PROSITE entry PS50911

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
View entry auxiliary file in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission

General information about the entry

Entry name [info]	CHAP
Accession [info]	PS50911
Entry type [info]	MATRIX
Date [info]	01-JUN-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 29-MAY-2024 INFO UPDATE.
PROSITE Doc. [info]	PDOC50911
Associated ProRule [info]	PRU00048

Name and characterization of the entry

Description [info]

CHAP domain profile.

Matrix / Profile [info]

/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=130;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=125;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.9443059; R2=0.0272077; TEXT='NScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=241; N_SCORE=9.5; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=131; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;

...

                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M:         M= -4, -7,-20, -8, -2,-15,-14,-11, -9, -3,-10, -5, -6,-13, -4, -4, -2, -4, -6,-24, -9, -4;
/M: SY='N';  M=  0, -2,-22, -5, -7,-17, -6,-12,-13, -3,-15,-10,  1,-10, -7, -7,  1, -2, -9,-26,-14, -8;
/M: SY='S';  M=  1, -1,-23, -1,  2,-22,-10,-10,-15, -3,-16,-11, -2, -5,  0, -8,  3, -1,-12,-27,-15,  0;
/M:         M= -2, -5,-23, -5, -5,-12, -9, -5,-16, -6,-13,-10, -6,-13, -7, -8, -2, -2,-12,-15, -3, -6;
/M: SY='Y';  M= -6, -3,-24, -3, -2,-10,-15, -3,-13, -3,-13, -9, -2,-14, -3, -5, -2, -3,-12,-19,  1, -4;
/M: SY='S';  M= -1, -2,-20, -3, -2,-15, -8, -8,-17, -6,-15,-11,  0,-13, -5, -7,  2, -1,-13,-21,-10, -4;
/M: SY='Y';  M= -8,-14,-26,-15,-10,  0,-18,-10, -6,-11, -7, -6,-11,-14,-10,-10, -9, -6, -8, -1,  8,-11;
/M:         M= -2, -7,-21,-11, -8, -3,-12,-10, -8,-10, -7, -6, -2,-16, -9,-10, -1, -3, -7,-20, -4, -9;
/M:         M= -1, -3,-22, -4, -2,-16,-11,-10,-13, -1,-13, -9, -2,-12, -4, -3,  0, -3, -9,-26,-12, -4;
/M:         M= -3, -8,-25,-10, -6,-14, -6,-10,-14, -3,-15, -9, -4,-12, -5, -5, -2, -4,-13,-15, -6, -6;
/M: SY='N';  M= -2,  2,-21, -2, -1,-15, -9, -8,-14, -4,-16,-12,  7,-10, -4, -6,  5,  2,-13,-27,-12, -3;
/M: SY='N';  M= -4, -1,-23, -3,  1,-18,-11, -7,-14,  0,-15,-10,  2,-12, -2,  0,  0, -3,-11,-27,-14, -2;
/M: SY='G';  M=  0, -5,-16, -8,-10,-20,  6, -9,-18,-10,-19,-12,  1,-13, -8,-11,  6, -1,-12,-28,-17,-10;
/M: SY='S';  M= -2, -5,-22,-10, -6,-12,-13, -8, -9, -4,-14, -6,  0,-12, -3, -4,  2,  0, -8,-21, -7, -6;
/M: SY='G';  M= -3, -6,-25, -6, -7,-16,  6, -8,-19, -9,-17,-10, -3,-13, -6,-10,  0, -6,-16,-20, -9, -7;
/M:         M= -6, -6,-24, -7,-11, -4,-10,-10, -9,-14,-10, -8, -5,-13,-13,-15, -5, -6, -9,-11,  0,-13;
/M: SY='D';  M= -8, 18,-25, 19,  2,-24, -2, -1,-24, -1,-24,-18, 16,-14, -3, -6,  3, -4,-21,-30,-13, -1;
/M: SY='G';  M=  0,-12,-23,-14,-10,-12,  1,-14,-13,-10,-14, -9, -7, -8,-10,-12, -2, -7,-10,-21,-11,-11;
/M: SY='N';  M=-13, 18,-26, 15,  0,-15, -9, -1,-21, -3,-20,-15, 19,-18, -2, -4, -1, -7,-23,-19, -8, -1;
/M: SY='G';  M= -1, -8,-14,-12,-12,-14,  3,-13,-16,-13,-10, -7, -3,-15,-11,-10,  1, -1,-12,-25,-13,-12;
/M: SY='Y';  M=-10,-17,-23,-19,-19, 11,-10,  0, -7,-14, -6, -3,-14,-25,-14,-14,-11, -9, -9,  9, 32,-18;
/M: SY='Y';  M= -3,-16,-25,-17,-13,  0,-10, -7,-11,-13,-10, -7,-12, -1,-13,-14, -6, -4,-11, -9,  6,-15;
/M: SY='G';  M= -5,-12,-27,-14,-13, -8,  7,-12,-18, -5,-16, -8, -7,-19,-11, -8, -6,-11,-15, -5, -3,-12;
/M: SY='G';  M= -4,-15,-28,-17,-18,-10, 22,-14,-26,-13,-20,-15, -9,-22,-15,-10, -8,-14,-22,  8, -3,-17;
/M: SY='Q';  M= -9,  0,-30,  0, 19,-37,-16,  7,-21,  8,-21, -3,  1,-10, 51,  7,  0,-10,-30,-18,-11, 35;
/M: SY='C';  M=-10,-18,117,-28,-29,-20,-30,-29,-30,-29,-20,-20,-19,-39,-29,-30,-10,-10,-10,-50,-30,-29;
/M: SY='T';  M= -1,-15,-13,-21,-19,  3,-22,-20,  0,-15, -4, -4,-14,-20,-18,-15,  1, 18,  8, -8,  2,-18;
/M: SY='W';  M=-13,  3,-34, 11,  6,-16,-15,-10,-26, -6,-22,-21, -7,-14, -3,-12,-11,-14,-26, 26,  1,  2;
/M: SY='Y';  M=-14,-24,-25,-26,-23, 27,-17, -6, -1,-21,  7,  0,-20,-28,-21,-16,-19,-10, -4, 10, 31,-22;
/M: SY='A';  M= 18,-19,-14,-23,-17,-11,-16,-23,  6,-14, -4, -3,-18, -8,-17,-19,  0,  0, 16,-24,-13,-18;
/M: SY='Y';  M= -5, -9,-15,-15,-12,  1,-17, -6,-14, -1,-12, -8, -3,-22,-10,  2, -8, -8,-11, -9,  6,-12;
/M: SY='N';  M=-10,  2,-26,  0, -2,-11,-13, -3,-19, -1,-17,-11,  4,-18,  0,  3, -4, -7,-18, -7, -2, -2;
/M: SY='R';  M=-14,-19,-27,-21,-14,  5,-22, -6, -9,  1, -3, -1,-14,-24, -7, 16,-16,-10, -8,  2, 14,-13;
/M: SY='L';  M=  0,-21,-17,-25,-18,  3,-18,-17,  0,-15,  5,  3,-18,-23,-15,-10,-12, -6,  1, -5, -1,-17;
/I:         I=-5; MD=-9;
/M: SY='K';  M=  2, -3,-21, -8, -6,-10,-11, -7,-13,  3,-13, -5,  0,-13, -5, -2, -2, -4,-11,-18, -3, -6; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-9;
/M: SY='Q';  M= -8, -1,-26, -2, 11,-20,-16,  5,-18,  4,-16, -8,  0,-13, 13,  2, -4, -9,-20,-11, -4, 12; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-9;
/M: SY='L';  M= -3,-18,-21,-21,-15,  0,-19,-14,  4,-14, 12,  4,-17,-22,-11, -9,-15, -8,  1, -8,  0,-14; D=-5;
/I:         I=-5; MD=-9;
/M: SY='G';  M= -7, -9,-26,-10,-14, -9, 23,-13,-24,-10,-19,-12, -4,-18,-14,-11, -7,-14,-20, -1, -7,-13; D=-5;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='Y';  M= -6, -9,-19,-10, -7, -5, -8, -4, -6, -4, -5, -2, -6,-12, -6, -5, -7, -6, -7, -9,  2, -7; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='P';  M= -4, -9,-19, -9, -4,-11,-11, -8, -9, -5,-12, -6, -6,  4, -3, -7,  0, -2, -9,-17, -9, -4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M:         M= -3, -9,-21,-12,-12,-10, -2,-15, -3,-13, -7, -3, -4,-17,-12,-13, -5, -7, -2,-22,-12,-13; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M:         M= -5,-10,-17,-11,-10, -5,-10,-14, -7,-15, -7, -7, -7,-10,-14,-14, -4, -5, -4,-21,-10,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='N';  M= -7,  7,-23,  5,  0,-21,-10, -5,-18,  0,-19,-12,  9,-11,  0,  1,  4,  2,-15,-28,-14, -1; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='Y';  M=-10,-11,-23,-14,-12,  0,-13, -7, -6,-14,  2, -1, -9,-22,-12,-11,-10, -3, -7, -8,  4,-12; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-9;
/M: SY='W';  M=-11,-25,-31,-27,-20,  7,-22,-18, -3,-15, -3,  0,-24,-21,-15,-15,-21,-13, -8, 41, 12,-16;
/M: SY='G';  M=  1,-10,-28,-10,-17,-28, 57,-19,-36,-17,-28,-19, -1,-19,-17,-17,  1,-17,-26,-19,-27,-17;
/M: SY='N';  M=-11, 28,-22, 19,  1,-20, -7,  9,-19, -3,-21,-14, 36,-18,  0, -4,  4, -3,-24,-35,-13,  0;
/M: SY='A';  M= 26,-10,-19,-15,-14,-22, 24,-19,-20,-14,-17,-13, -6,-15,-14,-20,  5, -8,-11,-20,-21,-14;
/M: SY='G';  M= -1, -6,-23,-10, -9,-17,  2,-10,-19,  0,-18,-10,  0,-18, -6,  1, -3, -9,-15,-17,-12, -8;
/M: SY='D';  M= -8, 20,-25, 23, 10,-25,-13, -1,-25,  3,-22,-16, 12,-12,  6, -3,  2, -1,-22,-29,-12,  8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='W';  M=-13,-24,-40,-26,-22,  3,-15,-20,-18,-14,-18,-17,-23,-26,-15,-14,-26,-21,-25, 91, 20,-16;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='A';  M=  2, -6,-23, -8, -7,-11, -2,-12,-14, -7,-13, -9, -4,-15, -8, -9, -3, -8,-11,-15, -8, -8; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='N';  M= -1,  5,-21,  2,  2,-18, -8,  0,-18, -1,-18,-11,  7,-13,  1, -2,  4, -1,-15,-24, -8,  1; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='N';  M= -4, -1,-20, -5, -2,-12, -9, -7,-14,  2,-17,-10,  5,-13,  0,  2,  3,  0,-12,-22, -9, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='A';  M= 17, -9,-18,-13, -9,-17,  3,-12,-14, -9,-11, -8, -7,-10, -9,-12,  1, -5, -8,-17,-14,-10; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-16;
/M: SY='A';  M=  5,-10,-18,-12, -6,-15, -6,-15,-14, -5,-13,-10, -9, -8, -6, -7, -3, -6, -9, -8,-11, -6; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='A';  M=  7, -7,-16,-10, -4,-12,-13,-12, -8, -2, -9, -6, -5,-13, -3, -4,  3,  3, -3,-21, -9, -4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='V';  M=  1,-12,-20,-13, -8,-13,-20,-14,  1, -4, -3,  0,-11,-15, -3, -6, -5, -4,  4,-22, -8, -6; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='G';  M= -4,-10,-26,-12,-17,-12, 20, -9,-18,-16,-16,-10, -4,-19,-15,-16, -5,-13,-14,-16, -7,-17; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='Y';  M=-14,-15,-28,-16,-11,  7,-18,  1,-13, -2,-10, -6,-11,-23, -5,  2,-13,-11,-15, 10, 25, -9;
/M: SY='N';  M= -8,  3,-24, -2,  0,-15,-12, -5,-18,  1,-19,-11,  9, -6, -1,  3,  1,  1,-18,-25,-12, -2;
/M: SY='T';  M= -3, -9,-17,-12,-15, -9,-14,-17, -1,-13, -8, -6, -7,-15,-15,-12,  3, 11,  7,-27, -9,-16;
/M: SY='S';  M= -5,  2,-23,  2, -3,-22,  3,-10,-23, -8,-22,-16,  4, -3, -7,-10,  7,  4,-17,-29,-18, -6;
/M: SY='N';  M= -2,  6,-20,  3, -1,-21, -5,  4,-21, -2,-22,-13, 11,-15, -2, -1,  8,  2,-15,-31,-13, -2;
/I:         I=-11; MD=-23;
/M: SY='F';  M=  0, -7,-13, -9, -6,  3, -7, -7, -5, -9, -4, -3, -5, -7, -8, -9, -3, -2, -5,-10, -1, -7; D=-11;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='T';  M= -1, -1,-19, -6, -4,-18,-15,-11,-13,  5,-14, -8,  1,-14, -1,  2,  3,  9, -7,-27,-12, -3;
/M: SY='P';  M= -4,-19,-35,-13, -3,-26,-19,-19,-16,-11,-22,-15,-19, 70,-10,-19, -9, -9,-24,-28,-26,-10;
/M: SY='K';  M= -5, -4,-24, -5,  7,-24,-18, -7,-17, 15,-17, -5, -4,-12, 12, 10, -2, -4,-12,-24,-11,  9;
/M: SY='A';  M=  8,-16,-21,-18,-10,-16,-18,-20, -1, -8,-10, -6,-15,  5,-12,-13, -3, -2,  5,-25,-16,-12;
/M: SY='G';  M= -3, -4,-29, -3,-15,-28, 52,-13,-36,-18,-26,-18,  1,-19,-17,-18, -1,-18,-27,-22,-24,-16;
/M: SY='A';  M= 14,  8,-17, 10, -1,-23, -5,-11,-20, -7,-19,-17,  2,-12, -6,-14, 10,  2,-11,-26,-15, -4;
/M: SY='I';  M=  0,-26,-21,-32,-25,  1,-28,-26, 26,-24, 15, 12,-21,-22,-21,-23,-14, -6, 23,-18, -4,-24;
/M: SY='V';  M=  7,-23,-15,-28,-22,  4,-19,-21, 11,-20, 11,  7,-21,-23,-21,-20,-10, -5, 15,-19, -4,-21;
/M: SY='V';  M= -2,-16,-10,-19,-16, -9,-22,-19,  8,-15, -6, -1,-12,-22,-10,-15,  0,  0, 14,-23,-10,-14;
/M: SY='F';  M=-13,-23,-25,-28,-21, 29,-24,-15, -4,-19, -2, -3,-19,-25,-19,-16,-13, -5, -6, 24, 22,-18;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='A';  M=  1, -6,-15, -7, -4,-12, -5, -8, -8, -3,-11, -6, -4, -2, -2, -5,  1,  0, -6,-16, -8, -4; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  1, -6,-17, -7, -6,-10, -2, -8,-12, -8,-13, -9, -3, -5, -6, -9,  4,  0, -9,-16, -7, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='G';  M= -3, -2,-19, -4, -9,-12, 13, -9,-18, -9,-16,-11,  2,-14, -9, -9,  1, -5,-13,-15,-10, -9; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-16;
/M: SY='S';  M=  3,  0,-21, -2, -6,-15,  0,-11,-17,-10,-18,-14,  1, -9, -9,-14,  6,  2,-13,-22, -9, -8;
/M: SY='D';  M= -5,  4,-24,  6, -3,-17, -4,-10,-20, -8,-17,-14,  0, -9, -8,-11, -1, -4,-15,-22,-10, -6;
/M: SY='G';  M=  1, -4,-24, -7, -9,-23, 16, -7,-23,-11,-22,-13,  2, -7, -9,-13,  4, -4,-19,-26,-19,-10;
/M: SY='P';  M= -2, -8,-26, -7, -4,-22, -1,-12,-20, -8,-22,-14, -5,  9, -4,-11,  2, -1,-18,-22,-16, -5;
/M: SY='Y';  M=-13,-20,-27,-22,-20, 23,-26,  3, -1,-14, -2, -3,-19,-27,-14,-13,-15, -7, -6, 24, 49,-19;
/M: SY='G';  M=  0, -6,-29, -6,-17,-30, 62,-18,-38,-18,-30,-20,  3,-19,-18,-19,  2,-17,-29,-22,-29,-18;
/M: SY='H';  M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='V';  M= -1,-25,-11,-27,-26, -2,-29,-28, 24,-19,  8,  7,-24,-26,-26,-19, -6,  8, 39,-29, -9,-26;
/M: SY='A';  M= 32, -7,-15,-14,-10,-22, 12,-18,-16,-11,-15,-11, -6,-13,-11,-18,  7, -4, -7,-22,-21,-10;
/M: SY='I';  M= -9,-28,-24,-35,-28, 19,-32,-22, 24,-25, 11,  9,-23,-25,-24,-23,-18, -9, 19, -2, 13,-27;
/M: SY='V';  M= -2,-30,-14,-32,-30,  2,-32,-30, 32,-22, 12, 12,-28,-28,-28,-22,-12, -2, 45,-27, -7,-30;
/M: SY='E';  M= -5, -3,-20, -3, 12,-16,-22,-13, -9, -3,-10, -9, -5,-10, -1, -8,  2,  7, -6,-27,-12,  5;
/M: SY='E';  M=  1,  2,-22,  2, 10,-23, -7, -1,-22,  3,-22,-14,  4,-11,  6, -1,  7, -2,-18,-27,-13,  8;
/M: SY='V';  M= -1,-18,-17,-17,-20, -8,-22,-24, 14,-18,  3,  2,-19,-18,-22,-19, -8, -3, 25,-29,-13,-22;
/M: SY='N';  M= -5,  6,-16,  0, -5,-15, -4,  0,-19, -6,-19,-12, 12,-18, -4, -6,  5,  0,-17,-27, -9, -5;
/M: SY='D';  M= -4,  8,-24, 11,  2,-25,  3, -9,-25, -5,-22,-17,  6, -7, -5, -9,  5, -3,-20,-29,-18, -2;
/M: SY='D';  M=-11, 28,-26, 33,  6,-30,  0, -3,-31,  1,-28,-22, 21,-14, -2, -5,  4, -4,-25,-34,-18,  2;
/M: SY='G';  M= -4, -7,-23, -9,-14,-17, 22,-12,-26,-11,-22,-15, -1,-19,-11,-10,  1, -4,-20,-12, -8,-13;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S';  M=  0, -2,-11, -3, -3, -8, -7, -5,-10, -3,-13, -8,  1, -9, -2, -3, 12, 11, -6,-16, -2, -3; D=-12;
/I:         I=-12; DM=-25;
/M: SY='I';  M=-10,-28,-23,-35,-28, 14,-30,-23, 28,-25, 14, 15,-23,-25,-24,-23,-18, -8, 23,-12,  6,-27;
/M: SY='R';  M=-11, -9,-20,-11, -4,-12,-23, -9, -7, -4, -1, -2, -9,-19,  1,  2, -8,  0, -7,-17, -3, -3;
/M: SY='V';  M= -4,-24,-19,-28,-24, -2,-26,-26, 25,-22,  7,  8,-19,-22,-22,-22, -7,  1, 28,-26, -7,-25;
/M: SY='A';  M=  5,-13,-16,-15, -7, -9,-16,-15,  0,-13, -2, -2, -9,-17, -8,-14,  5,  3,  3,-27,-10, -8;
/M: SY='E';  M=-11, 13,-30, 23, 45,-31,-11,  0,-32,  6,-22,-20,  3, -4, 15, -3,  0,-11,-30,-30,-20, 30;
/M: SY='Q';  M= -4, -6,-20, -9,  2,-22,-14,  3,-12, -1,-13,  5, -5,-15, 25, -2,  0, -5,-17,-19, -3, 13;
/M: SY='N';  M=-10, 37,-21, 18, -1,-21,  2,  8,-21, -1,-30,-20, 56,-17, -1, -1,  9, -1,-30,-39,-21, -1;
/M: SY='W';  M=-13,-23,-28,-25,-20,  9,-23, -4, -2,-14, -6, -3,-21,-25,-11,-14,-18,-12, -5, 30, 30,-17;
/M: SY='N';  M= -4,  1,-24, -1, -7,-19,  1, -9,-16, -4,-17,-10,  5,-14, -7, -4, -1, -6,-14,-25,-14, -8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='G';  M= -4, -2,-23, -6,-12,-13, 21, -8,-22,-13,-19,-13,  5,-15,-13,-12, -1, -8,-18,-20,-14,-12; D=-8;
/I:         I=-8; MD=-17;
/M: SY='N';  M= -6,  2,-20, -1, -1,-15, -5,  3,-15, -2,-17,-10,  8, -3,  0, -2,  1, -3,-16,-21, -9, -2; D=-8;
/I:         I=-8; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
/M: SY='G';  M=  5, -5,-20, -6, -7,-21, 20,-12,-22, -5,-19,-11, -1, -7, -6, -9,  2, -7,-16,-18,-18, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='W';  M= -8,-12,-25,-11, -8, -6,-16,-10, -9, -9, -5, -6,-12, -9, -5, -8,-10, -7,-12,  8,  3, -7; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M: SY='Y';  M= -8, -7,-26, -7, -9, -9, -4, -5,-16, -9,-15,-10, -6,-13, -8, -9, -5, -5,-14, -7,  3,-10; D=-8;
/I:         I=-8; DM=-17;
/M:         M= -5, -7,-22,-11, -9,-14,-16,-12, -2, -7, -9, -4, -2,-16, -6, -7, -3, -2, -1,-22,-11, -9;
/M:         M= -6,-12,-26,-13, -9,-12, -5,-12, -8,-10, -9, -5, -8,-14, -7, -8, -6, -7, -8,-15, -6, -9;
/M: SY='N';  M= -3,  0,-21, -4, -5,-12,-13,  0,-11, -6,-17,-10,  6,-12, -4, -8,  6,  3,-10,-25, -3, -5;
/M: SY='Y';  M= -4,-12,-23,-13, -6, -2,-14, -5,-11, -9,-11, -8, -9,-13, -7,-10, -2, -2,-10, -9,  7, -7;
/M: SY='R';  M= -7,-11,-27,-12, -4,-15,-15, -4,-19, 11,-15, -8, -5,-17,  3, 28, -8, -9,-15,-12, -2, -4;
/M: SY='T';  M= -6, -5,-24, -6, -2,-18,-14, -9,-15, -4,-14,-10, -5, -1, -3, -5,  1,  7,-12,-24,-12, -4;
/M: SY='I';  M= -8,-19,-25,-23,-17,  3,-23,-16,  6,-14,  3,  2,-15,-22,-15,-11,-14, -9,  3, -5,  3,-17;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='S';  M= -5, -4,-21, -5, -3,-11,-13, -6,-14, -5,-16,-10,  1, -8, -2, -2,  5,  2,-12,-20, -9, -3; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A';  M=  5, -7,-18,-10, -9,-11, -9,-11, -8, -7, -7, -6, -4,-12, -9, -8,  0, -1, -5,-20,-10, -9; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='P';  M= -4, -6,-23, -6,  0,-13,-11, -1,-14, -3,-15, -9, -4,  1,  0, -4, -2, -5,-14,-16, -4, -2; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='Q';  M= -5,  3,-17,  3,  5,-16,-13,  5,-12, -2,-10, -4,  1,-10,  6, -4,  0, -1,-10,-20, -5,  5; D=-7;
/I:         I=-7; MD=-14;
/M: SY='A';  M=  3, -5,-13, -7, -5, -7, -7, -9, -6, -4, -8, -6, -4,-10, -6, -5,  1,  1, -2,-15, -5, -6; D=-7;
/I:         I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14;
/M: SY='G';  M= -3,  5,-22,  5,  2,-22, 11, -7,-25, -3,-23,-16,  8,-10, -1, -5,  6, -5,-21,-25,-18,  1; D=-7;
/I:         I=-7; DM=-14;
/M: SY='S';  M= -2, -3,-19, -7, -7,-18, -5,-12,-11, -7,-16, -9,  1,-11, -6, -9,  4,  0, -7,-29,-16, -7;
/M: SY='V';  M= -3,-18,-19,-22,-19,  2,-20,-14,  7,-14,  5,  8,-17,-22,-15,-14, -9, -1, 10,-16,  5,-18;
/M: SY='T';  M= -8, -8,-15,-12,-12,-10, -8, -8,-17,-12,-15,-12, -4,-20, -9,-10, -3,  1,-14, -3, -1,-11;
/M: SY='Y';  M=-18,-24,-26,-28,-24, 43,-29, -2, -1,-18,  3, -1,-20,-29,-22,-15,-19, -8, -6, 25, 50,-23;
/M: SY='I';  M= -6,-27,-23,-33,-25,  1,-33,-27, 30,-25, 13, 11,-21,-14,-21,-25,-15, -4, 22,-22, -4,-26;
/M: SY='Y';  M=-14, -9,-25, -8, -5, -8,-23, 11,-12, -3, -9, -3, -6,-15,  0,  4, -9, -6,-13,-15, 12, -6;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;

» more

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2024_05 which contains 572'214 sequence entries.

Total number of hits	61 in 61 different sequences
Number of true positive hits	61 in 61 different sequences
Number of 'unknown' hits	0
Number of false positive hits	0
Number of false negative sequences	0
Number of 'partial' sequences	0

Precision (true positives / (true positives + false positives))	100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives))	100.00 %

Comments [info]

Taxonomic range [info]	Bacteriophages, Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info]	1
Matrix type [info]	protein_domain
Scaling database [info]	reversed
Author [info]	CJA_Sigrist
Feature key [info]	DOMAIN
Feature description [info]	CHAP
Version [info]	3

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences

61 sequences

ENLYS_BPG15 (D6QY02), ENLYS_BPPGK (Q6Y7T6), ENLYS_BPPHA (Q8SDS7),

ENLYS_BPSH5 (B8QIR1), ENLYS_BPTWO (O56788), GSP_CRIFA   (P90518), 
GSP_ECOLI   (P0AES0), GSP_SHIFL   (P0AES1), LDP_STAA8   (Q2G278), 
LYS_BPB30   (Q8HA43), LYTA_STAAU  (P24556), LYTN_STAA8  (Q9ZNI1), 
LYTN_STAAC  (Q5HGI5), LYTN_STAAM  (Q99UM3), LYTN_STAAN  (Q7A5Y8), 
LYTN_STAAR  (Q6GHI8), LYTN_STAAS  (Q6G9W6), LYTN_STAAW  (Q7A123), 
LYTO_STAA8  (Q2FX77), PCSB_STRP2  (A0A0H2ZQ76), PCSB_STRPN  (A0A0H2US70), 
PCSB_STRR6  (Q8DMY4), PH_STAA8(Q2FYD8), PLYCA_BPSC1 (Q7Y3F1), 
SLE1_STAA3  (Q2FJH7), SLE1_STAA8  (Q2G0U9), SLE1_STAAB  (Q2YVT4), 
SLE1_STAAC  (Q5HIL2), SLE1_STAAN  (Q7A7E0), SLE1_STAAR  (Q6GJK9), 
SLE1_STAAS  (Q6GC24), SLE1_STAAU  (P0C1U7), SLE1_STAAW  (Q7A1T4), 
SLE1_STAEQ  (Q5HRU2), SLE1_STAES  (Q8CMN2), SLE1_STAHJ  (Q4L3C1), 
SLE1_STAS1  (Q49UX4), SSAA1_STAAC (Q5HCY4), SSAA1_STAAM (Q7A2K8), 
SSAA1_STAAN (Q7A3D7), SSAA1_STAAR (Q6GDN3), SSAA1_STAAS (Q6G6A8), 
SSAA1_STAAW (Q79ZY3), SSAA2_STAA8 (Q2G2J2), SSAA2_STAAC (Q5HDQ9), 
SSAA2_STAAM (Q99RX4), SSAA2_STAAN (Q7A423), SSAA2_STAAR (Q6GED5), 
SSAA2_STAAS (Q6G723), SSAA2_STAAW (Q8NV83), SSAAL_STAA8 (Q2G0D4), 
SSAA_STAA8  (Q2FV55), SSAA_STAAE  (Q53587), SSAA_STAEP  (Q9KJT6), 
SSAA_STAEQ  (Q5HLV2), SSAA_STAES  (Q7CCJ3), TRYS_CRIFA  (O60993), 
TRYS_TRYCC  (Q9GT49), USP45_LACLM (P22865), Y2979_STAA8 (Q2G222), 
Y367_STRMU  (Q8DVU8)

» more

Retrieve an alignment of UniProtKB/Swiss-Prot true positive hits:
[Clustal format, color, condensed view] [Clustal format, color]
[Clustal format, plain text] [Fasta format]
Retrieve the sequence logo from the alignment

PDB
[Detailed view]

15 PDB

2IO7; 2IO8; 2IO9; 2IOA; 2IOB; 3A2Y; 3A2Z; 3A30; 3O98; 4CGK; 4CSH; 4CT3; 4F88; 4OLK; 5T1Q
» more