ID MIR; MATRIX. AC PS50919; DT 01-AUG-2003 CREATED; 01-OCT-2013 DATA UPDATE; 27-MAR-2024 INFO UPDATE. DE MIR domain profile. MA /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=56; MA /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=51; MA /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.4597137; R2=0.0244729; TEXT='NScore'; MA /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=247; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='R'; MA /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=96; N_SCORE=4.8; MODE=1; TEXT='RR'; MA /DEFAULT: B0=-30; E0=-30; M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; MA /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105; MA /M: SY='G'; M=-4,-4,-26,-3,-5,-24,17,-9,-26,-11,-22,-15,0,-5,-8,-12,-1,-10,-22,-26,-21,-8; MA /M: SY='E'; M=-4,1,-23,2,4,-24,-2,-8,-23,-1,-21,-14,2,-8,0,-1,3,-4,-18,-28,-17,1; MA /M: M=-6,-5,-23,-7,-3,-8,-19,-3,-8,-6,-8,-5,-4,-13,-6,-7,-5,-2,-7,-21,-1,-6; MA /M: SY='I'; M=-6,-28,-21,-30,-26,2,-26,-26,24,-24,15,10,-25,-25,-23,-22,-17,-8,24,-14,-3,-26; MA /M: SY='R'; M=-7,-8,-25,-9,-2,-17,-18,-4,-16,10,-13,-6,-5,-10,1,11,-7,-4,-12,-21,-7,-2; MA /M: SY='W'; M=-12,-16,-22,-18,-16,0,-15,-6,-12,-12,-11,-9,-13,-22,-12,-9,-13,-10,-12,15,14,-15; MA /M: SY='G'; M=-2,-5,-26,-6,-14,-23,38,-14,-28,-14,-22,-15,4,-20,-14,-14,0,-13,-22,-23,-21,-14; MA /M: SY='D'; M=-5,13,-22,17,9,-27,-9,2,-25,-2,-25,-17,10,-10,7,-5,12,3,-20,-34,-15,8; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='V'; M=-2,-12,-21,-13,-9,-10,-20,-12,0,-8,-3,-1,-12,-13,-9,-9,-5,-2,4,-23,-6,-10; MA /M: SY='V'; M=-8,-28,-10,-33,-27,16,-31,-24,21,-25,14,9,-24,-28,-26,-22,-16,-6,24,-18,3,-27; MA /M: SY='R'; M=-14,-11,-26,-13,-4,-13,-22,-7,-16,14,-12,-5,-5,-19,5,34,-8,-4,-11,-19,-6,-3; MA /M: SY='L'; M=-11,-30,-21,-33,-23,17,-31,-22,22,-29,37,16,-27,-28,-23,-21,-26,-9,13,-16,3,-23; MA /M: SY='R'; M=-12,-12,-25,-14,-5,-7,-23,-7,-9,8,-7,0,-8,-19,1,16,-11,-8,-6,-18,-3,-3; MA /M: SY='H'; M=-16,4,-28,2,1,-21,-16,77,-28,-9,-22,-4,14,-15,8,-1,-4,-15,-29,-32,11,0; MA /M: SY='V'; M=-1,-20,-17,-23,-18,-7,-17,-18,9,-16,7,6,-17,-21,-15,-15,-10,-4,12,-24,-9,-17; MA /M: SY='N'; M=1,0,-15,-3,-2,-18,-9,-5,-16,-4,-15,-10,2,-15,-5,-7,2,-1,-11,-28,-13,-4; MA /M: SY='T'; M=1,-2,-14,-7,-6,-13,-14,-12,-11,-10,-11,-8,0,-11,-4,-10,15,26,-5,-29,-11,-5; MA /M: SY='G'; M=-4,6,-26,6,3,-28,21,-7,-31,-4,-26,-18,9,-14,-2,-6,4,-9,-26,-27,-22,0; MA /I: I=-13; MI=0; MD=-27; IM=0; DM=-27; MA /M: SY='R'; M=-7,-10,-9,-13,-7,-16,-15,-7,-15,1,-10,-2,-6,-20,-3,5,-6,-5,-9,-26,-11,-6; MA /M: SY='Y'; M=-13,-18,-26,-21,-18,14,-23,-1,-7,-12,-5,-6,-16,-24,-13,-10,-17,-10,-12,26,36,-17; MA /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-21,9,-30,-20,22,-29,45,21,-29,-29,-20,-20,-28,-9,13,-20,0,-21; MA /M: SY='H'; M=-2,-5,-19,-8,-6,-16,-11,22,-20,-9,-16,-7,1,-13,-2,-7,2,1,-15,-23,-2,-6; MA /M: SY='S'; M=5,-13,-7,-16,-12,-8,-14,-13,-5,-15,-6,-5,-9,-18,-11,-15,7,5,1,-26,-7,-12; MA /M: SY='H'; M=-6,3,-22,2,4,-19,-14,22,-20,-6,-17,-8,6,-12,3,-5,5,2,-18,-31,-5,2; MA /M: SY='D'; M=-4,5,-24,7,5,-22,-6,-7,-20,-4,-19,-15,4,-8,-3,-8,2,-2,-16,-27,-15,0; MA /M: M=-5,-2,-22,-4,-2,-15,-16,-1,-10,-5,-12,-7,-1,-14,-2,-5,-1,-2,-7,-25,-7,-4; MA /M: SY='E'; M=-6,1,-25,2,7,-24,-14,-3,-20,3,-20,-12,2,1,6,1,1,-3,-19,-28,-15,5; MA /I: I=-4; MD=-8; MA /M: SY='Y'; M=-5,-11,-22,-11,-8,-4,-14,-6,-6,-9,-3,-4,-10,-11,-8,-10,-7,-5,-7,-12,5,-10; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-8; MA /M: SY='P'; M=-5,-11,-26,-7,-3,-19,-11,-13,-14,-4,-15,-10,-10,21,-5,-10,-6,-7,-15,-22,-15,-6; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-8; MA /M: M=-4,-5,-18,-5,0,-13,-17,-9,-6,-3,-5,-2,-6,-12,-1,-3,-3,-2,-4,-23,-9,-1; D=-4; MA /I: I=-4; MD=-8; MA /M: SY='W'; M=-6,-9,-19,-9,-7,-6,-11,-8,-7,-6,-5,-5,-9,-7,-7,-6,-8,-4,-8,5,0,-7; D=-4; MA /I: I=-4; MI=0; MD=-8; IM=0; DM=-8; MA /M: SY='G'; M=-2,3,-20,4,0,-23,16,-10,-24,-8,-21,-16,5,-13,-5,-9,5,-6,-18,-25,-19,-3; D=-4; MA /I: I=-4; DM=-8; MA /M: SY='K'; M=-6,-2,-24,-1,2,-14,-13,-8,-21,5,-20,-13,-1,-6,-2,2,2,-2,-15,-23,-10,-1; MA /M: SY='G'; M=-4,-6,-26,-7,-2,-18,2,-9,-17,-8,-12,-8,-3,-14,-4,-7,-4,-9,-15,-20,-13,-4; MA /M: SY='Q'; M=-6,1,-20,0,10,-26,-16,2,-20,3,-19,-8,0,-12,20,1,-1,-8,-21,-22,-11,14; MA /M: SY='Q'; M=-10,-9,-25,-11,-2,-11,-20,-1,-10,2,-8,1,-6,-17,10,6,-8,-6,-11,-17,-1,3; MA /M: SY='E'; M=-9,5,-27,9,22,-29,-16,-3,-26,13,-22,-14,2,-5,15,9,0,-6,-23,-27,-16,18; MA /M: SY='V'; M=4,-24,-13,-28,-24,-3,-25,-25,22,-19,9,9,-23,-23,-22,-20,-7,0,31,-26,-9,-24; MA /M: SY='T'; M=0,-7,-14,-13,-13,-9,-14,-14,-3,-12,-9,-5,-3,-17,-12,-12,9,16,4,-28,-9,-13; MA /M: SY='C'; M=1,-15,9,-20,-17,-10,-7,-17,-11,-19,-5,-6,-11,-22,-17,-19,-4,-5,-5,-27,-14,-17; MA /M: SY='Y'; M=-10,-10,-21,-11,-8,2,-23,1,-5,-8,-2,1,-10,-21,-7,-7,-10,-5,-4,-12,13,-8; MA /I: I=-7; MD=-14; MA /M: SY='E'; M=-4,-5,-20,-4,4,-21,-8,-6,-18,0,-18,-11,-4,-1,1,-3,0,-3,-15,-24,-14,1; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-14; MA /M: SY='E'; M=-7,1,-22,1,3,-9,-6,3,-19,-6,-15,-10,2,-13,-2,-6,0,-5,-17,-20,-5,0; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-14; MA /M: SY='G'; M=0,-5,-17,-6,-6,-18,3,-12,-17,-5,-16,-10,-2,-10,-7,-6,0,-5,-12,-22,-15,-7; D=-7; MA /I: I=-7; MD=-14; MA /M: SY='S'; M=1,-1,-10,-4,-3,-11,-5,-8,-9,-4,-9,-6,0,-10,-4,-5,2,1,-5,-18,-10,-4; D=-7; MA /I: I=-7; MI=0; MD=-14; IM=0; DM=-14; MA /M: SY='D'; M=-10,18,-24,22,9,-25,-6,9,-26,-1,-23,-16,13,-9,3,-4,2,-6,-23,-29,-12,5; D=-7; MA /I: I=-7; DM=-14; MA /M: SY='E'; M=0,-1,-18,-1,4,-19,-12,-9,-13,-3,-13,-6,-2,-10,-1,-8,2,-2,-10,-25,-12,1; D=-7; MA /I: I=-7; DM=-14; MA /M: SY='N'; M=-4,12,-24,10,4,-25,-6,-2,-24,6,-23,-15,14,-13,3,4,3,-4,-21,-29,-15,3; MA /M: SY='S'; M=-2,11,-13,9,4,-20,-11,-9,-18,-7,-20,-16,11,-10,-3,-10,12,9,-14,-34,-17,0; MA /M: SY='L'; M=-7,-14,-20,-16,-11,-5,-18,-10,-5,-13,1,-2,-14,-22,-10,-12,-13,-7,-6,-4,0,-11; MA /M: SY='W'; M=-19,-34,-40,-36,-27,22,-23,-24,-13,-20,-8,-12,-32,-29,-22,-17,-33,-23,-20,96,27,-20; MA /M: SY='K'; M=-5,0,-22,-3,1,-15,-17,-8,-12,2,-12,-8,2,-15,-1,2,0,2,-10,-25,-9,-1; MA /M: SY='I'; M=-5,-27,-19,-31,-25,5,-31,-25,27,-24,18,13,-23,-25,-22,-22,-16,-5,26,-22,-3,-25; MA /M: SY='E'; M=-6,0,-25,3,15,-20,-16,-1,-16,0,-12,-9,-2,-12,6,-2,-2,-6,-14,-27,-12,10; MA /M: SY='P'; M=-9,-10,-24,-7,0,-19,-19,-13,-12,-6,-14,-9,-10,14,-6,-7,-6,-6,-12,-28,-17,-5; MA /M: M=-3,-9,-16,-12,-11,-8,-15,-7,-4,-12,-6,-3,-6,-17,-11,-12,-3,-2,0,-25,-7,-12; MA /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105; NR /RELEASE=2024_02,571282; NR /TOTAL=241(62); /POSITIVE=241(62); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=0(0); NR /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0; CC /MATRIX_TYPE=protein_domain; CC /SCALING_DB=reversed; CC /AUTHOR=CJA_Sigrist; CC /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=5; CC /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=MIR; CC /VERSION=4; DR Q9TU34 , ITPR1_BOVIN, T; Q14643 , ITPR1_HUMAN, T; DR P11881 , ITPR1_MOUSE, T; P29994 , ITPR1_RAT , T; DR Q8WN96 , ITPR2_BOVIN, T; Q14571 , ITPR2_HUMAN, T; DR Q9Z329 , ITPR2_MOUSE, T; P29995 , ITPR2_RAT , T; DR Q8WN95 , ITPR3_BOVIN, T; Q14573 , ITPR3_HUMAN, T; DR P70227 , ITPR3_MOUSE, T; Q63269 , ITPR3_RAT , T; DR Q9Y0A1 , ITPR_CAEEL , T; P29993 , ITPR_DROME , T; DR Q8WSR4 , ITPR_PATPE , T; O74189 , PMT1_CANAL , T; DR O13898 , PMT1_SCHPO , T; P33775 , PMT1_YEAST , T; DR Q5ADM9 , PMT2_CANAL , T; Q9C100 , PMT2_SCHPO , T; DR P31382 , PMT2_YEAST , T; P47190 , PMT3_YEAST , T; DR Q59X23 , PMT4_CANAL , T; O42933 , PMT4_SCHPO , T; DR P46971 , PMT4_YEAST , T; Q5ACU3 , PMT5_CANAL , T; DR P52867 , PMT5_YEAST , T; Q5A688 , PMT6_CANAL , T; DR P42934 , PMT6_YEAST , T; Q06644 , PMT7_YEAST , T; DR F1QF89 , POMT1_DANRE, T; Q9VTK2 , POMT1_DROME, T; DR Q2LZ62 , POMT1_DROPS, T; Q9Y6A1 , POMT1_HUMAN, T; DR Q8R2R1 , POMT1_MOUSE, T; Q99PR0 , POMT1_RAT , T; DR F1Q8R9 , POMT2_DANRE, T; Q9W5D4 , POMT2_DROME, T; DR Q29IL2 , POMT2_DROPS, T; Q9UKY4 , POMT2_HUMAN, T; DR Q8BGQ4 , POMT2_MOUSE, T; P21817 , RYR1_HUMAN , T; DR E9PZQ0 , RYR1_MOUSE , T; P16960 , RYR1_PIG , T; DR P11716 , RYR1_RABIT , T; F1LMY4 , RYR1_RAT , T; DR Q92736 , RYR2_HUMAN , T; E9Q401 , RYR2_MOUSE , T; DR P30957 , RYR2_RABIT , T; B0LPN4 , RYR2_RAT , T; DR Q15413 , RYR3_HUMAN , T; A2AGL3 , RYR3_MOUSE , T; DR Q9TS33 , RYR3_RABIT , T; Q24498 , RYR_DROME , T; DR Q3T083 , SDF2L_BOVIN, T; Q9HCN8 , SDF2L_HUMAN, T; DR Q9ESP1 , SDF2L_MOUSE, T; Q93ZE8 , SDF2_ARATH , T; DR Q3SZ45 , SDF2_BOVIN , T; Q54P23 , SDF2_DICDI , T; DR Q99470 , SDF2_HUMAN , T; Q9DCT5 , SDF2_MOUSE , T; 3D 1N4K; 1XZZ; 2MC2; 2XOA; 3HSM; 3ILA; 3IM5; 3IM6; 3IM7; 3J8H; 3JAV; 3JRR; 3D 3MAL; 3QR5; 3T8S; 3UJ0; 3UJ4; 4I0Y; 4I1E; 4I2S; 4I37; 4I3N; 4I6I; 4I7I; 3D 4I8M; 4I96; 4JKQ; 4KEI; 4KEJ; 4KEK; 4L4H; 4L4I; 4UWA; 4UWE; 5GKY; 5GKZ; 3D 5GL0; 5GL1; 5GUG; 5J8V; 5T15; 5T9M; 5T9N; 5T9R; 5T9S; 5T9V; 5TA3; 5TAL; 3D 5TAM; 5TAN; 5TAP; 5TAQ; 5TAS; 5TAT; 5TAU; 5TAV; 5TAW; 5TAX; 5TAY; 5TAZ; 3D 5TB0; 5TB1; 5TB2; 5TB3; 5TB4; 5X9Z; 5XA0; 5XA1; 6DQJ; 6DQN; 6DQS; 6DQV; 3D 6DQZ; 6DR0; 6DR2; 6DRA; 6DRC; 6FG3; 6FOO; 6M2W; 6MU1; 6MU2; 6P25; 6P28; 3D 6P2R; 6UQK; 6WOT; 6WOU; 6WOV; 6ZQP; 6ZQQ; 7CF9; 7LHE; 7LHF; 7M6A; 7M6L; 3D 7T3P; 7T3Q; 7T3R; 7T3T; 7T3U; 7T64; 7T65; 7TDG; 7TDH; 7TDI; 7TDJ; 7TDK; 3D 7TZC; 7U9Q; 7U9R; 7U9T; 7U9X; 7U9Z; 7UA1; 7UA3; 7UA4; 7UA5; 7UA9; 7VML; 3D 7VMM; 7VMN; 7VMO; 7VMP; 7VMQ; 7VMR; 7VMS; 8DRP; 8DTB; 8DUJ; 8DVE; 8EAQ; 3D 8EAR; 8SEN; 8SEO; 8SEP; 8SEQ; 8SER; 8SES; 8SET; 8SEU; 8SEV; 8SEW; 8SEX; 3D 8SEY; 8SEZ; 8SF0; 8TK8; 8TKD; 8TKE; 8TKF; 8TKG; 8TKH; 8TKI; 8TL9; 8TLA; 3D 8UQ2; 8UQ3; 8UQ4; 8UQ5; 8UXC; 8UXE; 8UXF; 8UXG; 8UXH; 8UXI; 8UXL; 8UXM; PR PRU00131; DO PDOC50919; //