Entry: PS50927

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] BULB_LECTIN
Accession [info] PS50927
Entry type [info] MATRIX
Date [info] SEP-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50927
Associated ProRule [info] PRU00038

Name and characterization of the entry

Description [info] Bulb-type lectin domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=115;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=110;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.0290728; R2=0.0127875; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=6732.64822; R2=26.44157; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=389; N_SCORE=8.0; H_SCORE=14956; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=272; N_SCORE=6.5; H_SCORE=13898; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-50; I=-50; B1=-500; E1=-500; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='T'; M= -2, -4,-18, -7, -4,-11,-17,-11,-11, -7,-10, -8, -3,-11, -5, -6,  4,  8, -7,-25, -8, -5;
/M: SY='B'; M= -6, 15,-22, 14,  1,-19, -8, -3,-18, -6,-16,-14, 14,-14, -4, -7,  3, -2,-17,-31,-13, -2;
/M: SY='T'; M= -1, -9,-17,-13,-10,-11,-18,-13, -1,-13, -6, -3, -6,-11, -9,-12,  5, 10,  2,-28, -9,-11;
/M: SY='L'; M=  1,-20,-18,-23,-16, -1,-22,-19, 10,-20, 15,  6,-17,-20,-15,-17, -9, -3,  8,-23, -7,-16;
/M: SY='T'; M= -4, -9,-18,-14,-10, -2,-16,-12, -7,-12, -5, -5, -5,-15,-10, -9,  3, 10, -4,-21, -4,-10;
/M: SY='S'; M= -1, -4,-22, -4,  4,-20,-10, -7,-17, -5,-20,-13,  0,  1,  3, -7,  7,  1,-17,-25,-13,  2;
/M: SY='G'; M= -1, -3,-24, -5, -6,-22, 15,-12,-23, -9,-23,-15,  3,-11, -6, -9,  7, -3,-18,-25,-19, -6;
/M: SY='Q'; M= -7,  1,-23,  1,  8,-21,-13,  1,-17, -2,-13, -8,  3,-13, 11, -2,  0, -5,-18,-25,-11,  9;
/M: SY='T'; M= -2, -6,-18,-10, -7,-14,-15,-14, -9, -8,-13, -9, -4, -4, -7, -9,  8, 17, -4,-28,-12, -8;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-22,-30,-21,  7,-29,-21, 22,-27, 34, 16,-26,-26,-20,-21,-24, -9, 13,-17,  0,-21;
/M: SY='S'; M= -2, -5,-18, -7, -6,-13, -8, -4,-16, -5,-19,-11,  2,-14, -4, -1, 11,  6,-10,-25, -7, -6;
/M: SY='S'; M=  4, -2,-21, -3, -5,-20,  0,-13,-18, -9,-19,-14,  0, -7, -6,-10,  8,  2,-13,-25,-17, -6;
/M: SY='G'; M= -3,  6,-24,  3, -5,-23, 21, -8,-27, -8,-25,-18, 13,-16, -8,-10,  6, -4,-22,-28,-20, -6;
/M: SY='E'; M= -8,  4,-28,  6, 13,-27,-10, -2,-24,  5,-22,-13,  3, -9, 13,  5,  0, -8,-23,-21,-14, 12;
/M: SY='T'; M= -2, -4,-16, -8, -5,-10,-12,-11,-12, -7,-14, -9,  0,-14, -5, -5, 12, 16, -6,-28,-10, -6;
/M: SY='L'; M= -8,-26,-21,-28,-19,  8,-28,-17, 15,-23, 31, 13,-23,-27,-18,-16,-22, -8,  9,-18,  2,-19;
/M: SY='T'; M= -2,-11,-18,-13, -9, -9,-19,-16, -1, -9, -6, -4, -9,-14,-11,-10,  1,  6,  6,-26, -9,-11;
/M: SY='S'; M=  2, -7,-15, -8, -6,-10,-13,-13, -6,-12,-11, -9, -1,-15, -7,-12, 12,  7, -1,-29,-11, -7;
/M: SY='G'; M=  1, -6,-25, -4, -1,-25,  7,-13,-23, -7,-23,-16, -2,  6, -5,-10,  5, -5,-20,-28,-22, -4;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='G'; M= -4,  3,-18,  1, -5,-12,  8, -6,-18, -8,-17,-12,  7,-11, -8, -8,  3, -4,-15,-21,-12, -6; D=-9;
/I:         I=-9; MD=-18;
/M: SY='G'; M= -3,  1,-14,  0, -3,-10,  6, -3,-14, -5,-13, -9,  4, -6, -3, -5,  2, -4,-12,-14, -8, -3; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-18; IM=0; DM=-18;
/M: SY='N'; M= -1,  0,-20, -4, -1,-12, -7,-11,-15, -7,-16,-12,  3,-12, -5, -8,  3, -1,-12,-26,-13, -3;
/M: SY='F'; M=-11,-18,-22,-22,-16, 24,-22, -6, -4,-14,  4,  0,-13,-25,-17, -9,-14, -8, -6, -2, 20,-17;
/M: SY='T'; M= -4, -3,-20, -6, -2,-17, -5,-11,-18, -2,-17,-12, -1,-12, -5, -2,  3,  4,-12,-26,-14, -4;
/M: SY='F'; M=-11,-26,-19,-30,-22, 31,-27,-19,  7,-25, 22,  7,-22,-24,-25,-18,-19, -6,  4,-10,  9,-22;
/M: SY='F'; M= -7,-16,-22,-20,-16,  4,-12,-18,  0,-17, -2, -2,-11,-18,-18,-15, -7, -3,  1,-18, -4,-17;
/M: SY='F'; M= -8,-13,-19,-19,-14,  8,-17,-11, -1,-13,  0,  7, -8,-19,-11,-10, -6, -3, -1,-19, -1,-12;
/M: SY='Q'; M= -6,-10,-24,-11, -2,-10,-12,-10,-15, -8,-13, -8, -6, -1,  3, -7,  1, -1,-15,-21, -9,  0;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-21,  2,  2,-23,  0, -8,-23, -4,-24,-17,  7, -7, -2, -6,  9,  3,-19,-28,-17, -1;
/M: SY='D'; M=-12, 24,-26, 32,  9,-31,-11, -4,-29, -1,-27,-22, 14,  4, -1, -7,  3, -3,-25,-35,-20,  3;
/M: SY='C'; M= -2,-10, 10,-13,-14,-20,  3,-17,-23,-14,-21,-15, -4,-19,-14,-14,  2, -5,-13,-28,-21,-14;
/M: SY='N'; M= -6, 10,-20,  2, -4,-10, -7, -3,-17, -6,-20,-14, 19,-18, -4, -5,  7,  4,-18,-23, -8, -4;
/M: SY='L'; M=-10,-18,-21,-19,-10,  8,-24,-10,  1,-15, 14,  4,-16,-22,-11, -8,-13, -4, -2,-17,  4,-11;
/M: SY='V'; M= -2,-18,-19,-19,-15, -6,-16,-18,  2,-14, -2, -2,-15,-20,-14,-11, -3,  1,  9,-16, -7,-15;
/I:         I=-9; MD=-19;
/M: SY='Y'; M= -4, -6, -7, -8, -8, -3,  0, -2, -8, -7, -6, -5, -2,-12, -7, -5, -3, -5, -7, -7,  1, -8; D=-9;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='L'; M=-11,-28,-23,-33,-24, 15,-32,-22, 23,-26, 26, 14,-23,-26,-21,-19,-23,-10, 14,-13,  4,-24;
/M: SY='W'; M=-13,-25,-32,-27,-21, 18,-23, -7, -8,-14, -7, -7,-23,-27,-14,-13,-21,-13,-14, 54, 38,-18;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='Y'; M=-12,  1,-27,  2,  2, -9,-18,  0,-17,  3,-15,-11,  0,-11, -1,  1, -6, -5,-17,-16,  5, -1;
/M: SY='N'; M= -1, -5,-21,-10,-11,-14, -2,-10,-11, -7,-12, -7,  1,-17, -9, -8,  1,  1, -8,-23,-11,-10;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M: SY='G'; M=  0,  8,-20,  5, -4,-23, 14, -8,-24, -7,-26,-18, 14,-14, -5, -9, 14,  1,-19,-31,-20, -5; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M:         M= -6, -6,-20, -7, -5,-12,-13,-12, -2, -7, -7, -4, -4, -9, -5, -8, -3, -2, -3,-16, -7, -6; D=-4;
/I:         I=-4; MD=-9;
/M:         M= -6, -5,-16, -5, -2, -9,-10, -8,-10, -1,-11, -7, -3, -3, -3,  0, -2, -3, -9, -9, -6, -4; D=-4;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-9; IM=0; DM=-9;
/M: SY='T'; M=  0, -3,-13, -8, -5,-12,-16,-13, -9, -4,-10, -8, -1,-11, -5, -1,  9, 22, -2,-24, -9, -6; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='V'; M= -5,-21,-20,-22,-18,  0,-25,-13,  9,-13,  0,  1,-20,-10,-15,-14,-11, -4, 11,-10,  8,-19; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='V'; M= -1,-26,-13,-28,-26,  0,-28,-26, 26,-19, 10,  9,-25,-26,-24,-18,-11, -1, 37,-25, -6,-26; D=-4;
/I:         I=-4; DM=-9;
/M: SY='W'; M=-20,-40,-49,-40,-30, 12,-20,-30,-20,-20,-19,-20,-40,-30,-20,-20,-40,-30,-29,147, 30,-20;
/M: SY='V'; M=  6,-15,-15,-17,-13,-12,-20,-18,  6,-11, -4,  0,-14,-20,-10,-13,  1,  2, 17,-28,-12,-12;
/M: SY='A'; M= 32, -7,-11,-14, -8,-19, -3,-17,-12,-10,-15,-12, -4, -8, -8,-17, 16,  9, -3,-26,-19, -8;
/M: SY='N'; M= -8, 30,-22, 16, -2,-22,  6,  4,-22, -3,-29,-19, 46,-19, -2, -3,  8, -3,-28,-35,-20, -2;
/M: SY='R'; M=-10, -6,-24, -8, -1,-18,-17, -6,-23, 12,-18,-11,  0,-10,  2, 31,  1,  7,-15,-25,-12, -2;
/M: SY='D'; M= -6, 19,-24, 23,  9,-26, -3, -2,-27, -3,-23,-19, 11,-13,  0, -8,  2, -6,-22,-30,-15,  4;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='N'; M= -1, 10,-21,  3, -2,-21,  4, -4,-22, -3,-24,-16, 19,-15, -2, -3,  9,  0,-19,-31,-18, -3;
/M: SY='P'; M= -9,-14,-34,-10, -1,-24,-19,-15,-17, -3,-22,-14,-12, 48, -6, -8, -8, -7,-23,-26,-22, -7;
/I:         I=-10; MD=-21;
/M: SY='I'; M= -3,-16,-10,-17,-14,  3,-17,-14, 15,-14, 13,  8,-15,-15,-13,-12,-10, -3, 15,-12, -2,-14; D=-10;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='G'; M=  0,  0,-23,  0, -9,-22, 21,-10,-25,-14,-20,-15,  5,-16,-10,-14,  5, -6,-19,-27,-20,-10;
/I:         I=-9; MI=0; MD=-19; IM=0; DM=-19;
/M: SY='S'; M= -1,  3,-17,  0,  0,-17, -8, -3,-17, -2,-20,-13,  8, -9,  0, -1, 11,  5,-13,-28,-13, -1; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='S'; M=  1,  2,-19, -1, -4,-18,  5, -8,-20, -8,-22,-15,  8,-12, -6, -9, 11,  2,-15,-28,-16, -5; D=-9;
/I:         I=-9; DM=-19;
/M: SY='C'; M=  7,-11, 17,-17,-15,-18, -7,-20,-15,-18,-16,-13, -7,-17,-15,-20,  6,  1, -6,-33,-21,-16;
/M:         M= -6, -9,-22,-13,-11, -9, -9, -7, -9, -7,-10, -4, -4,-19, -8, -3, -2,  0, -5,-21, -4,-11;
/M: SY='L'; M= -1,-22,-17,-26,-20,  2,-17,-22,  9,-23, 20,  8,-20,-23,-20,-20,-14, -2,  8,-21, -6,-20;
/M: SY='T'; M= -2, -8,-17,-11, -6,-12,-17,-15, -8, -4, -7, -5, -5,-15, -6, -2,  4, 11, -2,-27,-11, -7;
/M: SY='L'; M=-10,-24,-23,-28,-19,  8,-28,-18, 16,-17, 23, 17,-21,-24,-16,-14,-21, -9, 10,-17,  1,-18;
/M: SY='Q'; M= -4, -3,-23, -5, -1,-21,-10, -8,-12, -3,-15, -7,  1,-14,  6, -5,  5,  2,-11,-27,-12,  2;
/M: SY='S'; M= -1,  1,-22,  0,  1,-20,-10, -4,-15, -4,-19,-12,  4, -8, -1, -5,  7,  1,-12,-30,-14, -1;
/M: SY='D'; M=-10, 26,-23, 29,  8,-25, -9,  1,-27, -1,-25,-20, 21,-13, -1, -5,  7,  0,-23,-35,-15,  3;
/M: SY='G'; M=  2, -9,-27,-10,-19,-28, 59,-18,-35,-18,-27,-16,  0,-19,-18,-19,  1,-17,-26,-21,-28,-18;
/M: SY='N'; M= -9, 27,-21, 16,  4,-21, -5,  5,-21,  0,-25,-18, 37,-16,  1, -1,  8,  0,-24,-36,-17,  2;
/M: SY='L'; M=-11,-23,-20,-26,-19,  9,-27,-16, 16,-25, 36, 18,-20,-28,-18,-17,-24, -9,  7,-20,  0,-18;
/M: SY='V'; M= -2,-24,-13,-25,-20, -4,-27,-22, 16,-17,  8,  6,-23,-25,-19,-14,-11, -3, 26,-25, -8,-20;
/M: SY='L'; M= -7,-29,-20,-32,-25,  5,-32,-24, 28,-26, 29, 17,-26,-27,-22,-22,-21, -7, 24,-22, -2,-24;
/M: SY='Y'; M= -7,-19,-22,-22,-16,  8,-24, -7,  5,-15, 11,  5,-16,-24,-13,-12,-14, -5,  2,-10, 14,-16;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='D'; M=-11, 28,-24, 35,  9,-29, -2,  0,-30, -2,-25,-22, 18,-12, -1, -7,  4, -5,-24,-33,-17,  4; D=-5;
/I:         I=-5; DM=-11;
/M: SY='H'; M= -3, -1,-24,  0, -2,-22, -1,  3,-21, -6,-19,-11,  2,-10,  1, -6,  2, -6,-18,-26,-11, -2;
/M: SY='N'; M= -4, 10,-21,  9,  3,-22, -4, -6,-23,  1,-24,-16, 12,-13,  1,  0, 10,  1,-19,-31,-16,  2;
/M: SY='G'; M= -6, 11,-25,  6, -6,-24, 22, -3,-29, -8,-26,-18, 19,-17, -8, -7,  3, -8,-26,-29,-20, -7;
/M: SY='R'; M= -5,  1,-23, -2,  0,-21,-11, -4,-21, 10,-21,-11,  6,-13,  2, 11,  4,  3,-15,-27,-12,  0;
/M: SY='T'; M=  4,-14,-16,-16,-12, -9,-17,-19, -1,-14, -7, -6,-11, -4,-14,-15,  6, 10,  6,-28,-13,-13;
/I:         I=-11; MI=0; MD=-23; IM=0; DM=-23;
/M: SY='V'; M= -3,-27,-17,-30,-26,  1,-28,-25, 26,-21, 16, 11,-24,-27,-24,-20,-14, -4, 31,-25, -6,-26;
/M: SY='W'; M=-20,-39,-48,-40,-30, 12,-21,-29,-18,-20,-18,-19,-39,-30,-21,-20,-39,-28,-28,141, 30,-20;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='S'; M=  7, -1,-14, -3,  1,-22, -6, -7,-19, -4,-24,-15,  5,-11,  4, -3, 22, 10,-12,-32,-17,  2;
/M: SY='T'; M=  6, -1,-11, -6, -6,-15, -9,-15,-14,-11,-19,-14,  4,-10, -6,-11, 27, 31, -5,-34,-15, -6;
/M: SY='N'; M= -8, 16,-21,  6, -4,-16,  1,  2,-20, -3,-23,-14, 28,-16, -4, -3,  3, -4,-23,-30,-14, -4;
/M: SY='T'; M=  0, -8,-16,-12,-10,-10,-17,-16, -3,-13, -3, -5, -7,-14,-11,-12,  3, 12,  2,-27, -9,-11;
/M: SY='S'; M=  2,  2,-17, -3, -5,-18, -6,-11,-14, -7,-18,-12,  7,-11, -4, -8, 14, 14, -9,-30,-15, -5;
/I:         I=-12; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='G'; M= -2, -1,-24, -4, -8,-21, 21,-12,-27, -7,-24,-16,  7,-15, -9, -4,  5, -4,-20,-26,-20, -9;
/M: SY='N'; M= -2,  3,-22,  1,  2,-21, -8, -5,-18,  0,-19,-12,  6,-12,  2, -2,  5,  0,-14,-28,-14,  1;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='R'; M= -3, -1,-18, -4,  0,-17,-10, -7,-14,  4,-15, -9,  3, -9,  1,  9,  4,  2,-10,-23,-12, -1; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='G'; M=  0,  1,-21, -2, -7,-21, 19,-10,-24, -9,-23,-16, 10,-15, -7, -9,  9, -3,-19,-28,-20, -7; D=-10;
/I:         I=-10; DM=-21;
/M: SY='N'; M= -5,  1,-24,  0, -4,-20, -7, -6,-16, -6,-19,-12,  5,  0, -6, -7,  1, -2,-14,-30,-16, -6;
/M: SY='Y'; M= -4,-16,-16,-19,-16,  1,-23, -9,  2,-12, -3, -2,-15,-18,-13,-12, -4,  3,  6,-13, 11,-16;
/M: SY='V'; M= -1,-19,-17,-22,-19, -4,-18,-17,  7,-13,  0,  2,-17,-23,-17,-11, -5,  0, 16,-22, -5,-19;
/I:         I=-15; MD=-32;
/M: SY='A'; M= 19,-16,-11,-22,-15, -7,-10,-18, -1,-15,  5,  1,-15,-18,-13,-18, -4, -3,  3,-20,-11,-14; D=-15;
/I:         I=-15; MI=-32; IM=-32; DM=-32;
/M: SY='E'; M= -4, -9,-22, -8,  6,-16,-21,-14, -3, -3, -7, -4,-10,-15, -1, -5, -3, -2,  1,-27,-13,  2;
/M: SY='L'; M= -9,-29,-21,-31,-21,  9,-31,-21, 23,-29, 41, 19,-27,-28,-20,-21,-26, -9, 13,-20,  0,-21;
/M: SY='L'; M= -9,-14,-23,-14, -6,-10,-21, -8, -2,-11, 12,  6,-13,-19,  3, -5,-12, -5, -6,-23, -6, -2;
/M: SY='D'; M= -5, 18,-26, 25, 11,-29,-11, -6,-27,  1,-23,-20,  7, -1,  0, -6,  1, -7,-22,-31,-18,  5;
/I:         I=-10; MI=0; MD=-22; IM=0; DM=-22;
/M: SY='B'; M= -8, 23,-21, 21,  4,-23, -5, -3,-24, -3,-25,-20, 23,-14, -2, -6, 11,  6,-21,-34,-17,  1;
/M: SY='G'; M= -2,-10,-30,-10,-17,-28, 53,-17,-36,-13,-27,-17, -1,-20,-15, -9, -2,-18,-27,-19,-26,-16;
/M: SY='N'; M= -9, 30,-21, 15,  0,-20, -3,  7,-19,  0,-26,-17, 46,-18,  0,  0,  7, -1,-26,-37,-18,  0;
/M: SY='L'; M= -9,-28,-19,-31,-23, 23,-28,-21, 14,-26, 27, 12,-25,-28,-25,-19,-21, -7, 13,-14,  5,-23;
/M: SY='V'; M= -1,-25,-13,-26,-25, -2,-28,-25, 22,-16,  7,  8,-25,-27,-24,-15, -9,  0, 37,-27, -8,-25;
/M: SY='I'; M= -8,-26,-21,-30,-23,  3,-30,-21, 27,-24, 27, 20,-24,-25,-18,-20,-20, -7, 20,-22, -2,-22;
/M: SY='R'; M=-13,-12,-26,-13, -8, -2,-22,  1,-11,  4, -9, -4, -8,-20, -2, 16,-10, -7,-10, -9, 14, -8;
/M: SY='D'; M= -9, 20,-26, 28,  6,-30,  8, -4,-33, -5,-27,-22, 12,-13, -4, -9,  5, -7,-25,-32,-18,  1;
/M: SY='S'; M=  0, -2,-23, -1,  0,-21, -5, -9,-21, -6,-23,-16,  1,  6, -3, -9,  9,  2,-17,-28,-17, -2;
/M: SY='N'; M=  1,  5,-19,  2, -3,-21, -3, -9,-18, -4,-21,-14,  8,-11, -5, -7,  7,  0,-13,-30,-17, -5;
/M: SY='N'; M= -5,  4,-21, -3, -8,-14, -4, -9,-10, -9,-15,-10, 12,-16, -8, -9,  4,  1,-10,-29,-14, -9;
/M: SY='W'; M= -8, -4,-28, -7, -6,-11, -7,-11,-20, -5,-19,-14,  1,-17, -6, -5, -6, -7,-21, 10, -5, -5;
/M: SY='S'; M= -1,  4,-21,  4, -2,-18, -8,-10,-17, -5,-17,-13,  4,-12, -4, -6,  6,  1,-12,-26,-14, -3;
/M: SY='T'; M=  1, -9,-18,-12,-10,-12,-18,-16, -4, -9, -6, -4, -8,-12, -9, -9,  1,  8,  1,-22,-10,-10;
/M: SY='W'; M= -6,-11,-27,-12,-12, -8, -6,-15,-13,-14,-13,-11, -8,-17,-11,-14, -7, -9,-13,  8, -3,-11;
/M:         M= -4,-10,-26,-11, -6,-15, -8,-12,-15, -8,-15,-10, -7,-12,  0, -7, -2, -2,-15, -4, -8, -3;
/M: SY='Y'; M= -8,-10,-24,-13, -7,  2,-14, -8,-14,-11,-14,-10, -5,-15, -7,-10, -1, -3,-13,  0,  3, -6;
/M:         M= -8,-14,-24,-16, -8,  0,-15,-12, -9,-11, -3, -3,-10,-14, -7, -7, -8, -6,-10,-13, -4, -7;
/M: SY='W'; M=-10, -9,-27, -9, -8, -2,-12,-13,-19,-10,-16,-14, -8,-14,-10, -9, -6, -7,-17, 12,  0, -8;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_09 which contains 546'439 sequence entries.


Total number of hits 65 in 61 different sequences
Number of true positive hits 65 in 61 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes, Eukaryotic viruses
Maximum number of repetitions [info] 2
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] Bulb-type lectin
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
61 sequences

ASAL_ALLSA  (P83886), B120_ARATH  (O81906), CE101_ARATH (Q9LW83), 
COMI_DICDI  (Q03380), CURC1_CURLA (P19667), CURC2_CURLA (Q6F495), 
EP1G_DAUCA  (Q39688), KPRO_MAIZE  (P17801), LEC1_CROVR  (Q9FVA1), 
LEC2_CROVR  (Q9FV99), LEC3_CROVR  (P86626), LEC_ALOAR   (P49329), 
LEC_DENFN   (B2KNH9), LEC_GALNI   (P30617), PSRK_ARATH  (P0DH87), 
RKS1_ARATH  (Q9ZT07), RLK1_ARATH  (Q39202), SD113_ARATH (Q9LPZ9), 
SD11_ARATH  (O81833), SD129_ARATH (O64782), SD16_ARATH  (Q9S972), 
SD17_ARATH  (Q39086), SD18_ARATH  (O81905), SD22_ARATH  (Q39203), 
SD25_ARATH  (Q8RWZ5), SD31_ARATH  (P93756), SLSG0_BRAOA (P22551), 
SLSG1_BRAOA (P22552), SLSG2_BRAOA (P22553), SLSG3_BRAOL (P17840), 
SLSG4_BRAOL (P17841), SLSG6_BRAOL (P07761), SRK6_BRAOV  (Q09092), 
SRK_ARATH   (P0DH86), Y1112_ARATH (Q9SXB3), Y1130_ARATH (Q9SXB4), 
Y1133_ARATH (Q9SXB8), Y1135_ARATH (Q9SXB5), Y1136_ARATH (O64784), 
Y1137_ARATH (O64783), Y1141_ARATH (Q9LPZ3), Y1142_ARATH (O64778), 
Y1144_ARATH (O64776), Y1146_ARATH (O64774), Y1148_ARATH (O64771), 
Y1150_ARATH (Q9SYA0), Y1155_ARATH (Q9SY95), Y1343_ARATH (Q9XID3), 
Y1614_ARATH (O64780), Y1639_ARATH (O64781), Y1643_ARATH (O64777), 
Y1649_ARATH (O64770), Y1661_ARATH (Q9SY89), Y1675_ARATH (O64793), 
Y2913_ARATH (O64477), Y4119_ARATH (Q9T058), Y4230_ARATH (Q9ZR08), 
Y4729_ARATH (O81832), Y5248_ARATH (Q9FLV4), Y5537_ARATH (O65238), 
YL633_MIMIV (Q5UR81)
» More

PDB
[Detailed view]
6 PDB

1JPC; 1MSA; 1NIV; 2D04; 2DPF; 3MEZ

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission