Entry: PS50921

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] ANTAR
Accession [info] PS50921
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50921
Associated ProRule [info] PRU00308

Name and characterization of the entry

Description [info] ANTAR domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=62;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=57;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9703017; R2=0.0155768; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2588.48352; R2=23.06960; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=452; N_SCORE=9.0; H_SCORE=11516; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=291; N_SCORE=6.5; H_SCORE=9302; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-7; D=-30; I=-30; B1=-300; E1=-300; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -3,-15,-21,-20,-15,  4,-22,-16,  3,-13,  6,  4,-12,-20,-14, -7,-10, -3,  2,-18, -2,-15;
/M: SY='Q'; M= -3, -6,-23, -7,  5,-22,-18, -7,-13,  5,-13, -5, -3,-13, 14,  6,  2,  0,-13,-25,-11,  9;
/M: SY='K'; M=  6, -1,-22, -3,  2,-25,-13, -9,-22, 14,-20,-11, -1,-12,  7, 12,  3,  0,-14,-24,-14,  4;
/I:         I=-9; MD=-32;
/M: SY='L'; M= -9,-25,-21,-25,-17,  5,-24,-17,  9,-21, 29, 12,-24,-26,-14,-12,-22, -9,  3, -6,  0,-16; D=-9;
/I:         I=-9; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M=  1, -1,-24,  0, 10,-26, -8, -8,-21,  7,-19,-12, -2,-12,  8,  5,  1, -7,-15,-25,-16,  8;
/M: SY='R'; M= -2, -4,-26, -5,  7,-26, -4, -7,-26, 12,-21,-12, -1,-13,  9, 17, -1, -6,-20,-22,-16,  7;
/M: SY='E'; M= -8,  7,-26, 12, 28,-29,-18, -2,-22,  7,-20,-13,  1, -8, 20,  0,  3, -3,-20,-29,-16, 24;
/M: SY='L'; M=  6,-20,-16,-23,-17, -5,-21,-13,  7,-16, 13,  5,-19,-23,-15,-12,-10, -2, 12,-24, -7,-17;
/M: SY='A'; M= 19, -5,-19, -7, 11,-23,-11,-11,-15, -1,-13,-10, -7,-10,  4, -5,  3, -4, -8,-24,-18,  7;
/M: SY='Q'; M= -1,  7,-23,  7, 10,-28,-15, -7,-23, 11,-21,-12,  2, -9, 13,  3,  4,  3,-18,-26,-14, 12;
/M: SY='L'; M= -3,-24,-19,-26,-18,  4,-24,-15, 11,-19, 28, 14,-24,-26,-15,-12,-20, -8,  7,-17,  2,-17;
/M: SY='K'; M= -7, -1,-25, -1, 12,-26,-17, -6,-25, 21,-22,-11,  1,-11, 14, 21,  2,  1,-18,-24,-13, 12;
/M: SY='E'; M= -4,  6,-24,  9, 15,-24,-15, -1,-24,  5,-17,-14,  2,-11,  5,  6,  2, -3,-18,-29,-14,  9;
/M: SY='R'; M=  7, -4,-23, -6,  1,-24, -6,-10,-23, 10,-19,-11, -2,-13,  4, 14,  0, -4,-15,-22,-16,  1;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-20,-31,-22,  7,-31,-21, 25,-28, 41, 22,-28,-28,-19,-21,-26, -9, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='E'; M=  2, -3,-25,  1, 25,-21,-12, -8,-19,  0, -8,-11, -6, -9,  5, -3, -3, -9,-17,-25,-17, 15;
/M: SY='S'; M= -1,  3,-20,  3,  9,-22, -2,-11,-24, -4,-21,-17,  3,-10, -1, -5, 13, 11,-16,-30,-18,  4;
/M: SY='R'; M=-19,  0,-29, -1,  3,-23,-18,  1,-29, 24,-22,-12,  7,-19, 12, 54, -7, -9,-22,-23,-12,  3;
/M: SY='K'; M= -7,  2,-27,  3,  9,-29,-17,  1,-27, 27,-26,-10,  2,-11, 14, 20, -3, -8,-21,-23,-10, 11;
/M: SY='L'; M= -9,-18,-22,-17, -5, -6,-27,-16,  4, -7, 12,  4,-17,-21, -9, -1,-15, -5,  6,-24, -7, -8;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-24,-36,-29,  1,-36,-29, 41,-28, 22, 18,-24,-24,-22,-26,-19, -8, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='E'; M= -1, 11,-27, 16, 22,-30,  5, -7,-30, -2,-23,-20,  6, -9,  3, -9,  2,-10,-26,-29,-22, 12;
/M: SY='R'; M=-13, -4,-29, -3, 13,-26,-21, -2,-24, 24,-17, -7, -2,-14, 19, 32, -8,-10,-21,-21,-11, 14;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-25, -9, -1,-21,-22,-14,-13, 27,-17, -2, -5,-13,  2, 14, -7, -1, -7,-22, -9,  0;
/M: SY='G'; M= 11, -9,-24,-11,-16,-27, 48,-19,-32,-17,-26,-18, -1,-17,-16,-19,  7,-11,-22,-22,-27,-16;
/M: SY='I'; M= -8,-28,-22,-31,-22,  2,-32,-22, 29,-25, 28, 20,-25,-25,-16,-21,-21, -8, 21,-22, -2,-21;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20, 10,-30,-20, 20,-30, 50, 20,-30,-30,-20,-20,-30,-10, 10,-20,  0,-20;
/M: SY='M'; M=-10,-18,-22,-26,-15, -5,-21,  0, 16, -8, 15, 51,-17,-19,  7, -8,-17,-10,  6,-20, -1, -4;
/M: SY='A'; M=  7, -7,-20,-10, -1,-20,-11,-15,-12,  2,-12, -7, -6,-12, -1, -4,  2,  3, -7,-24,-14, -1;
/M: SY='R'; M=-13, -5,-25, -7,  4,-14,-19, -2,-15, 10, -9, -1, -1,-17,  4, 21, -7, -5,-14,-22, -5,  2;
/M: SY='H'; M=-14, -3,-28, -3,  5,-19,-19, 24,-23,  9,-16, -6,  3,-17, 11, 18, -7,-10,-21,-23,  2,  5;
/M: SY='G'; M= -8,  7,-28,  7, -7,-28, 32, -5,-35, -7,-28,-19, 12,-18, -9, -3,  0,-14,-29,-26,-22, -9;
/M: SY='M'; M= -9,-25, -3,-31,-24,  0,-29,-21, 15,-23, 16, 17,-23,-26,-17,-20,-18, -6, 11,-15, -4,-21;
/M: SY='S'; M= -2, 11,-18, 14,  2,-25, -2,-10,-25, -7,-25,-19,  9,-11, -1,-10, 19, 14,-16,-34,-18,  0;
/M: SY='E'; M=  4,  5,-24, 10, 41,-27,-14, -5,-25,  4,-19,-18, -1, -3, 12, -5,  5, -5,-22,-29,-20, 27;
/M: SY='E'; M=-11, 12,-29, 16, 21,-28, -8,  3,-29,  1,-25,-19,  9,  3,  5, -2,  1, -8,-28,-32,-19, 12;
/M: SY='E'; M= -5,  8,-28, 14, 30,-31, -6, -3,-29,  5,-21,-17,  2, -7, 14,  0,  0,-10,-26,-27,-19, 22;
/M: SY='A'; M= 50,-10,-10,-20,-10,-20,  0,-20,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-10,-20, 10,  0,  0,-20,-20,-10;
/M: SY='F'; M=-19,-25,-26,-30,-24, 47,-29,  1, -2,-21,  6,  0,-20,-29,-24,-15,-21,-12, -6, 20, 45,-23;
/M: SY='R'; M= -5,  4,-25,  4, 12,-26,-16, -3,-24, 12,-20,-12,  4,-11, 14, 16,  1, -2,-20,-25,-14, 12;
/M: SY='Y'; M= -5,-19,-26,-20,-11, -2,-21, -5, -2,-13,  3,  2,-17,-21, -8,-10,-14,-10, -6,  6,  9,-10;
/M: SY='L'; M=-10,-28,-22,-32,-22,  6,-30,-18, 26,-26, 38, 28,-26,-26,-16,-20,-26,-10, 14,-20,  0,-20;
/M: SY='R'; M=-15, -9,-27, -9,  2,-22,-19, -1,-23, 20,-18, -7, -2,-18, 16, 47, -5, -7,-16,-22,-11,  5;
/M: SY='R'; M=-14, -3,-29, -4,  8,-23,-20, -3,-26, 29,-19, -9,  1,-15, 11, 39, -9, -9,-20,-22,-11,  7;
/M: SY='T'; M=  5, -9,-18,-14, -4,-12,-18,-11, -4, -9, -2,  0, -9,-14,  2,-11,  2, 10, -4,-20, -5, -2;
/M: SY='A'; M= 32, -6,-10,-11, -6,-20,  0,-16,-14,-10,-19,-14, -1,-10, -6,-16, 23,  9, -4,-29,-20, -6;
/M: SY='M'; M=-10,-14,-23,-21, -9,-11,-20,  3,  9, -4,  9, 43,-14,-17, 17, -4,-14,-10, -1,-20, -3,  4;
/M: SY='D'; M= -8, 29,-24, 34,  9,-30, -7, -2,-30,  3,-28,-23, 21,-12,  1, -1,  7, -3,-24,-36,-19,  5;
/M: SY='R'; M=-15, -6,-28, -5,  8,-21,-19,  5,-25, 21,-18, -5,  0,-15, 12, 39, -6, -9,-19,-23, -9,  7;
/M: SY='N'; M=-11, 11,-25,  3,  0,-23, -2,  1,-26, 11,-26,-15, 24,-18,  6, 23,  2, -5,-25,-29,-16,  1;
/M: SY='V'; M= -6,-14, -4,-16, -8,-16,-25,-16, -2, -1, -8,  1,-14,-21, -4, -3, -6, -2,  8,-28,-12, -6;
/M: SY='K'; M= -8, -6,-29, -5,  3,-26,-18,-12,-25, 21,-27,-14, -4, 13,  2, 16, -2, -2,-20,-26,-16,  1;
/M: SY='I'; M=-10,-27,-24,-34,-24,  3,-31,-18, 33,-24, 28, 32,-23,-23,-14,-21,-23,-10, 19,-20,  0,-21;
/M: SY='R'; M= -5, -6,-24, -6,  0,-20,-14, -9,-13,  5,-11, -4, -4,-16,  2,  9, -4, -6, -9,-25,-12, -1;
/M: SY='D'; M=-12, 23,-28, 31, 25,-33,-14,  0,-31,  9,-25,-19, 11, -9, 14,  4,  0, -9,-27,-31,-17, 19;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-20,-34,-28,  2,-34,-28, 36,-26, 23, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 33,-24, -4,-28;
/M: SY='A'; M= 46,-11, -1,-21,-11,-20, -2,-21,-11,-11,-11,-11,-11,-12,-11,-21,  9, -1, -1,-22,-21,-11;
/M: SY='E'; M=  3,  1,-23,  0, 16,-26,-13, -3,-22,  8,-19,-12,  3,-10, 14, 11,  3, -5,-20,-25,-16, 14;
/M: SY='Q'; M=  5, -3,-18, -5,  2,-21,-14, -9,-13, -3,-13, -8, -3,-13,  8, -3,  8,  6, -8,-27,-14,  5;
/M: SY='I'; M= -6,-30,-19,-34,-28,  2,-34,-28, 35,-26, 22, 16,-26,-26,-24,-24,-18, -6, 35,-24, -4,-28;
/M: SY='V'; M= -6,-29, -9,-32,-27,  2,-32,-27, 27,-26, 22, 13,-27,-29,-25,-23,-18, -6, 30,-26, -6,-27;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 4 in 4 different sequences
Number of true positive hits 4 in 4 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] ANTAR
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
4 sequences

AMIR_PSEAE  (P10932), NASR_KLEOX  (Q48468), PDTAR_MYCTO (P9WGM2), 
PDTAR_MYCTU (P9WGM3)
» More

PDB
[Detailed view]
4 PDB

1QO0; 1S8N; 1SD5; 4AKK

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission