Entry: PS50925

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BLUF
Accession [info] PS50925
Entry type [info] MATRIX
Date [info] SEP-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); SEP-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50925
Associated ProRule [info] PRU00030

Name and characterization of the entry

Description [info] BLUF domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=92;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=87;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.9650857; R2=0.0161330; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=2713.14433; R2=32.81443; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=468; N_SCORE=9.5; H_SCORE=16003; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=282; N_SCORE=6.5; H_SCORE=11934; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M=-11,-29,-21,-30,-21, 10,-30,-17, 20,-28, 43, 21,-28,-29,-18,-19,-28,-10, 10,-17,  5,-20;
/M: SY='V'; M=-11,-21,-22,-25,-20, 10,-29,-15,  8, -9,  2,  3,-16,-23,-17, -3,-11, -1, 11,-12, 10,-20;
/M: SY='R'; M=-11, -6,-12, -9, -2,-15,-19,  4,-23,  4,-18,-10,  0,-18,  3, 20,  1,  3,-16,-26, -8, -2;
/M: SY='L'; M=-10,-29, -7,-31,-23,  5,-31,-23, 20,-30, 37, 16,-28,-30,-21,-22,-26,-10, 13,-23, -3,-23;
/M: SY='I'; M= -3,-22,-14,-28,-23, -4,-21,-23, 17,-23, 14, 11,-18,-22,-18,-22,-12, -2, 14,-24, -7,-22;
/M: SY='Y'; M=-20,-20,-30,-20,-20, 30,-30, 20,  0,-10,  0,  0,-20,-30,-10,-10,-20,-10,-10, 30, 80,-20;
/M: SY='V'; M= -4,-20,-18,-22,-17, -6,-24,-17,  8, -8,  1,  2,-15,-23,-13,  1, -6,  0, 16,-24, -5,-17;
/M: SY='S'; M= 10,  0,-10,  0,  0,-20,  0,-10,-20,-10,-30,-20, 10,-10,  0,-10, 40, 20,-10,-40,-20,  0;
/M: SY='R'; M= -7, -2,-26, -2,  3,-24,-18,  1,-19, 11,-16, -7,  0,-14, 13, 15, -3, -4,-16,-24, -9,  7;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='A'; M= 10,-12,-19,-14, -6,-18, -4,-17, -7, -7,-11, -6,-10, -9, -7,-12,  0, -5,  0,-23,-16, -7; D=-11;
/I:         I=-11; DM=-23;
/M: SY='P'; M= -3, -8,-16,-12, -7,-20,-15, -9,-13, -5,-16, -9, -4,  1, -4, -4, -3, -2,-11,-27,-15, -8;
/M: SY='P'; M= -8, -7,-28, -4,  0,-16,-20,  2,-13, -7,-10, -7, -7,  3, -2, -4, -9,-10,-15,-25, -9, -3;
/M: SY='D'; M= -5, 12,-26, 14,  6,-25, -9,  0,-22, -2,-20,-15,  9, -4, -2, -7, -2, -8,-20,-31,-16,  1;
/M: SY='L'; M=-12,-12,-12,-15,-10, -3,-24,-11,  0,-11,  8,  7,-10,-23,-10, -3,-15, -9, -1,-25, -7,-11;
/M: SY='S'; M= -1, -2,-22, -5, -1,-19,-16,-13,-10, -4,-15,-10,  0, -1, -2, -8,  6,  6, -9,-29,-15, -3;
/M: SY='A'; M=  3, -9,-24, -9, -2,-14,-16,-13,-15,  3,-14,-10, -9,  0, -6, -2, -4, -6,-10,-20, -9, -5;
/M: SY='E'; M= -3,  4,-23,  4,  8,-22,-11,  0,-20,  1,-16,-12,  3,-14,  2,  1,  0, -4,-16,-28,-14,  4;
/M: SY='D'; M=-14, 27,-28, 41, 20,-29,-10, -1,-31, -1,-24,-23,  9,-11,  1, -9,  1, -8,-24,-31,-13, 10;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 29,-30, 41, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 16,-20,  0,-23;
/M: SY='A'; M=  6, -8,-22,-10, -4,-16,-14,-15, -1,-10, -1,  1,-10,-15, -5,-14, -6, -7,  0,-24,-12, -5;
/M: SY='D'; M=  6, 12,-21, 13,  8,-28,  2, -7,-25, -5,-24,-19,  9,-11,  2,-10, 12, -2,-19,-31,-20,  5;
/M: SY='I'; M=-10,-29,-27,-37,-27,  1,-36,-25, 42,-27, 23, 25,-21,-21,-17,-26,-21,-10, 25,-20,  0,-26;
/M: SY='L'; M= -4,-26,-19,-28,-19,  2,-27,-19, 19,-23, 31, 17,-25,-26,-15,-18,-21, -8, 15,-22, -4,-17;
/M: SY='E'; M= -3, -3,-23, -3,  8,-16,-18,  4,-19,  1,-11, -8, -3,-13,  3,  3, -2, -2,-15,-24, -7,  5;
/M: SY='T'; M=  4, -8,-18,-12, -4,-17,-17,-15, -8,  0,-12, -7, -6,-14, -2,  1,  6,  9,  0,-26,-13, -4;
/M: SY='A'; M= 31, -7,-10,-13, -7,-19, -2,-17,-11,-11,-17,-13, -3,-11, -7,-16, 21,  8, -1,-29,-19, -7;
/M: SY='R'; M=-12, -7,-24,-10, -2,-12,-20, -6,-16,  7,-12, -7,  0,-17,  4, 25, -2,  1,-12,-22, -8, -1;
/M: SY='A'; M=  5,-10,-21,-12,  0,-13,-11,-14,-12, -2, -8, -7, -8,-15, -5,  0, -1, -3, -6,-22,-13, -4;
/M: SY='R'; M=-16, -1,-25, -8, -5,  0,-18,  7,-18,  4,-13, -7,  9,-21, -2, 16, -8, -9,-18,-20, -1, -4;
/M: SY='N'; M=-10, 40,-20, 20,  0,-20,  0, 10,-20,  0,-30,-20, 60,-20,  0,  0, 10,  0,-30,-40,-20,  0;
/M: SY='E'; M= -3, -6,-26, -3,  5,-21,-12,-10,-16, -3, -9, -8, -8, -1,  2, -5, -5, -8,-16,-26,-16,  3;
/M: SY='R'; M= -2, -8,-25, -9, -2,-23, -9, -9,-19,  4,-20,-10, -2, -4,  6, 11,  4, -2,-15,-25,-16,  0;
/M: SY='A'; M=  3, -8,-20,-13, -9,-11,-16,  0, -5,-10,  0, -1, -3,-19, -6, -7, -4, -5, -6,-26, -7, -9;
/M: SY='G'; M= -6, 11,-27,  8, -5,-30, 29, -7,-32, -5,-29,-18, 17,-17, -3, -8,  2,-12,-29,-27,-23, -4;
/M: SY='I'; M= -8,-30,-25,-37,-29,  1,-37,-29, 43,-28, 21, 18,-23,-23,-22,-27,-19, -8, 32,-22, -2,-29;
/M: SY='T'; M=  1,  0,-11, -8, -7,-13,-17,-18,-13, -6,-14,-11,  1,-10, -7, -7, 21, 42, -3,-31,-11, -7;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='I'; M=  0,-23,-19,-29,-22,  4,-24,-18, 19,-20, 12, 16,-19,-22,-16,-19,-11, -5, 17,-18,  1,-20;
/M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-30,-20,  9,-29,-18, 20,-28, 48, 23,-29,-29,-18,-19,-29,-10, 10,-20,  0,-19;
/M: SY='L'; M= -3,-26, -8,-30,-23, 10,-27,-20, 13,-25, 23,  9,-24,-27,-22,-21,-19, -8, 11,-17,  3,-23;
/M: SY='Y'; M=-19,-20,-27,-23,-20, 34,-29, 18, -2,-15,  0,  0,-17,-29,-15,-12,-18,-11, -7, 17, 59,-20;
/M: SY='N'; M= -2,  6,-20, -1, -7,-15,  0,  1,-16, -6,-19,-12, 16,-19, -5, -7,  7, -1,-15,-28, -9, -7;
/M: SY='N'; M= -5, 15,-23, 12,  1,-26,  7, -3,-27,  1,-29,-19, 22,-15,  1, -1, 11, -2,-24,-33,-20,  1;
/M: SY='G'; M= -5,-10,-27, -9,-12,-23, 21,-17,-23,-14,-16,-12, -6, -7,-11,-12, -3, -8,-18,-24,-21,-12;
/M: SY='F'; M= -6,-13, -9,-18,-12,  5,-21,  1, -6,-16, -2,  0, -9,-23,-10,-13, -8, -7, -4,-19,  4,-11;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-21,-40,-30, 70,-31,-21,  6,-30, 11,  3,-20,-29,-37,-21,-20,-10,  4,  6, 26,-30;
/M: SY='F'; M= -3,-27,-17,-32,-24, 28,-25,-21, 10,-24, 18,  9,-23,-27,-26,-20,-16, -7, 13,-11,  6,-23;
/M: SY='Q'; M=-10,  0,-30,  0, 20,-40,-20, 10,-20, 10,-20,  0,  0,-10, 60, 10,  0,-10,-30,-20,-10, 40;
/M: SY='V'; M= -5,-25, -9,-29,-25,  7,-28,-23, 13,-22, 10,  5,-23,-26,-23,-20,-13,  0, 18,-13,  1,-24;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-23,-33,-23,  7,-33,-23, 30,-30, 40, 20,-27,-27,-20,-23,-27,-10, 17,-20,  0,-23;
/M: SY='E'; M=-10, 10,-30, 20, 60,-30,-20,  0,-30, 10,-20,-20,  0,  0, 20,  0,  0,-10,-30,-30,-20, 40;
/M: SY='G'; M=  0,-10,-30,-10,-20,-30, 70,-20,-40,-20,-30,-20,  0,-20,-20,-20,  0,-20,-30,-20,-30,-20;
/M: SY='P'; M= -9,  1,-28,  7, 18,-26,-17, -9,-25,  1,-24,-19, -3, 20,  3, -2,  3,  1,-23,-31,-21,  8;
/M: SY='E'; M= -9,  1,-15,  4, 17,-26,-18, -7,-28, 12,-23,-16, -1, -7,  6, 16, -1, -7,-21,-29,-18, 10;
/M: SY='E'; M=  0, -1,-25,  1, 19,-26, -9, -7,-23,  6,-19,-14, -2, -4,  9,  1,  4, -5,-20,-27,-18, 13;
/M: SY='A'; M= 12, -1,-19, -3, -4,-22,-11,-13,-13,  0,-16,-11, -3, -9, -5, -5,  2, -3, -5,-27,-17, -5;
/M: SY='V'; M= -4,-29, -8,-32,-28,  1,-32,-28, 28,-24, 17, 12,-27,-29,-26,-23,-16, -4, 35,-27, -7,-28;
/M: SY='D'; M= -6,  8,-25, 13, 13,-24, -8, -3,-23, -1,-21,-15,  4,-12,  7, -3,  4, -5,-19,-27,-12, 10;
/M: SY='E'; M= -5,  6,-25, 11, 21,-21,-11, -6,-26,  5,-22,-17,  2, -9,  7,  0,  4, -5,-21,-27,-15, 14;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-17,-28,-21,  4,-29,-21, 19,-24, 31, 16,-24,-26,-19,-19,-18,  0, 16,-23, -3,-20;
/M: SY='F'; M=-20,-25,-24,-31,-25, 54,-30, -1,  1,-20,  6,  3,-20,-30,-25,-15,-20,-10, -4, 17, 51,-25;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -5,  5,-24,  2, 14,-22,-15,  2,-18,  3,-14, -9,  8,-12, 13,  3,  1, -3,-20,-28,-13, 13;
/M: SY='R'; M=-11, -1,-25, -4,  2,-19,-18,  5,-19, 14,-17, -8,  5,-16,  4, 19, -3, -3,-16,-26, -8,  1;
/M: SY='I'; M=-10,-30,-30,-40,-30,  0,-40,-30, 50,-30, 20, 20,-20,-20,-20,-30,-20,-10, 30,-20,  0,-30;
/M: SY='Q'; M= -5,-11, -6,-15, -9,-15, -9,-12,-12,-10,-11, -3, -6,-19,  1, -7,  1, -2, -9,-26,-13, -4;
/M: SY='Q'; M= -3,  1,-25, -1,  6,-27,-15, -1,-21, 12,-18, -8,  4,-14, 20, 16,  0, -6,-20,-24,-13, 12;
/M: SY='D'; M=-20, 50,-30, 70, 20,-40,-10,  0,-40,  0,-30,-30, 20,-10,  0,-10,  0,-10,-30,-40,-20, 10;
/M: SY='P'; M= -8, -1,-29,  3, 11,-28,-15, -3,-24,  4,-27,-17,  0, 20,  6, -1,  3, -4,-24,-31,-19,  6;
/M: SY='R'; M=-20,-10,-30,-10,  0,-20,-20,  0,-30, 30,-20,-10,  0,-20, 10, 70,-10,-10,-20,-20,-10,  0;
/M: SY='H'; M=-20,  0,-30,  0,  0,-20,-20,100,-30,-10,-20,  0, 10,-20, 10,  0,-10,-20,-30,-30, 20,  0;
/M: SY='R'; M= -9, -4,-25, -4,  7,-20,-14,  4,-20,  5,-18, -9,  0,-14, 10, 11,  2, -1,-17,-23, -5,  7;
/M: SY='D'; M= -9, 24,-25, 27,  8,-29,  1,  2,-31, -1,-27,-21, 21,-14, -1, -3,  5, -6,-26,-34,-19,  3;
/M: SY='V'; M= -4,-26, 17,-30,-26, -5,-29,-27, 12,-25,  9,  4,-25,-26,-25,-24,-14, -6, 20,-31,-13,-26;
/M: SY='E'; M= -7,-12,-23,-11,  6,-16,-26,-14,  3, -2, -3,  0,-13,-16,  2, -7, -8, -7,  5,-26,-11,  3;
/M: SY='V'; M=  1,-17,-20,-20,-10,-10,-25,-21, 11, -8,  3,  3,-16,-18,-12,-12, -9, -3, 15,-24, -9,-12;
/M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-33,-24, 15,-32,-23, 25,-29, 37, 17,-27,-28,-23,-22,-26, -9, 16,-17,  3,-24;
/M: SY='F'; M=  1,-11,-20,-13, -7,  7,-17, -4, -8,-14, -2, -2,-10,-19,-11,-14, -4, -5, -7,-13,  7, -9;
/M: SY='C'; M= -6, -1,  1, -3, -3,-10,-19, -9,-17, -9,-10, -8, -3,-20, -6, -9, -5, -5,-13,-26, -9, -5;
/M: SY='E'; M=  0,  2,-25,  5, 10,-24,  1, -8,-26,  3,-21,-14,  0,-11,  1, -2,  2, -7,-20,-24,-14,  5;
/M: SY='P'; M= -5, -2,-30,  3,  8,-22,-17, -8,-20, -5,-22,-17, -6, 28, -3,-13, -4, -5,-23,-24,-12,  0;
/M: SY='I'; M= -1,-21,-12,-27,-22, -6,-29,-25, 23,-24, 11,  8,-18,-22,-19,-24,-12, -6, 18,-25, -8,-23;
/M: SY='D'; M= -1,  6,-23,  7,  7,-21,-15, -9,-20, -3,-19,-16,  1,  5, -3, -8,  4,  7,-17,-27,-14,  1;
/M: SY='E'; M= -1, -4,-23, -3,  9,-20,-10,  3,-21,  2,-18,-11, -2,-13,  5,  3,  3, -3,-16,-24, -8,  5;
/M: SY='R'; M=-19,-11,-29,-11, -1,-18,-21, -1,-27, 26,-15, -8, -2,-21,  8, 64,-11,-10,-18,-20, -9, -1;
/M: SY='R'; M= -2, -9,-21,-11, -4,-13,-17,-10, -8, -1,  0,  0, -7,-18, -4,  7, -7, -5, -5,-25,-11, -5;
/M: SY='F'; M=-20,-29,-21,-37,-29, 73,-30,-15,  0,-27,  9,  0,-20,-30,-36,-19,-20,-10, -1, 13, 37,-29;
/M: SY='G'; M=  3, -3,-25, -1, -2,-27,  9, -8,-25,-10,-25,-16, -1,  4, -3,-13,  7, -4,-21,-28,-21, -3;
/I:         I=-15; MI=0; MD=-32; IM=0; DM=-32;
/M: SY='N'; M= -8,  7,-28,  7,  4,-28,  8, -9,-25,  0,-24,-16,  9, -8, -2, -6, -2,-11,-23,-28,-20,  1;
/M: SY='W'; M=-17,-37,-44,-37,-28,  8,-21,-29,-14,-20,-13,-15,-37,-29,-20,-19,-34,-23,-21,119, 24,-20;
/M: SY='S'; M=  1,  2,-20,  3,  4,-25,  1,  4,-26, -3,-27,-16,  7,-12,  4, -5, 17,  2,-19,-32,-15,  3;
/M: SY='M'; M=-10,-20,-20,-30,-20,  0,-20,  0, 20,-10, 20, 60,-20,-20,  0,-10,-20,-10, 10,-20,  0,-10;
/M: SY='G'; M=  6, -5,-24, -8, -1,-26,  8,-12,-26,  6,-22,-12, -2,-13,  1,  4,  0, -7,-18,-21,-18,  0;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_10 which contains 546'790 sequence entries.


Total number of hits 23 in 12 different sequences
Number of true positive hits 23 in 12 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Prokaryotes (Bacteria)
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] BLUF
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
12 sequences

BLUF_ECOLI  (P75990), PAL1F_EUGGR (P84738), PALFB_EUGGR (P84737), 
PALST_EUGGR (P84739), PBL1F_EUGGR (P84742), PBL9F_EUGGR (P84740), 
PBLFB_EUGGR (P84741), PBLST_EUGGR (P84743), PCYAA_EUGGR (Q8S9F2), 
PCYAA_EUGLO (Q76L34), PCYAB_EUGGR (Q8S9F1), PCYAB_EUGLO (Q76L33)
» More


View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission