3_YEAST  (Q04006), 
YN02_CAEEL  (Q03606)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission