Entry: PS50947

Forthcoming changes to the profile format
General information about the entry

Entry name [info] DDENN
Accession [info] PS50947
Entry type [info] MATRIX
Date [info] DEC-2003 (CREATED); OCT-2013 (DATA UPDATE); JUL-2014 (INFO UPDATE).
PROSITE Doc. [info] PDOC50211
Associated ProRule [info] PRU00306

Name and characterization of the entry

Description [info] dDENN domain profile.
Matrix / Profile [info]
/GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=70;
/DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=65;
/NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.5107152; R2=0.0135752; TEXT='NScore';
/NORMALIZATION: MODE=-1; FUNCTION=LINEAR; R1=1938.27941; R2=17.60662; TEXT='HScore';
/CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=515; N_SCORE=8.5; H_SCORE=9703; MODE=1; TEXT='!';
/CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=368; N_SCORE=6.5; H_SCORE=8418; MODE=1; TEXT='?';
/DEFAULT: M0=-8; D=-20; I=-20; B1=-200; E1=-200; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
...
                A   B   C   D   E   F   G   H   I   K   L   M   N   P   Q   R   S   T   V   W   Y   Z
/I:         B1=0; BI=-105; BD=-105;
/M: SY='L'; M= -7,-22,-20,-25,-19,  0,-27,-12, 16,-21, 18, 12,-19,-22,-16,-16,-16, -5, 14,-24, -3,-19;
/M: SY='D'; M=-11, 27,-26, 30, 11,-31,  1,  0,-30, -2,-28,-22, 23,-10,  4, -6,  6, -6,-28,-35,-21,  7;
/M: SY='D'; M= -6,  0,-17,  1,  1,-18,-17,-12,-11,  0,-12, -8, -3,-17, -4, -5, -4, -6, -4,-28,-14, -2;
/M: SY='E'; M= -1, -3,-24, -2, 12,-24,-10, -2,-19,  1,-13, -9, -4,-12, 11,  1, -1, -7,-17,-24,-14, 11;
/M: SY='V'; M= -1,-26,-12,-30,-25,  1,-29,-26, 23,-23, 15,  9,-23,-25,-23,-22,-12, -1, 26,-24, -6,-25;
/M: SY='R'; M=  0, -7,-23, -9, -1,-22,-10, -4,-23, 10,-19,-10,  0,-16,  8, 27,  4, -3,-15,-24,-13,  1;
/M: SY='E'; M=  2, -6,-22, -5,  8,-21,-10,-13,-15,  2,-13, -9, -7,-13, -1, -1, -2, -4, -7,-25,-16,  3;
/M: SY='A'; M= 14,-17,-11,-22,-16,-13,-15,-19,  3,-13, -4, -2,-14,-14,-15,-18, -3, -2,  9,-25,-13,-17;
/M: SY='F'; M=-18,-28,-19,-38,-28, 66,-29,-18,  3,-27, 10,  7,-20,-28,-34,-19,-18, -8,  2,  4, 24,-27;
/M: SY='L'; M= -3,-28,-17,-30,-23,  4,-28,-22, 22,-24, 31, 18,-27,-27,-21,-20,-21, -7, 21,-23, -4,-22;
/M: SY='R'; M=-15,  1,-28, -2,  3,-21,-16,  1,-26, 21,-21,-10,  8,-18, 12, 37, -6, -9,-22,-22, -9,  5;
/M: SY='F'; M= -7,-24,-12,-30,-22, 29,-25,-18,  0,-19,  8,  1,-19,-27,-25, -9,-15, -8,  4, -9,  8,-22;
/M: SY='F'; M=-16,-26,-21,-34,-23, 46,-27,-14,  6,-23, 14, 15,-20,-26,-22,-16,-20,-10,  1, -2, 17,-20;
/I:         I=-5; MI=0; MD=-25; IM=0; DM=-25;
/M: SY='A'; M= 22,-13,-13,-17,-11,-15,-14,-21,  2,-11, -5, -4,-14,-16,-12,-17,  2,  2, 13,-25,-15,-12;
/M: SY='Q'; M= -3,  2,-17,  1, 11,-24,-13, -1,-19,  1,-18, -9,  6,-12, 15, -2,  8, -1,-19,-30,-15, 13;
/M: SY='L'; M= -9,-26,-21,-31,-22,  6,-30,-21, 24,-25, 29, 21,-23,-24,-18,-20,-20, -3, 16,-21, -1,-21;
/M: SY='F'; M=-13,-29, -7,-34,-26, 33,-30,-22, 10,-28, 21,  9,-24,-30,-29,-21,-21, -9, 10,-12,  8,-26;
/M: SY='G'; M=  2, -7,-25, -8, -7,-23, 17, -5,-26, -4,-23,-13, -1,-16,  0, -4,  4, -8,-21,-19,-12, -4;
/M: SY='G'; M= -5,  9,-23,  9, -6,-26, 20,  3,-32,-11,-26,-18, 11,-17, -8,-12,  4, -8,-25,-29,-17, -7;
/M: SY='Y'; M=-18,-23,-27,-24,-21, 32,-30,  9,  3,-15,  7,  3,-21,-30,-15,-13,-21,-10, -5, 20, 62,-21;
/M: SY='R'; M= -9, -2,-26, -2,  9,-24,-16,  2,-26, 14,-21,-11,  1,-12, 13, 28,  1, -4,-20,-25,-12,  9;
/M: SY='N'; M= -2,  7,-20,  6,  2,-18,-10, -2,-16, -6,-17,-12,  8,-12, -2, -8,  8,  0,-14,-28,-11,  0;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='Y'; M=-10,-14,-10,-20,-17, 18,-19, 17,-13,-18, -7, -4, -8,-25,-16,-13,-11,-11,-12, -9, 20,-17; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='L'; M= -6,-23,-17,-27,-21,  5,-28,-22, 18,-23, 25, 12,-21,-24,-19,-18,-14,  4, 16,-22, -3,-20; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='R'; M= -9, -9,-23,-13, -8,-14,-21,-12, -2,  1, -7, -1, -5,-16, -2,  8, -6,  0, -1,-23, -8, -7; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='T'; M= -8,-12,-19,-14,-10, -8,-17, -9, -7, -8, -7, -4, -9, -7, -5, -6, -5,  2, -7,-18, -1, -9; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='I'; M= -4, -8,-21,-10, -5,-11,-16,-12,  1,-12, -2, -3, -6, -3, -8,-14, -3, -1, -3,-24,-10, -8; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='R'; M= -4, -4,-20, -4,  4,-18,-14, -5,-16,  4,-16,-10, -1, -5,  2, 11,  2,  1,-10,-24,-12,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='Q'; M= -7, -7,-22, -8, -1,-17, -7, -7, -8,  0, -7, -1, -4,-10,  7,  0, -6, -8,-11,-18, -9,  2; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='S'; M=  2, -2,-13, -3,  0,-11, -2,  0,-16, -5,-15,-10,  0,-11, -2, -7,  5, -2,-12,-17, -5, -1; D=-2;
/I:         I=-2; MD=-11;
/M: SY='P'; M= -7, -3,-24, -1,  5,-21,-10, -6,-17,  1,-19,-11, -2, 24,  2, -1, -4, -7,-20,-21,-16,  1; D=-2;
/I:         I=-2; MI=0; MD=-11; IM=0; DM=-11;
/M: SY='D'; M= -9, 10,-18, 16, 10,-19, -4, -3,-20,  4,-16,-13,  4, -3,  2,  4, -1, -5,-16,-19,-12,  5; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='P'; M= -4, -7,-19, -4,  5,-16,-13, -8,-10, -1,-12, -8, -7, 15,  1, -2, -2, -1,-10,-19,-12,  1; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M: SY='V'; M= -3, -8,-13, -9,-10, -7,-14, -7,  5,-11, -1,  2, -7,-15,-10,-11, -2,  0,  9,-21, -6,-11; D=-2;
/I:         I=-2; DM=-11;
/M:         M= -3,-10,-21,-14,-11,-13,-13, -5, -4, -7, -8, -3, -3,-19, -5, -3, -1, -3, -1,-25, -7,-10;
/M: SY='T'; M=  5, -9,-16,-13,-11,-10,-14,-10, -3,-14,  1, -2, -6,-18,-10,-13,  1,  7,  1,-27,-10,-11;
/M: SY='F'; M=-18,-27,-21,-35,-23, 61,-29,-17,  1,-27, 14,  2,-20,-28,-31,-18,-20,-10, -1,  4, 24,-24;
/M: SY='Q'; M=-11,  8,-21, 11,  7,-24,-16,  9,-21, -3,-17,-10,  5,-12, 13, -4, -1, -7,-22,-27, -7,  9;
/M: SY='K'; M= -7, -9,-23,-11,  1,-13,-21,-12,-10,  9, -6,  0, -9,-13, -1,  7, -7, -2, -6,-23, -9, -1;
/M: SY='E'; M= -2, 10,-26, 13, 20,-29, -9, -4,-24,  3,-20,-15,  5, -9, 10, -2,  2, -7,-22,-28,-18, 15;
/M: SY='A'; M= 16, -5,-16, -8, -4,-22,  5,-11,-20, -7,-22,-15,  0,-10, -5,-10, 16,  3,-11,-29,-19, -5;
/M: SY='F'; M=-20,-30,-21,-40,-30, 78,-30,-20, -1,-30,  9, -1,-21,-30,-39,-20,-21,-11, -1, 15, 30,-30;
/M: SY='L'; M=-10,-26,-16,-28,-20,  2,-30,-16, 15,-22, 29, 13,-23,-27,-17,-12,-22, -8, 10,-23, -3,-20;
/M: SY='R'; M= -5,  0,-25,  1,  5,-25, -7, -9,-27, 17,-24,-14,  1,-13,  3, 18,  0, -5,-17,-25,-15,  3;
/M: SY='S'; M=  4,  2,-17,  2,  1,-21, -8, -3,-19, -4,-23,-14,  6,-13,  5, -3, 18,  6,-13,-31,-14,  3;
/M: SY='R'; M=-15,-13,-26,-15, -5, -7,-22, -2,-17, 12,-11, -4, -6,-21,  5, 35,-11, -9,-12,-16, -2, -2;
/M: SY='P'; M= -5, -2,-29,  4,  9,-27,-12, -9,-24, -2,-26,-18, -4, 27, -2, -8,  2, -3,-23,-30,-21,  1;
/M: SY='R'; M= -7, -5,-25, -5,  2,-21, -9, -6,-21,  5,-17,-11, -1, -9,  5, 13,  2, -4,-18,-25,-13,  1;
/M: SY='S'; M=  1, -7,-16, -9, -6,-20,-10, -6,-16, -2,-18, -8, -3,-10, -3, -1,  5,  0, -8,-28,-14, -6;
/M: SY='H'; M= -7,  4,-22,  5,  5,-19,-15,  9,-20, -4,-17,-11,  3,-10,  5, -4,  7,  4,-17,-27, -5,  4;
/I:         I=-3; MD=-16;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-21, -8, -3,-16,-16,  7,-10, -1, -6,  3,  1,-18,  8,  7, -8, -9,-13,-24, -6,  1; D=-3;
/I:         I=-3; MI=0; MD=-16; IM=0; DM=-16;
/M: SY='P'; M= -4, -4,-25, -1,  4,-24,-15, -2,-19,  4,-19,-11, -5, 11,  3,  1, -3, -6,-17,-25,-14,  1; D=-3;
/I:         I=-3; DM=-16;
/M: SY='F'; M=-18,-29,-22,-36,-27, 61,-29,-15,  3,-26, 13,  6,-21,-29,-32,-18,-21,-11,  0, 10, 30,-26;
/M: SY='L'; M= -7,-25,-21,-28,-21, 10,-28,-12, 17,-24, 25, 13,-23,-26,-18,-19,-20, -8, 10,-14, 10,-21;
/M: SY='E'; M= -3,  3,-20,  2,  8,-20,-13, -7,-19,  6,-19,-11,  5,-12,  4,  1,  8,  4,-14,-29,-14,  6;
/M: SY='R'; M= -8, -8,-20, -9, -3,-18,-19, -8,-13,  6, -9, -2, -6,-18,  6, 10, -6, -6, -9,-19, -9,  1;
/M: SY='F'; M= -8,-27,-19,-32,-23, 32,-27,-18,  9,-24, 20, 12,-23,-27,-24,-18,-19, -8,  8, -9,  9,-21;
/M: SY='L'; M= -4,-22, -9,-26,-20, -1,-25,-18, 13,-20, 21, 16,-20,-25,-16,-16,-16, -4, 11,-25, -6,-18;
/M: SY='E'; M=-12, 10,-29, 16, 19,-29,-12,  5,-29, 10,-24,-16,  5, -8,  8,  8, -2,-10,-24,-29,-14, 12;
/M: SY='T'; M=  4, -3,-12,-10, -9,-11,-12,-17,-10,-12, -8, -9,  0,-13, -9,-12, 16, 31, -3,-30,-12, -9;
/M: SY='Q'; M=-10, -4,-28, -4, 10,-28,-21,  4,-12,  3,-12,  4, -5,-10, 39,  3, -4, -9,-20,-19, -6, 24;
/I:         I=-4; MI=0; MD=-21; IM=0; DM=-21;
/M: SY='M'; M= -1,-19,-20,-26,-18,  4,-18, -9,  8,-16, 12, 21,-18,-21,-10,-15,-12, -5,  3,-11,  5,-15;
/M: SY='F'; M=-18,-30,-19,-39,-29, 69,-30,-21,  4,-29, 13,  2,-21,-30,-38,-20,-20, -9,  4,  5, 25,-29;
/M: SY='A'; M=  9, -8,-19,-12, -3,-17,-11,-10, -9, -6, -7, -5, -5,-14, -2, -8,  3,  0, -6,-25,-13, -3;
/M: SY='Q'; M= -8,  2,-25,  3,  7,-23, -5, -4,-22,  0,-18,-12,  2,-14,  9,  3,  3, -1,-19,-25,-12,  7;
/M: SY='F'; M=-19,-30,-23,-38,-29, 68,-29,-19,  0,-28,  9,  0,-22,-30,-36,-19,-22,-12, -2, 20, 31,-28;
/M: SY='I'; M= -5,-27,-24,-34,-26,  0,-33,-27, 37,-27, 19, 15,-20,-22,-20,-26,-15, -7, 26,-22, -3,-26;
/M: SY='E'; M=-12,  9,-27, 14, 23,-24,-16,  4,-23,  1,-14,-12,  2,-11, 13, -3, -3, -9,-23,-28,-12, 17;
/M: SY='E'; M= -7, 11,-19, 13, 19,-23,-11, -2,-27,  2,-22,-18,  8,-11,  3, -2,  3, -3,-23,-31,-16, 11;
/M: SY='R'; M=-13,-13, -3,-15, -7,-20,-21,-10,-26, 12,-19,-12, -8,-14, -2, 31,-11,-10,-17,-21,-14, -7;
/I:         E1=0; IE=-105; DE=-105;
» More

Numerical results [info]

Numerical results for UniProtKB/Swiss-Prot release 2014_08 which contains 546'238 sequence entries.


Total number of hits 37 in 37 different sequences
Number of true positive hits 37 in 37 different sequences
Number of 'unknown' hits
Number of false positive hits
Number of false negative sequences 0
Number of 'partial' sequences 0
Precision (true positives / (true positives + false positives)) 100.00 %
Recall (true positives / (true positives + false negatives)) 100.00 %

Comments [info]

Matrix type [info] protein_domain
Scaling database [info] reversed
Author [info] CJA_Sigrist
Taxonomic range [info] Eukaryotes
Maximum number of repetitions [info] 1
Feature key [info] DOMAIN
Feature description [info] dDENN
Version [info] 2

Cross-references [info]

UniProtKB/Swiss-Prot
True positive sequences
37 sequences

DEN1A_HUMAN (Q8TEH3), DEN1A_MOUSE (Q8K382), DEN1A_XENLA (Q68F67), 
DEN1B_HUMAN (Q6P3S1), DEN1B_MOUSE (Q3U1T9), DEN1C_HUMAN (Q8IV53), 
DEN1C_MOUSE (Q8CFK6), DEN2A_HUMAN (Q9ULE3), DEN2A_MOUSE (Q8C4S8), 
DEN2C_HUMAN (Q68D51), DEN2C_MOUSE (Q6P9P8), DEN2D_HUMAN (Q9H6A0), 
DEN2D_MOUSE (Q91VV4), DEN4B_HUMAN (O75064), DEN4B_MOUSE (Q3U1Y4), 
DEN4C_HUMAN (Q5VZ89), DEN4C_MOUSE (A6H8H2), DEN5A_HUMAN (Q6IQ26), 
DEN5A_MOUSE (Q6PAL8), DEN5B_DANRE (Q6NXD8), DEN5B_HUMAN (Q6ZUT9), 
DEN5B_MOUSE (A2RSQ0), DEND3_HUMAN (A2RUS2), DEND3_MOUSE (A2RT67), 
DENN_SCHPO  (Q9Y7Q7), MADD_CAEEL  (O02626), MADD_DROME  (Q9VXY2), 
MADD_HUMAN  (Q8WXG6), MADD_MOUSE  (Q80U28), MADD_RAT    (O08873), 
MTMR5_HUMAN (O95248), MTMR5_MOUSE (Q6ZPE2), MTMRD_HUMAN (Q86WG5), 
MTMRD_XENLA (Q6NTN5), MYCPP_HUMAN (Q7Z401), ST5_HUMAN   (P78524), 
ST5_MOUSE   (Q924W7)
» More

PDB
[Detailed view]
1 PDB

3TW8

View entry in original PROSITE format
View entry in raw text format (no links)
Direct ScanProsite submission